Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6vrp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N SER 25.A O.A GLN 3.A H 2.938 2.112 GLN 3.A N SER 25.A O.B GLN 3.A H 2.889 2.063 VAL 5.A N ALA 23.A O VAL 5.A H 2.934 2.134 GLU 6.A N GLN 107.A OE1 GLU 6.A H 2.881 2.025 SER 7.A N.A SER 21.A O.A SER 7.A H.A 3.161 2.383 SER 7.A N.A SER 21.A O.B SER 7.A H.A 2.995 2.230 SER 7.A N.B SER 21.A O.A SER 7.A H.B 3.147 2.363 SER 7.A N.B SER 21.A O.B SER 7.A H.B 2.976 2.208 VAL 12.A N THR 112.A O VAL 12.A H 2.903 2.097 GLY 15.A N LEU 87.A O GLY 15.A H 2.689 1.836 GLY 16.A N GLN 13.A O GLY 16.A H 2.969 2.170 LEU 18.A N MET 84.A O LEU 18.A H.B 2.891 2.100 LEU 20.A N LEU 82.A O LEU 20.A H 2.834 2.001 SER 21.A N.A SER 7.A O.A SER 21.A H.A 2.940 2.096 SER 21.A N.A SER 7.A O.B SER 21.A H.A 2.934 2.089 SER 21.A N.B SER 7.A O.A SER 21.A H.B 2.960 2.124 SER 21.A N.B SER 7.A O.B SER 21.A H.B 2.953 2.118 CYS 22.A N ALA 80.A O CYS 22.A H.A 2.706 1.974 ALA 23.A N VAL 5.A O ALA 23.A H 2.850 1.997 ALA 24.A N ASN 78.A O ALA 24.A H 3.002 2.144 SER 25.A N.A GLN 3.A O SER 25.A H.A 2.906 2.164 SER 25.A N.B GLN 3.A O SER 25.A H.B 2.911 2.166 LEU 29.A N ASN 78.A OD1 LEU 29.A H.A 2.816 1.986 SER 30.A N SER 28.A OG.B SER 30.A H 3.388 2.628 THR 31.A N SER 28.A O.A THR 31.A H 3.272 2.426 THR 31.A N SER 28.A O.B THR 31.A H 3.316 2.472 ILE 34.A N THR 31.A O ILE 34.A H 3.255 2.427 GLY 35.A N SER 100.A O GLY 35.A H 3.000 2.162 VAL 36.A N ILE 53.A O VAL 36.A H 2.885 2.086 THR 37.A N ALA 98.A O THR 37.A H 2.824 2.023 TRP 38.A N ALA 51.A O TRP 38.A H 2.849 2.031 VAL 39.A N TYR 96.A O VAL 39.A H 2.861 2.032 ARG 40.A N GLU 48.A O ARG 40.A H 2.879 2.072 ARG 40.A NE GLU 48.A OE1 ARG 40.A HE 2.890 2.067 ARG 40.A NH1 ASP 91.A OD1 ARG 40.A HH12 2.809 1.971 ARG 40.A NH1 TYR 95.A OH ARG 40.A HH11 2.969 2.150 ARG 40.A NH2 GLU 48.A OE1 ARG 40.A HH21 3.217 2.514 GLN 41.A N VAL 94.A O GLN 41.A H 2.925 2.200 GLN 41.A NE2 LYS 45.A O GLN 41.A HE21 3.122 2.383 LYS 45.A N ALA 42.A O LYS 45.A H 2.930 2.113 GLU 48.A N ARG 40.A O GLU 48.A H 2.868 2.063 TRP 49.A NE1 THR 52.A OG1 TRP 49.A HE1 2.859 2.014 LEU 50.A N TRP 38.A O LEU 50.A H 2.875 2.055 THR 52.A N ARG 60.A O THR 52.A H 2.974 2.180 THR 52.A OG1 THR 37.A OG1 THR 52.A HG1 2.744 1.969 ILE 53.A N VAL 36.A O ILE 53.A H 2.888 2.062 TRP 54.A N ASP 58.A O TRP 54.A H 2.911 2.093 TRP 55.A N ILE 34.A O TRP 55.A H 2.913 2.240 ASP 57.A N TRP 54.A O ASP 57.A H 2.931 2.120 ARG 60.A N THR 52.A O ARG 60.A H 2.990 2.201 ALA 62.A N LEU 50.A O ALA 62.A H 2.866 2.117 SER 64.A OG GLU 48.A OE2 SER 64.A HG 2.769 2.053 VAL 65.A N ALA 62.A O VAL 65.A H 3.284 2.437 LYS 66.A N ASP 63.A O LYS 66.A H 3.075 2.216 ARG 68.A N VAL 65.A O ARG 68.A H 3.211 2.378 ARG 68.A NH1 ASN 85.A O ARG 68.A HH11 3.279 2.578 ARG 68.A NH1 SER 86.A O ARG 68.A HH11 3.170 2.533 ARG 68.A NH1 ASP 91.A OD2 ARG 68.A HH12 2.896 2.147 ARG 68.A NH2 SER 64.A O ARG 68.A HH21 3.477 2.624 ARG 68.A NH2 ASP 91.A OD1 ARG 68.A HH22 2.973 2.123 PHE 69.A N VAL 65.A O PHE 69.A H 3.195 2.356 THR 70.A N GLN 83.A O THR 70.A H 2.817 2.038 ILE 71.A N TYR 61.A OH ILE 71.A H 2.869 2.053 SER 72.A N TYR 81.A O SER 72.A H 3.144 2.349 ASP 74.A N THR 79.A O ASP 74.A H 2.799 1.954 LYS 77.A N ASP 74.A O LYS 77.A H 3.162 2.542 LYS 77.A N ASP 74.A OD2 LYS 77.A H 2.732 2.006 ASN 78.A N THR 75.A O ASN 78.A H 2.994 2.198 ASN 78.A ND2 ALA 24.A O ASN 78.A HD22 2.984 2.236 ASN 78.A ND2 PHE 27.A O ASN 78.A HD21 2.694 1.873 THR 79.A N ASP 74.A O THR 79.A H 3.182 2.355 THR 79.A OG1 LYS 77.A O THR 79.A HG1 2.857 2.034 ALA 80.A N CYS 22.A O ALA 80.A H 2.875 2.048 TYR 81.A N SER 72.A O TYR 81.A H 2.795 1.978 LEU 82.A N LEU 20.A O LEU 82.A H 2.948 2.152 GLN 83.A N THR 70.A O GLN 83.A H 2.859 2.024 GLN 83.A NE2 ASN 85.A OD1 GLN 83.A HE21 2.961 2.176 MET 84.A N LEU 18.A O MET 84.A H 2.762 1.940 ASN 85.A N ARG 68.A O ASN 85.A H 3.033 2.245 LEU 87.A N GLY 16.A O LEU 87.A H 3.027 2.168 THR 88.A N ASP 91.A OD2 THR 88.A H 2.974 2.139 GLU 90.A N THR 88.A OG1 GLU 90.A H 3.116 2.373 ASP 91.A N THR 88.A O ASP 91.A H 2.840 1.997 THR 92.A N ALA 89.A O THR 92.A H 3.052 2.217 ALA 93.A N VAL 111.A O ALA 93.A H 3.010 2.230 VAL 94.A N GLN 41.A O VAL 94.A H 2.991 2.226 TYR 95.A N THR 109.A O TYR 95.A H 2.846 1.991 TYR 95.A OH ASP 91.A O TYR 95.A HH 2.624 1.796 TYR 96.A N VAL 39.A O TYR 96.A H 2.681 1.823 CYS 97.A N GLU 6.A OE2 CYS 97.A H 3.139 2.366 ALA 98.A N THR 37.A O ALA 98.A H 2.827 2.140 GLN 99.A N HIS 104.A O GLN 99.A H 2.861 2.046 SER 100.A N GLY 35.A O SER 100.A H 2.890 2.042 ASP 103.A N GLN 99.A O ASP 103.A H 3.311 2.593 HIS 104.A ND1 GLN 99.A OE1 HIS 104.A HD1 2.895 2.039 TRP 105.A NE1 MET 102.A O TRP 105.A HE1 2.932 2.187 GLY 106.A N CYS 97.A O GLY 106.A H 2.860 2.014 GLN 107.A N GLN 107.A OE1 GLN 107.A H 2.789 2.000 GLN 107.A NE2 GLU 6.A O GLN 107.A HE22 2.926 2.175 GLY 108.A N GLU 6.A OE2 GLY 108.A H 2.953 2.176 THR 109.A N TYR 95.A O THR 109.A H 2.971 2.192 VAL 111.A N ALA 93.A O VAL 111.A H 2.885 2.025 THR 112.A N GLY 10.A O THR 112.A H 2.951 2.103 VAL 113.A N THR 92.A OG1 VAL 113.A H 2.975 2.115 SER 114.A N VAL 12.A O SER 114.A H 3.046 2.279 GLN 120.A N SER 143.A OG GLN 120.A H 2.928 2.109 THR 122.A N ARG 141.A O THR 122.A H 2.836 1.987 GLN 123.A NE2 TYR 203.A O GLN 123.A HE22 2.758 1.973 GLN 123.A NE2 THR 219.A OG1 GLN 123.A HE21 2.975 2.308 SER 124.A N.A THR 139.A O SER 124.A H.A 2.888 2.052 SER 124.A N.B THR 139.A O SER 124.A H.B 2.897 2.067 LEU 128.A N LYS 220.A O LEU 128.A H 2.898 2.103 ALA 130.A N GLU 222.A O ALA 130.A H.A 2.904 2.118 SER 131.A N ASP 134.A OD2 SER 131.A H 2.803 1.948 GLY 133.A N LEU 195.A O GLY 133.A H 2.723 1.893 ASP 134.A N SER 131.A O ASP 134.A H 2.983 2.137 VAL 136.A N ILE 192.A O VAL 136.A H 2.910 2.084 ILE 138.A N LEU 190.A O ILE 138.A H 2.867 2.019 THR 139.A N SER 124.A O.A THR 139.A H 2.942 2.090 THR 139.A N SER 124.A O.B THR 139.A H 2.951 2.094 CYS 140.A N.A PHE 188.A O CYS 140.A H.A 2.806 2.005 CYS 140.A N.B PHE 188.A O CYS 140.A H.B 2.831 2.052 CYS 140.A N.C PHE 188.A O CYS 140.A H.C 2.872 2.213 CYS 140.A SG.A THR 139.A O no hydrogen 3.605 N/A ARG 141.A N THR 122.A O ARG 141.A H.A 2.865 2.057 ARG 141.A NH1 THR 186.A OG1 ARG 141.A HH11 2.797 1.978 ALA 142.A N THR 186.A O ALA 142.A H 2.951 2.121 SER 143.A N GLN 120.A O SER 143.A H 2.944 2.252 GLN 144.A NE2 SER 117.A O GLN 144.A HE22 3.573 3.028 SER 147.A N.A ASP 145.A OD1 SER 147.A H.A 2.852 1.997 SER 147.A N.B ASP 145.A OD1 SER 147.A H.B 2.853 2.002 TYR 149.A N ILE 146.A O TYR 149.A H 3.024 2.175 LEU 150.A N SER 148.A O LEU 150.A H 2.856 2.183 ASN 151.A N GLN 206.A O ASN 151.A H 2.815 1.980 ASN 151.A ND2 GLN 206.A OE1 ASN 151.A HD22 3.002 2.146 TRP 152.A N ILE 165.A O TRP 152.A H 2.858 2.036 TYR 153.A N TYR 204.A O TYR 153.A H 2.777 1.943 TYR 153.A OH GLN 206.A OE1 TYR 153.A HH 2.851 2.017 GLN 154.A N LYS 162.A O GLN 154.A H 2.841 2.015 GLN 154.A NE2 TYR 203.A OH GLN 154.A HE21 2.988 2.159 GLN 155.A N THR 202.A O GLN 155.A H 2.700 1.882 GLN 155.A NE2 LYS 159.A O GLN 155.A HE21 2.992 2.195 LYS 156.A NZ GLU 198.A O.A LYS 156.A HZ3 2.969 2.316 LYS 156.A NZ GLU 198.A O.B LYS 156.A HZ3 2.965 2.400 LYS 159.A N LYS 156.A O LYS 159.A H 3.058 2.252 LYS 162.A N GLN 154.A O LYS 162.A H 2.678 1.863 LEU 164.A N TRP 152.A O LEU 164.A H 2.921 2.075 ILE 165.A N TRP 152.A O ILE 165.A H 3.310 2.483 TYR 166.A N SER 170.A O TYR 166.A H 2.865 2.056 THR 168.A N LEU 150.A O THR 168.A H 2.837 1.992 THR 168.A OG1 SER 148.A O THR 168.A HG1 2.767 1.958 SER 169.A N.A TYR 167.A O SER 169.A H.A 2.799 2.071 SER 169.A N.B TYR 167.A O SER 169.A H.B 2.809 2.076 SER 169.A OG.B GLY 181.A O SER 169.A HG.B 2.677 1.878 SER 170.A N TYR 166.A O SER 170.A H.A 2.919 2.124 HIS 172.A N LEU 164.A O HIS 172.A H 2.997 2.142 HIS 172.A ND1 SER 173.A O HIS 172.A HD1 2.852 2.010 VAL 175.A N HIS 172.A O VAL 175.A H 3.146 2.326 ARG 178.A NE ASP 199.A OD2 ARG 178.A HE 2.736 1.933 ARG 178.A NH2 GLU 198.A OE2.A ARG 178.A HH22 2.981 2.262 ARG 178.A NH2 ASP 199.A OD1 ARG 178.A HH21 2.881 2.026 ARG 178.A NH2 ASP 199.A OD2 ARG 178.A HH21 3.487 2.898 PHE 179.A N PRO 176.A O PHE 179.A H 3.133 2.275 SER 180.A N THR 191.A O SER 180.A H 2.961 2.167 SER 182.A N THR 189.A O SER 182.A H 2.998 2.216 ARG 183.A NE SER 148.A OG ARG 183.A HE 2.764 2.002 ARG 183.A NH1 GLY 185.A O ARG 183.A HH11 2.919 2.135 ARG 183.A NH2 SER 148.A OG ARG 183.A HH21 3.288 2.676 SER 184.A N ASP 187.A O SER 184.A H 2.775 1.946 ASP 187.A N SER 184.A O ASP 187.A H 2.976 2.132 PHE 188.A N CYS 140.A O.A PHE 188.A H 2.735 1.887 PHE 188.A N CYS 140.A O.B PHE 188.A H 2.835 2.010 PHE 188.A N CYS 140.A O.C PHE 188.A H 3.059 2.283 THR 189.A N SER 182.A O THR 189.A H 2.930 2.095 LEU 190.A N ILE 138.A O LEU 190.A H 2.757 1.951 THR 191.A N SER 180.A O THR 191.A H 2.916 2.065 ILE 192.A N VAL 136.A O ILE 192.A H 2.873 2.053 SER 193.A N ARG 178.A O SER 193.A H 2.906 2.100 LEU 195.A N ASP 134.A O LEU 195.A H 2.747 1.934 GLN 196.A N ASP 199.A OD2 GLN 196.A H 2.942 2.099 GLN 196.A NE2 SER 194.A O GLN 196.A HE21 3.083 2.238 ASP 199.A N GLN 196.A O ASP 199.A H.A 2.815 1.968 PHE 200.A N PRO 197.A O PHE 200.A H 3.465 2.625 ALA 201.A N VAL 221.A O ALA 201.A H 3.286 2.588 THR 202.A N GLN 155.A O THR 202.A H 2.960 2.108 TYR 203.A N THR 219.A O TYR 203.A H 2.894 2.101 TYR 203.A OH ASP 199.A O TYR 203.A HH 2.574 1.770 TYR 204.A N TYR 153.A O TYR 204.A H 2.859 2.042 CYS 205.A N GLN 123.A OE1 CYS 205.A H 3.393 2.573 CYS 205.A SG GLN 123.A OE1 no hydrogen 3.724 N/A GLN 206.A N ASN 151.A O GLN 206.A H 2.892 2.209 GLN 206.A NE2 GLN 207.A O GLN 206.A HE21 3.167 2.442 GLN 207.A N THR 214.A O GLN 207.A H 2.952 2.169 GLN 207.A NE2 LYS 210.A O GLN 207.A HE22 3.180 2.384 GLN 207.A NE2 THR 214.A OG1 GLN 207.A HE21 3.086 2.278 TYR 208.A N TYR 149.A O TYR 208.A H 3.042 2.225 LYS 210.A N GLN 207.A OE1 LYS 210.A H 3.283 2.478 LYS 210.A NZ SER 117.A O LYS 210.A HZ1 3.160 2.283 LYS 210.A NZ GLN 144.A OE1 LYS 210.A HZ3 3.513 2.697 THR 214.A OG1 ILE 119.A O THR 214.A HG1 2.755 1.934 GLY 216.A N CYS 205.A O GLY 216.A H 2.937 2.157 GLY 218.A N GLN 123.A OE1 GLY 218.A H 3.166 2.388 THR 219.A N TYR 203.A O THR 219.A H 2.889 2.111 THR 219.A OG1 PRO 125.A O THR 219.A HG1 2.668 1.866 LYS 220.A N SER 126.A O.A LYS 220.A H 3.023 2.223 LYS 220.A N SER 126.A O.B LYS 220.A H 3.124 2.301 VAL 221.A N ALA 201.A O VAL 221.A H 2.855 2.001 GLU 222.A N LEU 128.A O GLU 222.A H 2.848 2.021 LYS 224.A N ALA 130.A O LYS 224.A H 2.988 2.175 SER 226.A N ILE 223.A O SER 226.A H 3.016 2.361