Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6ywy_WW.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): VAL 5.A N TYR 31.A OH VAL 5.A H 3.344 2.583 SER 11.A N ASP 93.A OD1 SER 11.A H 3.288 2.480 SER 11.A OG ASP 93.A OD2 SER 11.A HG 3.326 2.511 GLU 14.A N SER 12.A OG GLU 14.A H 3.139 2.430 GLU 17.A N PRO 13.A O GLU 17.A H 3.178 2.384 ALA 18.A N GLU 14.A O ALA 18.A H 3.253 2.490 ALA 18.A N LEU 15.A O ALA 18.A H 3.137 2.521 LEU 19.A N LEU 15.A O LEU 19.A H 3.189 2.402 GLU 20.A N LYS 16.A O GLU 20.A H 2.824 1.965 THR 21.A N GLU 17.A O THR 21.A H 3.336 2.571 THR 21.A OG1 GLU 17.A O THR 21.A HG1 2.523 1.707 ARG 23.A N LEU 19.A O ARG 23.A H 2.816 1.984 GLU 24.A N GLU 20.A O GLU 24.A H 3.234 2.440 LYS 25.A N LEU 22.A O LYS 25.A H 3.327 2.529 LYS 25.A NZ ASP 73.A O LYS 25.A HZ3 3.007 2.118 VAL 26.A N LEU 22.A O VAL 26.A H 2.634 1.844 ILE 27.A N LEU 22.A O ILE 27.A H 3.091 2.473 LEU 28.A N ARG 23.A O LEU 28.A H 2.790 1.974 THR 30.A N ILE 27.A O THR 30.A H 3.165 2.426 THR 30.A OG1 ILE 27.A O THR 30.A HG1 2.392 1.617 TYR 31.A N LEU 28.A O TYR 31.A H 2.944 2.139 LEU 32.A N PRO 29.A O LEU 32.A H 3.023 2.175 ARG 37.A N PRO 33.A O ARG 37.A H 3.046 2.209 GLN 38.A N GLU 35.A O GLN 38.A H 3.271 2.493 LYS 39.A N LEU 36.A O LYS 39.A H 2.917 2.091 ASN 42.A N LYS 39.A O ASN 42.A H 3.132 2.394 GLU 46.A N LYS 43.A O GLU 46.A H 3.199 2.351 LEU 49.A N TYR 45.A O LEU 49.A H 2.971 2.125 ALA 50.A N GLU 46.A O ALA 50.A H 3.241 2.453 HIS 51.A N GLU 48.A O HIS 51.A H 2.958 2.215 HIS 51.A ND1 LYS 47.A O HIS 51.A HD1 2.511 1.787 ASP 52.A N GLU 48.A O ASP 52.A H 3.112 2.286 VAL 54.A N PHE 65.A O VAL 54.A H 3.201 2.460 ILE 58.A N ILE 56.A O ILE 58.A H 2.890 2.195 GLN 61.A N ASP 59.A OD1 GLN 61.A H 3.321 2.565 GLN 63.A N ILE 56.A O GLN 63.A H 2.923 2.098 ARG 64.A N GLN 63.A OE1 ARG 64.A H 2.520 1.684 ILE 68.A N ILE 40.A O ILE 68.A H 3.077 2.245 ASN 69.A N ASP 73.A OD2 ASN 69.A H 3.045 2.250 LEU 71.A N ASN 69.A OD1 LEU 71.A H 3.334 2.498 ASP 73.A N ASN 69.A O ASP 73.A H 2.937 2.299 LYS 79.A N ASN 76.A OD1 LYS 79.A H 2.680 1.822 ASN 80.A N ASN 76.A O ASN 80.A H 3.031 2.184 ILE 81.A N THR 77.A O ILE 81.A H 2.954 2.113 ARG 82.A N PRO 78.A O ARG 82.A H 2.973 2.144 ALA 83.A N LYS 79.A O ALA 83.A H 2.798 1.950 ALA 84.A N ASN 80.A O ALA 84.A H 2.830 1.979 LEU 85.A N ILE 81.A O LEU 85.A H 2.713 1.931 LEU 86.A N ARG 82.A O LEU 86.A H 2.908 2.067 SER 87.A N ALA 83.A O SER 87.A H 3.207 2.447 SER 87.A OG ALA 83.A O SER 87.A HG 2.880 2.043 ASP 93.A N ASN 90.A O ASP 93.A H 3.205 2.542 PHE 94.A N ASN 90.A O PHE 94.A H 3.370 2.545 ASN 96.A N ASP 93.A O ASN 96.A H 3.138 2.292 ASN 96.A ND2 LYS 9.A O ASN 96.A HD21 3.345 2.495 LEU 97.A N PHE 94.A O LEU 97.A H 3.261 2.415 LEU 100.A N ASN 96.A O LEU 100.A H 2.715 1.897 LEU 101.A N LEU 97.A O LEU 101.A H 2.956 2.122 GLY 103.A N GLY 99.A O GLY 103.A H 3.055 2.214 MET 104.A N LEU 100.A O MET 104.A H 3.040 2.191 HIS 105.A N LEU 101.A O HIS 105.A H 3.023 2.246 ARG 106.A N GLU 102.A O ARG 106.A H 2.969 2.236 ALA 107.A N GLY 103.A O ALA 107.A H 2.774 1.979 ARG 109.A N MET 104.A O ARG 109.A H 3.161 2.306 LEU 115.A N PRO 112.A O LEU 115.A H 2.840 1.996 ALA 117.A N TRP 114.A O ALA 117.A H 3.158 2.569 GLN 118.A N TRP 114.A O GLN 118.A H 3.257 2.551 GLN 118.A N LEU 115.A O GLN 118.A H 2.969 2.329 ILE 119.A N LEU 115.A O ILE 119.A H 3.028 2.207 VAL 120.A N SER 116.A O VAL 120.A H 3.318 2.511 ARG 121.A N GLN 118.A O ARG 121.A H 3.196 2.546 LYS 122.A N GLN 118.A O LYS 122.A H 3.197 2.352 ALA 123.A N ILE 119.A O ALA 123.A H 3.100 2.276 CYS 124.A N VAL 120.A O CYS 124.A H 3.277 2.543 CYS 124.A SG VAL 120.A O CYS 124.A HG 3.141 2.329 LYS 125.A N ARG 121.A O LYS 125.A H 3.152 2.348 GLY 127.A N CYS 124.A O GLY 127.A H 3.241 2.413 HIS 128.A N ALA 123.A O HIS 128.A H 3.237 2.489 ILE 132.A N LEU 129.A O ILE 132.A H 3.029 2.343 LEU 133.A N LEU 129.A O LEU 133.A H 3.014 2.178 ASN 134.A N GLN 130.A O ASN 134.A H 2.817 2.031 VAL 136.A N ILE 132.A O VAL 136.A H 2.938 2.108 ARG 137.A N LEU 133.A O ARG 137.A H 2.852 2.049 ASP 138.A N ASN 134.A O ASP 138.A H 2.775 1.980 ARG 141.A NE ASP 138.A OD2 ARG 141.A HE 2.623 1.911 ARG 141.A NH1 SER 98.A OG ARG 141.A HH12 2.828 1.999 ARG 141.A NH1 ASP 138.A OD2 ARG 141.A HH11 2.562 1.907 ARG 141.A NH2 SER 98.A O ARG 141.A HH22 3.188 2.520 ARG 141.A NH2 SER 98.A OG ARG 141.A HH22 3.224 2.527 ARG 141.A NH2 GLU 102.A OE1 ARG 141.A HH21 2.543 1.761 THR 142.A N ASP 138.A O THR 142.A H 3.214 2.368 THR 142.A OG1 ASP 138.A O THR 142.A HG1 2.620 1.820 GLY 143.A N VAL 139.A O GLY 143.A H 3.144 2.382 LEU 146.A N HIS 193.A ND1 LEU 146.A H 3.156 2.341 ARG 148.A NH2 VAL 276.A O ARG 148.A HH22 2.661 1.832 HIS 149.A N GLN 201.A OE1 HIS 149.A H 2.937 2.284 HIS 149.A ND1 TYR 280.A OH HIS 149.A HD1 2.789 2.005 HIS 149.A NE2 ASP 212.A OD2 HIS 149.A HE2 3.081 2.277 ASN 153.A N HIS 149.A O ASN 153.A H 3.150 2.384 ASN 153.A ND2 ASN 153.A O ASN 153.A HD22 3.100 2.357 ASN 153.A ND2 GLN 214.A OE1 ASN 153.A HD21 2.553 1.874 GLU 154.A N GLU 150.A O GLU 154.A H 2.502 1.747 LEU 155.A N THR 151.A O LEU 155.A H 2.947 2.124 LEU 156.A N VAL 152.A O LEU 156.A H 3.228 2.375 TRP 158.A N GLU 154.A O TRP 158.A H 3.385 2.583 ILE 159.A N LEU 155.A O ILE 159.A H 3.121 2.286 GLN 160.A N LEU 156.A O GLN 160.A H 3.158 2.341 GLN 160.A NE2 LEU 156.A O GLN 160.A HE21 3.581 2.807 ARG 161.A N PHE 157.A O ARG 161.A H 2.944 2.188 PHE 162.A N TRP 158.A O PHE 162.A H 2.791 1.953 TRP 164.A N GLN 160.A O TRP 164.A H 2.855 2.047 LYS 165.A N ARG 161.A O LYS 165.A H 2.711 2.014 SER 166.A OG SER 166.A O SER 166.A HG 2.307 1.601 ASP 167.A N TRP 164.A O ASP 167.A H 3.102 2.293 TYR 168.A N ALA 163.A O TYR 168.A H 2.948 2.180 SER 169.A OG SER 166.A OG SER 169.A HG 2.556 1.973 THR 173.A N SER 169.A O THR 173.A H 2.778 1.928 THR 173.A OG1 SER 169.A O THR 173.A HG1 2.542 1.723 ARG 174.A N GLU 170.A O ARG 174.A H 3.023 2.166 LYS 175.A NZ GLU 179.A OE2 LYS 175.A HZ3 3.201 2.333 ALA 176.A N GLU 172.A O ALA 176.A H 2.475 1.695 LEU 177.A N THR 173.A O LEU 177.A H 2.846 2.012 ARG 178.A N LYS 175.A O ARG 178.A H 3.240 2.587 GLU 179.A N LYS 175.A O GLU 179.A H 3.376 2.623 VAL 180.A N ALA 176.A O VAL 180.A H 3.326 2.517 GLN 181.A N LEU 177.A O GLN 181.A H 3.362 2.508 GLN 181.A NE2 ASP 185.A OD1 GLN 181.A HE21 2.811 2.053 GLU 182.A N ARG 178.A O GLU 182.A H 2.859 2.100 ILE 183.A N GLU 179.A O ILE 183.A H 3.125 2.473 ILE 183.A N VAL 180.A O ILE 183.A H 3.019 2.308 LEU 184.A N VAL 180.A O LEU 184.A H 3.033 2.195 ASP 185.A N GLN 181.A O ASP 185.A H 2.983 2.175 LEU 187.A N ILE 183.A O LEU 187.A H 2.806 1.987 GLY 189.A N ASP 185.A O GLY 189.A H 2.916 2.092 ARG 192.A N ASP 190.A OD1 ARG 192.A H 3.196 2.339 MET 194.A N GLU 191.A O MET 194.A H 3.272 2.422 SER 195.A OG GLU 147.A OE2 SER 195.A HG 2.665 1.835 ARG 198.A NE GLN 202.A OE1 ARG 198.A HE 3.247 2.396 ARG 198.A NH1 LEU 187.A O ARG 198.A HH12 3.488 2.899 ARG 198.A NH1 HIS 193.A O ARG 198.A HH11 3.058 2.314 ARG 198.A NH2 LEU 187.A O ARG 198.A HH22 2.616 1.762 LYS 199.A N SER 195.A O LYS 199.A H 3.125 2.355 ARG 200.A N LYS 196.A O ARG 200.A H 3.191 2.475 ARG 200.A N ASP 197.A O ARG 200.A H 3.077 2.437 GLN 201.A N ASP 197.A O GLN 201.A H 3.092 2.279 GLN 202.A N ARG 198.A O GLN 202.A H 2.980 2.137 ALA 203.A N LYS 199.A O ALA 203.A H 3.305 2.525 LEU 204.A N ARG 200.A O LEU 204.A H 3.202 2.444 THR 205.A N GLN 201.A O THR 205.A H 3.110 2.297 THR 205.A OG1 GLN 201.A O THR 205.A HG1 3.076 2.248 ARG 206.A N GLN 202.A O ARG 206.A H 2.775 2.119 TYR 209.A N GLN 202.A OE1 TYR 209.A H 3.276 2.481 ARG 211.A N PRO 208.A O ARG 211.A H 2.664 1.840 ASP 212.A N TYR 209.A O ASP 212.A H 3.277 2.449 GLN 214.A N ASP 212.A OD1 GLN 214.A H 3.120 2.277 GLN 214.A NE2 TYR 290.A O GLN 214.A HE22 3.101 2.410 PHE 215.A N ASP 212.A O PHE 215.A H 2.890 2.192 LEU 216.A N ASP 212.A O LEU 216.A H 2.902 2.057 ALA 217.A N PRO 213.A O ALA 217.A H 3.093 2.306 ALA 218.A N PHE 215.A O ALA 218.A H 2.936 2.170 ARG 219.A NH2 GLN 181.A OE1 ARG 219.A HH21 2.880 2.061 LEU 220.A N LEU 216.A O LEU 220.A H 3.083 2.315 ASN 221.A N ALA 217.A O ASN 221.A H 3.101 2.495 ASN 221.A N ALA 218.A O ASN 221.A H 3.255 2.546 ASN 221.A ND2 GLN 160.A OE1 ASN 221.A HD22 2.861 2.120 ASN 221.A ND2 TYR 168.A OH ASN 221.A HD21 3.437 2.594 THR 223.A N ARG 219.A O THR 223.A H 3.349 2.521 THR 223.A OG1 ARG 219.A O THR 223.A HG1 2.740 1.904 ALA 224.A N LEU 220.A O ALA 224.A H 3.070 2.261 GLU 225.A N ASN 221.A O GLU 225.A H 3.018 2.358 GLU 225.A N LEU 222.A O GLU 225.A H 3.077 2.420 LEU 226.A N THR 223.A O LEU 226.A H 3.047 2.214 ARG 229.A NE TYR 168.A O ARG 229.A HE 3.361 2.719 ARG 229.A NH1 TYR 168.A O ARG 229.A HH11 3.197 2.487 GLN 236.A N THR 232.A O GLN 236.A H 3.003 2.225 LEU 237.A N SER 233.A O LEU 237.A H 2.968 2.248 SER 239.A N GLN 235.A O SER 239.A H 3.305 2.479 SER 239.A OG GLN 236.A O SER 239.A HG 2.673 1.932 ALA 240.A N GLN 236.A O ALA 240.A H 3.107 2.247 ASN 241.A N LEU 237.A O ASN 241.A H 2.868 2.108 ASP 242.A N ASN 238.A O ASP 242.A H 2.801 2.001 VAL 243.A N SER 239.A O VAL 243.A H 3.243 2.560 LYS 244.A N ASN 241.A O LYS 244.A H 3.014 2.268 LEU 246.A N ASP 242.A O LEU 246.A H 3.066 2.252 VAL 247.A N VAL 243.A O VAL 247.A H 3.457 2.601 LYS 248.A N LYS 244.A O LYS 248.A H 3.018 2.303 TYR 249.A N ASN 245.A O TYR 249.A H 2.682 1.831 ALA 250.A N LEU 246.A O ALA 250.A H 2.699 1.857 GLU 251.A N VAL 247.A O GLU 251.A H 3.167 2.421 GLN 252.A N LYS 248.A O GLN 252.A H 3.166 2.553 GLN 252.A N TYR 249.A O GLN 252.A H 2.834 2.153 LEU 253.A N TYR 249.A O LEU 253.A H 2.875 2.099 LEU 256.A N GLN 252.A O LEU 256.A H 3.405 2.560 TRP 257.A N LEU 253.A O TRP 257.A H 2.828 2.021 TRP 257.A NE1 LYS 261.A O TRP 257.A HE1 2.624 1.787 LEU 264.A N GLU 327.A OE2 LEU 264.A H 2.974 2.204 ASP 265.A N ALA 262.A O ASP 265.A H 3.399 2.599 THR 268.A OG1 LEU 204.A O THR 268.A HG1 2.382 1.700 ASP 269.A N ASP 269.A OD1 ASP 269.A H 2.586 1.976 ALA 271.A N THR 268.A O ALA 271.A H 3.173 2.317 ILE 282.A N ARG 279.A O ILE 282.A H 3.036 2.203 VAL 286.A N LYS 283.A O VAL 286.A H 3.014 2.257 HIS 287.A N LYS 283.A O HIS 287.A H 2.945 2.138 HIS 287.A NE2 GLU 327.A OE2 HIS 287.A HE2 2.699 1.912 LEU 288.A N PRO 284.A O LEU 288.A H 3.199 2.349 ARG 289.A N VAL 286.A O ARG 289.A H 3.047 2.390 ARG 289.A NH1 GLU 154.A OE2 ARG 289.A HH12 2.845 2.001 ARG 289.A NH2 GLU 154.A OE1 ARG 289.A HH22 2.475 1.823 ARG 289.A NH2 GLU 154.A OE2 ARG 289.A HH22 3.474 2.824 TYR 290.A N VAL 286.A O TYR 290.A H 3.363 2.589 TYR 290.A OH GLU 154.A OE2 TYR 290.A HH 2.875 2.230 ALA 291.A N HIS 287.A O ALA 291.A H 2.845 2.224 SER 292.A OG LEU 288.A O SER 292.A HG 2.479 1.777 THR 294.A OG1 TYR 290.A O THR 294.A HG1 3.176 2.358 GLN 296.A N SER 292.A O GLN 296.A H 2.900 2.043 ALA 297.A N PHE 293.A O ALA 297.A H 2.856 2.112 LYS 299.A N LEU 295.A O LYS 299.A H 3.286 2.452 LYS 299.A NZ GLU 325.A OE2 LYS 299.A HZ1 3.120 2.275 ASN 300.A N GLN 296.A O ASN 300.A H 3.044 2.186 ASN 300.A ND2 GLU 225.A OE2 ASN 300.A HD22 3.044 2.358 ALA 301.A N ALA 297.A O ALA 301.A H 2.688 1.925 ALA 302.A N LEU 298.A O ALA 302.A H 2.719 1.874 LYS 303.A N LYS 299.A O LYS 303.A H 3.109 2.358 ILE 304.A N ASN 300.A O ILE 304.A H 3.472 2.621 VAL 305.A N ALA 301.A O VAL 305.A H 3.106 2.253 GLY 306.A N ALA 302.A O GLY 306.A H 3.100 2.460 GLY 306.A N LYS 303.A O GLY 306.A H 2.932 2.265 GLN 307.A N LYS 303.A O GLN 307.A H 3.182 2.521 GLN 307.A N ILE 304.A O GLN 307.A H 2.865 2.179 GLY 309.A N GLY 306.A O GLY 309.A H 3.429 2.622 ALA 314.A N HIS 310.A O ALA 314.A H 3.138 2.320 ALA 315.A N GLY 311.A O ALA 315.A H 3.034 2.214 GLN 316.A N PRO 312.A O GLN 316.A H 2.802 2.003 LEU 317.A N LEU 313.A O LEU 317.A H 2.836 1.986 ILE 318.A N ALA 314.A O ILE 318.A H 3.229 2.389 ASN 319.A N ALA 315.A O ASN 319.A H 3.069 2.371 ASN 319.A N GLN 316.A O ASN 319.A H 2.918 2.291 ARG 320.A N GLN 316.A O ARG 320.A H 3.322 2.552 ARG 320.A NH1 GLN 316.A O ARG 320.A HH11 3.509 2.752 ARG 320.A NH1 GLN 316.A OE1 ARG 320.A HH12 2.402 1.738 ARG 320.A NH2 TRP 257.A O ARG 320.A HH21 2.536 1.681 ALA 321.A N LEU 317.A O ALA 321.A H 3.021 2.168 ALA 322.A N ILE 318.A O ALA 322.A H 2.959 2.111 ALA 323.A N ASN 319.A O ALA 323.A H 3.091 2.343 VAL 324.A N ARG 320.A O VAL 324.A H 2.720 1.918 GLU 325.A N ALA 321.A O GLU 325.A H 2.595 1.748 ALA 326.A N ALA 322.A O ALA 326.A H 3.112 2.278 GLU 327.A N ALA 323.A O GLU 327.A H 3.256 2.408 SER 328.A N VAL 324.A O SER 328.A H 2.639 1.833 GLN 329.A N GLU 325.A O GLN 329.A H 2.751 1.915 LEU 330.A N ALA 326.A O LEU 330.A H 3.184 2.393 ALA 331.A N GLU 327.A O ALA 331.A H 3.244 2.426 TYR 332.A N SER 328.A O TYR 332.A H 2.988 2.281 TYR 332.A N GLN 329.A O TYR 332.A H 3.122 2.505 ALA 333.A N LEU 330.A O ALA 333.A H 3.041 2.246 LYS 334.A N ALA 331.A O LYS 334.A H 3.313 2.478 VAL 335.A N ALA 331.A O VAL 335.A H 3.163 2.388 MET 339.A N ASP 336.A O MET 339.A H 3.231 2.373 LYS 343.A N MET 339.A O LYS 343.A H 3.290 2.535 LYS 343.A N ALA 340.A O LYS 343.A H 3.044 2.457 ILE 344.A N ALA 340.A O ILE 344.A H 2.877 2.028 TYR 345.A N GLY 341.A O TYR 345.A H 3.067 2.232 GLU 346.A N GLN 342.A O GLU 346.A H 3.132 2.366 MET 347.A N LYS 343.A O MET 347.A H 2.947 2.247 MET 347.A N ILE 344.A O MET 347.A H 2.912 2.258 VAL 348.A N ILE 344.A O VAL 348.A H 2.802 2.028 VAL 349.A N TYR 345.A O VAL 349.A H 3.028 2.299 GLY 350.A N TYR 345.A O GLY 350.A H 3.290 2.457 LYS 353.A NZ GLY 351.A O LYS 353.A HZ1 2.702 2.052