Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6v7l_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 4.A N ASN 2.A OD1 TYR 4.A H 3.167 2.414 PHE 6.A N ILE 268.A O PHE 6.A H 2.765 1.913 ARG 7.A NH1 THR 262.A O ARG 7.A HH12 2.936 2.108 ARG 7.A NH1 ASP 267.A OD2 ARG 7.A HH11 2.842 2.100 SER 8.A N ASP 267.A OD1 SER 8.A H 2.776 2.045 LYS 10.A N ARG 7.A O LYS 10.A H 3.000 2.165 LYS 10.A NZ ASN 9.A OD1 LYS 10.A HZ2 3.458 2.787 LEU 12.A N LEU 24.A O LEU 12.A H 2.845 1.988 LEU 14.A N LEU 22.A O LEU 14.A H 2.921 2.237 PHE 15.A N LEU 22.A O PHE 15.A H 3.245 2.403 ASN 17.A N GLY 20.A O ASN 17.A H 3.167 2.335 ASN 17.A ND2 ILE 174.A O ASN 17.A HD21 3.218 2.400 GLN 18.A N GLN 18.A OE1 GLN 18.A H 2.755 1.965 HIS 19.A N ASN 17.A OD1 HIS 19.A H 2.808 1.997 SER 21.A N CYS 47.A O SER 21.A H 2.557 1.731 LEU 22.A N PHE 15.A O LEU 22.A H 2.900 2.065 ARG 23.A N GLU 45.A O ARG 23.A H 2.904 2.068 ARG 23.A NH1 GLU 45.A OE1 ARG 23.A HH12 2.649 2.007 ARG 23.A NH2 SER 8.A O ARG 23.A HH21 3.044 2.430 LEU 24.A N LEU 12.A O LEU 24.A H 2.733 1.953 LEU 25.A N VAL 43.A O LEU 25.A H 2.924 2.133 GLN 26.A N LYS 10.A O GLN 26.A H 3.382 2.557 GLN 26.A NE2 ASP 31.A OD2 GLN 26.A HE22 3.279 2.520 ARG 27.A NH2 THR 126.A OG1 ARG 27.A HH22 3.041 2.265 ASN 29.A N ASN 29.A OD1 ASN 29.A H 2.683 2.051 GLU 30.A N ARG 27.A O GLU 30.A H 3.344 2.505 LYS 34.A N THR 32.A OG1 LYS 34.A H 3.323 2.471 GLU 36.A N GLU 33.A O GLU 36.A H 3.335 2.581 LEU 38.A N LEU 35.A O LEU 38.A H 3.068 2.215 ARG 39.A N GLU 36.A O ARG 39.A H 3.219 2.436 TYR 41.A N LEU 38.A O TYR 41.A H 3.082 2.228 ARG 42.A N ALA 118.A O ARG 42.A H 3.088 2.272 ARG 42.A NE LEU 25.A O ARG 42.A HE 3.229 2.483 ARG 42.A NH1 GLY 125.A O ARG 42.A HH11 2.766 1.991 ARG 42.A NH2 LEU 25.A O ARG 42.A HH21 3.055 2.271 LEU 44.A N LYS 116.A O LEU 44.A H 2.877 2.077 GLU 45.A N ARG 23.A O GLU 45.A H 2.857 2.117 TYR 46.A N ILE 114.A O TYR 46.A H 2.848 2.002 CYS 47.A N SER 21.A O CYS 47.A H 3.031 2.390 SER 48.A N LEU 112.A O SER 48.A H 2.863 2.048 SER 48.A OG THR 52.A OG1 SER 48.A HG 2.740 1.915 LYS 49.A N HIS 19.A O LYS 49.A H 2.711 1.855 ASN 51.A ND2 ASN 108.A OD1 ASN 51.A HD21 2.992 2.228 THR 52.A OG1 LYS 49.A O THR 52.A HG1 2.841 2.020 LEU 53.A N VAL 175.A O LEU 53.A H 2.753 1.932 LEU 54.A N LEU 103.A O LEU 54.A H 2.700 1.859 LEU 55.A N VAL 173.A O LEU 55.A H 2.849 2.000 HIS 57.A N PHE 101.A O HIS 57.A H 3.156 2.336 HIS 57.A ND1 LEU 55.A O HIS 57.A HD1 3.069 2.212 HIS 58.A N PHE 130.A O HIS 58.A H 3.154 2.386 ASP 60.A N GLU 128.A O ASP 60.A H 3.087 2.302 SER 61.A N SER 59.A OG SER 61.A H 3.208 2.360 SER 61.A OG ASP 60.A OD1 SER 61.A HG 2.931 2.135 ASP 62.A N ILE 119.A O ASP 62.A H 3.209 2.582 LEU 63.A N ILE 95.A O LEU 63.A H 2.992 2.134 LEU 64.A N PHE 117.A O LEU 64.A H 2.976 2.118 VAL 65.A N ILE 93.A O VAL 65.A H 2.910 2.079 LEU 66.A N LEU 115.A O LEU 66.A H 3.060 2.426 VAL 67.A N ASP 91.A O VAL 67.A H 2.924 2.074 LEU 68.A N ARG 113.A O LEU 68.A H 3.050 2.370 GLU 69.A N ARG 113.A O GLU 69.A H 3.251 2.448 ALA 72.A N LEU 87.A O ALA 72.A H 2.822 2.006 ILE 73.A N ILE 104.A O ILE 73.A H 2.971 2.141 LEU 74.A N TYR 85.A O LEU 74.A H 2.885 2.077 VAL 75.A N TYR 102.A O VAL 75.A H 3.086 2.242 LEU 76.A N ASP 83.A O LEU 76.A H 2.790 1.996 VAL 77.A N PRO 100.A O VAL 77.A H 2.770 1.910 ASN 78.A N GLY 81.A O ASN 78.A H 3.050 2.265 ASN 78.A ND2 ASP 83.A OD2 ASN 78.A HD21 3.368 2.744 GLY 81.A N ASN 78.A OD1 GLY 81.A H 2.915 2.081 ASP 83.A N LEU 76.A O ASP 83.A H 2.873 2.076 TYR 85.A N LEU 74.A O TYR 85.A H 2.813 1.998 LEU 87.A N ALA 72.A O LEU 87.A H 2.687 1.841 ASP 88.A N ASP 91.A OD2 ASP 88.A H 2.938 2.123 GLY 90.A N VAL 67.A O GLY 90.A H 2.759 1.900 ASP 91.A N ASP 88.A O ASP 91.A H 2.960 2.135 ALA 92.A N PHE 182.A O ALA 92.A H 2.760 1.937 ILE 93.A N VAL 65.A O ILE 93.A H 2.821 2.034 LYS 94.A N GLN 208.A OE1 LYS 94.A H 2.788 1.979 ILE 95.A N LEU 63.A O ILE 95.A H 2.781 2.027 ALA 97.A N ASP 62.A OD1 ALA 97.A H 2.871 2.060 GLY 98.A N SER 59.A O GLY 98.A H 3.024 2.234 THR 99.A N GLN 96.A O THR 99.A H 3.272 2.436 PHE 101.A N HIS 57.A O PHE 101.A H 2.877 2.073 TYR 102.A N VAL 75.A O TYR 102.A H 3.158 2.400 LEU 103.A N LEU 54.A O LEU 103.A H 3.382 2.594 ILE 104.A N ILE 73.A O ILE 104.A H 3.037 2.294 ASN 105.A N THR 52.A O ASN 105.A H 3.040 2.261 ASN 105.A ND2 SER 48.A O ASN 105.A HD22 3.487 2.775 ASN 105.A ND2 LYS 49.A O ASN 105.A HD22 3.175 2.504 ASN 105.A ND2 GLN 110.A O ASN 105.A HD21 2.953 2.146 ASN 109.A N ASP 107.A OD1 ASN 109.A H 3.075 2.347 LEU 112.A N SER 48.A O LEU 112.A H 2.768 1.918 ARG 113.A N GLU 69.A O ARG 113.A H 2.962 2.121 ARG 113.A NH1 GLU 69.A OE1 ARG 113.A HH11 3.228 2.386 ARG 113.A NH1 ASN 242.A OD1 ARG 113.A HH12 3.334 2.557 ARG 113.A NH2 ASN 242.A OD1 ARG 113.A HH22 3.268 2.471 ILE 114.A N TYR 46.A O ILE 114.A H 3.005 2.221 LEU 115.A N LEU 66.A O LEU 115.A H 2.824 1.985 LYS 116.A N LEU 44.A O LYS 116.A H 2.963 2.148 PHE 117.A N LEU 64.A O PHE 117.A H 2.890 2.095 ALA 118.A N ARG 42.A O ALA 118.A H 2.850 2.071 ILE 119.A N ASP 62.A O ILE 119.A H 2.758 1.936 THR 120.A N ASP 40.A O THR 120.A H 2.968 2.128 THR 120.A OG1 SER 61.A OG THR 120.A HG1 3.315 2.574 THR 120.A OG1 THR 126.A O THR 120.A HG1 3.457 2.898 ARG 122.A NE ASP 60.A OD2 ARG 122.A HE 2.905 2.239 ARG 122.A NH2 ASP 60.A OD2 ARG 122.A HH21 3.095 2.490 THR 126.A N ARG 123.A O THR 126.A H 3.025 2.183 GLU 128.A N ASP 60.A OD1 GLU 128.A H 2.900 2.092 PHE 130.A N HIS 58.A O PHE 130.A H 2.792 1.979 LEU 132.A N PRO 56.A O LEU 132.A H 3.344 2.504 SER 134.A OG LEU 166.A O SER 134.A HG 2.576 1.836 THR 135.A N LEU 138.A O THR 135.A H 2.866 2.050 THR 135.A OG1 LEU 138.A O THR 135.A HG1 2.770 1.952 LYS 136.A N GLU 171.A O LYS 136.A H 3.302 2.464 SER 140.A OG LEU 132.A O SER 140.A HG 2.606 1.824 LEU 142.A N SER 140.A OG LEU 142.A H 3.327 2.497 SER 143.A N SER 140.A O SER 143.A H 3.014 2.247 SER 143.A OG SER 140.A O SER 143.A HG 2.655 1.838 ALA 144.A N TYR 141.A O ALA 144.A H 3.361 2.555 PHE 145.A N LEU 142.A O PHE 145.A H 3.257 2.436 PHE 149.A N SER 146.A OG PHE 149.A H 3.363 2.503 LEU 150.A N SER 146.A O LEU 150.A H 3.215 2.357 GLU 151.A N LYS 147.A O GLU 151.A H 3.083 2.236 ALA 152.A N ASN 148.A O ALA 152.A H 2.912 2.053 SER 153.A N PHE 149.A O SER 153.A H 2.803 2.037 SER 153.A OG PHE 149.A O SER 153.A HG 2.580 1.830 TYR 154.A N LEU 150.A O TYR 154.A H 3.137 2.303 SER 156.A N GLU 151.A O SER 156.A H 3.269 2.494 SER 156.A OG TYR 154.A O SER 156.A HG 3.013 2.180 TYR 158.A N GLU 151.A OE2 TYR 158.A H 2.788 2.065 ILE 161.A N PRO 157.A O ILE 161.A H 3.226 2.378 GLU 162.A N TYR 158.A O GLU 162.A H 2.708 1.867 GLN 163.A N ASP 159.A O GLN 163.A H 3.079 2.234 THR 164.A N GLU 160.A O THR 164.A H 2.955 2.360 THR 164.A OG1 GLU 160.A O THR 164.A HG1 2.638 1.839 LEU 165.A N ILE 161.A O LEU 165.A H 2.851 2.087 LEU 166.A N GLU 162.A O LEU 166.A H 3.040 2.331 GLN 167.A N GLU 162.A O GLN 167.A H 2.814 2.050 VAL 175.A N LEU 53.A O VAL 175.A H 2.970 2.139 LYS 176.A NZ PRO 50.A O LYS 176.A HZ2 3.340 2.457 MET 177.A N ASN 51.A O MET 177.A H 2.804 1.948 PHE 182.A N ALA 92.A O PHE 182.A H 3.021 2.242 ASN 183.A ND2 GLN 89.A O ASN 183.A HD21 3.023 2.226 ASN 183.A ND2 ASP 91.A OD1 ASN 183.A HD22 2.892 2.053 LEU 184.A N GLY 90.A O LEU 184.A H 3.009 2.205 ARG 185.A N ASN 183.A OD1 ARG 185.A H 3.312 2.476 SER 186.A N ASN 183.A O SER 186.A H 3.104 2.285 SER 186.A OG ASN 183.A O SER 186.A HG 2.546 1.732 ILE 190.A N LEU 198.A O ILE 190.A H 2.965 2.235 ASN 193.A N GLY 196.A O ASN 193.A H 3.095 2.285 ASN 193.A ND2 SER 339.A O ASN 193.A HD22 3.283 2.728 ASN 193.A ND2 PHE 341.A O ASN 193.A HD21 2.528 1.847 TYR 195.A N ASN 193.A OD1 TYR 195.A H 3.003 2.150 LYS 197.A N GLN 220.A O LYS 197.A H 2.901 2.130 LEU 198.A N TYR 191.A O LEU 198.A H 2.899 2.115 TYR 199.A N CYS 218.A O TYR 199.A H 3.022 2.226 ILE 201.A N LEU 216.A O ILE 201.A H 2.893 2.115 LYS 205.A N THR 202.A O LYS 205.A H 2.954 2.108 GLN 208.A NE2 LYS 180.A O GLN 208.A HE22 2.472 1.808 LEU 209.A N ASN 206.A O LEU 209.A H 3.220 2.565 LEU 209.A N ASN 206.A OD1 LEU 209.A H 3.138 2.367 ARG 210.A N ASN 206.A O ARG 210.A H 3.028 2.272 ARG 210.A NH2 GLU 204.A O ARG 210.A HH21 3.312 2.506 LEU 212.A N LEU 209.A O LEU 212.A H 2.918 2.302 ASP 213.A N ARG 210.A O ASP 213.A H 3.262 2.496 LEU 215.A N GLY 291.A O LEU 215.A H 2.863 2.069 LEU 216.A N ILE 201.A O LEU 216.A H 3.122 2.356 ASN 217.A N GLY 289.A O ASN 217.A H 2.999 2.208 ASN 217.A ND2 GLU 200.A OE1 ASN 217.A HD22 2.703 1.880 CYS 218.A N TYR 199.A O CYS 218.A H 3.144 2.447 LEU 219.A N MET 287.A O LEU 219.A H 2.940 2.148 GLN 220.A N LYS 197.A O GLN 220.A H 3.094 2.249 MET 221.A N LEU 285.A O MET 221.A H 2.967 2.128 ASN 222.A N TYR 195.A O ASN 222.A H 3.015 2.198 ASN 222.A ND2 ASN 194.A O ASN 222.A HD22 3.074 2.529 GLU 223.A N ASP 284.A OD1 GLU 223.A H 2.989 2.152 GLY 224.A N ALA 281.A O GLY 224.A H 2.679 1.843 ALA 225.A N ASN 222.A O ALA 225.A H 2.916 2.094 LEU 226.A N VAL 342.A O LEU 226.A H 2.801 1.986 PHE 227.A N LEU 279.A O PHE 227.A H 2.759 1.922 VAL 228.A N TYR 340.A O VAL 228.A H 2.974 2.122 HIS 230.A N VAL 277.A O HIS 230.A H 3.019 2.211 HIS 230.A ND1 VAL 228.A O HIS 230.A HD1 2.886 2.064 TYR 231.A N ASN 300.A O TYR 231.A H 3.098 2.328 SER 233.A N GLU 298.A O SER 233.A H 2.916 2.195 ARG 234.A N ASN 297.A OD1 ARG 234.A H 3.223 2.370 ALA 235.A N ASN 297.A OD1 ALA 235.A H 2.970 2.130 THR 236.A N VAL 292.A O THR 236.A H 3.189 2.533 VAL 237.A N ILE 271.A O VAL 237.A H 3.122 2.312 ILE 238.A N ILE 290.A O ILE 238.A H 2.786 1.957 LEU 239.A N ILE 269.A O LEU 239.A H 2.889 2.058 VAL 240.A N VAL 288.A O VAL 240.A H 2.916 2.089 ALA 241.A N ASP 267.A O ALA 241.A H 2.986 2.184 ASN 242.A N ASN 286.A O ASN 242.A H 3.263 2.493 ASN 242.A ND2 ASN 286.A OD1 ASN 242.A HD22 3.614 2.864 GLU 243.A N ASN 286.A O GLU 243.A H 3.087 2.233 ARG 245.A N SER 283.A OG ARG 245.A H 3.020 2.255 ALA 246.A N LEU 263.A O ALA 246.A H 3.106 2.349 GLU 247.A N LYS 280.A O GLU 247.A H 2.810 2.111 VAL 248.A N ALA 261.A O VAL 248.A H 2.823 1.981 GLU 249.A N ALA 278.A O GLU 249.A H 2.993 2.148 LEU 250.A N TYR 259.A O LEU 250.A H 3.167 2.436 VAL 251.A N PRO 276.A O VAL 251.A H 2.937 2.094 GLY 252.A N ARG 257.A O GLY 252.A H 3.115 2.295 LEU 256.A N GLN 255.A OE1 LEU 256.A H 2.986 2.289 ARG 257.A N GLY 252.A O ARG 257.A H 3.238 2.382 ARG 257.A NH1 ARG 258.A O ARG 257.A HH12 3.539 2.878 TYR 259.A N LEU 250.A O TYR 259.A H 2.659 1.806 ALA 261.A N VAL 248.A O ALA 261.A H 3.010 2.318 LEU 263.A N ALA 246.A O LEU 263.A H 2.834 2.024 SER 264.A N ASP 267.A OD2 SER 264.A H 3.128 2.272 GLU 265.A N GLU 265.A OE1 GLU 265.A H 2.924 2.101 GLY 266.A N ALA 241.A O GLY 266.A H 2.936 2.084 ASP 267.A N SER 264.A O ASP 267.A H 2.888 2.049 ILE 268.A N PHE 6.A O ILE 268.A H 2.981 2.172 ILE 269.A N LEU 239.A O ILE 269.A H 3.023 2.287 VAL 270.A N TYR 4.A O VAL 270.A H 2.809 1.976 ILE 271.A N VAL 237.A O ILE 271.A H 2.772 1.918 SER 273.A N THR 236.A OG1 SER 273.A H 3.298 2.573 SER 274.A N ASN 232.A O SER 274.A H 2.700 1.941 VAL 277.A N HIS 230.A O VAL 277.A H 2.694 1.895 ALA 278.A N GLU 249.A O ALA 278.A H 2.957 2.139 LEU 279.A N PHE 227.A O LEU 279.A H 3.114 2.391 LYS 280.A N GLU 247.A O LYS 280.A H 2.762 1.951 ALA 281.A N ALA 225.A O ALA 281.A H 2.893 2.052 ALA 282.A N ARG 245.A O ALA 282.A H 3.013 2.281 LEU 285.A N MET 221.A O LEU 285.A H 3.164 2.415 ASN 286.A N GLU 243.A O ASN 286.A H 3.195 2.556 MET 287.A N LEU 219.A O MET 287.A H 2.787 1.998 VAL 288.A N VAL 240.A O VAL 288.A H 3.035 2.217 GLY 289.A N ASN 217.A O GLY 289.A H 2.743 1.890 ILE 290.A N ILE 238.A O ILE 290.A H 2.925 2.075 GLY 291.A N LEU 215.A O GLY 291.A H 2.793 1.966 VAL 292.A N THR 236.A O VAL 292.A H 2.940 2.107 ASN 293.A ND2 ARG 234.A O ASN 293.A HD22 3.221 2.362 ALA 294.A N ASP 213.A O ALA 294.A H 3.460 2.606 GLU 295.A N ASP 213.A OD1 GLU 295.A H 2.873 2.098 ASN 296.A N GLU 204.A OE2 ASN 296.A H 2.776 2.069 ASN 297.A N ALA 294.A O ASN 297.A H 3.024 2.220 ASN 297.A ND2 ASN 232.A OD1 ASN 297.A HD21 3.449 2.595 GLU 298.A N SER 233.A OG GLU 298.A H 2.922 2.217 ARG 299.A NH1 TYR 191.A OH ARG 299.A HH11 3.276 2.459 ARG 299.A NH1 GLU 200.A OE2 ARG 299.A HH12 3.565 2.789 ARG 299.A NH2 GLU 200.A OE1 ARG 299.A HH22 2.727 1.931 ARG 299.A NH2 GLU 200.A OE2 ARG 299.A HH22 3.531 2.743 ASN 300.A N TYR 231.A O ASN 300.A H 3.085 2.297 PHE 301.A N GLU 307.A O PHE 301.A H 3.163 2.369 LEU 302.A N PRO 229.A O LEU 302.A H 2.968 2.132 LYS 306.A N SER 339.A OG LYS 306.A H 3.137 2.282 ASN 308.A ND2 GLY 304.A O ASN 308.A HD22 2.934 2.106 VAL 309.A N PHE 301.A O VAL 309.A H 3.011 2.269 ILE 310.A N ASN 308.A OD1 ILE 310.A H 2.990 2.294 ARG 311.A N ASN 308.A O ARG 311.A H 2.960 2.238 ARG 311.A NH1 HIS 305.A O ARG 311.A HH11 3.377 2.640 ARG 311.A NH2 GLU 334.A OE2 ARG 311.A HH21 2.504 1.690 GLN 312.A N VAL 309.A O GLN 312.A H 3.068 2.314 ILE 313.A N ILE 310.A O ILE 313.A H 3.198 2.392 ARG 315.A NE GLU 330.A OE1 ARG 315.A HE 2.782 2.064 VAL 317.A N PRO 314.A O VAL 317.A H 3.168 2.509 SER 318.A N PRO 314.A O SER 318.A H 2.929 2.074 SER 318.A OG ILE 313.A O SER 318.A HG 3.481 3.054 SER 318.A OG PRO 314.A O SER 318.A HG 3.010 2.181 ASP 319.A N ARG 315.A O ASP 319.A H 2.881 2.043 LEU 320.A N VAL 317.A O LEU 320.A H 3.091 2.379 THR 321.A N VAL 317.A O THR 321.A H 3.012 2.193 THR 321.A OG1 VAL 317.A O THR 321.A HG1 2.915 2.082 PHE 322.A N SER 318.A O PHE 322.A H 2.886 2.070 GLU 328.A N SER 325.A OG GLU 328.A H 3.315 2.499 VAL 329.A N SER 325.A O VAL 329.A H 3.133 2.309 GLU 330.A N GLY 326.A O GLU 330.A H 3.117 2.280 GLU 331.A N GLU 327.A O GLU 331.A H 2.816 1.995 LEU 332.A N GLU 328.A O LEU 332.A H 3.135 2.368 LEU 333.A N VAL 329.A O LEU 333.A H 3.121 2.371 GLU 334.A N GLU 331.A O GLU 334.A H 3.152 2.410 SER 339.A N GLU 338.A OE2.B SER 339.A H 2.529 1.686 TYR 340.A OH GLU 307.A OE2 TYR 340.A HH 2.860 2.022 PHE 341.A N SER 339.A O PHE 341.A H 2.717 2.110 VAL 342.A N LEU 226.A O VAL 342.A H 2.893 2.077 GLY 344.A N GLY 224.A O GLY 344.A H 2.840 2.097