Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7arf_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 213.A OD1 GLY 2.A H 2.787 2.123 ARG 4.A N GLN 298.A OE1 ARG 4.A H 3.049 2.204 LYS 5.A NZ GLU 287.A OE1.B LYS 5.A HZ3 3.170 2.541 LYS 5.A NZ GLU 287.A OE2.B LYS 5.A HZ3 3.013 2.255 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 3.049 2.383 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.880 2.062 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.340 2.550 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.876 2.028 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.347 2.492 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.921 2.081 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.804 1.951 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.891 2.046 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.843 2.048 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 2.980 2.223 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.352 2.524 THR 25.A OG1 CYS 44.A O THR 25.A HG1 3.393 2.674 THR 26.A OG1 THR 21.A OG1 THR 26.A HG1 2.793 1.998 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 2.959 2.182 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD22 3.362 2.758 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD22 2.567 1.906 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.825 1.992 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.718 1.933 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.731 1.877 TRP 31.A NE1 THR 93.A O TRP 31.A HE1 3.199 2.490 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 3.044 2.206 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 3.096 2.269 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.142 2.335 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.740 1.906 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.829 2.006 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.241 2.482 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.127 2.295 ARG 40.A NE ASP 186.A OD2 ARG 40.A HE 2.659 1.799 ARG 40.A NH2 ASP 186.A OD1 ARG 40.A HH21 3.151 2.308 ARG 40.A NH2 ASP 186.A OD2 ARG 40.A HH21 3.484 2.883 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.196 2.363 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.154 2.300 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.216 2.400 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 3.051 2.196 ASP 48.A N THR 45.A OG1 ASP 48.A H 3.319 2.510 LEU 50.A N GLU 47.A O LEU 50.A H 3.359 2.554 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 2.974 2.124 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 3.049 2.226 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 3.050 2.321 LEU 58.A N GLU 55.A O LEU 58.A H 3.220 2.581 ILE 59.A N GLU 55.A O ILE 59.A H 3.216 2.524 ILE 59.A N ASP 56.A O ILE 59.A H 3.178 2.510 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 3.103 2.289 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.648 1.800 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.897 2.066 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.203 2.368 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 3.012 2.156 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.831 1.994 GLN 69.A NE2 GLY 71.A O GLN 69.A HE21 3.164 2.426 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.909 2.178 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 2.955 2.102 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.908 2.098 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.716 1.959 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.769 1.925 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 3.000 2.306 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.892 2.082 ASN 84.A ND2 GLU 177.A O ASN 84.A HD21 2.638 1.794 CYS 85.A N GLY 178.A O CYS 85.A H 2.965 2.174 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 2.953 2.097 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.929 2.088 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.935 2.115 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ2 3.514 2.825 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.841 2.009 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.765 2.030 LYS 90.A NZ ASP 34.A OD2 LYS 90.A HZ2 3.160 2.492 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 3.042 2.270 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 2.976 2.354 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.971 2.168 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD22 3.186 2.376 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD21 2.940 2.137 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 3.001 2.155 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.077 2.233 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.680 1.842 LYS 100.A NZ ASP 154.A OD2 no hydrogen 2.537 N/A TYR 101.A OH ASP 33.A OD2 TYR 101.A HH 2.949 2.227 LYS 102.A N VAL 156.A O LYS 102.A H 3.013 2.242 VAL 104.A N PHE 158.A O VAL 104.A H 2.946 2.102 ARG 105.A NH1 ASP 175.A OD2 ARG 105.A HH11 3.169 2.360 ARG 105.A NH1 ASN 179.A O ARG 105.A HH12 3.150 2.420 ARG 105.A NH1 PHE 180.A O ARG 105.A HH12 3.524 2.848 ARG 105.A NH2 PHE 180.A O ARG 105.A HH22 2.984 2.143 ILE 106.A N TYR 181.A OH ILE 106.A H 2.975 2.226 GLN 107.A N GLN 110.A OE1.B GLN 107.A H 2.774 1.966 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.921 2.068 GLN 110.A N.A GLN 107.A O GLN 110.A H.A 3.067 2.211 GLN 110.A N.B GLN 107.A O GLN 110.A H.B 3.051 2.196 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 3.071 2.254 SER 113.A N PHE 149.A O SER 113.A H 2.902 2.066 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.892 2.074 LEU 115.A N VAL 147.A O LEU 115.A H 3.102 2.299 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.889 2.092 CYS 117.A N SER 146.A OG CYS 117.A H 3.169 2.327 TYR 118.A N SER 121.A O no hydrogen 3.109 N/A GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.844 2.031 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 3.383 2.604 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.914 2.089 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.162 2.388 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 3.014 2.155 CYS 128.A SG PHE 112.A O CYS 128.A HG 3.824 2.779 MET 130.A N GLN 110.A O.A MET 130.A H 3.078 2.273 MET 130.A N GLN 110.A O.B MET 130.A H 3.040 2.258 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.863 2.035 ARG 131.A NE ASP 196.A OD1 ARG 131.A HE 3.239 2.595 ARG 131.A NE ASP 196.A OD2 ARG 131.A HE 3.207 2.351 ARG 131.A NH1 ASP 288.A OD1 ARG 131.A HH12 3.056 2.203 ARG 131.A NH1 ASP 288.A OD2 ARG 131.A HH12 3.243 2.618 ARG 131.A NH1 GLU 289.A OE2 ARG 131.A HH11 3.502 2.753 ARG 131.A NH2 THR 197.A O ARG 131.A HH21 3.191 2.539 ARG 131.A NH2 ASP 288.A OD2 ARG 131.A HH22 2.683 1.885 ASN 133.A ND2 GLY 194.A O ASN 133.A HD22 3.189 2.351 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.843 2.018 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.297 2.540 ILE 136.A N HIS 171.A O ILE 136.A H 2.902 2.088 GLY 138.A N HIS 171.A ND1 GLY 138.A H 3.178 2.397 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.968 2.156 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 2.779 1.967 SER 144.A OG LEU 141.A O SER 144.A HG 2.698 1.996 GLY 145.A N HIS 162.A O GLY 145.A H 2.999 2.175 SER 146.A N SER 144.A O SER 146.A H 2.863 2.083 GLY 148.A N TYR 160.A O GLY 148.A H 2.852 2.035 PHE 149.A N SER 113.A O PHE 149.A H 2.710 1.948 ASN 150.A N SER 157.A O ASN 150.A H 2.948 2.126 ASN 150.A ND2 THR 111.A O ASN 150.A HD22 3.212 2.421 ASP 152.A N CYS 155.A O ASP 152.A H 3.001 2.216 CYS 155.A N ASP 152.A O CYS 155.A H 3.111 2.289 VAL 156.A N LYS 100.A O VAL 156.A H 2.805 1.952 SER 157.A N ASN 150.A O SER 157.A H 2.749 1.932 PHE 158.A N LYS 102.A O PHE 158.A H 3.027 2.341 CYS 159.A N GLY 148.A O CYS 159.A H 2.983 2.129 TYR 160.A N GLY 148.A O TYR 160.A H 3.310 2.625 MET 161.A N THR 174.A O MET 161.A H 2.748 1.996 HIS 162.A N SER 146.A O HIS 162.A H 2.756 1.928 HIS 163.A N ALA 172.A O HIS 163.A H 3.273 2.459 MET 164.A N.A ALA 172.A O MET 164.A H.A 2.953 2.100 MET 164.A N.B ALA 172.A O MET 164.A H.B 2.958 2.103 LEU 166.A N VAL 170.A O LEU 166.A H 2.937 2.188 GLY 169.A N LEU 166.A O GLY 169.A H 2.926 2.080 HIS 171.A N ILE 136.A O HIS 171.A H 2.954 2.247 ALA 172.A N MET 164.A O.A ALA 172.A H 3.025 2.186 ALA 172.A N MET 164.A O.B ALA 172.A H 3.108 2.272 THR 174.A N MET 161.A O THR 174.A H 3.021 2.232 ASP 175.A N ASN 179.A O ASP 175.A H 2.995 2.200 GLU 177.A N ASP 175.A OD1 GLU 177.A H 2.807 2.083 GLY 178.A N ASP 175.A O GLY 178.A H 3.130 2.284 ASN 179.A N ASP 175.A OD1 ASN 179.A H 3.079 2.264 TYR 181.A N GLY 173.A O TYR 181.A H 2.930 2.107 TYR 181.A OH CYS 159.A O TYR 181.A HH 2.704 1.878 VAL 185.A N GLN 191.A OE1 VAL 185.A H 2.768 1.938 ARG 187.A N VAL 185.A O ARG 187.A H 2.805 2.057 GLN 188.A N MET 49.A O no hydrogen 2.669 N/A GLN 191.A NE2 VAL 185.A O GLN 191.A HE22 2.847 2.112 THR 198.A N ASN 237.A O THR 198.A H 3.004 2.185 ILE 199.A N ASP 288.A OD2 ILE 199.A H 3.089 2.246 THR 200.A OG1 GLU 239.A O THR 200.A HG1 2.503 1.830 ASN 202.A N ILE 199.A O ASN 202.A H 3.007 2.371 ASN 202.A ND2 GLY 109.A O ASN 202.A HD21 3.013 2.169 ASN 202.A ND2 ASP 288.A O ASN 202.A HD22 2.862 2.036 VAL 203.A N ILE 199.A O VAL 203.A H 3.195 2.381 LEU 204.A N THR 200.A O LEU 204.A H 3.080 2.250 ALA 205.A N VAL 201.A O ALA 205.A H 3.061 2.239 TRP 206.A N ASN 202.A O TRP 206.A H 2.935 2.132 LEU 207.A N VAL 203.A O LEU 207.A H 2.810 2.010 TYR 208.A N LEU 204.A O TYR 208.A H 2.925 2.111 TYR 208.A OH ILE 258.A O TYR 208.A HH 2.932 2.097 ALA 209.A N ALA 205.A O ALA 209.A H 2.939 2.129 ALA 210.A N TRP 206.A O ALA 210.A H 2.886 2.076 VAL 211.A N LEU 207.A O VAL 211.A H 3.093 2.278 ILE 212.A N TYR 208.A O ILE 212.A H 3.052 2.227 ASN 213.A N ALA 209.A O ASN 213.A H 3.054 2.413 ASN 213.A N ALA 210.A O ASN 213.A H 3.012 2.303 ASN 213.A ND2 ALA 209.A O ASN 213.A HD21 2.723 1.882 GLY 214.A N VAL 211.A O GLY 214.A H 3.151 2.340 LEU 219.A N ARG 216.A O.A LEU 219.A H 2.848 2.014 LEU 219.A N ARG 216.A O.B LEU 219.A H 3.074 2.257 PHE 222.A N ASN 220.A OD1 PHE 222.A H 2.923 2.108 THR 223.A OG1 ASP 262.A OD1 THR 223.A HG1 2.849 2.271 ASP 228.A N THR 225.A OG1 ASP 228.A H 3.034 2.209 PHE 229.A N THR 225.A O PHE 229.A H 2.836 1.995 ASN 230.A N LEU 226.A O ASN 230.A H 3.005 2.167 ASN 230.A ND2 LEU 241.A O ASN 230.A HD22 3.167 2.322 LEU 231.A N ASN 227.A O LEU 231.A H 3.180 2.442 LEU 231.A N ASP 228.A O LEU 231.A H 3.185 2.560 ALA 233.A N PHE 229.A O ALA 233.A H 2.903 2.114 MET 234.A N ASN 230.A O MET 234.A H 3.079 2.266 LYS 235.A NZ LEU 231.A O LYS 235.A HZ3 2.972 2.179 TYR 236.A N VAL 232.A O TYR 236.A H 3.245 2.534 TYR 236.A N ALA 233.A O TYR 236.A H 3.133 2.449 ASN 237.A N MET 234.A O ASN 237.A H 3.116 2.262 TYR 238.A N ALA 233.A O TYR 238.A H 2.735 1.883 GLU 239.A N THR 198.A O GLU 239.A H 2.742 1.887 LEU 241.A N ASN 230.A OD1 LEU 241.A H 2.949 2.094 THR 242.A N HIS 245.A ND1 THR 242.A H 3.235 2.398 HIS 245.A N THR 242.A OG1 HIS 245.A H 3.148 2.325 VAL 246.A N THR 242.A O VAL 246.A H 3.107 2.288 ASP 247.A N GLN 243.A O ASP 247.A H 2.736 1.922 ILE 248.A N ASP 244.A O ILE 248.A H 2.899 2.179 ILE 248.A N HIS 245.A O ILE 248.A H 3.166 2.548 LEU 249.A N HIS 245.A O LEU 249.A H 3.266 2.529 LEU 249.A N VAL 246.A O LEU 249.A H 3.205 2.551 GLY 250.A N ASP 247.A O GLY 250.A H 3.237 2.401 SER 253.A N LEU 249.A O SER 253.A H 2.860 2.024 ALA 254.A N GLY 250.A O ALA 254.A H 2.760 1.958 GLN 255.A N PRO 251.A O GLN 255.A H 3.026 2.214 THR 256.A N LEU 252.A O THR 256.A H 3.054 2.244 GLY 257.A N SER 253.A O GLY 257.A H 2.927 2.250 MET 263.A N ALA 259.A O MET 263.A H 3.058 2.249 CYS 264.A N VAL 260.A O CYS 264.A H 2.828 2.024 ALA 265.A N LEU 261.A O ALA 265.A H 3.112 2.369 ALA 265.A N ASP 262.A O ALA 265.A H 3.218 2.626 SER 266.A N ASP 262.A O SER 266.A H 3.235 2.485 LEU 267.A N MET 263.A O LEU 267.A H 2.964 2.149 LYS 268.A N CYS 264.A O LYS 268.A H 2.865 2.019 GLU 269.A N ALA 265.A O GLU 269.A H 3.194 2.373 LEU 270.A N SER 266.A O LEU 270.A H 3.088 2.321 LEU 271.A N LEU 267.A O LEU 271.A H 2.874 2.106 GLN 272.A N LYS 268.A O GLN 272.A H 2.999 2.238 ASN 273.A N GLU 269.A O ASN 273.A H 2.833 2.049 GLY 274.A N LEU 270.A O GLY 274.A H 2.819 2.105 ARG 278.A N MET 275.A O ARG 278.A H 2.911 2.072 ILE 280.A N SER 283.A O ILE 280.A H 2.897 2.083 SER 283.A N ILE 280.A O SER 283.A H 3.019 2.273 SER 283.A OG GLU 287.A OE2.A SER 283.A HG 2.696 1.995 LEU 285.A N SER 283.A OG LEU 285.A H 3.105 2.286 GLU 289.A N GLU 287.A OE2.B GLU 289.A H 3.059 2.366 THR 291.A N ASP 294.A OD2 THR 291.A H 3.243 2.403 ASP 294.A N THR 291.A OG1 no hydrogen 2.776 N/A VAL 295.A N THR 291.A O VAL 295.A H 3.024 2.223 VAL 296.A N PRO 292.A O VAL 296.A H 3.181 2.328 ARG 297.A N PHE 293.A O ARG 297.A H 2.965 2.143 GLN 298.A N ASP 294.A O GLN 298.A H 2.866 2.069 GLN 298.A NE2 ARG 4.A O GLN 298.A HE22 3.069 2.302 CYS 299.A N VAL 295.A O CYS 299.A H 2.894 2.056 CYS 299.A SG VAL 295.A O CYS 299.A HG 3.191 2.300 SER 300.A N VAL 296.A O SER 300.A H 2.983 2.343 GLY 301.A N ARG 297.A O GLY 301.A H 2.597 1.860