Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yw5_OO.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 6.A N SER 2.A O LYS 6.A H 3.236 2.501 LYS 7.A N GLN 3.A O LYS 7.A H 3.285 2.451 LYS 7.A NZ GLN 3.A O LYS 7.A HZ3 3.210 2.457 ARG 8.A N LYS 4.A O ARG 8.A H 2.979 2.137 LYS 9.A N GLU 5.A O LYS 9.A H 2.772 1.958 MET 10.A N LYS 6.A O MET 10.A H 3.152 2.303 LYS 11.A N LYS 7.A O LYS 11.A H 2.993 2.364 LYS 11.A N ARG 8.A O LYS 11.A H 3.130 2.431 GLN 12.A N ARG 8.A O GLN 12.A H 3.241 2.516 GLN 12.A N LYS 9.A O GLN 12.A H 3.229 2.542 GLY 16.A N ASP 13.A OD1 GLY 16.A H 2.551 1.712 TRP 17.A N ASP 13.A O TRP 17.A H 3.110 2.278 ALA 18.A N PRO 14.A O ALA 18.A H 3.309 2.568 GLN 19.A N TYR 15.A O GLN 19.A H 3.144 2.357 ALA 20.A N GLY 16.A O ALA 20.A H 3.192 2.378 GLN 21.A N TRP 17.A O GLN 21.A H 3.271 2.536 GLN 21.A N ALA 18.A O GLN 21.A H 3.241 2.605 GLN 22.A N ALA 18.A O GLN 22.A H 3.092 2.343 ARG 23.A N GLN 19.A O ARG 23.A H 3.282 2.464 LYS 24.A N ALA 20.A O LYS 24.A H 3.286 2.468 ALA 25.A N GLN 21.A O ALA 25.A H 2.863 2.071 VAL 26.A N ARG 23.A O VAL 26.A H 3.113 2.451 ASN 27.A N ARG 23.A O ASN 27.A H 3.419 2.625 VAL 28.A N LYS 24.A O VAL 28.A H 2.866 2.018 LYS 29.A N ALA 25.A O LYS 29.A H 2.932 2.179 ARG 30.A N VAL 26.A O ARG 30.A H 2.886 2.040 ARG 30.A NH2 GLU 33.A OE1 ARG 30.A HH21 3.211 2.436 GLN 31.A N ASN 27.A O GLN 31.A H 2.617 1.810 ALA 32.A N VAL 28.A O ALA 32.A H 3.158 2.467 ALA 32.A N LYS 29.A O ALA 32.A H 3.077 2.460 GLU 33.A N LYS 29.A O GLU 33.A H 3.150 2.401 LEU 34.A N ARG 30.A O LEU 34.A H 3.248 2.420 GLN 35.A N GLN 31.A O GLN 35.A H 3.234 2.475 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.189 2.336 GLN 37.A N GLU 33.A O GLN 37.A H 2.969 2.201 ARG 38.A N LEU 34.A O ARG 38.A H 2.906 2.201 ASP 39.A N GLN 35.A O ASP 39.A H 2.622 1.782 ALA 40.A N ALA 36.A O ALA 40.A H 3.387 2.602 TRP 42.A N ASP 39.A O TRP 42.A H 3.140 2.488 VAL 46.A N ASP 44.A OD2 VAL 46.A H 3.145 2.340 LYS 47.A N ASP 44.A OD2 LYS 47.A H 3.033 2.233 LYS 47.A NZ GLU 218.A OE2 LYS 47.A HZ1 3.570 2.872 GLY 48.A N ASP 44.A O GLY 48.A H 2.775 2.023 ILE 49.A N GLY 264.A O ILE 49.A H 2.927 2.136 THR 51.A OG1 THR 262.A O THR 51.A HG1 2.671 1.863 GLU 55.A N THR 51.A O GLU 55.A H 2.979 2.148 SER 56.A N PRO 52.A O SER 56.A H 3.154 2.542 SER 56.A N PHE 53.A O SER 56.A H 3.182 2.493 PHE 57.A N VAL 54.A O PHE 57.A H 3.172 2.328 ALA 60.A N PHE 57.A O ALA 60.A H 3.083 2.252 GLY 61.A N SER 56.A O GLY 61.A H 2.888 2.084 GLN 62.A N SER 59.A O GLN 62.A H 3.196 2.483 GLN 62.A NE2 ALA 60.A O GLN 62.A HE21 3.240 2.521 GLN 62.A NE2 SER 79.A O GLN 62.A HE22 3.236 2.500 SER 66.A N LYS 74.A O SER 66.A H 3.017 2.231 LYS 74.A N SER 66.A OG LYS 74.A H 3.303 2.465 LEU 76.A N SER 64.A O LEU 76.A H 2.864 2.051 SER 79.A N GLY 61.A O SER 79.A H 2.721 1.896 LEU 82.A N SER 79.A O LEU 82.A H 3.166 2.327 ARG 83.A N LEU 87.A O ARG 83.A H 2.879 2.045 ARG 83.A NH2 PRO 80.A O ARG 83.A HH22 2.486 1.705 ARG 83.A NH2 LEU 82.A O ARG 83.A HH21 3.225 2.424 ASN 84.A N ALA 141.A O ASN 84.A H 2.844 2.041 ASN 84.A ND2 ASP 150.A OD2 ASN 84.A HD21 3.440 2.788 TYR 85.A N ASN 84.A OD1 TYR 85.A H 2.813 2.137 LYS 89.A N HIS 81.A O LYS 89.A H 2.652 1.900 GLU 91.A N ASN 88.A OD1 GLU 91.A H 2.629 1.792 PHE 92.A N ASN 88.A O PHE 92.A H 2.848 2.015 ASP 93.A N LYS 89.A O ASP 93.A H 2.963 2.119 SER 94.A N ASP 90.A O SER 94.A H 2.891 2.059 ALA 95.A N GLU 91.A O ALA 95.A H 3.068 2.288 ILE 96.A N PHE 92.A O ILE 96.A H 3.102 2.275 GLN 97.A N ASP 93.A O GLN 97.A H 2.991 2.137 TYR 98.A N SER 94.A O TYR 98.A H 3.019 2.313 ALA 99.A N ALA 95.A O ALA 99.A H 2.806 1.987 GLU 100.A N ILE 96.A O GLU 100.A H 3.009 2.161 HIS 101.A N TYR 98.A O HIS 101.A H 3.252 2.598 ILE 102.A N TYR 98.A O ILE 102.A H 3.226 2.396 LEU 103.A N ALA 99.A O LEU 103.A H 3.126 2.342 LYS 104.A N HIS 101.A O LYS 104.A H 3.339 2.511 ARG 111.A NE ARG 111.A O ARG 111.A HE 3.376 2.678 ARG 111.A NH2 ALA 114.A O ARG 111.A HH21 3.444 2.797 THR 113.A N ASP 110.A OD1 THR 113.A H 3.129 2.361 GLU 117.A N GLU 117.A OE1 GLU 117.A H 2.379 1.623 GLU 119.A N ASP 115.A O GLU 119.A H 3.213 2.538 GLU 119.A N PRO 116.A O GLU 119.A H 2.993 2.305 ASP 120.A N PRO 116.A O ASP 120.A H 2.963 2.112 ALA 123.A N GLU 119.A O ALA 123.A H 3.099 2.363 ARG 124.A N ASP 120.A O ARG 124.A H 3.299 2.534 GLU 125.A N GLU 121.A O GLU 125.A H 2.931 2.089 HIS 126.A N GLU 122.A O HIS 126.A H 2.959 2.154 ALA 127.A N ALA 123.A O ALA 127.A H 2.882 2.052 ALA 128.A N ARG 124.A O ALA 128.A H 2.671 1.811 ARG 129.A N GLU 125.A O ARG 129.A H 2.825 2.003 HIS 130.A N HIS 126.A O HIS 130.A H 2.654 1.940 ALA 131.A N ALA 127.A O ALA 131.A H 2.911 2.077 LYS 132.A N ALA 128.A O LYS 132.A H 3.145 2.329 ALA 133.A N ARG 129.A O ALA 133.A H 3.287 2.550 VAL 134.A N HIS 130.A O VAL 134.A H 3.004 2.192 ALA 135.A N ALA 131.A O ALA 135.A H 3.115 2.296 ALA 136.A N LYS 132.A O ALA 136.A H 3.057 2.215 LEU 137.A N ALA 133.A O LEU 137.A H 2.858 2.021 GLU 138.A N VAL 134.A O GLU 138.A H 2.990 2.165 ARG 139.A N ALA 136.A O ARG 139.A H 3.248 2.555 ILE 140.A N ALA 136.A O ILE 140.A H 3.148 2.421 ALA 141.A N LEU 137.A O ALA 141.A H 2.980 2.132 HIS 145.A N LYS 142.A O HIS 145.A H 3.230 2.431 GLY 146.A N LEU 143.A O GLY 146.A H 3.285 2.446 GLY 147.A N ASP 150.A OD1 GLY 147.A H 3.069 2.251 ARG 151.A N GLY 147.A O ARG 151.A H 3.363 2.567 ARG 151.A NE GLY 147.A O ARG 151.A HE 3.126 2.353 ARG 151.A NH2 ASP 58.A O ARG 151.A HH21 2.851 2.240 LYS 152.A N ALA 148.A O LYS 152.A H 2.809 2.029 HIS 153.A N LYS 149.A O HIS 153.A H 3.134 2.297 ALA 154.A N ASP 150.A O ALA 154.A H 3.049 2.340 ASN 155.A N ARG 151.A O ASN 155.A H 2.694 1.867 ASN 155.A ND2 PHE 57.A O ASN 155.A HD21 3.333 2.498 ILE 156.A N LYS 152.A O ILE 156.A H 3.117 2.333 ARG 157.A N ALA 154.A O ARG 157.A H 3.233 2.621 ARG 157.A NH1 LEU 87.A O ARG 157.A HH12 3.014 2.190 ARG 157.A NH2 ARG 83.A O ARG 157.A HH22 3.028 2.377 ARG 157.A NH2 LEU 87.A O ARG 157.A HH22 3.385 2.677 ARG 158.A N ALA 154.A O ARG 158.A H 3.235 2.529 ARG 158.A NE SER 79.A OG ARG 158.A HE 3.398 2.794 ARG 158.A NH1 SER 56.A OG ARG 158.A HH12 2.913 2.116 ARG 158.A NH2 SER 56.A O ARG 158.A HH22 2.964 2.376 ARG 158.A NH2 SER 56.A OG ARG 158.A HH22 3.235 2.540 CYS 159.A N ASN 155.A O CYS 159.A H 2.926 2.121 CYS 159.A SG ASN 155.A O CYS 159.A HG 3.461 2.409 ILE 160.A N ILE 156.A O ILE 160.A H 3.232 2.419 GLU 161.A N ARG 157.A O GLU 161.A H 3.105 2.402 GLU 161.A N ARG 158.A O GLU 161.A H 3.204 2.608 THR 162.A N ARG 158.A O THR 162.A H 2.850 2.170 THR 162.A OG1 ARG 158.A O THR 162.A HG1 2.818 2.062 PHE 163.A N CYS 159.A O PHE 163.A H 2.964 2.174 ARG 165.A N ASP 195.A OD2 ARG 165.A H 2.852 2.010 ARG 165.A NE GLU 200.A OE1 ARG 165.A HE 3.485 2.682 ARG 165.A NH2 GLU 200.A OE2 ARG 165.A HH21 2.493 1.690 ILE 167.A N GLY 164.A O ILE 167.A H 2.738 1.892 THR 168.A N GLY 164.A O THR 168.A H 3.006 2.210 ASP 169.A N ARG 165.A O ASP 169.A H 3.340 2.581 GLN 170.A N ILE 167.A O GLN 170.A H 3.356 2.554 SER 171.A N ILE 167.A O SER 171.A H 3.089 2.337 LEU 172.A N THR 168.A O LEU 172.A H 3.162 2.307 ARG 191.A NH1 ASP 169.A OD2 ARG 191.A HH12 2.973 2.154 ARG 191.A NH2 ASP 169.A OD2 ARG 191.A HH22 3.540 2.886 ASP 195.A N HIS 166.A ND1 ASP 195.A H 3.303 2.448 GLN 202.A N SER 198.A O GLN 202.A H 3.123 2.267 GLN 202.A NE2 GLY 197.A O GLN 202.A HE21 2.536 1.747 ILE 203.A N SER 199.A O ILE 203.A H 2.943 2.117 ALA 204.A N GLU 200.A O ALA 204.A H 2.948 2.190 ILE 205.A N VAL 201.A O ILE 205.A H 2.802 1.977 LEU 206.A N GLN 202.A O LEU 206.A H 2.892 2.049 THR 207.A N ILE 203.A O THR 207.A H 3.116 2.396 THR 207.A OG1 ILE 203.A O THR 207.A HG1 2.716 1.905 SER 208.A N ALA 204.A O SER 208.A H 3.148 2.380 SER 208.A OG ILE 205.A O SER 208.A HG 2.579 1.892 LYS 209.A N ILE 205.A O LYS 209.A H 3.134 2.324 ILE 210.A N LEU 206.A O ILE 210.A H 2.900 2.083 ARG 211.A N THR 207.A O ARG 211.A H 3.154 2.385 ARG 211.A NE ASP 58.A OD1 ARG 211.A HE 2.696 1.889 ARG 211.A NH1 ASP 58.A OD2 ARG 211.A HH11 3.139 2.352 ALA 212.A N SER 208.A O ALA 212.A H 3.022 2.173 LEU 213.A N LYS 209.A O LEU 213.A H 2.942 2.142 SER 214.A N ILE 210.A O SER 214.A H 2.857 2.022 SER 214.A OG ILE 210.A O SER 214.A HG 2.591 1.948 SER 214.A OG ARG 211.A O SER 214.A HG 3.348 2.742 LYS 215.A N ARG 211.A O LYS 215.A H 2.842 2.066 LYS 215.A NZ ASP 58.A OD2 LYS 215.A HZ2 3.039 2.163 ALA 216.A N LEU 213.A O ALA 216.A H 2.961 2.298 LEU 217.A N LEU 213.A O LEU 217.A H 2.939 2.132 GLY 219.A N ALA 216.A O GLY 219.A H 3.347 2.583 GLY 222.A N GLY 219.A O GLY 222.A H 3.207 2.382 ARG 224.A N GLY 221.A O ARG 224.A H 3.236 2.456 ASP 225.A N GLY 222.A O ASP 225.A H 3.221 2.394 LYS 226.A NZ ASN 223.A O LYS 226.A HZ3 2.916 2.265 ASN 228.A N ASP 225.A OD1 ASN 228.A H 3.347 2.518 ASN 228.A ND2 ASP 225.A OD2 ASN 228.A HD22 2.510 1.698 ARG 230.A N ASN 227.A O ARG 230.A H 3.294 2.491 SER 231.A OG ASN 228.A OD1 SER 231.A HG 3.217 2.555 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.072 2.248 ARG 233.A N LYS 229.A O ARG 233.A H 3.409 2.579 ARG 234.A N ARG 230.A O ARG 234.A H 2.714 1.982 LEU 235.A N SER 231.A O LEU 235.A H 2.933 2.209 LEU 235.A N LEU 232.A O LEU 235.A H 3.219 2.612 CYS 236.A N LEU 232.A O CYS 236.A H 3.093 2.281 CYS 236.A SG LEU 232.A O CYS 236.A HG 3.232 2.357 HIS 237.A N ARG 233.A O HIS 237.A H 3.159 2.372 HIS 237.A NE2 ILE 274.A O HIS 237.A HE2 3.107 2.300 LYS 238.A N ARG 234.A O LYS 238.A H 3.216 2.471 ARG 239.A N LEU 235.A O ARG 239.A H 3.102 2.310 ARG 239.A NH1 THR 207.A OG1 ARG 239.A HH11 3.364 2.559 ARG 239.A NH2 PRO 45.A O ARG 239.A HH21 3.432 2.881 ARG 239.A NH2 VAL 46.A O ARG 239.A HH22 3.354 2.518 GLN 240.A N CYS 236.A O GLN 240.A H 2.892 2.105 GLN 240.A NE2 TRP 270.A O GLN 240.A HE21 3.284 2.439 GLN 240.A NE2 GLY 272.A O GLN 240.A HE22 2.791 2.267 ARG 241.A N HIS 237.A O ARG 241.A H 3.338 2.563 ARG 241.A NE HIS 237.A O ARG 241.A HE 3.504 2.745 LEU 242.A N LYS 238.A O LEU 242.A H 3.428 2.615 LEU 243.A N ARG 239.A O LEU 243.A H 2.898 2.040 ARG 244.A N GLN 240.A O ARG 244.A H 2.878 2.090 TYR 245.A N ARG 241.A O TYR 245.A H 2.972 2.223 MET 246.A N LEU 242.A O MET 246.A H 2.801 1.945 GLU 247.A N LEU 243.A O GLU 247.A H 2.997 2.277 LYS 249.A N TYR 245.A O LYS 249.A H 3.010 2.204 GLU 250.A N MET 246.A O GLU 250.A H 2.984 2.155 ARG 251.A NH1 PRO 178.A O ARG 251.A HH12 2.767 1.986 ARG 251.A NH2 PRO 178.A O ARG 251.A HH22 2.905 2.169 GLY 254.A N ARG 174.A O GLY 254.A H 3.035 2.390 ARG 255.A N PRO 175.A O ARG 255.A H 3.319 2.539 ARG 255.A NE GLU 250.A OE2 ARG 255.A HE 2.921 2.241 ARG 255.A NH1 GLU 250.A OE2 ARG 255.A HH11 2.868 2.187 TRP 256.A N SER 253.A O TRP 256.A H 2.799 2.051 HIS 257.A N SER 253.A O HIS 257.A H 3.201 2.439 HIS 258.A N GLY 254.A O HIS 258.A H 3.086 2.266 LEU 260.A N TRP 256.A O LEU 260.A H 3.366 2.559 GLU 261.A N HIS 257.A O GLU 261.A H 3.023 2.164 THR 262.A N HIS 258.A O THR 262.A H 3.131 2.319 THR 262.A OG1 HIS 258.A O THR 262.A HG1 2.695 2.006 LEU 263.A N MET 259.A O LEU 263.A H 3.009 2.156 LEU 265.A N LEU 260.A O LEU 265.A H 3.129 2.448 ALA 268.A N TRP 42.A O ALA 268.A H 3.138 2.328 THR 269.A N THR 266.A O THR 269.A H 2.937 2.081 THR 269.A OG1 THR 266.A O THR 269.A HG1 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