Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6y5a_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 7.A NH1 GLN 2.A O ARG 7.A HH12 2.891 2.324 LEU 8.A N LEU 5.A O LEU 8.A H 3.117 2.440 SER 9.A N LEU 5.A O SER 9.A H 2.636 1.777 ASP 10.A N LEU 6.A O ASP 10.A H 3.313 2.492 HIS 11.A N LEU 8.A O HIS 11.A H 2.758 2.116 LEU 12.A N LEU 8.A O LEU 12.A H 3.043 2.332 LEU 13.A N SER 9.A O LEU 13.A H 3.247 2.405 TYR 16.A N LEU 13.A O TYR 16.A H 3.216 2.452 TYR 16.A OH ASP 63.A OD1 TYR 16.A HH 3.108 2.287 LYS 18.A NZ ASP 84.A O LYS 18.A HZ3 3.144 2.481 ARG 21.A NH1 LYS 28.A O ARG 21.A HH12 2.968 2.207 ARG 21.A NH2 LYS 28.A O ARG 21.A HH22 3.298 2.632 ARG 21.A NH2 THR 30.A OG1 ARG 21.A HH21 2.625 2.005 VAL 23.A N ARG 21.A O VAL 23.A H 2.731 2.107 ARG 27.A N ASP 25.A OD1 ARG 27.A H 3.150 2.312 ARG 27.A NH1 ASP 25.A OD1 ARG 27.A HH11 2.960 2.179 LYS 28.A N ASP 25.A O LYS 28.A H 3.179 2.339 THR 30.A N ASP 155.A O THR 30.A H 2.558 1.817 VAL 32.A N ASN 157.A O VAL 32.A H 3.105 2.418 SER 33.A N TYR 60.A O SER 33.A H 2.950 2.217 SER 33.A OG THR 159.A OG1 SER 33.A HG 3.084 2.244 ASP 35.A N ARG 58.A O ASP 35.A H 3.152 2.415 ILE 37.A N TRP 56.A O ILE 37.A H 3.223 2.533 TYR 39.A N TYR 54.A O TYR 39.A H 3.079 2.333 ALA 40.A N TYR 54.A O ALA 40.A H 3.249 2.541 LEU 42.A N THR 52.A O LEU 42.A H 2.952 2.198 ASN 43.A N THR 52.A O ASN 43.A H 3.229 2.396 GLU 46.A N GLU 46.A OE1 GLU 46.A H 2.821 2.014 ASN 48.A N ASP 45.A OD1 ASN 48.A H 2.947 2.103 GLN 49.A N ASP 45.A O GLN 49.A H 2.913 2.321 GLN 49.A NE2 GLU 46.A O GLN 49.A HE21 3.503 2.684 GLN 49.A NE2 LEU 130.A O GLN 49.A HE22 2.742 1.926 VAL 50.A N ASP 45.A O VAL 50.A H 3.237 2.436 LEU 51.A N THR 126.A O LEU 51.A H 2.710 2.106 THR 52.A N ASN 43.A O THR 52.A H 2.982 2.141 THR 53.A N LEU 124.A O THR 53.A H 3.288 2.487 THR 53.A OG1 ALA 40.A O THR 53.A HG1 2.927 2.124 TYR 54.A N ALA 40.A O TYR 54.A H 3.195 2.409 ILE 55.A N LEU 122.A O ILE 55.A H 3.258 2.445 TRP 56.A N ILE 37.A O TRP 56.A H 2.718 1.897 TYR 57.A N LYS 120.A O TYR 57.A H 2.920 2.120 TYR 57.A OH GLN 59.A OE1 TYR 57.A HH 2.469 1.707 ARG 58.A N ASP 35.A O ARG 58.A H 3.403 2.583 ARG 58.A NE ASP 35.A OD2 ARG 58.A HE 2.940 2.154 ARG 58.A NH1 ASP 35.A OD2 ARG 58.A HH11 3.121 2.406 ARG 58.A NH2 TYR 119.A OH ARG 58.A HH21 3.305 2.517 TYR 60.A N SER 33.A O TYR 60.A H 3.272 2.522 ASP 63.A N GLY 114.A O ASP 63.A H 3.059 2.368 PHE 65.A N ASP 63.A OD2 PHE 65.A H 2.935 2.258 LEU 66.A N ASP 63.A O LEU 66.A H 3.229 2.611 LEU 66.A N ASP 63.A OD2 LEU 66.A H 2.913 2.172 GLN 67.A N PHE 65.A O GLN 67.A H 2.968 2.351 GLN 67.A NE2 ARG 113.A O GLN 67.A HE21 2.994 2.413 TRP 68.A NE1 VAL 76.A O TRP 68.A HE1 2.904 2.054 ASP 72.A N THR 69.A O ASP 72.A H 3.199 2.416 PHE 73.A N PRO 70.A O PHE 73.A H 2.993 2.151 ASN 75.A N PRO 70.A O ASN 75.A H 2.712 2.097 VAL 76.A N PHE 73.A O VAL 76.A H 3.262 2.470 ILE 81.A N VAL 108.A O ILE 81.A H 2.951 2.131 SER 85.A N PRO 82.A O SER 85.A H 3.426 2.585 ILE 86.A N THR 83.A O ILE 86.A H 3.435 2.612 TRP 87.A N TYR 16.A OH TRP 87.A H 3.197 2.359 LEU 92.A N THR 147.A O LEU 92.A H 2.820 2.061 ASN 94.A N THR 145.A O ASN 94.A H 3.261 2.467 VAL 108.A N ILE 81.A O VAL 108.A H 2.795 1.986 TYR 109.A N GLN 117.A O TYR 109.A H 3.126 2.358 VAL 110.A N LEU 79.A O VAL 110.A H 2.739 1.999 HIS 111.A ND1 GLU 115.A O no hydrogen 3.180 N/A VAL 116.A N TRP 61.A O VAL 116.A H 3.147 2.436 GLN 117.A N TYR 109.A O GLN 117.A H 2.997 2.177 GLN 117.A NE2 GLU 115.A OE2 GLN 117.A HE21 3.565 2.780 ASN 118.A N GLN 59.A O ASN 118.A H 3.097 2.281 LYS 120.A N TYR 57.A O LYS 120.A H 2.960 2.122 LEU 122.A N ILE 55.A O LEU 122.A H 3.342 2.595 LEU 124.A N THR 53.A O LEU 124.A H 3.064 2.327 THR 126.A N LEU 51.A O THR 126.A H 2.951 2.132 ALA 127.A N GLU 95.A O ALA 127.A H 3.221 2.475 CYS 128.A N GLN 49.A O CYS 128.A H 3.400 2.567 LEU 130.A N GLN 49.A OE1 LEU 130.A H 3.301 2.604 TYR 133.A N ASP 131.A OD1 TYR 133.A H 2.806 2.032 GLN 140.A N ILE 209.A O GLN 140.A H 3.346 2.522 GLN 140.A NE2 ASP 131.A O GLN 140.A HE21 3.120 2.330 CYS 142.A N VAL 207.A O CYS 142.A H 2.992 2.162 LEU 144.A N PHE 205.A O LEU 144.A H 2.960 2.205 THR 145.A OG1 GLU 95.A OE2 THR 145.A HG1 2.617 1.806 PHE 146.A N MET 203.A O PHE 146.A H 2.905 2.054 THR 147.A N LEU 92.A O THR 147.A H 2.995 2.197 THR 147.A OG1 ALA 201.A O THR 147.A HG1 2.370 1.684 SER 148.A OG HIS 151.A O SER 148.A HG 2.710 2.034 LEU 150.A N ASP 90.A OD2 LEU 150.A H 2.916 2.071 HIS 151.A ND1 ASP 90.A OD1 HIS 151.A HD1 2.819 2.031 THR 152.A OG1 GLN 154.A OE1 THR 152.A HG1 2.411 1.605 ILE 153.A N SER 199.A O ILE 153.A H 2.981 2.174 GLN 154.A N GLN 154.A OE1 GLN 154.A H 2.763 2.016 ASP 155.A N THR 152.A O ASP 155.A H 3.226 2.461 ILE 156.A N THR 152.A O ILE 156.A H 2.813 1.978 ILE 158.A N ASN 157.A OD1 ILE 158.A H 2.602 1.922 THR 159.A N VAL 32.A O THR 159.A H 3.283 2.442 TRP 161.A N ILE 34.A O TRP 161.A H 2.553 1.710 ARG 162.A NE ASP 35.A OD1 ARG 162.A HE 2.454 1.689 ARG 162.A NH1 ASP 170.A OD1 ARG 162.A HH12 3.021 2.248 ARG 162.A NH2 ASP 35.A OD1 ARG 162.A HH21 2.803 2.173 VAL 167.A N SER 163.A O VAL 167.A H 3.206 2.392 ARG 168.A N PRO 164.A O ARG 168.A H 2.503 1.726 SER 169.A N GLU 165.A O SER 169.A H 3.265 2.545 LYS 171.A NZ LEU 183.A O LYS 171.A HZ1 3.205 2.327 SER 172.A OG ASP 170.A OD1 SER 172.A HG 3.442 2.800 SER 172.A OG ASP 170.A OD2 SER 172.A HG 3.122 2.387 GLU 181.A N ARG 210.A O GLU 181.A H 2.573 1.726 LEU 183.A N ILE 208.A O LEU 183.A H 3.300 2.466 PHE 186.A N TYR 206.A O PHE 186.A H 2.902 2.106 GLN 188.A N LYS 204.A O GLN 188.A H 3.016 2.312 LYS 190.A N GLU 202.A O LYS 190.A H 3.323 2.491 SER 197.A N ASP 195.A OD2 SER 197.A H 3.306 2.598 ASN 198.A N ASP 195.A OD1 ASN 198.A H 3.312 2.490 TYR 200.A N PHE 192.A O TYR 200.A H 2.653 1.803 MET 203.A N PHE 146.A O MET 203.A H 2.959 2.227 LYS 204.A N GLN 188.A O LYS 204.A H 2.662 1.873 LYS 204.A NZ THR 145.A OG1 LYS 204.A HZ3 2.535 1.715 TYR 206.A N PHE 186.A O TYR 206.A H 2.733 1.893 VAL 207.A N CYS 142.A O VAL 207.A H 2.645 1.786 ILE 208.A N GLU 184.A O ILE 208.A H 3.094 2.277 ILE 209.A N GLN 140.A O ILE 209.A H 3.050 2.250 ARG 210.A N GLU 181.A O ARG 210.A H 2.793 2.018 ARG 210.A NH1 TRP 385.A O ARG 210.A HH11 2.936 2.274 ARG 210.A NH2 GLU 181.A OE1 ARG 210.A HH21 2.863 2.046 ARG 211.A NE PHE 135.A O ARG 211.A HE 2.779 2.184 ARG 211.A NH1 GLU 179.A OE2 ARG 211.A HH11 3.177 2.416 ARG 211.A NH2 ASP 138.A OD2 ARG 211.A HH21 2.646 1.803 ARG 212.A N GLU 179.A O ARG 212.A H 2.976 2.186 ARG 212.A NE GLY 178.A O ARG 212.A HE 2.785 2.112 ARG 212.A NH2 TRP 180.A O ARG 212.A HH21 3.349 2.735 TYR 216.A OH GLU 179.A OE2 TYR 216.A HH 2.636 1.833 ALA 217.A N PRO 213.A O ALA 217.A H 2.875 2.116 VAL 218.A N LEU 214.A O VAL 218.A H 3.277 2.445 SER 219.A N PHE 215.A O SER 219.A H 2.999 2.148 SER 219.A OG PHE 215.A O SER 219.A HG 2.911 2.080 LEU 220.A N TYR 216.A O LEU 220.A H 2.870 2.177 LEU 221.A N ALA 217.A O LEU 221.A H 2.896 2.181 LEU 222.A N ALA 217.A O LEU 222.A H 3.286 2.486 SER 224.A N LEU 220.A O SER 224.A H 3.122 2.284 SER 224.A OG LEU 221.A O SER 224.A HG 2.667 1.870 ILE 225.A N LEU 221.A O ILE 225.A H 2.574 1.731 PHE 226.A N LEU 222.A O PHE 226.A H 2.522 1.709 LEU 227.A N PRO 223.A O LEU 227.A H 2.602 1.768 MET 228.A N ILE 225.A O MET 228.A H 3.119 2.303 ILE 232.A N VAL 229.A O ILE 232.A H 3.015 2.409 VAL 233.A N VAL 230.A O VAL 233.A H 3.109 2.471 PHE 235.A N ASP 231.A O PHE 235.A H 2.715 1.910 CYS 236.A N VAL 233.A O CYS 236.A H 3.317 2.484 LEU 237.A N VAL 233.A O LEU 237.A H 3.209 2.306 GLU 243.A N ASP 240.A OD2 GLU 243.A H 2.499 1.697 ARG 244.A NE GLY 234.A O ARG 244.A HE 3.215 2.660 ARG 244.A NH2 ASP 360.A OD1 ARG 244.A HH22 2.931 2.343 SER 246.A N GLY 242.A O SER 246.A H 3.081 2.253 PHE 247.A N GLU 243.A O PHE 247.A H 2.873 2.089 LYS 248.A N ARG 244.A O LYS 248.A H 2.864 2.020 ILE 249.A N VAL 245.A O ILE 249.A H 2.790 2.026 LEU 252.A N LYS 248.A O LEU 252.A H 3.385 2.600 LEU 252.A N ILE 249.A O LEU 252.A H 3.059 2.471 TYR 255.A N LEU 251.A O TYR 255.A H 2.710 1.881 TYR 255.A OH PHE 280.A O TYR 255.A HH 2.868 2.067 SER 256.A N LEU 252.A O SER 256.A H 2.644 1.820 SER 256.A OG LEU 252.A O SER 256.A HG 2.709 1.964 VAL 257.A N LEU 253.A O VAL 257.A H 2.567 1.716 PHE 258.A N GLY 254.A O PHE 258.A H 2.688 1.910 LEU 259.A N TYR 255.A O LEU 259.A H 2.677 1.889 ILE 260.A N SER 256.A O ILE 260.A H 3.116 2.405 VAL 262.A N PHE 258.A O VAL 262.A H 3.177 2.399 SER 263.A N ILE 260.A O SER 263.A H 3.004 2.308 THR 265.A OG1 ILE 261.A O THR 265.A HG1 2.408 1.760 LEU 266.A N VAL 262.A O LEU 266.A H 2.897 2.073 LEU 275.A N TYR 133.A O LEU 275.A H 3.353 2.549 GLY 277.A N PRO 274.A O GLY 277.A H 3.239 2.487 VAL 278.A N LEU 275.A O VAL 278.A H 2.896 2.115 VAL 282.A N VAL 278.A O VAL 282.A H 3.071 2.222 CYS 283.A N TYR 279.A O CYS 283.A H 2.747 1.888 MET 284.A N PHE 280.A O MET 284.A H 2.586 1.896 ALA 285.A N VAL 281.A O ALA 285.A H 2.665 1.813 LEU 286.A N VAL 282.A O LEU 286.A H 2.767 1.914 VAL 288.A N MET 284.A O VAL 288.A H 3.385 2.586 ILE 289.A N ALA 285.A O ILE 289.A H 3.078 2.263 SER 290.A OG LEU 287.A O SER 290.A HG 2.641 1.885 LEU 291.A N LEU 287.A O LEU 291.A H 2.996 2.139 ALA 292.A N VAL 288.A O ALA 292.A H 2.398 1.716 GLU 293.A N ILE 289.A O GLU 293.A H 2.552 1.821 THR 294.A N SER 290.A O THR 294.A H 3.084 2.256 THR 294.A OG1 SER 290.A O THR 294.A HG1 2.980 2.156 ILE 297.A N GLU 293.A O ILE 297.A H 3.330 2.602 ILE 297.A N THR 294.A O ILE 297.A H 2.761 2.151 VAL 298.A N THR 294.A O VAL 298.A H 2.982 2.163 ARG 299.A N ILE 295.A O ARG 299.A H 3.125 2.299 LEU 300.A N ILE 297.A O LEU 300.A H 3.055 2.283 VAL 301.A N ILE 297.A O VAL 301.A H 2.612 1.764 HIS 302.A N VAL 298.A O HIS 302.A H 3.352 2.579 LYS 303.A NZ VAL 298.A O LYS 303.A HZ3 3.559 2.678 ARG 315.A N PRO 311.A O ARG 315.A H 2.771 1.964 HIS 316.A N ASP 312.A O HIS 316.A H 2.487 1.669 LEU 317.A N TRP 313.A O LEU 317.A H 2.808 2.062 VAL 318.A N LEU 314.A O VAL 318.A H 2.915 2.065 LEU 319.A N ARG 315.A O LEU 319.A H 2.856 2.064 ASP 320.A N HIS 316.A O ASP 320.A H 2.939 2.085 ARG 321.A N LEU 317.A O ARG 321.A H 2.869 2.114 ARG 321.A NE ARG 321.A O ARG 321.A HE 2.706 2.061 ILE 322.A N VAL 318.A O ILE 322.A H 2.934 2.087 ALA 323.A N LEU 319.A O ALA 323.A H 2.934 2.118 TRP 324.A N ASP 320.A O TRP 324.A H 2.899 2.158 TRP 324.A N ARG 321.A O TRP 324.A H 3.240 2.607 ILE 325.A N ARG 321.A O ILE 325.A H 2.865 2.066 LEU 326.A N ILE 322.A O LEU 326.A H 2.921 2.208 GLU 331.A N GLU 331.A OE1 GLU 331.A H 2.516 1.789 LEU 332.A N LEU 328.A O LEU 332.A H 2.469 1.707 SER 333.A N LEU 329.A O SER 333.A H 2.895 2.071 SER 334.A N GLN 330.A O SER 334.A H 2.349 1.706 SER 334.A OG GLU 331.A O SER 334.A HG 2.257 1.655 ARG 336.A N LEU 332.A O ARG 336.A H 3.165 2.324 ARG 336.A NE SER 333.A OG ARG 336.A HE 3.284 2.646 ARG 336.A NH2 SER 333.A OG ARG 336.A HH21 2.617 1.797 HIS 337.A N SER 333.A O HIS 337.A H 2.464 1.620 PHE 338.A N SER 334.A O PHE 338.A H 2.476 1.759 LEU 339.A N ILE 335.A O LEU 339.A H 3.311 2.625 LEU 339.A N ARG 336.A O LEU 339.A H 2.843 2.170 GLU 340.A N ARG 336.A O GLU 340.A H 3.095 2.442 LYS 341.A N HIS 337.A O LYS 341.A H 3.050 2.349 ASP 343.A N GLU 340.A O ASP 343.A H 3.296 2.477 ALA 349.A N ARG 346.A O ALA 349.A H 2.793 1.985 ASP 351.A N GLU 347.A O ASP 351.A H 2.938 2.157 TRP 352.A N VAL 348.A O TRP 352.A H 2.996 2.160 LEU 353.A N ALA 349.A O LEU 353.A H 2.477 1.752 ARG 354.A N ARG 350.A O ARG 354.A H 3.247 2.436 VAL 355.A N ASP 351.A O VAL 355.A H 2.420 1.685 TYR 357.A N LEU 353.A O TYR 357.A H 2.723 1.895 ASP 360.A N TYR 357.A O ASP 360.A H 2.790 2.067 LEU 362.A N LEU 359.A O LEU 362.A H 2.571 1.756 LEU 363.A N LEU 359.A O LEU 363.A H 2.788 1.984 PHE 364.A N ASP 360.A O PHE 364.A H 2.950 2.149 ILE 366.A N LEU 362.A O ILE 366.A H 2.786 2.050 TYR 367.A N LEU 363.A O TYR 367.A H 3.100 2.262 TYR 367.A OH ASP 231.A OD2 TYR 367.A HH 2.896 2.120 LEU 368.A N PHE 364.A O LEU 368.A H 3.091 2.243 LEU 369.A N ARG 365.A O LEU 369.A H 3.247 2.498 ALA 370.A N ILE 366.A O ALA 370.A H 2.681 1.851 VAL 371.A N TYR 367.A O VAL 371.A H 2.857 2.024 LEU 372.A N LEU 368.A O LEU 372.A H 2.977 2.341 LEU 372.A N LEU 369.A O LEU 372.A H 2.965 2.301 TYR 374.A N ALA 370.A O TYR 374.A H 3.254 2.417 TYR 374.A OH SER 224.A OG TYR 374.A HH 2.814 1.975 SER 375.A N VAL 371.A O SER 375.A H 3.297 2.593 SER 375.A N LEU 372.A O SER 375.A H 3.026 2.339 SER 375.A OG LEU 372.A O SER 375.A HG 2.501 1.720 ILE 376.A N LEU 372.A O ILE 376.A H 2.957 2.250 THR 377.A N ALA 373.A O THR 377.A H 2.924 2.091 LEU 381.A N THR 377.A O LEU 381.A H 2.908 2.056 TRP 382.A N LEU 378.A O TRP 382.A H 3.406 2.604 SER 383.A N VAL 379.A O SER 383.A H 2.758 2.021 ILE 384.A N THR 380.A O ILE 384.A H 3.033 2.204 TRP 385.A N LEU 381.A O TRP 385.A H 2.939 2.081 TRP 385.A NE1 ARG 211.A O TRP 385.A HE1 2.713 1.869 HIS 386.A N TRP 382.A O HIS 386.A H 2.670 1.909 SER 387.A N SER 383.A O SER 387.A H 2.651 1.885 SER 387.A OG ILE 384.A O SER 387.A HG 2.596 1.788 SER 388.A N ILE 384.A O SER 388.A H 2.965 2.228 SER 388.A OG ILE 384.A O SER 388.A HG 2.898 2.069