Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7jnu_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N LYS 17.A O MET 1.A H2 3.479 2.745 ALA 5.A N GLY 13.A O ALA 5.A H 3.072 2.242 MET 6.A N MET 55.A O MET 6.A H 2.989 2.203 LEU 7.A N LYS 11.A O LEU 7.A H 3.002 2.380 SER 8.A N LYS 11.A O SER 8.A H 3.421 2.611 LYS 11.A N SER 8.A O LYS 11.A H 2.918 2.059 GLY 13.A N ALA 5.A O GLY 13.A H 3.069 2.264 LYS 17.A NZ ASN 54.A O LYS 17.A HZ1 2.870 2.205 LYS 17.A NZ ASP 117.A OD1 LYS 17.A HZ2 3.393 2.595 GLY 23.A N ASP 26.A OD2 GLY 23.A H 2.926 2.157 ASP 26.A N GLY 23.A O ASP 26.A H 3.091 2.287 ALA 27.A N VAL 126.A O ALA 27.A H 3.092 2.270 ILE 28.A N GLU 67.A O ILE 28.A H 3.215 2.526 VAL 29.A N PHE 124.A O VAL 29.A H 3.174 2.347 ARG 30.A N GLU 64.A O ARG 30.A H 3.251 2.455 ARG 30.A NE GLU 64.A OE2 ARG 30.A HE 2.866 2.097 ARG 30.A NH2 GLU 64.A OE2 ARG 30.A HH21 3.045 2.348 LEU 32.A N VAL 62.A O LEU 32.A H 2.587 1.753 ALA 33.A N VAL 62.A O ALA 33.A H 3.156 2.354 VAL 34.A N VAL 349.A O VAL 34.A H 3.083 2.271 ALA 35.A N GLU 60.A O ALA 35.A H 3.164 2.439 CYS 37.A SG ASP 150.A OD2 no hydrogen 3.376 N/A ASP 40.A N CYS 37.A O ASP 40.A H 3.192 2.505 ILE 41.A N THR 38.A O ILE 41.A H 3.097 2.469 HIS 42.A N THR 38.A O HIS 42.A H 3.426 2.615 HIS 42.A ND1 GLU 46.A OE1 HIS 42.A HD1 2.772 2.017 THR 43.A N SER 39.A O THR 43.A H 3.172 2.357 THR 43.A OG1 SER 39.A O THR 43.A HG1 3.453 2.736 VAL 44.A N ASP 40.A O VAL 44.A H 3.027 2.276 PHE 45.A N ILE 41.A O PHE 45.A H 2.804 1.949 GLU 46.A N HIS 42.A O GLU 46.A H 3.229 2.491 GLY 50.A N GLY 47.A O GLY 50.A H 3.463 2.610 ARG 52.A NE ASN 114.A O ARG 52.A HE 2.451 1.655 ARG 52.A NH1 GLU 51.A O ARG 52.A HH11 3.350 2.601 ARG 52.A NH2 ASN 114.A O ARG 52.A HH21 2.724 2.049 ASN 54.A N MET 6.A O ASN 54.A H 2.803 2.164 ILE 56.A N ASP 117.A OD1 ILE 56.A H 3.223 2.396 LEU 57.A N PHE 4.A O LEU 57.A H 2.780 1.954 HIS 59.A NE2 ASP 150.A OD2 no hydrogen 2.870 N/A VAL 62.A N ALA 33.A O VAL 62.A H 2.858 2.033 GLY 63.A N VAL 81.A O GLY 63.A H 3.114 2.278 GLU 64.A N ARG 30.A O GLU 64.A H 3.044 2.232 VAL 65.A N ASP 79.A O VAL 65.A H 2.987 2.165 VAL 66.A N ILE 28.A O VAL 66.A H 3.345 2.494 GLU 67.A N ILE 28.A O GLU 67.A H 3.278 2.491 GLU 71.A N PRO 24.A O GLU 71.A H 2.862 2.015 VAL 72.A N GLY 69.A O VAL 72.A H 3.373 2.558 LYS 73.A N ASP 130.A OD1 LYS 73.A H 3.266 2.503 LYS 73.A N ASP 130.A OD2 LYS 73.A H 3.049 2.246 ASP 74.A N ASP 130.A OD1 ASP 74.A H 2.974 2.134 LYS 76.A N ASP 79.A OD2 LYS 76.A H 2.900 2.046 GLY 78.A N VAL 65.A O GLY 78.A H 2.630 1.805 ASP 79.A N LYS 76.A O ASP 79.A H 3.291 2.502 VAL 81.A N GLY 63.A O VAL 81.A H 2.990 2.146 VAL 82.A N ALA 134.A O VAL 82.A H 2.771 1.974 VAL 83.A N ALA 61.A O VAL 83.A H 3.407 2.607 ALA 85.A N PRO 149.A O ALA 85.A H 3.241 2.391 THR 87.A N GLY 109.A O THR 87.A H 3.114 2.519 TRP 90.A NE1 ASN 132.A OD1 TRP 90.A HE1 2.966 2.115 GLU 94.A N GLU 94.A OE1 GLU 94.A H 3.030 2.288 ARG 97.A N SER 93.A O ARG 97.A H 3.288 2.608 ARG 97.A N GLU 94.A O ARG 97.A H 3.125 2.485 GLY 98.A N VAL 95.A O GLY 98.A H 3.107 2.323 TYR 99.A N GLU 94.A O TYR 99.A H 3.449 2.595 GLN 101.A N GLN 101.A OE1 GLN 101.A H 2.832 2.020 GLN 101.A NE2 LEU 294.A O GLN 101.A HE21 2.975 2.214 HIS 102.A N TYR 99.A O HIS 102.A H 3.129 2.314 SER 103.A N HIS 100.A O SER 103.A H 3.059 2.248 SER 103.A OG ASP 89.A O SER 103.A HG 2.460 1.748 GLY 104.A N GLU 94.A OE1 GLY 104.A H 3.148 2.319 GLY 105.A N HIS 102.A O GLY 105.A H 3.175 2.316 LEU 107.A N HIS 102.A ND1 LEU 107.A H 3.089 2.232 ALA 108.A N GLY 105.A O ALA 108.A H 3.126 2.281 GLY 109.A N GLN 101.A O GLY 109.A H 2.732 1.928 TRP 110.A N LEU 107.A O TRP 110.A H 3.126 2.355 SER 113.A N LYS 116.A O SER 113.A H 2.877 2.178 SER 113.A OG PHE 112.A O SER 113.A HG 2.615 1.945 ASN 114.A N LYS 111.A O ASN 114.A H 3.008 2.322 ASN 114.A ND2 TRP 110.A O ASN 114.A HD22 2.746 1.903 VAL 115.A N LYS 111.A O VAL 115.A H 3.062 2.276 LYS 116.A NZ HIS 125.A O LYS 116.A HZ3 2.803 2.209 GLY 118.A N ILE 56.A O GLY 118.A H 3.062 2.296 VAL 119.A N GLY 58.A O VAL 119.A H 3.145 2.369 PHE 120.A N LEU 57.A O PHE 120.A H 3.225 2.409 PHE 124.A N VAL 29.A O PHE 124.A H 3.186 2.402 HIS 125.A NE2 ASP 26.A OD2 HIS 125.A HE2 2.925 2.273 VAL 126.A N ALA 27.A O VAL 126.A H 2.976 2.149 ASN 127.A ND2 THR 87.A O ASN 127.A HD21 2.984 2.201 ASN 127.A ND2 ASP 89.A OD1 ASN 127.A HD22 3.169 2.591 ASP 128.A N ASP 26.A OD1 ASP 128.A H 3.149 2.325 ALA 129.A N PHE 25.A O ALA 129.A H 3.021 2.216 MET 131.A N ASP 128.A O MET 131.A H 2.894 2.144 ASN 132.A N ASP 128.A O ASN 132.A H 2.894 2.295 ASN 132.A N ALA 129.A O ASN 132.A H 3.301 2.559 ASN 132.A ND2 PRO 88.A O ASN 132.A HD21 3.138 2.287 ASN 132.A ND2 ASN 127.A O ASN 132.A HD22 2.985 2.153 ALA 134.A N VAL 82.A O ALA 134.A H 3.416 2.625 LEU 136.A N ARG 80.A O LEU 136.A H 2.665 1.825 GLU 139.A N GLU 139.A OE2 GLU 139.A H 2.623 1.866 ILE 140.A N PRO 137.A O ILE 140.A H 3.253 2.396 GLU 143.A N GLU 143.A OE1 GLU 143.A H 2.825 2.021 ALA 145.A N PRO 141.A O ALA 145.A H 3.014 2.186 VAL 146.A N LEU 142.A O VAL 146.A H 2.949 2.169 MET 147.A N ALA 144.A O MET 147.A H 3.116 2.291 ILE 148.A N ALA 145.A O ILE 148.A H 3.045 2.202 MET 152.A N MET 147.A O MET 152.A H 2.867 2.043 THR 153.A OG1 PRO 296.A O THR 153.A HG1 2.733 1.963 THR 154.A N ASP 150.A O THR 154.A H 2.929 2.134 GLY 155.A N MET 151.A O GLY 155.A H 3.041 2.182 PHE 156.A N MET 152.A O PHE 156.A H 2.861 2.009 HIS 157.A N THR 153.A O HIS 157.A H 3.018 2.263 HIS 157.A ND1 GLU 160.A OE1 HIS 157.A HD1 3.197 2.348 GLY 158.A N THR 154.A O GLY 158.A H 3.088 2.308 ALA 159.A N GLY 155.A O ALA 159.A H 3.278 2.488 GLU 160.A N PHE 156.A O GLU 160.A H 2.907 2.101 LEU 161.A N HIS 157.A O LEU 161.A H 2.820 1.978 ALA 162.A N GLY 158.A O ALA 162.A H 3.129 2.499 ALA 162.A N ALA 159.A O ALA 162.A H 3.246 2.550 ASP 163.A N GLU 160.A O ASP 163.A H 3.298 2.441 GLY 167.A N GLY 190.A O GLY 167.A H 2.743 1.892 ALA 168.A N GLU 165.A O ALA 168.A H 2.916 2.091 THR 169.A N ASP 237.A OD2 THR 169.A H 2.755 1.909 VAL 170.A N ARG 193.A O VAL 170.A H 2.959 2.119 ALA 171.A N ALA 238.A O ALA 171.A H 3.018 2.196 VAL 172.A N ILE 195.A O VAL 172.A H 2.870 2.060 LEU 173.A N ILE 240.A O LEU 173.A H 2.673 1.844 GLY 174.A N VAL 197.A O GLY 174.A H 3.075 2.325 LEU 180.A N GLY 176.A O LEU 180.A H 2.831 2.008 MET 181.A N PRO 177.A O MET 181.A H 3.292 2.477 ALA 182.A N VAL 178.A O ALA 182.A H 2.884 2.125 VAL 183.A N GLY 179.A O VAL 183.A H 2.891 2.110 ALA 184.A N LEU 180.A O ALA 184.A H 3.063 2.230 GLY 185.A N MET 181.A O GLY 185.A H 2.703 1.901 ALA 186.A N ALA 182.A O ALA 186.A H 2.843 2.002 LYS 187.A N VAL 183.A O LYS 187.A H 3.131 2.296 LEU 188.A N ALA 184.A O LEU 188.A H 2.944 2.169 ARG 189.A N GLY 185.A O ARG 189.A H 2.913 2.290 ARG 189.A N ALA 186.A O ARG 189.A H 3.017 2.332 GLY 190.A N LYS 187.A O GLY 190.A H 3.113 2.278 ALA 191.A N ALA 186.A O ALA 191.A H 2.994 2.145 GLY 192.A N ALA 168.A O GLY 192.A H 2.941 2.166 ARG 193.A NE ASP 214.A OD1 ARG 193.A HE 2.917 2.067 ARG 193.A NH1 LEU 230.A O ARG 193.A HH12 2.789 1.985 ARG 193.A NH2 ASP 214.A OD2 ARG 193.A HH21 2.988 2.140 ARG 193.A NH2 LEU 230.A O ARG 193.A HH22 3.563 2.973 ILE 194.A N THR 213.A OG1 ILE 194.A H 3.014 2.243 ILE 195.A N VAL 170.A O ILE 195.A H 2.836 2.006 ALA 196.A N ASP 214.A O ALA 196.A H 2.930 2.094 VAL 197.A N VAL 172.A O VAL 197.A H 3.027 2.229 GLY 198.A N VAL 216.A O GLY 198.A H 3.292 2.545 VAL 204.A N ARG 200.A O VAL 204.A H 2.865 2.043 ASP 205.A N PRO 201.A O ASP 205.A H 2.914 2.094 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.412 2.607 ALA 207.A N CYS 203.A O ALA 207.A H 2.903 2.123 LYS 208.A N VAL 204.A O LYS 208.A H 3.273 2.454 TYR 209.A N ASP 205.A O TYR 209.A H 3.205 2.418 TYR 210.A N ALA 206.A O TYR 210.A H 2.976 2.268 TYR 210.A N ALA 207.A O TYR 210.A H 3.236 2.595 TYR 210.A OH ASP 315.A O TYR 210.A HH 2.757 1.934 GLY 211.A N LYS 208.A O GLY 211.A H 3.298 2.511 ALA 212.A N ALA 207.A O ALA 212.A H 2.833 1.990 THR 213.A N ILE 194.A O THR 213.A H 2.872 2.122 THR 213.A OG1 ASP 214.A OD1 THR 213.A HG1 2.681 1.860 ASP 214.A N ILE 194.A O ASP 214.A H 3.137 2.365 VAL 216.A N ALA 196.A O VAL 216.A H 2.860 2.042 LYS 219.A N ASN 217.A OD1 LYS 219.A H 2.854 2.017 ASP 220.A N ASN 217.A O ASP 220.A H 3.247 2.389 GLU 224.A N GLU 224.A OE1 GLU 224.A H 2.597 1.773 GLN 226.A N PRO 222.A O GLN 226.A H 3.083 2.257 GLN 226.A NE2 ASN 217.A O GLN 226.A HE22 3.580 2.893 ILE 227.A N ILE 223.A O ILE 227.A H 2.941 2.108 MET 228.A N GLU 224.A O MET 228.A H 3.021 2.179 ASN 229.A N SER 225.A O ASN 229.A H 3.087 2.292 LEU 230.A N GLN 226.A O LEU 230.A H 3.197 2.416 THR 231.A N ILE 227.A O THR 231.A H 3.037 2.215 THR 231.A OG1 ILE 227.A O THR 231.A HG1 3.128 2.315 THR 231.A OG1 MET 228.A O THR 231.A HG1 3.449 2.984 GLU 232.A N ASN 229.A O GLU 232.A H 3.146 2.324 GLY 233.A N MET 228.A O GLY 233.A H 2.630 1.792 LYS 234.A N THR 231.A O LYS 234.A H 3.164 2.311 LYS 234.A NZ THR 231.A O LYS 234.A HZ2 2.772 2.010 GLY 235.A N THR 231.A OG1 GLY 235.A H 2.896 2.126 VAL 236.A N ILE 255.A O VAL 236.A H 2.861 2.059 ASP 237.A N THR 169.A O ASP 237.A H 2.847 2.162 ALA 239.A N THR 261.A O ALA 239.A H 3.020 2.211 ILE 240.A N ALA 171.A O ILE 240.A H 2.732 1.905 ILE 241.A N ALA 263.A O ILE 241.A H 2.725 1.904 ALA 242.A N LEU 173.A O ALA 242.A H 2.845 1.991 ASP 247.A N ASN 245.A OD1 ASP 247.A H 2.821 2.064 ILE 248.A N ASN 245.A O ILE 248.A H 3.115 2.292 MET 249.A N ALA 246.A O MET 249.A H 3.153 2.348 THR 251.A N ASP 247.A O THR 251.A H 3.250 2.452 ALA 252.A N ILE 248.A O ALA 252.A H 2.872 2.070 VAL 253.A N MET 249.A O VAL 253.A H 3.052 2.227 LYS 254.A N ALA 250.A O LYS 254.A H 3.095 2.354 LYS 254.A N THR 251.A O LYS 254.A H 3.184 2.573 ILE 255.A N THR 251.A O ILE 255.A H 3.228 2.483 VAL 256.A N ALA 252.A O VAL 256.A H 3.234 2.476 LYS 257.A N VAL 236.A O LYS 257.A H 2.967 2.145 LYS 257.A NZ ASP 237.A OD1 LYS 257.A HZ2 2.958 2.160 GLY 259.A N ALA 286.A O GLY 259.A H 3.209 2.467 GLY 260.A N LYS 257.A O GLY 260.A H 2.930 2.097 ILE 262.A N THR 289.A O ILE 262.A H 2.686 1.841 ALA 263.A N ALA 239.A O ALA 263.A H 2.806 1.973 ASN 264.A N LYS 291.A O ASN 264.A H 2.787 1.971 ASN 264.A ND2 ASN 266.A O ASN 264.A HD21 3.246 2.490 VAL 265.A N ILE 241.A O VAL 265.A H 2.956 2.099 ASN 266.A ND2 GLY 244.A O ASN 266.A HD21 3.037 2.377 GLU 280.A N GLU 280.A OE1 GLU 280.A H 2.672 1.958 TRP 281.A N PRO 277.A O TRP 281.A H 3.044 2.356 TRP 281.A NE1 LYS 288.A O TRP 281.A HE1 2.837 2.046 GLY 282.A N LEU 279.A O GLY 282.A H 3.043 2.322 CYS 283.A N ARG 278.A O CYS 283.A H 2.600 1.830 GLY 284.A N TRP 281.A O GLY 284.A H 3.131 2.356 MET 285.A N GLY 282.A O MET 285.A H 3.081 2.362 ALA 286.A N TRP 281.A O ALA 286.A H 3.291 2.614 LYS 288.A NZ VAL 256.A O LYS 288.A HZ2 3.098 2.418 LYS 288.A NZ GLU 280.A O LYS 288.A HZ1 2.645 2.053 THR 289.A N GLY 260.A O THR 289.A H 3.102 2.393 LYS 291.A N ILE 262.A O LYS 291.A H 2.753 1.905 LYS 291.A NZ LEU 161.A O LYS 291.A HZ2 3.043 2.289 GLY 293.A N ASN 264.A O GLY 293.A H 3.299 2.533 GLY 297.A N HIS 100.A NE2 GLY 297.A H 3.052 2.333 ARG 299.A N MET 131.A O ARG 299.A H 2.684 1.915 ARG 299.A NE GLU 303.A OE2 ARG 299.A HE 2.865 2.027 ARG 299.A NH1 ASP 74.A OD2 ARG 299.A HH12 2.669 1.844 ARG 299.A NH1 ASP 130.A O ARG 299.A HH11 3.125 2.273 ARG 301.A NE THR 153.A OG1 ARG 301.A HE 3.038 2.181 ARG 301.A NH1 GLU 160.A OE1 ARG 301.A HH12 3.484 2.917 ARG 301.A NH1 GLU 160.A OE2 ARG 301.A HH12 2.845 2.003 ARG 301.A NH2 THR 153.A O ARG 301.A HH21 3.183 2.358 ARG 301.A NH2 GLU 160.A OE1 ARG 301.A HH22 3.182 2.549 MET 302.A N GLY 298.A O MET 302.A H 3.260 2.414 GLU 303.A N ARG 299.A O GLU 303.A H 2.797 1.955 ARG 304.A N LEU 300.A O ARG 304.A H 2.839 2.050 LEU 305.A N ARG 301.A O LEU 305.A H 3.048 2.219 ILE 306.A N MET 302.A O ILE 306.A H 2.780 1.947 ASP 307.A N GLU 303.A O ASP 307.A H 3.011 2.200 LEU 308.A N ARG 304.A O LEU 308.A H 3.140 2.354 VAL 309.A N LEU 305.A O VAL 309.A H 2.973 2.187 PHE 310.A N ILE 306.A O PHE 310.A H 2.632 1.800 TYR 311.A N ASP 307.A O TYR 311.A H 2.904 2.047 LYS 312.A N VAL 309.A O LYS 312.A H 3.016 2.195 ARG 313.A N LEU 308.A O ARG 313.A H 2.747 1.944 SER 317.A N ASP 315.A OD1 SER 317.A H 2.985 2.142 LYS 318.A NZ ASP 205.A OD2 LYS 318.A HZ1 3.491 2.862 LEU 319.A N PRO 316.A O LEU 319.A H 2.961 2.112 VAL 320.A N SER 317.A O VAL 320.A H 3.114 2.315 THR 321.A N LYS 346.A O THR 321.A H 3.355 2.613 HIS 322.A ND1 THR 321.A OG1 HIS 322.A HD1 2.794 2.083 PHE 324.A N VAL 348.A O PHE 324.A H 2.920 2.095 GLY 326.A N ILE 350.A O GLY 326.A H 2.969 2.167 ASN 329.A N GLY 326.A O ASN 329.A H 3.258 2.485 ASN 329.A ND2 ARG 325.A O ASN 329.A HD21 2.419 1.762 ILE 330.A N PHE 327.A O ILE 330.A H 2.912 2.072 GLU 331.A N ASP 328.A O GLU 331.A H 3.405 2.625 ALA 333.A N ASN 329.A O ALA 333.A H 3.049 2.193 PHE 334.A N ILE 330.A O PHE 334.A H 2.973 2.183 MET 335.A N GLU 331.A O MET 335.A H 3.315 2.485 LEU 336.A N LYS 332.A O LEU 336.A H 2.797 2.021 MET 337.A N PHE 334.A O MET 337.A H 3.090 2.335 ASP 339.A N MET 335.A O ASP 339.A H 2.813 1.973 LEU 344.A N PRO 341.A O LEU 344.A H 3.167 2.319 ILE 345.A N THR 321.A OG1 ILE 345.A H 3.120 2.297 LYS 346.A NZ PRO 36.A O LYS 346.A HZ1 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