Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ypv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 5.A N ALA 2.A O ALA 5.A H 3.074 2.228 VAL 6.A N VAL 163.A O VAL 6.A H 2.956 2.141 LEU 8.A N VAL 161.A O LEU 8.A H 2.691 1.837 ARG 10.A N ASP 160.A OD1 ARG 10.A H 2.876 2.099 PHE 11.A N LEU 8.A O PHE 11.A H 3.382 2.593 ALA 12.A N GLY 159.A O ALA 12.A H 2.874 2.016 PHE 13.A N ARG 10.A O PHE 13.A H 3.220 2.379 ALA 16.A N PHE 13.A O ALA 16.A H 3.447 2.596 GLN 18.A NE2 ASP 22.A OD2 GLN 18.A HE21 3.099 2.240 LEU 19.A N ALA 15.A O LEU 19.A H 3.020 2.195 ILE 20.A N ALA 16.A O ILE 20.A H 2.940 2.162 ARG 21.A N.A GLU 17.A O no hydrogen 3.172 N/A ARG 21.A N.B GLU 17.A O no hydrogen 3.172 N/A ASP 22.A N GLN 18.A O ASP 22.A H.A 3.009 2.192 ILE 23.A N LEU 19.A O ILE 23.A H 2.864 2.059 ASN 24.A N ILE 20.A O ASN 24.A H 3.060 2.255 ASP 25.A N ARG 21.A O.A ASP 25.A H 3.137 2.354 ASP 25.A N ARG 21.A O.B ASP 25.A H 3.132 2.349 VAL 26.A N ASP 22.A O VAL 26.A H 2.883 2.033 ALA 27.A N ILE 23.A O ALA 27.A H 2.871 2.048 SER 28.A N ASN 24.A O SER 28.A H 2.959 2.264 SER 28.A N ASP 25.A O SER 28.A H 3.182 2.540 SER 28.A OG ASP 25.A O SER 28.A HG 2.665 1.849 GLN 29.A N VAL 26.A O GLN 29.A H 3.050 2.275 GLN 29.A NE2 ASP 25.A O GLN 29.A HE21 3.228 2.402 SER 30.A N VAL 26.A O SER 30.A H 2.914 2.091 SER 30.A OG ASP 68.A OD2 SER 30.A HG 2.750 2.059 ARG 33.A N MET 47.A O ARG 33.A H 2.933 2.138 ARG 33.A NE PRO 31.A O ARG 33.A HE 2.761 1.982 ARG 33.A NH1 ASP 68.A OD1 ARG 33.A HH12 3.002 2.163 ARG 33.A NH2 PRO 31.A O ARG 33.A HH21 2.812 2.069 ARG 33.A NH2 ASP 68.A OD1 ARG 33.A HH22 3.446 2.744 ARG 33.A NH2 ASP 68.A OD2 ARG 33.A HH22 2.729 1.913 GLN 34.A NE2 MET 43.A O GLN 34.A HE21 2.596 1.751 THR 37.A N TYR 41.A O THR 37.A H 2.772 1.921 GLY 40.A N THR 37.A O GLY 40.A H 2.781 1.926 TYR 41.A N THR 37.A OG1 TYR 41.A H 3.073 2.253 MET 43.A N MET 35.A O MET 43.A H 2.988 2.130 ALA 46.A N ARG 107.A O ALA 46.A H 3.141 2.312 MET 47.A N ARG 33.A O MET 47.A H 3.043 2.241 THR 48.A N ILE 105.A O THR 48.A H 3.060 2.321 THR 48.A OG1 SER 30.A O THR 48.A HG1 2.705 1.918 ASN 49.A ND2 TRP 55.A O ASN 49.A HD21 2.801 2.084 CYS 50.A N CYS 103.A O CYS 50.A H 3.082 2.319 GLY 51.A N PRO 76.A O GLY 51.A H 2.870 2.043 LEU 53.A N ASP 101.A O LEU 53.A H 3.023 2.207 GLY 54.A N SER 65.A O GLY 54.A H 2.935 2.115 TRP 55.A N ASN 49.A OD1 TRP 55.A H 3.043 2.350 TRP 55.A NE1 ASP 121.A OD2 TRP 55.A HE1 3.116 2.269 THR 56.A N LEU 63.A O THR 56.A H 3.009 2.197 THR 57.A OG1 VAL 36.A O THR 57.A HG1 3.438 2.725 HIS 58.A N GLY 61.A O HIS 58.A H 2.615 1.795 LEU 63.A N THR 56.A O LEU 63.A H 3.036 2.258 TYR 64.A OH GLU 122.A OE1 TYR 64.A HH 2.406 1.663 SER 65.A N GLY 54.A O SER 65.A H 3.040 2.197 ILE 67.A N SER 65.A OG ILE 67.A H 3.280 2.427 ASP 68.A N LYS 73.A O ASP 68.A H 2.759 1.903 GLN 70.A N ASP 68.A OD1 GLN 70.A H 2.771 1.928 THR 71.A N ASP 68.A O THR 71.A H 3.160 2.424 ASN 72.A N ASP 68.A O ASN 72.A H 2.626 1.883 LYS 73.A N THR 71.A OG1 LYS 73.A H 3.234 2.467 TRP 75.A NE1 SER 65.A O TRP 75.A HE1 2.839 2.137 HIS 83.A N PRO 79.A O HIS 83.A H 3.202 2.353 ASN 84.A N GLN 80.A O ASN 84.A H 2.820 1.962 LEU 85.A N SER 81.A O LEU 85.A H 2.996 2.148 CYS 86.A N PHE 82.A O CYS 86.A H 2.934 2.076 GLN 87.A N HIS 83.A O GLN 87.A H 2.998 2.144 ARG 88.A N ASN 84.A O ARG 88.A H 2.997 2.157 ALA 89.A N LEU 85.A O ALA 89.A H 2.953 2.134 ALA 90.A N CYS 86.A O ALA 90.A H 2.803 1.949 THR 91.A N GLN 87.A O THR 91.A H 2.919 2.067 ALA 92.A N ARG 88.A O ALA 92.A H 3.095 2.258 ALA 93.A N ALA 89.A O ALA 93.A H 3.009 2.229 GLY 94.A N THR 91.A O GLY 94.A H 3.000 2.168 TYR 95.A N ALA 90.A O TYR 95.A H 2.742 1.894 PHE 98.A N TYR 95.A O PHE 98.A H 3.282 2.427 GLN 99.A N GLN 197.A OE1 GLN 99.A H 3.369 2.516 ASP 101.A N ARG 196.A O ASP 101.A H 3.012 2.310 ALA 102.A N ARG 196.A O ALA 102.A H 3.219 2.534 CYS 103.A N CYS 50.A O CYS 103.A H 2.929 2.185 LEU 104.A N THR 194.A O LEU 104.A H 3.181 2.393 ILE 105.A N THR 48.A O ILE 105.A H 2.732 1.886 ASN 106.A N ASN 192.A O ASN 106.A H 2.785 1.936 ASN 106.A ND2 TYR 108.A OH ASN 106.A HD22 3.476 2.660 ARG 107.A N ALA 46.A O ARG 107.A H 2.745 1.928 TYR 108.A N ARG 190.A O TYR 108.A H 2.727 1.903 GLY 111.A N LEU 178.A O GLY 111.A H 2.905 2.087 ALA 112.A N ALA 109.A O ALA 112.A H 2.864 2.012 LYS 113.A N SER 44.A OG LYS 113.A H 3.164 2.318 LEU 114.A N ILE 175.A O LEU 114.A H 3.059 2.243 HIS 117.A N HIS 173.A O HIS 117.A H 2.879 2.161 HIS 117.A ND1 SER 115.A O HIS 117.A HD1 2.857 2.011 GLN 118.A NE2 LEU 170.A O GLN 118.A HE21 2.626 1.833 ARG 126.A N ASP 124.A OD1 ARG 126.A H 2.979 2.207 ALA 127.A N ASP 124.A O ALA 127.A H 3.347 2.505 ILE 129.A N TRP 164.A O ILE 129.A H 3.177 2.385 VAL 130.A N PHE 195.A O VAL 130.A H 3.291 2.504 SER 131.A N VAL 162.A O SER 131.A H 2.731 1.887 VAL 132.A N LEU 193.A O VAL 132.A H 2.757 1.963 SER 133.A N ASP 160.A O SER 133.A H 2.960 2.129 LEU 134.A N TYR 191.A O LEU 134.A H 2.815 2.035 GLY 135.A N HIS 158.A ND1 GLY 135.A H 3.071 2.223 LEU 136.A N CYS 189.A O LEU 136.A H 3.245 2.412 ALA 138.A N LEU 156.A O ALA 138.A H 2.925 2.103 PHE 140.A N LEU 154.A O PHE 140.A H 2.768 1.991 GLN 141.A N GLY 174.A O GLN 141.A H 3.021 2.174 PHE 142.A N LYS 152.A O PHE 142.A H 2.894 2.086 GLY 143.A N TYR 172.A O GLY 143.A H 2.908 2.104 LYS 146.A N ASP 149.A OD2 LYS 146.A H 2.952 2.115 ASP 149.A N LYS 146.A O ASP 149.A H 3.379 2.530 LYS 152.A N PHE 142.A O LYS 152.A H 2.702 1.853 ARG 153.A NE GLN 176.A OE1 ARG 153.A HE 2.632 1.823 LEU 154.A N PHE 140.A O LEU 154.A H 2.715 1.913 LEU 156.A N ALA 138.A O LEU 156.A H 2.790 1.943 GLU 157.A N ASP 160.A OD2 GLU 157.A H 2.840 1.982 GLY 159.A N SER 133.A O GLY 159.A H 2.748 1.935 ASP 160.A N GLU 157.A O ASP 160.A H 2.956 2.105 VAL 161.A N LEU 8.A O VAL 161.A H 2.931 2.085 VAL 162.A N SER 131.A O VAL 162.A H 2.886 2.070 VAL 163.A N VAL 6.A O VAL 163.A H 2.852 2.014 TRP 164.A N ILE 129.A O TRP 164.A H 2.778 1.931 GLY 165.A N GLY 4.A O GLY 165.A H 2.927 2.219 SER 168.A N ALA 3.A O SER 168.A H 2.907 2.184 SER 168.A OG GLY 165.A O SER 168.A HG 2.736 1.899 ARG 169.A N GLY 166.A O ARG 169.A H 2.937 2.144 ARG 169.A NE ALA 127.A O ARG 169.A HE 2.836 2.120 ARG 169.A NH1 ASP 119.A O ARG 169.A HH12 2.414 1.595 ARG 169.A NH1 ARG 169.A O ARG 169.A HH11 3.128 2.312 ARG 169.A NH2 GLU 122.A OE2 ARG 169.A HH22 2.601 1.773 LEU 170.A N GLU 167.A O LEU 170.A H 2.988 2.129 PHE 171.A N SER 168.A O PHE 171.A H 3.210 2.357 TYR 172.A N GLY 144.A O TYR 172.A H 2.946 2.124 HIS 173.A N HIS 117.A O HIS 173.A H 2.945 2.194 HIS 173.A ND1 PHE 171.A O HIS 173.A HD1 2.884 2.057 GLY 174.A N GLN 141.A O GLY 174.A H 2.835 2.096 ILE 175.A N LEU 114.A O ILE 175.A H 2.790 1.973 GLN 176.A N ILE 139.A O GLN 176.A H 3.112 2.267 LEU 178.A N ALA 112.A O LEU 178.A H 2.907 2.109 HIS 183.A N ILE 187.A O HIS 183.A H 2.980 2.178 LEU 185.A N HIS 183.A ND1 LEU 185.A H 3.191 2.344 THR 186.A OG1 CYS 189.A O THR 186.A HG1 2.764 2.134 ILE 187.A N HIS 183.A O ILE 187.A H 2.662 1.920 ASP 188.A N THR 186.A O ASP 188.A H 2.772 2.112 ARG 190.A N TYR 108.A O ARG 190.A H 2.974 2.177 ARG 190.A NH2 SER 133.A OG ARG 190.A HH21 2.793 2.042 TYR 191.A N LEU 134.A O TYR 191.A H 2.741 1.945 ASN 192.A N ASN 106.A O ASN 192.A H 2.906 2.105 ASN 192.A ND2 SER 131.A OG ASN 192.A HD21 2.928 2.085 LEU 193.A N VAL 132.A O LEU 193.A H 2.867 2.057 THR 194.A N LEU 104.A O THR 194.A H 3.039 2.219 THR 194.A OG1 LEU 104.A O THR 194.A HG1 3.430 2.883 PHE 195.A N VAL 130.A O PHE 195.A H 2.781 1.959 ARG 196.A N ALA 102.A O ARG 196.A H 2.825 2.006 ARG 196.A NE THR 194.A O ARG 196.A HE 3.265 2.637 ARG 196.A NE THR 194.A OG1 ARG 196.A HE 3.069 2.284 ARG 196.A NH1 TYR 64.A OH ARG 196.A HH11 2.945 2.186 ARG 196.A NH2 THR 194.A OG1 ARG 196.A HH21 3.051 2.275 ALA 198.A N ASP 101.A OD1 ALA 198.A H 2.686 1.836 GLY 199.A N ASP 101.A OD2 GLY 199.A H 2.592 1.943