Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6y88_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 6.A N PRO 2.A O GLN 6.A H 2.827 2.019 LYS 7.A N THR 3.A O LYS 7.A H 3.023 2.212 ILE 8.A N VAL 4.A O ILE 8.A H 2.951 2.127 LEU 9.A N LEU 5.A O LEU 9.A H 2.854 2.021 ALA 10.A N GLN 6.A O ALA 10.A H 2.985 2.145 ARG 11.A N LYS 7.A O ARG 11.A H 3.122 2.266 ARG 11.A NE ASP 98.A OD2 ARG 11.A HE 3.161 2.517 ARG 11.A NH1 GLU 14.A OE1 ARG 11.A HH11 2.574 1.776 ARG 11.A NH1 GLU 18.A OE2 ARG 11.A HH12 3.276 2.525 ARG 11.A NH2 GLU 18.A OE2 ARG 11.A HH22 3.503 2.817 LYS 12.A N ILE 8.A O LYS 12.A H 2.733 1.934 ALA 13.A N LEU 9.A O ALA 13.A H 3.025 2.258 GLU 15.A N ARG 11.A O GLU 15.A H 2.996 2.168 VAL 16.A N LYS 12.A O VAL 16.A H 2.963 2.128 ALA 17.A N ALA 13.A O ALA 17.A H 3.062 2.228 GLU 18.A N GLU 14.A O GLU 18.A H 2.886 2.035 ARG 19.A N GLU 15.A O ARG 19.A H 2.898 2.093 ARG 19.A NH1 ASP 104.A OD2 ARG 19.A HH12 2.709 1.941 ARG 19.A NH1 GLU 132.A OE2 ARG 19.A HH11 3.186 2.361 ARG 20.A N VAL 16.A O ARG 20.A H 2.868 2.010 ARG 20.A NH1 ASP 126.A OD1 ARG 20.A HH12 3.299 2.573 ARG 20.A NH1 ASP 126.A OD2 ARG 20.A HH12 3.221 2.436 ALA 21.A N ALA 17.A O ALA 21.A H 2.922 2.106 ARG 22.A N GLU 18.A O ARG 22.A H 3.361 2.609 VAL 23.A N ARG 19.A O VAL 23.A H 2.673 1.819 GLU 27.A N ASN 24.A O GLU 27.A H 2.986 2.372 GLU 27.A N ASN 24.A OD1 GLU 27.A H 2.997 2.204 VAL 28.A N ASN 24.A O VAL 28.A H.A 3.105 2.275 GLU 29.A N LEU 25.A O GLU 29.A H 2.828 2.000 ARG 30.A N ALA 26.A O ARG 30.A H 3.004 2.242 LEU 31.A N GLU 27.A O LEU 31.A H 2.921 2.101 ALA 32.A N VAL 28.A O ALA 32.A H 2.879 2.081 ARG 33.A N GLU 29.A O ARG 33.A H 3.061 2.232 SER 34.A N ARG 30.A O SER 34.A H 3.247 2.566 SER 34.A N LEU 31.A O SER 34.A H 3.149 2.480 SER 34.A OG ARG 30.A O SER 34.A HG 3.373 2.695 ALA 35.A N ALA 32.A O ALA 35.A H 3.324 2.517 ARG 39.A N ASP 139.A OD1 ARG 39.A H 2.683 1.891 ARG 39.A NH1 ARG 111.A O ARG 39.A HH12 3.232 2.543 ARG 39.A NH1 CYS 114.A O ARG 39.A HH12 3.044 2.467 ARG 39.A NH1 LEU 116.A O ARG 39.A HH11 2.659 1.856 ARG 39.A NH2 ARG 111.A O ARG 39.A HH22 3.034 2.286 ARG 39.A NH2 CYS 114.A O ARG 39.A HH22 3.251 2.718 ALA 42.A N ASP 166.A OD2 ALA 42.A H 2.789 1.931 ASN 43.A ND2 GLU 47.A OE1 ASN 43.A HD21 3.261 2.654 ALA 44.A N GLY 40.A O ALA 44.A H 3.123 2.321 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.866 2.027 GLU 47.A N ASN 43.A O GLU 47.A H 2.937 2.092 ARG 48.A NH1 ALA 44.A O ARG 48.A HH11 3.031 2.219 ALA 49.A N LEU 45.A O ALA 49.A H 2.841 1.988 LYS 50.A N LEU 46.A O LYS 50.A H 2.965 2.119 ARG 51.A N ARG 48.A O ARG 51.A H 2.862 2.156 ARG 51.A NE GLU 47.A O ARG 51.A HE 2.954 2.226 LYS 52.A N ALA 49.A O LYS 52.A H 2.810 1.984 GLU 53.A N ARG 48.A O GLU 53.A H 2.991 2.140 ALA 55.A N TYR 240.A O ALA 55.A H 2.759 1.906 ILE 57.A N PHE 242.A O ILE 57.A H 2.798 1.953 ALA 58.A N CYS 90.A O ALA 58.A H 2.897 2.082 GLU 59.A N VAL 244.A O GLU 59.A H 2.948 2.150 ILE 60.A N SER 92.A O ILE 60.A H 2.674 1.838 LYS 62.A NZ ARG 71.A O LYS 62.A HZ3 2.812 1.988 SER 64.A N GLY 68.A O SER 64.A H 3.019 2.302 LYS 67.A N SER 64.A OG LYS 67.A H 3.095 2.399 GLY 68.A N SER 64.A O GLY 68.A H 2.935 2.202 LEU 70.A N LYS 62.A O LEU 70.A H 2.823 1.964 ARG 71.A NH1 MET 249.A O ARG 71.A HH11 2.703 2.002 ARG 71.A NH1 ALA 251.A O ARG 71.A HH12 2.726 1.880 ARG 71.A NH2 ALA 251.A O ARG 71.A HH22 3.357 2.713 ARG 71.A NH2 ASP 252.A O ARG 71.A HH22 3.093 2.355 ILE 79.A N VAL 75.A O ILE 79.A H 3.004 2.163 ALA 80.A N PRO 76.A O ALA 80.A H 2.845 1.998 ARG 81.A N ALA 77.A O ARG 81.A H 3.092 2.309 SER 82.A N GLU 78.A O SER 82.A H 2.996 2.161 TYR 83.A N ILE 79.A O TYR 83.A H 2.835 1.984 TYR 83.A OH GLU 59.A O TYR 83.A HH 2.806 1.993 GLU 84.A N ALA 80.A O GLU 84.A H 2.982 2.164 ALA 85.A N ARG 81.A O ALA 85.A H 3.052 2.217 GLY 86.A N SER 82.A O GLY 86.A H 2.947 2.184 GLY 87.A N GLU 84.A O GLY 87.A H 3.229 2.443 ALA 88.A N TYR 83.A O ALA 88.A H 3.086 2.230 ALA 89.A N VAL 56.A O ALA 89.A H 2.864 2.104 CYS 90.A N VAL 56.A O CYS 90.A H 3.266 2.453 LEU 91.A N PRO 117.A O LEU 91.A H 2.831 2.004 SER 92.A N ALA 58.A O SER 92.A H 2.910 2.089 SER 92.A OG GLU 59.A OE1 SER 92.A HG 2.736 2.092 VAL 93.A N ILE 119.A O VAL 93.A H 3.191 2.356 LEU 94.A N ILE 60.A O LEU 94.A H 3.314 2.472 THR 95.A N LYS 121.A O THR 95.A H 3.006 2.199 THR 95.A OG1 ASP 122.A OD2 THR 95.A HG1 2.626 1.844 PHE 99.A N ASP 96.A OD2 PHE 99.A H 2.809 2.021 PHE 100.A N ASP 96.A OD2 PHE 100.A H 3.128 2.538 GLY 102.A N ASP 96.A O GLY 102.A H 2.786 1.993 TYR 106.A N ALA 103.A O TYR 106.A H 2.980 2.267 LEU 107.A N ASP 104.A O LEU 107.A H 2.959 2.314 LYS 108.A N ASP 104.A O LYS 108.A H 3.206 2.383 GLU 109.A N ALA 105.A O GLU 109.A H 2.918 2.086 ALA 110.A N TYR 106.A O ALA 110.A H 2.924 2.078 ARG 111.A N LEU 107.A O ARG 111.A H 2.879 2.050 ARG 111.A NE ASP 139.A OD2 ARG 111.A HE 3.015 2.189 ARG 111.A NH2 ALA 37.A O ARG 111.A HH22 3.153 2.529 ARG 111.A NH2 ASP 139.A OD1 ARG 111.A HH21 2.895 2.045 ALA 112.A N LYS 108.A O ALA 112.A H 2.986 2.141 ALA 113.A N GLU 109.A O ALA 113.A H 3.199 2.530 ALA 113.A N ALA 110.A O ALA 113.A H 3.209 2.507 CYS 114.A N ARG 111.A O CYS 114.A H 3.339 2.493 CYS 114.A SG ALA 110.A O CYS 114.A HG 3.587 2.412 ALA 115.A N GLU 84.A OE2 ALA 115.A H 2.855 2.001 VAL 118.A N ASP 139.A OD2 VAL 118.A H 2.901 2.172 ILE 119.A N LEU 91.A O ILE 119.A H 2.823 2.007 ARG 120.A N CYS 140.A O ARG 120.A H 3.031 2.229 ARG 120.A NE THR 95.A OG1 ARG 120.A HE 2.932 2.111 ARG 120.A NH1 GLU 132.A OE1 ARG 120.A HH12 2.837 2.045 ARG 120.A NH2 ASP 104.A OD1 ARG 120.A HH21 2.803 2.173 ARG 120.A NH2 GLU 132.A OE1 ARG 120.A HH22 3.008 2.275 LYS 121.A N VAL 93.A O LYS 121.A H 3.001 2.155 LYS 121.A NZ GLU 59.A OE1 LYS 121.A HZ2 2.885 2.025 PHE 123.A N ASP 122.A OD1 PHE 123.A H 2.669 1.920 ILE 125.A N GLN 129.A OE1 ILE 125.A H 2.714 1.854 TYR 128.A N ASP 126.A OD1 TYR 128.A H 2.781 1.937 TYR 128.A OH VAL 23.A O TYR 128.A HH 2.652 1.857 GLN 129.A N ASP 126.A O GLN 129.A H 2.937 2.302 GLN 129.A NE2 PHE 123.A O GLN 129.A HE22 2.981 2.248 VAL 131.A N PRO 127.A O VAL 131.A H 3.075 2.231 GLU 132.A N TYR 128.A O GLU 132.A H 2.873 2.029 ALA 133.A N GLN 129.A O ALA 133.A H 2.830 2.043 ARG 134.A N ILE 130.A O ARG 134.A H 3.292 2.492 ARG 134.A NE ALA 138.A O ARG 134.A HE 2.855 2.045 ARG 134.A NH1 ASP 36.A O ARG 134.A HH12 3.152 2.486 ARG 134.A NH1 GLY 137.A O ARG 134.A HH11 3.198 2.513 ARG 134.A NH1 ALA 138.A O ARG 134.A HH11 3.056 2.332 ARG 134.A NH2 ASP 36.A O ARG 134.A HH22 2.705 1.890 ALA 135.A N VAL 131.A O ALA 135.A H 2.955 2.153 ILE 136.A N GLU 132.A O ILE 136.A H 2.928 2.134 GLY 137.A N ARG 134.A O GLY 137.A H 2.904 2.093 ALA 138.A N ALA 133.A O ALA 138.A H 2.914 2.143 ASP 139.A N VAL 118.A O ASP 139.A H 2.808 1.966 ILE 141.A N ASP 166.A O ILE 141.A H 3.037 2.241 LEU 143.A N LEU 168.A O LEU 143.A H 2.911 2.071 VAL 145.A N GLU 170.A O VAL 145.A H 3.016 2.163 SER 146.A OG GLU 176.A OE2 SER 146.A HG 2.668 1.917 ALA 147.A N ILE 144.A O ALA 147.A H 2.870 2.081 LEU 148.A N VAL 145.A O LEU 148.A H 3.116 2.257 LEU 152.A N ASP 149.A OD1 LEU 152.A H 2.820 1.961 MET 153.A N ASP 149.A O MET 153.A H 2.847 2.025 ALA 154.A N ASP 150.A O ALA 154.A H 2.841 1.999 GLU 155.A N VAL 151.A O GLU 155.A H 2.888 2.076 LEU 156.A N LEU 152.A O LEU 156.A H 2.828 1.983 ALA 157.A N MET 153.A O ALA 157.A H 3.023 2.177 ALA 158.A N ALA 154.A O ALA 158.A H 2.864 2.044 THR 159.A N GLU 155.A O THR 159.A H 2.906 2.076 THR 159.A OG1 GLU 155.A O THR 159.A HG1 2.946 2.135 ALA 160.A N LEU 156.A O ALA 160.A H 2.934 2.137 LYS 161.A N ALA 157.A O LYS 161.A H 2.989 2.150 LYS 161.A NZ ASP 185.A OD1 LYS 161.A HZ1 2.929 2.112 SER 162.A N ALA 158.A O SER 162.A H 3.077 2.257 SER 162.A OG ALA 158.A O SER 162.A HG 3.467 2.835 SER 162.A OG THR 159.A O SER 162.A HG 2.926 2.210 VAL 163.A N THR 159.A O VAL 163.A H 3.267 2.628 VAL 163.A N ALA 160.A O VAL 163.A H 3.044 2.294 GLY 164.A N LYS 161.A O GLY 164.A H 3.025 2.189 LEU 165.A N ALA 160.A O LEU 165.A H 2.862 2.026 ASP 166.A N ASP 139.A O ASP 166.A H 3.128 2.285 LEU 168.A N ILE 141.A O LEU 168.A H 2.968 2.122 VAL 169.A N LEU 188.A O VAL 169.A H 3.205 2.365 GLU 170.A N LEU 143.A O GLU 170.A H 2.745 1.921 VAL 171.A N GLY 190.A O VAL 171.A H 2.851 2.026 HIS 172.A N GLU 176.A OE1 HIS 172.A H 2.789 1.987 GLU 176.A N ASP 173.A OD1 GLU 176.A H 2.758 1.901 LEU 177.A N ASP 173.A O LEU 177.A H 2.815 2.000 GLU 178.A N GLY 174.A O GLU 178.A H 2.959 2.165 ARG 179.A N THR 175.A O ARG 179.A H 3.171 2.324 ARG 179.A NE ASP 150.A OD1 ARG 179.A HE 2.758 1.937 ARG 179.A NH2 LEU 148.A O ARG 179.A HH22 2.595 1.810 ARG 179.A NH2 ASP 150.A OD1 ARG 179.A HH21 2.995 2.275 ALA 180.A N GLU 176.A O ALA 180.A H 2.895 2.060 LEU 181.A N LEU 177.A O LEU 181.A H 2.852 2.034 LYS 182.A N GLU 178.A O LYS 182.A H 2.993 2.167 THR 183.A N ARG 179.A O THR 183.A H 2.971 2.218 THR 183.A OG1 ARG 179.A O THR 183.A HG1 2.731 2.035 LEU 184.A N ALA 180.A O LEU 184.A H 2.883 2.046 THR 186.A OG1 VAL 167.A O THR 186.A HG1 2.619 1.785 LEU 188.A N THR 186.A OG1 LEU 188.A H 3.068 2.214 VAL 189.A N LEU 218.A O VAL 189.A H 2.999 2.146 GLY 190.A N VAL 169.A O GLY 190.A H 2.674 1.855 ILE 191.A N VAL 220.A O ILE 191.A H 2.897 2.084 ASN 192.A N VAL 171.A O ASN 192.A H 2.957 2.139 ASN 192.A ND2 GLU 170.A OE2 ASN 192.A HD22 3.057 2.216 ASN 193.A N GLU 222.A O ASN 193.A H 2.796 1.958 ASN 193.A ND2 THR 221.A OG1 ASN 193.A HD21 2.937 2.084 ASN 193.A ND2 SER 223.A O ASN 193.A HD22 2.977 2.121 ARG 194.A N ASN 192.A OD1 ARG 194.A H 2.914 2.065 ARG 194.A NH1 PHE 199.A O ARG 194.A HH11 3.095 2.473 ASN 195.A N GLU 200.A O ASN 195.A H 2.878 2.089 HIS 197.A N ASN 195.A OD1 HIS 197.A H 2.680 1.929 THR 198.A N ASN 195.A OD1 THR 198.A H 3.216 2.458 PHE 199.A N ASN 195.A O PHE 199.A H 2.739 2.058 GLU 200.A N THR 198.A OG1 GLU 200.A H 3.205 2.350 SER 202.A N ASN 193.A O SER 202.A H 3.013 2.199 THR 205.A N SER 202.A O THR 205.A H 3.128 2.307 THR 205.A OG1 SER 202.A O THR 205.A HG1 2.844 2.166 THR 206.A N LEU 203.A O THR 206.A H 3.135 2.443 THR 206.A OG1 ASN 193.A OD1 THR 206.A HG1 2.645 1.863 LEU 207.A N LEU 203.A O LEU 207.A H 3.439 2.623 ASP 208.A N GLU 204.A O ASP 208.A H 2.796 1.957 LEU 209.A N THR 206.A O LEU 209.A H 3.046 2.253 LEU 210.A N LEU 207.A O LEU 210.A H 3.372 2.594 GLU 212.A N LEU 209.A O GLU 212.A H 2.927 2.075 ILE 213.A N LEU 210.A O ILE 213.A H 3.212 2.354 ARG 217.A N PRO 214.A O ARG 217.A H 2.958 2.106 ARG 217.A NH1 LEU 184.A O ARG 217.A HH12 2.906 2.128 ARG 217.A NH1 THR 186.A O ARG 217.A HH11 2.715 2.013 ARG 217.A NH2 LEU 181.A O ARG 217.A HH22 3.071 2.493 ARG 217.A NH2 LEU 184.A O ARG 217.A HH22 3.041 2.308 LEU 218.A N PRO 187.A O LEU 218.A H 2.716 1.868 VAL 220.A N VAL 189.A O VAL 220.A H 3.001 2.174 THR 221.A N ALA 241.A O THR 221.A H 2.948 2.140 THR 221.A OG1 THR 206.A OG1 THR 221.A HG1 2.768 1.994 GLU 222.A N ILE 191.A O GLU 222.A H 2.857 2.076 SER 223.A N LEU 243.A O SER 223.A H 3.339 2.497 SER 223.A OG ASN 192.A OD1 SER 223.A HG 2.848 2.312 LEU 226.A N ASP 230.A OD2 LEU 226.A H 3.016 2.172 ASN 227.A N ASP 230.A OD2 ASN 227.A H 3.010 2.253 ASP 230.A N ASN 227.A OD1 ASP 230.A H 2.911 2.118 VAL 231.A N ASN 227.A O VAL 231.A H 3.244 2.452 GLU 232.A N ARG 228.A O GLU 232.A H 2.809 1.967 LEU 233.A N ALA 229.A O LEU 233.A H 2.931 2.087 MET 234.A N ASP 230.A O MET 234.A H 3.180 2.352 GLU 235.A N VAL 231.A O GLU 235.A H 2.945 2.109 VAL 236.A N GLU 232.A O VAL 236.A H 2.920 2.061 SER 237.A N LEU 233.A O SER 237.A H 3.142 2.357 SER 237.A OG LEU 233.A O SER 237.A HG 3.370 2.698 GLU 238.A N GLU 235.A O GLU 238.A H 2.840 2.020 VAL 239.A N MET 234.A O VAL 239.A H 2.832 1.983 TYR 240.A OH GLU 238.A OE1 TYR 240.A HH 3.097 2.265 PHE 242.A N ALA 55.A O PHE 242.A H 3.106 2.312 LEU 243.A N THR 221.A O LEU 243.A H 2.777 1.964 VAL 244.A N ILE 57.A O VAL 244.A H 3.214 2.389 PHE 248.A N GLY 245.A O PHE 248.A H 2.977 2.320 MET 249.A N GLY 245.A O MET 249.A H 2.835 2.006 ARG 250.A N GLU 246.A O ARG 250.A H 3.064 2.239 ARG 250.A NE GLU 246.A OE2 ARG 250.A HE 3.077 2.247 ALA 251.A N PHE 248.A O ALA 251.A H 3.028 2.190 GLY 255.A N SER 82.A OG GLY 255.A H 2.735 1.931 LEU 256.A N ASP 253.A O LEU 256.A H 2.918 2.278 LEU 256.A N ASP 253.A OD1 LEU 256.A H 3.243 2.503 GLU 257.A N ASP 253.A O GLU 257.A H 3.119 2.299 LEU 258.A N PRO 254.A O LEU 258.A H 3.029 2.232 LYS 259.A N GLY 255.A O LYS 259.A H 2.913 2.083 ARG 260.A N LEU 256.A O ARG 260.A H 2.832 2.036 LEU 261.A N GLU 257.A O LEU 261.A H 2.897 2.098 PHE 262.A N LEU 258.A O PHE 262.A H 2.987 2.280 PHE 263.A N LYS 259.A O PHE 263.A H 2.752 1.932