Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7ldl_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 214.A OD1 GLY 2.A H 2.737 2.029 ARG 4.A N GLN 299.A OE1 ARG 4.A H 2.741 1.886 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.873 2.031 SER 10.A OG GLU 14.A OE2 SER 10.A HG 2.486 1.809 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 3.107 2.411 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.998 2.163 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.420 2.580 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.819 1.976 CYS 16.A SG LYS 12.A O CYS 16.A HG 3.388 2.471 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.141 2.283 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 3.077 2.254 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 3.048 2.196 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.891 2.038 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.714 1.933 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 3.116 2.337 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.200 2.363 THR 25.A OG1 CYS 44.A O THR 25.A HG1 3.122 2.471 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 3.077 2.243 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 3.131 2.282 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 2.958 2.274 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD21 3.032 2.558 ASN 28.A ND2 SER 144.A O ASN 28.A HD22 3.469 2.781 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 3.173 2.381 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.899 2.058 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.848 2.070 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.781 1.928 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.913 2.100 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 2.889 2.054 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.097 2.278 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.899 2.093 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.926 2.106 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.086 2.302 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.018 2.181 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.770 1.911 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 3.059 2.200 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 40.A HH21 3.524 2.888 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.245 2.400 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.020 2.172 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.250 2.404 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 3.370 2.510 LEU 50.A N GLU 47.A O LEU 50.A H 3.340 2.481 TYR 54.A OH ASP 187.A O TYR 54.A HH 2.674 1.851 GLU 55.A N ASN 53.A OD1 GLU 55.A H 3.145 2.550 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.019 2.185 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.926 2.129 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.898 2.115 ILE 59.A N GLU 55.A O ILE 59.A H 3.079 2.222 ARG 60.A N ASP 56.A O ARG 60.A H 3.308 2.615 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 2.903 2.049 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.728 1.873 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 3.075 2.283 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.117 2.280 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.692 1.834 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 3.027 2.238 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.676 1.894 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.707 1.895 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.750 1.922 GLY 79.A N LYS 90.A O GLY 79.A H 3.299 2.605 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.937 2.129 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 2.984 2.322 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.883 2.052 GLN 83.A NE2 GLU 178.A OE2 GLN 83.A HE22 2.994 2.317 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.829 1.993 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.963 2.167 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.093 2.237 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.902 2.147 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.764 1.913 LYS 88.A NZ GLN 83.A OE1 LYS 88.A HZ2 3.141 2.257 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.795 1.940 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.769 2.087 LYS 90.A NZ ASP 34.A OD1 LYS 90.A HZ3 2.779 2.020 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 2.932 2.087 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 3.045 2.340 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.891 2.072 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD22 3.041 2.189 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD21 2.873 2.024 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.960 2.139 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.142 2.348 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.840 2.010 LYS 100.A NZ ASP 155.A OD2 LYS 100.A HZ2 2.967 2.219 TYR 101.A OH ASP 33.A OD2 TYR 101.A HH 3.194 2.359 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.826 2.027 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.822 2.011 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 3.031 2.237 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 2.974 2.219 ARG 105.A NH1 PHE 181.A O ARG 105.A HH12 3.529 2.873 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.896 2.046 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.257 2.443 GLN 107.A N GLN 110.A OE1 GLN 107.A H 3.012 2.199 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.907 2.057 GLN 110.A N GLN 107.A O GLN 110.A H 3.269 2.424 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD2 THR 111.A HG1 2.697 1.934 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 2.944 2.143 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.845 2.004 SER 113.A OG GLN 127.A OE1 SER 113.A HG 2.708 2.076 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.755 1.911 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.162 2.342 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 3.073 2.435 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 2.884 2.092 CYS 117.A SG LEU 115.A O CYS 117.A HG 3.448 2.266 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 3.143 2.336 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.770 1.980 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 2.873 2.017 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.906 2.050 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.116 2.325 TYR 126.A OH SER 139.A O TYR 126.A HH 3.117 2.280 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H.A 2.969 2.214 ALA 129.A N GLU 290.A OE1 ALA 129.A H 3.198 2.540 MET 130.A N GLN 110.A O MET 130.A H 3.102 2.305 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.825 1.987 ARG 131.A NE ASP 197.A OD2 ARG 131.A HE 2.789 2.013 ARG 131.A NH1 ASP 197.A OD2 ARG 131.A HH11 3.395 2.801 ARG 131.A NH1 THR 198.A O ARG 131.A HH11 2.983 2.334 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 2.687 1.864 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH22 2.790 1.936 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 3.311 2.689 ARG 131.A NH2 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH21 2.809 2.043 ASN 133.A N ASP 197.A OD1 ASN 133.A H 3.359 2.603 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 2.884 2.043 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 3.068 2.261 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.346 2.515 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.713 1.967 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.838 2.018 GLY 138.A N HIS 172.A ND1 GLY 138.A H 3.031 2.350 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.974 2.210 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 3.053 2.287 SER 144.A OG LEU 141.A O SER 144.A HG 2.682 1.989 CYS 145.A SG HIS 164.A O no hydrogen 3.009 N/A GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.858 2.052 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 2.952 2.113 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.564 1.769 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.775 1.966 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.830 2.136 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 2.960 2.137 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD22 3.120 2.293 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.932 2.112 ASP 155.A N ASP 155.A OD1 ASP 155.A H 2.417 1.722 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 3.019 2.160 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 3.062 2.231 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.695 1.856 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.934 2.220 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.054 2.210 TYR 161.A N GLY 149.A O TYR 161.A H 3.311 2.556 MET 162.A N THR 175.A O MET 162.A H 2.754 1.949 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.901 2.127 HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.369 2.527 HIS 164.A NE2 THR 175.A OG1 HIS 164.A HE2 3.087 2.441 MET 165.A N ALA 173.A O MET 165.A H 3.105 2.351 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.710 1.920 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.874 2.032 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.894 2.130 HIS 172.A NE2 GLU 166.A OE1 HIS 172.A HE2 2.829 2.100 ALA 173.A N MET 165.A O ALA 173.A H 3.000 2.187 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 3.027 2.219 THR 175.A OG1 ASP 176.A O THR 175.A HG1 2.854 2.039 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 3.090 2.288 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 2.818 2.119 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 2.924 2.085 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 3.144 2.311 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.809 2.014 TYR 182.A OH CYS 160.A O TYR 182.A HH 2.631 2.006 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 2.939 2.119 ASP 187.A N ASP 187.A OD1 ASP 187.A H 2.588 1.896 ARG 188.A NE LEU 50.A O ARG 188.A HE 3.075 2.363 ARG 188.A NH2 LEU 50.A O ARG 188.A HH21 2.916 2.170 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 2.948 2.174 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 2.727 1.867 GLN 192.A NE2 ARG 188.A O GLN 192.A HE21 3.654 3.073 THR 198.A OG1 GLU 240.A OE2 THR 198.A HG1 2.570 1.760 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 2.989 2.162 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.978 2.143 THR 201.A OG1 GLU 240.A O THR 201.A HG1 2.632 1.992 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD21 3.049 2.197 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD22 2.836 2.007 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.075 2.260 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.003 2.175 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.011 2.223 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 2.929 2.104 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.857 2.071 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 3.057 2.322 TYR 209.A OH ILE 259.A O TYR 209.A HH 2.769 1.930 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.982 2.160 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.899 2.085 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.043 2.211 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 2.838 1.989 ASN 214.A N ALA 210.A O ASN 214.A H 2.984 2.284 ASN 214.A N ALA 211.A O ASN 214.A H 2.901 2.234 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD22 3.184 2.344 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 2.815 1.958 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 3.056 2.301 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.855 2.031 LEU 220.A N ARG 217.A O LEU 220.A H 2.986 2.129 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD21 3.286 2.451 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.996 2.208 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 3.016 2.245 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.969 2.144 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 3.129 2.306 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.064 2.325 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.909 2.122 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 2.918 2.085 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 3.120 2.328 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.202 2.342 ASN 238.A ND2 ASP 197.A O ASN 238.A HD21 2.936 2.360 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 2.965 2.125 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 2.949 2.099 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.730 1.879 THR 243.A N HIS 246.A ND1 THR 243.A H 3.157 2.332 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 2.882 2.035 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 2.885 2.047 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.795 1.985 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 2.931 2.277 ILE 249.A N HIS 246.A O ILE 249.A H 3.135 2.470 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.299 2.563 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.217 2.532 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 2.804 1.970 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.989 2.135 SER 254.A OG ILE 259.A O SER 254.A HG 2.774 1.943 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.857 2.069 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 2.976 2.141 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.129 2.390 THR 257.A OG1 LEU 253.A O THR 257.A HG1 2.985 2.191 THR 257.A OG1 SER 254.A O THR 257.A HG1 3.226 2.748 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.876 2.175 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 3.093 2.269 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.841 2.061 CYS 265.A SG VAL 261.A O CYS 265.A HG 3.447 2.418 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.233 2.448 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.242 2.537 SER 267.A N MET 264.A O SER 267.A H 3.085 2.476 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 3.058 2.227 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.894 2.072 LYS 269.A NZ ASP 229.A O LYS 269.A HZ2 3.400 2.828 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.311 2.477 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 2.931 2.085 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.861 2.080 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 2.969 2.171 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.797 2.061 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.724 2.031 ARG 279.A N MET 276.A O ARG 279.A H 2.835 1.988 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.844 2.026 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 2.887 2.028 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 2.852 2.007 SER 284.A OG GLU 288.A OE2 SER 284.A HG 3.216 2.405 LEU 286.A N SER 284.A OG LEU 286.A H 2.834 1.979 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 3.032 2.198 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 3.039 2.180 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 2.985 2.196 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 2.959 2.126 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.735 1.881 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 3.115 2.275 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O GLN 299.A HE22 2.891 2.118 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.891 2.044 SER 301.A N ARG 298.A O SER 301.A H 3.248 2.416 SER 301.A OG VAL 297.A O SER 301.A HG 3.174 2.421 GLY 302.A N ARG 298.A O GLY 302.A H 2.696 2.049 VAL 303.A N ARG 298.A O VAL 303.A H 3.315 2.531