Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6vqd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 3.A N VAL 103.A O HIS 3.A H 2.948 2.133 HIS 3.A ND1 ASP 29.A OD2 HIS 3.A HD1 2.698 1.856 SER 4.A N ASP 29.A OD1 SER 4.A H 2.878 2.117 MET 5.A N CYS 101.A O MET 5.A H 2.848 2.026 ARG 6.A N TYR 27.A O ARG 6.A H 2.896 2.069 ARG 6.A NH1 MET 5.A O ARG 6.A HH11 3.246 2.448 ARG 6.A NH1 CYS 101.A O ARG 6.A HH12 3.288 2.710 ARG 6.A NH1 ASP 102.A OD1 ARG 6.A HH12 2.772 2.014 ARG 6.A NH2 ASP 102.A OD1 ARG 6.A HH22 2.797 2.049 TYR 7.A N TYR 99.A O TYR 7.A H 2.876 2.038 PHE 8.A N VAL 25.A O PHE 8.A H 2.897 2.043 HIS 9.A N ASN 97.A O HIS 9.A H 2.877 2.220 HIS 9.A ND1 ASN 97.A O HIS 9.A HD1 2.918 2.072 THR 10.A N ILE 23.A O THR 10.A H 2.882 2.091 SER 11.A N LEU 95.A O SER 11.A H 2.912 2.077 VAL 12.A N ARG 21.A O VAL 12.A H 2.972 2.193 SER 13.A N HIS 93.A O SER 13.A H 2.918 2.105 ARG 14.A NE GLU 19.A O ARG 14.A HE 2.826 1.996 ARG 14.A NH1 ASP 39.A OD2 ARG 14.A HH12 3.062 2.255 ARG 14.A NH2 GLU 19.A O ARG 14.A HH21 3.226 2.536 ARG 14.A NH2 ASP 39.A OD1 ARG 14.A HH22 2.878 2.063 ARG 14.A NH2 ASP 39.A OD2 ARG 14.A HH22 3.253 2.508 ARG 17.A N ARG 14.A O ARG 17.A H 2.828 2.040 ARG 21.A N VAL 12.A O ARG 21.A H 3.109 2.356 ARG 21.A NE ASP 37.A OD1 ARG 21.A HE 3.252 2.411 ARG 21.A NH2 ASP 37.A OD2 ARG 21.A HH21 2.747 1.913 PHE 22.A N SER 38.A OG PHE 22.A H 2.915 2.070 ILE 23.A N THR 10.A O ILE 23.A H 2.926 2.095 THR 24.A N PHE 36.A O THR 24.A H 3.010 2.188 THR 24.A OG1 PHE 8.A O THR 24.A HG1 2.746 1.969 VAL 25.A N PHE 8.A O VAL 25.A H 3.087 2.333 GLY 26.A N VAL 34.A O GLY 26.A H 2.964 2.148 TYR 27.A N ARG 6.A O TYR 27.A H 2.818 1.993 VAL 28.A N THR 31.A O VAL 28.A H 3.006 2.245 ASP 29.A N SER 4.A O ASP 29.A H 2.870 2.046 THR 31.A N VAL 28.A O THR 31.A H 2.847 2.009 PHE 33.A N GLY 26.A O PHE 33.A H 2.965 2.119 ARG 35.A N GLU 46.A O ARG 35.A H 3.042 2.257 PHE 36.A N THR 24.A O no hydrogen 2.835 N/A SER 38.A N PHE 22.A O SER 38.A H 2.888 2.068 ASP 39.A N ASP 37.A OD1 ASP 39.A H 2.896 2.055 ALA 40.A N ASP 37.A O ALA 40.A H 3.060 2.210 ARG 44.A NH2 ASP 61.A OD1 ARG 44.A HH22 2.879 2.136 GLU 45.A N THR 64.A OG1 GLU 45.A H 3.043 2.218 GLU 46.A N ARG 35.A O GLU 46.A H 2.869 2.050 ARG 48.A N PHE 33.A O ARG 48.A H 2.895 2.129 ARG 48.A NH1 GLU 46.A OE1 ARG 48.A HH12 3.161 2.478 ARG 48.A NH1 PRO 47.A O ARG 48.A HH11 2.802 2.025 ARG 48.A NH2 GLU 46.A OE1 ARG 48.A HH22 2.934 2.182 ILE 52.A N ALA 49.A O ILE 52.A H 3.258 2.445 GLU 53.A N PRO 50.A O GLU 53.A H 3.111 2.294 GLU 55.A N ILE 52.A O GLU 55.A H 3.117 2.265 GLU 58.A N GLU 58.A OE1 GLU 58.A H 2.694 1.873 TYR 59.A OH TYR 171.A OH TYR 59.A HH 2.772 1.989 TRP 60.A N GLY 56.A O TRP 60.A H 3.333 2.538 TRP 60.A NE1 GLU 55.A O TRP 60.A HE1 2.995 2.303 ASP 61.A N PRO 57.A O ASP 61.A H 2.827 1.997 ARG 62.A N GLU 58.A O ARG 62.A H 3.037 2.183 GLU 63.A N TYR 59.A O GLU 63.A H 2.991 2.138 THR 64.A N TRP 60.A O THR 64.A H 2.859 2.038 THR 64.A OG1 TRP 60.A O THR 64.A HG1 2.972 2.240 GLN 65.A N ASP 61.A O GLN 65.A H 2.973 2.148 ILE 66.A N ARG 62.A O ILE 66.A H 2.939 2.106 CYS 67.A N GLU 63.A O CYS 67.A H 2.958 2.139 CYS 67.A SG GLU 63.A O CYS 67.A HG 3.381 2.505 LYS 68.A N THR 64.A O LYS 68.A H 2.952 2.129 ALA 69.A N GLN 65.A O ALA 69.A H 2.893 2.052 LYS 70.A N ILE 66.A O LYS 70.A H 2.861 2.074 ALA 71.A N CYS 67.A O ALA 71.A H 3.001 2.190 GLN 72.A N LYS 68.A O GLN 72.A H 3.129 2.335 THR 73.A N ALA 69.A O THR 73.A H 2.926 2.083 THR 73.A OG1 ALA 69.A O THR 73.A HG1 3.333 2.585 THR 73.A OG1 LYS 70.A O THR 73.A HG1 3.085 2.556 ASP 74.A N LYS 70.A O ASP 74.A H 2.839 2.001 ARG 75.A N ALA 71.A O ARG 75.A H 3.103 2.345 GLU 76.A N GLN 72.A O GLU 76.A H 3.095 2.266 ASP 77.A N THR 73.A O ASP 77.A H 2.767 1.939 LEU 78.A N ASP 74.A O LEU 78.A H 2.850 2.061 ARG 79.A N ARG 75.A O ARG 79.A H 3.270 2.456 THR 80.A N GLU 76.A O THR 80.A H 2.993 2.158 THR 80.A OG1 GLU 76.A O THR 80.A HG1 3.057 2.242 LEU 81.A N ASP 77.A O LEU 81.A H 2.893 2.085 LEU 82.A N LEU 78.A O LEU 82.A H 3.141 2.322 ARG 83.A N ARG 79.A O ARG 83.A H 3.340 2.542 TYR 84.A N THR 80.A O TYR 84.A H 2.908 2.107 TYR 85.A N LEU 81.A O TYR 85.A H 3.044 2.293 TYR 85.A OH ASP 137.A OD1 TYR 85.A HH 3.253 2.697 TYR 85.A OH ASP 137.A OD2 TYR 85.A HH 2.724 1.891 ASN 86.A N ARG 83.A O ASN 86.A H 3.106 2.263 GLN 87.A N LEU 82.A O GLN 87.A H 2.903 2.049 ALA 90.A N SER 88.A OG ALA 90.A H 2.654 1.870 HIS 93.A N SER 13.A OG HIS 93.A H 2.840 2.004 HIS 93.A ND1 ASP 119.A OD2 HIS 93.A HD1 2.683 1.851 THR 94.A N ASP 119.A OD1 THR 94.A H 3.000 2.203 LEU 95.A N SER 11.A O LEU 95.A H 2.910 2.079 GLN 96.A N ALA 117.A O GLN 96.A H 2.958 2.106 ASN 97.A N HIS 9.A O ASN 97.A H 3.033 2.234 ASN 97.A ND2 GLN 115.A O ASN 97.A HD22 3.125 2.512 ASN 97.A ND2 ASP 116.A OD1 ASN 97.A HD22 3.394 2.804 ASN 97.A ND2 ASP 116.A OD2 ASN 97.A HD22 3.502 2.830 MET 98.A N GLN 115.A O MET 98.A H 2.939 2.126 TYR 99.A N TYR 7.A O TYR 99.A H 3.128 2.359 GLY 100.A N TYR 113.A O GLY 100.A H 3.129 2.362 CYS 101.A N MET 5.A O CYS 101.A H 3.092 2.369 ASP 102.A N ARG 111.A O ASP 102.A H 2.959 2.149 VAL 103.A N HIS 3.A O VAL 103.A H 2.844 2.012 GLY 104.A N ARG 108.A O GLY 104.A H 2.823 2.043 GLY 107.A N GLY 104.A O GLY 107.A H 2.761 1.914 ARG 108.A N ASP 106.A OD1 ARG 108.A H 3.053 2.204 ARG 108.A NE ASP 106.A OD2 ARG 108.A HE 2.233 1.373 LEU 110.A N ASP 102.A O LEU 110.A H 2.754 1.909 ARG 111.A NE GLY 112.A O ARG 111.A HE 3.176 2.374 ARG 111.A NH1 GLY 112.A O ARG 111.A HH11 3.205 2.429 TYR 113.A N GLY 100.A O TYR 113.A H 2.801 2.081 TYR 113.A OH ASP 102.A OD2 TYR 113.A HH 2.694 1.875 GLN 115.A N MET 98.A O GLN 115.A H 2.829 2.011 ASP 116.A N ILE 124.A O ASP 116.A H 2.881 2.112 ALA 117.A N GLN 96.A O ALA 117.A H 2.898 2.093 TYR 118.A N LYS 121.A O TYR 118.A H 2.891 2.167 TYR 118.A OH GLN 87.A OE1 TYR 118.A HH 2.695 1.866 ASP 119.A N THR 94.A O ASP 119.A H 2.838 1.989 LYS 121.A N TYR 118.A O LYS 121.A H 3.047 2.215 TYR 123.A N ASP 116.A O TYR 123.A H 2.918 2.104 TYR 123.A OH THR 143.A OG1 TYR 123.A HH 2.783 1.999 ALA 125.A N THR 134.A O ALA 125.A H 2.976 2.210 LEU 126.A N HIS 114.A O LEU 126.A H 2.781 1.924 ASN 127.A N SER 132.A O ASN 127.A H 2.843 1.986 ASN 127.A ND2 SER 132.A OG ASN 127.A HD22 2.731 1.873 LEU 130.A N ASN 127.A O LEU 130.A H 2.819 1.972 SER 131.A N ASP 129.A OD1 SER 131.A H 2.738 1.881 SER 132.A N ASP 129.A OD1 SER 132.A H 2.916 2.150 SER 132.A OG ASP 129.A OD1 SER 132.A HG 3.383 2.566 SER 132.A OG ASP 129.A OD2 SER 132.A HG 2.740 2.043 THR 134.A N ALA 125.A O THR 134.A H 2.874 2.030 THR 134.A OG1 ASN 127.A OD1 THR 134.A HG1 2.607 1.886 ALA 136.A N TYR 123.A O ALA 136.A H 2.887 2.068 ALA 140.A N ASP 137.A OD1 ALA 140.A H 2.822 1.975 GLN 141.A N ASP 137.A O GLN 141.A H 3.021 2.275 ILE 142.A N ALA 139.A O ILE 142.A H 2.862 2.117 GLN 144.A N ALA 140.A O GLN 144.A H 2.831 2.017 GLN 144.A NE2 GLU 148.A OE2 GLN 144.A HE21 3.098 2.270 ARG 145.A N GLN 141.A O ARG 145.A H 3.031 2.206 LYS 146.A N ILE 142.A O LYS 146.A H 3.072 2.227 TRP 147.A N THR 143.A O TRP 147.A H 2.744 1.911 GLU 148.A N GLN 144.A O GLU 148.A H 2.734 1.901 ALA 149.A N ARG 145.A O ALA 149.A H 2.931 2.103 ALA 150.A N LYS 146.A O ALA 150.A H 3.046 2.302 ARG 151.A N GLU 148.A O ARG 151.A H 3.075 2.239 VAL 152.A N TRP 147.A O VAL 152.A H 3.023 2.173 GLU 154.A N GLU 154.A OE1.A GLU 154.A H.A 2.675 1.935 GLN 155.A N.A VAL 152.A O GLN 155.A H.A 3.029 2.499 LEU 156.A N VAL 152.A O LEU 156.A H.A 2.928 2.101 ARG 157.A N ALA 153.A O ARG 157.A H 2.811 1.977 ARG 157.A NE GLU 161.A OE1 ARG 157.A HE 3.006 2.166 ALA 158.A N GLU 154.A O ALA 158.A H 3.199 2.394 TYR 159.A N GLN 155.A O.A TYR 159.A H 3.150 2.323 TYR 159.A N GLN 155.A O.B TYR 159.A H 3.166 2.339 LEU 160.A N LEU 156.A O LEU 160.A H 2.769 1.923 GLU 161.A N ARG 157.A O GLU 161.A H 2.938 2.099 GLY 162.A N ALA 158.A O GLY 162.A H 3.003 2.389 GLY 162.A N TYR 159.A O GLY 162.A H 3.083 2.389 CYS 164.A N TYR 159.A O CYS 164.A H.A 2.981 2.114 GLU 166.A N.A GLY 162.A O GLU 166.A H.A 2.914 2.074 GLU 166.A N.B GLY 162.A O GLU 166.A H.B 2.913 2.075 TRP 167.A N GLU 163.A O TRP 167.A H 2.810 1.956 LEU 168.A N CYS 164.A O LEU 168.A H 3.091 2.245 ARG 169.A N VAL 165.A O ARG 169.A H 2.916 2.086 ARG 170.A N GLU 166.A O.A ARG 170.A H.A 3.036 2.230 ARG 170.A N GLU 166.A O.B ARG 170.A H.A 3.054 2.248 ARG 170.A NE GLU 55.A OE2 ARG 170.A HE 2.924 2.271 TYR 171.A N TRP 167.A O TYR 171.A H 2.805 1.957 LEU 172.A N LEU 168.A O LEU 172.A H 2.880 2.073 GLU 173.A N ARG 169.A O GLU 173.A H 3.099 2.308 ASN 174.A N ARG 170.A O ASN 174.A H 2.939 2.095 GLY 175.A N TYR 171.A O GLY 175.A H 2.872 2.046 LYS 176.A N GLU 173.A O LYS 176.A H 3.214 2.411 LYS 176.A NZ GLU 173.A OE2 LYS 176.A HZ3 2.926 2.056 THR 178.A N GLY 175.A O THR 178.A H.A 2.991 2.248 THR 178.A OG1 GLY 175.A O THR 178.A HG1 3.245 2.776 LEU 179.A N GLY 175.A O LEU 179.A H 2.714 1.881 GLN 180.A N LYS 176.A O GLN 180.A H 3.307 2.524 GLN 180.A NE2 LEU 172.A O GLN 180.A HE21 3.026 2.196 ARG 181.A N THR 178.A O ARG 181.A H 3.269 2.423 ARG 181.A NE ASP 183.A OD1 ARG 181.A HE 2.904 2.050 ARG 181.A NH1 GLU 177.A O ARG 181.A HH11 3.003 2.369 ARG 181.A NH2 ASP 183.A OD2 ARG 181.A HH21 3.407 2.695 ASP 183.A N TYR 209.A O ASP 183.A H 2.751 2.049 LYS 186.A N LEU 206.A O LYS 186.A H 2.798 1.967 HIS 188.A N TRP 204.A O HIS 188.A H 3.333 2.593 THR 190.A N ARG 202.A O THR 190.A H 2.960 2.135 HIS 191.A NE2 GLU 254.A OE2 HIS 191.A HE2 2.924 2.123 HIS 192.A N THR 200.A O HIS 192.A H 2.952 2.144 ILE 194.A N GLU 198.A O ILE 194.A H 3.024 2.284 SER 195.A N GLU 198.A O SER 195.A H 3.149 2.315 HIS 197.A N SER 195.A OG HIS 197.A H 2.857 2.018 ALA 199.A N VAL 249.A O ALA 199.A H 3.050 2.283 THR 200.A N HIS 192.A O THR 200.A H 2.831 1.973 LEU 201.A N VAL 247.A O LEU 201.A H 2.999 2.195 ARG 202.A N THR 190.A O ARG 202.A H 2.964 2.142 CYS 203.A N ALA 245.A O CYS 203.A H 2.749 1.908 TRP 204.A N HIS 188.A O TRP 204.A H 2.857 2.018 ALA 205.A N LYS 243.A O ALA 205.A H 2.893 2.066 LEU 206.A N LYS 186.A O LEU 206.A H 2.928 2.168 PHE 208.A N PHE 241.A O PHE 208.A H 3.374 2.572 TYR 209.A N ASP 183.A O TYR 209.A H 2.981 2.199 ALA 211.A N ASP 30.A OD2 ALA 211.A H 2.797 1.937 THR 214.A N GLN 262.A O THR 214.A H 3.086 2.248 THR 216.A N HIS 260.A O THR 216.A H 2.967 2.178 TRP 217.A NE1 ALA 245.A O TRP 217.A HE1 2.981 2.137 GLN 218.A N THR 258.A O GLN 218.A H 2.796 1.954 GLN 218.A NE2 ASP 223.A OD1 GLN 218.A HE21 3.205 2.516 ARG 219.A N GLU 222.A O ARG 219.A H 2.856 2.042 ARG 219.A NH1 GLU 253.A OE1 ARG 219.A HH12 2.924 2.208 ARG 219.A NH1 TYR 257.A OH ARG 219.A HH11 2.653 1.928 ARG 219.A NH2 GLU 253.A OE1 ARG 219.A HH22 2.937 2.227 ASP 220.A N ARG 256.A O ASP 220.A H 2.927 2.104 GLU 222.A N ARG 219.A O GLU 222.A H 2.880 2.026 GLN 224.A N TRP 217.A O GLN 224.A H 2.829 2.001 ASP 227.A N GLN 224.A O ASP 227.A H 2.954 2.243 THR 228.A OG1 GLN 224.A O THR 228.A HG1 2.652 1.845 GLU 229.A N ALA 246.A O GLU 229.A H 2.795 1.959 VAL 231.A N TRP 244.A O VAL 231.A H 3.351 2.530 ARG 234.A N GLN 242.A O ARG 234.A H 2.948 2.127 ARG 234.A NE GLN 242.A OE1 ARG 234.A HE 2.981 2.180 ARG 234.A NH2 GLN 242.A OE1 ARG 234.A HH21 3.069 2.314 ALA 236.A N THR 240.A O ALA 236.A H 2.865 2.006 ARG 239.A NE ASP 183.A OD2 ARG 239.A HE 3.100 2.443 ARG 239.A NH1 ARG 181.A O ARG 239.A HH12 3.014 2.235 ARG 239.A NH1 ASP 183.A OD2 ARG 239.A HH11 2.609 1.796 ARG 239.A NH2 THR 178.A O ARG 239.A HH22 2.998 2.151 THR 240.A N ASP 238.A OD1 THR 240.A H 2.949 2.110 THR 240.A OG1 ASP 238.A OD1 THR 240.A HG1 2.692 1.867 PHE 241.A N PHE 208.A O PHE 241.A H 2.831 2.087 GLN 242.A N ARG 234.A O GLN 242.A H 2.831 2.078 LYS 243.A N ALA 205.A O LYS 243.A H 2.947 2.153 LYS 243.A NZ VAL 231.A O LYS 243.A HZ2 2.757 2.047 LYS 243.A NZ THR 233.A OG1 LYS 243.A HZ3 2.963 2.243 ALA 245.A N CYS 203.A O ALA 245.A H 3.048 2.272 ALA 246.A N GLU 229.A O ALA 246.A H 2.833 2.062 VAL 247.A N LEU 201.A O VAL 247.A H 3.003 2.207 VAL 249.A N ALA 199.A O VAL 249.A H 2.800 1.961 SER 251.A N HIS 197.A O SER 251.A H 3.020 2.168 GLY 252.A N GLU 254.A OE1 GLY 252.A H 2.915 2.222 GLU 253.A N PRO 250.A O GLU 253.A H 2.934 2.096 GLU 254.A N GLU 254.A OE1 GLU 254.A H 2.825 2.050 GLN 255.A NE2 TRP 274.A O GLN 255.A HE22 3.207 2.348 ARG 256.A N GLU 253.A O ARG 256.A H 2.977 2.168 ARG 256.A NE ASP 220.A OD1 ARG 256.A HE 2.921 2.063 ARG 256.A NE ASP 220.A OD2 ARG 256.A HE 3.308 2.669 ARG 256.A NH2 ASP 220.A OD2 ARG 256.A HH21 2.616 1.770 TYR 257.A N GLU 254.A O TYR 257.A H 3.062 2.221 THR 258.A N GLN 218.A O THR 258.A H 2.904 2.103 THR 258.A OG1 HIS 260.A NE2 THR 258.A HG1 2.890 2.393 CYS 259.A N LEU 272.A O CYS 259.A H 2.790 1.958 CYS 259.A SG THR 216.A O no hydrogen 3.809 N/A HIS 260.A N THR 216.A O HIS 260.A H 2.788 1.962 VAL 261.A N LEU 270.A O VAL 261.A H 2.915 2.109 GLN 262.A N THR 214.A O GLN 262.A H 2.998 2.169 HIS 263.A NE2 PRO 210.A O HIS 263.A HE2 2.881 2.029 GLY 265.A N HIS 263.A ND1 GLY 265.A H 2.997 2.148 LEU 266.A N HIS 263.A O LEU 266.A H 2.823 1.975 LEU 270.A N VAL 261.A O LEU 270.A H 2.897 2.142 LEU 272.A N CYS 259.A O LEU 272.A H 2.726 1.915 ARG 273.A NH2.B GLN 255.A O ARG 273.A HH22.B 3.051 2.370 ARG 273.A NH2.B GLN 255.A OE1 ARG 273.A HH21.B 3.490 2.822