Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yt1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N ASP 89.A O MET 1.A H3 3.063 2.190 LEU 2.A N ASP 134.A OD2 LEU 2.A H 2.746 1.914 ILE 3.A N VAL 91.A O ILE 3.A H 2.839 2.012 ALA 4.A N TRP 135.A O ALA 4.A H 2.909 2.077 ILE 5.A N LEU 93.A O ILE 5.A H 2.787 1.929 GLU 6.A N VAL 137.A O GLU 6.A H 2.750 1.909 ASP 9.A N TYR 103.A OH ASP 9.A H 3.016 2.239 ALA 11.A N VAL 8.A O ALA 11.A H 3.078 2.307 LYS 13.A NZ GLY 7.A O LYS 13.A HZ3 3.178 2.393 LYS 13.A NZ VAL 8.A O LYS 13.A HZ3 2.971 2.340 LEU 16.A N GLY 12.A O LEU 16.A H 3.144 2.330 VAL 17.A N LYS 13.A O VAL 17.A H 2.758 1.916 GLU 18.A N ARG 14.A O GLU 18.A H 2.939 2.122 LYS 19.A N THR 15.A O LYS 19.A H 2.872 2.037 LEU 20.A N LEU 16.A O LEU 20.A H 2.752 1.913 SER 21.A N VAL 17.A O SER 21.A H 2.895 2.052 SER 21.A OG VAL 17.A O SER 21.A HG 2.952 2.255 SER 21.A OG GLU 18.A O SER 21.A HG 2.638 2.114 GLY 22.A N GLU 18.A O GLY 22.A H 3.084 2.260 ALA 23.A N LYS 19.A O ALA 23.A H 3.064 2.285 PHE 24.A N LEU 20.A O PHE 24.A H 2.990 2.158 ARG 25.A N SER 21.A O ARG 25.A H 3.003 2.179 ALA 26.A N GLY 22.A O ALA 26.A H 2.938 2.138 ALA 27.A N ALA 23.A O ALA 27.A H 3.116 2.457 ALA 27.A N PHE 24.A O ALA 27.A H 3.073 2.415 GLY 28.A N ARG 25.A O GLY 28.A H 2.983 2.139 ARG 29.A N PHE 24.A O ARG 29.A H 2.999 2.171 ARG 29.A NH2 ALA 189.A O ARG 29.A HH21 3.349 2.525 SER 30.A N ASP 89.A OD2 SER 30.A H 2.958 2.116 ALA 32.A N VAL 90.A O ALA 32.A H 2.965 2.161 LEU 34.A N ILE 92.A O LEU 34.A H 3.102 2.343 PHE 36.A N ASP 94.A O PHE 36.A H 3.006 2.165 ARG 38.A N ASP 73.A OD2 ARG 38.A H 2.930 2.124 ARG 38.A NE ASP 73.A OD1 ARG 38.A HE 2.771 1.966 ARG 38.A NH2 ASP 73.A O ARG 38.A HH21 2.858 2.300 ARG 38.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 38.A HH21 3.273 2.629 GLY 40.A N ASP 46.A OD1 GLY 40.A H 2.662 1.817 GLN 41.A N ARG 38.A O GLN 41.A H 2.814 1.995 SER 42.A OG ASP 73.A OD1 SER 42.A HG 2.842 2.200 ALA 45.A N SER 42.A OG ALA 45.A H 2.974 2.138 ASP 46.A N SER 42.A O ASP 46.A H 3.044 2.226 ILE 47.A N VAL 43.A O ILE 47.A H 2.893 2.045 ALA 48.A N ALA 44.A O ALA 48.A H 3.056 2.209 ALA 49.A N ALA 45.A O ALA 49.A H 3.008 2.162 GLU 50.A N ASP 46.A O GLU 50.A H 2.976 2.129 ALA 51.A N ILE 47.A O ALA 51.A H 2.845 2.055 LEU 52.A N ALA 48.A O LEU 52.A H 3.195 2.449 LEU 52.A N ALA 49.A O LEU 52.A H 3.132 2.516 HIS 53.A N GLU 50.A O HIS 53.A H 3.009 2.266 HIS 53.A ND1 ALA 49.A O HIS 53.A HD1 3.080 2.228 GLY 54.A N ALA 51.A O GLY 54.A H 3.055 2.215 GLU 55.A N GLU 50.A O GLU 55.A H 3.094 2.252 HIS 56.A NE2 GLU 50.A OE1 HIS 56.A HE2 2.729 1.927 LEU 59.A N HIS 56.A O LEU 59.A H 3.108 2.277 SER 61.A N ASP 58.A O SER 61.A H 3.175 2.428 SER 61.A OG ASP 58.A O SER 61.A HG 2.772 1.941 SER 62.A N LEU 59.A O SER 62.A H 3.145 2.303 ALA 65.A N SER 62.A OG ALA 65.A H 2.970 2.168 MET 66.A N SER 62.A O MET 66.A H 3.130 2.285 ALA 67.A N VAL 63.A O ALA 67.A H 2.988 2.147 THR 68.A N TYR 64.A O THR 68.A H 2.886 2.120 THR 68.A OG1 TYR 64.A O THR 68.A HG1 2.736 2.001 LEU 69.A N ALA 65.A O LEU 69.A H 3.009 2.192 PHE 70.A N MET 66.A O PHE 70.A H 3.088 2.262 ALA 71.A N ALA 67.A O ALA 71.A H 2.952 2.144 LEU 72.A N THR 68.A O LEU 72.A H 2.828 2.036 ASP 73.A N LEU 69.A O ASP 73.A H 2.977 2.145 ARG 74.A N PHE 70.A O ARG 74.A H 3.110 2.289 ARG 74.A NE GLU 124.A OE1 ARG 74.A HE 2.630 1.770 ARG 74.A NH2 GLU 124.A OE1 ARG 74.A HH21 3.366 2.747 ARG 74.A NH2 GLU 124.A OE2 ARG 74.A HH21 2.673 1.820 ALA 75.A N ALA 71.A O ALA 75.A H 2.820 2.031 GLY 76.A N LEU 72.A O GLY 76.A H 3.236 2.442 ALA 77.A N ARG 74.A O ALA 77.A H 2.893 2.078 VAL 78.A N ALA 75.A O VAL 78.A H 3.382 2.528 ILE 81.A N ALA 77.A O ILE 81.A H 2.876 2.031 GLN 82.A N VAL 78.A O GLN 82.A H 2.904 2.055 GLY 83.A N HIS 79.A O GLY 83.A H 2.829 2.023 LEU 84.A N THR 80.A O LEU 84.A H 2.893 2.059 CYS 85.A N ILE 81.A O CYS 85.A H 2.931 2.120 CYS 85.A SG ILE 81.A O CYS 85.A HG 3.363 2.485 ARG 86.A N GLN 82.A O ARG 86.A H 3.092 2.332 GLY 87.A N GLY 83.A O GLY 87.A H 3.096 2.472 GLY 87.A N LEU 84.A O GLY 87.A H 3.245 2.534 TYR 88.A N LEU 84.A O TYR 88.A H 3.059 2.362 ASP 89.A N SER 30.A OG ASP 89.A H 2.812 1.988 VAL 90.A N SER 30.A O VAL 90.A H 2.998 2.223 VAL 91.A N MET 1.A O VAL 91.A H 2.896 2.060 ILE 92.A N ALA 32.A O ILE 92.A H 2.889 2.068 LEU 93.A N ILE 3.A O LEU 93.A H 2.756 1.929 ASP 94.A N LEU 34.A O ASP 94.A H 2.917 2.122 ARG 95.A N ILE 5.A O no hydrogen 2.907 N/A ARG 95.A NE.A PHE 36.A O ARG 95.A HE.A 2.819 2.005 ARG 95.A NE.B PHE 36.A O ARG 95.A HE.B 2.457 1.643 ARG 95.A NH2.A PHE 36.A O ARG 95.A HH21.A 3.181 2.492 ARG 95.A NH2.B PHE 36.A O ARG 95.A HH21.B 2.960 2.331 TYR 96.A N GLU 6.A OE2 TYR 96.A H 2.936 2.267 TYR 96.A OH PRO 131.A O TYR 96.A HH 2.721 1.883 SER 99.A N.A TYR 96.A O SER 99.A H.A 3.056 2.341 SER 99.A N.B TYR 96.A O SER 99.A H.B 3.062 2.330 SER 99.A OG.A GLU 6.A OE1 SER 99.A HG.A 2.609 1.863 SER 99.A OG.B TYR 96.A O SER 99.A HG.B 2.531 1.713 ASN 100.A N VAL 97.A O ASN 100.A H.A 2.940 2.331 ASN 100.A ND2 ALA 67.A O ASN 100.A HD21 2.927 2.077 ASN 100.A ND2 GLU 124.A OE2 ASN 100.A HD22 2.828 2.051 ALA 101.A N VAL 97.A O ALA 101.A H 3.324 2.537 ALA 102.A N ALA 98.A O ALA 102.A H 2.870 2.037 TYR 103.A N SER 99.A O.A TYR 103.A H 2.989 2.130 TYR 103.A N SER 99.A O.B TYR 103.A H 3.008 2.149 TYR 103.A OH GLN 153.A OE1 TYR 103.A HH 2.672 1.927 SER 104.A N ASN 100.A O SER 104.A H 2.999 2.180 SER 104.A OG ASN 100.A O SER 104.A HG 2.763 2.190 ALA 105.A N ALA 101.A O ALA 105.A H 2.951 2.098 ALA 106.A N ALA 102.A O ALA 106.A H 2.967 2.140 ARG 107.A N TYR 103.A O ARG 107.A H 2.882 2.061 ARG 107.A NH1 ALA 60.A O ARG 107.A HH12 2.773 1.992 ARG 107.A NH2 ALA 60.A O ARG 107.A HH22 3.046 2.358 ARG 107.A NH2 TYR 146.A OH ARG 107.A HH21 2.797 2.044 LEU 108.A N SER 104.A O LEU 108.A H 3.198 2.431 LEU 108.A N ALA 105.A O LEU 108.A H 3.112 2.518 HIS 109.A N ALA 106.A O HIS 109.A H 3.140 2.294 GLU 110.A N ALA 105.A O GLU 110.A H 2.865 2.016 ALA 112.A N GLU 162.A OE1 ALA 112.A H 2.986 2.195 ALA 113.A N ASN 111.A OD1 ALA 113.A H 2.827 2.116 GLY 114.A N ASN 111.A O GLY 114.A H 3.035 2.200 ALA 116.A N GLU 110.A OE1 ALA 116.A H 2.989 2.142 TRP 119.A N LYS 115.A O TRP 119.A H 2.823 2.012 VAL 120.A N ALA 116.A O VAL 120.A H 2.894 2.072 GLN 121.A N ALA 117.A O GLN 121.A H 3.141 2.305 ARG 122.A N ALA 118.A O ARG 122.A H 3.006 2.190 ILE 123.A N TRP 119.A O ILE 123.A H 2.899 2.075 GLU 124.A N VAL 120.A O GLU 124.A H 2.908 2.055 PHE 125.A N GLN 121.A O PHE 125.A H 3.131 2.359 ARG 127.A N ARG 122.A O ARG 127.A H 2.979 2.246 LEU 128.A N ILE 123.A O LEU 128.A H 2.884 2.096 LEU 130.A N GLU 124.A O LEU 130.A H.B 3.030 2.173 ASP 134.A N LEU 2.A O ASP 134.A H 2.787 2.126 TRP 135.A N LEU 2.A O TRP 135.A H 3.231 2.438 TRP 135.A NE1 LEU 188.A O TRP 135.A HE1 2.994 2.351 GLN 136.A N ARG 171.A O GLN 136.A H 2.992 2.198 GLN 136.A NE2 TRP 168.A O GLN 136.A HE22 2.910 2.166 VAL 137.A N ALA 4.A O VAL 137.A H 2.771 1.919 LEU 138.A N LEU 173.A O LEU 138.A H 2.793 1.997 LEU 139.A N GLU 6.A O LEU 139.A H 2.810 1.955 ALA 140.A N VAL 175.A O ALA 140.A H 2.929 2.130 ASP 144.A N GLU 147.A OE1 ASP 144.A H 3.217 2.468 ASN 145.A N LEU 52.A O ASN 145.A H 2.848 2.092 GLU 147.A N ASP 144.A OD1 GLU 147.A H 2.839 1.994 ARG 148.A N ASP 144.A O ARG 148.A H 3.067 2.280 ASP 149.A N TYR 146.A O ASP 149.A H 2.990 2.192 LEU 152.A N ASP 149.A OD2 LEU 152.A H 3.005 2.161 GLN 153.A N ASP 149.A O GLN 153.A H 3.078 2.245 GLN 153.A NE2 ASP 9.A OD2 GLN 153.A HE21 3.306 2.584 GLN 153.A NE2 TYR 146.A O GLN 153.A HE22 2.784 1.940 GLN 154.A N ALA 150.A O GLN 154.A H 3.013 2.202 ARG 155.A N GLU 151.A O ARG 155.A H 2.848 2.009 ARG 155.A NE ALA 106.A O ARG 155.A HE 2.906 2.111 ARG 155.A NH2 ALA 106.A O ARG 155.A HH21 2.996 2.246 THR 156.A N LEU 152.A O THR 156.A H 2.748 1.919 THR 156.A OG1 LEU 152.A O THR 156.A HG1 2.814 1.997 GLY 157.A N GLN 153.A O GLY 157.A H 2.979 2.146 ALA 158.A N GLN 154.A O ALA 158.A H 3.231 2.453 VAL 159.A N ARG 155.A O VAL 159.A H 2.969 2.146 TYR 160.A N THR 156.A O TYR 160.A H 2.890 2.041 TYR 160.A OH GLU 6.A OE1 TYR 160.A HH 2.867 2.118 ALA 161.A N GLY 157.A O ALA 161.A H 3.160 2.347 GLU 162.A N ALA 158.A O GLU 162.A H 3.125 2.335 LEU 163.A N VAL 159.A O LEU 163.A H 2.780 1.946 ALA 164.A N TYR 160.A O ALA 164.A H 2.964 2.124 ALA 165.A N ALA 161.A O ALA 165.A H 3.013 2.210 GLN 166.A N GLU 162.A O GLN 166.A H 2.979 2.241 GLN 166.A NE2 ALA 112.A O GLN 166.A HE22 3.608 3.006 GLY 167.A N ALA 164.A O GLY 167.A H 3.219 2.393 TRP 168.A N LEU 163.A O TRP 168.A H 3.001 2.149 GLY 170.A N GLY 167.A O GLY 170.A H 3.127 2.293 TRP 172.A NE1 TRP 168.A O TRP 172.A HE1 2.702 1.871 LEU 173.A N GLN 136.A O LEU 173.A H 2.904 2.107 VAL 175.A N LEU 138.A O VAL 175.A H 2.884 2.033 VAL 179.A N GLY 176.A O VAL 179.A H 3.039 2.205 ARG 183.A N ASP 180.A OD2 ARG 183.A H 2.905 2.094 LEU 184.A N ASP 180.A O LEU 184.A H 3.112 2.273 ALA 185.A N PRO 181.A O ALA 185.A H 2.941 2.094 ALA 186.A N GLY 182.A O ALA 186.A H 3.113 2.296 THR 187.A N ARG 183.A O THR 187.A H 2.919 2.166 THR 187.A OG1 ARG 183.A O THR 187.A HG1 2.989 2.170 LEU 188.A N LEU 184.A O LEU 188.A H 2.918 2.094 ALA 189.A N ALA 185.A O ALA 189.A H 2.968 2.141