Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yqi_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ALA 8.A N GLY 4.A O ALA 8.A H 2.899 2.057 ALA 9.A N ASN 5.A O ALA 9.A H 2.977 2.128 LYS 10.A N ALA 6.A O LYS 10.A H 3.000 2.162 LYS 11.A N ALA 7.A O LYS 11.A H 2.948 2.123 GLY 12.A N ALA 8.A O GLY 12.A H 2.884 2.038 GLU 13.A N LYS 10.A O GLU 13.A H 2.913 2.089 GLN 14.A N LYS 11.A O GLN 14.A H 2.931 2.144 GLU 15.A N GLY 12.A O GLU 15.A H 2.963 2.145 VAL 17.A N GLU 13.A O VAL 17.A H 3.003 2.224 LYS 18.A N GLN 14.A O LYS 18.A H 3.151 2.351 LYS 18.A NZ GLU 15.A OE2 LYS 18.A HZ2 2.554 1.677 GLU 19.A N GLU 15.A O GLU 19.A H 3.032 2.231 PHE 20.A N SER 16.A O PHE 20.A H 2.890 2.045 LEU 21.A N VAL 17.A O LEU 21.A H 2.854 2.036 ALA 22.A N LYS 18.A O ALA 22.A H 2.937 2.137 LYS 23.A N GLU 19.A O LYS 23.A H 3.170 2.332 ALA 24.A N PHE 20.A O ALA 24.A H 2.896 2.074 LYS 25.A N LEU 21.A O LYS 25.A H 2.861 2.077 GLU 26.A N ALA 22.A O GLU 26.A H 3.135 2.301 GLU 27.A N LYS 23.A O GLU 27.A H 3.014 2.205 PHE 28.A N ALA 24.A O PHE 28.A H 2.913 2.072 LEU 29.A N LYS 25.A O LEU 29.A H 2.920 2.073 LYS 30.A N GLU 26.A O LYS 30.A H 3.170 2.336 LYS 31.A N GLU 27.A O LYS 31.A H 3.200 2.378 TRP 32.A N PHE 28.A O TRP 32.A H 2.736 1.902 GLU 33.A N LYS 30.A O GLU 33.A H 3.350 2.584 SER 34.A N LYS 30.A O SER 34.A H 2.926 2.144 GLN 38.A NE2 ASP 40.A OD1 GLN 38.A HE21 2.652 1.813 GLN 38.A NE2 ASP 40.A OD2 GLN 38.A HE21 3.451 2.738 HIS 41.A N GLN 38.A O HIS 41.A H 3.017 2.179 PHE 42.A N LEU 39.A O PHE 42.A H 3.091 2.298 ASP 43.A N LYS 57.A O ASP 43.A H 2.796 1.959 ILE 45.A N LEU 55.A O ILE 45.A H 2.865 2.023 LYS 46.A NZ ASP 323.A OD1 LYS 46.A HZ1 2.882 2.051 THR 47.A N GLU 326.A OE2 THR 47.A H 2.869 2.010 THR 47.A OG1 GLU 326.A OE1 THR 47.A HG1 2.648 1.932 LEU 48.A N VAL 53.A O LEU 48.A H 2.759 1.938 GLY 49.A N VAL 53.A O GLY 49.A H 3.366 2.612 ARG 52.A N ILE 69.A O no hydrogen 3.096 N/A VAL 53.A N GLY 49.A O VAL 53.A H 2.848 2.003 MET 54.A N MET 67.A O MET 54.A H 2.850 2.025 LEU 55.A N LYS 46.A O LEU 55.A H 2.715 1.975 VAL 56.A N TYR 65.A O VAL 56.A H 2.881 2.040 LYS 57.A N ASP 43.A O LYS 57.A H 2.818 2.015 HIS 58.A N ASN 63.A O HIS 58.A H 2.808 1.973 LYS 59.A N HIS 41.A O LYS 59.A H 2.918 2.063 LYS 59.A NZ ASP 40.A O LYS 59.A HZ2 2.956 2.230 THR 61.A N HIS 58.A ND1 THR 61.A H 3.213 2.364 THR 61.A OG1 HIS 58.A ND1 THR 61.A HG1 3.191 2.399 GLY 62.A N HIS 58.A O GLY 62.A H 2.730 1.973 ASN 63.A N THR 61.A OG1 ASN 63.A H 3.127 2.270 ASN 63.A ND2 TYR 65.A OH ASN 63.A HD22 3.322 2.479 TYR 65.A N VAL 56.A O TYR 65.A H 2.913 2.110 ALA 66.A N MET 116.A O ALA 66.A H 2.828 2.013 MET 67.A N MET 54.A O MET 67.A H 2.764 1.912 LYS 68.A N MET 114.A O LYS 68.A H 2.772 1.944 LYS 68.A NZ GLU 87.A OE1 LYS 68.A HZ3 2.873 2.106 LYS 68.A NZ GLU 87.A OE2 LYS 68.A HZ3 3.318 2.509 ILE 69.A N ARG 52.A O ILE 69.A H 2.821 1.986 LEU 70.A N LEU 112.A O LEU 70.A H 2.888 2.049 LYS 72.A N SER 110.A O LYS 72.A H 2.978 2.130 LYS 72.A NZ ASP 108.A O LYS 72.A HZ1 2.677 1.957 LYS 72.A NZ LYS 335.A O LYS 72.A HZ2 2.867 2.012 LYS 74.A N ASP 71.A OD1 LYS 74.A H 3.056 2.253 VAL 75.A N ASP 71.A O VAL 75.A H 2.943 2.139 VAL 76.A N LYS 72.A O VAL 76.A H 3.052 2.235 LYS 77.A N GLN 73.A O LYS 77.A H 3.060 2.225 LEU 78.A N LYS 74.A O LEU 78.A H 2.996 2.190 LYS 79.A N VAL 76.A O LYS 79.A H 2.965 2.129 GLN 80.A N VAL 75.A O GLN 80.A H 2.894 2.034 GLN 80.A NE2 LEU 78.A O GLN 80.A HE21 3.074 2.222 HIS 83.A ND1 GLN 80.A OE1 HIS 83.A HD1 2.717 1.871 THR 84.A N GLN 80.A O THR 84.A H 2.919 2.127 THR 84.A OG1 GLN 80.A O THR 84.A HG1 2.808 2.003 LEU 85.A N ILE 81.A O LEU 85.A H 3.005 2.189 ASN 86.A N GLU 82.A O ASN 86.A H 2.831 2.003 GLU 87.A N HIS 83.A O GLU 87.A H 2.970 2.176 LYS 88.A N THR 84.A O LYS 88.A H 3.283 2.442 LYS 88.A NZ GLU 342.A O LYS 88.A HZ2 3.385 2.795 LYS 88.A NZ PHE 343.A OXT LYS 88.A HZ2 2.700 1.990 ARG 89.A N LEU 85.A O ARG 89.A H 3.018 2.162 ILE 90.A N ASN 86.A O ILE 90.A H 2.847 1.990 LEU 91.A N GLU 87.A O LEU 91.A H 2.967 2.120 GLN 92.A N.A LYS 88.A O GLN 92.A H.A 2.997 2.190 GLN 92.A N.B LYS 88.A O GLN 92.A H.B 2.981 2.154 ALA 93.A N ILE 90.A O ALA 93.A H 3.061 2.266 VAL 94.A N ILE 90.A O VAL 94.A H 3.075 2.348 ASN 95.A N TYR 151.A OH ASN 95.A H 2.896 2.073 LEU 99.A N PHE 96.A O LEU 99.A H 3.200 2.343 VAL 100.A N VAL 177.A O VAL 100.A H 3.045 2.194 GLU 103.A N VAL 115.A O GLU 103.A H 2.734 1.895 PHE 104.A N VAL 115.A O PHE 104.A H 3.150 2.338 PHE 106.A N TYR 113.A O PHE 106.A H 3.096 2.295 LYS 107.A NZ PHE 340.A O LYS 107.A HZ1 2.801 2.136 LYS 107.A NZ PHE 343.A O LYS 107.A HZ2 2.937 2.091 ASP 108.A N ASN 111.A O ASP 108.A H 3.006 2.186 SER 110.A N ASP 108.A OD1 SER 110.A H 2.947 2.156 ASN 111.A N ASP 108.A OD1 ASN 111.A H 2.793 1.980 ASN 111.A ND2 TYR 113.A OH ASN 111.A HD22 2.948 2.097 LEU 112.A N LEU 70.A O LEU 112.A H 2.814 2.003 TYR 113.A N PHE 106.A O TYR 113.A H 2.829 2.042 TYR 113.A OH ASP 108.A OD2 TYR 113.A HH 2.655 1.904 MET 114.A N LYS 68.A O MET 114.A H 2.984 2.171 VAL 115.A N PHE 104.A O VAL 115.A H 2.809 1.950 MET 116.A N ALA 66.A O MET 116.A H 2.768 1.912 GLU 117.A N LYS 101.A O GLU 117.A H 2.957 2.139 TYR 118.A OH ASP 317.A O TYR 118.A HH 2.594 1.782 GLY 121.A N ILE 169.A O GLY 121.A H 2.940 2.340 MET 124.A N LEU 167.A O MET 124.A H 2.705 1.856 PHE 125.A N PRO 164.A O PHE 125.A H 3.202 2.459 SER 126.A N.B GLU 123.A O SER 126.A H.B 3.140 2.486 SER 126.A OG.B GLU 123.A O SER 126.A HG.B 3.130 2.476 HIS 127.A NE2 GLY 121.A O HIS 127.A HE2 2.723 1.874 LEU 128.A N MET 124.A O LEU 128.A H 2.823 1.987 ARG 129.A N PHE 125.A O ARG 129.A H 2.906 2.059 ARG 129.A NH1 GLU 224.A OE2 ARG 129.A HH12 3.053 2.323 ARG 129.A NH2 GLU 224.A OE2 ARG 129.A HH22 2.857 2.059 ARG 130.A N SER 126.A O.A ARG 130.A H 2.901 2.110 ARG 130.A N SER 126.A O.B ARG 130.A H 3.047 2.274 ILE 131.A N HIS 127.A O ILE 131.A H 2.984 2.157 GLY 132.A N LEU 128.A O GLY 132.A H 2.845 2.096 PHE 134.A N MET 225.A O PHE 134.A H 2.844 1.990 HIS 137.A NE2 TYR 141.A OH HIS 137.A HE2 3.053 2.235 ARG 139.A N GLU 135.A O ARG 139.A H 2.801 1.999 ARG 139.A NH2 TRP 290.A O ARG 139.A HH21 2.934 2.268 PHE 140.A N PRO 136.A O PHE 140.A H 3.036 2.245 TYR 141.A N HIS 137.A O TYR 141.A H 3.418 2.595 ALA 142.A N ALA 138.A O ALA 142.A H 2.814 1.979 ALA 143.A N ARG 139.A O ALA 143.A H 2.867 2.049 GLN 144.A NE2 PHE 140.A O GLN 144.A HE21 3.038 2.233 ILE 145.A N TYR 141.A O ILE 145.A H 3.228 2.432 VAL 146.A N ALA 142.A O VAL 146.A H 2.894 2.064 LEU 147.A N ALA 143.A O LEU 147.A H 3.066 2.232 THR 148.A N GLN 144.A O THR 148.A H 2.955 2.143 THR 148.A OG1 GLN 144.A O THR 148.A HG1 2.786 1.967 PHE 149.A N ILE 145.A O PHE 149.A H 2.839 1.998 GLU 150.A N VAL 146.A O GLU 150.A H 2.870 2.056 TYR 151.A N LEU 147.A O TYR 151.A H 2.988 2.158 LEU 152.A N THR 148.A O LEU 152.A H 2.862 2.019 HIS 153.A N PHE 149.A O HIS 153.A H 2.806 1.951 HIS 153.A NE2 ASP 214.A OD2 HIS 153.A HE2 2.793 1.939 SER 154.A N GLU 150.A O SER 154.A H 3.183 2.415 SER 154.A OG TYR 151.A O SER 154.A HG 2.757 1.917 LEU 155.A N LEU 152.A O LEU 155.A H 2.980 2.284 ASP 156.A N HIS 153.A O ASP 156.A H 2.921 2.097 LEU 157.A N LEU 152.A O LEU 157.A H 2.976 2.137 ILE 158.A N.A LYS 184.A O ILE 158.A H.A 2.928 2.098 ILE 158.A N.B LYS 184.A O ILE 158.A H.B 2.942 2.125 TYR 159.A N ASP 214.A OD2 TYR 159.A H 2.908 2.052 TYR 159.A OH THR 178.A O TYR 159.A HH 2.567 1.824 TYR 159.A OH ASP 179.A O TYR 159.A HH 3.331 2.771 ARG 160.A N ASP 214.A OD1 ARG 160.A H 2.897 2.047 ARG 160.A NE PHE 182.A O ARG 160.A HE 2.793 1.994 ARG 160.A NH1 TYR 209.A OH ARG 160.A HH11 2.800 2.060 ARG 160.A NH2 PHE 182.A O ARG 160.A HH21 2.946 2.217 LYS 163.A NZ THR 195.A OG1 LYS 163.A HZ2 2.776 1.895 GLU 165.A N GLU 165.A OE1 GLU 165.A H 2.708 1.932 ASN 166.A N LYS 163.A O ASN 166.A H 2.988 2.167 ASN 166.A ND2 ASP 161.A O ASN 166.A HD22 2.916 2.211 ASN 166.A ND2 ASP 161.A OD2 ASN 166.A HD21 3.090 2.363 LEU 167.A N PRO 164.A O LEU 167.A H 3.272 2.422 LEU 168.A N GLN 176.A O LEU 168.A H 2.875 2.019 ILE 169.A N GLY 122.A O ILE 169.A H 2.873 2.051 ASP 170.A N TYR 174.A O ASP 170.A H 2.814 1.977 GLN 172.A N ASP 170.A OD1 GLN 172.A H 2.861 2.141 GLY 173.A N ASP 170.A O GLY 173.A H 2.918 2.066 TYR 174.A N ASP 170.A OD1 TYR 174.A H 2.951 2.165 TYR 174.A OH VAL 304.A O TYR 174.A HH 2.617 1.913 ILE 175.A N GLN 144.A OE1 ILE 175.A H 2.777 1.920 GLN 176.A N LEU 168.A O GLN 176.A H 2.795 1.978 VAL 177.A N PHE 98.A O VAL 177.A H 2.762 1.922 THR 178.A N ASN 166.A O THR 178.A H 3.059 2.211 THR 178.A OG1 ASP 179.A OD1 THR 178.A HG1 2.850 2.097 PHE 180.A N GLU 87.A OE2 PHE 180.A H 2.882 2.128 ALA 183.A N PHE 180.A O ALA 183.A H 3.014 2.207 LYS 184.A N ILE 158.A O.A LYS 184.A H 3.003 2.248 LYS 184.A N ILE 158.A O.B LYS 184.A H 3.055 2.286 LYS 184.A NZ THR 190.A OG1 LYS 184.A HZ3 2.829 2.003 ARG 185.A NE LEU 155.A O ARG 185.A HE 2.687 1.842 ARG 185.A NH2 LEU 155.A O ARG 185.A HH21 3.448 2.836 VAL 186.A N ASP 156.A O VAL 186.A H 2.716 1.879 ARG 189.A NH1 GLY 208.A O ARG 189.A HH11 3.558 2.880 THR 190.A N TYR 209.A O THR 190.A H 2.835 2.047 THR 195.A OG1 ASP 161.A OD1 THR 195.A HG1 2.776 2.057 GLU 197.A N GLU 197.A OE1 GLU 197.A H 2.730 1.987 TYR 198.A N THR 195.A O TYR 198.A H 2.836 2.026 TYR 198.A OH GLU 224.A OE1 TYR 198.A HH 2.686 1.890 LEU 199.A N PRO 196.A O LEU 199.A H 3.207 2.351 GLU 202.A N GLU 202.A OE1 GLU 202.A H 2.841 2.025 ILE 203.A N ALA 200.A O ILE 203.A H 3.032 2.364 ILE 204.A N ALA 200.A O ILE 204.A H 3.397 2.573 LEU 205.A N PRO 201.A O LEU 205.A H 2.905 2.137 SER 206.A N ILE 203.A O SER 206.A H 2.973 2.129 LYS 207.A N GLU 202.A O LYS 207.A H 3.062 2.222 TYR 209.A N THR 190.A O TYR 209.A H 2.927 2.085 ASN 210.A ND2 ASN 277.A OD1 ASN 210.A HD21 3.274 2.492 ALA 212.A N ASN 210.A OD1 ALA 212.A H 2.910 2.100 VAL 213.A N ASN 210.A O VAL 213.A H 3.125 2.267 ASP 214.A N LYS 211.A O ASP 214.A H 2.950 2.162 TRP 216.A N ALA 212.A O TRP 216.A H 3.086 2.249 ALA 217.A N VAL 213.A O ALA 217.A H 3.015 2.184 LEU 218.A N ASP 214.A O LEU 218.A H 2.906 2.128 GLY 219.A N TRP 215.A O GLY 219.A H 3.144 2.340 VAL 220.A N TRP 216.A O VAL 220.A H 3.085 2.303 LEU 221.A N ALA 217.A O LEU 221.A H 2.866 2.050 ILE 222.A N LEU 218.A O ILE 222.A H 2.849 2.001 TYR 223.A N GLY 219.A O TYR 223.A H 2.994 2.137 TYR 223.A OH ARG 250.A O TYR 223.A HH 2.678 1.838 GLU 224.A N VAL 220.A O GLU 224.A H 2.862 2.027 MET 225.A N LEU 221.A O MET 225.A H 2.817 1.970 ALA 226.A N ILE 222.A O ALA 226.A H 3.008 2.207 ALA 227.A N TYR 223.A O ALA 227.A H 2.777 2.010 GLY 228.A N GLU 224.A O GLY 228.A H 2.781 1.970 GLN 236.A N GLN 239.A OE1 GLN 236.A H 3.175 2.422 ILE 240.A N GLN 236.A O ILE 240.A H 3.086 2.273 TYR 241.A N PRO 237.A O TYR 241.A H 2.863 2.045 GLU 242.A N ILE 238.A O GLU 242.A H 3.107 2.294 LYS 243.A N GLN 239.A O LYS 243.A H 3.218 2.401 ILE 244.A N ILE 240.A O ILE 244.A H 2.989 2.180 VAL 245.A N TYR 241.A O VAL 245.A H 3.028 2.206 SER 246.A N GLU 242.A O SER 246.A H 3.145 2.308 SER 246.A OG LYS 243.A O SER 246.A HG 2.792 1.955 GLY 247.A N LYS 243.A O GLY 247.A H 3.129 2.332 LYS 248.A N SER 246.A OG LYS 248.A H 3.020 2.227 PHE 255.A N PRO 252.A O PHE 255.A H 3.055 2.208 SER 256.A N GLU 135.A OE2 SER 256.A H 2.882 2.047 LEU 259.A N SER 256.A OG LEU 259.A H 3.060 2.235 LYS 260.A N SER 256.A O LYS 260.A H 2.967 2.132 ASP 261.A N SER 257.A O.A ASP 261.A H 2.964 2.135 ASP 261.A N SER 257.A O.B ASP 261.A H 2.859 2.024 LEU 262.A N ASP 258.A O LEU 262.A H 3.065 2.215 LEU 263.A N LEU 259.A O LEU 263.A H 2.910 2.077 ARG 264.A N LYS 260.A O ARG 264.A H 2.868 2.044 ASN 265.A N ASP 261.A O ASN 265.A H 3.191 2.446 ASN 265.A N LEU 262.A O ASN 265.A H 3.065 2.428 ASN 265.A ND2 ASP 261.A O ASN 265.A HD22 2.862 2.162 LEU 266.A N LEU 262.A O LEU 266.A H 2.979 2.253 LEU 267.A N LEU 263.A O LEU 267.A H 2.780 1.926 ASP 270.A N GLN 268.A OE1 ASP 270.A H 2.985 2.141 THR 272.A N ASP 270.A OD1 THR 272.A H 2.945 2.173 THR 272.A OG1 ASP 270.A OD1 THR 272.A HG1 2.695 1.855 THR 272.A OG1 ASP 270.A OD2 THR 272.A HG1 3.353 2.754 LYS 273.A N ASP 270.A O LYS 273.A H 2.927 2.085 ARG 274.A NE GLN 268.A O ARG 274.A HE 2.840 2.039 ARG 274.A NH1 GLU 202.A OE2 ARG 274.A HH12 2.804 2.009 ARG 274.A NH1 ALA 212.A O ARG 274.A HH11 3.057 2.285 ARG 274.A NH2 GLU 202.A OE1 ARG 274.A HH22 2.903 2.044 ARG 274.A NH2 GLU 202.A OE2 ARG 274.A HH22 3.465 2.860 ARG 274.A NH2 GLN 268.A O ARG 274.A HH21 2.962 2.223 PHE 275.A N ASN 265.A O PHE 275.A H 2.920 2.103 ASN 277.A N ARG 274.A O ASN 277.A H 2.974 2.194 ASN 277.A ND2 LEU 271.A O ASN 277.A HD22 2.849 1.999 ASN 280.A ND2 ASP 284.A OD1 ASN 280.A HD22 2.924 2.072 GLY 281.A N LEU 278.A O GLY 281.A H 2.882 2.062 ASN 283.A N ASN 280.A O ASN 283.A H 3.098 2.389 ASP 284.A N GLY 281.A O ASP 284.A H 3.310 2.518 ILE 285.A N VAL 282.A O ILE 285.A H 2.961 2.285 LYS 286.A N VAL 282.A O LYS 286.A H 2.970 2.137 LYS 286.A NZ GLU 150.A OE1 LYS 286.A HZ1 2.807 1.947 ASN 287.A N ASN 283.A O ASN 287.A H 2.935 2.130 ASN 287.A ND2 GLN 14.A OE1 ASN 287.A HD21 3.006 2.156 HIS 288.A N ILE 285.A O HIS 288.A H 3.099 2.249 HIS 288.A NE2 ASP 261.A OD2 HIS 288.A HE2 2.754 1.908 TRP 290.A N HIS 288.A ND1 TRP 290.A H 2.943 2.084 TRP 290.A NE1 GLU 135.A OE1 TRP 290.A HE1 2.906 2.082 PHE 291.A N HIS 288.A O PHE 291.A H 2.889 2.115 ALA 292.A N LYS 289.A O ALA 292.A H 3.002 2.161 THR 294.A N PHE 291.A O THR 294.A H 2.907 2.058 THR 294.A OG1 PHE 291.A O THR 294.A HG1 3.435 2.911 ALA 298.A N ASP 295.A OD1 ALA 298.A H 3.124 2.286 ILE 299.A N ASP 295.A O ILE 299.A H 2.961 2.131 TYR 300.A N TRP 296.A O TYR 300.A H 3.008 2.158 GLN 301.A N ILE 297.A O GLN 301.A H 2.853 2.038 ARG 302.A N ILE 299.A O ARG 302.A H 2.928 2.117 ARG 302.A NH1 ASP 170.A OD1 ARG 302.A HH12 3.536 2.825 ARG 302.A NH1 ASP 170.A OD2 ARG 302.A HH12 2.724 1.879 ARG 302.A NH1 GLN 172.A OE1 ARG 302.A HH11 3.103 2.530 ARG 302.A NH2 ASP 170.A OD2 ARG 302.A HH22 3.297 2.646 LYS 303.A N ALA 298.A O LYS 303.A H 2.927 2.076 ASP 317.A N GLY 314.A O ASP 317.A H 3.182 2.327 SER 319.A N ASP 317.A OD1 SER 319.A H 3.215 2.428 SER 319.A N ASP 317.A OD2 SER 319.A H 3.081 2.307 SER 319.A OG ASP 317.A OD2 SER 319.A HG 2.727 1.906 ASN 320.A ND2 PRO 120.A O ASN 320.A HD22 3.142 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