Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7gtp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 2.A O LYS 5.A H 3.013 2.182 GLU 6.A N GLU 2.A O GLU 6.A H 3.125 2.231 PHE 7.A N MET 3.A O PHE 7.A H 2.741 1.949 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.399 2.535 GLN 9.A N LYS 5.A O GLN 9.A H 3.056 2.190 ILE 10.A N GLU 6.A O ILE 10.A H 2.918 2.040 ASP 11.A N PHE 7.A O ASP 11.A H 2.767 1.897 LYS 12.A N GLU 8.A O LYS 12.A H 2.875 1.976 SER 13.A N GLN 9.A O SER 13.A H 3.205 2.343 GLY 14.A N ASP 11.A O GLY 14.A H 3.084 2.245 SER 15.A N ILE 10.A O SER 15.A H 3.268 2.421 TRP 16.A NE1 ASP 11.A OD1 TRP 16.A HE1 3.124 2.314 ALA 18.A N SER 15.A O ALA 18.A H 3.020 2.289 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 3.067 2.183 TYR 20.A N TRP 16.A O TYR 20.A H 3.008 2.115 TYR 20.A OH ILE 261.A O TYR 20.A HH 2.708 1.813 GLN 21.A N ALA 17.A O GLN 21.A H 3.346 2.521 ASP 22.A N ALA 18.A O ASP 22.A H 3.127 2.279 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 3.153 2.294 ARG 24.A N TYR 20.A O ARG 24.A H 2.953 2.070 ARG 24.A NE GLN 21.A OE1 ARG 24.A HE 3.220 2.381 HIS 25.A N GLN 21.A O HIS 25.A H 2.822 2.001 GLU 26.A N ASP 22.A O GLU 26.A H 3.056 2.236 ALA 27.A N ARG 24.A O ALA 27.A H 3.424 2.600 ARG 33.A N ASP 53.A OD2 ARG 33.A H 2.759 1.899 VAL 34.A N ASP 53.A OD1 VAL 34.A H 2.995 2.089 LYS 36.A N ARG 33.A O LYS 36.A H 3.350 2.619 LEU 37.A N VAL 34.A O LEU 37.A H 3.040 2.181 ASN 40.A N LEU 37.A O ASN 40.A H 3.051 2.157 ASN 40.A ND2 VAL 34.A O ASN 40.A HD22 3.149 2.282 LYS 41.A N PRO 38.A O LYS 41.A H 3.341 2.509 ARG 43.A N ASN 40.A O ARG 43.A H 3.014 2.152 ARG 43.A NH1 ASN 64.A O ARG 43.A HH12 3.320 2.486 ARG 43.A NH1 TYR 66.A O ARG 43.A HH11 2.806 2.024 ASN 44.A N LYS 41.A O ASN 44.A H 3.401 2.515 ASN 44.A ND2 ALA 35.A O ASN 44.A HD21 3.187 2.489 ARG 45.A N GLN 85.A OE1 ARG 45.A H 2.974 2.102 ARG 45.A NE GLY 86.A O ARG 45.A HE 3.152 2.310 ARG 45.A NH2 GLY 86.A O ARG 45.A HH21 3.252 2.460 ARG 45.A NH2 PRO 87.A O ARG 45.A HH21 2.875 2.242 ASP 48.A N ASP 48.A OD1 ASP 48.A H 2.771 2.105 ASP 53.A N PRO 31.A O ASP 53.A H 2.925 2.032 HIS 54.A NE2 LYS 255.A O HIS 54.A HE2 2.925 2.194 SER 55.A OG PHE 256.A O SER 55.A HG 2.562 1.844 ARG 56.A NH1 ASP 65.A O ARG 56.A HH12 3.506 2.778 ARG 56.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH12 2.975 2.194 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH22 2.959 2.174 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 56.A HH22 3.179 2.373 ILE 57.A N ALA 69.A O ILE 57.A H 2.967 2.095 LEU 59.A N ASP 65.A O LEU 59.A H 2.953 2.072 HIS 60.A N GLU 101.A OE1 HIS 60.A H 2.950 2.060 GLN 61.A NE2 GLU 97.A OE1 GLN 61.A HE22 3.284 2.479 ASN 64.A ND2 ASN 40.A OD1 ASN 64.A HD21 2.585 1.706 TYR 66.A N ASN 64.A OD1 TYR 66.A H 3.019 2.219 ASN 68.A ND2 ASN 44.A OD1 ASN 68.A HD22 3.012 2.261 ASN 68.A ND2 VAL 49.A O ASN 68.A HD21 3.001 2.191 SER 70.A N LEU 83.A O SER 70.A H 2.938 2.117 LEU 71.A N SER 55.A O LEU 71.A H 2.946 2.053 ILE 72.A N TYR 81.A O ILE 72.A H 2.744 1.899 MET 74.A N ARG 79.A O MET 74.A H 2.975 2.085 GLN 78.A N GLU 75.A O GLN 78.A H 3.386 2.623 ARG 79.A N MET 74.A O ARG 79.A H 3.477 2.606 ARG 79.A NE ASP 229.A OD2 ARG 79.A HE 2.769 1.878 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 79.A HH21 3.068 2.186 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 79.A HH21 3.359 2.679 TYR 81.A N ILE 72.A O TYR 81.A H 3.049 2.189 TYR 81.A OH THR 230.A OG1 TYR 81.A HH 2.725 1.975 ILE 82.A N VAL 211.A O ILE 82.A H 2.965 2.055 LEU 83.A N SER 70.A O LEU 83.A H 3.064 2.248 THR 84.A N VAL 213.A O THR 84.A H 3.195 2.369 GLN 85.A N ASN 68.A O GLN 85.A H 3.459 2.617 GLN 85.A NE2 ARG 43.A O GLN 85.A HE21 2.896 2.192 GLY 86.A N SER 216.A O GLY 86.A H 2.925 2.064 LEU 88.A N THR 91.A OG1 LEU 88.A H 2.865 2.018 ASN 90.A ND2 ASN 42.A O ASN 90.A HD21 2.860 2.009 THR 91.A N LEU 88.A O THR 91.A H 2.825 1.959 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 2.857 1.982 TRP 96.A N VAL 92.A O TRP 96.A H 3.293 2.442 TRP 96.A NE1 TYR 124.A O TRP 96.A HE1 2.995 2.163 GLU 97.A N GLY 93.A O GLU 97.A H 3.063 2.175 MET 98.A N HIS 94.A O MET 98.A H 2.904 2.033 VAL 99.A N PHE 95.A O VAL 99.A H 3.025 2.143 TRP 100.A N TRP 96.A O TRP 100.A H 2.882 2.009 GLU 101.A N GLU 97.A O GLU 101.A H 2.814 1.916 GLN 102.A N MET 98.A O GLN 102.A H 2.884 2.021 LYS 103.A N TRP 100.A O LYS 103.A H 3.164 2.326 SER 104.A N VAL 99.A O SER 104.A H 3.313 2.502 ARG 105.A NH1 SER 201.A O ARG 105.A HH12 3.173 2.562 ARG 105.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 105.A HH21 3.075 2.305 VAL 107.A N LEU 172.A O VAL 107.A H 2.893 2.013 VAL 108.A N VAL 212.A O VAL 108.A H 2.909 2.028 MET 109.A N PHE 174.A O MET 109.A H 2.872 1.978 LEU 110.A N HIS 214.A O LEU 110.A H 3.167 2.380 ASN 111.A ND2 ARG 112.A O ASN 111.A HD22 2.927 2.220 ARG 112.A N GLU 115.A OE2 ARG 112.A H 2.783 1.891 GLU 115.A N SER 118.A O GLU 115.A H 3.007 2.205 LYS 116.A NZ ASP 181.A OD2 LYS 116.A HZ1 2.798 2.005 SER 118.A N GLU 115.A O SER 118.A H 3.070 2.176 LYS 120.A N VAL 113.A O LYS 120.A H 2.871 1.975 ALA 122.A N PRO 87.A O ALA 122.A H 3.033 2.151 GLN 123.A NE2 TRP 125.A O GLN 123.A HE22 3.037 2.275 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 2.890 2.052 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.731 1.977 LYS 131.A N LYS 128.A O LYS 131.A H 2.919 2.034 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.721 1.856 MET 133.A N LEU 142.A O MET 133.A H 2.981 2.122 PHE 135.A N LEU 140.A O PHE 135.A H 2.993 2.093 THR 138.A OG1 GLY 93.A O THR 138.A HG1 3.122 2.258 ASN 139.A N PHE 135.A O ASN 139.A H 2.790 2.139 LEU 140.A N PHE 135.A O LEU 140.A H 3.294 2.430 LYS 141.A N GLU 161.A O LYS 141.A H 2.995 2.121 LEU 142.A N MET 133.A O LEU 142.A H 2.923 2.022 THR 143.A N GLU 159.A O THR 143.A H 3.062 2.241 ILE 145.A N GLN 157.A O ILE 145.A H 2.932 2.050 SER 146.A N GLN 157.A O SER 146.A H 3.314 2.475 SER 146.A OG GLN 157.A OE1 SER 146.A HG 2.818 2.288 ASP 148.A N VAL 155.A O ASP 148.A H 2.871 2.009 LYS 150.A N TYR 153.A O LYS 150.A H 2.903 2.118 SER 151.A N GLU 297.A O SER 151.A H 2.509 1.630 SER 151.A OG HIS 296.A O SER 151.A HG 2.681 2.155 TYR 153.A OH GLU 297.A OE1 TYR 153.A HH 2.484 1.739 THR 154.A N HIS 175.A O THR 154.A H 2.955 2.099 VAL 155.A N ASP 148.A O VAL 155.A H 2.962 2.102 ARG 156.A N HIS 173.A O ARG 156.A H 2.895 2.020 ARG 156.A NE GLU 147.A OE2 ARG 156.A HE 2.570 1.736 GLN 157.A N SER 146.A O GLN 157.A H 2.910 2.092 GLN 157.A NE2 GLU 170.A OE2 GLN 157.A HE22 2.753 1.990 LEU 158.A N ILE 171.A O LEU 158.A H 2.927 2.044 GLU 159.A N THR 143.A O GLU 159.A H 2.973 2.127 LEU 160.A N ARG 169.A O LEU 160.A H 2.931 2.034 GLU 161.A N LYS 141.A O GLU 161.A H 2.772 1.867 ASN 162.A N GLU 167.A O ASN 162.A H 2.899 2.124 LEU 163.A N ASN 139.A O LEU 163.A H 3.153 2.379 THR 164.A N ASN 162.A OD1 THR 164.A H 2.759 1.961 THR 165.A N ASN 162.A O THR 165.A H 3.076 2.265 THR 165.A OG1 GLU 167.A OE2 THR 165.A HG1 2.743 1.751 GLN 166.A N ASN 162.A O GLN 166.A H 2.618 1.826 GLU 167.A N THR 165.A OG1 GLU 167.A H 3.327 2.439 ARG 169.A N LEU 160.A O ARG 169.A H 2.983 2.132 ARG 169.A NH1 TRP 100.A O ARG 169.A HH12 2.756 1.933 ILE 171.A N LEU 158.A O ILE 171.A H 2.985 2.169 LEU 172.A N ARG 105.A O LEU 172.A H 2.898 2.018 HIS 173.A N ARG 156.A O HIS 173.A H 2.953 2.057 PHE 174.A N VAL 107.A O PHE 174.A H 2.851 1.948 HIS 175.A N THR 154.A O HIS 175.A H 2.993 2.095 HIS 175.A NE2 ASN 111.A O HIS 175.A HE2 2.901 2.155 TYR 176.A N MET 109.A O TYR 176.A H 2.811 1.966 THR 177.A N TYR 152.A O THR 177.A H 2.670 1.845 TRP 179.A NE1 GLY 183.A O TRP 179.A HE1 2.935 2.255 GLY 183.A N PRO 180.A O GLY 183.A H 3.327 2.514 ALA 189.A N SER 187.A OG ALA 189.A H 2.976 2.287 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 3.368 2.484 ASN 193.A N ALA 189.A O ASN 193.A H 2.998 2.111 ASN 193.A ND2 TYR 152.A OH ASN 193.A HD22 2.668 1.790 ASN 193.A ND2 GLU 297.A OE1 ASN 193.A HD21 2.793 1.989 PHE 194.A N SER 190.A O PHE 194.A H 3.248 2.414 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 2.986 2.180 PHE 196.A N LEU 192.A O PHE 196.A H 2.994 2.131 LYS 197.A N ASN 193.A O LYS 197.A H 3.219 2.361 VAL 198.A N PHE 194.A O VAL 198.A H 3.126 2.275 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 3.105 2.276 ARG 199.A NE ASP 229.A OD1 ARG 199.A HE 2.884 2.084 ARG 199.A NH2 ASP 229.A O ARG 199.A HH21 3.227 2.675 ARG 199.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 199.A HH21 2.833 2.037 GLU 200.A N PHE 196.A O GLU 200.A H 2.887 2.000 SER 201.A N LYS 197.A O SER 201.A H 3.225 2.436 SER 201.A N VAL 198.A O SER 201.A H 3.279 2.597 GLY 202.A N ARG 199.A O GLY 202.A H 2.919 2.033 SER 203.A N SER 201.A OG SER 203.A H 3.170 2.368 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 3.273 2.390 GLU 207.A N GLU 207.A OE1 GLU 207.A H 3.061 2.327 HIS 208.A N SER 205.A O HIS 208.A H 3.084 2.181 GLY 209.A N LYS 103.A O GLY 209.A H 2.899 2.190 VAL 212.A N GLY 106.A O VAL 212.A H 3.211 2.309 VAL 213.A N ILE 82.A O VAL 213.A H 2.793 1.903 HIS 214.A N VAL 108.A O HIS 214.A H 3.047 2.208 HIS 214.A ND1 CYS 215.A O HIS 214.A HD1 2.770 2.004 HIS 214.A NE2 TYR 124.A OH HIS 214.A HE2 2.847 2.147 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH12 3.162 2.399 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 221.A HH12 3.011 2.164 ARG 221.A NH1 TRP 179.A O ARG 221.A HH11 2.846 2.150 ARG 221.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH22 3.540 2.877 THR 224.A N GLY 220.A O THR 224.A H 3.155 2.353 PHE 225.A N ARG 221.A O PHE 225.A H 3.116 2.348 CYS 226.A N SER 222.A O CYS 226.A H 3.341 2.468 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 2.982 2.112 ALA 228.A N THR 224.A O ALA 228.A H 3.249 2.354 ASP 229.A N PHE 225.A O ASP 229.A H 3.132 2.234 THR 230.A N CYS 226.A O THR 230.A H 3.072 2.188 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H 3.035 2.141 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 3.165 2.279 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 3.124 2.281 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.988 2.125 MET 235.A N CYS 231.A O MET 235.A H 3.189 2.395 ASP 236.A N LEU 232.A O ASP 236.A H 3.288 2.488 LYS 237.A N LEU 233.A O LYS 237.A H 3.193 2.371 LYS 239.A N MET 235.A O LYS 239.A H 2.864 2.193 SER 243.A N ASP 240.A O SER 243.A H 2.689 2.022 LYS 247.A NZ GLU 6.A OE2 LYS 247.A HZ3 2.585 1.873 LYS 248.A NZ ASP 245.A OD2 LYS 248.A HZ1 2.878 1.987 VAL 249.A N ASP 245.A O VAL 249.A H 3.056 2.215 LEU 250.A N ILE 246.A O LEU 250.A H 2.906 2.048 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 3.015 2.131 GLU 252.A N LYS 248.A O GLU 252.A H 3.132 2.294 MET 253.A N VAL 249.A O MET 253.A H 2.956 2.135 ARG 254.A N LEU 250.A O ARG 254.A H 2.818 2.025 ARG 254.A NE LEU 260.A O ARG 254.A HE 2.950 2.246 ARG 254.A NH2 LEU 260.A O ARG 254.A HH21 2.866 2.145 ARG 254.A NH2 ILE 261.A O ARG 254.A HH21 2.923 2.357 LYS 255.A N GLU 252.A O LYS 255.A H 3.232 2.385 LYS 255.A NZ GLU 252.A OE1 LYS 255.A HZ1 2.744 2.087 PHE 256.A N MET 253.A O PHE 256.A H 3.005 2.114 ARG 257.A NE GLY 218.A O ARG 257.A HE 3.061 2.227 ARG 257.A NH1 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH12 3.245 2.463 ARG 257.A NH1 SER 70.A OG ARG 257.A HH11 2.899 2.033 ARG 257.A NH2 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH22 3.036 2.184 ARG 257.A NH2 ALA 217.A O ARG 257.A HH21 3.239 2.418 ILE 261.A N ILE 219.A O ILE 261.A H 2.819 1.991 GLN 262.A N GLN 266.A OE1 GLN 262.A H 2.786 1.875 GLN 262.A NE2 GLY 259.A O GLN 262.A HE22 2.626 1.825 ASP 265.A N THR 263.A OG1 ASP 265.A H 3.208 2.563 GLN 266.A N THR 263.A OG1 GLN 266.A H 3.010 2.119 LEU 267.A N THR 263.A O LEU 267.A H 3.219 2.369 ARG 268.A N ALA 264.A O ARG 268.A H 3.114 2.254 ARG 268.A NE ASP 11.A OD1 ARG 268.A HE 3.128 2.261 ARG 268.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 268.A HH21 3.014 2.119 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 2.793 1.917 SER 270.A N GLN 266.A O SER 270.A H 2.924 2.052 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 3.254 2.376 LEU 272.A N ARG 268.A O LEU 272.A H 3.130 2.243 ALA 273.A N PHE 269.A O ALA 273.A H 2.726 1.866 VAL 274.A N SER 270.A O VAL 274.A H 3.031 2.163 ILE 275.A N TYR 271.A O ILE 275.A H 2.893 1.982 GLU 276.A N LEU 272.A O GLU 276.A H 2.888 2.005 GLY 277.A N ALA 273.A O GLY 277.A H 2.776 1.935 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 2.908 2.174 LYS 279.A N GLU 276.A O LYS 279.A H 3.198 2.355 LYS 279.A NZ ILE 275.A O LYS 279.A HZ3 2.844 1.937 PHE 280.A N GLY 277.A O PHE 280.A H 3.069 2.418 MET 282.A N ALA 278.A O MET 282.A H 3.479 2.620 GLY 283.A N PHE 280.A O GLY 283.A H 2.483 1.612 VAL 287.A N ASP 284.A OD1 VAL 287.A H 3.319 2.545 GLN 288.A N SER 285.A O GLN 288.A H 3.144 2.304 GLN 288.A NE2 GLU 200.A OE2 GLN 288.A HE21 2.560 1.829 GLN 290.A N SER 286.A O GLN 290.A H 3.233 2.401 TRP 291.A N VAL 287.A O TRP 291.A H 2.878 2.017 TRP 291.A NE1 GLU 276.A OE2 TRP 291.A HE1 3.329 2.471 LYS 292.A N GLN 288.A O LYS 292.A H 3.162 2.273 GLU 293.A N ASP 289.A O GLU 293.A H 3.040 2.170 LEU 294.A N GLN 290.A O LEU 294.A H 2.811 1.905 SER 295.A N TRP 291.A O SER 295.A H 2.782 2.107 SER 295.A N LYS 292.A O SER 295.A H 3.320 2.593 SER 295.A OG TYR 152.A OH SER 295.A HG 3.413 2.791 HIS 296.A N GLU 293.A O HIS 296.A H 3.079 2.252