Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7gtm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 2.A O LYS 5.A H 3.032 2.213 GLU 6.A N GLU 2.A O GLU 6.A H 3.153 2.258 PHE 7.A N MET 3.A O PHE 7.A H 2.666 1.874 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.426 2.554 GLN 9.A N LYS 5.A O GLN 9.A H 2.939 2.032 ILE 10.A N GLU 6.A O ILE 10.A H 3.007 2.153 ASP 11.A N PHE 7.A O ASP 11.A H 2.906 2.031 LYS 12.A N GLU 8.A O LYS 12.A H 2.787 1.888 LYS 12.A NZ GLN 9.A O LYS 12.A HZ3 3.451 2.891 SER 13.A N GLN 9.A O SER 13.A H 3.135 2.303 GLY 14.A N ASP 11.A O GLY 14.A H 3.016 2.163 SER 15.A N ILE 10.A O SER 15.A H 3.062 2.220 TRP 16.A NE1 ASP 11.A OD1 TRP 16.A HE1 2.835 1.999 ALA 18.A N SER 15.A O ALA 18.A H 3.059 2.430 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 3.035 2.147 TYR 20.A N TRP 16.A O TYR 20.A H 2.966 2.086 TYR 20.A OH ILE 261.A O TYR 20.A HH 2.675 1.736 GLN 21.A N ALA 17.A O GLN 21.A H 3.058 2.171 ASP 22.A N ALA 18.A O ASP 22.A H 3.134 2.275 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 3.160 2.308 ARG 24.A N TYR 20.A O ARG 24.A H 2.943 2.073 ARG 24.A NE GLN 21.A OE1 ARG 24.A HE 3.074 2.270 HIS 25.A N GLN 21.A O HIS 25.A H 2.937 2.144 GLU 26.A N ASP 22.A O GLU 26.A H 3.111 2.285 ARG 33.A N ASP 53.A OD2 ARG 33.A H 2.886 2.009 VAL 34.A N ASP 53.A OD1 VAL 34.A H 3.034 2.143 LYS 36.A N ARG 33.A O LYS 36.A H 3.138 2.354 LEU 37.A N VAL 34.A O LEU 37.A H 3.100 2.206 ASN 40.A N LEU 37.A O ASN 40.A H 2.897 2.000 ASN 40.A ND2 VAL 34.A O ASN 40.A HD22 3.006 2.153 LYS 41.A N PRO 38.A O LYS 41.A H 3.324 2.441 ARG 43.A N ASN 40.A O ARG 43.A H 2.790 1.901 ARG 43.A NH1 TYR 66.A O ARG 43.A HH11 2.872 2.037 ASN 44.A N LYS 41.A O ASN 44.A H 3.499 2.602 ASN 44.A ND2 ALA 35.A O ASN 44.A HD21 2.998 2.372 ARG 45.A N GLN 85.A OE1 ARG 45.A H 2.951 2.042 ARG 45.A NE GLY 86.A O ARG 45.A HE 3.096 2.258 ARG 45.A NH2 GLY 86.A O ARG 45.A HH21 3.187 2.388 ARG 45.A NH2 PRO 87.A O ARG 45.A HH21 2.835 2.210 ASP 48.A N ASP 48.A OD1 ASP 48.A H 2.642 1.937 VAL 49.A N TYR 46.A O VAL 49.A H 3.278 2.372 ASP 53.A N PRO 31.A O ASP 53.A H 2.865 1.968 HIS 54.A NE2 LYS 255.A O HIS 54.A HE2 2.934 2.184 SER 55.A OG PHE 256.A O SER 55.A HG 2.583 1.907 ARG 56.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH12 2.894 2.054 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH22 3.196 2.457 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 56.A HH22 3.302 2.464 ILE 57.A N ALA 69.A O ILE 57.A H 3.043 2.164 LEU 59.A N ASP 65.A O LEU 59.A H 2.862 1.974 HIS 60.A N GLU 101.A OE1 HIS 60.A H 2.866 2.005 HIS 60.A N GLU 101.A OE2 HIS 60.A H 3.372 2.587 GLN 61.A NE2 GLU 97.A OE1 GLN 61.A HE22 2.982 2.290 ASN 64.A ND2 ASN 40.A OD1 ASN 64.A HD21 2.946 2.079 TYR 66.A N ASN 64.A OD1 TYR 66.A H 3.025 2.177 ASN 68.A ND2 ASN 44.A OD1 ASN 68.A HD22 2.971 2.231 ASN 68.A ND2 VAL 49.A O ASN 68.A HD21 2.974 2.148 SER 70.A N LEU 83.A O SER 70.A H 2.958 2.114 LEU 71.A N SER 55.A O LEU 71.A H 2.869 1.972 ILE 72.A N TYR 81.A O ILE 72.A H 2.791 1.892 MET 74.A N ARG 79.A O MET 74.A H 2.856 1.970 GLN 78.A N MET 74.A O GLN 78.A H 2.982 2.345 GLN 78.A N GLU 75.A O GLN 78.A H 3.271 2.513 ARG 79.A N MET 74.A O ARG 79.A H 3.332 2.505 ARG 79.A NE ASP 229.A OD2 ARG 79.A HE 2.929 2.036 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 79.A HH21 3.125 2.249 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 79.A HH21 3.341 2.595 TYR 81.A N ILE 72.A O TYR 81.A H 2.952 2.114 TYR 81.A OH THR 230.A OG1 TYR 81.A HH 2.763 1.963 ILE 82.A N VAL 211.A O ILE 82.A H 2.788 1.881 LEU 83.A N SER 70.A O LEU 83.A H 2.989 2.166 THR 84.A N VAL 213.A O THR 84.A H 3.000 2.171 GLN 85.A N ASN 68.A O GLN 85.A H 3.443 2.578 GLN 85.A NE2 ARG 43.A O GLN 85.A HE21 2.835 2.151 GLY 86.A N SER 216.A O GLY 86.A H 2.925 2.071 LEU 88.A N THR 91.A OG1 LEU 88.A H 2.947 2.058 ASN 90.A N ASN 90.A OD1 ASN 90.A H 2.638 1.982 ASN 90.A ND2 ASN 42.A O ASN 90.A HD21 2.882 2.111 THR 91.A N LEU 88.A O THR 91.A H 2.853 1.992 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 2.913 2.031 TRP 96.A N VAL 92.A O TRP 96.A H 3.242 2.366 TRP 96.A NE1 TYR 124.A O TRP 96.A HE1 2.926 2.095 GLU 97.A N GLY 93.A O GLU 97.A H 3.029 2.140 MET 98.A N HIS 94.A O MET 98.A H 2.981 2.120 VAL 99.A N PHE 95.A O VAL 99.A H 3.132 2.267 TRP 100.A N TRP 96.A O TRP 100.A H 3.061 2.185 GLU 101.A N GLU 97.A O GLU 101.A H 2.865 1.992 GLN 102.A N MET 98.A O GLN 102.A H 2.868 1.977 LYS 103.A N TRP 100.A O LYS 103.A H 3.327 2.492 SER 104.A N VAL 99.A O SER 104.A H 3.295 2.491 ARG 105.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 105.A HH21 2.869 2.118 VAL 107.A N LEU 172.A O VAL 107.A H 2.890 2.019 VAL 108.A N VAL 212.A O VAL 108.A H 2.780 1.899 MET 109.A N PHE 174.A O MET 109.A H 2.845 1.951 LEU 110.A N HIS 214.A O LEU 110.A H 3.027 2.218 ASN 111.A ND2 ARG 112.A O ASN 111.A HD22 2.922 2.128 ARG 112.A N GLU 115.A OE2 ARG 112.A H 2.759 1.868 ARG 112.A NH1 THR 177.A O ARG 112.A HH11 3.008 2.257 ARG 112.A NH1 TRP 179.A O ARG 112.A HH12 2.732 1.930 ARG 112.A NH2 TRP 179.A O ARG 112.A HH22 2.819 2.053 ARG 112.A NH2 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH21 2.761 1.938 GLU 115.A N SER 118.A O GLU 115.A H 3.189 2.366 LYS 116.A N ASP 181.A OD2 LYS 116.A H 2.984 2.151 SER 118.A N GLU 115.A O SER 118.A H 3.065 2.163 LYS 120.A N VAL 113.A O LYS 120.A H 2.785 1.900 ALA 122.A N PRO 87.A O ALA 122.A H 2.942 2.038 GLN 123.A NE2 TRP 125.A O GLN 123.A HE22 3.046 2.449 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 2.838 2.005 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.744 1.899 LYS 131.A N LYS 128.A O LYS 131.A H 3.021 2.127 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.761 1.897 MET 133.A N LEU 142.A O MET 133.A H 2.940 2.040 PHE 135.A N LEU 140.A O PHE 135.A H 2.918 2.023 THR 138.A OG1 GLY 93.A O THR 138.A HG1 3.197 2.345 ASN 139.A N PHE 135.A O ASN 139.A H 2.884 2.242 LEU 140.A N PHE 135.A O LEU 140.A H 3.294 2.446 LYS 141.A N GLU 161.A O LYS 141.A H 2.963 2.087 LEU 142.A N MET 133.A O LEU 142.A H 2.857 1.974 THR 143.A N GLU 159.A O THR 143.A H 2.990 2.126 ILE 145.A N GLN 157.A O ILE 145.A H 2.820 1.934 SER 146.A N GLN 157.A O SER 146.A H 3.373 2.536 SER 146.A OG GLN 157.A OE1 SER 146.A HG 2.623 2.156 ASP 148.A N VAL 155.A O ASP 148.A H 2.800 1.942 LYS 150.A N TYR 153.A O LYS 150.A H 2.876 2.051 THR 154.A N HIS 175.A O THR 154.A H 2.859 1.985 VAL 155.A N ASP 148.A O VAL 155.A H 2.950 2.109 ARG 156.A N HIS 173.A O ARG 156.A H 2.901 2.021 ARG 156.A NE GLU 147.A OE2 ARG 156.A HE 2.660 1.784 ARG 156.A NH2 GLU 147.A OE2 ARG 156.A HH21 3.344 2.699 GLN 157.A N SER 146.A O GLN 157.A H 2.964 2.135 GLN 157.A NE2 GLU 170.A OE2 GLN 157.A HE22 2.607 1.754 LEU 158.A N ILE 171.A O LEU 158.A H 2.858 2.000 GLU 159.A N THR 143.A O GLU 159.A H 2.871 1.994 LEU 160.A N ARG 169.A O LEU 160.A H 2.960 2.074 GLU 161.A N LYS 141.A O GLU 161.A H 2.865 1.973 ASN 162.A N GLU 167.A O ASN 162.A H 2.948 2.169 LEU 163.A N ASN 139.A O LEU 163.A H 3.006 2.142 THR 164.A N ASN 162.A OD1 THR 164.A H 2.898 2.148 THR 165.A N ASN 162.A O THR 165.A H 3.202 2.448 THR 165.A OG1 GLU 167.A OE2 THR 165.A HG1 2.656 1.767 GLN 166.A N ASN 162.A O GLN 166.A H 2.698 1.923 GLU 167.A N THR 165.A OG1 GLU 167.A H 3.306 2.405 ARG 169.A N LEU 160.A O ARG 169.A H 2.945 2.097 ARG 169.A NH1 TRP 100.A O ARG 169.A HH12 3.082 2.302 ILE 171.A N LEU 158.A O ILE 171.A H 2.913 2.069 LEU 172.A N ARG 105.A O LEU 172.A H 3.020 2.115 HIS 173.A N ARG 156.A O HIS 173.A H 2.809 1.910 PHE 174.A N VAL 107.A O PHE 174.A H 2.833 1.935 HIS 175.A N THR 154.A O HIS 175.A H 2.867 1.980 HIS 175.A NE2 ASN 111.A O HIS 175.A HE2 2.815 2.026 TYR 176.A N MET 109.A O TYR 176.A H 2.943 2.123 TYR 176.A OH SER 190.A OG TYR 176.A HH 2.782 2.119 THR 177.A N TYR 152.A O THR 177.A H 3.071 2.176 TRP 179.A NE1 GLY 183.A O TRP 179.A HE1 3.143 2.336 ALA 189.A N SER 187.A OG ALA 189.A H 3.040 2.135 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 2.951 2.051 ASN 193.A N ALA 189.A O ASN 193.A H 2.981 2.073 PHE 194.A N SER 190.A O PHE 194.A H 3.031 2.166 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 2.891 2.018 PHE 196.A N LEU 192.A O PHE 196.A H 2.949 2.069 LYS 197.A N ASN 193.A O LYS 197.A H 3.088 2.282 VAL 198.A N PHE 194.A O VAL 198.A H 3.074 2.229 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 3.008 2.142 ARG 199.A NE ASP 229.A OD1 ARG 199.A HE 2.810 1.993 ARG 199.A NH2 ASP 229.A O ARG 199.A HH21 3.248 2.632 ARG 199.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 199.A HH21 2.873 2.101 GLU 200.A N PHE 196.A O GLU 200.A H 2.994 2.145 SER 201.A N LYS 197.A O SER 201.A H 3.290 2.523 SER 201.A N VAL 198.A O SER 201.A H 3.306 2.599 GLY 202.A N ARG 199.A O GLY 202.A H 3.217 2.312 SER 203.A N SER 201.A OG SER 203.A H 3.121 2.284 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 3.139 2.245 GLU 207.A N GLU 207.A OE1 GLU 207.A H 3.033 2.246 HIS 208.A N SER 205.A O HIS 208.A H 3.080 2.176 GLY 209.A N LYS 103.A O GLY 209.A H 2.833 2.051 VAL 212.A N GLY 106.A O VAL 212.A H 3.154 2.255 VAL 213.A N ILE 82.A O VAL 213.A H 2.769 1.877 HIS 214.A N VAL 108.A O HIS 214.A H 2.956 2.093 HIS 214.A ND1 CYS 215.A O HIS 214.A HD1 2.944 2.101 HIS 214.A NE2 TYR 124.A OH HIS 214.A HE2 2.668 1.872 ARG 221.A NH1 LEU 110.A O ARG 221.A HH11 3.105 2.253 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH12 3.394 2.752 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 221.A HH12 2.952 2.090 ARG 221.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH22 2.970 2.202 GLY 223.A N ILE 219.A O GLY 223.A H 3.309 2.603 THR 224.A N GLY 220.A O THR 224.A H 3.101 2.271 PHE 225.A N ARG 221.A O PHE 225.A H 3.105 2.247 CYS 226.A N SER 222.A O CYS 226.A H 3.302 2.425 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 2.990 2.109 ALA 228.A N THR 224.A O ALA 228.A H 3.039 2.146 ASP 229.A N PHE 225.A O ASP 229.A H 3.069 2.165 THR 230.A N CYS 226.A O THR 230.A H 2.947 2.045 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H 3.005 2.099 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 3.086 2.192 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 3.051 2.199 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.938 2.058 MET 235.A N CYS 231.A O MET 235.A H 3.054 2.227 ASP 236.A N LEU 232.A O ASP 236.A H 3.211 2.401 LYS 237.A N LEU 233.A O LYS 237.A H 3.103 2.377 LYS 237.A N LEU 234.A O LYS 237.A H 3.243 2.566 LYS 237.A NZ GLU 76.A O LYS 237.A HZ3 3.053 2.179 ARG 238.A N LEU 234.A O ARG 238.A H 3.097 2.290 ARG 238.A NE GLU 76.A OE2 ARG 238.A HE 2.743 1.871 ARG 238.A NH1 SER 243.A OG ARG 238.A HH11 3.385 2.555 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 238.A HH21 2.444 1.551 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 238.A HH21 3.314 2.646 SER 242.A N ASP 240.A OD1 SER 242.A H 3.202 2.466 SER 243.A N ASP 240.A O SER 243.A H 3.045 2.157 VAL 244.A N PRO 241.A O VAL 244.A H 3.293 2.407 LYS 247.A NZ GLU 6.A OE2 LYS 247.A HZ3 2.672 1.961 LYS 248.A N ASP 245.A OD1 LYS 248.A H 3.363 2.508 LYS 248.A NZ ASP 245.A OD2 LYS 248.A HZ1 3.030 2.129 VAL 249.A N ASP 245.A O VAL 249.A H 3.015 2.155 LEU 250.A N ILE 246.A O LEU 250.A H 2.931 2.047 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 3.063 2.182 GLU 252.A N LYS 248.A O GLU 252.A H 3.067 2.208 MET 253.A N VAL 249.A O MET 253.A H 3.015 2.135 ARG 254.A N LEU 250.A O ARG 254.A H 2.920 2.069 ARG 254.A NE LEU 260.A O ARG 254.A HE 2.910 2.140 ARG 254.A NH2 LEU 260.A O ARG 254.A HH21 2.946 2.193 ARG 254.A NH2 ILE 261.A O ARG 254.A HH21 2.988 2.381 LYS 255.A N GLU 252.A O LYS 255.A H 3.047 2.215 LYS 255.A NZ GLU 252.A OE2 LYS 255.A HZ1 3.095 2.215 PHE 256.A N MET 253.A O PHE 256.A H 2.892 1.990 ARG 257.A NE GLY 218.A O ARG 257.A HE 3.026 2.201 ARG 257.A NH1 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH12 3.180 2.391 ARG 257.A NH1 SER 70.A OG ARG 257.A HH11 3.028 2.163 ARG 257.A NH2 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH22 3.023 2.182 ARG 257.A NH2 ALA 217.A O ARG 257.A HH21 3.068 2.259 ILE 261.A N ILE 219.A O ILE 261.A H 2.932 2.086 GLN 262.A N GLN 266.A OE1 GLN 262.A H 2.806 1.896 GLN 266.A N THR 263.A OG1 GLN 266.A H 2.985 2.100 LEU 267.A N THR 263.A O LEU 267.A H 3.113 2.293 ARG 268.A N ALA 264.A O ARG 268.A H 3.000 2.107 ARG 268.A NE ASP 11.A OD1 ARG 268.A HE 3.020 2.141 ARG 268.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 268.A HH21 2.965 2.068 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 2.936 2.051 SER 270.A N GLN 266.A O SER 270.A H 3.027 2.210 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 3.156 2.273 LEU 272.A N ARG 268.A O LEU 272.A H 2.994 2.122 ALA 273.A N PHE 269.A O ALA 273.A H 2.932 2.081 VAL 274.A N SER 270.A O VAL 274.A H 3.071 2.203 ILE 275.A N TYR 271.A O ILE 275.A H 2.897 1.996 GLU 276.A N LEU 272.A O GLU 276.A H 2.991 2.094 GLY 277.A N ALA 273.A O GLY 277.A H 2.853 2.022 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 2.929 2.122 LYS 279.A N GLU 276.A O LYS 279.A H 3.374 2.613 LYS 279.A NZ GLU 4.A OE1 LYS 279.A HZ2 3.544 2.864 LYS 279.A NZ GLU 4.A OE2 LYS 279.A HZ2 3.560 2.694 PHE 280.A N GLY 277.A O PHE 280.A H 2.962 2.069 ILE 281.A N GLY 277.A O ILE 281.A H 3.444 2.573 MET 282.A N ALA 278.A O MET 282.A H 2.952 2.107 GLY 283.A N PHE 280.A O GLY 283.A H 2.845 1.942 ASP 284.A N PHE 280.A O ASP 284.A H 3.276 2.552