Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yt8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 214.A OD1 GLY 2.A H 3.185 2.592 ARG 4.A N GLN 299.A OE1 ARG 4.A H 2.673 1.861 LYS 5.A NZ.B GLU 290.A OE1 LYS 5.A HZ2.B 2.940 2.073 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.790 1.957 LYS 12.A NZ ASP 155.A O LYS 12.A HZ2 3.041 2.326 LYS 12.A NZ GLN 306.A O LYS 12.A HZ3 2.628 1.932 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 2.927 2.278 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.838 2.016 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.387 2.567 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.765 1.935 CYS 16.A SG LYS 12.A O CYS 16.A HG 3.491 2.466 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.223 2.370 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.961 2.137 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.800 1.951 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.902 2.043 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.811 1.977 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 2.953 2.164 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.014 2.167 THR 25.A OG1 CYS 44.A O THR 25.A HG1 2.784 1.989 THR 26.A OG1 THR 21.A OG1 THR 26.A HG1 2.924 2.172 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 3.027 2.201 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 2.995 2.141 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 3.250 2.557 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD21 3.061 2.468 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 2.788 2.016 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.932 2.097 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.664 1.853 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.617 1.765 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.940 2.116 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.026 2.188 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.824 2.040 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.804 1.977 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.126 2.359 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.109 2.273 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.687 1.828 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 3.135 2.291 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 40.A HH21 3.443 2.825 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.258 2.405 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.172 2.319 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.007 2.165 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 3.083 2.226 ASP 48.A N THR 45.A OG1 ASP 48.A H 3.151 2.364 LEU 50.A N GLU 47.A O LEU 50.A H 3.413 2.559 TYR 54.A OH ASP 187.A O TYR 54.A HH 2.515 1.794 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.235 2.425 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.955 2.114 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.889 2.188 ILE 59.A N ASP 56.A O ILE 59.A H 3.189 2.495 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 2.916 2.084 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.777 1.958 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.952 2.133 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.139 2.280 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.887 2.063 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.765 1.943 GLN 69.A NE2 GLY 71.A O GLN 69.A HE21 3.621 3.103 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.809 2.030 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 3.131 2.367 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.845 1.994 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.771 1.976 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.724 1.869 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 3.230 2.514 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.960 2.111 GLN 83.A NE2 GLU 178.A O GLN 83.A HE21 3.308 2.627 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.860 2.120 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.888 2.151 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.016 2.156 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.829 1.987 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 3.017 2.171 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ2 2.978 2.333 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.768 1.911 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.711 2.018 LYS 90.A NZ ASP 34.A OD1 LYS 90.A HZ3 3.521 2.918 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 2.828 2.015 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 3.037 2.343 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.773 1.953 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD21 3.070 2.234 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD22 2.863 2.020 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 3.032 2.193 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.091 2.262 TYR 101.A OH ASP 33.A OD2 TYR 101.A HH 2.786 1.982 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.949 2.183 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.941 2.100 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 2.815 2.050 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 3.102 2.316 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.849 1.991 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.127 2.350 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.780 1.925 GLN 110.A N GLN 107.A O GLN 110.A H 3.185 2.341 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD1 THR 111.A HG1 3.371 2.803 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD2 THR 111.A HG1 2.579 1.841 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 2.743 1.942 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.927 2.098 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.835 1.988 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.325 2.498 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.902 2.240 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 2.984 2.207 CYS 117.A SG LEU 115.A O CYS 117.A HG 3.702 2.532 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 3.178 2.362 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.745 1.923 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 3.054 2.219 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.744 1.899 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.147 2.373 TYR 126.A OH SER 139.A O TYR 126.A HH 3.173 2.532 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.664 1.821 MET 130.A N GLN 110.A O MET 130.A H 2.989 2.163 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.840 2.013 ARG 131.A NE ASP 197.A OD1 ARG 131.A HE 2.985 2.184 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH12 2.917 2.062 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 3.127 2.537 ARG 131.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH11 3.163 2.407 ARG 131.A NH2 THR 198.A O ARG 131.A HH21 3.199 2.599 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 2.761 2.071 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 3.417 2.569 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.833 2.002 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.060 2.220 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.689 1.866 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.912 2.116 LYS 137.A NZ ASP 197.A OD2 LYS 137.A HZ1 2.856 2.024 GLY 138.A N HIS 172.A ND1 GLY 138.A H 3.068 2.291 SER 139.A N TYR 126.A OH SER 139.A H 3.063 2.214 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.902 2.099 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 2.949 2.156 SER 144.A OG LEU 141.A O SER 144.A HG 2.774 2.059 CYS 145.A SG HIS 41.A NE2 no hydrogen 3.602 N/A CYS 145.A SG HIS 164.A O no hydrogen 3.091 N/A GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.917 2.090 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 3.006 2.158 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.617 1.828 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.744 1.973 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.809 2.074 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 2.887 2.056 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD22 3.028 2.212 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.954 2.188 ASP 155.A N ASP 155.A OD1 ASP 155.A H 2.642 1.987 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 3.102 2.250 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 2.894 2.052 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.705 1.902 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.840 2.105 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.012 2.158 TYR 161.A N GLY 149.A O TYR 161.A H 3.237 2.497 TYR 161.A OH HIS 163.A ND1 TYR 161.A HH 3.152 2.417 MET 162.A N THR 175.A O MET 162.A H 2.685 1.903 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.838 2.048 HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.321 2.495 MET 165.A N.A ALA 173.A O MET 165.A H.A 3.194 2.344 MET 165.A N.B ALA 173.A O MET 165.A H.B 3.207 2.356 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.895 2.119 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.975 2.120 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.904 2.139 ALA 173.A N MET 165.A O.A ALA 173.A H 3.189 2.337 ALA 173.A N MET 165.A O.B ALA 173.A H 3.139 2.285 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 2.907 2.121 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 3.020 2.228 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 2.809 2.055 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.164 2.310 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 3.047 2.227 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.914 2.076 TYR 182.A OH CYS 160.A O TYR 182.A HH 2.449 1.694 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 2.743 1.925 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 2.742 1.881 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 3.087 2.362 THR 198.A N THR 196.A O THR 198.A H 3.025 2.432 THR 198.A OG1 GLU 240.A OE1 THR 198.A HG1 3.113 2.392 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 3.019 2.200 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.887 2.049 THR 201.A OG1 GLU 240.A O THR 201.A HG1 2.641 2.004 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 2.927 2.299 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD21 2.987 2.160 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD22 2.978 2.179 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.160 2.367 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.130 2.308 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.040 2.203 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 2.901 2.091 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.768 1.943 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 2.848 2.015 TYR 209.A OH ILE 259.A O TYR 209.A HH 2.729 1.908 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.893 2.090 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.863 2.108 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.075 2.258 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 3.028 2.191 ASN 214.A N ALA 211.A O ASN 214.A H 2.985 2.217 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD21 2.623 1.774 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 3.287 2.432 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 2.971 2.332 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.850 2.028 LEU 220.A N ARG 217.A O.A LEU 220.A H 3.038 2.204 LEU 220.A N ARG 217.A O.B LEU 220.A H 3.102 2.269 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD21 3.201 2.438 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.994 2.166 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 3.069 2.214 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 2.790 1.941 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.874 2.030 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 3.063 2.207 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.120 2.391 VAL 233.A N PHE 230.A O VAL 233.A H 2.756 2.138 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.855 2.057 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 2.876 2.055 TYR 237.A N VAL 233.A O TYR 237.A H 3.297 2.535 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 3.209 2.591 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.182 2.337 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 2.721 1.879 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 2.871 2.018 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.801 1.949 THR 243.A N HIS 246.A ND1 THR 243.A H 3.141 2.316 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 3.077 2.290 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.204 2.401 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 3.136 2.348 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 3.005 2.171 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 3.043 2.236 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.206 2.485 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.013 2.383 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 2.914 2.077 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.783 1.948 SER 254.A OG ILE 259.A O SER 254.A HG 3.228 2.413 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.580 1.779 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 2.778 1.942 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.144 2.322 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.785 2.001 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 3.093 2.284 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.881 2.061 CYS 265.A SG VAL 261.A O CYS 265.A HG 3.316 2.312 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.083 2.301 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.126 2.349 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 2.872 2.038 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.740 1.949 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.095 2.280 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 3.039 2.227 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.903 2.119 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 3.010 2.280 GLN 273.A N GLU 270.A O GLN 273.A H 3.191 2.602 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.776 1.964 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.950 2.262 ARG 279.A N MET 276.A O ARG 279.A H 2.810 1.981 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.912 2.096 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 2.550 1.694 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 3.043 2.235 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 2.968 2.113 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.798 2.003 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.005 2.206 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.157 2.301 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.853 2.049 ARG 298.A NH1 MET 6.A O ARG 298.A HH12 3.440 2.674 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 2.931 2.098 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O GLN 299.A HE22 2.904 2.191 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.872 2.145 VAL 303.A N ARG 298.A O VAL 303.A H 3.455 2.612