Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6z1p_AP.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 8.A N SER 5.A OG GLN 8.A H 3.300 2.475 LYS 9.A N SER 5.A O LYS 9.A H 3.026 2.377 LYS 9.A N ALA 6.A O LYS 9.A H 3.212 2.545 LEU 10.A N ALA 6.A O LEU 10.A H 3.120 2.307 ARG 11.A N SER 7.A O ARG 11.A H 3.214 2.381 GLN 12.A N LYS 9.A O GLN 12.A H 3.178 2.465 LYS 13.A N LYS 9.A O LYS 13.A H 2.957 2.200 ILE 14.A N LEU 10.A O ILE 14.A H 3.073 2.226 TYR 16.A N LYS 13.A O TYR 16.A H 2.883 2.115 ARG 17.A N LYS 13.A O ARG 17.A H 2.609 1.762 SER 18.A N ILE 14.A O SER 18.A H 3.018 2.233 LYS 23.A N ARG 20.A O LYS 23.A H 3.458 2.607 LYS 25.A N VAL 53.A O LYS 25.A H 2.956 2.167 VAL 27.A N SER 51.A O VAL 27.A H 3.048 2.354 LYS 49.A N LYS 29.A O LYS 49.A H 3.260 2.579 SER 51.A N VAL 27.A O SER 51.A H 3.210 2.482 VAL 53.A N LYS 25.A O VAL 53.A H 2.836 1.989 GLN 55.A N LYS 23.A O GLN 55.A H 3.137 2.481 ALA 57.A N ASP 22.A O ALA 57.A H 3.272 2.586 MET 74.A N PHE 71.A O MET 74.A H 2.792 2.048 GLU 78.A N THR 75.A OG1 GLU 78.A H 3.269 2.461 ILE 79.A N GLY 76.A O ILE 79.A H 3.204 2.481 LEU 80.A N ASN 77.A O LEU 80.A H 3.062 2.428 LEU 83.A N ILE 79.A O LEU 83.A H 3.060 2.382 LEU 83.A N LEU 80.A O LEU 83.A H 3.179 2.539 GLU 84.A N LEU 81.A O GLU 84.A H 3.130 2.370 LEU 89.A N ASN 85.A O LEU 89.A H 3.364 2.579 ARG 90.A N GLU 93.A OE1 ARG 90.A H 3.249 2.417 GLU 93.A N ARG 90.A O GLU 93.A H 2.854 2.054 ILE 94.A N ARG 90.A O ILE 94.A H 3.271 2.521 CYS 95.A N PRO 91.A O CYS 95.A H 3.410 2.589 ALA 97.A N ILE 94.A O ALA 97.A H 2.938 2.174 LEU 98.A N ILE 94.A O LEU 98.A H 3.023 2.212 ILE 99.A N CYS 95.A O ILE 99.A H 3.341 2.499 LEU 101.A N LEU 98.A O LEU 101.A H 3.237 2.614 LYS 103.A N GLU 100.A O LYS 103.A H 2.762 2.108 ARG 104.A N LEU 101.A O ARG 104.A H 3.026 2.217 ARG 104.A NE MET 74.A O ARG 104.A HE 2.824 2.129 ARG 104.A NH2 LYS 72.A O ARG 104.A HH22 3.146 2.349 ARG 104.A NH2 MET 74.A O ARG 104.A HH21 2.511 1.723 ASN 113.A ND2 ARG 148.A O ASN 113.A HD22 3.250 2.593 GLU 114.A N ASN 111.A O GLU 114.A H 3.288 2.438 VAL 118.A N HIS 115.A ND1 VAL 118.A H 3.472 2.622 ALA 119.A N HIS 115.A O ALA 119.A H 3.134 2.370 ALA 119.A N GLU 116.A O ALA 119.A H 3.039 2.440 ALA 120.A N GLU 116.A O ALA 120.A H 3.112 2.287 THR 121.A N TRP 117.A O THR 121.A H 2.719 1.948 THR 122.A N VAL 118.A O THR 122.A H 3.282 2.495 GLU 123.A N ALA 119.A O GLU 123.A H 3.279 2.458 HIS 124.A N ALA 120.A O HIS 124.A H 3.013 2.305 VAL 125.A N THR 121.A O VAL 125.A H 3.131 2.371 THR 126.A N THR 122.A O THR 126.A H 2.797 1.977 MET 128.A N HIS 124.A O MET 128.A H 3.275 2.438 TYR 132.A N MET 129.A O TYR 132.A H 2.885 2.032 VAL 136.A N THR 133.A O VAL 136.A H 3.100 2.483 CYS 138.A N SER 135.A O CYS 138.A H 3.150 2.559 TYR 139.A N VAL 136.A O TYR 139.A H 2.933 2.246 LEU 140.A N VAL 136.A O LEU 140.A H 3.149 2.506 LEU 140.A N VAL 137.A O LEU 140.A H 3.192 2.481 MET 141.A N VAL 137.A O MET 141.A H 3.138 2.285 PHE 144.A N LEU 140.A O PHE 144.A H 2.753 1.951 GLN 145.A N MET 141.A O GLN 145.A H 2.634 1.812 GLN 145.A NE2 GLU 183.A OE1 GLN 145.A HE21 3.205 2.618 ARG 146.A N VAL 142.A O ARG 146.A H 2.625 1.787 LEU 147.A N ALA 143.A O LEU 147.A H 3.134 2.530 ARG 148.A N GLN 145.A O ARG 148.A H 3.224 2.390 THR 150.A N ASN 113.A OD1 THR 150.A H 3.371 2.588 LEU 154.A N HIS 151.A ND1 LEU 154.A H 3.237 2.583 LEU 154.A N HIS 151.A O LEU 154.A H 2.931 2.308 TRP 155.A N HIS 151.A O TRP 155.A H 3.214 2.429 LYS 156.A N GLU 152.A O LYS 156.A H 3.218 2.607 ASN 157.A N LYS 153.A O ASN 157.A H 3.352 2.503 LEU 158.A N LEU 154.A O LEU 158.A H 3.082 2.275 PHE 160.A N LYS 156.A O PHE 160.A H 3.042 2.199 ALA 161.A N ASN 157.A O ALA 161.A H 3.027 2.348 ILE 162.A N THR 159.A O ILE 162.A H 3.002 2.194 GLU 163.A N THR 159.A O GLU 163.A H 2.956 2.138 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.052 2.209 SER 173.A N ASN 170.A O SER 173.A H 3.031 2.418 PHE 174.A N ASN 170.A O PHE 174.A H 2.780 2.157 PHE 174.A N ALA 171.A O PHE 174.A H 3.043 2.366 ALA 175.A N ALA 171.A O ALA 175.A H 3.119 2.436 TYR 178.A N PHE 174.A O TYR 178.A H 3.138 2.377 ILE 179.A N ALA 175.A O ILE 179.A H 2.953 2.230 ALA 180.A N TYR 176.A O ALA 180.A H 3.384 2.596 TYR 181.A N THR 177.A O TYR 181.A H 3.017 2.191 LEU 182.A N ILE 179.A O LEU 182.A H 3.256 2.580 GLU 183.A N ILE 179.A O GLU 183.A H 2.669 1.889 SER 186.A N ASP 184.A OD1 SER 186.A H 3.156 2.378 ARG 187.A NH1 ALA 180.A O ARG 187.A HH11 2.652 2.078 ARG 193.A NE TYR 181.A O ARG 193.A HE 2.554 1.722 ARG 193.A NH1 SER 188.A O ARG 193.A HH12 3.278 2.554 ARG 193.A NH2 TYR 181.A O ARG 193.A HH21 3.026 2.378 ARG 193.A NH2 ASP 184.A O ARG 193.A HH21 2.834 2.184 LYS 194.A N GLU 190.A O LYS 194.A H 2.822 2.027 LYS 195.A N GLU 191.A O LYS 195.A H 3.202 2.454 LEU 196.A N PHE 192.A O LEU 196.A H 3.306 2.522 VAL 197.A N ARG 193.A O VAL 197.A H 3.153 2.337 GLU 198.A N LYS 194.A O GLU 198.A H 3.123 2.321 LEU 199.A N LEU 196.A O LEU 199.A H 2.940 2.142 LEU 200.A N VAL 197.A O LEU 200.A H 3.384 2.556 HIS 203.A N LEU 200.A O HIS 203.A H 2.843 2.079 MET 207.A N LEU 204.A O MET 207.A H 3.054 2.200 LEU 212.A N PRO 209.A O LEU 212.A H 3.109 2.346 THR 213.A OG1 ASN 249.A OD1 THR 213.A HG1 2.966 2.225 GLU 217.A N THR 213.A O GLU 217.A H 3.117 2.390 GLU 221.A N GLU 217.A O GLU 221.A H 3.216 2.394 ARG 222.A N THR 219.A O ARG 222.A H 3.176 2.558 GLY 223.A N THR 219.A O GLY 223.A H 2.767 1.995 GLU 227.A N GLU 227.A OE1 GLU 227.A H 2.788 2.047 PHE 230.A N ASN 226.A O PHE 230.A H 3.363 2.563 GLU 231.A N GLU 227.A O GLU 231.A H 2.932 2.079 GLN 232.A N TYR 228.A O GLN 232.A H 3.122 2.301 HIS 233.A N LEU 229.A O HIS 233.A H 3.156 2.406 PHE 234.A N LEU 229.A O PHE 234.A H 2.994 2.157 HIS 235.A N PHE 230.A O HIS 235.A H 2.793 1.950 LEU 237.A N PHE 234.A O LEU 237.A H 2.826 2.153 TYR 238.A N PHE 234.A O TYR 238.A H 3.358 2.560 TRP 239.A N HIS 235.A O TRP 239.A H 2.964 2.242 ARG 240.A N VAL 236.A O ARG 240.A H 2.805 1.987 ARG 241.A N LEU 237.A O ARG 241.A H 2.417 1.770 ARG 241.A NH2 HIS 205.A O ARG 241.A HH22 3.308 2.596 VAL 243.A N ASN 242.A OD1 VAL 243.A H 2.418 1.751 GLY 246.A N VAL 243.A O GLY 246.A H 2.812 2.143 VAL 247.A N GLN 283.A OE1 VAL 247.A H 2.977 2.248 ASN 249.A ND2 ASN 210.A OD1 ASN 249.A HD22 2.518 1.718 ASN 249.A ND2 PHE 245.A O ASN 249.A HD21 3.145 2.303 ILE 250.A N VAL 247.A O ILE 250.A H 3.278 2.487 ILE 251.A N VAL 247.A O ILE 251.A H 3.414 2.587 VAL 253.A N ILE 250.A O VAL 253.A H 3.010 2.343 LEU 254.A N ILE 250.A O LEU 254.A H 3.204 2.448 LEU 254.A N ILE 251.A O LEU 254.A H 3.217 2.588 ILE 256.A N VAL 253.A O ILE 256.A H 2.992 2.150 TYR 257.A N VAL 253.A O TYR 257.A H 3.126 2.292 LEU 260.A N ILE 256.A O LEU 260.A H 2.892 2.047 ASP 267.A N ASP 264.A OD1 ASP 267.A H 3.394 2.595 ALA 272.A N PHE 268.A O ALA 272.A H 2.922 2.184 ILE 273.A N PHE 268.A O ILE 273.A H 2.885 2.127 LEU 274.A N PHE 269.A O LEU 274.A H 2.896 2.055 ALA 275.A N GLU 270.A O ALA 275.A H 2.679 1.905 ASN 276.A N ILE 273.A O ASN 276.A H 2.832 2.044 ASN 276.A ND2 ALA 272.A O ASN 276.A HD21 2.787 1.972 LYS 279.A NZ ASN 276.A OD1 LYS 279.A HZ2 3.101 2.294 VAL 280.A N ILE 277.A O VAL 280.A H 2.495 1.698 LEU 284.A N LYS 281.A O LEU 284.A H 3.022 2.188 ASN 288.A ND2 GLN 283.A O ASN 288.A HD21 3.317 2.749 THR 289.A N ASN 285.A O THR 289.A H 3.437 2.627 ALA 291.A N GLN 287.A O ALA 291.A H 3.285 2.456 LEU 292.A N ASN 288.A O LEU 292.A H 2.966 2.146 ILE 293.A N THR 289.A O ILE 293.A H 2.889 2.056 GLU 294.A N LYS 290.A O GLU 294.A H 2.906 2.087 ALA 295.A N LEU 292.A O ALA 295.A H 2.740 1.962 ILE 296.A N LEU 292.A O ILE 296.A H 2.717 1.909 GLN 297.A N ILE 293.A O GLN 297.A H 3.290 2.454 ALA 298.A N ALA 295.A O ALA 298.A H 2.916 2.298 LEU 299.A N ILE 296.A O LEU 299.A H 3.253 2.480 GLU 300.A N GLN 297.A O GLU 300.A H 3.236 2.601 TYR 303.A N LEU 299.A O TYR 303.A H 2.537 1.721 THR 311.A N ILE 308.A O THR 311.A H 2.887 2.146 LEU 315.A N THR 311.A O LEU 315.A H 2.714 1.953 ASN 316.A N LEU 312.A O ASN 316.A H 2.681 1.829 THR 317.A N LYS 313.A O THR 317.A H 2.759 1.926 HIS 318.A N LEU 315.A O HIS 318.A H 2.813 2.127 LEU 319.A N LEU 315.A O LEU 319.A H 2.574 1.842 THR 320.A N ASN 316.A O THR 320.A H 3.109 2.263 PHE 321.A N HIS 318.A O PHE 321.A H 3.217 2.628 CYS 322.A N HIS 318.A O CYS 322.A H 2.879 2.084 LEU 326.A N PHE 321.A O LEU 326.A H 2.822 2.147 GLU 330.A N LEU 326.A O GLU 330.A H 3.087 2.283 ASN 331.A N LYS 327.A O ASN 331.A H 2.870 2.016 SER 332.A N ILE 329.A O SER 332.A H 2.868 2.121 LYS 333.A N GLU 330.A O LYS 333.A H 3.210 2.417 ILE 337.A N LYS 333.A O ILE 337.A H 3.195 2.373 LEU 339.A N TYR 335.A O LEU 339.A H 3.077 2.232 ASN 340.A N ILE 337.A O ASN 340.A H 2.906 2.291 ASN 340.A ND2 ASN 331.A OD1 ASN 340.A HD22 3.693 2.941 ASP 341.A N ILE 337.A O ASP 341.A H 2.891 2.116 PHE 342.A N VAL 338.A O PHE 342.A H 3.168 2.380 TYR 344.A N ASN 340.A O TYR 344.A H 2.840 1.999 TYR 345.A N ASP 341.A O TYR 345.A H 3.037 2.375 TYR 345.A N PHE 342.A O TYR 345.A H 3.179 2.560 LYS 346.A N PHE 342.A O LYS 346.A H 2.946 2.205 ILE 347.A N GLU 343.A O ILE 347.A H 3.084 2.313 LYS 348.A N TYR 345.A O LYS 348.A H 3.286 2.565 GLU 349.A N TYR 345.A O GLU 349.A H 3.231 2.407 SER 350.A N LYS 346.A O SER 350.A H 3.152 2.436 ARG 352.A N LYS 348.A O ARG 352.A H 2.878 2.078 LYS 355.A N GLN 351.A O LYS 355.A H 2.706 1.856 GLU 356.A N ARG 352.A O GLU 356.A H 2.440 1.662 ALA 357.A N LEU 353.A O ALA 357.A H 3.018 2.213 LYS 358.A N GLU 354.A O LYS 358.A H 3.004 2.171 ALA 360.A N GLU 356.A O ALA 360.A H 2.717 1.907 GLU 361.A N ALA 357.A O GLU 361.A H 2.553 1.775 LYS 362.A N LYS 358.A O LYS 362.A H 3.162 2.486 THR 363.A N GLN 359.A O THR 363.A H 2.616 1.895 ASN 364.A N ALA 360.A O ASN 364.A H 3.359 2.508