Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ud4_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LYS 46.A O VAL 2.A H 3.002 2.321 VAL 3.A N ASP 80.A OD2 VAL 3.A H 2.611 1.753 VAL 4.A N LYS 48.A O VAL 4.A H 2.917 2.225 THR 5.A N ILE 81.A O THR 5.A H 3.087 2.342 THR 6.A N THR 50.A O THR 6.A H 2.900 2.171 GLU 9.A N ILE 7.A O GLU 9.A H 2.990 2.369 VAL 13.A N GLU 9.A O VAL 13.A H 3.161 2.321 MET 14.A N GLU 29.A O MET 14.A H 2.579 1.857 LYS 16.A N ARG 27.A O LYS 16.A H 3.100 2.270 ARG 27.A N GLY 24.A O ARG 27.A H 2.900 2.048 ARG 27.A NE GLY 24.A O ARG 27.A HE 2.981 2.157 GLU 29.A N MET 14.A O GLU 29.A H 2.544 1.781 CYS 32.A N TYR 12.A O CYS 32.A H 3.042 2.297 VAL 33.A N GLY 30.A O VAL 33.A H 2.921 2.262 ASP 34.A N GLY 30.A O ASP 34.A H 3.260 2.460 LEU 35.A N TYR 31.A O LEU 35.A H 2.921 2.109 ALA 36.A N CYS 32.A O ALA 36.A H 2.875 2.036 ALA 37.A N VAL 33.A O ALA 37.A H 2.905 2.106 GLU 38.A N ASP 34.A O GLU 38.A H 2.914 2.082 ILE 39.A N LEU 35.A O ILE 39.A H 2.913 2.104 ALA 40.A N ALA 36.A O ALA 40.A H 2.877 2.051 LYS 41.A N ALA 37.A O LYS 41.A H 2.912 2.073 HIS 42.A N GLU 38.A O HIS 42.A H 2.899 2.176 HIS 42.A N ILE 39.A O HIS 42.A H 3.161 2.559 CYS 43.A N ILE 39.A O CYS 43.A H 2.902 2.051 GLY 44.A N ALA 40.A O GLY 44.A H 2.405 1.676 LYS 48.A N VAL 2.A O LYS 48.A H 2.882 2.079 THR 50.A N VAL 4.A O THR 50.A H 2.878 2.206 VAL 52.A N THR 6.A O VAL 52.A H 3.191 2.530 LYS 56.A N ASP 54.A OD1 LYS 56.A H 2.864 2.183 LYS 65.A N ASP 61.A O LYS 65.A H 2.883 2.035 ILE 66.A N THR 64.A OG1 ILE 66.A H 3.148 2.433 ASN 68.A N ALA 59.A O ASN 68.A H 3.081 2.333 GLY 69.A N ASP 54.A OD2 GLY 69.A H 2.519 1.838 VAL 71.A N TYR 57.A O VAL 71.A H 3.216 2.389 GLY 72.A N ASN 68.A O GLY 72.A H 3.132 2.285 GLU 73.A N GLY 69.A O GLU 73.A H 2.927 2.106 LEU 74.A N MET 70.A O LEU 74.A H 2.892 2.117 VAL 75.A N VAL 71.A O VAL 75.A H 2.908 2.063 TYR 76.A N GLY 72.A O TYR 76.A H 2.730 1.992 GLY 77.A N LEU 74.A O GLY 77.A H 3.277 2.449 ALA 82.A N ALA 296.A O ALA 82.A H 3.378 2.525 LEU 86.A N ALA 84.A O LEU 86.A H 2.513 1.813 ILE 88.A N GLY 292.A O ILE 88.A H 3.304 2.524 ARG 92.A N THR 89.A OG1 ARG 92.A H 3.222 2.403 GLU 93.A N THR 89.A O GLU 93.A H 3.153 2.345 GLU 94.A N VAL 91.A O GLU 94.A H 3.386 2.621 VAL 95.A N ARG 92.A O VAL 95.A H 3.107 2.257 ILE 96.A N ARG 92.A O ILE 96.A H 3.143 2.456 ASP 97.A N THR 297.A O ASP 97.A H 3.434 2.583 PHE 98.A N GLU 93.A OE1 PHE 98.A H 3.166 2.330 SER 99.A N ILE 295.A O SER 99.A H 2.899 2.078 PHE 102.A N TYR 293.A O PHE 102.A H 2.908 2.285 LEU 105.A N LYS 291.A O LEU 105.A H 2.904 2.087 ILE 107.A N ASP 289.A OD1 ILE 107.A H 2.405 1.597 SER 108.A N LEU 265.A O SER 108.A H 2.760 1.984 MET 110.A N TYR 263.A O MET 110.A H 3.117 2.512 LYS 113.A N ASP 280.A O LYS 113.A H 2.902 2.051 SER 117.A N GLN 115.A O SER 117.A H 2.703 2.103 SER 123.A N GLY 120.A O SER 123.A H 3.012 2.241 LEU 125.A N PHE 122.A O LEU 125.A H 3.293 2.448 ASP 126.A N SER 123.A O ASP 126.A H 2.575 1.720 LEU 128.A N LEU 125.A O LEU 128.A H 3.342 2.543 ILE 132.A N ALA 129.A O ILE 132.A H 2.915 2.063 TRP 133.A N ALA 129.A O TRP 133.A H 3.331 2.547 TRP 133.A NE1 LEU 125.A O TRP 133.A HE1 3.130 2.289 MET 134.A N TYR 130.A O MET 134.A H 2.942 2.091 ILE 136.A N ILE 132.A O ILE 136.A H 2.879 2.061 VAL 137.A N TRP 133.A O VAL 137.A H 2.966 2.139 PHE 138.A N MET 134.A O PHE 138.A H 2.940 2.089 ALA 139.A N CYS 135.A O ALA 139.A H 2.850 2.014 TYR 140.A N ILE 136.A O TYR 140.A H 2.909 2.075 ILE 141.A N VAL 137.A O ILE 141.A H 3.024 2.202 GLY 142.A N PHE 138.A O GLY 142.A H 2.880 2.059 VAL 143.A N ALA 139.A O VAL 143.A H 2.878 2.054 SER 144.A N TYR 140.A O SER 144.A H 2.951 2.110 VAL 145.A N ILE 141.A O VAL 145.A H 2.888 2.091 VAL 146.A N GLY 142.A O VAL 146.A H 2.913 2.106 LEU 147.A N VAL 143.A O LEU 147.A H 2.907 2.071 PHE 148.A N SER 144.A O PHE 148.A H 2.917 2.070 LEU 149.A N VAL 145.A O LEU 149.A H 2.890 2.058 VAL 150.A N VAL 146.A O VAL 150.A H 2.904 2.059 SER 151.A N LEU 147.A O SER 151.A H 2.931 2.079 ARG 152.A N LEU 149.A O ARG 152.A H 2.968 2.238 PHE 153.A N LEU 149.A O PHE 153.A H 2.923 2.094 ARG 160.A N SER 156.A O ARG 160.A H 2.813 2.038 ILE 161.A N LEU 157.A O ILE 161.A H 2.927 2.130 VAL 162.A N SER 158.A O VAL 162.A H 2.935 2.086 GLY 163.A N GLY 159.A O GLY 163.A H 2.907 2.068 GLY 164.A N ARG 160.A O GLY 164.A H 2.920 2.130 VAL 165.A N ILE 161.A O VAL 165.A H 2.911 2.071 TRP 166.A N VAL 162.A O TRP 166.A H 2.897 2.069 TRP 167.A N GLY 163.A O TRP 167.A H 2.881 2.089 PHE 168.A N GLY 164.A O PHE 168.A H 2.942 2.105 PHE 169.A N VAL 165.A O PHE 169.A H 2.882 2.067 THR 170.A N TRP 166.A O THR 170.A H 2.896 2.040 LEU 171.A N TRP 167.A O LEU 171.A H 2.890 2.053 ILE 172.A N PHE 168.A O ILE 172.A H 3.002 2.158 ILE 173.A N PHE 169.A O ILE 173.A H 2.908 2.114 ILE 174.A N THR 170.A O ILE 174.A H 2.906 2.050 SER 175.A N LEU 171.A O SER 175.A H 2.956 2.121 SER 176.A N ILE 172.A O SER 176.A H 2.892 2.064 TYR 177.A N ILE 173.A O TYR 177.A H 2.957 2.107 TYR 177.A OH PHE 124.A O TYR 177.A HH 2.773 1.955 THR 178.A N ILE 174.A O THR 178.A H 2.893 2.039 ALA 179.A N SER 175.A O ALA 179.A H 2.891 2.072 ASN 180.A N SER 176.A O ASN 180.A H 2.942 2.094 LEU 181.A N TYR 177.A O LEU 181.A H 2.951 2.112 ALA 182.A N THR 178.A O ALA 182.A H 2.870 2.058 ALA 183.A N ALA 179.A O ALA 183.A H 2.901 2.071 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.944 2.101 LEU 185.A N LEU 181.A O LEU 185.A H 2.918 2.070 THR 186.A N ALA 182.A O THR 186.A H 2.865 2.009 VAL 187.A N ALA 183.A O VAL 187.A H 2.918 2.063 GLU 188.A N PHE 184.A O GLU 188.A H 2.924 2.068 ARG 189.A N THR 186.A O ARG 189.A H 2.784 2.057 MET 190.A N THR 186.A O MET 190.A H 2.937 2.161 LEU 200.A N ALA 197.A O LEU 200.A H 2.731 1.895 SER 201.A N ALA 197.A O SER 201.A H 3.202 2.435 LYS 202.A N GLU 198.A O LYS 202.A H 3.188 2.383 GLN 203.A N LEU 200.A O GLN 203.A H 3.009 2.165 GLN 203.A NE2 ILE 206.A O GLN 203.A HE22 2.505 1.878 ILE 206.A N GLN 203.A OE1 ILE 206.A H 2.888 2.079 ALA 207.A N LYS 260.A O ALA 207.A H 2.846 2.114 GLY 209.A N ALA 262.A O GLY 209.A H 2.919 2.126 GLU 218.A N GLY 214.A O GLU 218.A H 3.387 2.532 PHE 219.A N SER 215.A O PHE 219.A H 2.880 2.059 PHE 220.A N THR 216.A O PHE 220.A H 2.932 2.123 ARG 221.A N LYS 217.A O ARG 221.A H 2.614 1.799 ASP 229.A N ILE 225.A O ASP 229.A H 2.746 1.953 LYS 230.A N ALA 226.A O LYS 230.A H 2.879 2.050 MET 231.A N VAL 227.A O MET 231.A H 2.920 2.108 TRP 232.A N PHE 228.A O TRP 232.A H 2.872 2.048 THR 233.A N ASP 229.A O THR 233.A H 2.893 2.057 TYR 234.A N LYS 230.A O TYR 234.A H 2.884 2.047 MET 235.A N MET 231.A O MET 235.A H 2.909 2.053 ARG 236.A N TRP 232.A O ARG 236.A H 2.886 2.086 SER 237.A N THR 233.A O SER 237.A H 3.049 2.261 ALA 238.A N MET 235.A O ALA 238.A H 3.214 2.477 VAL 244.A N THR 210.A O VAL 244.A H 3.151 2.465 GLU 249.A N THR 246.A O GLU 249.A H 2.739 1.934 VAL 251.A N THR 247.A O VAL 251.A H 2.905 2.060 ALA 252.A N ALA 248.A O ALA 252.A H 2.879 2.044 ARG 253.A N GLU 249.A O ARG 253.A H 2.952 2.108 ARG 253.A NH1 SER 241.A O ARG 253.A HH12 3.429 2.811 ARG 253.A NH2 SER 241.A O ARG 253.A HH22 3.569 2.980 VAL 254.A N GLY 250.A O VAL 254.A H 2.934 2.143 ARG 255.A N VAL 251.A O ARG 255.A H 2.862 2.099 LYS 256.A N ALA 252.A O LYS 256.A H 2.934 2.110 SER 257.A N ARG 253.A O SER 257.A H 3.254 2.413 ALA 262.A N ALA 207.A O ALA 262.A H 2.877 2.227 LEU 264.A N GLY 209.A O LEU 264.A H 2.923 2.074 SER 267.A N GLY 106.A O SER 267.A H 2.875 2.110 ASN 270.A N GLU 266.A O ASN 270.A H 3.058 2.236 ASN 270.A ND2 ILE 109.A O ASN 270.A HD22 2.674 2.141 GLU 271.A N SER 267.A O GLU 271.A H 2.903 2.100 TYR 272.A N THR 268.A O TYR 272.A H 2.942 2.100 ILE 273.A N MET 269.A O ILE 273.A H 2.898 2.079 GLU 274.A N ASN 270.A O GLU 274.A H 2.894 2.051 GLN 275.A N GLU 271.A O GLN 275.A H 3.121 2.420 GLN 275.A N TYR 272.A O GLN 275.A H 3.222 2.531 GLN 275.A NE2 CYS 334.A O GLN 275.A HE22 2.827 2.346 ARG 276.A N ILE 273.A O ARG 276.A H 2.800 2.070 ARG 276.A NE TYR 272.A OH ARG 276.A HE 3.230 2.522 ARG 276.A NH1 GLN 275.A O ARG 276.A HH11 2.784 2.142 ARG 276.A NH1 LYS 331.A O ARG 276.A HH12 3.022 2.372 ARG 276.A NH2 LYS 331.A O ARG 276.A HH22 3.189 2.584 LYS 277.A N GLU 333.A OE1 LYS 277.A H 2.976 2.131 CYS 279.A N ARG 276.A O CYS 279.A H 2.881 2.091 CYS 279.A SG ARG 276.A O no hydrogen 3.878 N/A CYS 279.A SG GLU 333.A O no hydrogen 3.926 N/A LEU 288.A N ILE 107.A O LEU 288.A H 3.127 2.355 LYS 291.A N LEU 105.A O LYS 291.A H 2.903 2.070 LYS 291.A NZ ASP 289.A OD2 LYS 291.A HZ1 3.001 2.383 TYR 293.A N MET 103.A O TYR 293.A H 2.917 2.103 ILE 295.A N SER 99.A OG ILE 295.A H 3.009 2.252 LYS 299.A NZ GLU 93.A O LYS 299.A HZ1 3.525 2.665 SER 301.A N LYS 299.A O SER 301.A H 2.765 2.079 LEU 303.A N SER 301.A OG LEU 303.A H 2.984 2.166 ALA 306.A N SER 302.A O ALA 306.A H 3.391 2.608 VAL 307.A N GLY 304.A O VAL 307.A H 3.085 2.270 ASN 308.A N GLY 304.A O ASN 308.A H 2.904 2.059 VAL 311.A N VAL 307.A O VAL 311.A H 2.904 2.082 LEU 312.A N ASN 308.A O LEU 312.A H 2.937 2.105 LYS 313.A N LEU 309.A O LYS 313.A H 2.870 2.055 LEU 314.A N ALA 310.A O LEU 314.A H 2.921 2.104 ASN 315.A N VAL 311.A O ASN 315.A H 2.903 2.089 GLU 316.A N LEU 312.A O GLU 316.A H 2.899 2.141 GLN 317.A N LYS 313.A O GLN 317.A H 2.901 2.065 LYS 322.A N GLY 318.A O LYS 322.A H 2.890 2.089 LEU 323.A N LEU 319.A O LEU 323.A H 2.880 2.058 LYS 324.A N LEU 320.A O LYS 324.A H 2.917 2.086 ASN 325.A N ASP 321.A O ASN 325.A H 2.893 2.044 LYS 326.A N LYS 322.A O LYS 326.A H 2.886 2.055 LYS 326.A NZ ASP 34.A OD2 LYS 326.A HZ3 2.768 2.012 TRP 327.A N LEU 323.A O TRP 327.A H 2.933 2.126 TRP 327.A NE1 ASP 34.A OD2 TRP 327.A HE1 3.282 2.434 TRP 328.A N LYS 324.A O TRP 328.A H 2.893 2.299 TRP 328.A N ASN 325.A O TRP 328.A H 3.396 2.618 TRP 328.A NE1 THR 268.A O TRP 328.A HE1 3.259 2.457 TYR 329.A N ASN 325.A O TYR 329.A H 2.890 2.051 ASP 330.A N ASN 325.A O ASP 330.A H 3.010 2.207 LYS 331.A N LYS 326.A O LYS 331.A H 2.898 2.183 GLY 332.A N TYR 329.A O GLY 332.A H 2.618 1.834 GLU 333.A N GLN 275.A O GLU 333.A H 3.198 2.559 SER 344.A N SER 342.A OG SER 344.A H 3.263 2.450 ASN 345.A N SER 342.A O ASN 345.A H 3.197 2.418 VAL 346.A N LEU 343.A O VAL 346.A H 2.670 1.825 VAL 349.A N VAL 346.A O VAL 349.A H 2.885 2.182 TYR 351.A N ALA 347.A O TYR 351.A H 2.932 2.111 ILE 352.A N GLY 348.A O ILE 352.A H 2.923 2.079 LEU 353.A N VAL 349.A O LEU 353.A H 2.893 2.103 VAL 354.A N PHE 350.A O VAL 354.A H 2.920 2.067 GLY 355.A N TYR 351.A O GLY 355.A H 2.916 2.118 GLY 356.A N ILE 352.A O GLY 356.A H 2.901 2.056 LEU 357.A N LEU 353.A O LEU 357.A H 2.918 2.120 GLY 358.A N VAL 354.A O GLY 358.A H 2.895 2.041 LEU 359.A N GLY 355.A O LEU 359.A H 2.931 2.090 ALA 360.A N GLY 356.A O ALA 360.A H 2.877 2.086 MET 361.A N LEU 357.A O MET 361.A H 2.917 2.096 LEU 362.A N GLY 358.A O LEU 362.A H 2.935 2.099 VAL 363.A N LEU 359.A O VAL 363.A H 2.903 2.069 ALA 364.A N ALA 360.A O ALA 364.A H 2.880 2.047 LEU 365.A N MET 361.A O LEU 365.A H 2.919 2.097 ILE 366.A N LEU 362.A O ILE 366.A H 2.947 2.104 GLU 367.A N VAL 363.A O GLU 367.A H 2.909 2.097 PHE 368.A N ALA 364.A O PHE 368.A H 2.869 2.020 CYS 369.A N LEU 365.A O CYS 369.A H 2.960 2.118 TYR 370.A N ILE 366.A O TYR 370.A H 2.865 2.018 LYS 371.A N GLU 367.A O LYS 371.A H 2.897 2.193 SER 372.A N PHE 368.A O SER 372.A H 2.892 2.037 ARG 373.A N CYS 369.A O ARG 373.A H 2.913 2.174 GLU 375.A N LYS 371.A O GLU 375.A H 2.911 2.167 ALA 376.A N SER 372.A O ALA 376.A H 2.899 2.084 LYS 377.A N ARG 373.A O LYS 377.A H 2.918 2.277 ARG 378.A N ARG 373.A O ARG 378.A H 2.950 2.127