Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yvf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 214.A OD1 GLY 2.A H 2.799 2.009 ARG 4.A N.A GLN 299.A OE1 ARG 4.A H.A 2.738 1.926 ARG 4.A N.B GLN 299.A OE1 ARG 4.A H.B 2.743 1.945 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.857 2.026 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 3.014 2.375 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.862 2.029 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.286 2.496 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.783 1.935 CYS 16.A SG LYS 12.A O CYS 16.A HG 3.492 2.393 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.292 2.433 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.943 2.112 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.924 2.069 GLN 19.A NE2 ASN 119.A O GLN 19.A HE21 3.318 2.473 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.895 2.037 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.831 2.008 THR 21.A OG1 THR 26.A OG1 THR 21.A HG1 2.758 1.969 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 2.980 2.194 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.110 2.261 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 3.010 2.196 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 2.968 2.112 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 3.026 2.360 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD21 2.949 2.390 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 2.933 2.134 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.832 1.993 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.805 2.003 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.700 1.872 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 3.041 2.231 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 3.011 2.206 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.104 2.265 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.746 1.923 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.837 2.022 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.088 2.294 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.021 2.167 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.699 1.841 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 2.994 2.138 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.161 2.315 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.087 2.232 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.043 2.208 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 3.280 2.426 GLU 47.A N THR 45.A OG1 GLU 47.A H 3.154 2.566 ASP 48.A N THR 45.A O ASP 48.A H 2.716 1.913 TYR 54.A OH ASP 187.A O TYR 54.A HH 2.643 1.844 GLU 55.A N GLU 55.A OE1 GLU 55.A H 2.689 1.892 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.144 2.336 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.903 2.065 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.978 2.236 ILE 59.A N ASP 56.A O ILE 59.A H 3.185 2.445 ARG 60.A NE ASP 56.A O ARG 60.A HE 3.206 2.720 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 3.192 2.358 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.718 1.881 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.831 2.004 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.147 2.295 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.868 2.042 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.965 2.149 GLN 69.A NE2 GLY 71.A O GLN 69.A HE21 3.051 2.244 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.782 1.995 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 2.908 2.103 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.859 2.006 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.735 1.920 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.680 1.821 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 2.893 2.143 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.912 2.062 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.791 1.934 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.867 2.060 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 2.983 2.126 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.817 1.989 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.764 1.906 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ3 3.185 2.490 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.763 1.924 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.773 2.017 LYS 90.A NZ ASP 34.A OD2 LYS 90.A HZ3 3.204 2.555 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 2.897 2.052 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 3.022 2.332 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.878 2.057 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD21 3.008 2.156 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD22 2.890 2.036 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.862 2.038 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.061 2.232 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.621 1.786 TYR 101.A OH ASP 33.A OD2 TYR 101.A HH 2.824 2.001 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.868 2.091 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.892 2.049 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 2.866 2.080 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 3.071 2.294 ARG 105.A NH1 PHE 181.A O ARG 105.A HH12 3.557 2.917 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.868 2.022 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.024 2.234 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.690 1.831 GLN 110.A N GLN 107.A O GLN 110.A H 3.121 2.271 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 2.812 2.005 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.938 2.107 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.807 1.965 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.183 2.374 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.821 2.097 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 2.910 2.125 CYS 117.A SG LEU 115.A O CYS 117.A HG 3.678 2.504 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 3.077 2.257 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.786 1.978 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 2.939 2.110 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.707 1.880 GLY 124.A N ALA 116.A O GLY 124.A H 3.377 2.612 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.144 2.372 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.671 1.822 MET 130.A N GLN 110.A O MET 130.A H 2.945 2.131 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.824 1.984 ARG 131.A NE ASP 197.A OD1 ARG 131.A HE 3.076 2.278 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH12 2.967 2.110 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 3.350 2.723 ARG 131.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH11 2.920 2.149 ARG 131.A NH2 THR 198.A O.A ARG 131.A HH21 3.084 2.443 ARG 131.A NH2 THR 198.A O.B ARG 131.A HH21 3.002 2.352 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 2.790 1.993 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 3.053 2.211 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.758 1.917 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.242 2.431 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.801 1.987 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.902 2.077 GLY 138.A N HIS 172.A ND1 GLY 138.A H 3.007 2.230 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.917 2.127 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 2.986 2.187 SER 144.A OG LEU 141.A O SER 144.A HG 2.709 2.037 CYS 145.A SG HIS 164.A O CYS 145.A HG 3.068 2.384 GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.981 2.148 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 3.023 2.176 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.716 1.969 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.801 1.996 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.786 2.048 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 2.964 2.142 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD21 3.130 2.332 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.859 2.012 ASP 155.A N ASP 155.A OD1 ASP 155.A H 2.717 2.102 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 2.948 2.091 VAL 157.A N LYS 100.A O.A VAL 157.A H 2.822 1.984 VAL 157.A N LYS 100.A O.B VAL 157.A H 2.822 1.985 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.745 1.919 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.847 2.109 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.012 2.168 TYR 161.A N GLY 149.A O TYR 161.A H 3.324 2.581 TYR 161.A OH HIS 163.A ND1 TYR 161.A HH 3.080 2.400 MET 162.A N THR 175.A O MET 162.A H 2.754 1.969 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.865 2.070 HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.206 2.380 HIS 164.A NE2 THR 175.A OG1 HIS 164.A HE2 3.025 2.405 MET 165.A N.A ALA 173.A O MET 165.A H.A 2.965 2.132 MET 165.A N.B ALA 173.A O MET 165.A H.B 2.964 2.116 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.882 2.060 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.809 1.956 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.917 2.132 HIS 172.A NE2 GLU 166.A OE2 HIS 172.A HE2 3.058 2.323 ALA 173.A N MET 165.A O.A ALA 173.A H 2.961 2.123 ALA 173.A N MET 165.A O.B ALA 173.A H 3.024 2.184 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 2.962 2.179 THR 175.A OG1 ASP 176.A O THR 175.A HG1 2.713 1.926 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 2.990 2.201 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 3.064 2.440 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.035 2.203 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 2.939 2.124 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.908 2.092 TYR 182.A OH CYS 160.A O TYR 182.A HH 2.596 1.781 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 3.114 2.292 ASP 187.A N ASP 187.A OD1 ASP 187.A H 2.604 1.960 ARG 188.A NH2 PRO 52.A O ARG 188.A HH22 2.729 1.951 GLN 189.A N.A MET 49.A O GLN 189.A H.A 2.785 1.929 GLN 189.A N.B MET 49.A O GLN 189.A H.B 2.766 1.909 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 2.985 2.158 THR 198.A OG1.A GLU 240.A OE2.B THR 198.A HG1.A 2.391 1.574 THR 198.A OG1.B THR 196.A O THR 198.A HG1.B 3.533 2.881 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 3.003 2.182 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.882 2.048 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 3.028 2.418 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD21 3.011 2.190 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD22 2.857 2.038 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.121 2.311 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.007 2.180 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 2.977 2.143 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 2.898 2.091 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.888 2.101 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 2.976 2.156 TYR 209.A OH ILE 259.A O TYR 209.A HH 2.871 2.095 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.899 2.092 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.892 2.135 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.070 2.270 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 3.077 2.238 ASN 214.A N ALA 211.A O ASN 214.A H 2.964 2.150 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD21 2.819 1.976 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 3.161 2.312 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 3.114 2.482 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.884 2.035 LEU 220.A N ARG 217.A O.A LEU 220.A H 3.049 2.218 LEU 220.A N ARG 217.A O.B LEU 220.A H 3.073 2.245 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD21 3.216 2.409 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.903 2.066 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 3.012 2.173 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 2.775 1.916 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.941 2.135 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 3.098 2.239 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.186 2.423 LEU 232.A N ASP 229.A O LEU 232.A H 3.224 2.621 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.824 2.014 MET 235.A N.A ASN 231.A O MET 235.A H.A 2.959 2.112 MET 235.A N.B ASN 231.A O MET 235.A H.B 2.992 2.170 LYS 236.A N LEU 232.A O LYS 236.A H 3.386 2.538 TYR 237.A N VAL 233.A O TYR 237.A H 3.176 2.439 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 3.170 2.517 ASN 238.A N MET 235.A O.A ASN 238.A H 3.068 2.216 ASN 238.A N MET 235.A O.B ASN 238.A H 3.386 2.535 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 2.727 1.876 GLU 240.A N.A THR 199.A O GLU 240.A H.A 2.942 2.099 GLU 240.A N.B THR 199.A O GLU 240.A H.B 2.956 2.129 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.911 2.061 THR 243.A N HIS 246.A ND1 THR 243.A H 3.160 2.334 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 3.044 2.235 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.318 2.515 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 3.041 2.226 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.840 2.025 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 2.999 2.185 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.100 2.343 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.133 2.531 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 2.859 2.025 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.866 2.045 SER 254.A OG ILE 259.A O SER 254.A HG 2.777 1.954 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.759 1.936 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 2.893 2.057 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.156 2.349 THR 257.A OG1 LEU 253.A O THR 257.A HG1 3.076 2.331 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.729 2.089 ILE 259.A N THR 257.A OG1 ILE 259.A H 3.258 2.472 MET 264.A N.A ALA 260.A O MET 264.A H.A 2.955 2.139 MET 264.A N.B ALA 260.A O MET 264.A H.B 2.969 2.168 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.862 2.072 CYS 265.A SG VAL 261.A O CYS 265.A HG 3.424 2.395 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.057 2.305 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.148 2.385 LEU 268.A N MET 264.A O.A LEU 268.A H 2.925 2.101 LEU 268.A N MET 264.A O.B LEU 268.A H 2.899 2.072 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.774 1.938 LYS 269.A NZ ASP 229.A OD2 LYS 269.A HZ3 3.265 2.396 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.104 2.281 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 2.980 2.163 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.832 2.048 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 2.982 2.211 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.860 2.111 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.827 2.124 ARG 279.A N MET 276.A O.A ARG 279.A H 2.983 2.141 ARG 279.A N MET 276.A O.B ARG 279.A H 2.789 1.939 ILE 281.A N SER 284.A O.A ILE 281.A H 2.761 1.936 ILE 281.A N SER 284.A O.B ILE 281.A H 2.780 1.947 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 2.761 1.935 SER 284.A N.A ILE 281.A O SER 284.A H.A 2.893 2.094 SER 284.A N.B ILE 281.A O SER 284.A H.B 2.900 2.094 SER 284.A OG.B GLU 288.A OE2 SER 284.A HG.B 2.834 2.178 LEU 286.A N SER 284.A OG.B LEU 286.A H 3.089 2.254 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 3.021 2.169 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.922 2.100 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.075 2.287 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.077 2.233 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.712 1.858 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 2.950 2.092 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O.A GLN 299.A HE22 2.839 2.079 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O.B GLN 299.A HE22 2.841 2.083 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.878 2.046 SER 301.A N ARG 298.A O SER 301.A H 3.180 2.342 GLY 302.A N ARG 298.A O GLY 302.A H 2.947 2.134 GLN 306.A N TYR 154.A O GLN 306.A H 2.747 1.942