Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yy1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 4.A N GLU 4.A OE1 GLU 4.A H 2.718 1.978 VAL 8.A N VAL 120.A O VAL 8.A H 3.043 2.221 ILE 9.A N GLN 13.A OE1 ILE 9.A H 2.523 1.700 GLU 10.A N GLN 13.A OE1 GLU 10.A H 2.848 2.040 GLY 11.A N GLU 129.A OE2 GLY 11.A H 3.236 2.413 GLN 13.A NE2 ASP 7.A O GLN 13.A HE22 2.985 2.130 PHE 14.A N GLY 11.A O PHE 14.A H 2.874 2.018 ARG 16.A NH1 LYS 174.A O ARG 16.A HH11 3.506 2.847 ARG 16.A NH2 ASP 149.A OD1 ARG 16.A HH22 3.100 2.407 ARG 16.A NH2 ASP 149.A OD2 ARG 16.A HH22 2.517 1.828 MET 18.A N ASP 15.A OD1 MET 18.A H 2.576 1.730 LEU 19.A N ASP 15.A O LEU 19.A H 3.015 2.182 SER 20.A N ARG 16.A O SER 20.A H 3.118 2.266 SER 20.A OG ARG 16.A O SER 20.A HG 3.425 2.719 ALA 21.A N GLU 17.A O ALA 21.A H 2.884 2.061 ILE 22.A N MET 18.A O ILE 22.A H 2.806 1.997 PHE 23.A N LEU 19.A O PHE 23.A H 2.797 1.958 ASP 24.A N SER 20.A O ASP 24.A H 3.182 2.389 VAL 25.A N ALA 21.A O VAL 25.A H 3.381 2.582 ALA 26.A N ILE 22.A O ALA 26.A H 3.054 2.302 ARG 27.A N PHE 23.A O ARG 27.A H 3.133 2.364 ARG 27.A NH1 GLN 142.A OE1 ARG 27.A HH12 3.190 2.467 ARG 27.A NH2 ASP 24.A OD1 ARG 27.A HH21 3.354 2.538 ARG 27.A NH2 GLN 142.A OE1 ARG 27.A HH22 3.032 2.257 GLU 28.A N ASP 24.A O GLU 28.A H 3.153 2.407 MET 29.A N VAL 25.A O MET 29.A H 2.925 2.133 GLU 30.A N ALA 26.A O GLU 30.A H 2.777 2.056 LYS 31.A NZ GLU 28.A OE2 LYS 31.A HZ2 2.758 1.986 ILE 32.A N GLU 28.A O ILE 32.A H 3.057 2.265 GLU 33.A N MET 29.A O GLU 33.A H 2.955 2.134 LYS 34.A N GLU 30.A O LYS 34.A H 3.072 2.295 SER 35.A N LYS 31.A O SER 35.A H 3.078 2.337 SER 35.A OG SER 37.A O SER 35.A HG 3.218 2.550 GLN 38.A NE2 SER 39.A O GLN 38.A HE21 2.803 2.070 GLN 38.A NE2 LYS 67.A O GLN 38.A HE22 3.036 2.238 GLN 38.A NE2 ARG 68.A O GLN 38.A HE22 3.407 2.907 ILE 41.A N SER 39.A OG ILE 41.A H 3.218 2.367 LEU 42.A N LEU 69.A O LEU 42.A H 2.822 1.970 LYS 43.A N GLU 40.A O LYS 43.A H 3.207 2.390 TYR 45.A N LEU 42.A O TYR 45.A H 2.955 2.234 LEU 46.A N ASP 97.A OD2 LEU 46.A H 2.878 2.100 MET 47.A N GLU 72.A O MET 47.A H 2.699 1.852 ALA 48.A N ILE 98.A O ALA 48.A H 2.901 2.055 THR 49.A N LEU 74.A O THR 49.A H 3.178 2.425 THR 49.A OG1 GLU 63.A OE2 THR 49.A HG1 3.288 2.477 LEU 50.A N VAL 100.A O LEU 50.A H 2.832 2.072 PHE 51.A N THR 76.A O PHE 51.A H 3.349 2.508 TYR 52.A N ARG 102.A O TYR 52.A H 2.821 2.120 SER 55.A OG THR 58.A OG1 SER 55.A HG 3.037 2.396 THR 58.A N SER 55.A OG THR 58.A H 3.378 2.544 ARG 59.A N SER 55.A O ARG 59.A H 2.879 2.038 ARG 59.A NH1 GLU 63.A OE2 ARG 59.A HH11 3.280 2.434 LEU 60.A N THR 56.A O LEU 60.A H 3.099 2.242 SER 61.A N ARG 57.A O SER 61.A H 3.068 2.208 PHE 62.A N THR 58.A O PHE 62.A H 3.370 2.562 GLU 63.A N ARG 59.A O GLU 63.A H 2.856 2.037 SER 64.A N LEU 60.A O SER 64.A H 2.696 1.891 ALA 65.A N SER 61.A O ALA 65.A H 3.081 2.290 MET 66.A N PHE 62.A O MET 66.A H 3.080 2.261 LYS 67.A N GLU 63.A O LYS 67.A H 3.034 2.206 LYS 67.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 67.A HZ1 2.571 1.933 LYS 67.A NZ GLU 72.A OE2 LYS 67.A HZ1 3.401 2.610 ARG 68.A N SER 64.A O ARG 68.A H 2.827 1.986 LEU 69.A N ALA 65.A O LEU 69.A H 3.284 2.507 GLY 70.A N LYS 67.A O GLY 70.A H 2.937 2.101 GLY 71.A N MET 66.A O GLY 71.A H 2.830 2.118 GLU 72.A N TYR 45.A O GLU 72.A H 3.057 2.236 VAL 73.A N GLU 72.A OE1 VAL 73.A H 3.027 2.268 LEU 74.A N MET 47.A O LEU 74.A H 2.628 1.808 ALA 79.A N PHE 51.A O ALA 79.A H 3.019 2.236 ARG 80.A N ASN 78.A OD1 ARG 80.A H 3.392 2.573 GLU 86.A N GLU 86.A OE1 GLU 86.A H 2.532 1.706 ASP 87.A N THR 84.A OG1 ASP 87.A H 3.141 2.290 THR 88.A N THR 84.A O THR 88.A H 2.968 2.189 THR 88.A OG1 GLU 83.A OE2 THR 88.A HG1 2.874 2.232 ILE 89.A N LEU 85.A O ILE 89.A H 2.731 1.903 ARG 90.A N GLU 86.A O ARG 90.A H 3.114 2.256 ARG 90.A NH2 ASP 87.A OD1 ARG 90.A HH21 3.347 2.743 THR 91.A N ASP 87.A O THR 91.A H 3.360 2.516 THR 91.A OG1 ASP 87.A O THR 91.A HG1 2.949 2.135 VAL 92.A N THR 88.A O VAL 92.A H 3.007 2.157 GLU 93.A N ILE 89.A O GLU 93.A H 2.847 2.036 GLY 94.A N THR 91.A O GLY 94.A H 2.997 2.275 TYR 95.A N VAL 92.A O TYR 95.A H 2.639 1.848 SER 96.A OG VAL 92.A O SER 96.A HG 3.008 2.181 ASP 97.A N LEU 46.A O ASP 97.A H 2.875 2.018 ILE 99.A N PRO 119.A O ILE 99.A H 3.279 2.455 VAL 100.A N ALA 48.A O VAL 100.A H 2.988 2.190 MET 101.A N ILE 121.A O MET 101.A H 3.199 2.373 ARG 102.A N LEU 50.A O ARG 102.A H 3.005 2.221 ARG 102.A NH1 ALA 123.A O ARG 102.A HH11 2.522 1.958 HIS 103.A N GLY 124.A O HIS 103.A H 3.010 2.187 GLU 105.A N HIS 103.A ND1 GLU 105.A H 2.988 2.167 GLY 107.A N ASP 125.A OD2 GLY 107.A H 3.232 2.539 ALA 109.A N ASP 125.A OD1 ALA 109.A H 2.872 2.029 ALA 112.A N ALA 108.A O ALA 112.A H 2.877 2.078 ALA 113.A N ALA 109.A O ALA 113.A H 2.989 2.147 ALA 114.A N ARG 110.A O ALA 114.A H 3.262 2.442 THR 115.A N LYS 111.A O THR 115.A H 3.184 2.445 THR 115.A OG1 LYS 111.A O THR 115.A HG1 3.154 2.406 ALA 116.A N ALA 112.A O ALA 116.A H 3.127 2.304 ASN 117.A N GLU 93.A OE2 ASN 117.A H 3.012 2.188 VAL 120.A N ASP 7.A OD1 VAL 120.A H 2.993 2.334 ILE 121.A N ILE 99.A O ILE 121.A H 3.011 2.216 ASN 122.A N VAL 8.A O ASN 122.A H 2.981 2.127 ASN 122.A ND2 ILE 9.A O ASN 122.A HD22 2.857 2.242 ASN 122.A ND2 GLU 129.A O ASN 122.A HD21 3.085 2.400 ALA 123.A N MET 101.A O ALA 123.A H 2.820 1.974 GLY 124.A N ASN 122.A OD1 GLY 124.A H 2.561 1.739 ASP 125.A N GLU 129.A O ASP 125.A H 3.080 2.309 GLY 128.A N ASP 125.A O GLY 128.A H 3.129 2.317 GLN 133.A N HIS 130.A O GLN 133.A H 3.117 2.459 GLN 133.A NE2 ASP 137.A OD1 GLN 133.A HE21 3.085 2.408 ALA 134.A N HIS 130.A O ALA 134.A H 3.320 2.522 LEU 135.A N PRO 131.A O LEU 135.A H 2.878 2.152 LEU 136.A N THR 132.A O LEU 136.A H 3.113 2.279 ASP 137.A N GLN 133.A O ASP 137.A H 3.012 2.225 VAL 138.A N ALA 134.A O VAL 138.A H 3.273 2.423 TYR 139.A N LEU 135.A O TYR 139.A H 3.026 2.181 TYR 139.A OH GLU 30.A OE1 TYR 139.A HH 3.246 2.560 THR 140.A N LEU 136.A O THR 140.A H 3.018 2.223 THR 140.A OG1 LEU 136.A O THR 140.A HG1 2.798 2.044 ILE 141.A N ASP 137.A O ILE 141.A H 2.992 2.181 GLN 142.A N VAL 138.A O GLN 142.A H 2.895 2.046 SER 143.A N TYR 139.A O SER 143.A H 2.884 2.174 GLU 144.A N THR 140.A O GLU 144.A H 2.920 2.085 ILE 145.A N ILE 141.A O ILE 145.A H 2.935 2.096 GLY 146.A N GLN 142.A O GLY 146.A H 2.726 2.039 GLY 150.A N LYS 176.A O GLY 150.A H 2.728 1.949 SER 152.A N ASP 219.A OD2 SER 152.A H 3.369 2.557 VAL 153.A N LYS 179.A O VAL 153.A H 2.847 2.010 ALA 154.A N VAL 220.A O ALA 154.A H 2.981 2.146 LEU 155.A N TYR 181.A O LEU 155.A H 2.862 2.090 VAL 156.A N TYR 222.A O VAL 156.A H 2.976 2.124 GLY 157.A N VAL 183.A O GLY 157.A H 3.257 2.556 ALA 160.A N VAL 188.A O ALA 160.A H 3.146 2.517 ARG 163.A NH2 GLY 128.A O ARG 163.A HH21 3.203 2.353 ARG 166.A NH1 ASP 193.A OD1 ARG 166.A HH12 3.148 2.481 ARG 166.A NH1 ASP 193.A OD2 ARG 166.A HH12 3.412 2.807 ARG 166.A NH2 ASP 193.A OD2 ARG 166.A HH22 2.699 1.900 SER 167.A N ARG 163.A O SER 167.A H 2.940 2.145 SER 167.A OG ARG 163.A O SER 167.A HG 2.896 2.196 LEU 168.A N THR 164.A O LEU 168.A H 2.887 2.029 ALA 169.A N VAL 165.A O ALA 169.A H 2.854 2.009 TYR 170.A N ARG 166.A O TYR 170.A H 2.828 2.058 LEU 171.A N SER 167.A O LEU 171.A H 3.236 2.430 LEU 172.A N LEU 168.A O LEU 172.A H 2.901 2.088 ALA 173.A N ALA 169.A O ALA 173.A H 3.257 2.445 LYS 174.A N LEU 171.A O LYS 174.A H 3.223 2.421 PHE 175.A N LEU 172.A O PHE 175.A H 3.081 2.314 LYS 176.A N ASP 149.A OD1 LYS 176.A H 2.627 1.774 LYS 179.A N ILE 151.A O LYS 179.A H 3.028 2.205 LYS 179.A NZ TYR 181.A OH LYS 179.A HZ2 3.211 2.509 LYS 179.A NZ GLU 206.A OE2 LYS 179.A HZ3 3.063 2.198 ILE 180.A N GLU 204.A O ILE 180.A H 2.918 2.129 TYR 181.A N VAL 153.A O TYR 181.A H 2.905 2.125 PHE 182.A N GLU 206.A O PHE 182.A H 3.021 2.290 VAL 183.A N LEU 155.A O VAL 183.A H 3.012 2.380 SER 184.A N SER 208.A O SER 184.A H 3.124 2.350 SER 184.A OG PRO 185.A O SER 184.A HG 2.919 2.096 VAL 188.A N PRO 185.A O VAL 188.A H 3.122 2.321 LYS 189.A N GLU 186.A O LYS 189.A H 3.360 2.609 ILE 194.A N ASP 193.A OD1 ILE 194.A H 2.833 2.226 LYS 195.A NZ GLU 207.A OE2 LYS 195.A HZ2 2.301 1.619 ASP 196.A N ASP 192.A O ASP 196.A H 2.775 1.926 TYR 197.A N ASP 193.A O TYR 197.A H 2.933 2.141 TYR 197.A OH TYR 170.A O TYR 197.A HH 2.889 2.119 LEU 198.A N ILE 194.A O LEU 198.A H 2.761 1.945 THR 199.A N LYS 195.A O THR 199.A H 2.869 2.009 SER 200.A N ASP 196.A O SER 200.A H 2.846 1.985 SER 200.A OG ASP 196.A O SER 200.A HG 2.825 2.044 SER 201.A N LEU 198.A O SER 201.A H 2.958 2.304 SER 201.A OG TYR 197.A O SER 201.A HG 2.651 1.883 GLY 202.A N THR 199.A O GLY 202.A H 2.941 2.091 VAL 203.A N LEU 198.A O VAL 203.A H 2.873 2.036 GLU 204.A N VAL 178.A O GLU 204.A H 3.336 2.523 TRP 205.A NE1 THR 199.A OG1 TRP 205.A HE1 3.113 2.310 GLU 206.A N ILE 180.A O GLU 206.A H 3.070 2.342 SER 208.A N PHE 182.A O SER 208.A H 3.104 2.267 ASP 210.A N SER 208.A OG ASP 210.A H 2.781 1.922 MET 212.A N ASP 210.A OD1 MET 212.A H 3.161 2.490 GLU 213.A N ASP 210.A OD1 GLU 213.A H 3.360 2.545 VAL 214.A N ASP 210.A O VAL 214.A H 3.263 2.418 ALA 215.A N LEU 211.A O ALA 215.A H 2.971 2.193 LYS 217.A N VAL 214.A O LYS 217.A H 2.980 2.172 LYS 217.A NZ GLU 206.A OE1 LYS 217.A HZ1 3.342 2.674 CYS 218.A N ALA 215.A O CYS 218.A H 3.343 2.531 CYS 218.A SG VAL 214.A O CYS 218.A HG 3.294 2.464 ASP 219.A N SER 152.A O ASP 219.A H 2.801 2.073 VAL 220.A N SER 152.A O VAL 220.A H 3.190 2.458 VAL 221.A N ILE 260.A O VAL 221.A H 3.024 2.230 TYR 222.A N ALA 154.A O TYR 222.A H 2.792 1.938 GLN 223.A N MET 262.A O GLN 223.A H 2.833 2.011 GLN 223.A NE2 PHE 245.A O GLN 223.A HE22 2.793 2.032 GLN 223.A NE2 GLU 270.A O GLN 223.A HE21 3.170 2.389 THR 224.A N VAL 156.A O THR 224.A H 3.108 2.416 THR 224.A N GLN 223.A OE1 THR 224.A H 3.216 2.612 THR 224.A OG1 VAL 156.A O THR 224.A HG1 2.756 2.003 ARG 225.A NH2 ASP 269.A OD1 ARG 225.A HH22 3.271 2.531 ARG 225.A NH2 GLU 270.A OE1 ARG 225.A HH21 2.603 1.856 ARG 230.A N GLN 227.A O ARG 230.A H 2.935 2.099 PHE 231.A N ARG 228.A O PHE 231.A H 3.274 2.544 GLY 232.A N GLU 229.A O GLY 232.A H 3.065 2.245 ARG 234.A N PHE 231.A O ARG 234.A H 3.085 2.264 ARG 234.A NE ASP 236.A OD1 ARG 234.A HE 3.515 2.688 ARG 234.A NE ASP 236.A OD2 ARG 234.A HE 2.993 2.256 ARG 234.A NH2 ASP 236.A OD2 ARG 234.A HH21 2.759 1.960 LEU 235.A N GLU 233.A O LEU 235.A H 2.916 2.223 LEU 237.A N ARG 234.A O LEU 237.A H 3.089 2.502 TYR 238.A N ARG 234.A O TYR 238.A H 3.167 2.501 GLU 239.A N LEU 235.A O GLU 239.A H 2.978 2.178 ALA 240.A N ASP 236.A O ALA 240.A H 3.006 2.192 ALA 241.A N LEU 237.A O ALA 241.A H 3.295 2.599 ARG 242.A N TYR 238.A O ARG 242.A H 3.068 2.411 ARG 242.A N GLU 239.A O ARG 242.A H 3.283 2.612 ARG 242.A NH1 GLU 239.A OE1 ARG 242.A HH11 2.593 1.969 LYS 244.A N ALA 241.A O LYS 244.A H 3.096 2.251 VAL 247.A N GLU 270.A O VAL 247.A H 3.071 2.216 LEU 251.A N ASP 248.A OD1 LEU 251.A H 2.945 2.166 LEU 252.A N ASP 248.A O LEU 252.A H 2.974 2.142 GLY 253.A N ASP 250.A O GLY 253.A H 3.145 2.407 VAL 254.A N LEU 251.A O VAL 254.A H 3.091 2.232 GLN 256.A NE2 SER 216.A O GLN 256.A HE21 2.522 1.863 ILE 260.A N ASP 219.A O ILE 260.A H 3.151 2.478 ILE 261.A N ARG 280.A O ILE 261.A H 2.990 2.164 MET 262.A N VAL 221.A O MET 262.A H 2.951 2.105 HIS 263.A N GLN 286.A OE1 HIS 263.A H 3.197 2.371 HIS 263.A NE2 GLU 270.A OE2 HIS 263.A HE2 2.965 2.146 LEU 265.A N HIS 263.A ND1 LEU 265.A H 2.855 2.028 ARG 267.A NH1 ASP 276.A OD1 ARG 267.A HH12 2.969 2.275 ARG 267.A NH2 ASP 276.A OD1 ARG 267.A HH22 3.255 2.637 ARG 267.A NH2 ASP 276.A OD2 ARG 267.A HH22 2.912 2.062 LEU 268.A N GLU 270.A OE1 LEU 268.A H 3.323 2.587 LEU 268.A N GLU 270.A OE2 LEU 268.A H 3.115 2.319 GLU 270.A N GLU 270.A OE1 GLU 270.A H 2.947 2.190 THR 272.A N VAL 247.A O THR 272.A H 3.138 2.318 THR 272.A OG1 ASP 274.A OD1 THR 272.A HG1 3.003 2.347 VAL 275.A N THR 272.A O VAL 275.A H 2.981 2.139 ASP 276.A N ALA 273.A O ASP 276.A H 3.412 2.571 ARG 280.A N ASP 278.A OD1 ARG 280.A H 2.944 2.092 ARG 280.A NE ASP 278.A OD1 ARG 280.A HE 2.854 1.997 ARG 280.A NH1 LEU 252.A O ARG 280.A HH12 3.343 2.823 ARG 280.A NH1 GLN 256.A O ARG 280.A HH11 2.937 2.150 ARG 280.A NH2 LEU 252.A O ARG 280.A HH22 3.135 2.573 ARG 280.A NH2 ASP 278.A OD2 ARG 280.A HH21 3.063 2.211 ALA 281.A N ASP 278.A O ALA 281.A H 3.050 2.207 ALA 282.A N ILE 261.A O ALA 282.A H 2.923 2.097 TYR 283.A OH ASP 276.A OD1 TYR 283.A HH 2.316 1.566 ARG 285.A NE GLU 144.A OE2 ARG 285.A HE 2.907 2.048 ARG 285.A NH1 PRO 279.A O ARG 285.A HH12 2.923 2.228 ARG 285.A NH2 GLU 144.A OE1 ARG 285.A HH21 2.874 2.120 ARG 285.A NH2 PRO 279.A O ARG 285.A HH22 2.759 2.009 GLN 286.A N ALA 282.A O GLN 286.A H 2.601 1.797 GLN 286.A NE2 ASP 137.A OD1 GLN 286.A HE21 2.591 1.795 ALA 287.A N TYR 283.A O ALA 287.A H 3.223 2.503 ALA 287.A N PHE 284.A O ALA 287.A H 3.140 2.538 LYS 288.A N PHE 284.A O LYS 288.A H 3.162 2.321 LYS 288.A NZ GLU 33.A OE1 LYS 288.A HZ1 3.553 2.897 ASN 289.A N ARG 285.A O ASN 289.A H 2.951 2.199 ASN 289.A ND2 THR 140.A OG1 ASN 289.A HD22 2.697 1.850 GLY 290.A N ALA 287.A O GLY 290.A H 2.921 2.207 LEU 291.A N LYS 288.A O LEU 291.A H 2.955 2.323 ILE 293.A N ASN 289.A O ILE 293.A H 2.977 2.148 ARG 294.A N GLY 290.A O ARG 294.A H 2.841 2.023 ARG 294.A NE THR 132.A OG1 ARG 294.A HE 3.355 2.682 ARG 294.A NH1 SER 61.A OG ARG 294.A HH11 2.651 1.795 ARG 294.A NH2 THR 132.A OG1 ARG 294.A HH21 2.905 2.126 MET 295.A N LEU 291.A O MET 295.A H 2.783 1.929 ALA 296.A N PHE 292.A O ALA 296.A H 3.014 2.211 LEU 297.A N ILE 293.A O LEU 297.A H 3.017 2.270 LEU 298.A N ARG 294.A O LEU 298.A H 3.041 2.203 LYS 299.A N MET 295.A O LYS 299.A H 2.836 1.977 LYS 299.A NZ GLY 304.A O LYS 299.A HZ1 2.446 1.641 LEU 300.A N ALA 296.A O LEU 300.A H 2.851 2.038 LEU 301.A N LEU 297.A O LEU 301.A H 2.844 1.991 LEU 302.A N LEU 298.A O LEU 302.A H 3.208 2.539 LEU 302.A N LYS 299.A O LEU 302.A H 3.342 2.594 VAL 303.A N LYS 299.A O VAL 303.A H 3.016 2.169 GLY 304.A N LEU 300.A O GLY 304.A H 2.820 2.206 TRP 305.A N HIS 1.A O TRP 305.A H 3.064 2.409 TRP 305.A NE1 GLU 4.A OE1 TRP 305.A HE1 2.694 1.920