Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7gtd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 2.A O LYS 5.A H 3.155 2.380 GLU 6.A N GLU 2.A O GLU 6.A H 3.251 2.354 PHE 7.A N MET 3.A O PHE 7.A H 2.790 2.093 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.324 2.468 GLN 9.A N LYS 5.A O GLN 9.A H 3.054 2.191 ILE 10.A N GLU 6.A O ILE 10.A H 3.119 2.327 ASP 11.A N PHE 7.A O ASP 11.A H 2.897 2.028 LYS 12.A N GLU 8.A O LYS 12.A H 2.770 1.875 SER 13.A N GLN 9.A O SER 13.A H 3.210 2.372 GLY 14.A N ASP 11.A O GLY 14.A H 3.111 2.252 SER 15.A N ILE 10.A O SER 15.A H 3.061 2.240 TRP 16.A NE1 ASP 11.A OD1 TRP 16.A HE1 2.898 2.060 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 3.042 2.150 TYR 20.A N TRP 16.A O TYR 20.A H 2.947 2.061 TYR 20.A OH ILE 261.A O TYR 20.A HH 2.664 1.852 GLN 21.A N ALA 17.A O GLN 21.A H 2.945 2.095 ASP 22.A N ALA 18.A O ASP 22.A H 3.175 2.333 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 3.185 2.313 ARG 24.A N TYR 20.A O ARG 24.A H 3.115 2.233 ARG 24.A NE GLN 21.A OE1 ARG 24.A HE 3.406 2.570 HIS 25.A N GLN 21.A O HIS 25.A H 2.940 2.088 GLU 26.A N ASP 22.A O GLU 26.A H 2.984 2.234 GLU 26.A N ILE 23.A O GLU 26.A H 3.110 2.440 ARG 33.A N ASP 53.A OD2 ARG 33.A H 2.893 2.062 VAL 34.A N ASP 53.A OD1 VAL 34.A H 2.995 2.089 LYS 36.A N ARG 33.A O LYS 36.A H 3.252 2.530 LEU 37.A N VAL 34.A O LEU 37.A H 3.142 2.251 ASN 40.A N LEU 37.A O ASN 40.A H 3.003 2.119 ASN 40.A ND2 VAL 34.A O ASN 40.A HD22 2.961 2.144 LYS 41.A N PRO 38.A O LYS 41.A H 3.269 2.374 ARG 43.A N ASN 40.A O ARG 43.A H 2.840 1.948 ARG 43.A NH1 TYR 66.A O ARG 43.A HH11 2.898 2.072 ASN 44.A N LYS 41.A O ASN 44.A H 3.463 2.588 ASN 44.A ND2 ALA 35.A O ASN 44.A HD21 3.080 2.448 ARG 45.A N GLN 85.A OE1 ARG 45.A H 3.054 2.154 ARG 45.A NE GLY 86.A O ARG 45.A HE 3.176 2.359 ARG 45.A NH2 GLY 86.A O ARG 45.A HH21 3.178 2.371 ARG 45.A NH2 PRO 87.A O ARG 45.A HH21 2.854 2.252 ASP 48.A N ASP 48.A OD1 ASP 48.A H 2.604 1.916 VAL 49.A N TYR 46.A O VAL 49.A H 3.372 2.472 ASP 53.A N PRO 31.A O ASP 53.A H 2.807 1.910 HIS 54.A NE2 LYS 255.A O HIS 54.A HE2 2.835 2.089 SER 55.A N PHE 52.A O SER 55.A H 3.431 2.604 SER 55.A OG PHE 256.A O SER 55.A HG 2.596 1.937 ARG 56.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH12 2.934 2.105 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH22 3.137 2.373 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 56.A HH22 3.313 2.499 ILE 57.A N ALA 69.A O ILE 57.A H 2.970 2.092 LEU 59.A N ASP 65.A O LEU 59.A H 2.930 2.044 HIS 60.A N GLU 101.A OE1 HIS 60.A H 2.921 2.113 HIS 60.A N GLU 101.A OE2 HIS 60.A H 3.367 2.542 ASN 64.A ND2 ASN 40.A OD1 ASN 64.A HD21 2.953 2.077 TYR 66.A N ASN 64.A OD1 TYR 66.A H 3.074 2.262 ASN 68.A ND2 ASN 44.A OD1 ASN 68.A HD22 2.904 2.136 ASN 68.A ND2 VAL 49.A O ASN 68.A HD21 2.939 2.109 SER 70.A N LEU 83.A O SER 70.A H 2.992 2.118 LEU 71.A N SER 55.A O LEU 71.A H 2.925 2.030 ILE 72.A N TYR 81.A O ILE 72.A H 2.764 1.882 MET 74.A N ARG 79.A O MET 74.A H 2.837 1.953 GLN 78.A N GLU 75.A O GLN 78.A H 3.271 2.505 ARG 79.A N MET 74.A O ARG 79.A H 3.312 2.499 ARG 79.A NE ASP 229.A OD2 ARG 79.A HE 2.844 1.947 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 79.A HH21 3.076 2.195 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 79.A HH21 3.332 2.602 TYR 81.A N ILE 72.A O TYR 81.A H 2.965 2.109 TYR 81.A OH THR 230.A OG1 TYR 81.A HH 2.762 1.954 ILE 82.A N VAL 211.A O ILE 82.A H 2.849 1.957 LEU 83.A N SER 70.A O LEU 83.A H 2.926 2.085 THR 84.A N VAL 213.A O THR 84.A H 2.959 2.117 GLN 85.A N ASN 68.A O GLN 85.A H 3.438 2.579 GLN 85.A NE2 ARG 43.A O GLN 85.A HE21 2.870 2.170 GLY 86.A N SER 216.A O GLY 86.A H 3.081 2.249 LEU 88.A N THR 91.A OG1 LEU 88.A H 2.914 2.032 ASN 90.A N ASN 90.A OD1 ASN 90.A H 2.485 1.801 ASN 90.A ND2 ASN 42.A O ASN 90.A HD21 2.689 1.824 THR 91.A N LEU 88.A O THR 91.A H 2.849 1.970 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 2.909 2.027 TRP 96.A N VAL 92.A O TRP 96.A H 3.353 2.496 TRP 96.A NE1 TYR 124.A O TRP 96.A HE1 2.966 2.135 GLU 97.A N GLY 93.A O GLU 97.A H 3.008 2.142 MET 98.A N HIS 94.A O MET 98.A H 2.947 2.103 VAL 99.A N PHE 95.A O VAL 99.A H 3.053 2.163 TRP 100.A N TRP 96.A O TRP 100.A H 3.028 2.147 GLU 101.A N GLU 97.A O GLU 101.A H 2.879 1.981 GLN 102.A N MET 98.A O GLN 102.A H 2.870 1.986 LYS 103.A N TRP 100.A O LYS 103.A H 3.153 2.332 SER 104.A N VAL 99.A O SER 104.A H 3.327 2.547 ARG 105.A NH1 SER 201.A O ARG 105.A HH12 3.167 2.568 ARG 105.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 105.A HH21 3.329 2.568 VAL 107.A N LEU 172.A O VAL 107.A H 2.910 2.038 VAL 108.A N VAL 212.A O VAL 108.A H 2.791 1.898 MET 109.A N PHE 174.A O MET 109.A H 2.905 2.007 LEU 110.A N HIS 214.A O LEU 110.A H 3.016 2.185 ASN 111.A ND2 ARG 112.A O ASN 111.A HD22 2.930 2.142 ARG 112.A N GLU 115.A OE2 ARG 112.A H 2.788 1.900 ARG 112.A NH1 THR 177.A O ARG 112.A HH11 3.052 2.302 ARG 112.A NH1 TRP 179.A O ARG 112.A HH12 2.812 1.978 ARG 112.A NH2 TRP 179.A O ARG 112.A HH22 3.069 2.326 ARG 112.A NH2 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH21 2.674 1.931 GLU 115.A N SER 118.A O GLU 115.A H 3.099 2.271 LYS 116.A N ASP 181.A OD2 LYS 116.A H 2.996 2.139 SER 118.A N GLU 115.A O SER 118.A H 3.091 2.184 LYS 120.A N VAL 113.A O LYS 120.A H 2.743 1.851 ALA 122.A N PRO 87.A O ALA 122.A H 3.026 2.129 GLN 123.A NE2 TRP 125.A O GLN 123.A HE22 3.087 2.480 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 2.840 1.992 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.803 1.950 LYS 131.A N LYS 128.A O LYS 131.A H 3.082 2.208 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.775 1.913 MET 133.A N LEU 142.A O MET 133.A H 2.890 1.988 PHE 135.A N LEU 140.A O PHE 135.A H 2.900 2.007 THR 138.A OG1 GLY 93.A O THR 138.A HG1 3.090 2.299 LEU 140.A N PHE 135.A O LEU 140.A H 3.300 2.442 LYS 141.A N GLU 161.A O LYS 141.A H 2.988 2.115 LEU 142.A N MET 133.A O LEU 142.A H 2.919 2.030 THR 143.A N GLU 159.A O THR 143.A H 3.012 2.160 ILE 145.A N GLN 157.A O ILE 145.A H 2.806 1.939 SER 146.A N GLN 157.A O SER 146.A H 3.257 2.413 SER 146.A OG GLN 157.A OE1 SER 146.A HG 3.007 2.595 ASP 148.A N VAL 155.A O ASP 148.A H 2.830 1.947 LYS 150.A N TYR 153.A O LYS 150.A H 2.923 2.084 THR 154.A N HIS 175.A O THR 154.A H 2.922 2.048 VAL 155.A N ASP 148.A O VAL 155.A H 2.963 2.115 ARG 156.A N HIS 173.A O ARG 156.A H 2.890 2.005 ARG 156.A NE GLU 147.A OE2 ARG 156.A HE 2.609 1.777 GLN 157.A N SER 146.A O GLN 157.A H 2.997 2.125 LEU 158.A N ILE 171.A O LEU 158.A H 2.922 2.040 GLU 159.A N THR 143.A O GLU 159.A H 3.007 2.131 LEU 160.A N ARG 169.A O LEU 160.A H 3.006 2.112 GLU 161.A N LYS 141.A O GLU 161.A H 2.858 1.993 ASN 162.A N GLU 167.A O ASN 162.A H 2.895 2.058 LEU 163.A N ASN 139.A O LEU 163.A H 3.052 2.207 THR 164.A N ASN 162.A OD1 THR 164.A H 2.936 2.155 THR 165.A N ASN 162.A O THR 165.A H 3.189 2.462 THR 165.A OG1 GLU 167.A OE2 THR 165.A HG1 2.634 1.835 GLN 166.A N ASN 162.A O GLN 166.A H 2.695 1.898 ARG 169.A N LEU 160.A O ARG 169.A H 2.927 2.076 ARG 169.A NH1 TRP 100.A O ARG 169.A HH12 2.803 1.967 ILE 171.A N LEU 158.A O ILE 171.A H 2.923 2.048 LEU 172.A N ARG 105.A O LEU 172.A H 2.943 2.075 HIS 173.A N ARG 156.A O HIS 173.A H 2.852 1.952 PHE 174.A N VAL 107.A O PHE 174.A H 2.811 1.924 HIS 175.A N THR 154.A O HIS 175.A H 2.908 2.023 HIS 175.A NE2 ASN 111.A O HIS 175.A HE2 2.915 2.162 TYR 176.A N MET 109.A O TYR 176.A H 2.895 2.078 TYR 176.A OH SER 190.A OG TYR 176.A HH 2.772 2.038 THR 177.A N TYR 152.A O THR 177.A H 3.176 2.277 TRP 179.A NE1 GLY 183.A O TRP 179.A HE1 3.247 2.478 ALA 189.A N SER 187.A OG ALA 189.A H 3.050 2.153 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 3.005 2.099 ASN 193.A N ALA 189.A O ASN 193.A H 3.063 2.155 PHE 194.A N SER 190.A O PHE 194.A H 3.018 2.166 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 2.921 2.061 PHE 196.A N LEU 192.A O PHE 196.A H 2.971 2.107 LYS 197.A N ASN 193.A O LYS 197.A H 3.066 2.255 VAL 198.A N PHE 194.A O VAL 198.A H 3.040 2.171 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 2.968 2.071 ARG 199.A NE ASP 229.A OD1 ARG 199.A HE 2.843 2.009 ARG 199.A NH2 ASP 229.A O ARG 199.A HH21 3.280 2.683 ARG 199.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 199.A HH21 2.946 2.171 GLU 200.A N PHE 196.A O GLU 200.A H 2.994 2.116 SER 201.A N VAL 198.A O SER 201.A H 3.242 2.491 GLY 202.A N ARG 199.A O GLY 202.A H 3.033 2.126 SER 203.A N SER 201.A OG SER 203.A H 3.013 2.148 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 3.089 2.203 GLU 207.A N GLU 207.A OE1 GLU 207.A H 3.177 2.403 HIS 208.A N SER 205.A O HIS 208.A H 3.148 2.239 GLY 209.A N LYS 103.A O GLY 209.A H 2.962 2.193 VAL 212.A N GLY 106.A O VAL 212.A H 3.213 2.322 VAL 213.A N ILE 82.A O VAL 213.A H 2.701 1.797 HIS 214.A N VAL 108.A O HIS 214.A H 2.943 2.079 HIS 214.A ND1 CYS 215.A O HIS 214.A HD1 3.017 2.144 HIS 214.A NE2 TYR 124.A OH HIS 214.A HE2 2.721 1.881 ARG 221.A NH1 LEU 110.A O ARG 221.A HH11 2.997 2.141 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH12 3.446 2.794 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 221.A HH12 3.010 2.128 ARG 221.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH22 2.914 2.105 THR 224.A N GLY 220.A O THR 224.A H 3.067 2.229 PHE 225.A N ARG 221.A O PHE 225.A H 3.062 2.198 CYS 226.A N SER 222.A O CYS 226.A H 3.289 2.429 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 2.983 2.092 ALA 228.A N THR 224.A O ALA 228.A H 3.056 2.160 ASP 229.A N PHE 225.A O ASP 229.A H 3.172 2.266 THR 230.A N CYS 226.A O THR 230.A H 3.070 2.157 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H 3.027 2.139 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 3.120 2.225 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 3.085 2.232 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.985 2.093 MET 235.A N CYS 231.A O MET 235.A H 3.093 2.269 ASP 236.A N LEU 232.A O ASP 236.A H 3.185 2.410 ASP 236.A N LEU 233.A O ASP 236.A H 3.229 2.591 LYS 237.A N LEU 233.A O LYS 237.A H 3.171 2.501 LYS 237.A N LEU 234.A O LYS 237.A H 3.330 2.601 LYS 237.A NZ GLU 76.A O LYS 237.A HZ3 2.815 1.973 LYS 237.A NZ GLN 78.A OE1 LYS 237.A HZ2 2.975 2.366 ARG 238.A N LEU 234.A O ARG 238.A H 3.120 2.316 ARG 238.A NE GLU 76.A OE2 ARG 238.A HE 2.814 1.929 ARG 238.A NH1 SER 243.A OG ARG 238.A HH11 3.261 2.429 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 238.A HH21 2.644 1.752 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 238.A HH21 3.374 2.690 SER 242.A N ASP 240.A OD1 SER 242.A H 3.105 2.322 SER 243.A N ASP 240.A O SER 243.A H 3.116 2.228 VAL 244.A N PRO 241.A O VAL 244.A H 3.328 2.438 LYS 247.A NZ GLU 6.A OE2 LYS 247.A HZ3 2.555 1.866 LYS 248.A N ASP 245.A OD1 LYS 248.A H 3.446 2.584 LYS 248.A NZ ASP 245.A OD2 LYS 248.A HZ1 3.151 2.286 VAL 249.A N ASP 245.A O VAL 249.A H 3.007 2.160 LEU 250.A N ILE 246.A O LEU 250.A H 2.901 2.007 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 3.025 2.162 GLU 252.A N LYS 248.A O GLU 252.A H 3.104 2.221 MET 253.A N VAL 249.A O MET 253.A H 3.032 2.151 ARG 254.A N LEU 250.A O ARG 254.A H 2.908 2.071 ARG 254.A NE LEU 260.A O ARG 254.A HE 2.853 2.070 ARG 254.A NH2 LEU 260.A O ARG 254.A HH21 3.004 2.272 ARG 254.A NH2 ILE 261.A O ARG 254.A HH21 3.048 2.401 LYS 255.A N GLU 252.A O LYS 255.A H 3.138 2.297 LYS 255.A NZ GLU 252.A OE1 LYS 255.A HZ1 2.792 1.931 PHE 256.A N MET 253.A O PHE 256.A H 2.876 1.983 ARG 257.A NE GLY 218.A O ARG 257.A HE 2.992 2.185 ARG 257.A NH1 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH12 3.215 2.432 ARG 257.A NH1 SER 70.A OG ARG 257.A HH11 3.032 2.155 ARG 257.A NH2 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH22 3.016 2.168 ARG 257.A NH2 ALA 217.A O ARG 257.A HH21 3.125 2.318 ILE 261.A N ILE 219.A O ILE 261.A H 2.974 2.129 GLN 262.A N GLN 266.A OE1 GLN 262.A H 2.721 1.811 GLN 266.A N THR 263.A OG1 GLN 266.A H 3.106 2.234 LEU 267.A N THR 263.A O LEU 267.A H 3.173 2.341 ARG 268.A N ALA 264.A O ARG 268.A H 3.020 2.127 ARG 268.A NE ASP 11.A OD1 ARG 268.A HE 3.047 2.158 ARG 268.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 268.A HH21 2.851 1.968 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 3.058 2.170 SER 270.A N GLN 266.A O SER 270.A H 3.003 2.162 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 3.171 2.301 LEU 272.A N ARG 268.A O LEU 272.A H 3.026 2.138 ALA 273.A N PHE 269.A O ALA 273.A H 2.908 2.050 VAL 274.A N SER 270.A O VAL 274.A H 3.062 2.198 ILE 275.A N TYR 271.A O ILE 275.A H 2.912 2.009 GLU 276.A N LEU 272.A O GLU 276.A H 3.053 2.166 GLY 277.A N ALA 273.A O GLY 277.A H 2.827 1.965 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 2.916 2.076 LYS 279.A N GLU 276.A O LYS 279.A H 3.281 2.580 LYS 279.A NZ GLU 4.A OE1 LYS 279.A HZ2 3.368 2.760 PHE 280.A N GLY 277.A O PHE 280.A H 3.073 2.183 ILE 281.A N GLY 277.A O ILE 281.A H 3.294 2.403 MET 282.A N ALA 278.A O MET 282.A H 2.724 1.826 GLY 283.A N PHE 280.A O GLY 283.A H 2.778 1.988 ASP 284.A N PHE 280.A O ASP 284.A H 3.228 2.353