Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ywy_OO.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 6.A N SER 2.A O LYS 6.A H 2.951 2.175 LYS 7.A N GLN 3.A O LYS 7.A H 3.344 2.515 ARG 8.A N LYS 4.A O ARG 8.A H 3.369 2.598 LYS 9.A N GLU 5.A O LYS 9.A H 3.292 2.447 MET 10.A N LYS 6.A O MET 10.A H 2.949 2.114 LYS 11.A N LYS 7.A O LYS 11.A H 2.935 2.147 GLN 12.A N ARG 8.A O GLN 12.A H 2.597 1.906 GLN 12.A N LYS 9.A O GLN 12.A H 3.201 2.617 ASP 13.A N LYS 9.A O ASP 13.A H 3.230 2.380 GLY 16.A N ASP 13.A OD1 GLY 16.A H 2.959 2.136 TRP 17.A N ASP 13.A O TRP 17.A H 2.899 2.071 ALA 18.A N PRO 14.A O ALA 18.A H 3.226 2.402 GLN 19.A N TYR 15.A O GLN 19.A H 3.260 2.420 ALA 20.A N GLY 16.A O ALA 20.A H 3.162 2.386 GLN 21.A N TRP 17.A O GLN 21.A H 3.216 2.440 GLN 22.A N ALA 18.A O GLN 22.A H 2.991 2.246 ARG 23.A N GLN 19.A O ARG 23.A H 3.375 2.544 LYS 24.A N ALA 20.A O LYS 24.A H 3.225 2.450 ALA 25.A N GLN 21.A O ALA 25.A H 2.936 2.097 VAL 26.A N GLN 22.A O VAL 26.A H 3.343 2.591 VAL 28.A N LYS 24.A O VAL 28.A H 2.795 1.939 LYS 29.A N ALA 25.A O LYS 29.A H 2.784 2.085 LYS 29.A N VAL 26.A O LYS 29.A H 3.247 2.617 ARG 30.A N VAL 26.A O ARG 30.A H 3.076 2.237 GLN 31.A N ASN 27.A O GLN 31.A H 2.695 1.846 ALA 32.A N VAL 28.A O ALA 32.A H 3.259 2.428 GLU 33.A N LYS 29.A O GLU 33.A H 2.877 2.132 LEU 34.A N ARG 30.A O LEU 34.A H 2.683 2.039 LEU 34.A N GLN 31.A O LEU 34.A H 3.159 2.490 GLN 35.A N GLN 31.A O GLN 35.A H 3.016 2.246 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.268 2.426 ARG 38.A N LEU 34.A O ARG 38.A H 2.976 2.313 ASP 39.A N GLN 35.A O ASP 39.A H 2.737 2.078 TRP 42.A N ASP 39.A O TRP 42.A H 3.127 2.528 VAL 46.A N ASP 44.A OD2 VAL 46.A H 3.269 2.462 LYS 47.A NZ GLU 218.A OE2 LYS 47.A HZ3 2.950 2.074 GLY 48.A N ASP 44.A O GLY 48.A H 2.664 1.914 ILE 49.A N GLY 264.A O ILE 49.A H 3.051 2.245 THR 51.A OG1 THR 262.A O THR 51.A HG1 2.600 1.766 GLU 55.A N THR 51.A O GLU 55.A H 2.896 2.106 SER 56.A N PHE 53.A O SER 56.A H 3.164 2.396 SER 56.A OG PHE 53.A O SER 56.A HG 2.455 1.738 PHE 57.A N VAL 54.A O PHE 57.A H 3.326 2.506 SER 59.A N SER 56.A O SER 59.A H 3.155 2.319 ALA 60.A N PHE 57.A O ALA 60.A H 3.327 2.486 GLY 61.A N SER 56.A O GLY 61.A H 3.043 2.189 GLN 62.A N SER 59.A O GLN 62.A H 3.128 2.426 GLN 62.A NE2 LEU 82.A O GLN 62.A HE22 2.789 2.227 SER 66.A N LYS 74.A O SER 66.A H 3.080 2.308 LYS 69.A N GLU 71.A O LYS 69.A H 3.324 2.469 LEU 76.A N SER 64.A O LEU 76.A H 2.894 2.045 SER 79.A N GLY 61.A O SER 79.A H 2.522 1.692 HIS 81.A NE2 GLU 161.A OE1 HIS 81.A HE2 3.100 2.446 LEU 82.A N SER 79.A O LEU 82.A H 3.316 2.459 ARG 83.A N LEU 87.A O ARG 83.A H 3.146 2.343 ARG 83.A NH2 PRO 80.A O ARG 83.A HH22 2.980 2.212 ARG 83.A NH2 LEU 82.A O ARG 83.A HH21 3.314 2.581 ASN 84.A N ALA 141.A O ASN 84.A H 3.024 2.211 ASN 84.A ND2 ASP 150.A OD2 ASN 84.A HD21 3.185 2.436 TYR 85.A N ASN 84.A OD1 TYR 85.A H 2.933 2.268 LYS 89.A N HIS 81.A O LYS 89.A H 3.009 2.221 GLU 91.A N ASN 88.A OD1 GLU 91.A H 2.597 1.747 PHE 92.A N ASN 88.A O PHE 92.A H 2.820 1.966 ASP 93.A N LYS 89.A O ASP 93.A H 3.062 2.212 SER 94.A N ASP 90.A O SER 94.A H 2.963 2.162 ALA 95.A N GLU 91.A O ALA 95.A H 2.981 2.166 ILE 96.A N PHE 92.A O ILE 96.A H 3.079 2.251 GLN 97.A N ASP 93.A O GLN 97.A H 2.941 2.082 TYR 98.A N SER 94.A O TYR 98.A H 2.890 2.135 ALA 99.A N ALA 95.A O ALA 99.A H 2.667 1.830 GLU 100.A N ILE 96.A O GLU 100.A H 2.944 2.092 HIS 101.A N TYR 98.A O HIS 101.A H 3.152 2.529 ILE 102.A N TYR 98.A O ILE 102.A H 3.113 2.388 ALA 108.A N GLU 119.A OE2 ALA 108.A H 2.951 2.100 ALA 114.A N ARG 111.A O ALA 114.A H 2.937 2.193 GLU 117.A N ASP 115.A OD1 GLU 117.A H 2.727 2.083 LYS 118.A N ASP 115.A O LYS 118.A H 3.211 2.498 LYS 118.A N ASP 115.A OD1 LYS 118.A H 3.213 2.517 GLU 119.A N ASP 115.A O GLU 119.A H 2.915 2.055 ASP 120.A N PRO 116.A O ASP 120.A H 3.185 2.389 GLU 122.A N LYS 118.A O GLU 122.A H 2.865 2.017 ALA 123.A N GLU 119.A O ALA 123.A H 3.008 2.216 ARG 124.A N ASP 120.A O ARG 124.A H 3.262 2.440 GLU 125.A N GLU 121.A O GLU 125.A H 2.868 2.022 HIS 126.A N GLU 122.A O HIS 126.A H 2.666 1.811 HIS 126.A NE2 GLU 100.A OE1 HIS 126.A HE2 2.896 2.047 ALA 127.A N ALA 123.A O ALA 127.A H 2.883 2.062 ALA 128.A N ARG 124.A O ALA 128.A H 2.932 2.084 ARG 129.A N GLU 125.A O ARG 129.A H 2.961 2.152 HIS 130.A N HIS 126.A O HIS 130.A H 2.807 2.017 ALA 131.A N ALA 127.A O ALA 131.A H 3.134 2.312 LYS 132.A N ALA 128.A O LYS 132.A H 3.231 2.425 ALA 133.A N ARG 129.A O ALA 133.A H 3.074 2.249 VAL 134.A N HIS 130.A O VAL 134.A H 2.965 2.115 ALA 135.A N ALA 131.A O ALA 135.A H 2.988 2.151 ALA 136.A N LYS 132.A O ALA 136.A H 2.840 2.143 ALA 136.A N ALA 133.A O ALA 136.A H 3.051 2.439 LEU 137.A N ALA 133.A O LEU 137.A H 2.688 1.858 GLU 138.A N VAL 134.A O GLU 138.A H 2.967 2.127 ILE 140.A N ALA 136.A O ILE 140.A H 3.317 2.589 ALA 141.A N LEU 137.A O ALA 141.A H 2.981 2.155 GLU 144.A N GLU 144.A OE1 GLU 144.A H 2.549 1.845 HIS 145.A N LYS 142.A O HIS 145.A H 3.061 2.234 GLY 146.A N LEU 143.A O GLY 146.A H 3.120 2.310 GLY 147.A N ASP 150.A OD2 GLY 147.A H 3.329 2.602 ASP 150.A N GLY 147.A O ASP 150.A H 3.190 2.554 ARG 151.A N GLY 147.A O ARG 151.A H 3.402 2.595 ARG 151.A NH1 GLY 146.A O ARG 151.A HH11 3.494 2.874 LYS 152.A N ALA 148.A O LYS 152.A H 3.093 2.347 HIS 153.A N LYS 149.A O HIS 153.A H 3.379 2.572 ALA 154.A N ASP 150.A O ALA 154.A H 3.006 2.240 ASN 155.A N ARG 151.A O ASN 155.A H 2.687 1.880 ASN 155.A ND2 PHE 57.A O ASN 155.A HD21 3.243 2.391 ILE 156.A N LYS 152.A O ILE 156.A H 3.123 2.308 ARG 157.A NH1 LEU 87.A O ARG 157.A HH12 2.859 2.028 ARG 157.A NH2 ARG 83.A O ARG 157.A HH22 3.002 2.392 ARG 157.A NH2 LEU 87.A O ARG 157.A HH22 3.272 2.578 ARG 158.A N ALA 154.A O ARG 158.A H 3.221 2.528 ARG 158.A NE SER 79.A OG ARG 158.A HE 3.311 2.616 ARG 158.A NH1 SER 56.A OG ARG 158.A HH12 2.759 1.951 ARG 158.A NH2 SER 56.A OG ARG 158.A HH22 3.028 2.313 CYS 159.A N ASN 155.A O CYS 159.A H 2.813 1.997 CYS 159.A SG ASN 155.A O CYS 159.A HG 3.474 2.435 ILE 160.A N ILE 156.A O ILE 160.A H 3.279 2.461 GLU 161.A N ARG 157.A O GLU 161.A H 3.207 2.547 GLU 161.A N ARG 158.A O GLU 161.A H 3.024 2.392 THR 162.A N ARG 158.A O THR 162.A H 2.848 2.181 THR 162.A OG1 ARG 158.A O THR 162.A HG1 2.864 2.038 PHE 163.A N CYS 159.A O PHE 163.A H 2.867 2.028 ARG 165.A N ASP 195.A OD2 ARG 165.A H 2.828 1.980 ARG 165.A NE GLU 200.A OE1 ARG 165.A HE 3.516 2.689 ARG 165.A NH2 GLU 200.A OE2 ARG 165.A HH21 2.464 1.666 ILE 167.A N GLY 164.A O ILE 167.A H 2.667 1.816 THR 168.A N GLY 164.A O THR 168.A H 2.941 2.159 ASP 169.A N ARG 165.A O ASP 169.A H 3.294 2.605 SER 171.A N ILE 167.A O SER 171.A H 3.307 2.508 LEU 172.A N THR 168.A O LEU 172.A H 3.337 2.512 VAL 183.A N ALA 180.A O VAL 183.A H 3.378 2.555 ARG 191.A NH1 ASP 169.A OD2 ARG 191.A HH12 3.427 2.791 SER 198.A OG ASP 195.A OD2 SER 198.A HG 2.363 1.638 GLN 202.A N SER 198.A O GLN 202.A H 3.107 2.263 GLN 202.A NE2 GLY 197.A O GLN 202.A HE21 2.729 2.092 ILE 203.A N SER 199.A O ILE 203.A H 2.932 2.086 ALA 204.A N GLU 200.A O ALA 204.A H 3.127 2.345 ILE 205.A N VAL 201.A O ILE 205.A H 2.879 2.076 LEU 206.A N GLN 202.A O LEU 206.A H 2.841 2.025 THR 207.A N ILE 203.A O THR 207.A H 3.085 2.378 THR 207.A OG1 ILE 203.A O THR 207.A HG1 2.570 1.785 SER 208.A N ALA 204.A O SER 208.A H 3.052 2.347 SER 208.A OG ILE 205.A O SER 208.A HG 2.557 1.796 LYS 209.A N ILE 205.A O LYS 209.A H 3.203 2.436 ILE 210.A N LEU 206.A O ILE 210.A H 2.949 2.169 ARG 211.A N THR 207.A O ARG 211.A H 3.286 2.537 ARG 211.A NE ASP 58.A OD1 ARG 211.A HE 2.797 2.007 ARG 211.A NH1 ASP 58.A OD2 ARG 211.A HH11 3.289 2.569 ALA 212.A N SER 208.A O ALA 212.A H 3.294 2.459 LEU 213.A N LYS 209.A O LEU 213.A H 3.049 2.257 SER 214.A N ILE 210.A O SER 214.A H 2.885 2.060 SER 214.A OG ILE 210.A O SER 214.A HG 2.506 1.784 LYS 215.A N ARG 211.A O LYS 215.A H 2.946 2.168 LYS 215.A NZ ASP 58.A OD2 LYS 215.A HZ2 3.240 2.404 ALA 216.A N LEU 213.A O ALA 216.A H 2.908 2.314 LEU 217.A N LEU 213.A O LEU 217.A H 2.885 2.147 GLY 222.A N GLY 219.A O GLY 222.A H 2.925 2.119 ASP 225.A N GLY 222.A O ASP 225.A H 3.246 2.442 ASN 228.A ND2 ASP 225.A OD1 ASN 228.A HD22 3.494 2.867 ASN 228.A ND2 ASP 225.A OD2 ASN 228.A HD22 2.751 1.894 SER 231.A OG ASN 228.A OD1 SER 231.A HG 2.948 2.120 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.135 2.333 ARG 233.A N LYS 229.A O ARG 233.A H 3.419 2.616 ARG 234.A N ARG 230.A O ARG 234.A H 2.889 2.161 LEU 235.A N SER 231.A O LEU 235.A H 3.150 2.457 LEU 235.A N LEU 232.A O LEU 235.A H 3.127 2.491 CYS 236.A N LEU 232.A O CYS 236.A H 3.045 2.214 CYS 236.A SG LEU 232.A O CYS 236.A HG 3.375 2.313 HIS 237.A N ARG 233.A O HIS 237.A H 3.133 2.353 HIS 237.A NE2 ILE 274.A O HIS 237.A HE2 3.068 2.334 LYS 238.A N ARG 234.A O LYS 238.A H 3.015 2.206 ARG 239.A N LEU 235.A O ARG 239.A H 2.975 2.196 GLN 240.A N CYS 236.A O GLN 240.A H 2.973 2.321 GLN 240.A NE2 TRP 270.A O GLN 240.A HE21 3.116 2.275 GLN 240.A NE2 GLY 272.A O GLN 240.A HE22 2.497 1.917 ARG 241.A N HIS 237.A O ARG 241.A H 3.151 2.428 LEU 243.A N ARG 239.A O LEU 243.A H 3.109 2.270 ARG 244.A N GLN 240.A O ARG 244.A H 2.956 2.195 MET 246.A N LEU 242.A O MET 246.A H 2.829 1.978 GLU 247.A N LEU 243.A O GLU 247.A H 3.113 2.425 LYS 249.A N TYR 245.A O LYS 249.A H 3.058 2.284 GLU 250.A N MET 246.A O GLU 250.A H 3.016 2.204 ARG 251.A NH1 PRO 178.A O ARG 251.A HH12 2.882 2.170 ARG 251.A NH2 PRO 178.A O ARG 251.A HH22 2.655 1.859 SER 253.A N GLU 250.A O SER 253.A H 2.899 2.239 GLY 254.A N ARG 174.A O GLY 254.A H 3.035 2.375 ARG 255.A N PRO 175.A O ARG 255.A H 3.342 2.526 ARG 255.A NE GLU 250.A OE2 ARG 255.A HE 2.853 2.039 ARG 255.A NH1 GLU 250.A OE2 ARG 255.A HH11 3.137 2.462 TRP 256.A N SER 253.A O TRP 256.A H 2.857 2.109 HIS 257.A N SER 253.A O HIS 257.A H 3.258 2.547 HIS 257.A N GLY 254.A O HIS 257.A H 3.188 2.589 HIS 258.A N GLY 254.A O HIS 258.A H 3.040 2.230 GLU 261.A N HIS 257.A O GLU 261.A H 3.175 2.322 THR 262.A N HIS 258.A O THR 262.A H 3.335 2.558 THR 262.A OG1 HIS 258.A O THR 262.A HG1 2.422 1.674 LEU 263.A N MET 259.A O LEU 263.A H 3.053 2.211 GLY 264.A N LEU 260.A O GLY 264.A H 2.530 1.883 LEU 265.A N LEU 260.A O LEU 265.A H 3.085 2.415 THR 266.A OG1 TRP 42.A O THR 266.A HG1 2.867 2.156 ALA 268.A N TRP 42.A O ALA 268.A H 3.086 2.311 THR 269.A N THR 266.A O THR 269.A H 2.987 2.145 THR 269.A OG1 THR 266.A O THR 269.A HG1 2.459 1.693 TRP 270.A NE1 GLU 247.A OE2 TRP 270.A HE1 2.734 1.991 LYS 271.A N PRO 267.A O LYS 271.A H 2.918 2.083 LYS 271.A NZ GLU 247.A OE1 LYS 271.A HZ2 2.800 1.911