Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yw5_BB.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N GLU 2.A O LEU 5.A H 2.873 2.128 LYS 8.A N ALA 4.A O LYS 8.A H 2.879 2.119 GLN 9.A N LEU 5.A O GLN 9.A H 2.983 2.215 GLN 10.A N LYS 6.A O GLN 10.A H 3.303 2.588 GLN 10.A N LEU 7.A O GLN 10.A H 3.060 2.457 ILE 11.A N LEU 7.A O ILE 11.A H 3.267 2.468 GLU 12.A N LYS 8.A O GLU 12.A H 2.845 2.071 ALA 13.A N GLN 9.A O ALA 13.A H 2.781 2.161 ALA 13.A N GLN 10.A O ALA 13.A H 3.116 2.432 GLY 16.A N ALA 13.A O GLY 16.A H 3.094 2.500 ASN 17.A N ALA 13.A O ASN 17.A H 2.974 2.150 PHE 18.A N ILE 14.A O PHE 18.A H 2.960 2.142 LYS 19.A N PRO 15.A O LYS 19.A H 3.462 2.625 LEU 20.A N GLY 16.A O LEU 20.A H 3.094 2.265 PHE 21.A N ASN 17.A O PHE 21.A H 2.559 1.747 LYS 22.A N PHE 18.A O LYS 22.A H 2.941 2.137 GLN 23.A N LYS 19.A O GLN 23.A H 3.151 2.395 THR 24.A N LEU 20.A O THR 24.A H 3.041 2.188 LYS 25.A N PHE 21.A O LYS 25.A H 3.162 2.459 ALA 26.A N GLN 23.A O ALA 26.A H 3.130 2.515 GLN 27.A N THR 24.A O GLN 27.A H 3.170 2.337 GLN 43.A N ILE 40.A O GLN 43.A H 2.935 2.152 ARG 46.A N GLU 42.A O ARG 46.A H 3.098 2.248 ASN 47.A N GLN 43.A O ASN 47.A H 3.075 2.247 ASN 47.A ND2 ASN 47.A O ASN 47.A HD22 2.685 2.150 GLU 55.A N GLU 55.A OE1 GLU 55.A H 2.486 1.773 ASP 56.A N SER 53.A OG ASP 56.A H 3.377 2.544 LEU 57.A N SER 53.A O LEU 57.A H 2.958 2.137 MET 58.A N LEU 54.A O MET 58.A H 3.046 2.221 ALA 59.A N GLU 55.A O ALA 59.A H 2.886 2.047 ALA 60.A N ASP 56.A O ALA 60.A H 2.996 2.257 GLN 61.A N MET 58.A O GLN 61.A H 3.140 2.308 ALA 62.A N LEU 57.A O ALA 62.A H 3.058 2.202 GLY 65.A N HIS 87.A O GLY 65.A H 2.698 1.975 THR 68.A N GLY 85.A O THR 68.A H 3.201 2.409 SER 69.A N ASN 67.A OD1 SER 69.A H 2.881 2.029 LEU 70.A N ASN 67.A O LEU 70.A H 3.078 2.437 ASN 72.A N THR 217.A O ASN 72.A H 2.954 2.123 ALA 74.A N ASN 72.A OD1 ALA 74.A H 2.959 2.132 ASN 75.A N ASN 72.A O ASN 75.A H 2.974 2.257 ASN 75.A ND2 THR 217.A O ASN 75.A HD21 3.311 2.636 TYR 80.A N ILE 88.A O TYR 80.A H 2.603 1.768 ARG 83.A N ILE 86.A O ARG 83.A H 3.183 2.390 ILE 86.A N ARG 83.A O ILE 86.A H 3.233 2.377 HIS 87.A N HIS 66.A O HIS 87.A H 2.991 2.190 ILE 88.A N GLY 81.A O ILE 88.A H 3.137 2.291 ILE 89.A N HIS 63.A O ILE 89.A H 2.846 2.048 SER 90.A N TYR 78.A O SER 90.A H 2.863 2.008 THR 94.A N SER 90.A O THR 94.A H 3.087 2.278 THR 94.A OG1 PRO 229.A O THR 94.A HG1 2.515 1.722 ALA 95.A N LEU 91.A O ALA 95.A H 3.062 2.238 THR 96.A N GLU 92.A O THR 96.A H 3.065 2.212 THR 96.A OG1 GLU 92.A O THR 96.A HG1 3.019 2.260 HIS 97.A N THR 93.A O HIS 97.A H 3.120 2.265 HIS 97.A ND1 GLN 227.A O HIS 97.A HD1 3.106 2.381 LEU 98.A N THR 94.A O LEU 98.A H 2.930 2.190 ARG 99.A N ALA 95.A O ARG 99.A H 2.961 2.125 ARG 100.A N THR 96.A O ARG 100.A H 3.105 2.351 ALA 101.A N HIS 97.A O ALA 101.A H 3.057 2.224 ALA 102.A N LEU 98.A O ALA 102.A H 3.006 2.185 ARG 103.A N ARG 99.A O ARG 103.A H 3.337 2.556 VAL 104.A N ARG 100.A O VAL 104.A H 3.186 2.389 VAL 105.A N ALA 101.A O VAL 105.A H 2.911 2.086 GLU 106.A N ALA 102.A O GLU 106.A H 2.903 2.129 GLU 107.A N ARG 103.A O GLU 107.A H 2.939 2.135 VAL 108.A N VAL 104.A O VAL 108.A H 3.030 2.178 ALA 109.A N VAL 105.A O ALA 109.A H 3.183 2.351 TYR 110.A N GLU 106.A O TYR 110.A H 2.861 2.148 ARG 111.A N GLU 107.A O ARG 111.A H 2.895 2.150 ARG 111.A NH1 THR 266.A O ARG 111.A HH11 3.240 2.389 GLY 112.A N ALA 109.A O GLY 112.A H 3.327 2.491 GLY 113.A N VAL 108.A O GLY 113.A H 2.759 1.947 LEU 114.A N ASP 187.A OD2 LEU 114.A H 2.918 2.103 LEU 116.A N LEU 188.A O LEU 116.A H 2.831 2.192 PHE 117.A N CYS 138.A O PHE 117.A H 2.961 2.142 VAL 118.A N VAL 190.A O VAL 118.A H 2.729 1.917 GLY 119.A N LEU 140.A O GLY 119.A H 3.089 2.418 ARG 121.A NH1 ASP 233.A OD2 ARG 121.A HH12 2.855 2.003 ARG 121.A NH2 GLU 196.A OE2 ARG 121.A HH21 2.481 1.849 ARG 121.A NH2 ASP 233.A OD2 ARG 121.A HH22 3.493 2.838 GLN 124.A N ARG 121.A O GLN 124.A H 3.330 2.539 VAL 128.A N GLN 124.A O VAL 128.A H 3.072 2.235 VAL 129.A N ARG 125.A O VAL 129.A H 3.050 2.194 ARG 130.A N PRO 126.A O ARG 130.A H 3.259 2.450 ARG 130.A NE LEU 45.A O ARG 130.A HE 3.107 2.544 ALA 131.A N ILE 127.A O ALA 131.A H 3.085 2.264 ALA 132.A N VAL 128.A O ALA 132.A H 2.996 2.148 GLU 133.A N VAL 129.A O GLU 133.A H 3.078 2.311 LEU 134.A N ARG 130.A O LEU 134.A H 3.175 2.362 ALA 135.A N ALA 131.A O ALA 135.A H 3.173 2.340 LYS 136.A N GLU 133.A O LYS 136.A H 3.362 2.534 ALA 137.A N ALA 132.A O ALA 137.A H 2.816 1.970 CYS 138.A N ILE 115.A O CYS 138.A H 3.011 2.153 LEU 140.A N PHE 117.A O LEU 140.A H 2.939 2.321 TRP 144.A NE1 GLU 203.A OE2 TRP 144.A HE1 3.136 2.279 ARG 145.A NH1 LEU 155.A O ARG 145.A HH12 3.337 2.616 GLY 147.A N GLU 203.A OE2 GLY 147.A H 2.697 1.858 THR 148.A N ARG 145.A O THR 148.A H 3.225 2.500 THR 148.A OG1 ARG 145.A O THR 148.A HG1 2.571 1.785 ILE 149.A N GLU 203.A OE1 ILE 149.A H 2.986 2.180 THR 150.A N GLU 203.A OE1 THR 150.A H 3.396 2.590 ASN 151.A N GLY 147.A O ASN 151.A H 2.763 2.056 ARG 152.A NE ILE 149.A O ARG 152.A HE 3.044 2.218 ARG 152.A NH1 PRO 183.A O ARG 152.A HH11 3.526 2.671 ARG 152.A NH2 ILE 149.A O ARG 152.A HH21 3.441 2.752 GLU 153.A N GLU 153.A OE1 GLU 153.A H 2.631 1.885 GLN 154.A N ASN 151.A O GLN 154.A H 3.240 2.534 LEU 155.A N ASN 151.A O LEU 155.A H 3.377 2.546 LEU 156.A N ARG 152.A O LEU 156.A H 2.842 2.034 ASP 165.A N ARG 169.A O ASP 165.A H 3.123 2.373 GLU 166.A N GLU 166.A OE1 GLU 166.A H 2.548 1.727 LEU 167.A N ASP 165.A OD1 LEU 167.A H 3.269 2.608 ASP 168.A N ASP 165.A O ASP 168.A H 2.898 2.103 ARG 169.A N ASP 165.A OD1 ARG 169.A H 2.638 1.864 LEU 171.A N VAL 163.A O LEU 171.A H 2.820 1.974 GLU 175.A N GLU 175.A OE1 GLU 175.A H 2.404 1.704 LEU 178.A N PHE 174.A O LEU 178.A H 2.940 2.085 ARG 181.A NE HIS 177.A NE2 ARG 181.A HE 3.166 2.600 ARG 181.A NH2 ARG 182.A O ARG 181.A HH21 2.519 1.900 ARG 182.A NE GLU 153.A OE2 ARG 182.A HE 2.861 2.102 ASP 187.A N LEU 114.A O ASP 187.A H 2.645 1.963 LEU 188.A N LEU 114.A O LEU 188.A H 3.108 2.496 VAL 189.A N PRO 210.A O VAL 189.A H 3.290 2.527 VAL 190.A N LEU 116.A O VAL 190.A H 2.754 1.912 CYS 191.A N ILE 212.A O CYS 191.A H 2.725 1.890 LEU 192.A N VAL 118.A O LEU 192.A H 2.758 1.918 LYS 195.A NZ ASN 218.A O LYS 195.A HZ3 3.396 2.534 GLU 196.A N ASN 193.A O GLU 196.A H 3.190 2.372 ASN 197.A N PRO 194.A O ASN 197.A H 3.306 2.580 TYR 202.A N MET 198.A O TYR 202.A H 2.897 2.126 GLU 203.A N THR 199.A O GLU 203.A H 3.201 2.379 CYS 204.A N LEU 200.A O CYS 204.A H 3.184 2.395 CYS 204.A SG LEU 200.A O CYS 204.A HG 3.376 2.380 SER 205.A N LEU 201.A O SER 205.A H 3.101 2.358 LEU 206.A N TYR 202.A O LEU 206.A H 3.023 2.242 ALA 207.A N GLU 203.A O ALA 207.A H 2.865 2.038 ILE 209.A N CYS 204.A O ILE 209.A H 2.823 1.978 ILE 212.A N VAL 189.A O ILE 212.A H 2.731 1.902 GLY 213.A N TYR 226.A O GLY 213.A H 3.201 2.416 ILE 215.A N ILE 228.A O ILE 215.A H 3.214 2.469 THR 217.A N ASP 216.A OD1 THR 217.A H 2.489 1.729 THR 219.A N ASP 216.A O THR 219.A H 2.906 2.062 SER 222.A N ASN 220.A OD1 SER 222.A H 2.966 2.112 TRP 223.A N ASN 220.A O TRP 223.A H 3.410 2.582 THR 225.A N THR 211.A O THR 225.A H 3.125 2.435 THR 225.A N THR 211.A OG1 THR 225.A H 3.195 2.481 TYR 226.A N THR 211.A O TYR 226.A H 3.043 2.234 GLN 227.A NE2 PRO 221.A O GLN 227.A HE21 2.687 1.914 ILE 228.A N GLY 213.A O ILE 228.A H 2.849 2.152 ALA 230.A N ILE 215.A O ALA 230.A H 3.286 2.535 ASN 231.A N ALA 62.A O ASN 231.A H 2.941 2.181 ASN 231.A ND2 GLN 61.A O ASN 231.A HD22 3.112 2.315 ASP 233.A N ASN 231.A OD1 ASP 233.A H 3.101 2.257 SER 234.A OG ALA 60.A O SER 234.A HG 3.451 2.728 SER 234.A OG GLN 61.A OE1 SER 234.A HG 3.045 2.626 ARG 236.A N SER 234.A OG ARG 236.A H 3.244 2.488 ARG 236.A NE TYR 44.A OH ARG 236.A HE 3.357 2.544 THR 238.A N SER 234.A O THR 238.A H 2.995 2.175 THR 238.A OG1 SER 234.A O THR 238.A HG1 2.832 2.075 ALA 239.A N LEU 235.A O ALA 239.A H 3.240 2.490 LEU 240.A N ARG 236.A O LEU 240.A H 3.282 2.485 ILE 241.A N ALA 237.A O ILE 241.A H 3.046 2.187 SER 242.A N THR 238.A O SER 242.A H 2.981 2.149 GLY 243.A N ALA 239.A O GLY 243.A H 2.790 1.975 VAL 244.A N LEU 240.A O VAL 244.A H 2.840 2.024 LEU 245.A N ILE 241.A O LEU 245.A H 3.035 2.206 GLY 246.A N SER 242.A O GLY 246.A H 2.805 2.044 ARG 247.A N GLY 243.A O ARG 247.A H 2.975 2.163 ARG 247.A NE PRO 48.A O ARG 247.A HE 3.114 2.292 ARG 247.A NH2 GLU 250.A OE1 ARG 247.A HH21 3.000 2.313 ALA 248.A N VAL 244.A O ALA 248.A H 3.084 2.299 GLY 249.A N LEU 245.A O GLY 249.A H 3.064 2.235 GLU 250.A N GLY 246.A O GLU 250.A H 2.945 2.101 ARG 251.A N ARG 247.A O ARG 251.A H 2.769 1.942 ARG 251.A NE GLU 106.A OE1 ARG 251.A HE 3.554 2.740 GLY 252.A N ALA 248.A O GLY 252.A H 2.985 2.285 GLY 252.A N GLY 249.A O GLY 252.A H 3.092 2.472 GLN 253.A N GLY 249.A O GLN 253.A H 2.847 2.033 GLN 253.A NE2 ALA 135.A O GLN 253.A HE21 3.082 2.354 LYS 254.A N GLU 250.A O LYS 254.A H 3.059 2.257 ARG 256.A N GLY 252.A O ARG 256.A H 3.172 2.361 ARG 256.A NH1 ASP 168.A OD2 ARG 256.A HH12 3.113 2.397 LEU 257.A N GLN 253.A O LEU 257.A H 3.092 2.257 GLU 258.A N LYS 254.A O GLU 258.A H 2.956 2.199 ALA 259.A N ARG 255.A O ALA 259.A H 2.945 2.108 ALA 260.A N ARG 256.A O ALA 260.A H 3.175 2.445 GLN 261.A N LEU 257.A O GLN 261.A H 3.393 2.594 GLY 263.A N ALA 260.A O GLY 263.A H 2.779 1.946 VAL 264.A N ALA 259.A O VAL 264.A H 2.857 2.028 THR 266.A OG1 TYR 110.A O THR 266.A HG1 2.553 1.828 GLN 274.A N PRO 270.A O GLN 274.A H 2.720 1.938 GLY 275.A N ALA 271.A O GLY 275.A H 3.108 2.269 PHE 277.A N VAL 273.A O PHE 277.A H 3.282 2.506 PHE 277.A N GLN 274.A O PHE 277.A H 3.182 2.599 LEU 279.A N GLY 275.A O LEU 279.A H 3.195 2.364 ALA 280.A N TYR 276.A O ALA 280.A H 2.777 2.021 SER 281.A N PHE 277.A O SER 281.A H 2.995 2.167 SER 281.A OG PHE 277.A O SER 281.A HG 3.372 2.643 SER 281.A OG GLU 278.A O SER 281.A HG 2.672 2.058 ALA 282.A N GLU 278.A O ALA 282.A H 3.055 2.285 ARG 283.A N LEU 279.A O ARG 283.A H 3.121 2.303 ALA 284.A N ALA 280.A O ALA 284.A H 3.193 2.386 ALA 285.A N SER 281.A O ALA 285.A H 2.480 1.711 ASP 286.A N ALA 282.A O ASP 286.A H 2.625 1.825 ALA 287.A N ARG 283.A O ALA 287.A H 3.219 2.367 ARG 288.A N ALA 285.A O ARG 288.A H 3.062 2.388