Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ydm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A N GLU 164.A O LYS 3.A H 2.712 1.813 LYS 3.A NZ MET 1.A O LYS 3.A HZ1 2.714 2.120 VAL 5.A N LYS 109.A O VAL 5.A H 2.939 2.128 LEU 6.A N ILE 166.A O LEU 6.A H 2.795 1.913 PHE 7.A N ALA 111.A O PHE 7.A H 2.890 1.989 ASP 8.A N LEU 168.A O ASP 8.A H 3.247 2.336 GLY 11.A N THR 14.A O GLY 11.A H 2.792 1.982 VAL 12.A N LEU 9.A O VAL 12.A H 3.086 2.205 ILE 13.A N LEU 9.A O ILE 13.A H 2.803 1.993 THR 14.A N LEU 9.A O THR 14.A H 3.233 2.351 THR 16.A N ASP 10.A OD1 THR 16.A H 2.743 1.878 ALA 17.A N ASP 10.A OD1 ALA 17.A H 3.285 2.522 GLU 18.A N ASP 15.A OD1 GLU 18.A H 3.197 2.346 HIS 20.A N THR 16.A O HIS 20.A H 3.177 2.291 PHE 21.A N ALA 17.A O PHE 21.A H 3.048 2.187 ARG 22.A N GLU 18.A O ARG 22.A H 2.964 2.084 ARG 22.A NE GLU 18.A OE2 ARG 22.A HE 3.051 2.322 ARG 22.A NH1 GLU 18.A OE2 ARG 22.A HH11 3.464 2.838 ALA 23.A N TYR 19.A O ALA 23.A H 2.884 2.000 TRP 24.A N HIS 20.A O TRP 24.A H 2.952 2.097 LYS 25.A N PHE 21.A O LYS 25.A H 2.883 2.067 LYS 25.A NZ GLU 29.A OE1 LYS 25.A HZ1 3.249 2.378 ALA 26.A N ARG 22.A O ALA 26.A H 3.018 2.123 LEU 27.A N ALA 23.A O LEU 27.A H 3.092 2.231 ALA 28.A N TRP 24.A O ALA 28.A H 2.927 2.058 GLU 29.A N LYS 25.A O GLU 29.A H 2.821 1.937 GLU 30.A N ALA 26.A O GLU 30.A H 3.071 2.196 ILE 31.A N LEU 27.A O ILE 31.A H 3.305 2.489 GLY 32.A N GLU 29.A O GLY 32.A H 2.950 2.127 ILE 33.A N ALA 28.A O ILE 33.A H 2.887 1.980 PHE 40.A N ASP 37.A OD1 PHE 40.A H 2.750 1.845 ASN 41.A N ASP 37.A O ASN 41.A H 2.847 2.035 GLU 42.A N GLN 39.A O GLU 42.A H 3.170 2.346 GLN 43.A N PHE 40.A O GLN 43.A H 2.862 2.037 LEU 44.A N ASN 41.A O LEU 44.A H 2.826 1.969 VAL 47.A N LEU 44.A O VAL 47.A H 3.234 2.348 ASP 51.A N SER 48.A OG ASP 51.A H 3.131 2.244 SER 52.A N SER 48.A O SER 52.A H 2.799 1.909 LEU 53.A N ARG 49.A O LEU 53.A H 2.914 2.022 GLN 54.A N GLU 50.A O GLN 54.A H 2.940 2.078 GLN 54.A NE2 ASP 58.A OD1 GLN 54.A HE22 2.898 2.163 LYS 55.A N ASP 51.A O LYS 55.A H 3.034 2.242 ILE 56.A N SER 52.A O ILE 56.A H 3.075 2.227 LEU 57.A N LEU 53.A O LEU 57.A H 2.819 1.962 ASP 58.A N GLN 54.A O ASP 58.A H 2.986 2.234 LEU 59.A N ILE 56.A O LEU 59.A H 3.328 2.606 ALA 60.A N LEU 57.A O ALA 60.A H 3.338 2.606 ASP 61.A N ASP 58.A O ASP 61.A H 3.194 2.324 LYS 62.A N LEU 57.A O LYS 62.A H 2.883 2.016 GLU 68.A N SER 65.A OG GLU 68.A H 2.815 1.905 PHE 69.A N SER 65.A O PHE 69.A H 2.948 2.040 LYS 70.A N ALA 66.A O LYS 70.A H 3.064 2.226 GLU 71.A N GLU 67.A O GLU 71.A H 2.986 2.153 LEU 72.A N GLU 68.A O LEU 72.A H 2.822 1.928 ALA 73.A N PHE 69.A O ALA 73.A H 3.081 2.191 LYS 74.A N LYS 70.A O LYS 74.A H 3.032 2.203 LYS 74.A NZ ASP 78.A OD2 LYS 74.A HZ3 3.327 2.424 ARG 75.A N GLU 71.A O ARG 75.A H 2.864 1.961 ARG 75.A NE GLU 30.A OE1 ARG 75.A HE 2.896 2.222 LYS 76.A N LEU 72.A O LYS 76.A H 2.967 2.073 ASN 77.A N ALA 73.A O ASN 77.A H 3.200 2.374 ASP 78.A N LYS 74.A O ASP 78.A H 2.890 1.998 ASN 79.A N ARG 75.A O ASN 79.A H 2.768 1.871 TYR 80.A N LYS 76.A O TYR 80.A H 2.942 2.053 VAL 81.A N ASN 77.A O VAL 81.A H 2.819 1.964 LYS 82.A N ASP 78.A O LYS 82.A H 2.964 2.087 MET 83.A N ASN 79.A O MET 83.A H 3.020 2.201 ILE 84.A N TYR 80.A O ILE 84.A H 3.118 2.350 GLN 85.A N LYS 82.A O GLN 85.A H 3.211 2.352 GLN 85.A NE2 VAL 81.A O GLN 85.A HE22 3.007 2.145 ASP 86.A N MET 83.A O ASP 86.A H 3.491 2.584 VAL 87.A N ILE 84.A O VAL 87.A H 3.048 2.151 SER 88.A N ASP 91.A OD2 SER 88.A H 2.961 2.134 ALA 90.A N SER 88.A OG ALA 90.A H 2.938 2.129 ASP 91.A N SER 88.A O ASP 91.A H 3.090 2.188 VAL 92.A N PRO 89.A O VAL 92.A H 3.224 2.320 TYR 93.A N ILE 13.A O TYR 93.A H 2.806 1.906 ILE 96.A N TYR 93.A O ILE 96.A H 3.406 2.512 LEU 99.A N GLY 95.A O LEU 99.A H 2.908 2.033 LEU 100.A N ILE 96.A O LEU 100.A H 2.924 2.044 LYS 101.A N LEU 97.A O LYS 101.A H 2.939 2.074 LYS 101.A NZ TYR 131.A OH LYS 101.A HZ1 3.274 2.407 ASP 102.A N GLN 98.A O ASP 102.A H 2.879 1.995 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 2.930 2.026 ARG 104.A N LEU 100.A O ARG 104.A H 3.066 2.158 SER 105.A N LYS 101.A O SER 105.A H 3.034 2.134 ASN 106.A N ASP 102.A O ASN 106.A H 3.041 2.319 ASN 106.A N LEU 103.A O ASN 106.A H 3.056 2.385 ASN 106.A ND2 ASP 102.A O ASN 106.A HD22 2.842 1.982 LYS 107.A N ARG 104.A O LYS 107.A H 2.945 2.063 ILE 108.A N LEU 103.A O ILE 108.A H 2.996 2.088 LYS 109.A N LYS 3.A O LYS 109.A H 3.017 2.127 LYS 109.A NZ LYS 107.A O LYS 109.A HZ3 3.469 2.730 ILE 110.A N ASP 133.A OD2 ILE 110.A H 2.924 2.096 ALA 111.A N VAL 5.A O ALA 111.A H 3.189 2.317 LEU 112.A N ALA 134.A O LEU 112.A H 2.985 2.156 ALA 113.A N PHE 7.A O ALA 113.A H 2.833 1.944 SER 116.A N SER 114.A OG SER 116.A H 2.812 1.913 ASN 118.A N SER 116.A OG ASN 118.A H 2.971 2.116 LEU 122.A N ASN 118.A O LEU 122.A H 2.772 1.912 LEU 123.A N GLY 119.A O LEU 123.A H 2.861 1.999 GLU 124.A N PRO 120.A O GLU 124.A H 2.962 2.083 ARG 125.A N PHE 121.A O ARG 125.A H 2.961 2.096 MET 126.A N LEU 122.A O MET 126.A H 3.059 2.316 ASN 127.A N GLU 124.A O ASN 127.A H 3.045 2.254 LEU 128.A N LEU 123.A O LEU 128.A H 2.798 1.888 TYR 131.A N LEU 128.A O TYR 131.A H 2.904 2.044 PHE 132.A N THR 129.A O PHE 132.A H 2.991 2.142 ASP 133.A N ILE 110.A O ASP 133.A H 2.730 1.892 ALA 134.A N ILE 110.A O ALA 134.A H 3.345 2.540 ALA 136.A N LEU 112.A O ALA 136.A H 2.994 2.092 ALA 139.A N ASP 137.A OD1 ALA 139.A H 3.052 2.222 GLU 140.A N ASP 137.A O GLU 140.A H 2.922 2.067 VAL 141.A N PRO 138.A O VAL 141.A H 3.241 2.336 LYS 145.A NZ ALA 113.A O LYS 145.A HZ2 3.016 2.171 LYS 145.A NZ GLU 169.A OE2 LYS 145.A HZ3 2.683 1.811 ALA 147.A N SER 144.A O ALA 147.A H 2.980 2.177 ILE 152.A N PRO 148.A O ILE 152.A H 3.045 2.157 ALA 153.A N ASP 149.A O ALA 153.A H 2.878 2.009 ALA 154.A N ILE 150.A O ALA 154.A H 2.963 2.161 ALA 155.A N PHE 151.A O ALA 155.A H 3.038 2.207 HIS 156.A N ILE 152.A O HIS 156.A H 2.881 1.980 ALA 157.A N ALA 153.A O ALA 157.A H 2.941 2.075 VAL 158.A N ALA 155.A O VAL 158.A H 2.991 2.207 GLY 159.A N HIS 156.A O GLY 159.A H 2.923 2.071 VAL 160.A N ALA 155.A O VAL 160.A H 3.230 2.330 ALA 161.A N GLU 164.A OE2 ALA 161.A H 3.138 2.269 GLU 164.A N ALA 161.A O GLU 164.A H 2.892 1.997 SER 165.A N PRO 162.A O SER 165.A H 2.833 2.001 ILE 166.A N ALA 4.A O ILE 166.A H 3.150 2.285 GLY 167.A N LEU 184.A O GLY 167.A H 2.880 2.006 LEU 168.A N LEU 6.A O LEU 168.A H 2.941 2.065 ASP 170.A N GLU 169.A OE1 ASP 170.A H 2.954 2.168 GLN 172.A NE2 ASP 193.A O GLN 172.A HE22 3.123 2.628 GLY 174.A N SER 171.A OG GLY 174.A H 2.852 2.051 ILE 175.A N SER 171.A O ILE 175.A H 2.933 2.056 GLN 176.A N GLN 172.A O GLN 176.A H 2.993 2.097 GLN 176.A NE2 ASP 180.A OD2 GLN 176.A HE22 2.668 1.868 ALA 177.A N ALA 173.A O ALA 177.A H 2.940 2.074 ILE 178.A N GLY 174.A O ILE 178.A H 3.002 2.152 LYS 179.A N ILE 175.A O LYS 179.A H 2.983 2.072 ASP 180.A N GLN 176.A O ASP 180.A H 2.970 2.120 SER 181.A N ALA 177.A O SER 181.A H 2.999 2.231 SER 181.A N ILE 178.A O SER 181.A H 3.073 2.430 GLY 182.A N LYS 179.A O GLY 182.A H 3.277 2.444 ALA 183.A N SER 181.A OG ALA 183.A H 3.185 2.299 LEU 184.A N SER 165.A O LEU 184.A H 3.005 2.114 ILE 186.A N GLY 167.A O ILE 186.A H 2.908 2.033 GLY 187.A N VAL 199.A O GLY 187.A H 3.028 2.196 VAL 188.A N GLU 169.A O VAL 188.A H 3.024 2.204 GLY 189.A N VAL 201.A O GLY 189.A H 2.933 2.048 ARG 190.A NE GLU 192.A OE1 ARG 190.A HE 2.984 2.159 ASP 193.A N ARG 190.A O ASP 193.A H 2.923 2.086 LEU 194.A N ARG 190.A O LEU 194.A H 3.081 2.262 GLY 195.A N PRO 191.A O GLY 195.A H 2.822 2.015 VAL 201.A N GLY 187.A O VAL 201.A H 3.012 2.147 SER 205.A N ASP 203.A OD1 SER 205.A H 2.817 2.002 HIS 206.A N ASP 203.A O HIS 206.A H 3.340 2.448 TYR 207.A N THR 204.A O TYR 207.A H 3.052 2.195 PHE 211.A N THR 208.A OG1 PHE 211.A H 3.002 2.122 LEU 212.A N THR 208.A O LEU 212.A H 2.919 2.027 LYS 213.A N LEU 209.A O LYS 213.A H 2.951 2.103 GLU 214.A N GLU 210.A O GLU 214.A H 3.108 2.223 VAL 215.A N PHE 211.A O VAL 215.A H 3.010 2.151 TRP 216.A N LEU 212.A O TRP 216.A H 3.014 2.146 LEU 217.A N LYS 213.A O LEU 217.A H 3.066 2.171 GLN 218.A N GLU 214.A O GLN 218.A H 3.011 2.183 LYS 219.A N VAL 215.A O LYS 219.A H 3.053 2.328 LYS 219.A N TRP 216.A O LYS 219.A H 3.285 2.562