Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7ndo_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 1.A N GLN 4.A OE1 THR 1.A H 2.995 2.202 GLN 4.A N THR 1.A OG1 GLN 4.A H 3.307 2.495 ILE 5.A N THR 1.A O ILE 5.A H 3.030 2.273 ILE 6.A N ALA 2.A O ILE 6.A H 3.033 2.200 SER 7.A N ASP 3.A O SER 7.A H 2.993 2.134 SER 7.A OG.A ASP 3.A O SER 7.A HG.A 2.933 2.181 ALA 8.A N GLN 4.A O ALA 8.A H 2.980 2.168 LEU 9.A N ILE 5.A O LEU 9.A H 2.940 2.127 LEU 10.A N ILE 6.A O LEU 10.A H 2.878 2.038 GLU 11.A N SER 7.A O GLU 11.A H 2.975 2.135 ALA 12.A N ALA 8.A O ALA 12.A H 3.097 2.474 ALA 12.A N LEU 9.A O ALA 12.A H 3.183 2.493 GLU 13.A N LEU 10.A O GLU 13.A H 3.258 2.403 SER 19.A N ASP 97.A OD1 SER 19.A H 2.947 2.092 GLU 20.A N ASP 97.A OD2 GLU 20.A H 3.102 2.505 TYR 21.A N SER 19.A OG TYR 21.A H 3.196 2.455 TYR 21.A N ASP 97.A OD2 TYR 21.A H 3.295 2.624 ASP 22.A N TYR 31.A OH ASP 22.A H 2.853 2.092 SER 24.A N ASP 22.A OD1 SER 24.A H 3.017 2.168 ARG 25.A N ASP 22.A O ARG 25.A H 3.151 2.321 SER 28.A N PRO 26.A O SER 28.A H 2.741 2.006 TYR 31.A N SER 28.A OG TYR 31.A H 3.264 2.467 MET 32.A N SER 28.A O MET 32.A H 2.906 2.076 MET 33.A N GLU 29.A O MET 33.A H 2.846 1.989 GLY 34.A N ALA 30.A O GLY 34.A H 2.929 2.132 LEU 35.A N TYR 31.A O LEU 35.A H 2.960 2.142 LEU 36.A N MET 32.A O LEU 36.A H 2.932 2.100 THR 37.A N MET 33.A O THR 37.A H 2.772 1.951 THR 37.A OG1 MET 33.A O THR 37.A HG1 2.860 2.158 ASN 38.A N GLY 34.A O ASN 38.A H 2.962 2.104 LEU 39.A N LEU 35.A O LEU 39.A H 2.925 2.104 ALA 40.A N LEU 36.A O ALA 40.A H 2.933 2.085 ASP 41.A N THR 37.A O ASP 41.A H 2.881 2.051 ARG 42.A N ASN 38.A O ARG 42.A H 2.910 2.092 ARG 42.A NE ASN 38.A OD1 ARG 42.A HE 2.685 1.851 ARG 42.A NH1 TYR 18.A O ARG 42.A HH12 2.891 2.151 ARG 42.A NH2 TYR 18.A O ARG 42.A HH22 2.805 2.033 ARG 42.A NH2 ASN 38.A OD1 ARG 42.A HH21 3.258 2.615 GLU 43.A N LEU 39.A O GLU 43.A H 2.872 2.065 LEU 44.A N ALA 40.A O LEU 44.A H 3.026 2.322 LEU 44.A N ASP 41.A O LEU 44.A H 3.291 2.615 MET 47.A N GLU 43.A O MET 47.A H 2.849 2.101 ILE 48.A N LEU 44.A O ILE 48.A H 3.022 2.257 ASN 49.A N VAL 45.A O ASN 49.A H 3.311 2.483 TRP 50.A N HIS 46.A O TRP 50.A H 2.958 2.134 ALA 51.A N MET 47.A O ALA 51.A H 2.809 1.983 LYS 52.A N ILE 48.A O LYS 52.A H 3.149 2.308 LYS 52.A NZ LEU 229.A O LYS 52.A HZ2 2.455 1.695 LYS 53.A N TRP 50.A O LYS 53.A H 2.824 2.041 VAL 54.A N ALA 51.A O VAL 54.A H 2.917 2.120 PHE 57.A N VAL 54.A O PHE 57.A H 3.012 2.188 ASP 59.A N GLY 56.A O ASP 59.A H 2.785 2.019 LEU 60.A N PHE 57.A O LEU 60.A H 3.114 2.263 ARG 62.A NE ASP 230.A OD1 ARG 62.A HE 2.917 2.106 ARG 62.A NH2 ASP 230.A OD1 ARG 62.A HH21 3.109 2.374 HIS 63.A ND1 ASP 64.A OD1 HIS 63.A HD1 3.274 2.422 ASP 64.A N SER 61.A OG ASP 64.A H 3.218 2.367 GLN 65.A N SER 61.A O GLN 65.A H 2.884 2.036 GLN 65.A NE2 PHE 57.A O GLN 65.A HE21 2.653 1.820 VAL 66.A N ARG 62.A O VAL 66.A H 2.842 1.993 HIS 67.A N HIS 63.A O HIS 67.A H 2.957 2.124 HIS 67.A NE2 GLY 147.A O no hydrogen 2.808 N/A HIS 67.A NE2 THR 150.A OG1 no hydrogen 2.692 N/A LEU 68.A N ASP 64.A O LEU 68.A H 2.969 2.141 LEU 69.A N GLN 65.A O LEU 69.A H 2.962 2.118 GLU 70.A N VAL 66.A O GLU 70.A H 2.732 1.883 SER 71.A N HIS 67.A O SER 71.A H 3.124 2.326 SER 71.A OG.B HIS 67.A O SER 71.A HG.B 3.141 2.362 ALA 72.A N LEU 68.A O ALA 72.A H 3.025 2.332 ALA 72.A N LEU 69.A O ALA 72.A H 3.212 2.566 TRP 73.A N LEU 69.A O TRP 73.A H 2.964 2.334 ILE 76.A N ALA 72.A O ILE 76.A H 2.904 2.104 LEU 77.A N TRP 73.A O LEU 77.A H 2.968 2.140 MET 78.A N LEU 74.A O MET 78.A H 2.854 2.059 ILE 79.A N GLU 75.A O ILE 79.A H 2.883 2.039 GLY 80.A N ILE 76.A O GLY 80.A H 3.134 2.300 LEU 81.A N LEU 77.A O LEU 81.A H 2.931 2.126 VAL 82.A N MET 78.A O VAL 82.A H 2.816 1.985 TRP 83.A N ILE 79.A O TRP 83.A H 2.919 2.084 ARG 84.A N GLY 80.A O ARG 84.A H 2.928 2.079 ARG 84.A NE LEU 93.A O ARG 84.A HE 3.103 2.308 ARG 84.A NH2 PHE 94.A O ARG 84.A HH21 3.049 2.431 SER 85.A N VAL 82.A O SER 85.A H 3.104 2.356 SER 85.A OG LEU 81.A O SER 85.A HG 2.656 1.886 MET 86.A N TRP 83.A O MET 86.A H 3.366 2.513 HIS 88.A N SER 85.A O HIS 88.A H 2.959 2.136 LYS 91.A N HIS 88.A O LYS 91.A H 2.963 2.161 LEU 92.A N LEU 100.A O LEU 92.A H 2.784 1.946 LEU 93.A N SER 85.A OG LEU 93.A H 2.817 1.976 ALA 95.A N LEU 98.A O ALA 95.A H 3.378 2.536 LEU 98.A N ALA 95.A O LEU 98.A H 2.880 2.025 LEU 100.A N LEU 92.A O LEU 100.A H 2.975 2.135 ASP 101.A N GLN 104.A OE1 ASP 101.A H 3.052 2.258 ARG 102.A NE ASP 116.A OD1 ARG 102.A HE 2.653 2.050 ARG 102.A NE ASP 116.A OD2 ARG 102.A HE 2.904 2.179 ARG 102.A NH2 ASP 116.A OD2 ARG 102.A HH21 3.005 2.324 GLN 104.A N ASP 101.A OD1 GLN 104.A H 2.862 2.029 GLY 105.A N ARG 102.A O GLY 105.A H 3.049 2.362 LYS 106.A N GLU 103.A O LYS 106.A H 2.971 2.200 SER 107.A OG GLN 104.A O SER 107.A HG 2.710 1.961 VAL 108.A N GLY 105.A O VAL 108.A H 3.248 2.506 PHE 115.A N MET 111.A O PHE 115.A H 2.845 2.015 ASP 116.A N VAL 112.A O ASP 116.A H 2.916 2.088 MET 117.A N GLU 113.A O MET 117.A H 3.189 2.360 LEU 118.A N ILE 114.A O LEU 118.A H 2.946 2.109 LEU 119.A N PHE 115.A O LEU 119.A H 2.879 2.039 ALA 120.A N ASP 116.A O ALA 120.A H 2.832 1.997 THR 121.A N MET 117.A O THR 121.A H 2.905 2.118 THR 121.A OG1 MET 117.A O THR 121.A HG1 2.721 1.882 SER 122.A N LEU 118.A O SER 122.A H 2.930 2.121 GLU 123.A N LEU 119.A O GLU 123.A H 2.979 2.167 ARG 124.A N ALA 120.A O ARG 124.A H 2.939 2.126 PHE 125.A N THR 121.A O PHE 125.A H 2.976 2.136 ARG 126.A N SER 122.A O ARG 126.A H 2.913 2.096 ARG 126.A NH1 MET 86.A O ARG 126.A HH11 3.132 2.325 GLU 127.A N GLU 123.A O GLU 127.A H 2.807 1.971 MET 128.A N ARG 124.A O MET 128.A H 2.985 2.166 LYS 129.A N ARG 126.A O LYS 129.A H 3.050 2.232 LEU 130.A N PHE 125.A O LEU 130.A H 3.145 2.293 GLN 131.A N GLU 134.A OE1 GLN 131.A H 2.901 2.050 GLN 131.A NE2 LYS 129.A O GLN 131.A HE22 3.007 2.149 GLU 133.A N GLU 133.A OE1 GLU 133.A H 2.630 1.853 PHE 135.A N GLN 131.A O PHE 135.A H 2.941 2.128 VAL 136.A N ARG 132.A O VAL 136.A H 3.010 2.191 CYS 137.A SG GLU 133.A O CYS 137.A HG 3.448 2.543 LEU 138.A N GLU 134.A O LEU 138.A H 2.980 2.170 LYS 139.A N PHE 135.A O LYS 139.A H 2.995 2.174 LYS 139.A NZ GLU 13.A OE1 LYS 139.A HZ2 2.722 1.847 ALA 140.A N VAL 136.A O ALA 140.A H 3.112 2.290 ILE 141.A N CYS 137.A O ILE 141.A H 2.902 2.096 ILE 142.A N LEU 138.A O ILE 142.A H 2.919 2.106 LEU 143.A N LYS 139.A O LEU 143.A H 3.148 2.341 LEU 144.A N ALA 140.A O LEU 144.A H 3.081 2.289 ASN 145.A N ILE 142.A O ASN 145.A H 3.398 2.615 SER 146.A N ILE 142.A O SER 146.A H 3.052 2.226 SER 146.A OG.A ILE 142.A O SER 146.A HG.A 2.906 2.223 VAL 148.A N ASN 145.A O VAL 148.A H 3.306 2.463 THR 150.A N GLY 147.A O THR 150.A H 3.299 2.450 THR 150.A OG1 GLY 147.A O THR 150.A HG1 2.993 2.218 ASN 156.A N LYS 152.A O ASN 156.A H 2.984 2.176 LYS 157.A N SER 153.A O LYS 157.A H 2.870 2.048 GLU 158.A N.A LEU 154.A O GLU 158.A H.A 3.015 2.173 LYS 159.A N GLU 155.A O LYS 159.A H.A 2.804 2.019 ILE 160.A N ASN 156.A O ILE 160.A H 3.093 2.296 HIS 161.A N LYS 157.A O HIS 161.A H 3.003 2.204 ARG 162.A N GLU 158.A O.A ARG 162.A H 2.982 2.170 MET 163.A N LYS 159.A O MET 163.A H 3.076 2.253 LEU 164.A N ILE 160.A O LEU 164.A H 2.958 2.123 ASP 165.A N HIS 161.A O ASP 165.A H 2.909 2.092 LYS 166.A N ARG 162.A O LYS 166.A H 3.094 2.331 ILE 167.A N LEU 164.A O ILE 167.A H 2.846 2.207 THR 168.A N LEU 164.A O THR 168.A H 2.968 2.145 THR 168.A OG1 LEU 164.A O THR 168.A HG1 3.501 2.704 ASP 169.A N ASP 165.A O ASP 169.A H 2.871 2.024 ALA 170.A N LYS 166.A O ALA 170.A H 3.133 2.349 LEU 171.A N ILE 167.A O LEU 171.A H 2.817 2.004 ILE 172.A N THR 168.A O ILE 172.A H 2.939 2.093 TRP 173.A N ASP 169.A O TRP 173.A H 2.841 2.015 TYR 174.A N ALA 170.A O TYR 174.A H 2.936 2.116 MET 175.A N LEU 171.A O MET 175.A H 3.212 2.374 ALA 176.A N ILE 172.A O ALA 176.A H 2.837 2.011 LYS 177.A N TRP 173.A O LYS 177.A H 2.798 1.990 SER 178.A N TYR 174.A O SER 178.A H 2.867 2.132 GLY 179.A N ALA 176.A O GLY 179.A H 3.246 2.440 LEU 180.A N MET 175.A O LEU 180.A H 3.234 2.422 SER 181.A N GLN 184.A OE1 SER 181.A H 2.894 2.057 GLN 184.A N SER 181.A OG GLN 184.A H 3.182 2.334 GLN 185.A N SER 181.A O GLN 185.A H 2.738 1.952 GLN 185.A NE2 LEU 180.A O GLN 185.A HE22 2.909 2.061 HIS 186.A N LEU 182.A O HIS 186.A H.A 3.109 2.280 GLN 187.A N GLN 183.A O GLN 187.A H 2.985 2.162 ARG 188.A N GLN 184.A O ARG 188.A H 2.878 2.029 ARG 188.A NE GLU 134.A OE2 ARG 188.A HE 2.657 1.820 ARG 188.A NH1 MET 128.A O ARG 188.A HH12 2.982 2.227 ARG 188.A NH2 MET 128.A O ARG 188.A HH22 2.912 2.134 ARG 188.A NH2 GLU 134.A OE1 ARG 188.A HH21 2.882 2.024 ARG 188.A NH2 GLU 134.A OE2 ARG 188.A HH21 3.476 2.886 LEU 189.A N GLN 185.A O LEU 189.A H 2.906 2.057 ALA 190.A N HIS 186.A O ALA 190.A H 3.047 2.207 GLN 191.A N GLN 187.A O GLN 191.A H 2.907 2.080 LEU 192.A N ARG 188.A O LEU 192.A H 2.971 2.159 LEU 193.A N LEU 189.A O LEU 193.A H 2.996 2.163 LEU 194.A N ALA 190.A O LEU 194.A H 2.896 2.086 ILE 195.A N GLN 191.A O ILE 195.A H 3.130 2.355 LEU 196.A N LEU 192.A O LEU 196.A H 3.165 2.446 SER 197.A N LEU 194.A O SER 197.A H 3.208 2.586 SER 197.A OG.B LEU 194.A O SER 197.A HG.B 2.518 1.724 HIS 198.A N ILE 195.A O HIS 198.A H 2.943 2.332 ILE 199.A N ILE 195.A O ILE 199.A H 2.997 2.192 ARG 200.A N LEU 196.A O ARG 200.A H 2.872 2.046 ARG 200.A NE GLU 75.A OE1 ARG 200.A HE 3.232 2.621 HIS 201.A N SER 197.A O HIS 201.A H 3.027 2.224 MET 202.A N HIS 198.A O MET 202.A H 2.804 1.992 SER 203.A N ILE 199.A O SER 203.A H 2.872 2.037 ASN 204.A N ARG 200.A O ASN 204.A H 2.901 2.064 LYS 205.A N HIS 201.A O LYS 205.A H 2.921 2.088 LYS 205.A NZ GLU 208.A OE1 LYS 205.A HZ1 3.198 2.373 GLY 206.A N MET 202.A O GLY 206.A H 2.756 1.941 MET 207.A N SER 203.A O MET 207.A H 2.791 1.974 GLU 208.A N ASN 204.A O GLU 208.A H 3.088 2.245 HIS 209.A N LYS 205.A O HIS 209.A H 2.996 2.246 HIS 209.A NE2 GLU 109.A O HIS 209.A HE2 2.821 2.194 LEU 210.A N GLY 206.A O LEU 210.A H 2.810 2.135 LEU 210.A N MET 207.A O LEU 210.A H 3.059 2.416 TYR 211.A N MET 207.A O TYR 211.A H 2.926 2.072 SER 212.A N GLU 208.A O SER 212.A H 3.156 2.317 SER 212.A OG GLU 208.A O SER 212.A HG 2.879 2.230 MET 213.A N HIS 209.A O MET 213.A H 3.312 2.602 LYS 214.A N TYR 211.A O LYS 214.A H 2.761 1.918 SER 215.A N LEU 210.A O SER 215.A H 3.451 2.607 LEU 225.A N SER 221.A O LEU 225.A H 3.107 2.266 LEU 226.A N TYR 222.A O LEU 226.A H 2.852 2.010 GLU 227.A N ASP 223.A O GLU 227.A H 2.985 2.216 MET 228.A N LEU 224.A O MET 228.A H 3.051 2.266 LEU 229.A N LEU 225.A O LEU 229.A H 3.067 2.311 ASP 230.A N GLU 227.A O ASP 230.A H 3.185 2.390 ALA 231.A N MET 228.A O ALA 231.A H 3.203 2.369