Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yr7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 5.A N MET 2.A O MET 5.A H.A 2.993 2.147 ARG 7.A NH1 GLU 44.A OE1 ARG 7.A HH12 3.472 2.857 ARG 7.A NH1 GLU 44.A OE2 ARG 7.A HH12 2.878 2.042 ARG 7.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 7.A HH22 2.688 1.829 LEU 10.A N GLU 6.A O LEU 10.A H 3.064 2.236 ILE 11.A N.A ARG 7.A O ILE 11.A H.A 3.106 2.329 GLN 12.A N ALA 8.A O GLN 12.A H.A 2.940 2.114 LYS 13.A N SER 9.A O LYS 13.A H 2.895 2.093 ALA 14.A N LEU 10.A O ALA 14.A H 2.932 2.115 LYS 15.A N ILE 11.A O.A LYS 15.A H 3.096 2.277 LEU 16.A N GLN 12.A O LEU 16.A H 2.963 2.140 ALA 17.A N LYS 13.A O ALA 17.A H 2.705 1.852 GLU 18.A N ALA 14.A O GLU 18.A H 2.950 2.167 GLN 19.A N LYS 15.A O GLN 19.A H 3.041 2.219 ALA 20.A N LEU 16.A O ALA 20.A H 2.947 2.148 GLU 21.A N GLU 18.A O GLU 21.A H 3.004 2.169 ARG 22.A N ALA 17.A O ARG 22.A H 2.760 1.900 ARG 22.A NE ASP 25.A OD2 ARG 22.A HE 2.976 2.243 ARG 22.A NH2 ASP 25.A OD2 ARG 22.A HH21 2.836 2.074 MET 26.A N ARG 22.A O MET 26.A H 2.840 2.053 ALA 27.A N TYR 23.A O ALA 27.A H 2.908 2.125 ALA 28.A N GLU 24.A O ALA 28.A H 3.166 2.376 PHE 29.A N ASP 25.A O PHE 29.A H 3.010 2.193 MET 30.A N MET 26.A O MET 30.A H 3.079 2.239 LYS 31.A N ALA 27.A O LYS 31.A H 2.838 1.988 LYS 31.A NZ GLU 35.A OE2 LYS 31.A HZ1 2.769 1.988 GLY 32.A N ALA 28.A O GLY 32.A H 3.035 2.196 ALA 33.A N PHE 29.A O ALA 33.A H 2.902 2.119 VAL 34.A N MET 30.A O VAL 34.A H 2.802 1.963 GLU 35.A N LYS 31.A O GLU 35.A H 2.971 2.144 LYS 36.A N ALA 33.A O LYS 36.A H 3.146 2.337 LYS 36.A NZ MET 5.A O LYS 36.A HZ2 2.820 2.265 GLY 37.A N VAL 34.A O GLY 37.A H 2.851 2.000 SER 41.A N GLU 44.A OE1 SER 41.A H 3.034 2.205 GLU 44.A N SER 41.A OG GLU 44.A H 3.197 2.386 ARG 45.A N SER 41.A O ARG 45.A H 2.763 1.926 ASN 46.A N CYS 42.A O ASN 46.A H 3.222 2.421 ASN 46.A ND2 CYS 42.A O ASN 46.A HD22 2.571 1.890 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 3.149 2.334 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 3.033 2.183 SER 49.A N ARG 45.A O SER 49.A H 2.950 2.118 VAL 50.A N ASN 46.A O VAL 50.A H 2.717 1.867 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 2.931 2.107 TYR 52.A N LEU 48.A O TYR 52.A H 3.212 2.366 LYS 53.A N SER 49.A O LYS 53.A H 2.894 2.096 ASN 54.A N VAL 50.A O ASN 54.A H 3.123 2.295 ASN 54.A ND2 VAL 50.A O ASN 54.A HD22 2.814 1.987 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.222 2.419 VAL 56.A N.A TYR 52.A O VAL 56.A H.A 2.904 2.058 GLY 57.A N LYS 53.A O GLY 57.A H.A 2.874 2.136 GLY 58.A N ASN 54.A O GLY 58.A H 3.166 2.328 GLN 59.A N VAL 55.A O GLN 59.A H 3.373 2.557 GLN 59.A NE2 GLU 90.A O GLN 59.A HE22 3.600 3.127 GLN 59.A NE2 GLU 90.A OE1 GLN 59.A HE21 2.863 2.038 ARG 60.A N VAL 56.A O.A ARG 60.A H 2.825 1.987 ARG 60.A NE GLU 132.A OE1 ARG 60.A HE 3.334 2.554 ARG 60.A NH2 GLU 132.A OE2 ARG 60.A HH21 3.164 2.456 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 2.988 2.134 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.017 2.222 TRP 63.A N GLN 59.A O TRP 63.A H 2.759 1.925 TRP 63.A NE1 GLU 88.A OE1 TRP 63.A HE1 3.114 2.268 ARG 64.A N ARG 60.A O ARG 64.A H 2.900 2.088 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.104 2.257 LEU 66.A N ALA 62.A O LEU 66.A H 3.039 2.194 SER 67.A N.A TRP 63.A O SER 67.A H.A 2.813 2.031 SER 68.A N.A ARG 64.A O SER 68.A H.A 3.074 2.235 SER 68.A OG.A ARG 64.A O SER 68.A HG.A 3.044 2.235 SER 68.A OG.A VAL 65.A O SER 68.A HG.A 2.878 2.454 ILE 69.A N VAL 65.A O ILE 69.A H.A 3.226 2.371 GLU 70.A N LEU 66.A O GLU 70.A H 2.825 2.082 GLN 71.A N SER 67.A O.A GLN 71.A H 2.706 1.961 LYS 72.A N SER 68.A O.A LYS 72.A H 3.010 2.242 SER 73.A N GLN 71.A O SER 73.A H 2.714 1.960 GLU 79.A N GLU 79.A OE1 GLU 79.A H 2.647 1.912 ARG 81.A NH1 GLU 85.A OE2.A ARG 81.A HH11 2.974 2.202 GLU 82.A N PRO 78.A O GLU 82.A H 2.997 2.152 TYR 83.A N GLU 79.A O TYR 83.A H 3.053 2.202 ARG 84.A N VAL 80.A O.A ARG 84.A H 2.976 2.133 ARG 84.A NE GLU 70.A OE1 ARG 84.A HE 2.885 2.074 ARG 84.A NH1 GLU 88.A OE1 ARG 84.A HH11 3.074 2.411 ARG 84.A NH2 GLU 70.A OE1 ARG 84.A HH21 3.335 2.667 ARG 84.A NH2 GLU 70.A OE2 ARG 84.A HH21 3.049 2.198 GLU 85.A N.A ARG 81.A O GLU 85.A H.A 2.903 2.076 LYS 86.A N GLU 82.A O LYS 86.A H.A 3.028 2.205 VAL 87.A N TYR 83.A O VAL 87.A H 3.008 2.168 GLU 88.A N ARG 84.A O GLU 88.A H 2.827 1.988 THR 89.A N GLU 85.A O.A THR 89.A H 2.836 1.985 THR 89.A OG1 GLU 85.A O.A THR 89.A HG1 3.317 2.584 GLU 90.A N LYS 86.A O GLU 90.A H 3.119 2.322 LEU 91.A N VAL 87.A O LEU 91.A H 2.791 1.955 GLN 92.A N GLU 88.A O GLN 92.A H 2.886 2.045 GLY 93.A N THR 89.A O GLY 93.A H 3.047 2.251 VAL 94.A N GLU 90.A O VAL 94.A H 3.270 2.491 VAL 94.A N LEU 91.A O VAL 94.A H 3.152 2.561 CYS 95.A N LEU 91.A O CYS 95.A H 3.102 2.256 ASP 96.A N GLN 92.A O ASP 96.A H 2.838 1.980 THR 97.A N GLY 93.A O THR 97.A H 3.091 2.296 THR 97.A OG1 GLY 93.A O THR 97.A HG1 2.856 2.063 VAL 98.A N VAL 94.A O VAL 98.A H 2.981 2.189 LEU 99.A N CYS 95.A O LEU 99.A H 2.851 1.998 GLY 100.A N ASP 96.A O GLY 100.A H 2.738 1.899 LEU 101.A N THR 97.A O LEU 101.A H 3.037 2.254 LEU 102.A N VAL 98.A O LEU 102.A H 2.916 2.113 ASP 103.A N LEU 99.A O ASP 103.A H 2.993 2.141 SER 104.A N GLY 100.A O SER 104.A H 3.058 2.292 SER 104.A OG GLY 100.A O SER 104.A HG 2.775 2.156 HIS 105.A N LEU 101.A O HIS 105.A H 3.004 2.213 LEU 106.A N LEU 101.A O LEU 106.A H 3.357 2.620 LEU 106.A N LEU 102.A O LEU 106.A H 3.272 2.595 ILE 107.A N LEU 102.A O ILE 107.A H 2.800 1.942 LYS 108.A NZ HIS 105.A O LYS 108.A HZ3 3.094 2.222 SER 115.A N ASP 112.A OD1 SER 115.A H.A 2.945 2.092 SER 115.A OG ASP 112.A O SER 115.A HG 3.088 2.419 SER 115.A OG ASP 112.A OD1 SER 115.A HG 2.710 1.982 ARG 116.A N ASP 112.A O ARG 116.A H 3.178 2.321 ARG 116.A NE GLY 111.A O ARG 116.A HE 2.739 1.919 ARG 116.A NH1 GLY 111.A O ARG 116.A HH11 3.153 2.482 ARG 116.A NH1 GLU 160.A OE1 ARG 116.A HH12 3.536 2.685 ARG 116.A NH2 GLU 160.A OE2 ARG 116.A HH22 3.291 2.436 PHE 118.A N GLU 114.A O.A PHE 118.A H 2.932 2.103 TYR 119.A N SER 115.A O TYR 119.A H 2.998 2.158 LEU 120.A N ARG 116.A O LEU 120.A H 3.182 2.347 LYS 121.A N VAL 117.A O LYS 121.A H 2.840 1.981 LYS 121.A NZ ASP 125.A OD2 LYS 121.A HZ1 2.851 2.010 MET 122.A N.C PHE 118.A O no hydrogen 3.006 N/A MET 122.A O.C LYS 121.A O no hydrogen 3.365 N/A LYS 123.A N TYR 119.A O no hydrogen 2.874 N/A GLY 124.A N LEU 120.A O GLY 124.A H 3.043 2.225 ASP 125.A N LYS 121.A O ASP 125.A H 2.860 2.044 TYR 126.A N MET 122.A O.C TYR 126.A H 3.093 2.297 TYR 127.A N LYS 123.A O TYR 127.A H 3.097 2.257 ARG 128.A N GLY 124.A O ARG 128.A H 2.898 2.119 ARG 128.A NE TYR 150.A OH ARG 128.A HE 2.900 2.049 ARG 128.A NH2 ASP 125.A OD1 ARG 128.A HH21 3.148 2.344 ARG 128.A NH2 TYR 150.A OH ARG 128.A HH21 3.404 2.720 TYR 129.A N ASP 125.A O TYR 129.A H 2.913 2.116 LEU 130.A N TYR 126.A O LEU 130.A H 3.230 2.398 ALA 131.A N TYR 127.A O ALA 131.A H 2.826 2.049 GLU 132.A N ARG 128.A O GLU 132.A H 2.934 2.228 GLU 132.A N TYR 129.A O GLU 132.A H 3.178 2.540 VAL 133.A N LEU 130.A O VAL 133.A H 3.182 2.332 LYS 139.A N GLY 136.A O LYS 139.A H 2.545 1.804 LYS 140.A N GLY 136.A O LYS 140.A H 3.339 2.598 ARG 141.A N ASP 137.A O ARG 141.A H 3.180 2.323 ILE 142.A N ASP 138.A O ILE 142.A H 2.996 2.295 ILE 143.A N LYS 139.A O ILE 143.A H 2.740 1.922 ASP 144.A N LYS 140.A O ASP 144.A H 2.871 2.021 SER 145.A N ARG 141.A O SER 145.A H 3.331 2.564 SER 145.A OG ARG 141.A O SER 145.A HG 3.261 2.518 ALA 146.A N ILE 142.A O ALA 146.A H 3.002 2.198 ARG 147.A N.A ILE 143.A O ARG 147.A H.A 2.864 2.013 SER 148.A N ASP 144.A O SER 148.A H.A 2.880 2.027 ALA 149.A N SER 145.A O ALA 149.A H 3.081 2.266 TYR 150.A N ALA 146.A O TYR 150.A H 2.818 1.963 TYR 150.A OH ASP 125.A OD1 TYR 150.A HH 2.532 1.751 GLN 151.A N ARG 147.A O.A GLN 151.A H 2.815 1.992 GLN 151.A NE2 GLN 151.A O GLN 151.A HE21 3.474 2.945 GLN 151.A NE2 ASP 155.A OD1 GLN 151.A HE21 3.068 2.275 GLU 152.A N SER 148.A O GLU 152.A H 3.076 2.245 ALA 153.A N ALA 149.A O ALA 153.A H 3.044 2.187 MET 154.A N.A TYR 150.A O MET 154.A H.A 2.703 1.888 ASP 155.A N GLN 151.A O ASP 155.A H.A 2.769 1.952 ILE 156.A N GLU 152.A O ILE 156.A H 3.161 2.338 SER 157.A N ALA 153.A O SER 157.A H 2.991 2.181 SER 157.A OG MET 154.A O.A SER 157.A HG 2.874 2.082 LYS 158.A N MET 154.A O.A LYS 158.A H 3.037 2.193 LYS 159.A N ILE 156.A O LYS 159.A H 3.266 2.534 GLU 160.A N ILE 156.A O GLU 160.A H 2.970 2.193 MET 161.A N SER 157.A O MET 161.A H 3.000 2.335 ASN 165.A N PRO 162.A O ASN 165.A H 3.184 2.348 ARG 168.A N ASN 165.A OD1 ARG 168.A H 3.116 2.323 ARG 168.A NH1 MET 161.A O ARG 168.A HH11 2.844 2.170 LEU 169.A N ASN 165.A O LEU 169.A H 3.009 2.198 GLY 170.A N PRO 166.A O GLY 170.A H 2.886 2.049 LEU 171.A N ILE 167.A O LEU 171.A H 3.019 2.175 ALA 172.A N ARG 168.A O ALA 172.A H 3.031 2.171 LEU 173.A N LEU 169.A O LEU 173.A H 2.752 1.913 ASN 174.A N GLY 170.A O ASN 174.A H 2.941 2.117 ASN 174.A ND2 ASP 125.A OD1 ASN 174.A HD22 2.791 1.964 ASN 174.A ND2 ASP 125.A OD2 ASN 174.A HD22 3.178 2.530 PHE 175.A N LEU 171.A O PHE 175.A H 2.762 1.931 SER 176.A N ALA 172.A O SER 176.A H 2.882 2.051 SER 176.A OG ALA 172.A O SER 176.A HG 3.268 2.582 SER 176.A OG LEU 173.A O SER 176.A HG 2.493 1.859 VAL 177.A N LEU 173.A O VAL 177.A H 3.059 2.244 PHE 178.A N ASN 174.A O PHE 178.A H 2.850 2.053 HIS 179.A N PHE 175.A O HIS 179.A H 2.979 2.191 TYR 180.A N SER 176.A O TYR 180.A H 3.049 2.252 GLU 181.A N VAL 177.A O GLU 181.A H 2.914 2.091 ILE 182.A N PHE 178.A O ILE 182.A H 2.934 2.134 ALA 183.A N PHE 178.A O ALA 183.A H 2.989 2.162 SER 185.A N HIS 179.A O SER 185.A H 2.787 1.928 SER 185.A OG GLU 188.A OE2 SER 185.A HG 2.962 2.358 GLU 187.A N GLU 187.A OE1 GLU 187.A H 2.690 1.903 ALA 189.A N SER 185.A O ALA 189.A H 3.058 2.205 ILE 190.A N PRO 186.A O ILE 190.A H 2.890 2.038 SER 191.A N.A GLU 187.A O SER 191.A H.A 2.947 2.116 LEU 192.A N GLU 188.A O LEU 192.A H.A 2.854 2.002 ALA 193.A N ALA 189.A O ALA 193.A H 3.042 2.194 LYS 194.A N ILE 190.A O LYS 194.A H 2.964 2.107 THR 195.A N SER 191.A O.A THR 195.A H 2.844 1.992 THR 195.A OG1 SER 191.A O.A THR 195.A HG1 2.834 2.129 THR 196.A N LEU 192.A O THR 196.A H 2.860 2.032 THR 196.A OG1 LEU 192.A O THR 196.A HG1 2.658 1.846 PHE 197.A N ALA 193.A O PHE 197.A H 2.843 1.993 ASP 198.A N LYS 194.A O ASP 198.A H 2.908 2.049 GLU 199.A N THR 195.A O GLU 199.A H 3.084 2.238 ALA 200.A N THR 196.A O ALA 200.A H 3.086 2.256 MET 201.A N.A PHE 197.A O MET 201.A H.A 2.728 1.890 ALA 202.A N ASP 198.A O ALA 202.A H.A 3.103 2.336 ASP 203.A N ALA 200.A O ASP 203.A H 3.067 2.281 LEU 204.A N MET 201.A O.A LEU 204.A H 3.318 2.460 THR 206.A N ASP 203.A O THR 206.A H 3.243 2.398 THR 206.A OG1 ASP 203.A O THR 206.A HG1 2.805 1.975 LEU 207.A N LEU 204.A O LEU 207.A H 3.226 2.413 TYR 212.A N SER 208.A O TYR 212.A H 2.919 2.086 LYS 213.A N GLU 209.A O LYS 213.A H 3.276 2.581 LYS 213.A N ASP 210.A O LYS 213.A H 3.015 2.387 ASP 214.A N ASP 210.A O ASP 214.A H 3.140 2.349 SER 215.A N SER 211.A O SER 215.A H 2.961 2.111 SER 215.A OG THR 164.A O SER 215.A HG 2.738 2.053 THR 216.A N TYR 212.A O THR 216.A H 3.290 2.442 THR 216.A OG1 TYR 212.A O THR 216.A HG1 2.775 2.059 THR 216.A OG1 LYS 213.A O THR 216.A HG1 3.301 2.797 LEU 217.A N LYS 213.A O LEU 217.A H 3.284 2.487 MET 219.A N SER 215.A O MET 219.A H 2.950 2.110 GLN 220.A N THR 216.A O GLN 220.A H 2.864 2.068 GLN 220.A NE2 ASP 224.A OD1 GLN 220.A HE21 3.098 2.295 LEU 221.A N ILE 218.A O LEU 221.A H 2.925 2.333 LEU 222.A N ILE 218.A O LEU 222.A H 3.083 2.286 ARG 223.A N MET 219.A O ARG 223.A H 2.832 2.019 ASP 224.A N GLN 220.A O ASP 224.A H 2.844 2.033 ASN 225.A N LEU 221.A O ASN 225.A H 2.981 2.139 LEU 226.A N LEU 222.A O LEU 226.A H 2.938 2.104 THR 227.A N ARG 223.A O THR 227.A H 3.005 2.151 THR 227.A OG1 ARG 223.A O THR 227.A HG1 3.207 2.435 LEU 228.A N ASP 224.A O LEU 228.A H 3.173 2.424 LEU 228.A N ASN 225.A O LEU 228.A H 3.196 2.601 TRP 229.A N ASN 225.A O TRP 229.A H 2.794 2.008 THR 230.A N LEU 226.A O THR 230.A H 2.978 2.134