Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7gsd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 2.A O LYS 5.A H 3.221 2.445 GLU 6.A N GLU 2.A O GLU 6.A H 3.191 2.286 PHE 7.A N MET 3.A O PHE 7.A H 2.783 2.072 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.449 2.577 GLN 9.A N LYS 5.A O GLN 9.A H 2.987 2.085 ILE 10.A N GLU 6.A O ILE 10.A H 3.030 2.221 ASP 11.A N PHE 7.A O ASP 11.A H 2.852 1.999 LYS 12.A N GLU 8.A O LYS 12.A H 2.711 1.800 LYS 12.A NZ GLN 9.A O LYS 12.A HZ3 3.460 2.895 SER 13.A N GLN 9.A O SER 13.A H 3.302 2.474 GLY 14.A N ASP 11.A O GLY 14.A H 2.927 2.062 SER 15.A N ILE 10.A O SER 15.A H 3.055 2.202 TRP 16.A NE1 ASP 11.A OD1 TRP 16.A HE1 2.893 2.083 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 3.009 2.137 TYR 20.A N TRP 16.A O TYR 20.A H 2.999 2.122 TYR 20.A OH ILE 261.A O TYR 20.A HH 2.684 1.752 GLN 21.A N ALA 17.A O GLN 21.A H 3.041 2.171 ASP 22.A N ALA 18.A O ASP 22.A H 3.242 2.398 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 3.146 2.274 ARG 24.A N TYR 20.A O ARG 24.A H 3.042 2.159 ARG 24.A NE GLN 21.A OE1 ARG 24.A HE 3.279 2.483 HIS 25.A N GLN 21.A O HIS 25.A H 2.967 2.119 GLU 26.A N ASP 22.A O GLU 26.A H 2.991 2.243 GLU 26.A N ILE 23.A O GLU 26.A H 3.060 2.391 ALA 27.A N ILE 23.A O ALA 27.A H 2.949 2.290 ARG 33.A N ASP 53.A OD2 ARG 33.A H 2.814 1.967 VAL 34.A N ASP 53.A OD1 VAL 34.A H 2.995 2.091 LYS 36.A N ARG 33.A O LYS 36.A H 3.225 2.537 LEU 37.A N VAL 34.A O LEU 37.A H 3.117 2.229 ASN 40.A N LEU 37.A O ASN 40.A H 3.051 2.163 ASN 40.A ND2 VAL 34.A O ASN 40.A HD22 2.959 2.128 LYS 41.A N PRO 38.A O LYS 41.A H 3.285 2.420 ARG 43.A N ASN 40.A O ARG 43.A H 2.848 1.955 ARG 43.A NH1 TYR 66.A O ARG 43.A HH11 2.941 2.109 ASN 44.A N LYS 41.A O ASN 44.A H 3.502 2.619 ASN 44.A ND2 ALA 35.A O ASN 44.A HD21 3.042 2.404 ARG 45.A N GLN 85.A OE1 ARG 45.A H 2.981 2.102 ARG 45.A NE GLY 86.A O ARG 45.A HE 3.097 2.275 ARG 45.A NH2 GLY 86.A O ARG 45.A HH21 3.167 2.376 ARG 45.A NH2 PRO 87.A O ARG 45.A HH21 2.757 2.156 ASP 48.A N ASP 48.A OD1 ASP 48.A H 2.568 1.851 VAL 49.A N TYR 46.A O VAL 49.A H 3.344 2.442 ASP 53.A N PRO 31.A O ASP 53.A H 2.860 1.962 HIS 54.A NE2 LYS 255.A O HIS 54.A HE2 2.970 2.201 SER 55.A N PHE 52.A O SER 55.A H 3.375 2.564 SER 55.A OG PHE 256.A O SER 55.A HG 2.600 1.890 ARG 56.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH12 2.970 2.147 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH22 3.132 2.363 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 56.A HH22 3.300 2.498 ILE 57.A N ALA 69.A O ILE 57.A H 2.956 2.079 LEU 59.A N ASP 65.A O LEU 59.A H 2.936 2.053 HIS 60.A N GLU 101.A OE1 HIS 60.A H 2.906 2.082 HIS 60.A N GLU 101.A OE2 HIS 60.A H 3.319 2.508 GLN 61.A NE2 GLU 97.A OE1 GLN 61.A HE22 3.337 2.478 ASN 64.A ND2 ASN 40.A OD1 ASN 64.A HD21 2.903 2.028 TYR 66.A N ASN 64.A OD1 TYR 66.A H 3.033 2.219 ASN 68.A ND2 ASN 44.A OD1 ASN 68.A HD22 2.947 2.185 ASN 68.A ND2 VAL 49.A O ASN 68.A HD21 2.998 2.171 SER 70.A N LEU 83.A O SER 70.A H 2.907 2.035 LEU 71.A N SER 55.A O LEU 71.A H 2.943 2.040 ILE 72.A N TYR 81.A O ILE 72.A H 2.749 1.871 MET 74.A N ARG 79.A O MET 74.A H 2.836 1.952 GLN 78.A N GLU 75.A O GLN 78.A H 3.333 2.577 ARG 79.A N MET 74.A O ARG 79.A H 3.301 2.478 ARG 79.A NE ASP 229.A OD2 ARG 79.A HE 2.872 1.978 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 79.A HH21 3.059 2.184 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 79.A HH21 3.319 2.580 TYR 81.A N ILE 72.A O TYR 81.A H 2.946 2.105 TYR 81.A OH THR 230.A OG1 TYR 81.A HH 2.806 2.022 ILE 82.A N VAL 211.A O ILE 82.A H 2.818 1.913 LEU 83.A N SER 70.A O LEU 83.A H 2.945 2.121 THR 84.A N VAL 213.A O THR 84.A H 3.021 2.162 GLN 85.A N ASN 68.A O GLN 85.A H 3.404 2.555 GLN 85.A NE2 ARG 43.A O GLN 85.A HE21 2.863 2.159 GLY 86.A N SER 216.A O GLY 86.A H 2.952 2.088 LEU 88.A N THR 91.A OG1 LEU 88.A H 2.934 2.054 ASN 90.A ND2 ASN 42.A O ASN 90.A HD21 2.884 2.114 THR 91.A N LEU 88.A O THR 91.A H 2.853 1.988 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 2.899 2.020 TRP 96.A N VAL 92.A O TRP 96.A H 3.280 2.428 TRP 96.A NE1 TYR 124.A O TRP 96.A HE1 2.962 2.130 GLU 97.A N GLY 93.A O GLU 97.A H 2.984 2.107 MET 98.A N HIS 94.A O MET 98.A H 2.896 2.018 VAL 99.A N PHE 95.A O VAL 99.A H 3.029 2.152 TRP 100.A N TRP 96.A O TRP 100.A H 2.963 2.090 GLU 101.A N GLU 97.A O GLU 101.A H 2.843 1.947 GLN 102.A N MET 98.A O GLN 102.A H 2.867 1.991 LYS 103.A N TRP 100.A O LYS 103.A H 3.220 2.385 SER 104.A N VAL 99.A O SER 104.A H 3.332 2.557 ARG 105.A NH1 SER 201.A O ARG 105.A HH12 3.072 2.432 ARG 105.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 105.A HH21 3.251 2.445 VAL 107.A N LEU 172.A O VAL 107.A H 2.875 1.997 VAL 108.A N VAL 212.A O VAL 108.A H 2.774 1.886 MET 109.A N PHE 174.A O MET 109.A H 2.908 2.013 LEU 110.A N HIS 214.A O LEU 110.A H 3.039 2.234 ASN 111.A ND2 ARG 112.A O ASN 111.A HD22 2.936 2.132 ARG 112.A N GLU 115.A OE2 ARG 112.A H 2.856 1.967 ARG 112.A NH1 THR 177.A O ARG 112.A HH11 3.005 2.228 ARG 112.A NH1 TRP 179.A O ARG 112.A HH12 2.785 1.957 ARG 112.A NH2 TRP 179.A O ARG 112.A HH22 3.000 2.252 ARG 112.A NH2 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH21 2.680 1.920 GLU 115.A N SER 118.A O GLU 115.A H 3.078 2.269 LYS 116.A N ASP 181.A OD2 LYS 116.A H 3.028 2.176 SER 118.A N GLU 115.A O SER 118.A H 3.059 2.157 LYS 120.A N VAL 113.A O LYS 120.A H 2.763 1.872 ALA 122.A N PRO 87.A O ALA 122.A H 2.947 2.036 GLN 123.A NE2 TRP 125.A O GLN 123.A HE22 3.089 2.493 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 2.738 1.918 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.717 1.881 LYS 131.A N LYS 128.A O LYS 131.A H 2.986 2.095 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.733 1.866 MET 133.A N LEU 142.A O MET 133.A H 2.947 2.046 PHE 135.A N LEU 140.A O PHE 135.A H 2.898 2.006 THR 138.A OG1 GLY 93.A O THR 138.A HG1 3.092 2.292 LEU 140.A N PHE 135.A O LEU 140.A H 3.281 2.427 LYS 141.A N GLU 161.A O LYS 141.A H 2.983 2.115 LEU 142.A N MET 133.A O LEU 142.A H 2.941 2.062 THR 143.A N GLU 159.A O THR 143.A H 2.979 2.121 ILE 145.A N GLN 157.A O ILE 145.A H 2.871 1.988 SER 146.A N GLN 157.A O SER 146.A H 3.368 2.534 SER 146.A OG GLN 157.A OE1 SER 146.A HG 2.698 2.209 ASP 148.A N VAL 155.A O ASP 148.A H 2.781 1.906 LYS 150.A N TYR 153.A O LYS 150.A H 2.874 2.055 THR 154.A N HIS 175.A O THR 154.A H 2.927 2.050 VAL 155.A N ASP 148.A O VAL 155.A H 2.957 2.098 ARG 156.A N HIS 173.A O ARG 156.A H 2.911 2.020 ARG 156.A NE GLU 147.A OE2 ARG 156.A HE 2.608 1.770 ARG 156.A NH2 GLU 147.A OE2 ARG 156.A HH21 3.372 2.775 GLN 157.A N SER 146.A O GLN 157.A H 2.963 2.144 GLN 157.A NE2 GLU 170.A OE2 GLN 157.A HE22 2.815 1.948 LEU 158.A N ILE 171.A O LEU 158.A H 2.904 2.010 GLU 159.A N THR 143.A O GLU 159.A H 2.956 2.075 LEU 160.A N ARG 169.A O LEU 160.A H 2.944 2.055 GLU 161.A N LYS 141.A O GLU 161.A H 2.800 1.939 ASN 162.A N GLU 167.A O ASN 162.A H 2.899 2.055 LEU 163.A N ASN 139.A O LEU 163.A H 3.050 2.214 THR 164.A N ASN 162.A OD1 THR 164.A H 2.836 2.015 THR 165.A N ASN 162.A O THR 165.A H 3.116 2.345 THR 165.A OG1 GLU 167.A OE2 THR 165.A HG1 2.660 1.696 GLN 166.A N ASN 162.A O GLN 166.A H 2.666 1.895 GLU 167.A N THR 165.A OG1 GLU 167.A H 3.371 2.473 ARG 169.A N LEU 160.A O ARG 169.A H 2.922 2.080 ARG 169.A NH1 TRP 100.A O ARG 169.A HH12 2.813 1.988 ILE 171.A N LEU 158.A O ILE 171.A H 2.912 2.045 LEU 172.A N ARG 105.A O LEU 172.A H 2.977 2.100 HIS 173.A N ARG 156.A O HIS 173.A H 2.872 1.970 PHE 174.A N VAL 107.A O PHE 174.A H 2.852 1.965 HIS 175.A N THR 154.A O HIS 175.A H 2.892 2.009 HIS 175.A NE2 ASN 111.A O HIS 175.A HE2 2.864 2.048 TYR 176.A N MET 109.A O TYR 176.A H 2.880 2.048 TYR 176.A OH SER 190.A OG TYR 176.A HH 2.719 2.006 THR 177.A N TYR 152.A O THR 177.A H 3.217 2.338 ALA 189.A N SER 187.A OG ALA 189.A H 3.108 2.221 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 2.935 2.036 ASN 193.A N ALA 189.A O ASN 193.A H 3.011 2.102 PHE 194.A N SER 190.A O PHE 194.A H 3.074 2.230 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 2.963 2.116 PHE 196.A N LEU 192.A O PHE 196.A H 3.029 2.171 LYS 197.A N ASN 193.A O LYS 197.A H 3.075 2.261 VAL 198.A N PHE 194.A O VAL 198.A H 3.015 2.172 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 3.018 2.131 ARG 199.A NE ASP 229.A OD1 ARG 199.A HE 2.826 1.996 ARG 199.A NH2 ASP 229.A O ARG 199.A HH21 3.241 2.651 ARG 199.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 199.A HH21 2.888 2.109 GLU 200.A N PHE 196.A O GLU 200.A H 2.897 2.029 SER 201.A N VAL 198.A O SER 201.A H 3.200 2.425 GLY 202.A N ARG 199.A O GLY 202.A H 3.011 2.104 SER 203.A N SER 201.A OG SER 203.A H 3.030 2.164 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 3.082 2.200 GLU 207.A N GLU 207.A OE1 GLU 207.A H 3.181 2.381 HIS 208.A N SER 205.A O HIS 208.A H 3.125 2.215 GLY 209.A N LYS 103.A O GLY 209.A H 3.023 2.298 VAL 212.A N GLY 106.A O VAL 212.A H 3.227 2.334 VAL 213.A N ILE 82.A O VAL 213.A H 2.695 1.796 HIS 214.A N VAL 108.A O HIS 214.A H 2.905 2.045 HIS 214.A ND1 CYS 215.A O HIS 214.A HD1 2.897 2.036 HIS 214.A NE2 TYR 124.A OH HIS 214.A HE2 2.771 1.976 ARG 221.A NH1 LEU 110.A O ARG 221.A HH11 3.089 2.233 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH12 3.504 2.882 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 221.A HH12 2.923 2.054 ARG 221.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH22 2.966 2.191 THR 224.A N GLY 220.A O THR 224.A H 3.032 2.200 PHE 225.A N ARG 221.A O PHE 225.A H 3.096 2.237 CYS 226.A N SER 222.A O CYS 226.A H 3.313 2.431 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 2.970 2.074 ALA 228.A N THR 224.A O ALA 228.A H 3.097 2.201 ASP 229.A N PHE 225.A O ASP 229.A H 3.149 2.250 THR 230.A N CYS 226.A O THR 230.A H 2.982 2.075 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H 2.978 2.086 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 3.043 2.142 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 3.032 2.209 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.987 2.147 MET 235.A N CYS 231.A O MET 235.A H 2.968 2.092 ASP 236.A N LEU 233.A O ASP 236.A H 3.178 2.353 LYS 237.A N LEU 234.A O LYS 237.A H 2.855 2.067 SER 243.A N ASP 240.A O SER 243.A H 2.719 1.808 VAL 244.A N PRO 241.A O VAL 244.A H 3.121 2.342 LYS 247.A N ASP 245.A OD1 LYS 247.A H 3.192 2.559 LYS 247.A NZ GLU 6.A OE2 LYS 247.A HZ3 2.531 1.831 LYS 248.A N ASP 245.A OD1 LYS 248.A H 3.429 2.581 LYS 248.A NZ ASP 245.A OD2 LYS 248.A HZ1 2.984 2.110 VAL 249.A N ASP 245.A O VAL 249.A H 2.981 2.143 LEU 250.A N ILE 246.A O LEU 250.A H 2.889 1.999 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 3.038 2.157 GLU 252.A N LYS 248.A O GLU 252.A H 3.080 2.193 MET 253.A N VAL 249.A O MET 253.A H 2.931 2.068 ARG 254.A N LEU 250.A O ARG 254.A H 2.846 1.999 ARG 254.A NE LEU 260.A O ARG 254.A HE 2.862 2.093 ARG 254.A NH2 LEU 260.A O ARG 254.A HH21 2.977 2.248 ARG 254.A NH2 ILE 261.A O ARG 254.A HH21 2.998 2.370 LYS 255.A N GLU 252.A O LYS 255.A H 3.050 2.206 LYS 255.A NZ GLU 252.A OE2 LYS 255.A HZ1 3.091 2.196 PHE 256.A N MET 253.A O PHE 256.A H 2.828 1.929 ARG 257.A N MET 253.A O ARG 257.A H 3.446 2.621 ARG 257.A NE GLY 218.A O ARG 257.A HE 3.008 2.181 ARG 257.A NH1 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH12 3.136 2.342 ARG 257.A NH1 SER 70.A OG ARG 257.A HH11 3.009 2.133 ARG 257.A NH2 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH22 2.983 2.139 ARG 257.A NH2 ALA 217.A O ARG 257.A HH21 3.081 2.283 ILE 261.A N ILE 219.A O ILE 261.A H 2.923 2.082 GLN 262.A N GLN 266.A OE1 GLN 262.A H 2.794 1.884 GLN 266.A N THR 263.A OG1 GLN 266.A H 3.070 2.198 LEU 267.A N THR 263.A O LEU 267.A H 3.166 2.344 ARG 268.A N ALA 264.A O ARG 268.A H 3.017 2.129 ARG 268.A NE ASP 11.A OD1 ARG 268.A HE 3.046 2.159 ARG 268.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 268.A HH21 2.789 1.905 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 3.050 2.161 SER 270.A N GLN 266.A O SER 270.A H 2.986 2.151 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 3.134 2.264 LEU 272.A N ARG 268.A O LEU 272.A H 3.040 2.153 ALA 273.A N PHE 269.A O ALA 273.A H 2.902 2.039 VAL 274.A N SER 270.A O VAL 274.A H 3.041 2.175 ILE 275.A N TYR 271.A O ILE 275.A H 2.866 1.963 GLU 276.A N LEU 272.A O GLU 276.A H 2.999 2.144 GLY 277.A N ALA 273.A O GLY 277.A H 2.861 1.974 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 2.981 2.144 LYS 279.A N GLU 276.A O LYS 279.A H 3.188 2.395 LYS 279.A NZ GLU 4.A OE2 LYS 279.A HZ2 3.225 2.352 PHE 280.A N GLY 277.A O PHE 280.A H 3.041 2.164 ILE 281.A N GLY 277.A O ILE 281.A H 3.122 2.259