Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6z1p_Ad.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N SER 1.A O LYS 5.A H 3.103 2.479 LYS 5.A N LYS 2.A O LYS 5.A H 3.029 2.265 ARG 11.A NE GLN 9.A OE1 ARG 11.A HE 2.325 1.827 ARG 33.A NE LEU 336.A O ARG 33.A HE 3.567 2.747 THR 34.A N PRO 31.A O THR 34.A H 3.304 2.601 GLN 35.A NE2 ARG 218.A O GLN 35.A HE22 3.506 2.929 ASP 46.A N THR 44.A OG1 ASP 46.A H 3.067 2.345 LYS 47.A N THR 44.A OG1 LYS 47.A H 2.962 2.111 LYS 47.A NZ SER 42.A OG LYS 47.A HZ2 3.287 2.471 LYS 50.A N ASP 46.A O LYS 50.A H 2.947 2.151 MET 51.A N LYS 47.A O MET 51.A H 2.912 2.071 LEU 52.A N LEU 48.A O LEU 52.A H 3.061 2.369 LEU 52.A N PHE 49.A O LEU 52.A H 3.209 2.598 GLN 53.A N LYS 50.A O GLN 53.A H 3.075 2.385 TYR 55.A N MET 51.A O TYR 55.A H 3.103 2.323 THR 56.A N LEU 52.A O THR 56.A H 3.025 2.180 PHE 57.A N GLN 53.A O PHE 57.A H 2.767 1.915 LYS 58.A N ASP 54.A O LYS 58.A H 3.092 2.331 PHE 59.A N THR 56.A O PHE 59.A H 2.762 2.102 GLU 60.A N THR 56.A O GLU 60.A H 2.472 1.633 ALA 80.A N VAL 78.A O ALA 80.A H 2.829 2.226 ARG 81.A N LYS 89.A O ARG 81.A H 3.401 2.553 GLU 91.A N PRO 79.A O GLU 91.A H 3.434 2.580 ASN 93.A ND2 PRO 67.A O ASN 93.A HD22 3.591 2.926 ASN 93.A ND2 GLU 68.A O ASN 93.A HD21 2.441 1.766 ASN 96.A ND2 GLU 98.A OE2 ASN 96.A HD22 2.692 1.953 ASN 96.A ND2 VAL 301.A O ASN 96.A HD21 2.738 2.132 ASN 102.A N GLU 98.A O ASN 102.A H 2.781 1.947 LYS 104.A NZ VAL 101.A O LYS 104.A HZ2 3.058 2.307 PHE 112.A N PHE 338.A O PHE 112.A H 3.286 2.525 ARG 120.A NH1 ASN 337.A O ARG 120.A HH11 3.280 2.452 ARG 120.A NH2 ASP 324.A OD1 ARG 120.A HH21 2.915 2.296 ILE 123.A N ILE 322.A O ILE 123.A H 3.061 2.275 TYR 126.A N GLN 147.A O TYR 126.A H 2.891 2.045 LYS 127.A N SER 318.A O LYS 127.A H 3.261 2.442 LYS 127.A NZ GLY 314.A O LYS 127.A HZ3 2.531 1.841 LEU 128.A N VAL 145.A O LEU 128.A H 3.354 2.535 THR 131.A N LEU 143.A O THR 131.A H 2.885 2.070 ILE 133.A N HIS 141.A O ILE 133.A H 2.992 2.223 ASP 135.A N LYS 139.A O ASP 135.A H 2.819 1.997 LYS 136.A N ASP 135.A OD1 LYS 136.A H 2.643 1.917 TRP 137.A NE1 SER 358.A O TRP 137.A HE1 3.148 2.467 GLY 138.A N ASP 135.A O GLY 138.A H 3.089 2.252 HIS 141.A N ILE 133.A O HIS 141.A H 2.884 2.067 LEU 143.A N THR 131.A O LEU 143.A H 2.724 1.950 THR 144.A N ILE 308.A O THR 144.A H 2.697 1.912 VAL 145.A N GLY 129.A O VAL 145.A H 2.952 2.109 ILE 146.A N VAL 306.A O ILE 146.A H 2.816 2.047 GLN 147.A N TYR 126.A O GLN 147.A H 2.988 2.184 ILE 148.A N SER 304.A O ILE 148.A H 3.221 2.627 GLN 152.A N GLY 170.A O GLN 152.A H 2.875 2.193 GLN 152.A NE2 GLY 212.A O GLN 152.A HE21 2.935 2.152 VAL 153.A N TYR 213.A O VAL 153.A H 3.095 2.267 VAL 154.A N GLN 168.A O VAL 154.A H 3.387 2.563 LYS 157.A N ALA 166.A O LYS 157.A H 2.747 1.992 LYS 157.A NZ GLU 200.A OE2 LYS 157.A HZ3 2.740 1.959 GLU 159.A N ASN 165.A OD1 GLU 159.A H 2.785 2.050 ASP 162.A N THR 158.A O ASP 162.A H 2.833 2.129 GLY 163.A N GLU 159.A O GLY 163.A H 3.231 2.523 ALA 166.A N LYS 157.A O ALA 166.A H 2.784 1.958 LEU 167.A N PHE 201.A O LEU 167.A H 3.303 2.472 GLN 168.A N GLN 155.A O GLN 168.A H 3.073 2.277 LEU 169.A N LYS 199.A O LEU 169.A H 3.036 2.346 GLY 170.A N GLN 152.A O GLY 170.A H 2.714 2.050 GLY 172.A N ASP 149.A O GLY 172.A H 3.008 2.226 ARG 178.A N SER 175.A O ARG 178.A H 3.314 2.465 LYS 181.A N ASN 180.A OD1 LYS 181.A H 2.557 1.915 ILE 184.A N LYS 181.A O ILE 184.A H 2.852 2.170 HIS 186.A N PRO 182.A O HIS 186.A H 3.014 2.245 LEU 187.A N THR 183.A O LEU 187.A H 3.071 2.403 LEU 187.A N ILE 184.A O LEU 187.A H 2.934 2.243 MET 188.A N ILE 184.A O MET 188.A H 2.553 1.798 ASN 190.A ND2 VAL 154.A O ASN 190.A HD21 2.942 2.234 LYS 195.A NZ ARG 150.A O LYS 195.A HZ2 2.844 2.064 LYS 195.A NZ GLN 152.A OE1 LYS 195.A HZ1 3.490 2.625 ARG 196.A N VAL 171.A O ARG 196.A H 3.068 2.251 PHE 201.A N LEU 167.A O PHE 201.A H 3.214 2.447 VAL 203.A N ASN 165.A O VAL 203.A H 3.262 2.425 CYS 207.A N SER 204.A O CYS 207.A H 3.027 2.184 CYS 207.A SG LYS 119.A O CYS 207.A HG 3.381 2.428 LEU 215.A N CYS 151.A O LEU 215.A H 3.086 2.254 ARG 218.A NH1 GLN 35.A OE1 ARG 218.A HH11 2.437 1.681 ARG 218.A NH1 ALA 350.A O ARG 218.A HH12 3.192 2.616 ARG 218.A NH2 ALA 350.A O ARG 218.A HH22 2.958 2.333 HIS 219.A N SER 216.A O HIS 219.A H 3.063 2.220 HIS 219.A ND1 THR 340.A OG1 no hydrogen 2.544 N/A HIS 219.A NE2 THR 121.A O HIS 219.A HE2 2.699 1.973 PHE 220.A N ALA 217.A O PHE 220.A H 2.991 2.198 VAL 226.A N LEU 294.A O VAL 226.A H 2.505 1.789 ASP 227.A N ARG 323.A O ASP 227.A H 2.726 1.919 GLN 229.A N GLN 321.A O GLN 229.A H 2.899 2.110 SER 232.A N GLU 287.A O SER 232.A H 3.326 2.602 LYS 235.A N MET 284.A O LYS 235.A H 3.167 2.322 ALA 238.A N GLY 282.A O ALA 238.A H 2.897 2.219 ARG 243.A NH2 MET 280.A O ARG 243.A HH21 2.783 2.134 ASN 245.A N VAL 241.A O ASN 245.A H 2.634 1.913 GLN 249.A N HIS 259.A O GLN 249.A H 3.048 2.215 ASN 255.A ND2 SER 258.A OG ASN 255.A HD22 2.798 2.098 GLY 282.A N ALA 238.A O GLY 282.A H 3.368 2.564 MET 284.A N GLY 236.A O MET 284.A H 3.176 2.376 CYS 286.A N VAL 233.A O CYS 286.A H 3.061 2.301 GLU 287.A N SER 232.A OG GLU 287.A H 3.192 2.349 LYS 288.A NZ GLN 229.A OE1 LYS 288.A HZ1 2.775 2.029 VAL 289.A N GLY 230.A O VAL 289.A H 3.095 2.285 ILE 291.A N ILE 228.A O ILE 291.A H 3.315 2.552 LEU 294.A N VAL 226.A O LEU 294.A H 3.083 2.319 GLN 295.A NE2 TYR 225.A OH GLN 295.A HE21 3.390 2.609 TYR 297.A N TYR 307.A O TYR 297.A H 2.930 2.120 ILE 299.A N LEU 353.A O ILE 299.A H 2.922 2.212 LEU 305.A N ASP 300.A O LEU 305.A H 3.197 2.388 VAL 306.A N ILE 146.A O VAL 306.A H 2.708 1.958 TYR 307.A N LYS 298.A O TYR 307.A H 3.401 2.598 ILE 308.A N THR 144.A O ILE 308.A H 2.810 2.012 ARG 309.A N GLN 295.A O ARG 309.A H 3.359 2.592 ARG 309.A NE GLN 295.A OE1 ARG 309.A HE 2.396 1.931 GLY 310.A N ILE 308.A O GLY 310.A H 2.830 2.128 GLY 317.A N LYS 127.A O GLY 317.A H 3.125 2.302 VAL 320.A N GLY 125.A O VAL 320.A H 2.997 2.381 GLN 321.A N GLN 229.A O GLN 321.A H 3.406 2.627 GLN 321.A NE2 GLU 200.A O GLN 321.A HE21 3.675 3.060 ILE 322.A N ILE 123.A O ILE 322.A H 3.033 2.219 ARG 323.A N ASP 227.A O ARG 323.A H 3.098 2.299 LYS 327.A NZ ASP 293.A OD2 LYS 327.A HZ3 3.021 2.203 LYS 328.A N ALA 325.A O LYS 328.A H 3.466 2.627 GLN 329.A NE2 PHE 326.A O GLN 329.A HE22 2.874 2.283 GLU 333.A N VAL 330.A O GLU 333.A H 3.288 2.440 PHE 335.A N ASN 332.A O PHE 335.A H 3.030 2.349 LEU 353.A N ILE 299.A O LEU 353.A H 3.346 2.628 SER 360.A N SER 358.A OG SER 360.A H 3.295 2.438 ASN 363.A N ASP 361.A OD1 ASN 363.A H 3.136 2.307 GLU 364.A N ASP 361.A O GLU 364.A H 3.020 2.185 ASN 370.A N HIS 368.A ND1 ASN 370.A H 3.234 2.424 ASP 371.A N HIS 368.A O ASP 371.A H 3.138 2.296