Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6y1d_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 5.A N MET 2.A O MET 5.A H 3.063 2.223 ARG 7.A NH1 GLU 44.A OE1 ARG 7.A HH12 3.519 2.891 ARG 7.A NH1 GLU 44.A OE2 ARG 7.A HH12 2.934 2.092 ARG 7.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 7.A HH22 2.784 1.935 LEU 10.A N GLU 6.A O LEU 10.A H 2.976 2.162 ILE 11.A N.A ARG 7.A O ILE 11.A H.A 3.066 2.239 ILE 11.A N.B ARG 7.A O ILE 11.A H.B 3.093 2.290 GLN 12.A N ALA 8.A O GLN 12.A H.A 2.937 2.104 LYS 13.A N SER 9.A O LYS 13.A H 2.884 2.056 ALA 14.A N LEU 10.A O ALA 14.A H 2.837 2.024 LYS 15.A N ILE 11.A O.A LYS 15.A H 3.082 2.291 LYS 15.A N ILE 11.A O.B LYS 15.A H 3.134 2.338 LEU 16.A N GLN 12.A O LEU 16.A H 3.099 2.295 ALA 17.A N LYS 13.A O ALA 17.A H 2.783 1.947 GLU 18.A N ALA 14.A O GLU 18.A H 2.926 2.121 GLN 19.A N LYS 15.A O GLN 19.A H 3.105 2.287 ALA 20.A N LEU 16.A O ALA 20.A H 2.996 2.236 GLU 21.A N GLU 18.A O GLU 21.A H 3.019 2.180 ARG 22.A N ALA 17.A O ARG 22.A H 2.875 2.023 ARG 22.A NE ASP 25.A OD2 ARG 22.A HE 2.985 2.243 ARG 22.A NH2 ASP 25.A OD2 ARG 22.A HH21 2.878 2.113 MET 26.A N ARG 22.A O MET 26.A H 2.911 2.078 ALA 27.A N TYR 23.A O ALA 27.A H 2.875 2.059 ALA 28.A N GLU 24.A O.A ALA 28.A H 3.002 2.168 ALA 28.A N GLU 24.A O.B ALA 28.A H 2.992 2.157 PHE 29.A N ASP 25.A O PHE 29.A H 2.870 2.035 MET 30.A N MET 26.A O MET 30.A H 2.962 2.142 LYS 31.A N ALA 27.A O LYS 31.A H 2.810 1.962 LYS 31.A NZ GLU 35.A OE2 LYS 31.A HZ1 2.639 1.898 GLY 32.A N ALA 28.A O GLY 32.A H 3.024 2.185 ALA 33.A N PHE 29.A O ALA 33.A H 2.917 2.136 VAL 34.A N MET 30.A O VAL 34.A H 2.853 2.012 GLU 35.A N LYS 31.A O GLU 35.A H 2.923 2.117 LYS 36.A N ALA 33.A O LYS 36.A H 3.126 2.334 LYS 36.A NZ MET 2.A O LYS 36.A HZ3 3.360 2.655 LYS 36.A NZ MET 5.A O LYS 36.A HZ3 2.710 2.128 GLY 37.A N VAL 34.A O GLY 37.A H 2.981 2.141 SER 41.A N GLU 44.A OE1 SER 41.A H.A 2.866 2.034 GLU 44.A N SER 41.A OG GLU 44.A H 3.166 2.324 ARG 45.A N SER 41.A O ARG 45.A H 2.820 1.980 ARG 45.A NH1 LEU 40.A O.A ARG 45.A HH11 2.959 2.364 ARG 45.A NH1 LEU 40.A O.B ARG 45.A HH11 2.889 2.274 ASN 46.A N ASN 42.A O ASN 46.A H 3.058 2.238 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 2.979 2.196 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 2.982 2.145 SER 49.A N ARG 45.A O SER 49.A H 2.998 2.176 VAL 50.A N ASN 46.A O VAL 50.A H 2.853 1.998 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 3.022 2.190 TYR 52.A N LEU 48.A O TYR 52.A H 3.200 2.347 LYS 53.A N SER 49.A O LYS 53.A H 2.861 2.017 LYS 53.A NZ ASP 130.A OD2 LYS 53.A HZ3 2.933 2.075 ASN 54.A N VAL 50.A O ASN 54.A H 3.123 2.292 ASN 54.A ND2 VAL 50.A O ASN 54.A HD22 2.888 2.038 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.068 2.236 VAL 56.A N TYR 52.A O VAL 56.A H.B 2.865 2.008 GLY 57.A N LYS 53.A O GLY 57.A H 2.817 2.060 GLY 58.A N ASN 54.A O GLY 58.A H 3.131 2.319 GLN 59.A N VAL 55.A O GLN 59.A H 3.225 2.407 GLN 59.A NE2 GLU 95.A OE2.A GLN 59.A HE21 2.936 2.084 ARG 60.A N VAL 56.A O ARG 60.A H 2.796 1.970 ARG 60.A NE GLU 137.A OE1 ARG 60.A HE 2.928 2.094 ARG 60.A NH2 GLU 137.A OE1 ARG 60.A HH21 3.536 2.873 ARG 60.A NH2 GLU 137.A OE2 ARG 60.A HH21 2.871 2.059 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.030 2.188 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.057 2.224 TRP 63.A N GLN 59.A O TRP 63.A H 2.803 1.961 TRP 63.A NE1 GLU 93.A OE1 TRP 63.A HE1 2.856 2.017 ARG 64.A N ARG 60.A O ARG 64.A H 2.924 2.116 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.149 2.339 LEU 66.A N ALA 62.A O LEU 66.A H 3.018 2.186 SER 67.A N TRP 63.A O SER 67.A H.A 2.742 1.899 SER 68.A N ARG 64.A O SER 68.A H 3.005 2.184 ILE 69.A N VAL 65.A O ILE 69.A H 3.127 2.300 GLU 70.A N LEU 66.A O GLU 70.A H 2.911 2.087 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 2.859 2.051 LYS 72.A N SER 68.A O LYS 72.A H 3.000 2.157 SER 73.A N ILE 69.A O SER 73.A H 2.991 2.220 SER 73.A OG GLU 70.A O SER 73.A HG 2.653 1.833 ASN 74.A N GLN 71.A O ASN 74.A H 3.107 2.329 GLU 75.A N LYS 72.A O GLU 75.A H 3.172 2.331 SER 78.A N GLU 75.A O SER 78.A H 3.115 2.264 GLU 84.A N GLU 84.A OE1 GLU 84.A H 2.834 2.094 ARG 86.A NH1 GLU 90.A OE2 ARG 86.A HH11 3.282 2.449 GLU 87.A N PRO 83.A O GLU 87.A H 2.874 2.035 TYR 88.A N GLU 84.A O TYR 88.A H 2.916 2.084 ARG 89.A N VAL 85.A O ARG 89.A H 2.890 2.030 ARG 89.A NE GLU 70.A OE1 ARG 89.A HE 2.739 1.903 ARG 89.A NH1 GLU 93.A OE1 ARG 89.A HH11 2.963 2.239 ARG 89.A NH2 GLU 70.A OE1 ARG 89.A HH21 3.427 2.802 ARG 89.A NH2 GLU 70.A OE2 ARG 89.A HH21 2.888 2.032 GLU 90.A N ARG 86.A O GLU 90.A H 2.814 1.989 LYS 91.A N GLU 87.A O LYS 91.A H 2.882 2.123 VAL 92.A N TYR 88.A O VAL 92.A H 3.018 2.174 GLU 93.A N ARG 89.A O GLU 93.A H 2.848 2.014 THR 94.A N GLU 90.A O THR 94.A H 2.843 2.027 THR 94.A OG1 GLU 90.A O THR 94.A HG1 2.905 2.166 GLU 95.A N LYS 91.A O GLU 95.A H.B 3.107 2.291 LEU 96.A N VAL 92.A O LEU 96.A H 2.897 2.057 GLN 97.A N GLU 93.A O GLN 97.A H 2.841 1.995 GLY 98.A N THR 94.A O GLY 98.A H 2.907 2.114 VAL 99.A N GLU 95.A O VAL 99.A H 3.024 2.230 CYS 100.A N LEU 96.A O CYS 100.A H 2.984 2.136 ASP 101.A N GLN 97.A O ASP 101.A H 2.858 2.033 THR 102.A N GLY 98.A O THR 102.A H 2.937 2.143 VAL 103.A N VAL 99.A O VAL 103.A H 2.976 2.143 LEU 104.A N CYS 100.A O LEU 104.A H 2.867 2.010 GLY 105.A N ASP 101.A O GLY 105.A H 2.796 2.024 LEU 106.A N THR 102.A O LEU 106.A H 3.001 2.213 LEU 107.A N VAL 103.A O LEU 107.A H 2.980 2.159 ASP 108.A N LEU 104.A O ASP 108.A H 2.951 2.164 SER 109.A N GLY 105.A O SER 109.A H 2.898 2.263 LEU 111.A N LEU 106.A O LEU 111.A H 3.305 2.452 ILE 112.A N LEU 107.A O ILE 112.A H 2.965 2.106 ALA 115.A N ILE 112.A O ALA 115.A H 3.012 2.179 SER 120.A OG ASP 117.A O SER 120.A HG 2.972 2.406 ARG 121.A N ASP 117.A O ARG 121.A H 2.903 2.045 ARG 121.A NH1 ILE 112.A O ARG 121.A HH12 2.858 2.293 ARG 121.A NH1 ALA 115.A O ARG 121.A HH11 2.998 2.191 ARG 121.A NH2 GLU 157.A OE2 ARG 121.A HH21 3.461 2.660 VAL 122.A N ALA 118.A O VAL 122.A H 2.884 2.034 PHE 123.A N GLU 119.A O PHE 123.A H 3.409 2.603 TYR 124.A N SER 120.A O TYR 124.A H 2.977 2.170 LEU 125.A N ARG 121.A O LEU 125.A H 2.929 2.090 LYS 126.A N.A VAL 122.A O LYS 126.A H.A 2.837 1.984 LYS 126.A N.B VAL 122.A O LYS 126.A H.B 2.839 1.985 LYS 126.A NZ.B ASP 130.A OD2 LYS 126.A HZ3.B 2.911 2.062 MET 127.A N PHE 123.A O MET 127.A H.B 3.050 2.234 LYS 128.A N TYR 124.A O LYS 128.A H 2.878 2.073 GLY 129.A N LEU 125.A O GLY 129.A H 2.926 2.087 ASP 130.A N LYS 126.A O.A ASP 130.A H 2.839 2.012 ASP 130.A N LYS 126.A O.B ASP 130.A H 2.839 2.012 TYR 131.A N MET 127.A O TYR 131.A H 2.937 2.119 TYR 132.A N LYS 128.A O TYR 132.A H 3.061 2.205 ARG 133.A N GLY 129.A O ARG 133.A H 2.820 2.027 ARG 133.A NE TYR 155.A OH ARG 133.A HE 2.883 2.024 ARG 133.A NH2 ASP 130.A OD1 ARG 133.A HH21 3.225 2.403 ARG 133.A NH2 TYR 155.A OH ARG 133.A HH21 3.561 2.913 TYR 134.A N ASP 130.A O TYR 134.A H 2.889 2.102 LEU 135.A N TYR 131.A O LEU 135.A H 3.048 2.212 ALA 136.A N TYR 132.A O ALA 136.A H 2.812 2.037 GLU 137.A N ARG 133.A O GLU 137.A H 2.953 2.241 VAL 138.A N LEU 135.A O VAL 138.A H 3.236 2.468 ALA 139.A N ALA 136.A O ALA 139.A H 3.241 2.445 LYS 144.A N GLY 141.A O LYS 144.A H 3.233 2.381 ILE 147.A N ASP 143.A O ILE 147.A H 2.833 2.022 ILE 148.A N LYS 144.A O ILE 148.A H 2.934 2.084 ASP 149.A N LYS 145.A O ASP 149.A H 2.903 2.092 SER 150.A N ARG 146.A O SER 150.A H 2.893 2.112 SER 150.A OG ARG 146.A O SER 150.A HG 3.169 2.423 ALA 151.A N ILE 147.A O ALA 151.A H 3.022 2.202 ARG 152.A N ILE 148.A O ARG 152.A H.B 2.954 2.104 ARG 152.A NE.B ASP 149.A OD1 ARG 152.A HE.B 2.736 1.883 ARG 152.A NH2.B ASP 149.A OD1 ARG 152.A HH21.B 3.386 2.746 ARG 152.A NH2.B ASP 149.A OD2 ARG 152.A HH21.B 3.275 2.417 SER 153.A N ASP 149.A O SER 153.A H 2.856 2.031 ALA 154.A N SER 150.A O ALA 154.A H 3.141 2.304 TYR 155.A N ALA 151.A O TYR 155.A H 2.986 2.126 TYR 155.A OH ASP 130.A OD1 TYR 155.A HH 2.571 1.763 GLN 156.A N ARG 152.A O GLN 156.A H 2.811 2.002 GLN 156.A NE2 GLN 156.A O GLN 156.A HE21 3.354 2.842 GLN 156.A NE2 ASP 160.A OD1 GLN 156.A HE21 2.914 2.134 GLU 157.A N SER 153.A O GLU 157.A H 3.019 2.180 ALA 158.A N ALA 154.A O ALA 158.A H 3.012 2.176 MET 159.A N TYR 155.A O MET 159.A H 2.801 1.989 ASP 160.A N GLN 156.A O ASP 160.A H 2.899 2.072 ILE 161.A N GLU 157.A O ILE 161.A H 3.110 2.268 SER 162.A N ALA 158.A O SER 162.A H 2.885 2.053 LYS 163.A N MET 159.A O LYS 163.A H 2.880 2.046 LYS 164.A N ASP 160.A O LYS 164.A H.B 3.296 2.531 LYS 164.A N ILE 161.A O LYS 164.A H.B 3.110 2.524 GLU 165.A N ILE 161.A O GLU 165.A H 2.867 2.141 MET 166.A N SER 162.A O MET 166.A H.B 3.041 2.279 THR 169.A OG1 ASP 208.A OD2 THR 169.A HG1 2.741 2.020 ASN 170.A N PRO 167.A O ASN 170.A H 2.996 2.139 ILE 172.A N ASN 170.A OD1 ILE 172.A H 2.803 2.191 ARG 173.A N ASN 170.A OD1 ARG 173.A H 3.058 2.254 ARG 173.A NH1 MET 166.A O ARG 173.A HH11 2.810 2.159 LEU 174.A N ASN 170.A O LEU 174.A H 2.914 2.091 GLY 175.A N PRO 171.A O GLY 175.A H 2.937 2.095 LEU 176.A N ILE 172.A O LEU 176.A H 2.894 2.053 ALA 177.A N ARG 173.A O ALA 177.A H 3.010 2.170 LEU 178.A N LEU 174.A O LEU 178.A H 2.919 2.076 ASN 179.A N GLY 175.A O ASN 179.A H 3.017 2.200 ASN 179.A ND2 ASP 130.A OD1 ASN 179.A HD22 2.913 2.126 ASN 179.A ND2 ASP 130.A OD2 ASN 179.A HD22 3.282 2.614 PHE 180.A N LEU 176.A O PHE 180.A H 2.845 2.004 SER 181.A N ALA 177.A O SER 181.A H.A 2.879 2.050 SER 181.A OG.A ALA 194.A O SER 181.A HG.A 2.781 2.101 VAL 182.A N LEU 178.A O VAL 182.A H 3.056 2.243 PHE 183.A N ASN 179.A O PHE 183.A H 2.864 2.019 HIS 184.A N PHE 180.A O HIS 184.A H 2.880 2.060 TYR 185.A N SER 181.A O TYR 185.A H 2.942 2.139 GLU 186.A N VAL 182.A O GLU 186.A H 2.877 2.073 ILE 187.A N PHE 183.A O ILE 187.A H 2.907 2.099 ALA 188.A N PHE 183.A O ALA 188.A H 2.987 2.197 SER 190.A N HIS 184.A O SER 190.A H 2.763 1.928 SER 190.A OG ALA 188.A O SER 190.A HG 3.101 2.277 ALA 194.A N SER 190.A O ALA 194.A H 3.047 2.231 ILE 195.A N PRO 191.A O ILE 195.A H 2.929 2.108 SER 196.A N GLU 192.A O SER 196.A H.A 2.903 2.053 SER 196.A OG.B GLU 192.A O SER 196.A HG.B 3.142 2.480 LEU 197.A N GLU 193.A O LEU 197.A H 2.917 2.072 ALA 198.A N ALA 194.A O ALA 198.A H 3.025 2.183 LYS 199.A N ILE 195.A O LYS 199.A H 2.912 2.072 LYS 199.A NZ ASP 203.A OD2 LYS 199.A HZ3 2.592 1.965 THR 200.A N SER 196.A O THR 200.A H.A 2.939 2.080 THR 200.A OG1.A SER 196.A O THR 200.A HG1.A 3.252 2.634 THR 200.A OG1.B SER 196.A O THR 200.A HG1.B 2.873 2.049 THR 201.A N LEU 197.A O THR 201.A H 2.933 2.089 THR 201.A OG1 LEU 197.A O THR 201.A HG1 2.702 1.946 PHE 202.A N ALA 198.A O PHE 202.A H 2.951 2.105 ASP 203.A N LYS 199.A O ASP 203.A H 2.923 2.098 GLU 204.A N THR 200.A O GLU 204.A H 2.954 2.111 ALA 205.A N THR 201.A O ALA 205.A H 2.999 2.172 MET 206.A N PHE 202.A O MET 206.A H.A 2.885 2.042 ALA 207.A N ASP 203.A O ALA 207.A H 3.216 2.424 ASP 208.A N ALA 205.A O ASP 208.A H 2.946 2.138 LEU 209.A N MET 206.A O LEU 209.A H 3.334 2.499 HIS 210.A ND1 ALA 207.A O no hydrogen 3.150 N/A THR 211.A N ASP 208.A O THR 211.A H 3.119 2.266 THR 211.A OG1 ASP 208.A OD1 THR 211.A HG1 3.514 2.890 LEU 212.A N LEU 209.A O LEU 212.A H 3.083 2.248 SER 213.A OG SER 216.A OG SER 213.A HG 3.310 2.686 SER 216.A N SER 213.A OG SER 216.A H 3.149 2.296 TYR 217.A N SER 213.A O TYR 217.A H.B 2.828 1.980 LYS 218.A N GLU 214.A O LYS 218.A H.B 3.005 2.194 ASP 219.A N ASP 215.A O ASP 219.A H 3.094 2.283 SER 220.A N SER 216.A O SER 220.A H 2.892 2.061 SER 220.A OG THR 169.A O SER 220.A HG 2.670 1.983 THR 221.A N TYR 217.A O THR 221.A H 2.878 2.024 THR 221.A OG1 TYR 217.A O THR 221.A HG1 2.796 1.994 THR 221.A OG1 LYS 218.A O THR 221.A HG1 3.321 2.865 LEU 222.A N LYS 218.A O LEU 222.A H 3.135 2.328 MET 224.A N SER 220.A O MET 224.A H 2.985 2.146 GLN 225.A N THR 221.A O GLN 225.A H 2.959 2.183 GLN 225.A NE2 ASP 229.A OD1 GLN 225.A HE21 2.919 2.083 LEU 227.A N ILE 223.A O LEU 227.A H 3.194 2.393 ARG 228.A N MET 224.A O ARG 228.A H 2.944 2.120 ASP 229.A N GLN 225.A O ASP 229.A H 2.792 1.975 ASN 230.A N LEU 226.A O ASN 230.A H 3.091 2.279 LEU 231.A N LEU 227.A O LEU 231.A H 2.963 2.124 THR 232.A N ARG 228.A O THR 232.A H.A 2.853 2.025 THR 232.A OG1.A ARG 228.A O THR 232.A HG1.A 3.100 2.390 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 3.037 2.238 TRP 234.A N ASN 230.A O TRP 234.A H 2.887 2.189 THR 235.A N LEU 231.A O THR 235.A H 3.023 2.407