Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6vup_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 2.A N SER 24.A O GLN 2.A H 2.932 2.115 VAL 4.A N ALA 22.A O VAL 4.A H 2.870 2.029 SER 6.A N SER 20.A O.A SER 6.A H 2.972 2.210 SER 6.A N SER 20.A O.B SER 6.A H 3.026 2.261 GLY 9.A N LEU 112.A O GLY 9.A H 2.934 2.096 VAL 11.A N THR 114.A O VAL 11.A H 2.926 2.120 GLY 14.A N LEU 86.A O GLY 14.A H 2.749 1.892 GLY 15.A N GLN 12.A O GLY 15.A H 2.942 2.135 LEU 17.A N MET 83.A O.A LEU 17.A H.B 2.998 2.220 LEU 17.A N MET 83.A O.B LEU 17.A H.B 3.023 2.272 LEU 19.A N LEU 81.A O LEU 19.A H 2.852 2.021 SER 20.A N.A SER 6.A O SER 20.A H.A 2.968 2.114 SER 20.A N.B SER 6.A O SER 20.A H.B 2.982 2.130 CYS 21.A N.A ALA 79.A O CYS 21.A H.A 2.717 1.922 CYS 21.A SG.A SER 20.A O.A no hydrogen 3.203 N/A CYS 21.A SG.A SER 20.A O.B no hydrogen 3.144 N/A ALA 22.A N VAL 4.A O ALA 22.A H.B 2.914 2.080 ALA 23.A N ASN 77.A O ALA 23.A H 2.996 2.149 SER 24.A N GLN 2.A O SER 24.A H 2.894 2.095 LEU 28.A N ASN 77.A OD1 LEU 28.A H.A 2.827 1.989 SER 29.A N SER 27.A OG.A SER 29.A H 3.174 2.364 THR 30.A N SER 27.A O.A THR 30.A H 3.141 2.284 THR 30.A N SER 27.A O.B THR 30.A H 3.188 2.331 THR 30.A OG1 SER 27.A O.A THR 30.A HG1 3.348 2.884 THR 30.A OG1 SER 27.A O.B THR 30.A HG1 3.385 2.930 ILE 33.A N THR 30.A O ILE 33.A H 3.082 2.248 GLY 34.A N SER 99.A O GLY 34.A H 2.773 1.928 VAL 35.A N ILE 52.A O VAL 35.A H 2.904 2.098 THR 36.A N ALA 97.A O THR 36.A H 2.841 2.013 TRP 37.A N ALA 50.A O TRP 37.A H 2.868 2.054 VAL 38.A N TYR 95.A O VAL 38.A H 2.905 2.081 ARG 39.A N GLU 47.A O ARG 39.A H 2.936 2.121 ARG 39.A NE GLU 47.A OE1 ARG 39.A HE 2.846 2.005 ARG 39.A NH1 ASP 90.A OD1 ARG 39.A HH12 2.871 2.061 ARG 39.A NH1 TYR 94.A OH ARG 39.A HH11 2.933 2.118 ARG 39.A NH2 GLU 47.A OE1 ARG 39.A HH21 3.256 2.561 GLN 40.A N VAL 93.A O GLN 40.A H 2.815 2.080 GLN 40.A NE2 LYS 44.A O GLN 40.A HE21 3.133 2.422 LYS 44.A N ALA 41.A O LYS 44.A H 2.902 2.069 GLU 47.A N ARG 39.A O GLU 47.A H 2.872 2.086 TRP 48.A NE1 THR 51.A OG1 TRP 48.A HE1 2.887 2.040 LEU 49.A N TRP 37.A O LEU 49.A H 2.919 2.099 THR 51.A N ARG 59.A O THR 51.A H 2.962 2.164 ILE 52.A N VAL 35.A O ILE 52.A H 2.940 2.110 TRP 53.A N ASP 57.A O TRP 53.A H 2.880 2.067 TRP 54.A N ILE 33.A O TRP 54.A H 2.884 2.215 ASP 56.A N TRP 53.A O ASP 56.A H 2.934 2.105 ASP 57.A N ASP 55.A OD1 ASP 57.A H 3.008 2.160 ASN 58.A ND2 ASP 56.A O ASN 58.A HD22 3.009 2.159 ARG 59.A N THR 51.A O ARG 59.A H 3.010 2.214 ALA 61.A N LEU 49.A O ALA 61.A H 2.819 1.982 SER 63.A OG GLU 47.A OE2 SER 63.A HG 2.902 2.180 VAL 64.A N ALA 61.A O VAL 64.A H 3.094 2.239 LYS 65.A N ALA 61.A O LYS 65.A H 3.058 2.383 ARG 67.A N VAL 64.A O ARG 67.A H 3.105 2.285 ARG 67.A NH1 SER 85.A O ARG 67.A HH11 2.937 2.161 ARG 67.A NH1 ASP 90.A OD2 ARG 67.A HH12 2.765 1.921 ARG 67.A NH2 SER 63.A O ARG 67.A HH21 2.996 2.202 ARG 67.A NH2 ASP 90.A OD1 ARG 67.A HH22 2.985 2.125 ARG 67.A NH2 ASP 90.A OD2 ARG 67.A HH22 3.466 2.836 PHE 68.A N VAL 64.A O PHE 68.A H 3.015 2.165 THR 69.A N GLN 82.A O THR 69.A H 2.955 2.169 ILE 70.A N.A TYR 60.A OH ILE 70.A H.A 2.840 1.989 ILE 70.A N.B TYR 60.A OH ILE 70.A H.B 2.876 2.034 SER 71.A N TYR 80.A O SER 71.A H.A 3.105 2.314 ASP 73.A N THR 78.A O ASP 73.A H 2.782 1.927 SER 75.A N ASP 73.A OD1 SER 75.A H 2.854 2.198 LYS 76.A N ASP 73.A O LYS 76.A H 3.281 2.594 LYS 76.A N ASP 73.A OD1 LYS 76.A H 3.251 2.529 ASN 77.A ND2 ALA 23.A O ASN 77.A HD22 3.270 2.765 ASN 77.A ND2 PHE 26.A O ASN 77.A HD21 2.867 2.021 THR 78.A N ASP 73.A O THR 78.A H 3.178 2.377 THR 78.A OG1 LYS 76.A O THR 78.A HG1 2.909 2.083 ALA 79.A N CYS 21.A O.A ALA 79.A H 2.743 1.911 ALA 79.A N CYS 21.A O.B ALA 79.A H 2.897 2.047 TYR 80.A N SER 71.A O TYR 80.A H 2.958 2.137 LEU 81.A N LEU 19.A O LEU 81.A H 2.959 2.146 GLN 82.A N THR 69.A O GLN 82.A H 2.820 1.982 GLN 82.A NE2 MET 83.A O.B GLN 82.A HE21 3.586 2.910 MET 83.A N.A LEU 17.A O MET 83.A H.A 2.822 1.978 MET 83.A N.B LEU 17.A O MET 83.A H.B 2.808 1.961 LEU 86.A N GLY 15.A O LEU 86.A H 2.981 2.127 THR 87.A N.A ASP 90.A OD2 THR 87.A H.A 2.830 2.022 THR 87.A N.B ASP 90.A OD2 THR 87.A H.B 2.851 2.037 THR 87.A OG1.A ASP 90.A OD2 THR 87.A HG1.A 2.950 2.126 ASP 90.A N THR 87.A O.A ASP 90.A H.A 2.945 2.116 ASP 90.A N THR 87.A O.B ASP 90.A H.A 2.643 1.791 THR 91.A N ALA 88.A O THR 91.A H 3.116 2.262 ALA 92.A N VAL 113.A O ALA 92.A H 2.952 2.165 VAL 93.A N GLN 40.A O VAL 93.A H 2.896 2.088 TYR 94.A N THR 111.A O TYR 94.A H 2.787 1.948 TYR 94.A OH ASP 90.A O TYR 94.A HH 2.642 1.815 TYR 95.A N VAL 38.A O TYR 95.A H 2.708 1.849 ALA 97.A N THR 36.A O ALA 97.A H 2.777 2.068 GLN 98.A N.A ASP 105.A O GLN 98.A H.A 2.849 2.031 GLN 98.A N.B ASP 105.A O GLN 98.A H.B 2.844 2.109 SER 99.A N GLY 34.A O SER 99.A H.B 2.679 1.819 SER 99.A OG THR 36.A OG1 SER 99.A HG 2.741 2.101 ASP 105.A N GLN 98.A O.A ASP 105.A H 2.932 2.082 ASP 105.A N GLN 98.A O.B ASP 105.A H 2.742 1.896 HIS 106.A N ASP 105.A OD1 HIS 106.A H 2.713 2.018 HIS 106.A ND1 GLN 98.A OE1.A HIS 106.A HD1 2.525 1.676 TRP 107.A NE1 MET 104.A O TRP 107.A HE1 3.006 2.235 GLY 108.A N CYS 96.A O GLY 108.A H 2.787 1.969 GLY 110.A N GLU 5.A OE2 GLY 110.A H 3.021 2.263 THR 111.A N TYR 94.A O THR 111.A H 3.011 2.226 THR 111.A OG1 GLY 7.A O THR 111.A HG1 2.676 1.839 VAL 113.A N ALA 92.A O VAL 113.A H 2.899 2.039 THR 114.A N GLY 9.A O THR 114.A H 2.949 2.135 VAL 115.A N THR 91.A OG1 VAL 115.A H 2.985 2.137 SER 116.A N VAL 11.A O SER 116.A H 2.938 2.151 GLY 118.A N SER 116.A OG GLY 118.A H 3.169 2.315 GLN 125.A N SER 148.A OG GLN 125.A H 2.907 2.068 THR 127.A N ARG 146.A O THR 127.A H 2.904 2.073 GLN 128.A N GLN 222.A OE1 GLN 128.A H 2.837 1.979 GLN 128.A NE2 TYR 208.A O GLN 128.A HE22 3.031 2.236 GLN 128.A NE2 THR 224.A OG1 GLN 128.A HE21 3.047 2.350 SER 129.A N THR 144.A O SER 129.A H 2.893 2.104 LEU 133.A N LYS 225.A O LEU 133.A H 2.853 2.045 ALA 135.A N GLU 227.A O ALA 135.A H.A 2.961 2.189 SER 136.A N ASP 139.A OD2 SER 136.A H 2.826 1.972 GLY 138.A N LEU 200.A O GLY 138.A H 2.742 1.898 ASP 139.A N SER 136.A O ASP 139.A H 2.980 2.153 VAL 141.A N ILE 197.A O VAL 141.A H 2.934 2.110 ILE 143.A N LEU 195.A O ILE 143.A H 2.860 2.038 THR 144.A N SER 129.A O THR 144.A H 2.950 2.090 THR 144.A OG1 SER 129.A O THR 144.A HG1 3.199 2.425 CYS 145.A N.A PHE 193.A O CYS 145.A H.A 2.878 2.129 CYS 145.A N.B PHE 193.A O CYS 145.A H.B 2.866 2.064 CYS 145.A N.C PHE 193.A O CYS 145.A H.C 2.850 2.043 CYS 145.A SG.C THR 144.A O no hydrogen 3.627 N/A ARG 146.A N THR 127.A O ARG 146.A H.A 2.916 2.124 SER 148.A N GLN 125.A O SER 148.A H 2.895 2.237 SER 152.A N.A ASP 150.A OD2 SER 152.A H.A 2.858 2.009 SER 152.A N.B ASP 150.A OD2 SER 152.A H.B 2.860 2.007 TYR 154.A N ILE 151.A O TYR 154.A H 3.039 2.191 LEU 155.A N SER 153.A O LEU 155.A H 2.834 2.163 ASN 156.A N GLN 211.A O ASN 156.A H 2.821 1.983 ASN 156.A ND2 GLN 211.A OE1 ASN 156.A HD22 2.997 2.147 TRP 157.A N ILE 170.A O TRP 157.A H 2.882 2.056 TYR 158.A N TYR 209.A O TYR 158.A H 2.790 1.965 TYR 158.A OH GLN 211.A OE1 TYR 158.A HH 2.876 2.046 GLN 159.A N LYS 167.A O GLN 159.A H 2.840 2.023 GLN 159.A NE2 TYR 208.A OH GLN 159.A HE21 2.960 2.118 GLN 160.A N THR 207.A O GLN 160.A H 2.719 1.928 GLN 160.A NE2 LYS 164.A O GLN 160.A HE21 2.971 2.179 LYS 161.A NZ GLU 203.A O LYS 161.A HZ2 3.020 2.381 LYS 161.A NZ PHE 205.A O LYS 161.A HZ3 3.105 2.497 LYS 164.A N LYS 161.A O LYS 164.A H 3.011 2.191 LYS 167.A N GLN 159.A O LYS 167.A H 2.749 1.973 LEU 169.A N TRP 157.A O LEU 169.A H 2.867 2.014 ILE 170.A N TRP 157.A O ILE 170.A H 3.354 2.531 TYR 171.A N SER 175.A O TYR 171.A H 2.851 2.041 TYR 172.A N ASN 156.A OD1 TYR 172.A H 3.302 2.559 THR 173.A N LEU 155.A O THR 173.A H 2.853 2.004 THR 173.A OG1 SER 153.A O THR 173.A HG1 2.800 2.019 SER 174.A N TYR 172.A O SER 174.A H 2.786 2.063 SER 174.A OG GLY 186.A O SER 174.A HG 2.819 2.004 SER 175.A N TYR 171.A O SER 175.A H 2.943 2.126 HIS 177.A N LEU 169.A O HIS 177.A H 2.860 2.000 HIS 177.A ND1 SER 178.A O HIS 177.A HD1 2.665 1.875 VAL 180.A N HIS 177.A O VAL 180.A H 2.968 2.124 ARG 183.A NE ASP 204.A OD2 ARG 183.A HE 2.806 1.997 ARG 183.A NH2 GLU 203.A OE1 ARG 183.A HH22 3.241 2.650 ARG 183.A NH2 ASP 204.A OD1 ARG 183.A HH21 2.883 2.027 ARG 183.A NH2 ASP 204.A OD2 ARG 183.A HH21 3.504 2.898 PHE 184.A N PRO 181.A O PHE 184.A H 3.144 2.285 SER 185.A N THR 196.A O SER 185.A H 2.941 2.137 SER 187.A N THR 194.A O SER 187.A H 2.923 2.148 ARG 188.A NH1 SER 153.A OG ARG 188.A HH11 2.604 1.910 SER 189.A N ASP 192.A O SER 189.A H 2.847 2.020 THR 191.A N SER 189.A OG THR 191.A H 3.261 2.429 ASP 192.A N SER 189.A OG ASP 192.A H 3.062 2.407 PHE 193.A N CYS 145.A O.A PHE 193.A H 2.797 2.018 PHE 193.A N CYS 145.A O.B PHE 193.A H 2.835 2.006 PHE 193.A N CYS 145.A O.C PHE 193.A H 2.811 1.986 THR 194.A N SER 187.A O THR 194.A H 2.880 2.049 LEU 195.A N ILE 143.A O LEU 195.A H 2.846 2.055 THR 196.A N SER 185.A O THR 196.A H 2.835 1.985 ILE 197.A N VAL 141.A O ILE 197.A H 2.815 1.990 SER 198.A N ARG 183.A O SER 198.A H 2.906 2.104 LEU 200.A N ASP 139.A O LEU 200.A H 2.783 2.007 GLN 201.A N ASP 204.A OD2 GLN 201.A H 2.870 2.015 GLN 201.A NE2 SER 199.A O GLN 201.A HE21 3.180 2.326 GLU 203.A N GLU 203.A OE2 GLU 203.A H 2.770 1.955 ASP 204.A N GLN 201.A O ASP 204.A H 2.824 1.980 THR 207.A N GLN 160.A O THR 207.A H 2.886 2.030 TYR 208.A N THR 224.A O TYR 208.A H 2.889 2.074 TYR 208.A OH ASP 204.A O TYR 208.A HH 2.596 1.779 TYR 209.A N TYR 158.A O TYR 209.A H 2.910 2.096 CYS 210.A N GLN 128.A OE1 CYS 210.A H 3.010 2.201 CYS 210.A SG GLN 128.A OE1 no hydrogen 3.630 N/A GLN 211.A N ASN 156.A O GLN 211.A H 2.859 2.214 GLN 211.A NE2 GLN 212.A O GLN 211.A HE21 3.096 2.442 GLN 212.A N THR 219.A O GLN 212.A H 2.982 2.207 GLN 212.A NE2 LYS 215.A O GLN 212.A HE22 3.150 2.366 GLN 212.A NE2 THR 219.A OG1 GLN 212.A HE21 3.080 2.263 TYR 213.A N TYR 154.A O TYR 213.A H 3.033 2.219 LYS 215.A N GLN 212.A OE1 LYS 215.A H 3.214 2.401 THR 219.A OG1 ILE 124.A O THR 219.A HG1 2.771 1.959 GLY 221.A N CYS 210.A O GLY 221.A H 2.883 2.088 GLN 222.A N GLN 222.A OE1 GLN 222.A H 2.792 1.996 GLN 222.A NE2 GLN 128.A O GLN 222.A HE22 2.742 1.907 GLN 222.A NE2 SER 131.A OG.A GLN 222.A HE21 3.058 2.208 THR 224.A N TYR 208.A O THR 224.A H 2.879 2.104 THR 224.A OG1 PRO 130.A O THR 224.A HG1 2.656 1.912 LYS 225.A N SER 131.A O.A LYS 225.A H 3.056 2.226 LYS 225.A N SER 131.A O.B LYS 225.A H 2.937 2.121 VAL 226.A N ALA 206.A O VAL 226.A H 2.849 1.994 GLU 227.A N LEU 133.A O GLU 227.A H 2.889 2.052 LYS 229.A N ALA 135.A O LYS 229.A H 3.280 2.552