Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6vqp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ASP 5.A N ASP 5.A OD1 ASP 5.A H 2.789 2.150 MET 6.A N PRO 3.A O MET 6.A H 3.128 2.277 VAL 7.A N ILE 54.A O VAL 7.A H 2.865 2.030 ARG 8.A NE ASP 51.A OD2 ARG 8.A HE 2.782 1.944 ARG 8.A NH2 ASP 51.A OD2 ARG 8.A HH21 3.161 2.461 ILE 9.A N TYR 52.A O ILE 9.A H 2.770 1.926 GLY 11.A N ASP 51.A OD1 GLY 11.A H 2.679 1.842 GLY 12.A N LEU 49.A O GLY 12.A H 2.916 2.128 PHE 14.A N VAL 47.A O PHE 14.A H 2.857 2.061 GLN 16.A N ILE 45.A O GLN 16.A H 2.925 2.168 GLN 16.A NE2 TYR 232.A OH GLN 16.A HE21 2.886 2.034 GLY 17.A N GLU 143.A OE2 GLY 17.A H 2.774 1.930 SER 18.A N GLU 41.A O SER 18.A H 2.862 2.042 THR 22.A N PRO 19.A O THR 22.A H 3.031 2.376 THR 22.A OG1 TYR 151.A OH THR 22.A HG1 2.727 2.062 ASP 24.A N GLU 20.A O ASP 24.A H 2.917 2.076 TRP 25.A N ARG 21.A O TRP 25.A H 2.940 2.146 LEU 26.A N THR 22.A O LEU 26.A H 2.872 2.075 ASP 27.A N LEU 23.A O ASP 27.A H 2.953 2.159 ARG 28.A N ASP 24.A O ARG 28.A H 3.210 2.493 ARG 28.A N TRP 25.A O ARG 28.A H 3.132 2.473 GLU 29.A N TRP 25.A O GLU 29.A H 3.016 2.400 GLU 29.A N LEU 26.A O GLU 29.A H 3.119 2.402 GLN 31.A NE2 LEU 26.A O GLN 31.A HE21 3.199 2.368 GLN 31.A NE2 PHE 33.A O GLN 31.A HE22 3.037 2.232 PHE 33.A N GLN 31.A OE1 PHE 33.A H 2.841 2.022 ARG 35.A NH1 ASP 24.A OD1 ARG 35.A HH12 2.753 1.987 ARG 35.A NH1 ASP 27.A OD2 ARG 35.A HH11 2.963 2.171 ARG 35.A NH2 GLU 20.A OE1 ARG 35.A HH21 2.851 2.049 ARG 35.A NH2 ASP 24.A OD1 ARG 35.A HH22 2.953 2.250 TRP 37.A N PRO 34.A O TRP 37.A H 2.853 2.005 PHE 38.A N ARG 35.A O PHE 38.A H 2.798 1.948 THR 39.A OG1 ARG 237.A O THR 39.A HG1 2.596 1.827 GLU 41.A N PHE 38.A O GLU 41.A H 2.955 2.101 THR 42.A N THR 39.A O THR 42.A H 2.974 2.211 THR 42.A OG1 THR 39.A O THR 42.A HG1 2.665 1.945 GLN 44.A NE2 GLY 17.A O GLN 44.A HE21 3.085 2.309 ILE 45.A N GLN 16.A O ILE 45.A H 2.993 2.234 VAL 47.A N PHE 14.A O VAL 47.A H 2.862 2.082 THR 48.A OG1 THR 13.A OG1 THR 48.A HG1 2.877 2.074 LEU 49.A N GLY 12.A O LEU 49.A H 2.914 2.071 TYR 52.A N ILE 9.A O TYR 52.A H 3.119 2.330 LEU 53.A N ARG 288.A O LEU 53.A H 2.943 2.117 ILE 54.A N VAL 7.A O ILE 54.A H 3.008 2.195 ASP 55.A N CYS 286.A O ASP 55.A H 2.851 1.998 ARG 56.A N ASP 5.A O ARG 56.A H 2.923 2.065 ARG 56.A NH1 GLY 4.A O ARG 56.A HH12 2.895 2.044 GLN 58.A NE2 GLU 223.A OE2 GLN 58.A HE21 2.829 2.026 VAL 59.A N PHE 284.A O VAL 59.A H 2.890 2.067 THR 60.A N GLN 63.A OE1 THR 60.A H 3.192 2.378 VAL 61.A N HIS 115.A O VAL 61.A H 2.925 2.192 ALA 62.A N ASP 113.A O ALA 62.A H 2.936 2.089 GLN 63.A N THR 60.A OG1 GLN 63.A H 3.089 2.268 PHE 64.A N THR 60.A O PHE 64.A H 2.947 2.102 ALA 65.A N VAL 61.A O ALA 65.A H 2.812 1.975 ALA 66.A N ALA 62.A O ALA 66.A H 3.115 2.341 PHE 67.A N GLN 63.A O PHE 67.A H 3.222 2.404 VAL 68.A N PHE 64.A O VAL 68.A H 2.943 2.107 SER 69.A N ALA 65.A O SER 69.A H 2.749 1.896 ARG 70.A N ALA 66.A O ARG 70.A H 3.069 2.284 THR 71.A N PHE 67.A O THR 71.A H 2.961 2.284 THR 71.A N VAL 68.A O THR 71.A H 3.258 2.569 THR 71.A OG1 PHE 67.A O THR 71.A HG1 2.819 2.293 GLY 72.A N VAL 68.A O GLY 72.A H 2.646 1.847 TYR 73.A N THR 71.A OG1 TYR 73.A H 3.135 2.334 TYR 73.A OH ASP 124.A OD1 TYR 73.A HH 2.651 1.856 THR 75.A N GLU 78.A OE1 THR 75.A H 2.910 2.052 THR 75.A OG1 GLU 78.A OE1 THR 75.A HG1 2.755 1.916 SER 76.A N ASP 124.A OD1 SER 76.A H 3.046 2.244 ARG 79.A N THR 75.A O ARG 79.A H 3.058 2.224 ALA 80.A N SER 76.A O ALA 80.A H 2.852 2.074 GLY 81.A N GLU 78.A O GLY 81.A H 3.228 2.457 SER 83.A N ARG 94.A O SER 83.A H 3.150 2.346 SER 83.A OG HIS 119.A ND1 SER 83.A HG 2.800 2.310 MET 84.A N SER 278.A O MET 84.A H 3.408 2.593 VAL 85.A N GLU 92.A O VAL 85.A H 2.789 1.948 GLY 87.A N TYR 90.A O GLY 87.A H 2.905 2.069 GLU 92.A N VAL 85.A O GLU 92.A H 2.702 1.851 ARG 94.A N SER 83.A O ARG 94.A H 2.770 1.942 ARG 94.A NH2 GLU 92.A OE1 ARG 94.A HH21 2.915 2.218 GLY 96.A N GLY 81.A O GLY 96.A H 2.799 1.941 ALA 97.A N ARG 94.A O ALA 97.A H 3.163 2.318 CYS 98.A N ARG 101.A O.A CYS 98.A H 3.163 2.371 CYS 98.A N ARG 101.A O.B CYS 98.A H 3.191 2.402 HIS 100.A NE2 GLU 78.A OE2 HIS 100.A HE2 3.003 2.184 ARG 101.A N.A CYS 98.A O ARG 101.A H.A 2.946 2.204 ARG 101.A N.B CYS 98.A O ARG 101.A H.B 2.952 2.206 ARG 101.A NE.A GLY 96.A O ARG 101.A HE.A 3.214 2.396 ALA 103.A N SER 107.A OG ALA 103.A H 2.968 2.213 GLY 104.A N ARG 101.A O.A GLY 104.A H 2.827 1.975 GLY 104.A N ARG 101.A O.B GLY 104.A H 2.799 1.949 TYR 105.A N GLU 95.A O TYR 105.A H 3.306 2.502 SER 107.A N GLY 104.A O SER 107.A H 3.030 2.287 SER 107.A OG GLY 104.A O SER 107.A HG 2.725 1.889 ARG 112.A N ILE 109.A O ARG 112.A H 3.058 2.217 HIS 115.A N ARG 112.A O HIS 115.A H 3.159 2.324 HIS 115.A ND1 THR 198.A OG1 HIS 115.A HD1 2.696 1.836 VAL 117.A N VAL 59.A O VAL 117.A H 2.940 2.125 HIS 119.A N ASN 279.A O HIS 119.A H 2.928 2.165 HIS 119.A NE2 PRO 102.A O HIS 119.A HE2 2.714 1.866 SER 121.A N ASP 124.A OD2 SER 121.A H 2.953 2.100 SER 121.A OG SER 76.A OG SER 121.A HG 2.669 1.946 ASP 124.A N SER 121.A OG ASP 124.A H 3.041 2.191 ALA 125.A N SER 121.A O ALA 125.A H 3.020 2.193 GLU 126.A N PHE 122.A O GLU 126.A H 3.063 2.237 ALA 127.A N ALA 123.A O ALA 127.A H 2.800 1.973 TYR 128.A N ASP 124.A O TYR 128.A H 2.969 2.118 ALA 129.A N ALA 125.A O ALA 129.A H 2.958 2.099 ARG 130.A N GLU 126.A O ARG 130.A H 2.903 2.054 TRP 131.A N ALA 127.A O TRP 131.A H 2.930 2.076 ALA 132.A N TYR 128.A O ALA 132.A H 2.786 1.985 GLY 133.A N ARG 130.A O GLY 133.A H 2.928 2.082 ARG 134.A N ALA 129.A O ARG 134.A H 2.811 1.968 ARG 134.A NH1 ASP 5.A OD1 ARG 134.A HH12 3.465 2.831 ARG 134.A NH1 ASP 5.A OD2 ARG 134.A HH12 2.724 1.873 ARG 134.A NH2 ASP 5.A OD1 ARG 134.A HH22 2.897 2.101 ARG 134.A NH2 ASP 5.A OD2 ARG 134.A HH22 3.479 2.861 ARG 135.A N ALA 287.A O ARG 135.A H 3.067 2.393 ARG 135.A NH1 LEU 136.A O ARG 135.A HH11 3.154 2.406 ARG 135.A NH1 GLU 141.A OE1 ARG 135.A HH12 2.773 1.919 ARG 135.A NH1 GLU 141.A OE2 ARG 135.A HH12 3.416 2.763 ARG 135.A NH2 GLU 141.A OE2 ARG 135.A HH22 3.021 2.257 ARG 135.A NH2 ASP 289.A OD1 ARG 135.A HH21 2.736 1.974 THR 138.A N GLU 141.A OE1 THR 138.A H 3.045 2.225 GLU 139.A N THR 227.A OG1 GLU 139.A H 2.659 1.803 SER 140.A OG GLN 16.A OE1 SER 140.A HG 2.649 1.815 GLU 141.A N THR 138.A OG1 GLU 141.A H 3.028 2.179 TRP 142.A N THR 138.A O TRP 142.A H 2.915 2.124 TRP 142.A NE1 GLU 223.A OE1 TRP 142.A HE1 3.004 2.155 GLU 143.A N GLU 139.A O GLU 143.A H 2.933 2.090 ARG 144.A N SER 140.A O ARG 144.A H 2.988 2.130 ARG 144.A NH1 ARG 144.A O ARG 144.A HH11 2.880 2.038 ARG 144.A NH1 ASP 212.A OD2 ARG 144.A HH12 2.805 2.025 ALA 145.A N GLU 141.A O ALA 145.A H 3.112 2.287 ALA 146.A N TRP 142.A O ALA 146.A H 2.971 2.276 ALA 146.A N GLU 143.A O ALA 146.A H 2.851 2.236 THR 147.A N GLU 143.A O THR 147.A H 2.803 1.965 THR 147.A OG1 SER 150.A O THR 147.A HG1 3.110 2.326 GLY 148.A N ARG 144.A O GLY 148.A H 3.047 2.291 ARG 152.A N THR 147.A OG1 ARG 152.A H 2.952 2.161 ARG 152.A NH1 PRO 155.A O ARG 152.A HH11 2.953 2.120 LEU 153.A N ASP 158.A OD1 LEU 153.A H 2.877 2.055 TRP 154.A N GLY 157.A O TRP 154.A H 3.105 2.277 TRP 154.A NE1 ARG 261.A O TRP 154.A HE1 3.028 2.223 TRP 156.A NE1 THR 159.A O TRP 156.A HE1 2.882 2.085 GLY 157.A N TRP 154.A O GLY 157.A H 2.987 2.175 TRP 160.A NE1 SER 162.A OG TRP 160.A HE1 2.737 1.925 ARG 163.A N ASP 161.A OD1 no hydrogen 3.049 N/A ARG 163.A NE ASP 161.A OD1 no hydrogen 3.012 N/A ARG 163.A NE ASP 161.A OD2 no hydrogen 3.448 N/A ARG 163.A NH2 ASP 161.A OD2 no hydrogen 2.829 N/A ASN 164.A N ASP 161.A O ASN 164.A H 3.154 2.314 ASN 166.A ND2 GLN 197.A O ASN 166.A HD21 3.000 2.150 ASN 166.A ND2 THR 199.A OG1 ASN 166.A HD22 3.280 2.684 ASN 166.A ND2 ASN 220.A OD1 ASN 166.A HD22 3.042 2.259 ALA 168.A N ASN 259.A O ALA 168.A H 2.909 2.124 GLU 169.A N THR 167.A OG1 GLU 169.A H 3.089 2.347 HIS 170.A N THR 167.A O HIS 170.A H 3.126 2.387 ALA 172.A N ALA 168.A O ALA 172.A H 2.798 1.940 GLY 173.A N GLU 169.A O GLY 173.A H 2.940 2.124 ALA 174.A N HIS 170.A O ALA 174.A H 2.811 2.006 LEU 175.A N THR 171.A O LEU 175.A H 3.071 2.298 GLY 176.A N ALA 172.A O GLY 176.A H 3.202 2.589 GLY 176.A N GLY 173.A O GLY 176.A H 3.156 2.424 ALA 180.A N ASP 177.A OD2 ALA 180.A H 2.596 1.761 TRP 181.A N ASP 177.A O TRP 181.A H 3.020 2.207 ARG 182.A N LEU 178.A O ARG 182.A H 2.810 2.060 THR 183.A N ASP 179.A O THR 183.A H 2.845 2.022 TRP 184.A N ALA 180.A O TRP 184.A H 2.800 1.973 TRP 185.A N TRP 181.A O TRP 185.A H 2.877 2.041 TRP 185.A NE1 GLU 88.A O TRP 185.A HE1 2.956 2.148 GLY 186.A N ARG 182.A O GLY 186.A H 3.246 2.423 ALA 187.A N THR 183.A O ALA 187.A H 2.977 2.141 ILE 188.A N TRP 184.A O ILE 188.A H 2.917 2.094 HIS 189.A N GLY 186.A O HIS 189.A H 3.091 2.366 HIS 189.A ND1 TRP 185.A O HIS 189.A HD1 2.754 1.895 ALA 190.A N GLY 186.A O ALA 190.A H 3.020 2.265 ALA 190.A N ALA 187.A O ALA 190.A H 3.130 2.544 VAL 191.A N ALA 187.A O VAL 191.A H 2.871 2.050 THR 199.A N ASN 220.A OD1 THR 199.A H 2.871 2.058 VAL 201.A N ASP 114.A O VAL 201.A H 2.952 2.113 GLY 202.A N ASP 216.A OD2 GLY 202.A H 2.840 1.990 ALA 203.A N PRO 200.A O ALA 203.A H 3.098 2.311 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 3.218 2.367 SER 205.A OG ASP 209.A OD1 SER 205.A HG 2.773 1.963 ARG 207.A NH1 ASN 164.A OD1 ARG 207.A HH11 2.720 1.873 GLY 208.A N PHE 204.A O GLY 208.A H 3.018 2.176 ASP 209.A N PRO 206.A O ASP 209.A H 3.163 2.314 SER 210.A N CYS 214.A O SER 210.A H 2.946 2.147 SER 210.A OG ALA 145.A O SER 210.A HG 2.844 2.182 GLY 213.A N SER 210.A O GLY 213.A H 2.915 2.106 CYS 214.A N SER 210.A OG CYS 214.A H 3.115 2.308 ALA 215.A N ARG 56.A O ALA 215.A H 2.910 2.057 GLY 219.A N GLY 254.A O GLY 219.A H 2.949 2.174 ASN 220.A N ASN 166.A O ASN 220.A H 2.975 2.148 ASN 220.A ND2 GLN 58.A OE1 ASN 220.A HD22 3.183 2.530 ASN 220.A ND2 THR 199.A O ASN 220.A HD21 3.099 2.301 TYR 222.A N ALA 281.A O TYR 222.A H 2.834 2.147 GLU 223.A N ARG 253.A O GLU 223.A H 2.917 2.197 TRP 224.A N GLY 283.A O TRP 224.A H 3.149 2.348 TRP 224.A NE1 ILE 120.A O TRP 224.A HE1 2.835 1.982 THR 225.A N VAL 251.A O THR 225.A H 2.992 2.193 THR 225.A OG1 VAL 251.A O THR 225.A HG1 2.993 2.168 SER 226.A N PRO 137.A O SER 226.A H 2.850 2.040 THR 227.A N THR 225.A OG1 THR 227.A H 3.208 2.361 ALA 229.A N SER 249.A O ALA 229.A H 2.829 1.986 HIS 230.A ND1 LEU 231.A O HIS 230.A HD1 3.117 2.338 ALA 235.A N SER 233.A OG ALA 235.A H 3.256 2.400 THR 236.A N SER 233.A O THR 236.A H 3.051 2.199 THR 236.A OG1 THR 42.A O THR 236.A HG1 2.775 1.996 CYS 238.A N HIS 243.A NE2 CYS 238.A H 2.924 2.076 ASP 239.A N ASP 36.A O ASP 239.A H 2.891 2.113 THR 241.A N ASP 239.A OD2 THR 241.A H 2.891 2.075 THR 241.A OG1 ASP 239.A OD2 THR 241.A HG1 2.641 1.887 ILE 242.A N ASP 239.A O ILE 242.A H 2.867 2.171 HIS 243.A N ASP 239.A O HIS 243.A H 3.284 2.493 LEU 244.A N PRO 240.A O LEU 244.A H 2.973 2.243 VAL 245.A N ILE 242.A O VAL 245.A H 3.113 2.304 MET 246.A N HIS 243.A O MET 246.A H 3.040 2.203 GLY 247.A N ALA 229.A O GLY 247.A H 2.834 1.979 ARG 248.A N VAL 245.A O ARG 248.A H 3.035 2.254 SER 249.A N VAL 245.A O SER 249.A H 2.943 2.104 ARG 250.A N GLY 272.A O ARG 250.A H 3.002 2.223 ARG 250.A NH1 SER 226.A O ARG 250.A HH11 2.830 2.104 VAL 251.A N THR 227.A O VAL 251.A H 2.806 2.022 ILE 252.A N LEU 270.A O ILE 252.A H 2.703 1.852 ARG 253.A N GLU 223.A O ARG 253.A H 2.769 1.963 ARG 253.A NE GLU 139.A OE2 ARG 253.A HE 2.976 2.234 ARG 253.A NH1 CYS 266.A O ARG 253.A HH12 2.810 2.185 ARG 253.A NH2 GLU 139.A OE2 ARG 253.A HH21 2.789 1.999 ARG 253.A NH2 GLU 143.A OE1 ARG 253.A HH22 2.802 1.944 SER 256.A N ASN 259.A OD1 SER 256.A H 2.789 2.095 SER 256.A OG ASN 259.A OD1 SER 256.A HG 3.094 2.364 TRP 257.A N ASN 220.A O TRP 257.A H 2.852 2.109 MET 258.A N SER 256.A OG MET 258.A H 3.062 2.252 ASN 259.A N SER 256.A O ASN 259.A H 3.079 2.224 ARG 261.A N GLU 169.A OE2 ARG 261.A H 2.807 1.968 ARG 261.A NE GLU 169.A OE2 ARG 261.A HE 2.830 1.972 ARG 261.A NH2 GLU 169.A OE1 ARG 261.A HH21 2.951 2.110 TYR 262.A OH GLU 29.A OE1 TYR 262.A HH 2.553 1.915 GLN 263.A N PHE 260.A O GLN 263.A H 3.248 2.537 VAL 264.A N ARG 261.A O VAL 264.A H 3.254 2.404 ARG 265.A NE TYR 262.A O ARG 265.A HE 2.723 1.905 ARG 265.A NH1 GLU 41.A OE1 ARG 265.A HH12 2.758 1.907 ARG 265.A NH2 GLU 41.A OE1 ARG 265.A HH22 3.511 2.894 ARG 265.A NH2 GLU 41.A OE2 ARG 265.A HH22 2.816 1.982 ARG 265.A NH2 TYR 262.A O ARG 265.A HH21 3.252 2.590 CYS 266.A N LEU 153.A O CYS 266.A H 2.915 2.105 GLU 268.A N.A ARG 265.A O GLU 268.A H.A 3.091 2.272 GLU 268.A N.B ARG 265.A O GLU 268.A H.B 3.089 2.272 ARG 269.A NE GLU 139.A OE2 ARG 269.A HE 2.772 1.960 ARG 269.A NH1 ASP 40.A O ARG 269.A HH11 2.883 2.083 ARG 269.A NH1 HIS 230.A O ARG 269.A HH12 2.802 2.064 ARG 269.A NH2 GLU 139.A OE1 ARG 269.A HH21 3.030 2.290 ARG 269.A NH2 HIS 230.A O ARG 269.A HH22 2.722 1.954 LEU 270.A N ILE 252.A O LEU 270.A H 3.149 2.534 TYR 271.A OH ASP 40.A OD2 TYR 271.A HH 2.680 1.948 GLY 272.A N ARG 250.A O GLY 272.A H 2.901 2.080 THR 275.A N ASP 273.A OD1 THR 275.A H 2.853 2.051 PHE 280.A N MET 84.A O PHE 280.A H 2.971 2.309 ALA 281.A N ASN 279.A OD1 ALA 281.A H 2.748 1.923 LEU 282.A N ASN 279.A O LEU 282.A H 3.356 2.549 GLY 283.A N TYR 222.A O GLY 283.A H 2.802 1.945 ARG 285.A NE GLU 223.A OE1 ARG 285.A HE 2.897 2.043 ARG 285.A NH1 ASP 55.A O ARG 285.A HH11 3.172 2.329 ARG 285.A NH1 ARG 56.A O ARG 285.A HH12 2.867 2.305 ARG 285.A NH1 ALA 215.A O ARG 285.A HH12 3.166 2.444 ARG 285.A NH2 ALA 215.A O ARG 285.A HH22 2.883 2.069 ARG 285.A NH2 GLU 223.A OE2 ARG 285.A HH21 2.753 1.905 CYS 286.A N ASP 55.A OD2 CYS 286.A H 2.916 2.105 ALA 287.A N ARG 135.A O ALA 287.A H 2.733 1.887 ARG 288.A N LEU 53.A O ARG 288.A H 2.982 2.190 ARG 288.A NE ASP 289.A O ARG 288.A HE 2.963 2.105 ARG 288.A NH2 VAL 290.A O ARG 288.A HH21 2.901 2.141