Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ynz_t.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N ILE 4.A O no hydrogen 3.375 N/A ASN 5.A N PHE 26.A O ASN 5.A H 2.899 2.070 ASN 5.A ND2 ARG 2.A O ASN 5.A HD21 2.285 1.686 HIS 6.A ND1 HIS 6.A O HIS 6.A HD1 2.405 1.725 GLN 14.A N ARG 80.A O GLN 14.A H 3.044 2.236 GLN 14.A NE2 ASP 79.A OD2 GLN 14.A HE21 3.439 2.623 ASN 16.A ND2 ASP 19.A OD1 ASN 16.A HD22 3.470 2.892 THR 17.A OG1 GLU 88.A OE1 THR 17.A HG1 2.853 2.034 ASP 19.A N ASN 16.A O ASP 19.A H 3.329 2.590 SER 21.A N ASP 79.A OD2 SER 21.A H 3.021 2.210 SER 21.A OG ASP 79.A OD2 SER 21.A HG 2.745 1.974 ARG 23.A N SER 78.A OG ARG 23.A H 2.877 2.029 ARG 23.A NH1 ASN 77.A O ARG 23.A HH11 3.228 2.381 THR 25.A N LEU 69.A O THR 25.A H 2.601 1.944 PHE 26.A N ASN 5.A O PHE 26.A H 2.725 1.931 LEU 27.A N VAL 67.A O LEU 27.A H 2.749 1.900 ARG 28.A N ILE 3.A O ARG 28.A H 2.956 2.159 GLY 29.A N ASN 66.A OD1 GLY 29.A H 2.390 1.749 LYS 30.A NZ ASP 60.A OD1 LYS 30.A HZ2 2.792 2.180 ASP 33.A N ASP 33.A OD1 ASP 33.A H 2.496 1.840 MET 37.A N ASN 66.A O MET 37.A H 2.441 1.676 ILE 38.A N THR 106.A O ILE 38.A H 2.543 1.708 PHE 39.A N TRP 68.A O PHE 39.A H 2.934 2.100 PHE 40.A N GLY 108.A O PHE 40.A H 2.906 2.103 ASP 45.A N GLU 42.A O ASP 45.A H 3.063 2.297 ASN 49.A ND2 ASP 45.A OD1 ASN 49.A HD22 3.129 2.381 TRP 50.A N THR 47.A O TRP 50.A H 3.070 2.268 ILE 51.A N ALA 48.A O ILE 51.A H 2.940 2.107 PHE 54.A N TRP 50.A O PHE 54.A H 3.281 2.454 GLN 58.A N ASN 56.A OD1 GLN 58.A H 3.265 2.446 TYR 59.A N ASN 56.A O TYR 59.A H 3.143 2.560 TYR 59.A OH ASN 291.A OD1 TYR 59.A HH 2.847 2.083 ASP 60.A N ASN 56.A O ASP 60.A H 2.820 1.974 HIS 64.A N ILE 61.A O HIS 64.A H 2.880 2.038 ARG 65.A NH1 THR 106.A OG1 ARG 65.A HH11 3.194 2.530 ASN 66.A N PRO 35.A O ASN 66.A H 2.948 2.190 ASN 66.A ND2 LEU 34.A O ASN 66.A HD22 3.530 3.053 VAL 67.A N LEU 27.A O VAL 67.A H 3.141 2.297 TRP 68.A N MET 37.A O TRP 68.A H 2.450 1.617 LEU 69.A N THR 25.A O LEU 69.A H 2.516 1.819 LEU 70.A N PHE 39.A O LEU 70.A H 3.101 2.292 ASN 71.A N ARG 23.A O ASN 71.A H 3.130 2.313 ARG 73.A NE ASP 92.A OD2 ARG 73.A HE 2.704 1.932 ARG 73.A NH1 THR 17.A OG1 ARG 73.A HH12 2.813 2.123 ARG 73.A NH1 SER 83.A O ARG 73.A HH11 3.169 2.380 ARG 73.A NH1 GLU 88.A OE1 ARG 73.A HH12 3.489 2.915 ARG 73.A NH2 THR 17.A OG1 ARG 73.A HH22 2.568 1.788 ARG 73.A NH2 ASP 92.A OD1 ARG 73.A HH21 3.141 2.319 ARG 73.A NH2 ASP 92.A OD2 ARG 73.A HH21 2.795 2.086 ASN 74.A N ASP 79.A O ASN 74.A H 2.742 1.902 ASN 74.A ND2 HIS 81.A O ASN 74.A HD21 2.379 1.574 PHE 75.A N PRO 72.A O PHE 75.A H 3.093 2.330 SER 78.A N PHE 75.A O SER 78.A H 3.254 2.493 SER 78.A OG ASN 71.A O SER 78.A HG 2.517 1.715 ASP 79.A N SER 21.A O ASP 79.A H 3.120 2.263 ARG 80.A N VAL 12.A O ARG 80.A H 3.218 2.375 ARG 80.A NH1 GLY 76.A O ARG 80.A HH12 3.081 2.241 ARG 80.A NH2 GLY 76.A O ARG 80.A HH22 3.498 2.786 HIS 81.A N ASN 74.A OD1 HIS 81.A H 2.678 1.967 HIS 81.A ND1 GLN 14.A O HIS 81.A HD1 2.808 2.010 SER 83.A OG GLU 88.A OE1 SER 83.A HG 2.671 2.081 ASP 85.A N SER 83.A OG ASP 85.A H 3.418 2.560 GLN 87.A N ASP 85.A OD1 GLN 87.A H 3.094 2.262 MET 89.A N ASP 85.A O MET 89.A H 2.761 1.913 SER 90.A N LEU 86.A O SER 90.A H 2.816 2.143 ASP 91.A N GLN 87.A O ASP 91.A H 3.151 2.340 ASP 92.A N GLU 88.A O ASP 92.A H 3.136 2.351 VAL 93.A N SER 90.A O VAL 93.A H 3.106 2.510 MET 94.A N SER 90.A O MET 94.A H 3.251 2.489 ARG 95.A N ASP 91.A O ARG 95.A H 3.013 2.213 ARG 95.A NH1 VAL 20.A O ARG 95.A HH11 3.241 2.401 PHE 96.A N ASP 92.A O PHE 96.A H 3.027 2.193 MET 97.A N VAL 93.A O MET 97.A H 2.775 1.933 TYR 98.A N MET 94.A O TYR 98.A H 2.981 2.243 SER 99.A N ARG 95.A O SER 99.A H 2.725 1.878 SER 99.A OG ARG 95.A O SER 99.A HG 3.379 2.821 SER 99.A OG PHE 96.A O SER 99.A HG 2.882 2.117 GLN 100.A N PHE 96.A O GLN 100.A H 2.880 2.066 LYS 101.A N TYR 98.A O LYS 101.A H 2.914 2.100 ILE 102.A N MET 97.A O ILE 102.A H 2.536 1.687 ALA 105.A N ARG 127.A O ALA 105.A H 3.315 2.583 THR 106.A N THR 36.A O THR 106.A H 2.811 1.961 LEU 107.A N GLY 130.A O LEU 107.A H 3.133 2.276 GLY 108.A N ILE 38.A O GLY 108.A H 2.740 1.993 GLY 109.A N PHE 132.A O GLY 109.A H 3.283 2.520 HIS 110.A N PHE 40.A O HIS 110.A H 3.194 2.449 GLY 111.A N ILE 134.A O GLY 111.A H 2.914 2.073 ILE 112.A N GLU 42.A OE2 ILE 112.A H 3.423 2.587 GLY 113.A N HIS 110.A O GLY 113.A H 2.810 2.096 GLY 114.A N GLY 111.A O GLY 114.A H 2.741 2.080 LYS 115.A NZ MET 139.A O LYS 115.A HZ1 2.550 1.741 LYS 115.A NZ LEU 221.A O LYS 115.A HZ2 3.222 2.586 ILE 116.A N ILE 112.A O ILE 116.A H 3.185 2.382 ALA 117.A N GLY 113.A O ALA 117.A H 2.927 2.112 LEU 118.A N GLY 114.A O LEU 118.A H 3.001 2.169 ALA 119.A N LYS 115.A O ALA 119.A H 2.887 2.103 VAL 120.A N ILE 116.A O VAL 120.A H 3.395 2.614 CYS 122.A N LEU 118.A O CYS 122.A H 2.915 2.198 TYR 123.A N ALA 119.A O TYR 123.A H 2.831 2.043 TYR 123.A OH ASN 228.A OD1 TYR 123.A HH 3.087 2.334 HIS 124.A N VAL 120.A O HIS 124.A H 2.516 1.700 HIS 124.A ND1 SER 90.A OG HIS 124.A HD1 3.136 2.423 VAL 128.A N ALA 125.A O VAL 128.A H 3.225 2.368 THR 129.A N ALA 105.A O THR 129.A H 3.313 2.489 THR 129.A OG1 ASP 305.A OD1 THR 129.A HG1 2.854 2.174 VAL 131.A N ARG 234.A O VAL 131.A H 2.762 2.039 PHE 132.A N LEU 107.A O PHE 132.A H 3.060 2.286 SER 133.A N HIS 236.A O SER 133.A H 2.965 2.149 ILE 134.A N GLY 109.A O ILE 134.A H 2.975 2.212 ASP 135.A N ILE 238.A O ASP 135.A H 2.807 1.990 GLN 141.A N GLY 222.A O GLN 141.A H 2.517 1.673 ARG 142.A N ASP 140.A OD1 ARG 142.A H 2.905 2.047 HIS 144.A N GLN 141.A O HIS 144.A H 3.084 2.260 LYS 148.A N HIS 144.A O LYS 148.A H 3.026 2.211 GLU 149.A N GLU 145.A O GLU 149.A H 3.214 2.387 PHE 150.A N ALA 146.A O PHE 150.A H 3.380 2.526 LYS 151.A N PHE 147.A O LYS 151.A H 2.586 1.732 GLY 152.A N LYS 148.A O GLY 152.A H 2.405 1.673 TYR 153.A N GLU 149.A O TYR 153.A H 2.570 1.735 VAL 154.A N PHE 150.A O VAL 154.A H 3.061 2.205 ASN 155.A N GLY 152.A O ASN 155.A H 3.141 2.542 ALA 156.A N GLY 152.A O ALA 156.A H 3.143 2.352 LEU 157.A N TYR 153.A O LEU 157.A H 2.946 2.158 THR 158.A N ASN 155.A O THR 158.A H 3.199 2.410 THR 158.A OG1 ASN 155.A O THR 158.A HG1 2.326 1.619 GLU 159.A N ALA 156.A O GLU 159.A H 3.037 2.188 TRP 165.A N ASN 161.A O TRP 165.A H 2.758 1.905 SER 166.A N ASP 169.A OD2 SER 166.A H 3.087 2.232 VAL 170.A N SER 166.A O VAL 170.A H 3.110 2.394 VAL 170.A N ASP 167.A O VAL 170.A H 3.265 2.607 LYS 171.A N ASP 167.A O LYS 171.A H 3.289 2.461 VAL 172.A N LYS 168.A O VAL 172.A H 3.099 2.255 PHE 173.A N ASP 169.A O PHE 173.A H 3.160 2.419 LEU 174.A N VAL 170.A O LEU 174.A H 2.956 2.181 LYS 175.A N LYS 171.A O LYS 175.A H 3.282 2.427 GLU 176.A N VAL 172.A O GLU 176.A H 3.354 2.519 ASN 177.A N PHE 173.A O ASN 177.A H 2.938 2.107 ILE 178.A N LEU 174.A O ILE 178.A H 2.573 1.766 LYS 182.A NZ TYR 284.A OH LYS 182.A HZ1 2.563 1.812 LYS 182.A NZ ASP 285.A OD2 LYS 182.A HZ3 3.485 2.713 TRP 183.A N ASP 180.A OD2 TRP 183.A H 2.618 1.759 ARG 184.A N ASP 180.A O ARG 184.A H 3.147 2.316 ARG 184.A NE ILE 178.A O ARG 184.A HE 3.154 2.392 ARG 184.A NH2 ILE 178.A O ARG 184.A HH21 3.148 2.446 SER 185.A N PRO 181.A O SER 185.A H 2.901 2.072 SER 185.A OG PRO 181.A O SER 185.A HG 3.399 2.733 SER 185.A OG LYS 182.A O SER 185.A HG 2.619 1.959 ILE 186.A N LYS 182.A O ILE 186.A H 2.800 1.976 PHE 187.A N TRP 183.A O PHE 187.A H 2.935 2.114 THR 188.A N ARG 184.A O THR 188.A H 3.014 2.180 THR 188.A OG1 ARG 184.A O THR 188.A HG1 3.329 2.617 THR 188.A OG1 SER 185.A O THR 188.A HG1 2.590 2.056 ASN 189.A N SER 185.A O ASN 189.A H 3.177 2.332 ASN 190.A N ILE 186.A O ASN 190.A H 3.118 2.458 ASN 190.A N PHE 187.A O ASN 190.A H 3.088 2.442 ASN 190.A ND2 CYS 44.A O ASN 190.A HD21 2.402 1.684 ILE 191.A N THR 188.A O ILE 191.A H 3.100 2.298 SER 192.A N SER 201.A O SER 192.A H 2.827 1.983 ASN 194.A N SER 199.A O ASN 194.A H 3.404 2.597 THR 197.A N ASN 194.A O THR 197.A H 3.104 2.500 SER 201.A N SER 192.A O SER 201.A H 2.921 2.098 ASN 203.A N ASN 190.A O ASN 203.A H 2.841 2.052 GLU 205.A N ASN 74.A O GLU 205.A H 3.232 2.430 TYR 208.A N GLU 205.A OE1 TYR 208.A H 2.508 1.695 LEU 209.A N GLU 205.A O LEU 209.A H 3.241 2.453 ASN 210.A N ILE 206.A O ASN 210.A H 3.078 2.238 ASN 210.A ND2 ASN 155.A OD1 ASN 210.A HD21 3.507 2.838 HIS 211.A N ASN 207.A O HIS 211.A H 3.263 2.418 ASN 212.A N TYR 208.A O ASN 212.A H 3.352 2.544 ASN 212.A ND2 ASP 219.A O ASN 212.A HD21 2.445 1.670 ASN 212.A ND2 ASP 219.A OD2 ASN 212.A HD22 3.046 2.420 LEU 213.A N LEU 209.A O LEU 213.A H 3.032 2.221 ASN 214.A N ASN 210.A O ASN 214.A H 2.525 1.673 PHE 215.A N HIS 211.A O PHE 215.A H 3.096 2.268 SER 220.A N LYS 217.A O SER 220.A H 2.610 1.772 LEU 221.A N ASN 212.A OD1 LEU 221.A H 2.744 2.066 ASN 223.A N SER 220.A O ASN 223.A H 3.102 2.355 LYS 227.A NZ ASP 85.A OD1 LYS 227.A HZ3 2.816 2.066 ASN 228.A N ALA 225.A O ASN 228.A H 3.243 2.405 GLY 229.A N VAL 226.A O GLY 229.A H 3.190 2.446 TYR 231.A N VAL 258.A O TYR 231.A H 3.052 2.255 ARG 234.A NE VAL 307.A O ARG 234.A HE 2.913 2.064 ARG 234.A NH1 LYS 312.A O ARG 234.A HH12 3.548 2.843 ARG 234.A NH2 VAL 307.A O ARG 234.A HH21 3.525 2.867 ARG 234.A NH2 HIS 308.A O ARG 234.A HH21 2.516 1.787 ARG 234.A NH2 LEU 311.A O ARG 234.A HH22 2.522 1.742 HIS 236.A N VAL 131.A O HIS 236.A H 2.883 2.076 HIS 236.A ND1 ALA 235.A O no hydrogen 2.925 N/A PHE 237.A N ASP 268.A O PHE 237.A H 2.757 1.921 ILE 238.A N SER 133.A O ILE 238.A H 3.051 2.230 PHE 239.A N PHE 270.A O PHE 239.A H 3.299 2.526 GLU 241.A N VAL 272.A O GLU 241.A H 2.755 2.022 ARG 244.A NH2 GLU 149.A OE1 ARG 244.A HH22 3.305 2.477 ARG 244.A NH2 GLU 149.A OE2 ARG 244.A HH22 3.132 2.412 HIS 247.A N ASN 251.A OD1 HIS 247.A H 2.434 1.604 ASN 251.A N HIS 247.A O ASN 251.A H 2.924 2.138 LEU 253.A N THR 250.A O LEU 253.A H 3.335 2.543 MET 255.A N THR 252.A O MET 255.A H 3.080 2.368 LYS 257.A N LEU 253.A O LYS 257.A H 2.841 2.067 VAL 258.A N PRO 254.A O VAL 258.A H 2.711 2.029 CYS 259.A N MET 255.A O CYS 259.A H 2.751 1.923 ALA 260.A N TYR 231.A O ALA 260.A H 3.203 2.370 LYS 263.A N ASP 268.A OD1 LYS 263.A H 3.058 2.239 GLY 266.A N ILE 269.A O GLY 266.A H 2.854 2.018 HIS 267.A N GLY 264.A O HIS 267.A H 3.182 2.340 ASP 268.A N GLY 264.A O ASP 268.A H 3.114 2.271 PHE 270.A N PHE 237.A O PHE 270.A H 2.941 2.139 VAL 272.A N PHE 239.A O VAL 272.A H 2.886 2.107 GLY 274.A N GLU 241.A OE1 GLY 274.A H 3.332 2.524 LEU 279.A N ASN 277.A OD1 LEU 279.A H 3.145 2.286 ASN 280.A N ASN 277.A O ASN 280.A H 2.900 2.044 ASN 280.A ND2 TYR 242.A O ASN 280.A HD21 2.200 1.655 HIS 281.A ND1 ASP 135.A OD2 HIS 281.A HD1 2.641 1.800 TRP 282.A N LEU 279.A O TRP 282.A H 3.096 2.256 ASP 285.A N TRP 282.A O ASP 285.A H 3.200 2.362 PHE 286.A N VAL 283.A O PHE 286.A H 3.173 2.551 ALA 290.A N PHE 286.A O ALA 290.A H 3.041 2.217 ASN 291.A N GLU 287.A O ASN 291.A H 2.774 1.926 VAL 293.A N TYR 289.A O VAL 293.A H 3.134 2.293 ALA 294.A N ALA 290.A O ALA 294.A H 2.764 1.923 SER 295.A N ASN 291.A O SER 295.A H 3.161 2.310 SER 295.A OG ASN 291.A O SER 295.A HG 3.106 2.416 SER 295.A OG VAL 292.A O SER 295.A HG 2.725 2.225 LYS 296.A N VAL 292.A O LYS 296.A H 2.900 2.045 LEU 297.A N VAL 293.A O LEU 297.A H 2.592 1.814 ASN 298.A N ALA 294.A O ASN 298.A H 2.650 1.802 ASN 298.A ND2 TYR 59.A O ASN 298.A HD21 2.961 2.252 LYS 299.A N SER 295.A O LYS 299.A H 2.957 2.174 PHE 300.A N LYS 296.A O PHE 300.A H 2.999 2.204 LEU 301.A N LEU 297.A O LEU 301.A H 2.976 2.148 HIS 302.A N ASN 298.A O HIS 302.A H 2.980 2.250 SER 303.A N LYS 299.A O SER 303.A H 3.046 2.212 TYR 304.A N PHE 300.A O TYR 304.A H 3.197 2.452 ASP 305.A N PHE 300.A O ASP 305.A H 2.497 1.744 GLY 306.A N THR 129.A O GLY 306.A H 3.274 2.481 HIS 308.A N HIS 343.A NE2 HIS 308.A H 3.205 2.425 LEU 310.A N HIS 308.A ND1 LEU 310.A H 3.272 2.472 LEU 311.A N HIS 308.A O LEU 311.A H 3.195 2.436 LYS 312.A N GLU 316.A OE1 LYS 312.A H 2.861 2.040 ARG 314.A N SER 303.A O ARG 314.A H 2.775 2.150 GLU 316.A N ASP 313.A O GLU 316.A H 3.317 2.511 ILE 317.A N ARG 314.A O ILE 317.A H 3.133 2.282 ASN 319.A N GLU 316.A O ASN 319.A H 3.239 2.388 ASN 319.A ND2 THR 315.A O ASN 319.A HD21 2.543 1.759 ASN 319.A ND2 ILE 317.A O ASN 319.A HD22 3.589 3.022 PHE 320.A N GLU 316.A O PHE 320.A H 3.151 2.403 ILE 322.A N TYR 339.A O ILE 322.A H 2.438 1.614 SER 328.A OG ARG 325.A O SER 328.A HG 2.664 1.976 ARG 329.A N TYR 336.A OH ARG 329.A H 2.965 2.132 LYS 333.A N ASP 331.A OD1 LYS 333.A H 2.967 2.268 TYR 339.A N ILE 322.A O TYR 339.A H 2.825 2.015 HIS 343.A ND1 PRO 341.A O HIS 343.A HD1 3.068 2.342 ASN 347.A N HIS 345.A ND1 ASN 347.A H 3.412 2.554 LYS 356.A N HIS 352.A O LYS 356.A H 2.837 2.046 HIS 357.A N ILE 353.A O HIS 357.A H 2.933 2.095 ASP 358.A N TYR 354.A O ASP 358.A H 2.995 2.185 LEU 360.A N LYS 356.A O LEU 360.A H 3.195 2.373 ASP 361.A N HIS 357.A O ASP 361.A H 2.874 2.084 LYS 362.A N ASP 358.A O LYS 362.A H 3.178 2.407 LYS 363.A N GLU 359.A O LYS 363.A H 3.156 2.373 LEU 364.A N LEU 360.A O LEU 364.A H 3.398 2.627 ASN 365.A N ASP 361.A O ASN 365.A H 3.430 2.630