Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6w3a_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 3.A N PHE 10.A O VAL 3.A H 2.684 1.869 VAL 5.A N ILE 8.A O VAL 5.A H 3.152 2.323 LYS 7.A N GLU 69.A OE2 LYS 7.A H 3.325 2.472 SER 9.A N MET 27.A O SER 9.A H 2.900 2.127 PHE 10.A N VAL 3.A O PHE 10.A H 3.071 2.272 ASP 14.A N CYS 11.A O ASP 14.A H 3.066 2.331 LEU 16.A N VAL 23.A O LEU 16.A H 2.656 1.816 THR 21.A N GLU 19.A O THR 21.A H 2.711 2.071 ILE 22.A N ARG 37.A O ILE 22.A H 3.208 2.362 VAL 23.A N GLY 17.A O VAL 23.A H 2.966 2.192 TYR 24.A N VAL 35.A O TYR 24.A H 2.795 1.984 ARG 25.A N ASP 14.A O ARG 25.A H 3.259 2.469 GLY 26.A N VAL 33.A O GLY 26.A H 2.850 1.996 MET 27.A N SER 9.A O MET 27.A H 2.575 1.773 MET 27.A SD ARG 31.A O no hydrogen 3.160 N/A MET 27.A SD ASP 32.A OD1 no hydrogen 3.251 N/A PHE 28.A N ARG 31.A O PHE 28.A H 3.059 2.269 ARG 31.A N PHE 28.A O ARG 31.A H 2.828 2.045 VAL 33.A N GLY 26.A O VAL 33.A H 3.214 2.364 ALA 34.A N ILE 79.A O ALA 34.A H 2.651 1.867 VAL 35.A N TYR 24.A O VAL 35.A H 2.784 1.957 LYS 36.A N ILE 77.A O LYS 36.A H 3.000 2.194 LYS 36.A NZ GLU 49.A OE1 LYS 36.A HZ1 2.941 2.056 ARG 37.A N ILE 22.A O ARG 37.A H 2.729 1.901 ILE 38.A N GLN 75.A O ILE 38.A H 3.015 2.175 CYS 42.A N LEU 39.A O CYS 42.A H 3.255 2.558 PHE 45.A N CYS 42.A O PHE 45.A H 3.087 2.445 ALA 46.A N CYS 42.A O ALA 46.A H 2.793 2.105 ASP 47.A N PHE 43.A O ASP 47.A H 3.076 2.222 GLU 49.A N PHE 45.A O GLU 49.A H 3.080 2.387 VAL 50.A N ALA 46.A O VAL 50.A H 2.657 1.821 GLN 51.A N ASP 47.A O GLN 51.A H 3.177 2.414 LEU 52.A N ARG 48.A O LEU 52.A H 3.362 2.595 LEU 53.A N GLU 49.A O LEU 53.A H 3.307 2.532 ARG 54.A N VAL 50.A O ARG 54.A H 2.962 2.152 SER 56.A N LEU 52.A O SER 56.A H 3.167 2.482 ASP 57.A N LEU 53.A O ASP 57.A H 3.148 2.472 ASN 61.A N HIS 59.A ND1 ASN 61.A H 3.069 2.232 ASN 61.A ND2 ALA 137.A O ASN 61.A HD22 3.279 2.500 VAL 62.A N HIS 59.A O VAL 62.A H 2.940 2.114 ILE 63.A N ILE 139.A O ILE 63.A H 2.870 2.040 PHE 66.A N ALA 78.A O PHE 66.A H 3.033 2.175 THR 68.A OG1 TYR 76.A O THR 68.A HG1 2.564 1.794 GLU 69.A N TYR 76.A O GLU 69.A H 3.015 2.223 GLN 75.A N ILE 38.A O GLN 75.A H 3.169 2.450 GLN 75.A NE2 THR 68.A OG1 GLN 75.A HE21 3.349 2.549 TYR 76.A N GLU 69.A O TYR 76.A H 2.988 2.283 ILE 77.A N LYS 36.A O ILE 77.A H 3.113 2.411 ALA 78.A N CYS 67.A O ALA 78.A H 2.705 1.854 ILE 79.A N ALA 34.A O ILE 79.A H 2.837 1.997 GLU 80.A N ARG 64.A O GLU 80.A H 3.105 2.324 CYS 82.A SG GLU 80.A O CYS 82.A HG 3.654 2.465 ALA 83.A N ILE 126.A O ALA 83.A H 2.761 2.078 ALA 84.A N ILE 126.A O ALA 84.A H 3.263 2.457 THR 85.A N GLU 88.A OE1 THR 85.A H 3.414 2.614 LEU 86.A N ILE 124.A O LEU 86.A H 2.684 1.957 GLN 87.A N PRO 121.A O GLN 87.A H 3.225 2.568 GLN 87.A NE2 GLU 91.A OE1 GLN 87.A HE21 3.145 2.452 GLN 87.A NE2 GLU 91.A OE2 GLN 87.A HE21 3.215 2.412 GLU 88.A N THR 85.A OG1 GLU 88.A H 3.260 2.412 TYR 89.A N THR 85.A O TYR 89.A H 3.002 2.195 VAL 90.A N GLN 87.A O VAL 90.A H 3.207 2.445 GLU 91.A N GLN 87.A O GLU 91.A H 2.747 1.905 LEU 98.A N GLU 94.A O LEU 98.A H 3.395 2.617 LEU 99.A N PRO 95.A O LEU 99.A H 3.232 2.426 GLN 100.A N ILE 96.A O GLN 100.A H 2.890 2.089 GLN 101.A N THR 97.A O GLN 101.A H 2.791 1.954 THR 102.A N LEU 98.A O THR 102.A H 2.695 1.877 THR 102.A OG1 LEU 98.A O THR 102.A HG1 2.737 1.992 THR 103.A N LEU 99.A O THR 103.A H 2.745 1.907 THR 103.A OG1 LEU 99.A O THR 103.A HG1 2.703 1.977 SER 104.A N GLN 100.A O SER 104.A H 2.797 2.006 SER 104.A OG GLN 100.A O SER 104.A HG 2.955 2.240 GLY 105.A N GLN 101.A O GLY 105.A H 2.956 2.121 LEU 106.A N THR 102.A O LEU 106.A H 2.913 2.127 ALA 107.A N THR 103.A O ALA 107.A H 2.748 1.924 HIS 108.A N SER 104.A O HIS 108.A H 3.001 2.276 HIS 108.A N GLY 105.A O HIS 108.A H 3.207 2.611 LEU 109.A N GLY 105.A O LEU 109.A H 3.180 2.380 HIS 110.A N LEU 106.A O HIS 110.A H 3.063 2.255 HIS 110.A NE2 ASP 163.A OD2 HIS 110.A HE2 2.743 1.906 SER 111.A N ALA 107.A O SER 111.A H 3.078 2.351 SER 111.A N HIS 108.A O SER 111.A H 3.117 2.515 SER 111.A OG HIS 108.A O SER 111.A HG 2.610 1.837 LEU 112.A N HIS 108.A O LEU 112.A H 3.248 2.619 LEU 112.A N LEU 109.A O LEU 112.A H 3.194 2.468 ASN 113.A N HIS 110.A O ASN 113.A H 3.043 2.257 ILE 114.A N LEU 109.A O ILE 114.A H 2.804 2.038 HIS 116.A N ASP 163.A OD2 HIS 116.A H 2.738 1.888 ARG 117.A N ASP 163.A OD1 ARG 117.A H 2.884 2.099 ASP 118.A N HIS 116.A ND1 ASP 118.A H 3.373 2.626 HIS 122.A ND1 HIS 122.A O HIS 122.A HD1 2.775 2.165 ASN 123.A N LYS 120.A O ASN 123.A H 2.707 1.942 LEU 125.A N MET 138.A O LEU 125.A H 2.879 2.021 ILE 126.A N ALA 84.A O ILE 126.A H 2.592 1.760 SER 127.A N LYS 136.A O SER 127.A H 2.948 2.101 HIS 132.A N ASN 130.A OD1 HIS 132.A H 3.175 2.375 LYS 134.A N ASN 130.A OD1 LYS 134.A H 3.021 2.212 LYS 136.A N SER 127.A OG LYS 136.A H 3.035 2.257 LYS 136.A NZ PRO 60.A O LYS 136.A HZ1 3.140 2.415 ALA 137.A N GLN 101.A OE1 ALA 137.A H 2.976 2.168 MET 138.A N LEU 125.A O MET 138.A H 2.718 1.998 ILE 139.A N ASN 61.A O ILE 139.A H 2.999 2.158 SER 140.A OG ASN 123.A O SER 140.A HG 2.593 1.785 GLY 143.A N HIS 116.A O GLY 143.A H 3.141 2.303 GLY 148.A N GLN 189.A OE1 GLY 148.A H 2.919 2.099 ILE 150.A N GLN 189.A OE1 ILE 150.A H 3.354 2.551 MET 154.A N ALA 151.A O MET 154.A H 3.241 2.439 LEU 155.A N PRO 152.A O LEU 155.A H 3.334 2.585 VAL 162.A N THR 159.A O VAL 162.A H 3.389 2.547 SER 166.A N VAL 162.A O SER 166.A H 3.336 2.509 SER 166.A OG TRP 149.A O SER 166.A HG 2.731 1.919 ALA 167.A N ASP 163.A O ALA 167.A H 2.839 2.069 GLY 168.A N ILE 164.A O GLY 168.A H 2.851 2.068 CYS 169.A N PHE 165.A O CYS 169.A H 3.223 2.446 VAL 170.A N SER 166.A O VAL 170.A H 3.149 2.314 PHE 171.A N ALA 167.A O PHE 171.A H 2.686 1.902 TYR 172.A N GLY 168.A O TYR 172.A H 3.299 2.469 TYR 173.A N CYS 169.A O TYR 173.A H 2.845 2.183 TYR 173.A N VAL 170.A O TYR 173.A H 3.083 2.482 TYR 173.A OH GLU 91.A OE2 TYR 173.A HH 3.008 2.326 VAL 174.A N VAL 170.A O VAL 174.A H 3.029 2.265 ILE 175.A N PHE 171.A O ILE 175.A H 3.240 2.392 SER 176.A N TYR 172.A O SER 176.A H 2.993 2.166 SER 176.A OG TYR 172.A O SER 176.A HG 2.506 1.815 SER 176.A OG TYR 173.A O SER 176.A HG 3.371 2.851 GLU 177.A N VAL 174.A O GLU 177.A H 3.211 2.494 GLY 178.A N TYR 173.A O GLY 178.A H 2.987 2.306 PHE 182.A N HIS 180.A ND1 PHE 182.A H 3.032 2.183 GLY 183.A N HIS 180.A O GLY 183.A H 3.045 2.192 LYS 184.A N GLN 187.A OE1 LYS 184.A H 3.234 2.554 GLN 187.A N LYS 184.A O GLN 187.A H 2.856 2.065 ARG 188.A N SER 185.A O ARG 188.A H 3.387 2.536 ARG 188.A NE GLY 183.A O ARG 188.A HE 3.055 2.281 GLN 189.A NE2 ILE 150.A O GLN 189.A HE22 3.094 2.249 ASN 191.A N GLN 187.A O ASN 191.A H 3.144 2.307 ASN 191.A ND2 PHE 182.A O ASN 191.A HD22 2.971 2.138 ILE 192.A N ARG 188.A O ILE 192.A H 2.831 2.117 LEU 193.A N GLN 189.A O LEU 193.A H 3.258 2.426 LEU 194.A N ALA 190.A O LEU 194.A H 3.210 2.397 GLY 195.A N ILE 192.A O GLY 195.A H 2.910 2.121 ALA 196.A N ASN 191.A O ALA 196.A H 2.634 1.848 SER 198.A N PRO 181.A O SER 198.A H 2.635 1.842 CYS 201.A N TYR 172.A OH CYS 201.A H 2.908 2.060 CYS 201.A SG SER 179.A OG CYS 201.A HG 3.585 2.657 LEU 202.A N LEU 199.A O LEU 202.A H 3.205 2.384 HIS 203.A N ASP 209.A OD2 HIS 203.A H 3.028 2.266 LYS 206.A NZ ASP 209.A OD2 LYS 206.A HZ2 3.184 2.587 GLU 208.A N GLU 208.A OE1 GLU 208.A H 2.645 1.828 ASP 209.A N LYS 206.A O ASP 209.A H 3.166 2.482 VAL 210.A N LYS 206.A O VAL 210.A H 3.087 2.277 ILE 211.A N HIS 207.A O ILE 211.A H 3.219 2.380 ALA 212.A N GLU 208.A O ALA 212.A H 3.140 2.322 ARG 213.A N ASP 209.A O ARG 213.A H 2.920 2.063 ARG 213.A NE GLU 217.A OE2 ARG 213.A HE 3.244 2.442 ARG 213.A NH2 GLU 217.A OE2 ARG 213.A HH21 3.243 2.455 GLU 214.A N VAL 210.A O GLU 214.A H 3.334 2.555 LEU 215.A N ILE 211.A O LEU 215.A H 3.277 2.543 LEU 215.A N ALA 212.A O LEU 215.A H 2.871 2.229 ILE 216.A N ALA 212.A O ILE 216.A H 2.785 1.951 GLU 217.A N ARG 213.A O GLU 217.A H 2.862 2.026 LYS 218.A N LEU 215.A O LYS 218.A H 3.206 2.614 MET 219.A N LEU 215.A O MET 219.A H 3.046 2.303 ILE 220.A N ILE 216.A O ILE 220.A H 2.839 2.082 ALA 221.A N LYS 218.A O ALA 221.A H 3.414 2.595 LYS 226.A N ASP 223.A O LYS 226.A H 2.889 2.037 ARG 227.A N PRO 224.A O ARG 227.A H 3.265 2.434 ARG 227.A NE ALA 221.A O ARG 227.A HE 2.758 1.998 ARG 227.A NH1 GLU 153.A OE1 ARG 227.A HH12 3.515 2.826 ARG 227.A NH1 GLU 153.A OE2 ARG 227.A HH12 2.887 2.294 ARG 227.A NH1 THR 161.A O ARG 227.A HH11 2.994 2.173 ARG 227.A NH2 GLU 153.A OE2 ARG 227.A HH22 2.457 1.724 ARG 227.A NH2 ALA 221.A O ARG 227.A HH21 2.825 2.104 HIS 232.A N SER 229.A OG HIS 232.A H 3.361 2.580 VAL 233.A N SER 229.A O VAL 233.A H 2.890 2.074 LEU 234.A N ALA 230.A O LEU 234.A H 3.154 2.370 LYS 235.A N HIS 232.A O LYS 235.A H 3.133 2.358 HIS 236.A N VAL 233.A O HIS 236.A H 2.972 2.132 HIS 236.A NE2 GLU 214.A OE1 HIS 236.A HE2 2.539 1.705 PHE 238.A N HIS 236.A ND1 PHE 238.A H 3.146 2.319 PHE 239.A N HIS 236.A O PHE 239.A H 3.009 2.150 TRP 240.A N PRO 237.A O TRP 240.A H 2.993 2.194 TRP 240.A NE1 LYS 235.A O TRP 240.A HE1 2.890 2.271 LYS 244.A NZ PRO 358.A O LYS 244.A HZ1 3.568 2.709 GLN 245.A N SER 241.A O GLN 245.A H 2.906 2.089 GLN 245.A NE2 TRP 240.A O GLN 245.A HE21 3.496 2.713 LEU 246.A N LEU 242.A O LEU 246.A H 3.049 2.207 GLN 247.A N GLU 243.A O GLN 247.A H 2.852 2.066 PHE 248.A N LYS 244.A O PHE 248.A H 2.776 2.093 PHE 248.A N GLN 245.A O PHE 248.A H 3.038 2.423 PHE 249.A N GLN 245.A O PHE 249.A H 2.981 2.243 GLN 250.A N LEU 246.A O GLN 250.A H 3.012 2.388 ASP 251.A N GLN 247.A O ASP 251.A H 3.094 2.245 VAL 252.A N PHE 248.A O VAL 252.A H 3.279 2.471 ASP 254.A N GLN 250.A O ASP 254.A H 3.177 2.588 ASP 254.A N ASP 251.A O ASP 254.A H 3.222 2.482 ARG 255.A N ASP 251.A O ARG 255.A H 3.230 2.445 ARG 255.A NE GLU 353.A OE1 ARG 255.A HE 2.966 2.148 ARG 255.A NH2 GLU 353.A OE2 ARG 255.A HH21 3.420 2.600 ILE 256.A N VAL 252.A O ILE 256.A H 3.129 2.348 GLU 257.A N ASP 254.A O GLU 257.A H 3.292 2.526 GLU 259.A N ILE 256.A O GLU 259.A H 3.049 2.278 GLY 263.A N SER 260.A O GLY 263.A H 3.085 2.251 LYS 267.A N GLY 263.A O LYS 267.A H 3.310 2.527 GLN 268.A N PRO 264.A O GLN 268.A H 3.263 2.472 LEU 269.A N ILE 265.A O LEU 269.A H 2.840 2.073 GLU 270.A N VAL 266.A O GLU 270.A H 2.825 2.047 GLY 273.A N GLU 270.A O GLY 273.A H 2.874 2.042 VAL 277.A N GLY 273.A O VAL 277.A H 3.065 2.281 LYS 278.A N ALA 275.A O LYS 278.A H 3.308 2.485 MET 279.A N ARG 274.A O MET 279.A H 2.703 1.882 ASP 280.A N LYS 278.A O ASP 280.A H 2.577 1.848 TRP 281.A N GLY 294.A O TRP 281.A H 3.114 2.367 ARG 282.A N ASP 280.A OD1 ARG 282.A H 3.324 2.475 GLU 283.A N ASP 280.A O GLU 283.A H 2.991 2.174 GLN 289.A N VAL 286.A O GLN 289.A H 2.995 2.196 SER 296.A OG GLU 270.A OE1 SER 296.A HG 2.675 2.033 VAL 297.A N GLU 270.A OE2 VAL 297.A H 3.039 2.220 ARG 298.A N GLU 270.A OE1 ARG 298.A H 2.985 2.132 ARG 298.A NH1 GLU 259.A O ARG 298.A HH12 2.839 2.273 LEU 301.A N VAL 297.A O LEU 301.A H 3.109 2.322 ARG 302.A N ARG 298.A O ARG 302.A H 2.809 2.069 ALA 303.A N ASP 299.A O ALA 303.A H 2.835 2.159 MET 304.A N LEU 300.A O MET 304.A H 3.324 2.497 ASN 306.A N ARG 302.A O ASN 306.A H 3.295 2.452 LYS 307.A N ALA 303.A O LYS 307.A H 3.037 2.205 LYS 308.A N MET 304.A O LYS 308.A H 2.987 2.289 LYS 308.A N ARG 305.A O LYS 308.A H 3.126 2.501 LYS 308.A NZ GLN 250.A OE1 LYS 308.A HZ1 2.453 1.687 HIS 309.A N ARG 305.A O HIS 309.A H 2.715 1.867 HIS 310.A N ASN 306.A O HIS 310.A H 2.916 2.207 TYR 311.A N LYS 308.A O TYR 311.A H 3.167 2.319 ARG 319.A N PRO 315.A O ARG 319.A H 2.849 2.007 ARG 319.A NH1 TYR 311.A O ARG 319.A HH11 3.050 2.303 GLU 320.A N ALA 316.A O GLU 320.A H 2.999 2.360 LEU 322.A N VAL 318.A O LEU 322.A H 3.062 2.245 CYS 330.A N ASP 326.A O CYS 330.A H 3.118 2.310 CYS 330.A SG ASP 326.A O CYS 330.A HG 3.313 2.509 TYR 331.A N PHE 328.A O TYR 331.A H 3.118 2.347 PHE 332.A N VAL 329.A O PHE 332.A H 3.104 2.386 THR 333.A N VAL 329.A O THR 333.A H 3.034 2.177 SER 334.A N CYS 330.A O SER 334.A H 3.256 2.449 SER 334.A OG CYS 330.A O SER 334.A HG 2.378 1.733 SER 334.A OG TYR 331.A O SER 334.A HG 3.430 2.931 ARG 335.A NH1 TYR 331.A O ARG 335.A HH11 3.015 2.187 PHE 336.A N PHE 332.A O PHE 336.A H 2.701 2.099 LEU 339.A N PHE 336.A O LEU 339.A H 2.908 2.069 HIS 342.A N HIS 338.A O HIS 342.A H 2.983 2.214 HIS 342.A NE2 LEU 269.A O HIS 342.A HE2 2.968 2.151 THR 343.A N LEU 339.A O THR 343.A H 2.783 1.938 THR 343.A OG1 LEU 339.A O THR 343.A HG1 2.553 1.765 TYR 344.A N LEU 340.A O TYR 344.A H 2.769 1.965 ARG 345.A N ALA 341.A O ARG 345.A H 3.373 2.583 ALA 346.A N HIS 342.A O ALA 346.A H 3.006 2.258 MET 347.A N THR 343.A O MET 347.A H 3.061 2.284 CYS 350.A N MET 347.A O CYS 350.A H 2.945 2.097 SER 351.A N GLU 348.A O SER 351.A H 3.091 2.293 SER 351.A OG GLU 348.A O SER 351.A HG 2.929 2.364 GLU 353.A N CYS 350.A O GLU 353.A H 3.043 2.316 ARG 354.A NH1 ARG 354.A O ARG 354.A HH11 2.957 2.107 PHE 356.A N GLU 353.A O PHE 356.A H 2.912 2.071 GLN 357.A NE2 HIS 362.A O GLN 357.A HE22 3.320 2.552 TYR 359.A N PHE 356.A O TYR 359.A H 2.827 2.042 TYR 359.A OH ASP 251.A OD2 TYR 359.A HH 2.951 2.123 TYR 360.A N PHE 356.A O TYR 360.A H 3.087 2.374 TYR 360.A OH TYR 344.A O TYR 360.A HH 2.610 1.808