Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ud8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 2.A N LYS 46.A O VAL 2.A H 3.412 2.668 VAL 3.A N ASP 80.A OD2 VAL 3.A H 2.563 1.704 VAL 4.A N LYS 48.A O VAL 4.A H 2.925 2.219 THR 5.A N ILE 81.A O THR 5.A H 3.129 2.380 THR 6.A N THR 50.A O THR 6.A H 2.896 2.197 VAL 13.A N GLU 9.A O VAL 13.A H 2.928 2.087 MET 14.A N GLU 29.A O MET 14.A H 2.946 2.331 LYS 16.A N ARG 27.A O LYS 16.A H 2.965 2.166 LEU 22.A N HIS 19.A O LEU 22.A H 3.092 2.251 ASN 25.A ND2 TYR 47.A O ASN 25.A HD22 3.355 2.528 ARG 27.A N GLY 24.A O ARG 27.A H 2.898 2.046 ARG 27.A NE GLY 24.A O ARG 27.A HE 2.562 1.746 GLU 29.A N MET 14.A O GLU 29.A H 3.138 2.405 TYR 31.A N PRO 11.A O TYR 31.A H 3.388 2.622 CYS 32.A N TYR 12.A O CYS 32.A H 3.002 2.255 VAL 33.A N GLY 30.A O VAL 33.A H 2.915 2.276 ASP 34.A N GLY 30.A O ASP 34.A H 3.175 2.364 LEU 35.A N TYR 31.A O LEU 35.A H 2.918 2.124 ALA 36.A N CYS 32.A O ALA 36.A H 2.874 2.043 ALA 37.A N VAL 33.A O ALA 37.A H 2.921 2.106 GLU 38.A N ASP 34.A O GLU 38.A H 2.907 2.090 ILE 39.A N LEU 35.A O ILE 39.A H 2.910 2.100 ALA 40.A N ALA 36.A O ALA 40.A H 2.896 2.056 LYS 41.A N ALA 37.A O LYS 41.A H 2.902 2.062 HIS 42.A N GLU 38.A O HIS 42.A H 2.900 2.176 HIS 42.A N ILE 39.A O HIS 42.A H 3.206 2.602 CYS 43.A N ILE 39.A O CYS 43.A H 2.903 2.056 GLY 44.A N ALA 40.A O GLY 44.A H 2.456 1.739 LYS 48.A N VAL 2.A O LYS 48.A H 2.880 2.074 LEU 49.A N ASN 25.A OD1 LEU 49.A H 3.267 2.494 THR 50.A N VAL 4.A O THR 50.A H 2.873 2.153 VAL 52.A N THR 6.A O VAL 52.A H 3.272 2.569 LYS 65.A N ASP 61.A O LYS 65.A H 2.704 1.855 VAL 71.A N TYR 57.A O VAL 71.A H 3.241 2.408 GLY 72.A N ASN 68.A O GLY 72.A H 2.966 2.122 GLU 73.A N GLY 69.A O GLU 73.A H 2.918 2.111 LEU 74.A N MET 70.A O LEU 74.A H 2.905 2.125 VAL 75.A N VAL 71.A O VAL 75.A H 2.902 2.047 TYR 76.A N GLY 72.A O TYR 76.A H 2.730 1.922 GLY 77.A N LEU 74.A O GLY 77.A H 3.143 2.315 LEU 86.A N ALA 84.A O LEU 86.A H 2.572 1.843 ARG 92.A N THR 89.A OG1 ARG 92.A H 3.276 2.464 ARG 92.A NH1 THR 87.A O ARG 92.A HH11 2.829 2.134 ARG 92.A NH2 GLY 58.A O ARG 92.A HH21 3.271 2.674 GLU 93.A N THR 89.A O GLU 93.A H 2.986 2.243 GLU 94.A N VAL 91.A O GLU 94.A H 3.365 2.567 VAL 95.A N ARG 92.A O VAL 95.A H 3.297 2.459 ASP 97.A N THR 297.A O ASP 97.A H 3.369 2.539 SER 99.A N ILE 295.A O SER 99.A H 2.729 1.883 PHE 102.A N TYR 293.A O PHE 102.A H 3.016 2.404 LEU 105.A N LYS 291.A O LEU 105.A H 2.891 2.082 GLY 106.A N SER 267.A OG GLY 106.A H 3.268 2.460 ILE 107.A N ASP 289.A OD1 ILE 107.A H 2.345 1.557 SER 108.A N LEU 265.A O SER 108.A H 2.925 2.115 LYS 113.A N ASP 280.A O LYS 113.A H 2.868 2.018 LEU 125.A N PHE 122.A O LEU 125.A H 3.121 2.274 ASP 126.A N SER 123.A O ASP 126.A H 2.855 2.002 ILE 132.A N ALA 129.A O ILE 132.A H 2.989 2.139 TRP 133.A N ALA 129.A O TRP 133.A H 3.400 2.618 TRP 133.A NE1 LEU 128.A O TRP 133.A HE1 2.937 2.303 MET 134.A N TYR 130.A O MET 134.A H 2.929 2.082 ILE 136.A N ILE 132.A O ILE 136.A H 2.881 2.090 VAL 137.A N TRP 133.A O VAL 137.A H 2.950 2.117 PHE 138.A N MET 134.A O PHE 138.A H 2.945 2.093 ALA 139.A N CYS 135.A O ALA 139.A H 2.846 2.054 TYR 140.A N ILE 136.A O TYR 140.A H 2.922 2.092 ILE 141.A N VAL 137.A O ILE 141.A H 3.009 2.199 GLY 142.A N PHE 138.A O GLY 142.A H 2.880 2.063 VAL 143.A N ALA 139.A O VAL 143.A H 2.893 2.049 SER 144.A N TYR 140.A O SER 144.A H 2.955 2.124 VAL 145.A N ILE 141.A O VAL 145.A H 2.883 2.057 VAL 146.A N GLY 142.A O VAL 146.A H 2.908 2.140 LEU 147.A N VAL 143.A O LEU 147.A H 2.908 2.051 PHE 148.A N SER 144.A O PHE 148.A H 2.915 2.100 LEU 149.A N VAL 145.A O LEU 149.A H 2.889 2.051 VAL 150.A N VAL 146.A O VAL 150.A H 2.906 2.055 SER 151.A N LEU 147.A O SER 151.A H 2.942 2.088 ARG 152.A N LEU 149.A O ARG 152.A H 3.023 2.296 PHE 153.A N LEU 149.A O PHE 153.A H 2.946 2.112 SER 154.A N VAL 150.A O SER 154.A H 3.089 2.502 ARG 160.A NE SER 156.A O ARG 160.A HE 2.773 2.326 ILE 161.A N LEU 157.A O ILE 161.A H 2.934 2.134 VAL 162.A N SER 158.A O VAL 162.A H 2.924 2.076 GLY 163.A N GLY 159.A O GLY 163.A H 2.901 2.069 GLY 164.A N ARG 160.A O GLY 164.A H 2.918 2.126 VAL 165.A N ILE 161.A O VAL 165.A H 2.917 2.081 TRP 166.A N VAL 162.A O TRP 166.A H 2.890 2.059 TRP 167.A N GLY 163.A O TRP 167.A H 2.864 2.042 PHE 168.A N GLY 164.A O PHE 168.A H 2.953 2.115 PHE 169.A N VAL 165.A O PHE 169.A H 2.879 2.060 THR 170.A N TRP 166.A O THR 170.A H 2.883 2.027 LEU 171.A N TRP 167.A O LEU 171.A H 2.915 2.072 ILE 172.A N PHE 168.A O ILE 172.A H 2.984 2.135 ILE 173.A N PHE 169.A O ILE 173.A H 2.900 2.106 ILE 174.A N THR 170.A O ILE 174.A H 2.921 2.066 SER 175.A N LEU 171.A O SER 175.A H 2.971 2.128 SER 175.A OG LEU 171.A O SER 175.A HG 2.684 1.879 SER 176.A N ILE 172.A O SER 176.A H 2.873 2.057 TYR 177.A N ILE 173.A O TYR 177.A H 2.958 2.107 THR 178.A N ILE 174.A O THR 178.A H 2.898 2.043 ALA 179.A N SER 175.A O ALA 179.A H 2.887 2.089 ASN 180.A N SER 176.A O ASN 180.A H 2.960 2.111 ASN 180.A ND2 PRO 127.A O ASN 180.A HD21 2.360 1.707 LEU 181.A N TYR 177.A O LEU 181.A H 2.942 2.102 ALA 182.A N THR 178.A O ALA 182.A H 2.876 2.067 ALA 183.A N ALA 179.A O ALA 183.A H 2.901 2.086 PHE 184.A N ASN 180.A O PHE 184.A H 2.956 2.114 LEU 185.A N LEU 181.A O LEU 185.A H 2.911 2.062 THR 186.A N ALA 182.A O THR 186.A H 2.869 2.012 VAL 187.A N ALA 183.A O VAL 187.A H 2.925 2.070 GLU 188.A N PHE 184.A O GLU 188.A H 2.930 2.081 ARG 189.A N THR 186.A O ARG 189.A H 2.710 1.959 MET 190.A N THR 186.A O MET 190.A H 2.992 2.201 SER 196.A OG GLU 198.A OE2 SER 196.A HG 3.413 2.794 LEU 200.A N ALA 197.A O LEU 200.A H 2.680 1.905 SER 201.A N ALA 197.A O SER 201.A H 3.110 2.354 LYS 202.A N GLU 198.A O LYS 202.A H 3.044 2.224 GLN 203.A N LEU 200.A O GLN 203.A H 3.134 2.317 GLN 203.A NE2 ILE 206.A O GLN 203.A HE22 2.546 1.854 ILE 206.A N GLN 203.A OE1 ILE 206.A H 2.873 2.062 ALA 207.A N LYS 260.A O ALA 207.A H 2.706 2.047 GLY 209.A N ALA 262.A O GLY 209.A H 2.920 2.118 SER 213.A N ASP 212.A OD1 SER 213.A H 2.341 1.719 SER 213.A OG ASP 212.A OD1 SER 213.A HG 3.514 2.710 LYS 217.A NZ ASP 212.A O LYS 217.A HZ2 2.391 1.791 GLU 218.A N GLY 214.A O GLU 218.A H 3.100 2.253 PHE 219.A N SER 215.A O PHE 219.A H 2.877 2.065 PHE 220.A N THR 216.A O PHE 220.A H 2.932 2.107 ARG 221.A N LYS 217.A O ARG 221.A H 2.802 2.026 ILE 225.A N SER 223.A OG ILE 225.A H 3.230 2.558 ASP 229.A N ILE 225.A O ASP 229.A H 2.768 1.986 LYS 230.A N ALA 226.A O LYS 230.A H 2.877 2.049 MET 231.A N VAL 227.A O MET 231.A H 2.923 2.114 TRP 232.A N PHE 228.A O TRP 232.A H 2.863 2.042 THR 233.A N ASP 229.A O THR 233.A H 2.888 2.058 TYR 234.A N LYS 230.A O TYR 234.A H 2.901 2.088 MET 235.A N MET 231.A O MET 235.A H 2.912 2.058 ARG 236.A N TRP 232.A O ARG 236.A H 2.873 2.073 SER 237.A N THR 233.A O SER 237.A H 3.263 2.517 SER 237.A N TYR 234.A O SER 237.A H 2.918 2.288 ALA 238.A N MET 235.A O ALA 238.A H 3.228 2.496 GLU 249.A N THR 246.A O GLU 249.A H 2.689 1.876 VAL 251.A N THR 247.A O VAL 251.A H 2.891 2.138 ALA 252.A N ALA 248.A O ALA 252.A H 2.891 2.074 ARG 253.A N GLU 249.A O ARG 253.A H 2.933 2.107 ARG 253.A NH1 SER 241.A O ARG 253.A HH12 3.558 2.768 ARG 255.A N VAL 251.A O ARG 255.A H 2.884 2.091 LYS 256.A N ALA 252.A O LYS 256.A H 2.922 2.204 SER 257.A N ARG 253.A O SER 257.A H 3.313 2.477 ALA 262.A N ALA 207.A O ALA 262.A H 2.871 2.240 TYR 263.A N MET 110.A O TYR 263.A H 3.283 2.480 TYR 263.A OH THR 247.A OG1 TYR 263.A HH 3.104 2.305 LEU 264.A N GLY 209.A O LEU 264.A H 3.035 2.221 SER 267.A N GLY 106.A O SER 267.A H 2.764 1.942 THR 268.A OG1 TYR 12.A OH THR 268.A HG1 3.385 2.738 ASN 270.A N GLU 266.A O ASN 270.A H 2.902 2.081 ASN 270.A ND2 SER 108.A OG ASN 270.A HD22 3.342 2.544 GLU 271.A N SER 267.A O GLU 271.A H 2.913 2.075 TYR 272.A N THR 268.A O TYR 272.A H 2.904 2.078 ILE 273.A N MET 269.A O ILE 273.A H 2.892 2.080 GLU 274.A N ASN 270.A O GLU 274.A H 2.894 2.068 GLN 275.A N TYR 272.A O GLN 275.A H 3.320 2.600 ARG 276.A N ILE 273.A O ARG 276.A H 2.661 1.816 ARG 276.A NE TYR 272.A OH ARG 276.A HE 3.339 2.685 ARG 276.A NH1 GLN 275.A O ARG 276.A HH11 3.435 2.674 LYS 277.A N GLU 333.A OE1 LYS 277.A H 2.822 1.994 CYS 279.A N ARG 276.A O CYS 279.A H 2.967 2.175 CYS 279.A SG ARG 276.A O no hydrogen 3.892 N/A ASP 280.A N ASP 280.A OD1 ASP 280.A H 2.750 2.142 LYS 283.A NZ ASN 287.A OD1 LYS 283.A HZ3 3.375 2.631 ASN 287.A ND2 SER 267.A OG ASN 287.A HD22 2.984 2.406 LEU 288.A N ILE 107.A O LEU 288.A H 2.777 1.965 LYS 291.A N LEU 105.A O LYS 291.A H 2.914 2.060 TYR 293.A N MET 103.A O TYR 293.A H 2.918 2.092 ILE 295.A N SER 99.A OG ILE 295.A H 2.665 1.924 ALA 296.A N ALA 82.A O ALA 296.A H 3.287 2.545 SER 301.A N LYS 299.A O SER 301.A H 2.768 2.077 SER 301.A OG THR 297.A OG1 SER 301.A HG 3.384 2.658 LEU 303.A N SER 301.A OG LEU 303.A H 3.361 2.577 ALA 306.A N LEU 303.A O ALA 306.A H 2.516 1.863 VAL 307.A N GLY 304.A O VAL 307.A H 3.088 2.280 ASN 308.A N GLY 304.A O ASN 308.A H 2.913 2.057 VAL 311.A N VAL 307.A O VAL 311.A H 2.932 2.099 LEU 312.A N ASN 308.A O LEU 312.A H 2.922 2.082 LYS 313.A N LEU 309.A O LYS 313.A H 2.873 2.041 LEU 314.A N ALA 310.A O LEU 314.A H 2.922 2.096 ASN 315.A N VAL 311.A O ASN 315.A H 2.913 2.076 GLU 316.A N LEU 312.A O GLU 316.A H 2.889 2.164 GLN 317.A N LYS 313.A O GLN 317.A H 2.910 2.114 LEU 319.A N LEU 314.A O LEU 319.A H 3.175 2.572 LYS 322.A N GLY 318.A O LYS 322.A H 2.902 2.096 LEU 323.A N LEU 319.A O LEU 323.A H 2.898 2.092 LYS 324.A N LEU 320.A O LYS 324.A H 2.917 2.088 LYS 324.A NZ GLU 271.A OE1 LYS 324.A HZ1 3.377 2.632 ASN 325.A N ASP 321.A O ASN 325.A H 2.907 2.056 LYS 326.A N LYS 322.A O LYS 326.A H 2.892 2.057 LYS 326.A NZ ASP 34.A OD2 LYS 326.A HZ3 3.154 2.287 TRP 327.A N LEU 323.A O TRP 327.A H 2.927 2.110 TRP 327.A NE1 ASP 34.A OD2 TRP 327.A HE1 3.189 2.338 TRP 328.A N LYS 324.A O TRP 328.A H 2.919 2.305 TRP 328.A N ASN 325.A O TRP 328.A H 3.394 2.629 TRP 328.A NE1 THR 268.A O TRP 328.A HE1 3.291 2.449 TYR 329.A N ASN 325.A O TYR 329.A H 2.893 2.086 ASP 330.A N ASN 325.A O ASP 330.A H 3.049 2.242 LYS 331.A N LYS 326.A O LYS 331.A H 2.961 2.232 GLY 332.A N TYR 329.A O GLY 332.A H 2.740 1.914 CYS 334.A N GLN 275.A O CYS 334.A H 3.248 2.622 CYS 334.A SG GLU 274.A O no hydrogen 3.640 N/A SER 342.A N ASN 345.A OD1 SER 342.A H 3.081 2.492 SER 344.A N SER 342.A OG SER 344.A H 3.163 2.531 ASN 345.A N SER 342.A O ASN 345.A H 3.041 2.192 VAL 346.A N LEU 343.A O VAL 346.A H 2.755 1.899 GLY 348.A N VAL 121.A O GLY 348.A H 3.413 2.594 TYR 351.A N ALA 347.A O TYR 351.A H 2.934 2.099 ILE 352.A N GLY 348.A O ILE 352.A H 2.917 2.064 LEU 353.A N VAL 349.A O LEU 353.A H 2.891 2.081 VAL 354.A N PHE 350.A O VAL 354.A H 2.924 2.070 GLY 355.A N TYR 351.A O GLY 355.A H 2.932 2.102 GLY 356.A N ILE 352.A O GLY 356.A H 2.892 2.059 LEU 357.A N LEU 353.A O LEU 357.A H 2.895 2.088 GLY 358.A N VAL 354.A O GLY 358.A H 2.910 2.066 LEU 359.A N GLY 355.A O LEU 359.A H 2.918 2.075 ALA 360.A N GLY 356.A O ALA 360.A H 2.862 2.047 MET 361.A N LEU 357.A O MET 361.A H 2.929 2.109 LEU 362.A N GLY 358.A O LEU 362.A H 2.910 2.078 VAL 363.A N LEU 359.A O VAL 363.A H 2.911 2.074 ALA 364.A N ALA 360.A O ALA 364.A H 2.867 2.034 LEU 365.A N MET 361.A O LEU 365.A H 2.903 2.097 ILE 366.A N LEU 362.A O ILE 366.A H 2.954 2.114 GLU 367.A N VAL 363.A O GLU 367.A H 2.899 2.082 PHE 368.A N ALA 364.A O PHE 368.A H 2.854 2.005 CYS 369.A N LEU 365.A O CYS 369.A H 2.933 2.106 TYR 370.A N ILE 366.A O TYR 370.A H 2.897 2.050 LYS 371.A N GLU 367.A O LYS 371.A H 2.883 2.154 SER 372.A N PHE 368.A O SER 372.A H 2.892 2.035 ARG 373.A N CYS 369.A O ARG 373.A H 2.904 2.142 GLU 375.A N LYS 371.A O GLU 375.A H 2.911 2.202 GLU 375.A N SER 372.A O GLU 375.A H 3.259 2.606 ALA 376.A N SER 372.A O ALA 376.A H 2.887 2.091 LYS 377.A N ARG 373.A O LYS 377.A H 2.921 2.157 ARG 378.A N ARG 373.A O ARG 378.A H 3.205 2.398