Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yzd_AAA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 2.A N ASP 40.A OD1 GLU 2.A H 3.095 2.211 ARG 4.A N THR 41.A O ARG 4.A H 2.821 1.918 ARG 4.A NH2 GLU 35.A O ARG 4.A HH22 2.620 2.030 ILE 6.A N HIS 43.A O ILE 6.A H 3.033 2.182 LEU 8.A N GLU 45.A O LEU 8.A H 2.983 2.114 TYR 9.A N GLY 21.A O TYR 9.A H 2.824 1.990 ALA 10.A N GLU 47.A O ALA 10.A H 3.012 2.175 GLU 11.A N GLY 19.A O GLU 11.A H 2.897 2.036 ARG 12.A NE ASP 51.A OD1 ARG 12.A HE 2.662 1.819 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD1 ARG 12.A HH21 3.494 2.898 ARG 12.A NH2 ASP 51.A OD2 ARG 12.A HH21 2.967 2.156 LEU 13.A N GLN 17.A O LEU 13.A H 2.856 1.949 GLN 17.A N ALA 14.A O GLN 17.A H 3.357 2.557 MET 18.A N LYS 126.A O MET 18.A H 2.908 2.045 GLY 19.A N GLU 11.A O GLY 19.A H 2.881 2.026 GLY 21.A N TYR 9.A O GLY 21.A H 2.881 2.062 LYS 24.A NZ GLU 47.A OE2 LYS 24.A HZ2 3.211 2.529 GLY 25.A N GLU 11.A OE1 GLY 25.A H 3.260 2.455 GLY 25.A N GLU 11.A OE2 GLY 25.A H 2.862 2.020 ARG 26.A N GLU 23.A O ARG 26.A H 2.935 2.123 THR 28.A N TYR 20.A O THR 28.A H 3.116 2.255 GLY 31.A N TYR 129.A O GLY 31.A H 2.748 1.837 ILE 34.A N PRO 131.A O ILE 34.A H 3.133 2.236 LEU 36.A N ILE 133.A O LEU 36.A H 2.914 2.046 ASN 37.A N ASP 40.A OD2 ASN 37.A H 2.820 1.930 GLU 38.A N ARG 135.A O GLU 38.A H 2.821 1.943 GLY 39.A N THR 89.A OG1 GLY 39.A H 2.798 2.140 ASP 40.A N ASN 37.A O ASP 40.A H 2.917 2.022 THR 41.A N GLU 2.A O THR 41.A H 3.060 2.252 LEU 42.A N TRP 87.A O LEU 42.A H 2.700 1.803 HIS 43.A N ARG 4.A O HIS 43.A H 2.891 2.001 HIS 43.A ND1 THR 86.A OG1 HIS 43.A HD1 2.819 2.049 ILE 44.A N TYR 85.A O ILE 44.A H 2.726 1.831 GLU 45.A N ILE 6.A O GLU 45.A H 2.828 1.952 PHE 46.A N ARG 83.A O PHE 46.A H 2.882 2.003 GLU 47.A N LEU 8.A O GLU 47.A H 2.917 2.075 ASN 48.A N GLY 81.A O ASN 48.A H 2.857 2.004 ASN 48.A ND2 VAL 52.A O ASN 48.A HD21 2.869 1.995 ASN 48.A ND2 VAL 77.A O ASN 48.A HD22 3.154 2.373 ASN 48.A ND2 GLU 78.A O ASN 48.A HD22 3.326 2.676 THR 49.A N ALA 10.A O THR 49.A H 2.962 2.108 MET 50.A N ASN 48.A OD1 MET 50.A H 3.010 2.127 ARG 53.A NE ASP 76.A OD2 ARG 53.A HE 2.827 1.970 ARG 53.A NH2 ASP 76.A OD1 ARG 53.A HH21 2.970 2.094 ALA 54.A N VAL 77.A O ALA 54.A H 3.109 2.273 SER 55.A N ASP 112.A OD1 SER 55.A H 2.859 2.086 SER 55.A OG GLY 69.A O SER 55.A HG 2.664 1.876 LEU 56.A N TYR 85.A OH LEU 56.A H 3.454 2.595 HIS 57.A N HIS 111.A O HIS 57.A H 2.886 2.057 HIS 57.A ND1 ASP 68.A O HIS 57.A HD1 2.810 2.019 HIS 59.A N HIS 109.A O HIS 59.A H 2.952 2.043 ASP 62.A N ARG 88.A O ASP 62.A H 2.819 2.005 SER 67.A N GLU 64.A O SER 67.A H 2.777 1.907 ASP 68.A N VAL 65.A O ASP 68.A H 2.993 2.104 GLY 69.A N SER 75.A OG GLY 69.A H 3.024 2.324 THR 70.A N SER 75.A OG THR 70.A H 3.414 2.580 ASN 73.A N THR 70.A OG1 ASN 73.A H 3.119 2.258 ASN 73.A ND2 ASP 68.A OD2 ASN 73.A HD22 2.922 2.055 LYS 74.A N THR 71.A O LYS 74.A H 3.020 2.153 SER 75.A N THR 70.A O SER 75.A H 2.957 2.066 SER 75.A OG VAL 65.A O SER 75.A HG 3.198 2.436 VAL 77.A N ALA 54.A O VAL 77.A H 2.847 2.112 GLY 80.A N ASN 48.A O GLY 80.A H 2.795 2.155 GLY 81.A N GLU 78.A O GLY 81.A H 2.905 2.032 ARG 83.A N PHE 46.A O ARG 83.A H 2.845 1.989 ARG 83.A NE SER 66.A O ARG 83.A HE 3.437 2.758 ARG 83.A NH2 SER 66.A O ARG 83.A HH21 2.910 2.092 TYR 85.A N ILE 44.A O TYR 85.A H 2.910 2.127 TYR 85.A OH SER 75.A O TYR 85.A HH 2.699 1.994 TRP 87.A N LEU 42.A O TRP 87.A H 2.831 1.948 ARG 88.A N ASP 62.A O ARG 88.A H 2.763 1.861 THR 89.A OG1 ASN 37.A O THR 89.A HG1 3.311 2.599 HIS 90.A ND1 ASP 62.A OD2 HIS 90.A HD1 2.666 1.812 HIS 90.A NE2 ALA 102.A O HIS 90.A HE2 2.656 1.825 GLY 93.A N ARG 101.A O GLY 93.A H 3.221 2.417 ARG 94.A NH1 GLY 98.A O ARG 94.A HH11 2.895 2.103 ARG 95.A N THR 99.A O ARG 95.A H 2.883 1.982 ARG 95.A NH1 THR 99.A OG1 ARG 95.A HH11 2.912 2.097 GLY 98.A N ARG 95.A O GLY 98.A H 2.998 2.130 THR 99.A N ASP 97.A OD1 THR 99.A H 2.950 2.065 ARG 101.A N GLY 93.A O ARG 101.A H 2.813 1.937 SER 104.A N HIS 90.A O SER 104.A H 2.977 2.093 ALA 105.A N GLU 38.A OE2 ALA 105.A H 2.811 1.939 GLY 106.A N VAL 134.A O GLY 106.A H 2.862 2.054 TYR 107.A OH GLU 175.A OE2 TYR 107.A HH 2.610 1.970 TRP 108.A N VAL 132.A O TRP 108.A H 2.762 1.902 TRP 108.A NE1 SER 104.A O TRP 108.A HE1 2.826 2.031 HIS 109.A NE2 ALA 221.A O HIS 109.A HE2 2.817 2.074 TYR 110.A N GLY 130.A O TYR 110.A H 2.886 2.012 HIS 111.A N HIS 57.A O HIS 111.A H 2.835 1.999 HIS 111.A ND1 ASP 112.A O HIS 111.A HD1 2.747 1.893 ASP 112.A N LEU 128.A O ASP 112.A H 3.115 2.290 HIS 113.A N SER 55.A OG HIS 113.A H 2.954 2.117 HIS 113.A ND1 HIS 113.A O HIS 113.A HD1 2.801 2.150 HIS 113.A ND1 GLU 118.A O HIS 113.A HD1 2.902 2.193 VAL 114.A N ASP 112.A OD1 VAL 114.A H 3.205 2.307 VAL 114.A N ASP 112.A OD2 VAL 114.A H 3.197 2.500 VAL 115.A N ASP 112.A OD2 VAL 115.A H 2.696 1.801 HIS 119.A N THR 117.A OG1 HIS 119.A H 3.072 2.193 GLY 120.A N THR 117.A O GLY 120.A H 2.945 2.051 THR 121.A N THR 117.A OG1 THR 121.A H 3.364 2.457 GLY 123.A N VAL 115.A O GLY 123.A H 3.134 2.308 ILE 124.A N GLY 120.A O ILE 124.A H 2.824 1.916 ARG 125.A N THR 121.A O ARG 125.A H 3.027 2.143 LYS 126.A N GLY 122.A O LYS 126.A H 2.952 2.144 GLY 127.A N GLY 123.A O GLY 127.A H 3.081 2.441 GLY 127.A N ILE 124.A O GLY 127.A H 3.158 2.376 LEU 128.A N GLY 123.A O LEU 128.A H 2.888 1.982 TYR 129.A N GLY 127.A O TYR 129.A H 2.891 2.151 GLY 130.A N TYR 110.A O GLY 130.A H 2.884 2.063 VAL 132.A N TRP 108.A O VAL 132.A H 3.062 2.154 ILE 133.A N ILE 34.A O ILE 133.A H 2.910 2.060 VAL 134.A N GLY 106.A O VAL 134.A H 3.016 2.110 ARG 135.A N LEU 36.A O ARG 135.A H 2.817 1.942 ARG 135.A NE GLU 35.A OE2 ARG 135.A HE 2.843 1.986 ARG 135.A NH1 GLU 175.A OE2 ARG 135.A HH12 2.846 1.970 ARG 135.A NH2 GLU 35.A OE1 ARG 135.A HH21 3.403 2.574 ARG 135.A NH2 GLU 175.A OE1 ARG 135.A HH22 2.877 1.998 ARG 136.A N ASP 139.A OD2 ARG 136.A H 2.941 2.037 ARG 136.A NE GLU 38.A OE1 ARG 136.A HE 2.959 2.112 ARG 136.A NE GLU 38.A OE2 ARG 136.A HE 3.401 2.701 ARG 136.A NH2 GLU 38.A OE2 ARG 136.A HH21 2.828 1.995 ASP 139.A N ARG 136.A O ASP 139.A H 2.884 1.997 ASP 143.A N ARG 173.A O ASP 143.A H 2.703 1.875 HIS 146.A N GLU 175.A O HIS 146.A H 2.841 1.991 ILE 148.A N VAL 177.A O ILE 148.A H 2.863 1.965 VAL 149.A N ASN 156.A OD1 VAL 149.A H 2.764 1.928 PHE 150.A N ILE 179.A O PHE 150.A H 2.895 2.095 ASN 151.A N LEU 154.A O ASN 151.A H 2.895 2.052 ASN 151.A ND2 ILE 124.A O ASN 151.A HD21 3.047 2.389 ASN 151.A ND2 ARG 125.A O ASN 151.A HD21 3.321 2.758 ASN 151.A ND2 ASN 157.A OD1 ASN 151.A HD22 2.918 2.046 ASP 152.A N HIS 181.A O ASP 152.A H 2.948 2.050 LEU 154.A N ASN 151.A O LEU 154.A H 2.946 2.064 ASN 156.A N VAL 149.A O ASN 156.A H 2.852 2.014 ASN 156.A ND2 THR 147.A O ASN 156.A HD21 3.069 2.189 ASN 157.A ND2 ARG 125.A O ASN 157.A HD21 2.979 2.162 ARG 158.A N ILE 155.A O ARG 158.A H 2.919 2.017 ARG 158.A NH1 SER 162.A O ARG 158.A HH11 2.723 2.123 HIS 161.A N GLY 252.A O HIS 161.A H 3.147 2.294 PHE 166.A N LEU 256.A O PHE 166.A H 2.900 2.050 ALA 168.A N LEU 258.A O ALA 168.A H 2.934 2.081 THR 169.A N ASP 172.A OD2 THR 169.A H 2.825 1.919 VAL 170.A N LYS 260.A O VAL 170.A H 2.837 1.942 GLY 171.A N ALA 230.A O GLY 171.A H 2.879 1.979 ASP 172.A N THR 169.A O ASP 172.A H 2.853 1.962 ARG 173.A N ASP 143.A OD2 ARG 173.A H 2.781 1.882 ARG 173.A NH1 GLN 227.A OE1 ARG 173.A HH11 3.010 2.199 VAL 174.A N VAL 228.A O VAL 174.A H 2.888 1.992 GLU 175.A N ALA 144.A O GLU 175.A H 2.926 2.018 PHE 176.A N PHE 226.A O PHE 176.A H 2.820 1.955 VAL 177.A N HIS 146.A O VAL 177.A H 2.946 2.067 MET 178.A N PHE 224.A O MET 178.A H 2.826 1.926 ILE 179.A N ILE 148.A O ILE 179.A H 2.994 2.120 THR 180.A N ASP 222.A O THR 180.A H 3.054 2.238 HIS 181.A N PHE 150.A O HIS 181.A H 2.834 1.990 GLU 183.A N ASP 152.A OD1 GLU 183.A H 2.944 2.213 HIS 186.A N VAL 218.A O HIS 186.A H 2.877 1.996 PHE 188.A N LYS 216.A O PHE 188.A H 2.884 2.039 HIS 189.A N HIS 242.A O HIS 189.A H 2.979 2.144 HIS 189.A ND1 ASP 214.A O HIS 189.A HD1 2.777 1.940 MET 190.A N ASP 214.A O MET 190.A H 3.318 2.499 HIS 191.A N MET 240.A O HIS 191.A H 2.816 1.916 HIS 193.A ND1 HIS 191.A O HIS 193.A HD1 3.000 2.131 TRP 195.A N VAL 213.A O TRP 195.A H 2.957 2.095 ALA 196.A N GLY 201.A O ALA 196.A H 2.848 1.938 ASP 197.A N GLN 211.A O ASP 197.A H 2.896 2.002 ASN 198.A N ALA 196.A O ASN 198.A H 2.953 2.291 ASN 198.A ND2 MET 202.A O ASN 198.A HD21 2.977 2.114 ASN 198.A ND2 ASP 208.A OD2 ASN 198.A HD22 2.909 2.309 ARG 199.A NH1 ASP 139.A OD2 ARG 199.A HH12 2.937 2.061 ARG 199.A NH2 ASP 139.A OD1 ARG 199.A HH22 2.907 2.028 GLY 201.A N ASN 198.A OD1 GLY 201.A H 2.787 2.119 MET 202.A N THR 200.A OG1 MET 202.A H 3.116 2.264 THR 204.A N ASP 208.A OD2 THR 204.A H 3.117 2.300 ASP 207.A N ASP 207.A OD1 ASP 207.A H 2.772 2.059 ASP 208.A N GLY 205.A O ASP 208.A H 3.149 2.265 SER 210.A N ASP 208.A OD1 SER 210.A H 3.050 2.153 VAL 213.A N TRP 195.A O VAL 213.A H 2.833 1.949 LYS 216.A N PHE 188.A O LYS 216.A H 2.959 2.226 LYS 216.A NZ ASP 197.A OD1 LYS 216.A HZ3 2.905 2.066 VAL 218.A N HIS 186.A O VAL 218.A H 2.875 1.994 GLY 219.A N ASP 222.A OD2 GLY 219.A H 2.915 2.022 ALA 221.A N THR 180.A O ALA 221.A H 2.737 1.881 ASP 222.A N GLY 219.A O ASP 222.A H 2.990 2.097 PHE 224.A N MET 178.A O PHE 224.A H 3.032 2.178 PHE 226.A N PHE 176.A O PHE 226.A H 3.033 2.232 GLN 227.A NE2 VAL 140.A O GLN 227.A HE21 2.915 2.095 GLN 227.A NE2 GLU 175.A OE2 GLN 227.A HE22 3.272 2.395 VAL 228.A N VAL 174.A O VAL 228.A H 2.860 1.997 ALA 230.A N ASP 172.A O ALA 230.A H 2.841 1.949 GLU 232.A N ILE 229.A O GLU 232.A H 2.959 2.095 VAL 234.A N GLY 231.A O VAL 234.A H 2.942 2.041 GLY 235.A N GLY 231.A O GLY 235.A H 2.764 1.916 GLY 237.A N VAL 259.A O GLY 237.A H 2.818 1.956 TRP 239.A N PHE 257.A O TRP 239.A H 2.914 2.014 TRP 239.A NE1 GLY 235.A O TRP 239.A HE1 3.036 2.241 TYR 241.A N GLY 255.A O TYR 241.A H 2.927 2.066 HIS 242.A N HIS 189.A O HIS 242.A H 2.891 2.061 HIS 242.A ND1 CYS 243.A O HIS 242.A HD1 2.824 1.989 CYS 243.A N ALA 253.A O CYS 243.A H 3.114 2.321 HIS 244.A N THR 187.A O HIS 244.A H 2.775 1.985 HIS 244.A ND1 HIS 244.A O HIS 244.A HD1 2.763 2.060 HIS 248.A N VAL 245.A O HIS 248.A H 2.895 2.198 SER 249.A N VAL 245.A O SER 249.A H 3.125 2.269 ASP 250.A N GLN 246.A O ASP 250.A H 2.971 2.110 MET 251.A N SER 247.A O MET 251.A H 2.950 2.217 MET 251.A N HIS 248.A O MET 251.A H 3.244 2.580 GLY 252.A N HIS 248.A O GLY 252.A H 3.234 2.613 GLY 252.A N SER 249.A O GLY 252.A H 3.013 2.216 ALA 253.A N HIS 248.A O ALA 253.A H 3.061 2.181 GLY 255.A N TYR 241.A O GLY 255.A H 2.986 2.096 LEU 256.A N ASN 165.A OD1 LEU 256.A H 2.959 2.161 PHE 257.A N TRP 239.A O PHE 257.A H 2.762 1.864 LEU 258.A N PHE 166.A O LEU 258.A H 2.676 1.809 VAL 259.A N GLY 237.A O VAL 259.A H 2.897 1.991 LYS 260.A N ALA 168.A O LYS 260.A H 2.793 1.896 LYS 261.A N THR 265.A O LYS 261.A H 2.872 1.978 GLY 264.A N LYS 261.A O GLY 264.A H 2.833 1.964 THR 265.A N ASP 263.A OD1 THR 265.A H 2.956 2.050 GLY 268.A N GLU 270.A OE1 GLY 268.A H 2.909 2.140 TYR 269.A N ILE 266.A O TYR 269.A H 3.184 2.382 GLU 270.A N GLU 270.A OE1 GLU 270.A H 3.039 2.252