Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6y4a_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 2.A N ASP 40.A OD1 GLU 2.A H 3.013 2.126 ARG 4.A N THR 41.A O ARG 4.A H 2.768 1.870 ILE 6.A N HIS 43.A O ILE 6.A H 3.085 2.277 LEU 8.A N GLU 45.A O LEU 8.A H 3.019 2.145 TYR 9.A N GLY 21.A O TYR 9.A H 2.864 2.035 ALA 10.A N GLU 47.A O ALA 10.A H 3.030 2.216 GLU 11.A N GLY 19.A O GLU 11.A H 2.962 2.141 ARG 12.A NE ASP 51.A OD1 ARG 12.A HE 2.644 1.797 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD1 ARG 12.A HH21 3.520 2.936 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD2 ARG 12.A HH21 2.972 2.140 LEU 13.A N GLN 17.A O LEU 13.A H 2.737 1.833 GLN 17.A N ALA 14.A O GLN 17.A H 3.384 2.571 GLN 17.A NE2 ASN 157.A O GLN 17.A HE21 3.532 2.711 MET 18.A N LYS 126.A O MET 18.A H 2.965 2.074 GLY 19.A N GLU 11.A O GLY 19.A H 2.800 1.936 GLY 21.A N TYR 9.A O GLY 21.A H 2.956 2.121 GLY 25.A N GLU 11.A OE2 GLY 25.A H 2.487 1.612 ARG 26.A N GLU 23.A O ARG 26.A H 2.992 2.196 THR 28.A N TYR 20.A O THR 28.A H 3.006 2.171 GLY 31.A N TYR 129.A O GLY 31.A H 2.777 1.868 ILE 34.A N PRO 131.A O ILE 34.A H 3.216 2.319 LEU 36.A N ILE 133.A O LEU 36.A H 2.879 2.018 ASN 37.A N ASP 40.A OD2 ASN 37.A H 2.766 1.883 GLU 38.A N ARG 135.A O GLU 38.A H 2.855 1.961 GLY 39.A N THR 89.A OG1 GLY 39.A H 2.836 2.181 ASP 40.A N ASN 37.A O ASP 40.A H 2.864 1.983 THR 41.A N GLU 2.A O THR 41.A H 3.003 2.193 LEU 42.A N TRP 87.A O LEU 42.A H 2.777 1.882 HIS 43.A N ARG 4.A O HIS 43.A H 2.845 1.956 HIS 43.A ND1 THR 86.A OG1 HIS 43.A HD1 2.763 2.005 ILE 44.A N TYR 85.A O ILE 44.A H 2.718 1.845 GLU 45.A N ILE 6.A O GLU 45.A H 2.838 1.946 PHE 46.A N ARG 83.A O PHE 46.A H 2.909 2.025 GLU 47.A N LEU 8.A O GLU 47.A H 2.912 2.076 ASN 48.A N GLY 81.A O ASN 48.A H 2.931 2.088 ASN 48.A ND2 VAL 52.A O ASN 48.A HD21 2.785 1.904 ASN 48.A ND2 VAL 77.A O ASN 48.A HD22 3.156 2.359 ASN 48.A ND2 GLU 78.A O ASN 48.A HD22 3.460 2.815 THR 49.A N ALA 10.A O THR 49.A H 3.025 2.187 MET 50.A N ASN 48.A OD1 MET 50.A H 2.979 2.113 ARG 53.A NE ASP 76.A OD2 ARG 53.A HE 2.832 1.987 ARG 53.A NH2 ASP 76.A OD1 ARG 53.A HH21 2.998 2.127 ALA 54.A N VAL 77.A O ALA 54.A H 3.111 2.265 SER 55.A N ASP 112.A OD1 SER 55.A H 2.830 2.018 SER 55.A OG GLY 69.A O SER 55.A HG 2.730 1.947 HIS 57.A N HIS 111.A O HIS 57.A H 3.018 2.221 HIS 59.A N HIS 109.A O HIS 59.A H 2.858 1.949 ASP 62.A N ARG 88.A O ASP 62.A H 2.763 1.948 SER 67.A N GLU 64.A O SER 67.A H 2.769 1.880 ASP 68.A N VAL 65.A O ASP 68.A H 3.089 2.203 GLY 69.A N SER 75.A OG GLY 69.A H 2.989 2.317 THR 71.A OG1 GLU 118.A OE1 THR 71.A HG1 2.582 1.759 ASN 73.A N THR 70.A OG1 ASN 73.A H 3.148 2.290 ASN 73.A ND2 ASP 68.A OD2 ASN 73.A HD22 2.843 1.977 LYS 74.A N THR 71.A O LYS 74.A H 2.900 2.034 SER 75.A N THR 70.A O SER 75.A H 2.976 2.095 SER 75.A OG VAL 65.A O SER 75.A HG 3.118 2.378 VAL 77.A N ALA 54.A O VAL 77.A H 2.857 2.146 GLY 80.A N ASN 48.A O GLY 80.A H 2.722 2.073 GLY 81.A N GLU 78.A O GLY 81.A H 2.774 1.923 ARG 83.A N PHE 46.A O ARG 83.A H 2.903 2.046 ARG 83.A NE SER 66.A O ARG 83.A HE 3.408 2.710 ARG 83.A NH2 SER 66.A O ARG 83.A HH21 2.909 2.081 TYR 85.A N ILE 44.A O TYR 85.A H 2.920 2.147 TYR 85.A OH SER 75.A O TYR 85.A HH 2.667 1.919 TRP 87.A N LEU 42.A O TRP 87.A H 2.836 1.958 ARG 88.A N ASP 62.A O ARG 88.A H 2.637 1.735 THR 89.A N ASP 40.A O THR 89.A H 3.141 2.510 THR 89.A OG1 ASN 37.A O THR 89.A HG1 3.260 2.512 HIS 90.A ND1 ASP 62.A OD2 HIS 90.A HD1 2.626 1.768 HIS 90.A NE2 ALA 102.A O HIS 90.A HE2 2.745 1.913 GLY 93.A N ARG 101.A O GLY 93.A H 3.334 2.547 ARG 94.A NH1 GLY 98.A O ARG 94.A HH11 2.806 1.987 ARG 95.A N THR 99.A O ARG 95.A H 2.767 1.866 ARG 95.A NH1 THR 99.A OG1 ARG 95.A HH11 2.849 2.044 GLY 98.A N ARG 95.A O GLY 98.A H 2.876 2.023 THR 99.A N ASP 97.A OD1 THR 99.A H 2.973 2.073 ARG 101.A N GLY 93.A O ARG 101.A H 2.776 1.897 SER 104.A N HIS 90.A O SER 104.A H 2.909 2.014 ALA 105.A N GLU 38.A OE2 ALA 105.A H 2.882 2.040 GLY 106.A N VAL 134.A O GLY 106.A H 2.806 2.021 TRP 108.A N VAL 132.A O TRP 108.A H 2.707 1.824 TRP 108.A NE1 SER 104.A O TRP 108.A HE1 2.869 2.103 HIS 109.A NE2 ALA 221.A O HIS 109.A HE2 2.937 2.228 TYR 110.A N GLY 130.A O TYR 110.A H 2.991 2.115 HIS 111.A N HIS 57.A O HIS 111.A H 2.821 1.984 HIS 111.A ND1 ASP 112.A O HIS 111.A HD1 2.715 1.873 ASP 112.A N LEU 128.A O ASP 112.A H 3.166 2.329 HIS 113.A N SER 55.A OG HIS 113.A H 2.918 2.069 HIS 113.A ND1 HIS 113.A O HIS 113.A HD1 2.730 2.016 HIS 113.A ND1 GLU 118.A O HIS 113.A HD1 2.835 2.150 VAL 114.A N ASP 112.A OD1 VAL 114.A H 3.332 2.436 VAL 114.A N ASP 112.A OD2 VAL 114.A H 3.260 2.538 VAL 115.A N ASP 112.A OD2 VAL 115.A H 2.781 1.884 THR 117.A OG1 THR 121.A OG1 THR 117.A HG1 3.233 2.661 HIS 119.A N THR 117.A OG1 HIS 119.A H 3.125 2.260 GLY 120.A N THR 117.A O GLY 120.A H 3.033 2.137 THR 121.A N THR 117.A OG1 THR 121.A H 3.351 2.443 GLY 122.A N VAL 115.A O GLY 122.A H 2.963 2.304 GLY 123.A N VAL 115.A O GLY 123.A H 3.220 2.427 ILE 124.A N GLY 120.A O ILE 124.A H 2.875 1.966 ARG 125.A N THR 121.A O ARG 125.A H 3.037 2.153 LYS 126.A N GLY 122.A O LYS 126.A H 3.003 2.228 GLY 127.A N GLY 123.A O GLY 127.A H 2.963 2.294 GLY 127.A N ILE 124.A O GLY 127.A H 3.156 2.411 LEU 128.A N GLY 123.A O LEU 128.A H 2.806 1.900 TYR 129.A N GLY 127.A O TYR 129.A H 2.899 2.171 GLY 130.A N TYR 110.A O GLY 130.A H 2.939 2.102 VAL 132.A N TRP 108.A O VAL 132.A H 2.941 2.039 ILE 133.A N ILE 34.A O ILE 133.A H 2.909 2.054 VAL 134.A N GLY 106.A O VAL 134.A H 3.046 2.148 ARG 135.A N LEU 36.A O ARG 135.A H 2.806 1.920 ARG 135.A NE GLU 35.A OE2 ARG 135.A HE 2.837 1.968 ARG 135.A NH1 GLU 175.A OE2 ARG 135.A HH12 2.828 1.956 ARG 135.A NH2 GLU 35.A OE2 ARG 135.A HH21 3.510 2.853 ARG 135.A NH2 GLU 175.A OE1 ARG 135.A HH22 2.886 2.015 ARG 136.A N ASP 139.A OD2 ARG 136.A H 2.914 2.034 ARG 136.A NE GLU 38.A OE1 ARG 136.A HE 2.993 2.130 ARG 136.A NH2 GLU 38.A OE2 ARG 136.A HH21 2.836 1.986 ASP 139.A N ARG 136.A O ASP 139.A H 2.903 2.021 ASP 143.A N ARG 173.A O ASP 143.A H 2.678 1.859 HIS 146.A N GLU 175.A O HIS 146.A H 2.862 2.006 ILE 148.A N VAL 177.A O ILE 148.A H 2.818 1.927 VAL 149.A N ASN 156.A OD1 VAL 149.A H 2.777 1.937 PHE 150.A N ILE 179.A O PHE 150.A H 2.888 2.178 ASN 151.A N LEU 154.A O ASN 151.A H 3.024 2.234 ASN 151.A ND2 ILE 124.A O ASN 151.A HD21 3.105 2.472 ASN 151.A ND2 ARG 125.A O ASN 151.A HD21 3.369 2.799 ASN 151.A ND2 ASN 157.A OD1 ASN 151.A HD22 2.969 2.090 ASP 152.A N HIS 181.A O ASP 152.A H 2.926 2.040 LEU 154.A N ASN 151.A O LEU 154.A H 2.880 2.007 ASN 156.A N VAL 149.A O ASN 156.A H 2.891 2.037 ASN 156.A ND2 THR 147.A O ASN 156.A HD21 3.094 2.223 ASN 157.A ND2 ARG 125.A O ASN 157.A HD21 2.904 2.084 ARG 158.A N ILE 155.A O ARG 158.A H 2.973 2.068 SER 162.A N PRO 159.A O SER 162.A H 3.126 2.226 GLY 163.A N VAL 254.A O GLY 163.A H 2.959 2.092 PHE 166.A N LEU 256.A O PHE 166.A H 2.791 1.957 ALA 168.A N LEU 258.A O ALA 168.A H 2.931 2.072 THR 169.A N ASP 172.A OD2 THR 169.A H 2.825 1.922 VAL 170.A N LYS 260.A O VAL 170.A H 2.868 1.972 GLY 171.A N ALA 230.A O GLY 171.A H 2.826 1.937 ASP 172.A N THR 169.A O ASP 172.A H 2.818 1.944 ARG 173.A N ASP 143.A OD2 ARG 173.A H 2.622 1.725 ARG 173.A NH1 GLN 227.A OE1 ARG 173.A HH11 2.949 2.117 VAL 174.A N VAL 228.A O VAL 174.A H 2.753 1.852 GLU 175.A N ALA 144.A O GLU 175.A H 2.848 1.944 PHE 176.A N PHE 226.A O PHE 176.A H 2.913 2.042 VAL 177.A N HIS 146.A O VAL 177.A H 2.913 2.039 MET 178.A N PHE 224.A O MET 178.A H 2.863 1.960 ILE 179.A N ILE 148.A O ILE 179.A H 2.965 2.098 THR 180.A N ASP 222.A O THR 180.A H 3.034 2.204 HIS 181.A N PHE 150.A O HIS 181.A H 2.807 1.957 GLU 183.A N ASP 152.A OD1 GLU 183.A H 2.896 2.167 HIS 186.A N VAL 218.A O HIS 186.A H 2.812 1.969 PHE 188.A N LYS 216.A O PHE 188.A H 2.854 2.013 HIS 189.A N HIS 242.A O HIS 189.A H 3.131 2.356 HIS 189.A ND1 ASP 214.A O HIS 189.A HD1 2.776 2.041 MET 190.A N ASP 214.A O MET 190.A H 3.252 2.457 HIS 191.A N MET 240.A O HIS 191.A H 2.862 1.954 TRP 195.A N VAL 213.A O TRP 195.A H 2.925 2.067 ALA 196.A N GLY 201.A O ALA 196.A H 3.060 2.163 ASP 197.A N GLN 211.A O ASP 197.A H 2.934 2.031 ASN 198.A N ALA 196.A O ASN 198.A H 3.038 2.398 ASN 198.A ND2 MET 202.A O ASN 198.A HD21 2.985 2.104 ASN 198.A ND2 ASP 208.A OD2 ASN 198.A HD22 2.892 2.242 ARG 199.A NH1 ASP 139.A OD2 ARG 199.A HH12 3.259 2.410 ARG 199.A NH2 ASP 139.A OD1 ARG 199.A HH22 2.860 1.996 GLY 201.A N ASN 198.A O GLY 201.A H 3.360 2.535 MET 202.A N THR 200.A OG1 MET 202.A H 3.161 2.368 THR 204.A N ASP 208.A OD2 THR 204.A H 3.093 2.271 ASP 207.A N ASP 207.A OD1 ASP 207.A H 2.694 1.990 ASP 208.A N GLY 205.A O ASP 208.A H 3.111 2.243 SER 210.A N ASP 208.A OD1 SER 210.A H 3.035 2.134 VAL 213.A N TRP 195.A O VAL 213.A H 2.815 1.929 LYS 216.A N PHE 188.A O LYS 216.A H 2.960 2.196 LYS 216.A NZ ASP 197.A OD1 LYS 216.A HZ3 3.055 2.250 VAL 218.A N HIS 186.A O VAL 218.A H 2.869 1.982 GLY 219.A N ASP 222.A OD2 GLY 219.A H 2.886 1.989 ALA 221.A N THR 180.A O ALA 221.A H 2.698 1.871 ASP 222.A N GLY 219.A O ASP 222.A H 2.993 2.105 PHE 224.A N MET 178.A O PHE 224.A H 3.046 2.178 PHE 226.A N PHE 176.A O PHE 226.A H 3.058 2.264 GLN 227.A NE2 VAL 140.A O GLN 227.A HE21 2.941 2.160 GLN 227.A NE2 GLU 175.A OE2 GLN 227.A HE22 3.302 2.436 VAL 228.A N VAL 174.A O VAL 228.A H 2.859 1.996 ALA 230.A N ASP 172.A O ALA 230.A H 2.850 1.979 GLU 232.A N ILE 229.A O GLU 232.A H 3.098 2.277 VAL 234.A N GLY 231.A O VAL 234.A H 2.967 2.074 GLY 235.A N GLY 231.A O GLY 235.A H 2.794 1.909 GLY 237.A N VAL 259.A O GLY 237.A H 2.876 2.074 TRP 239.A N PHE 257.A O TRP 239.A H 2.801 1.906 TRP 239.A NE1 GLY 235.A O TRP 239.A HE1 3.031 2.215 TYR 241.A N GLY 255.A O TYR 241.A H 2.958 2.100 HIS 242.A N HIS 189.A O HIS 242.A H 2.941 2.090 HIS 242.A ND1 CYS 243.A O HIS 242.A HD1 2.828 1.988 CYS 243.A N ILE 253.A O CYS 243.A H 3.113 2.357 HIS 244.A N THR 187.A O HIS 244.A H 2.796 2.020 HIS 244.A N THR 187.A OG1 HIS 244.A H 3.208 2.477 HIS 244.A ND1 HIS 244.A O HIS 244.A HD1 2.750 2.020 HIS 248.A N VAL 245.A O HIS 248.A H 2.856 2.205 SER 249.A N VAL 245.A O SER 249.A H 3.021 2.166 ASP 250.A N GLN 246.A O ASP 250.A H 2.887 1.996 MET 251.A N SER 247.A O MET 251.A H 3.078 2.407 MET 251.A N HIS 248.A O MET 251.A H 3.221 2.462 GLY 252.A N SER 249.A O GLY 252.A H 2.948 2.117 ILE 253.A N HIS 248.A O ILE 253.A H 3.113 2.226 GLY 255.A N TYR 241.A O GLY 255.A H 2.893 2.004 LEU 256.A N ASN 165.A OD1 LEU 256.A H 2.917 2.207 PHE 257.A N TRP 239.A O PHE 257.A H 2.748 1.874 LEU 258.A N PHE 166.A O LEU 258.A H 2.749 1.874 VAL 259.A N GLY 237.A O VAL 259.A H 2.904 2.021 LYS 260.A N ALA 168.A O LYS 260.A H 2.754 1.861 LYS 260.A NZ GLU 167.A OE1 LYS 260.A HZ3 3.373 2.750 LYS 261.A N THR 265.A O LYS 261.A H 2.838 1.961 GLY 264.A N LYS 261.A O GLY 264.A H 2.908 2.095 THR 265.A N ASP 263.A OD1 THR 265.A H 2.971 2.076