Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7aph_AA.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 4.A N GLN 299.A OE1 ARG 4.A H 2.765 1.828 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.946 1.974 SER 10.A OG GLU 14.A OE2 SER 10.A HG 2.820 1.896 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 3.016 2.261 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.939 1.987 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.294 2.390 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.984 2.047 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.352 2.364 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 3.272 2.348 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.824 1.842 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.852 1.879 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.936 2.013 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 3.100 2.224 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.039 2.074 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 2.992 2.066 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 2.927 1.970 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 2.976 2.122 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 2.974 2.070 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.904 1.963 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.622 1.709 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.660 1.700 TRP 31.A NE1 THR 93.A O TRP 31.A HE1 3.230 2.412 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.984 2.046 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 2.932 2.094 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.028 2.093 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.638 1.766 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.871 1.896 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.160 2.226 CYS 38.A SG PRO 39.A O CYS 38.A HG 3.652 2.796 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 2.894 1.919 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.756 1.864 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 2.994 2.039 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.335 2.379 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.094 2.111 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 2.996 2.022 ASP 48.A N THR 45.A OG1 ASP 48.A H 3.238 2.333 LEU 50.A N GLU 47.A O LEU 50.A H 2.880 1.892 ASP 56.A N ASN 53.A O ASP 56.A H 2.640 1.895 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 2.874 2.062 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.925 1.983 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 3.009 2.055 ILE 59.A N ASP 56.A O ILE 59.A H 3.302 2.515 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 2.896 1.981 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.837 1.970 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.871 2.001 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.327 2.378 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 3.011 2.041 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.950 2.012 GLN 69.A NE2 GLN 74.A OE1 GLN 69.A HE21 3.539 2.958 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.674 1.710 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 2.948 2.064 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.712 1.803 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.759 1.884 GLY 79.A N LYS 90.A O GLY 79.A H 3.239 2.498 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.637 1.667 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 3.103 2.319 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.880 1.896 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.770 1.794 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.775 1.861 CYS 85.A SG ASP 187.A OD1 CYS 85.A HG 3.874 2.785 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.096 2.137 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.893 1.933 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.781 1.801 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ3 2.882 2.025 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.600 1.683 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.770 1.871 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 2.977 2.017 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 2.797 2.054 THR 93.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 93.A HG1 3.184 2.213 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.648 1.718 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD22 2.892 1.926 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD21 3.080 2.108 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.883 1.917 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.209 2.250 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.753 1.803 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.667 1.777 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.987 1.990 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 3.085 2.135 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 3.099 2.224 ARG 105.A NH1 PHE 181.A O ARG 105.A HH12 3.509 2.768 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.831 1.881 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 2.887 1.979 GLN 107.A N GLN 110.A OE1.B GLN 107.A H 2.957 2.084 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.704 1.755 GLN 110.A N.A GLN 107.A O GLN 110.A H.A 2.867 1.930 GLN 110.A N.B GLN 107.A O GLN 110.A H.B 2.886 1.944 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 3.018 2.084 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.851 1.870 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.790 1.819 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.350 2.403 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.817 1.970 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 3.170 2.282 CYS 117.A SG LEU 115.A O CYS 117.A HG 3.482 2.469 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 3.094 2.137 ASN 119.A ND2 GLN 19.A OE1 ASN 119.A HD21 3.357 2.409 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.828 1.923 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 2.979 2.062 SER 123.A N.A ALA 116.A O SER 123.A H.A 2.794 1.871 SER 123.A N.B ALA 116.A O SER 123.A H.B 2.817 1.856 GLY 124.A N ALA 116.A O GLY 124.A H 3.399 2.511 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.236 2.327 TYR 126.A OH SER 139.A O TYR 126.A HH 3.117 2.197 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.736 1.803 CYS 128.A SG LYS 137.A O CYS 128.A HG 3.755 2.808 ALA 129.A N GLU 290.A OE1 ALA 129.A H 3.256 2.427 MET 130.A N GLN 110.A O.A MET 130.A H 2.980 2.012 MET 130.A N GLN 110.A O.B MET 130.A H 2.943 1.976 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.995 2.071 ARG 131.A NE ASP 197.A OD1 ARG 131.A HE 2.826 1.874 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH12 3.103 2.134 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 3.412 2.731 ARG 131.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH11 3.006 2.161 ARG 131.A NH2 ASP 197.A OD1 ARG 131.A HH21 3.422 2.712 ARG 131.A NH2 THR 198.A O ARG 131.A HH21 3.110 2.326 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 2.815 1.964 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 2.909 1.942 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.782 1.929 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.195 2.291 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.987 2.028 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.882 1.977 GLY 138.A N HIS 172.A ND1 GLY 138.A H 2.927 2.138 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.650 1.687 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 3.364 2.423 CYS 145.A SG HIS 164.A O no hydrogen 3.320 N/A GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.837 1.867 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 3.054 2.100 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.515 1.727 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.711 1.794 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.743 1.903 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 3.124 2.181 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD21 2.935 2.011 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.882 1.948 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 2.991 2.037 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 2.853 1.880 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.750 1.779 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.667 1.859 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.058 2.074 TYR 161.A N GLY 149.A O TYR 161.A H 3.174 2.328 MET 162.A N.A THR 175.A O MET 162.A H.A 2.811 2.015 MET 162.A N.B THR 175.A O MET 162.A H.B 2.796 1.941 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.724 1.745 HIS 163.A ND1 TYR 161.A OH no hydrogen 2.961 N/A HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.224 2.317 MET 165.A N.A ALA 173.A O MET 165.A H.A 2.938 2.068 MET 165.A N.B ALA 173.A O MET 165.A H.B 2.860 2.060 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 3.008 2.035 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.814 1.859 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.895 1.984 HIS 172.A NE2 GLU 166.A OE2 HIS 172.A HE2 2.898 2.101 ALA 173.A N MET 165.A O.A ALA 173.A H 2.844 1.885 ALA 173.A N MET 165.A O.B ALA 173.A H 3.050 2.078 THR 175.A N MET 162.A O.A THR 175.A H 3.160 2.225 THR 175.A N MET 162.A O.B THR 175.A H 3.070 2.132 THR 175.A OG1 HIS 164.A NE2 THR 175.A HG1 2.798 2.233 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 2.853 1.920 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 2.958 2.105 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.237 2.310 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 3.123 2.213 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.965 2.044 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 2.891 1.929 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 3.003 2.012 ALA 191.A N THR 190.A OG1 ALA 191.A H 2.412 1.672 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 3.065 2.166 THR 198.A OG1 GLU 240.A OE2 THR 198.A HG1 3.280 2.354 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 3.073 2.148 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 3.135 2.178 THR 201.A OG1 GLU 240.A O THR 201.A HG1 2.819 1.961 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 2.972 2.199 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD21 3.109 2.125 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD22 2.764 1.826 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.182 2.319 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.072 2.129 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.117 2.164 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 2.870 1.917 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.861 1.987 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 2.835 1.880 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.892 1.991 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.902 2.123 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.082 2.109 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 2.996 2.039 ASN 214.A N ALA 210.A O ASN 214.A H 2.921 2.195 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD21 2.907 1.977 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 3.213 2.247 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 2.839 1.980 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.809 1.847 LEU 220.A N ARG 217.A O LEU 220.A H 3.126 2.196 ASN 221.A ND2.A ALA 266.A O ASN 221.A HD21.A 3.372 2.397 ARG 222.A N ASN 221.A OD1.B ARG 222.A H 2.495 1.563 PHE 223.A N ASN 221.A OD1.A PHE 223.A H 3.117 2.198 THR 224.A OG1 ASP 263.A OD1 THR 224.A HG1 2.740 2.033 THR 225.A OG1 THR 226.A O THR 225.A HG1 3.312 2.351 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 2.897 2.035 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 2.762 1.825 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 3.044 2.096 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 2.610 1.668 VAL 233.A N ASP 229.A O VAL 233.A H 3.467 2.623 VAL 233.A N PHE 230.A O VAL 233.A H 2.716 1.962 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.888 2.036 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 2.940 1.994 LYS 236.A N LEU 232.A O LYS 236.A H 3.185 2.257 TYR 237.A N VAL 233.A O TYR 237.A H 3.271 2.516 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 3.334 2.519 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.413 2.463 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 2.793 1.837 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 3.013 2.028 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.772 1.789 THR 243.A N HIS 246.A ND1 THR 243.A H 3.270 2.384 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 3.107 2.300 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.202 2.286 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 2.961 2.087 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.734 1.754 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 2.856 1.925 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.077 2.368 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.035 2.247 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 2.949 1.987 SER 254.A N.A LEU 250.A O SER 254.A H.A 3.004 2.086 SER 254.A N.B LEU 250.A O SER 254.A H.B 3.040 2.085 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.735 1.760 GLN 256.A N.A PRO 252.A O GLN 256.A H.A 2.842 1.865 GLN 256.A N.B PRO 252.A O GLN 256.A H.B 2.884 1.896 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.032 2.301 THR 257.A N SER 254.A O.A THR 257.A H 3.364 2.604 THR 257.A N SER 254.A O.B THR 257.A H 3.309 2.556 THR 257.A OG1 LEU 253.A O THR 257.A HG1 2.874 1.987 THR 257.A OG1 SER 254.A O.A THR 257.A HG1 3.279 2.751 THR 257.A OG1 SER 254.A O.B THR 257.A HG1 3.250 2.729 GLY 258.A N SER 254.A O.A GLY 258.A H 2.590 1.761 GLY 258.A N SER 254.A O.B GLY 258.A H 2.531 1.697 ILE 259.A N THR 257.A OG1 ILE 259.A H 2.992 2.026 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 2.851 1.903 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.858 1.921 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 2.981 2.192 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 2.947 2.134 SER 267.A OG PHE 219.A O SER 267.A HG 3.231 2.354 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 2.844 1.891 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.748 1.829 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.257 2.270 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 3.187 2.339 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.837 1.880 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 2.980 2.148 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.858 1.984 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.814 2.114 ARG 279.A N.A MET 276.A O.A ARG 279.A H.A 2.972 2.043 ARG 279.A N.A MET 276.A O.B ARG 279.A H.A 3.042 2.113 ARG 279.A N.B MET 276.A O.A ARG 279.A H.B 2.999 2.035 ARG 279.A N.B MET 276.A O.B ARG 279.A H.B 3.070 2.106 ARG 279.A NE.B THR 280.A OG1 ARG 279.A HE.B 3.427 2.517 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.851 1.897 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 2.799 1.915 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 2.787 1.825 LEU 286.A N SER 284.A OG.B LEU 286.A H 3.193 2.272 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 3.003 2.026 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.911 1.966 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.142 2.282 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.300 2.333 ARG 298.A N PHE 294.A O.A ARG 298.A H 2.751 1.825 ARG 298.A N PHE 294.A O.B ARG 298.A H 2.869 1.963 ARG 298.A NH2 ASP 295.A OD1 ARG 298.A HH22 2.988 2.179 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 2.937 1.967 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O GLN 299.A HE22 2.897 1.987 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.694 1.803 SER 301.A N ARG 298.A O SER 301.A H 3.191 2.354 SER 301.A OG VAL 297.A O SER 301.A HG 2.613 1.881 VAL 303.A N ARG 298.A O VAL 303.A H 3.364 2.394 GLN 306.A N TYR 154.A O GLN 306.A H 2.920 2.190