Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yo5_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 2.A N ASP 40.A OD1 GLU 2.A H 2.866 1.961 ARG 4.A N THR 41.A O ARG 4.A H 2.843 1.949 ARG 4.A NH1 GLU 35.A O ARG 4.A HH11 3.216 2.477 ILE 6.A N HIS 43.A O ILE 6.A H 3.021 2.186 LEU 8.A N GLU 45.A O LEU 8.A H 3.055 2.189 TYR 9.A N GLY 21.A O TYR 9.A H 2.828 2.046 ALA 10.A N GLU 47.A O ALA 10.A H 2.998 2.162 GLU 11.A N GLY 19.A O GLU 11.A H 2.887 2.027 ARG 12.A NE ASP 51.A OD1 ARG 12.A HE 2.782 1.921 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD1 ARG 12.A HH21 3.524 2.896 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD2 ARG 12.A HH21 2.946 2.113 LEU 13.A N GLN 17.A O LEU 13.A H 2.866 1.956 GLN 17.A N ALA 14.A O GLN 17.A H 3.287 2.488 MET 18.A N LYS 126.A O MET 18.A H 2.836 1.966 GLY 19.A N GLU 11.A O GLY 19.A H 2.921 2.051 GLY 21.A N TYR 9.A O GLY 21.A H 2.869 2.030 GLY 25.A N GLU 11.A OE1 GLY 25.A H 2.757 1.867 ARG 26.A N GLU 23.A O ARG 26.A H 2.956 2.154 ALA 27.A N GLU 11.A OE2 ALA 27.A H 3.128 2.243 THR 28.A N TYR 20.A O THR 28.A H 3.065 2.203 GLY 31.A N TYR 129.A O GLY 31.A H 2.784 1.873 ILE 34.A N PRO 131.A O ILE 34.A H 3.142 2.253 LEU 36.A N ILE 133.A O LEU 36.A H 2.897 2.036 ASN 37.A N ASP 40.A OD2 ASN 37.A H 2.786 1.890 GLU 38.A N ARG 135.A O GLU 38.A H 2.819 1.936 GLY 39.A N THR 89.A OG1 GLY 39.A H 2.790 2.101 ASP 40.A N ASN 37.A O ASP 40.A H 2.898 2.002 THR 41.A N GLU 2.A O THR 41.A H 2.986 2.159 LEU 42.A N TRP 87.A O LEU 42.A H 2.746 1.846 HIS 43.A N ARG 4.A O HIS 43.A H 2.869 1.986 HIS 43.A ND1 THR 86.A OG1 HIS 43.A HD1 2.803 2.011 ILE 44.A N TYR 85.A O ILE 44.A H 2.721 1.824 GLU 45.A N ILE 6.A O GLU 45.A H 2.846 1.964 PHE 46.A N ARG 83.A O PHE 46.A H 2.836 1.953 GLU 47.A N LEU 8.A O GLU 47.A H 2.938 2.084 ASN 48.A N GLY 81.A O ASN 48.A H 2.877 2.033 ASN 48.A ND2 VAL 52.A O ASN 48.A HD21 2.846 1.963 ASN 48.A ND2 VAL 77.A O ASN 48.A HD22 3.140 2.348 ASN 48.A ND2 GLU 78.A O ASN 48.A HD22 3.289 2.692 THR 49.A N ALA 10.A O THR 49.A H 2.995 2.134 MET 50.A N ASN 48.A OD1 MET 50.A H 2.963 2.097 ARG 53.A NE ASP 76.A OD2 ARG 53.A HE 2.791 1.936 ARG 53.A NH2 ASP 76.A OD1 ARG 53.A HH21 2.914 2.038 ALA 54.A N VAL 77.A O ALA 54.A H 3.112 2.264 SER 55.A N ASP 112.A OD1 SER 55.A H 2.832 2.032 SER 55.A OG GLY 69.A O SER 55.A HG 2.664 1.881 LEU 56.A N TYR 85.A OH LEU 56.A H 3.427 2.564 HIS 57.A N HIS 111.A O HIS 57.A H 2.932 2.131 HIS 57.A ND1 ASP 68.A O HIS 57.A HD1 2.859 2.056 HIS 59.A N HIS 109.A O HIS 59.A H 2.943 2.038 ASP 62.A N ARG 88.A O ASP 62.A H 2.850 2.014 SER 67.A N GLU 64.A O SER 67.A H 2.787 1.909 ASP 68.A N VAL 65.A O ASP 68.A H 3.041 2.151 GLY 69.A N SER 75.A OG GLY 69.A H 2.993 2.274 ASN 73.A N THR 70.A OG1 ASN 73.A H 3.155 2.293 ASN 73.A ND2 ASP 68.A OD2 ASN 73.A HD22 2.940 2.065 LYS 74.A N THR 71.A O LYS 74.A H 2.920 2.047 SER 75.A N THR 70.A O SER 75.A H 2.982 2.095 SER 75.A OG VAL 65.A O SER 75.A HG 3.187 2.433 VAL 77.A N ALA 54.A O VAL 77.A H 2.859 2.087 GLY 80.A N ASN 48.A O GLY 80.A H 2.789 2.142 GLY 81.A N GLU 78.A O GLY 81.A H 2.848 1.975 ARG 83.A N PHE 46.A O ARG 83.A H 2.824 1.970 ARG 83.A NE SER 66.A O ARG 83.A HE 3.410 2.726 ARG 83.A NH2 SER 66.A O ARG 83.A HH21 2.959 2.149 TYR 85.A N ILE 44.A O TYR 85.A H 2.885 2.091 TYR 85.A OH SER 75.A O TYR 85.A HH 2.706 2.018 TRP 87.A N LEU 42.A O TRP 87.A H 2.869 1.982 ARG 88.A N ASP 62.A O ARG 88.A H 2.802 1.905 THR 89.A OG1 ASN 37.A O THR 89.A HG1 3.308 2.602 HIS 90.A ND1 ASP 62.A OD2 HIS 90.A HD1 2.644 1.787 HIS 90.A NE2 ALA 102.A O HIS 90.A HE2 2.655 1.813 GLY 93.A N ARG 101.A O GLY 93.A H 3.302 2.519 ARG 94.A NH1 GLY 98.A O ARG 94.A HH11 2.833 2.042 ARG 95.A N THR 99.A O ARG 95.A H 2.809 1.916 ARG 95.A NH1 THR 99.A OG1 ARG 95.A HH11 2.853 2.020 GLY 98.A N ARG 95.A O GLY 98.A H 2.916 2.038 THR 99.A N ASP 97.A OD1 THR 99.A H 2.972 2.079 ARG 101.A N GLY 93.A O ARG 101.A H 2.786 1.911 SER 104.A N HIS 90.A O SER 104.A H 2.993 2.102 ALA 105.A N GLU 38.A OE2 ALA 105.A H 2.833 1.996 GLY 106.A N VAL 134.A O GLY 106.A H 2.910 2.093 TYR 107.A OH GLU 175.A OE2 TYR 107.A HH 2.560 1.931 TRP 108.A N VAL 132.A O TRP 108.A H 2.846 1.964 TRP 108.A NE1 SER 104.A O TRP 108.A HE1 2.815 2.011 HIS 109.A NE2 ALA 221.A O HIS 109.A HE2 2.838 2.106 TYR 110.A N GLY 130.A O TYR 110.A H 2.865 1.987 HIS 111.A N HIS 57.A O HIS 111.A H 2.854 2.024 HIS 111.A ND1 ASP 112.A O HIS 111.A HD1 2.780 1.944 ASP 112.A N LEU 128.A O ASP 112.A H 3.131 2.306 HIS 113.A N SER 55.A OG HIS 113.A H 2.947 2.133 HIS 113.A ND1 HIS 113.A O HIS 113.A HD1 2.778 2.094 HIS 113.A ND1 GLU 118.A O HIS 113.A HD1 2.920 2.269 VAL 114.A N ASP 112.A OD1 VAL 114.A H 3.164 2.273 VAL 114.A N ASP 112.A OD2 VAL 114.A H 3.218 2.487 VAL 115.A N ASP 112.A OD2 VAL 115.A H 2.720 1.830 THR 117.A OG1 THR 121.A OG1 THR 117.A HG1 3.251 2.680 HIS 119.A N THR 117.A OG1 HIS 119.A H 3.063 2.190 GLY 120.A N THR 117.A O GLY 120.A H 2.952 2.057 THR 121.A N THR 117.A OG1 THR 121.A H 3.299 2.391 GLY 122.A N VAL 115.A O GLY 122.A H 2.996 2.347 GLY 123.A N VAL 115.A O GLY 123.A H 3.138 2.348 ILE 124.A N GLY 120.A O ILE 124.A H 2.791 1.881 ARG 125.A N THR 121.A O ARG 125.A H 3.013 2.140 LYS 126.A N GLY 122.A O LYS 126.A H 2.955 2.155 GLY 127.A N GLY 123.A O GLY 127.A H 3.094 2.466 GLY 127.A N ILE 124.A O GLY 127.A H 3.149 2.352 LEU 128.A N GLY 123.A O LEU 128.A H 2.869 1.969 TYR 129.A N GLY 127.A O TYR 129.A H 2.847 2.127 GLY 130.A N TYR 110.A O GLY 130.A H 2.892 2.058 VAL 132.A N TRP 108.A O VAL 132.A H 3.025 2.126 ILE 133.A N ILE 34.A O ILE 133.A H 2.916 2.066 VAL 134.A N GLY 106.A O VAL 134.A H 3.052 2.148 ARG 135.A N LEU 36.A O ARG 135.A H 2.849 1.974 ARG 135.A NE GLU 35.A OE2 ARG 135.A HE 2.796 1.941 ARG 135.A NH1 GLU 175.A OE2 ARG 135.A HH12 2.872 1.995 ARG 135.A NH2 GLU 175.A OE1 ARG 135.A HH22 2.823 1.944 ARG 136.A N ASP 139.A OD2 ARG 136.A H 2.910 2.008 ARG 136.A NE GLU 38.A OE1 ARG 136.A HE 2.930 2.075 ARG 136.A NH2 GLU 38.A OE2 ARG 136.A HH21 2.771 1.925 ASP 139.A N ARG 136.A O ASP 139.A H 2.890 2.026 ASP 143.A N ARG 173.A O ASP 143.A H 2.686 1.839 HIS 146.A N GLU 175.A O HIS 146.A H 2.787 1.938 ILE 148.A N VAL 177.A O ILE 148.A H 2.841 1.947 VAL 149.A N ASN 156.A OD1 VAL 149.A H 2.721 1.898 PHE 150.A N ILE 179.A O PHE 150.A H 2.885 2.118 ASN 151.A N LEU 154.A O ASN 151.A H 2.921 2.119 ASN 151.A ND2 ILE 124.A O ASN 151.A HD21 3.075 2.409 ASN 151.A ND2 ARG 125.A O ASN 151.A HD21 3.328 2.747 ASN 151.A ND2 ASN 157.A OD1 ASN 151.A HD22 2.917 2.036 ASP 152.A N HIS 181.A O ASP 152.A H 2.952 2.063 LEU 154.A N ASN 151.A O LEU 154.A H 2.862 1.995 ASN 156.A N VAL 149.A O ASN 156.A H 2.827 1.992 ASN 156.A ND2 THR 147.A O ASN 156.A HD21 3.069 2.193 ASN 157.A ND2 ARG 125.A O ASN 157.A HD21 3.074 2.260 ARG 158.A N ILE 155.A O ARG 158.A H 2.895 1.996 ARG 158.A NH1 SER 162.A O ARG 158.A HH11 2.526 1.908 HIS 161.A N GLY 252.A O HIS 161.A H 2.974 2.142 PHE 166.A N LEU 256.A O PHE 166.A H 2.898 2.043 ALA 168.A N LEU 258.A O ALA 168.A H 2.883 2.023 THR 169.A N ASP 172.A OD2 THR 169.A H 2.830 1.923 VAL 170.A N LYS 260.A O VAL 170.A H 2.838 1.949 GLY 171.A N ALA 230.A O GLY 171.A H 2.885 1.996 ASP 172.A N THR 169.A O ASP 172.A H 2.921 2.028 ARG 173.A N ASP 143.A OD2 ARG 173.A H 2.804 1.901 ARG 173.A NH1 GLN 227.A OE1 ARG 173.A HH11 2.959 2.143 VAL 174.A N VAL 228.A O VAL 174.A H 2.850 1.952 GLU 175.A N ALA 144.A O GLU 175.A H 2.904 1.997 PHE 176.A N PHE 226.A O PHE 176.A H 2.848 1.973 VAL 177.A N HIS 146.A O VAL 177.A H 2.882 2.002 MET 178.A N PHE 224.A O MET 178.A H 2.852 1.960 ILE 179.A N ILE 148.A O ILE 179.A H 2.988 2.112 THR 180.A N ASP 222.A O THR 180.A H 3.089 2.267 HIS 181.A N PHE 150.A O HIS 181.A H 2.842 1.990 GLU 183.A N ASP 152.A OD1 GLU 183.A H 2.879 2.136 HIS 186.A N VAL 218.A O HIS 186.A H 2.852 1.968 PHE 188.A N LYS 216.A O PHE 188.A H 2.886 2.043 HIS 189.A N HIS 242.A O HIS 189.A H 2.956 2.112 HIS 189.A ND1 ASP 214.A O HIS 189.A HD1 2.791 1.958 MET 190.A N ASP 214.A O MET 190.A H 3.353 2.555 HIS 191.A N MET 240.A O HIS 191.A H 2.800 1.894 HIS 193.A ND1 HIS 191.A O HIS 193.A HD1 3.028 2.162 TRP 195.A N VAL 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178.A O PHE 224.A H 3.025 2.171 PHE 226.A N PHE 176.A O PHE 226.A H 3.044 2.240 GLN 227.A NE2 VAL 140.A O GLN 227.A HE21 2.946 2.134 GLN 227.A NE2 GLU 175.A OE2 GLN 227.A HE22 3.284 2.415 VAL 228.A N VAL 174.A O VAL 228.A H 2.860 2.000 ALA 230.A N ASP 172.A O ALA 230.A H 2.846 1.966 GLU 232.A N ILE 229.A O GLU 232.A H 2.986 2.135 VAL 234.A N GLY 231.A O VAL 234.A H 2.883 1.986 GLY 235.A N GLY 231.A O GLY 235.A H 2.772 1.920 GLY 237.A N VAL 259.A O GLY 237.A H 2.798 1.952 TRP 239.A N PHE 257.A O TRP 239.A H 2.912 2.016 TRP 239.A NE1 GLY 235.A O TRP 239.A HE1 3.082 2.290 TYR 241.A N GLY 255.A O TYR 241.A H 2.956 2.089 HIS 242.A N HIS 189.A O HIS 242.A H 2.970 2.136 HIS 242.A ND1 CYS 243.A O HIS 242.A HD1 2.843 1.997 HIS 244.A N THR 187.A O HIS 244.A H 2.771 2.011 HIS 244.A N THR 187.A OG1 HIS 244.A H 3.339 2.606 HIS 244.A ND1 HIS 244.A O HIS 244.A HD1 2.761 2.055 SER 249.A N VAL 245.A O SER 249.A H 3.089 2.217 ASP 250.A N GLN 246.A O ASP 250.A H 2.959 2.183 MET 251.A N HIS 248.A O MET 251.A H 3.136 2.264 GLY 252.A N SER 249.A O GLY 252.A H 3.407 2.513 GLY 255.A N TYR 241.A O GLY 255.A H 3.119 2.220 LEU 256.A N ASN 165.A OD1 LEU 256.A H 2.909 2.102 PHE 257.A N TRP 239.A O PHE 257.A H 2.759 1.857 LEU 258.A N PHE 166.A O LEU 258.A H 2.740 1.877 VAL 259.A N GLY 237.A O VAL 259.A H 2.911 2.009 LYS 260.A N ALA 168.A O LYS 260.A H 2.797 1.900 LYS 261.A N THR 265.A O LYS 261.A H 2.787 1.889 GLY 264.A N LYS 261.A O GLY 264.A H 2.873 2.010 THR 265.A N ASP 263.A OD1 THR 265.A H 2.914 2.030