Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7bmc_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N GLY 1.A O GLY 4.A H 3.008 2.176 MET 6.A N MET 3.A O MET 6.A H 3.166 2.314 ARG 8.A NH1 GLU 44.A OE2 ARG 8.A HH12 2.966 2.110 ARG 8.A NH2 GLU 44.A OE1 ARG 8.A HH22 2.827 1.970 LEU 11.A N GLU 7.A O LEU 11.A H 2.975 2.175 ILE 12.A N ARG 8.A O ILE 12.A H 3.066 2.246 GLN 13.A N ALA 9.A O GLN 13.A H 2.944 2.103 LYS 14.A N SER 10.A O LYS 14.A H 2.845 2.034 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.848 2.070 LYS 16.A N ILE 12.A O LYS 16.A H 3.110 2.304 LEU 17.A N GLN 13.A O LEU 17.A H 3.080 2.264 ALA 18.A N LYS 14.A O ALA 18.A H 2.871 2.041 GLU 19.A N ALA 15.A O GLU 19.A H 2.951 2.151 GLN 20.A N LYS 16.A O GLN 20.A H 3.074 2.241 ALA 21.A N LEU 17.A O ALA 21.A H 3.033 2.271 GLU 22.A N GLU 19.A O GLU 22.A H 2.967 2.129 ARG 23.A N ALA 18.A O ARG 23.A H 2.855 2.017 ARG 23.A NE ASP 26.A OD2 ARG 23.A HE 2.954 2.205 ARG 23.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 23.A HH21 2.852 2.084 MET 27.A N ARG 23.A O MET 27.A H 2.932 2.112 ALA 28.A N TYR 24.A O ALA 28.A H 2.904 2.108 ALA 29.A N GLU 25.A O ALA 29.A H 3.119 2.311 PHE 30.A N ASP 26.A O PHE 30.A H 2.947 2.112 MET 31.A N MET 27.A O MET 31.A H 3.093 2.264 LYS 32.A N ALA 28.A O LYS 32.A H 2.831 2.006 LYS 32.A NZ GLU 36.A OE2 LYS 32.A HZ1 2.540 1.827 GLY 33.A N ALA 29.A O GLY 33.A H 3.029 2.196 ALA 34.A N PHE 30.A O ALA 34.A H 2.921 2.147 VAL 35.A N MET 31.A O VAL 35.A H 2.913 2.076 GLU 36.A N LYS 32.A O GLU 36.A H 3.026 2.219 LYS 37.A N ALA 34.A O LYS 37.A H 3.140 2.322 LYS 37.A NZ MET 3.A O LYS 37.A HZ2 3.386 2.679 LYS 37.A NZ MET 6.A O LYS 37.A HZ2 2.720 2.162 GLY 38.A N VAL 35.A O GLY 38.A H 3.062 2.209 SER 42.A N GLU 44.A OE1 SER 42.A H 2.905 2.068 GLU 44.A N SER 42.A OG GLU 44.A H 3.299 2.491 ARG 45.A N SER 42.A O ARG 45.A H 2.835 2.018 LEU 47.A N GLU 43.A O LEU 47.A H 3.255 2.471 LEU 48.A N GLU 44.A O LEU 48.A H 3.125 2.311 SER 49.A N ARG 45.A O SER 49.A H 3.036 2.207 SER 49.A OG ARG 45.A O SER 49.A HG 3.560 2.859 SER 49.A OG ASN 46.A O SER 49.A HG 3.222 2.561 VAL 50.A N ASN 46.A O VAL 50.A H 2.992 2.141 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 3.116 2.301 TYR 52.A N LEU 48.A O TYR 52.A H 3.329 2.483 LYS 53.A N SER 49.A O LYS 53.A H 2.891 2.064 ASN 54.A N VAL 50.A O ASN 54.A H 3.112 2.315 ASN 54.A N ALA 51.A O ASN 54.A H 3.214 2.615 ASN 54.A ND2 VAL 50.A O ASN 54.A HD22 3.031 2.176 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.090 2.265 VAL 56.A N TYR 52.A O VAL 56.A H 2.887 2.031 GLY 57.A N LYS 53.A O GLY 57.A H 2.823 2.080 GLY 58.A N ASN 54.A O GLY 58.A H 3.138 2.318 GLN 59.A N VAL 55.A O GLN 59.A H 3.226 2.399 GLN 59.A NE2 GLU 93.A O.A GLN 59.A HE22 3.285 2.650 GLN 59.A NE2 GLU 93.A OE2.A GLN 59.A HE21 3.100 2.272 ARG 60.A N VAL 56.A O ARG 60.A H 2.819 2.000 ARG 60.A NE GLU 135.A OE1 ARG 60.A HE 3.069 2.262 ARG 60.A NH2 GLU 135.A OE2 ARG 60.A HH21 3.116 2.321 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.116 2.271 ALA 62.A N GLY 58.A O ALA 62.A H 3.079 2.256 TRP 63.A N GLN 59.A O TRP 63.A H 2.809 1.966 TRP 63.A NE1 GLU 91.A OE1 TRP 63.A HE1 2.924 2.084 ARG 64.A N.A ARG 60.A O ARG 64.A H.A 2.858 2.053 ARG 64.A N.B ARG 60.A O ARG 64.A H.B 2.862 2.060 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.098 2.284 LEU 66.A N ALA 62.A O LEU 66.A H 3.051 2.217 SER 67.A N TRP 63.A O SER 67.A H 2.792 1.948 SER 68.A N ARG 64.A O.A SER 68.A H 2.986 2.177 SER 68.A N ARG 64.A O.B SER 68.A H 2.993 2.184 ILE 69.A N VAL 65.A O ILE 69.A H 3.118 2.278 GLU 70.A N LEU 66.A O GLU 70.A H 2.776 1.954 GLN 71.A N SER 67.A O GLN 71.A H 2.823 2.027 LYS 72.A N SER 68.A O LYS 72.A H 3.007 2.165 SER 73.A N ILE 69.A O SER 73.A H 3.014 2.227 SER 73.A OG GLU 70.A O SER 73.A HG 2.622 1.787 ASN 74.A N GLN 71.A O ASN 74.A H 3.107 2.302 GLU 75.A N LYS 72.A O GLU 75.A H 3.119 2.281 SER 77.A OG LYS 72.A O SER 77.A HG 2.687 1.850 GLU 82.A N GLU 82.A OE1 GLU 82.A H 2.695 1.949 ARG 84.A NH1 GLU 88.A OE1 ARG 84.A HH11 3.462 2.650 GLU 85.A N PRO 81.A O GLU 85.A H 2.886 2.061 TYR 86.A N GLU 82.A O TYR 86.A H 2.907 2.066 ARG 87.A N VAL 83.A O ARG 87.A H 2.908 2.061 ARG 87.A NE GLU 70.A OE1 ARG 87.A HE 2.697 1.922 ARG 87.A NH1 GLU 91.A OE1 ARG 87.A HH11 2.760 2.040 ARG 87.A NH2 GLU 70.A OE2 ARG 87.A HH21 3.057 2.210 GLU 88.A N ARG 84.A O GLU 88.A H 2.828 2.005 LYS 89.A N GLU 85.A O LYS 89.A H 2.895 2.141 VAL 90.A N TYR 86.A O VAL 90.A H 3.047 2.204 GLU 91.A N ARG 87.A O GLU 91.A H 2.898 2.080 THR 92.A N GLU 88.A O THR 92.A H 2.841 2.003 THR 92.A OG1 GLU 88.A O THR 92.A HG1 2.842 2.054 GLU 93.A N.A LYS 89.A O GLU 93.A H.A 3.129 2.291 GLU 93.A N.B LYS 89.A O GLU 93.A H.B 3.128 2.287 LEU 94.A N VAL 90.A O LEU 94.A H 2.863 2.067 GLN 95.A N GLU 91.A O GLN 95.A H 2.824 1.987 GLY 96.A N THR 92.A O GLY 96.A H 2.952 2.174 VAL 97.A N GLU 93.A O.A VAL 97.A H 3.234 2.437 VAL 97.A N GLU 93.A O.B VAL 97.A H 3.174 2.377 CYS 98.A N LEU 94.A O CYS 98.A H 3.078 2.236 ASP 99.A N GLN 95.A O ASP 99.A H 2.820 1.982 THR 100.A N GLY 96.A O THR 100.A H 2.970 2.190 THR 100.A OG1 GLY 96.A O THR 100.A HG1 3.066 2.303 VAL 101.A N VAL 97.A O VAL 101.A H 2.983 2.147 LEU 102.A N CYS 98.A O LEU 102.A H 2.946 2.092 GLY 103.A N ASP 99.A O GLY 103.A H 2.942 2.140 LEU 104.A N THR 100.A O LEU 104.A H 3.064 2.263 LEU 105.A N VAL 101.A O LEU 105.A H 3.001 2.161 ASP 106.A N LEU 102.A O ASP 106.A H 2.944 2.155 SER 107.A N LEU 104.A O SER 107.A H 2.996 2.263 ILE 110.A N LEU 105.A O ILE 110.A H 2.979 2.125 GLU 112.A N HIS 108.A O GLU 112.A H 3.386 2.599 ALA 113.A N ILE 110.A O ALA 113.A H 3.256 2.413 GLU 117.A N GLU 117.A OE1 no hydrogen 2.555 N/A SER 118.A OG ASP 115.A O SER 118.A HG 2.904 2.217 ARG 119.A N ASP 115.A O ARG 119.A H 3.064 2.229 ARG 119.A NH1 ILE 110.A O ARG 119.A HH12 2.606 2.055 ARG 119.A NH1 ALA 113.A O ARG 119.A HH11 3.331 2.593 VAL 120.A N ALA 116.A O VAL 120.A H 2.927 2.069 PHE 121.A N GLU 117.A O PHE 121.A H 3.090 2.274 TYR 122.A N SER 118.A O TYR 122.A H 2.993 2.155 LEU 123.A N ARG 119.A O LEU 123.A H 3.012 2.182 LYS 124.A N VAL 120.A O LYS 124.A H 2.797 1.966 LYS 124.A NZ ASP 128.A OD2 LYS 124.A HZ3 3.002 2.170 MET 125.A N PHE 121.A O MET 125.A H 3.096 2.279 LYS 126.A N TYR 122.A O LYS 126.A H 2.915 2.095 GLY 127.A N LEU 123.A O GLY 127.A H 3.009 2.189 ASP 128.A N LYS 124.A O ASP 128.A H 2.815 1.997 TYR 129.A N MET 125.A O TYR 129.A H 2.946 2.131 TYR 130.A N LYS 126.A O TYR 130.A H 3.142 2.312 ARG 131.A N GLY 127.A O ARG 131.A H 2.887 2.084 ARG 131.A NE TYR 153.A OH ARG 131.A HE 3.010 2.159 ARG 131.A NH2 ASP 128.A OD1 ARG 131.A HH21 3.223 2.398 ARG 131.A NH2 TYR 153.A OH ARG 131.A HH21 3.498 2.803 TYR 132.A N ASP 128.A O TYR 132.A H 2.919 2.143 LEU 133.A N TYR 129.A O LEU 133.A H 3.212 2.412 ALA 134.A N TYR 130.A O ALA 134.A H 2.921 2.174 GLU 135.A N ARG 131.A O GLU 135.A H 2.936 2.227 ALA 137.A N ALA 134.A O ALA 137.A H 3.242 2.456 ASP 141.A N ASP 141.A OD1 ASP 141.A H 2.587 1.960 LYS 142.A N GLY 139.A O LYS 142.A H 3.400 2.545 LYS 142.A NZ ALA 134.A O LYS 142.A HZ3 3.207 2.615 ILE 145.A N ASP 141.A O ILE 145.A H 2.832 1.986 ILE 146.A N LYS 142.A O ILE 146.A H 2.862 2.037 ASP 147.A N LYS 143.A O ASP 147.A H 3.128 2.361 SER 148.A N ARG 144.A O SER 148.A H 3.002 2.202 SER 148.A OG ARG 144.A O SER 148.A HG 3.277 2.525 ALA 149.A N ILE 145.A O ALA 149.A H 3.148 2.339 ARG 150.A N.A ILE 146.A O ARG 150.A H.A 2.998 2.155 ARG 150.A N.B ILE 146.A O ARG 150.A H.B 2.994 2.149 ARG 150.A NE.A ASP 147.A OD1 ARG 150.A HE.A 2.941 2.096 ARG 150.A NH2.A ASP 147.A OD1 ARG 150.A HH21.A 3.557 2.899 ARG 150.A NH2.A ASP 147.A OD2 ARG 150.A HH21.A 3.215 2.357 SER 151.A N ASP 147.A O SER 151.A H 2.801 1.960 ALA 152.A N SER 148.A O ALA 152.A H 3.098 2.271 TYR 153.A N ALA 149.A O TYR 153.A H 2.845 1.986 TYR 153.A OH ASP 128.A OD1 TYR 153.A HH 2.443 1.693 GLN 154.A N ARG 150.A O.A GLN 154.A H 2.745 1.956 GLN 154.A N ARG 150.A O.B GLN 154.A H 2.761 1.975 GLN 154.A NE2 GLN 154.A O GLN 154.A HE21 3.475 2.986 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 3.113 2.335 GLU 155.A N SER 151.A O GLU 155.A H 3.167 2.316 ALA 156.A N ALA 152.A O ALA 156.A H 3.212 2.357 MET 157.A N TYR 153.A O MET 157.A H 2.919 2.113 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.944 2.121 ILE 159.A N GLU 155.A O ILE 159.A H 3.041 2.209 SER 160.A N ALA 156.A O SER 160.A H 2.890 2.060 SER 160.A OG ALA 156.A O SER 160.A HG 3.479 2.936 SER 160.A OG MET 157.A O SER 160.A HG 3.068 2.284 LYS 161.A N MET 157.A O LYS 161.A H 2.964 2.133 LYS 162.A N ASP 158.A O LYS 162.A H 3.251 2.585 LYS 162.A N ILE 159.A O LYS 162.A H 3.023 2.341 GLU 163.A N ILE 159.A O GLU 163.A H 2.793 2.083 MET 164.A N SER 160.A O MET 164.A H 3.057 2.305 THR 167.A OG1 ASP 206.A OD2 THR 167.A HG1 3.260 2.573 ASN 168.A N PRO 165.A O ASN 168.A H.A 3.125 2.268 ILE 170.A N ASN 168.A OD1 ILE 170.A H 2.826 2.159 ARG 171.A N ASN 168.A OD1 ARG 171.A H 3.244 2.465 ARG 171.A NH1 MET 164.A O ARG 171.A HH11 2.823 2.171 LEU 172.A N ASN 168.A O LEU 172.A H 2.962 2.123 GLY 173.A N PRO 169.A O GLY 173.A H 2.858 2.019 LEU 174.A N ILE 170.A O LEU 174.A H 2.926 2.075 ALA 175.A N ARG 171.A O ALA 175.A H 3.084 2.270 LEU 176.A N LEU 172.A O LEU 176.A H 2.884 2.058 ASN 177.A N GLY 173.A O ASN 177.A H 3.095 2.265 ASN 177.A ND2 ASP 128.A OD1 ASN 177.A HD22 2.897 2.055 ASN 177.A ND2 ASP 128.A OD2 ASN 177.A HD22 3.385 2.731 PHE 178.A N LEU 174.A O PHE 178.A H 2.856 2.011 SER 179.A N ALA 175.A O SER 179.A H 3.016 2.241 SER 179.A OG ALA 175.A O SER 179.A HG 3.502 2.973 SER 179.A OG LEU 176.A O SER 179.A HG 2.578 1.794 VAL 180.A N LEU 176.A O VAL 180.A H 3.107 2.314 PHE 181.A N ASN 177.A O PHE 181.A H 2.881 2.057 HIS 182.A N PHE 178.A O HIS 182.A H 3.008 2.193 TYR 183.A N SER 179.A O TYR 183.A H 3.006 2.281 GLU 184.A N VAL 180.A O GLU 184.A H 3.094 2.250 ILE 185.A N PHE 181.A O ILE 185.A H 2.979 2.188 ALA 186.A N PHE 181.A O ALA 186.A H 2.970 2.170 SER 188.A N HIS 182.A O SER 188.A H 2.778 1.944 ALA 192.A N SER 188.A O ALA 192.A H 3.030 2.205 ILE 193.A N PRO 189.A O ILE 193.A H 2.950 2.164 SER 194.A N GLU 190.A O SER 194.A H 2.948 2.104 LEU 195.A N GLU 191.A O no hydrogen 2.982 N/A ALA 196.A N ALA 192.A O ALA 196.A H 3.054 2.212 LYS 197.A N ILE 193.A O LYS 197.A H 3.118 2.327 LYS 197.A NZ ASP 201.A OD2 LYS 197.A HZ1 2.998 2.328 THR 198.A N SER 194.A O THR 198.A H 3.044 2.186 THR 199.A N LEU 195.A O THR 199.A H 2.893 2.052 THR 199.A OG1 LEU 195.A O THR 199.A HG1 2.691 1.975 PHE 200.A N ALA 196.A O PHE 200.A H 2.951 2.107 ASP 201.A N LYS 197.A O ASP 201.A H 2.827 1.982 GLU 202.A N THR 198.A O GLU 202.A H 3.035 2.198 ALA 203.A N THR 199.A O ALA 203.A H 3.200 2.401 MET 204.A N PHE 200.A O MET 204.A H 2.936 2.102 ALA 205.A N ASP 201.A O ALA 205.A H 3.153 2.338 ASP 206.A N ALA 203.A O ASP 206.A H 3.020 2.235 LEU 207.A N MET 204.A O LEU 207.A H 3.278 2.431 HIS 208.A ND1 ALA 205.A O no hydrogen 3.252 N/A THR 209.A N ASP 206.A O THR 209.A H 3.201 2.345 THR 209.A OG1 ASP 206.A O THR 209.A HG1 2.792 1.971 LEU 210.A N LEU 207.A O LEU 210.A H 3.000 2.142 SER 218.A N ASP 217.A OD1 SER 218.A H 2.776 2.180 SER 218.A OG THR 167.A O SER 218.A HG 2.555 1.995 THR 219.A N TYR 215.A O THR 219.A H 2.931 2.109 LEU 220.A N LYS 216.A O LEU 220.A H 3.051 2.225 ILE 221.A N ASP 217.A O ILE 221.A H 3.108 2.325 MET 222.A N SER 218.A O MET 222.A H 2.956 2.112 GLN 223.A N THR 219.A O GLN 223.A H 3.031 2.264 GLN 223.A NE2 GLN 223.A O GLN 223.A HE21 3.242 2.775 GLN 223.A NE2 ASP 227.A OD1 GLN 223.A HE21 2.741 1.973 LEU 224.A N LEU 220.A O LEU 224.A H 3.169 2.416 LEU 225.A N ILE 221.A O LEU 225.A H 2.976 2.165 ARG 226.A N MET 222.A O ARG 226.A H 3.071 2.250 ASP 227.A N GLN 223.A O ASP 227.A H 2.882 2.126 ASN 228.A N LEU 224.A O ASN 228.A H 2.956 2.118 LEU 229.A N LEU 225.A O LEU 229.A H 3.017 2.179 THR 230.A N ARG 226.A O THR 230.A H 3.008 2.185 THR 230.A OG1 ARG 226.A O THR 230.A HG1 2.944 2.155 LEU 231.A N ASP 227.A O LEU 231.A H 3.015 2.209 TRP 232.A N ASN 228.A O TRP 232.A H 2.776 2.056 THR 233.A N LEU 229.A O THR 233.A H 2.878 2.240 THR 233.A OG1 LEU 229.A O THR 233.A HG1 2.613 1.778