Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7nij_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N ASN 214.A O SER 1.A H3 2.885 2.257 SER 1.A OG ASN 214.A OD1 SER 1.A HG 2.517 2.056 LYS 5.A NZ GLU 290.A OE1 LYS 5.A HZ2 2.736 1.846 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.753 1.907 SER 10.A OG GLU 14.A OE2 SER 10.A HG 2.670 1.886 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 2.947 2.217 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.974 2.183 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.881 2.038 CYS 16.A SG LYS 12.A O CYS 16.A HG 3.617 2.586 MET 17.A N GLU 14.A O no hydrogen 3.314 N/A VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 3.024 2.217 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 2.942 2.085 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.904 2.046 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.960 2.223 THR 21.A OG1 THR 26.A OG1 THR 21.A HG1 2.906 2.185 CYS 22.A N THR 25.A O no hydrogen 2.912 N/A CYS 22.A SG.A ASN 65.A O CYS 22.A HG.A 3.617 2.690 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.182 2.335 THR 25.A OG1 CYS 44.A O THR 25.A HG1 2.950 2.134 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 2.876 2.053 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 3.143 2.292 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 3.118 2.414 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 2.973 2.237 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.928 2.101 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.770 1.965 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.726 1.891 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.958 2.158 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 2.995 2.173 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.031 2.215 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.836 1.996 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.792 1.964 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.022 2.228 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.124 2.301 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.790 1.932 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 3.099 2.244 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.274 2.424 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.255 2.396 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.060 2.214 THR 45.A N ASP 48.A OD2 THR 45.A H 3.364 2.511 THR 45.A OG1 GLU 47.A OE1 THR 45.A HG1 2.662 1.949 GLU 47.A N GLU 47.A OE1 GLU 47.A H 2.545 1.805 ASP 48.A N THR 45.A O ASP 48.A H 2.975 2.247 TYR 54.A OH ASP 187.A O TYR 54.A HH 2.861 2.036 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.236 2.380 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.923 2.082 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.795 1.987 ILE 59.A N GLU 55.A O ILE 59.A H 3.052 2.357 ILE 59.A N ASP 56.A O ILE 59.A H 3.247 2.588 ARG 60.A N LEU 57.A O ARG 60.A H 3.221 2.557 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 3.286 2.480 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.877 2.063 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.136 2.293 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.894 2.035 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.939 2.135 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.755 1.932 ASN 72.A ND2 ASN 72.A O ASN 72.A HD22 3.069 2.447 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 3.021 2.266 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.891 2.087 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.622 1.789 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.871 2.055 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 3.047 2.247 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.872 2.058 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.881 2.032 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 3.028 2.211 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.015 2.162 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.794 2.005 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.800 1.940 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.769 1.927 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.794 1.997 LYS 90.A NZ ASP 34.A OD1 LYS 90.A HZ2 3.388 2.667 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 3.039 2.182 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 3.272 2.501 THR 93.A OG1 ASP 92.A OD1 THR 93.A HG1 3.140 2.410 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.840 2.031 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD21 3.011 2.160 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD22 2.976 2.117 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.942 2.089 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.130 2.287 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.708 1.883 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.872 2.082 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 3.001 2.158 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 2.938 2.161 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 3.092 2.304 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.875 2.034 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.027 2.221 GLN 107.A N GLN 110.A OE1 GLN 107.A H 2.917 2.066 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.814 1.986 GLN 110.A N GLN 107.A O GLN 110.A H 3.160 2.318 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD1 THR 111.A HG1 3.522 2.921 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD2 THR 111.A HG1 2.713 1.917 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 2.979 2.190 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.935 2.102 SER 113.A OG GLN 127.A OE1 SER 113.A HG 2.640 2.115 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.791 1.956 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.269 2.481 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.781 2.076 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 3.098 2.278 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 3.109 2.284 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.578 1.770 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 3.191 2.331 SER 121.A OG TYR 118.A O SER 121.A HG 3.179 2.391 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.784 1.945 GLY 124.A N ALA 116.A O GLY 124.A H 3.208 2.423 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 3.113 2.323 TYR 126.A OH ASN 142.A O TYR 126.A HH 2.740 1.913 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.872 2.035 ALA 129.A N GLU 290.A OE2 ALA 129.A H 3.083 2.340 MET 130.A N GLN 110.A O MET 130.A H 2.941 2.120 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 3.072 2.221 ARG 131.A NE ASP 197.A OD1 ARG 131.A HE 3.232 2.384 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH12 2.988 2.137 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 3.380 2.740 ARG 131.A NH2 THR 198.A O ARG 131.A HH21 3.062 2.357 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 2.812 1.994 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 3.060 2.210 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.831 1.984 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.238 2.523 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.677 1.871 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.930 2.133 SER 139.A N ASN 142.A OD1 SER 139.A H 2.856 2.003 ASN 142.A N SER 139.A OG ASN 142.A H 3.084 2.243 GLY 143.A N SER 139.A O GLY 143.A H 3.019 2.302 GLY 143.A N PHE 140.A O GLY 143.A H 3.228 2.563 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 3.157 2.323 SER 144.A OG CYS 117.A O SER 144.A HG 3.247 2.727 CYS 145.A SG.A HIS 164.A O CYS 145.A HG.A 3.396 2.450 GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 2.924 2.076 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 3.057 2.208 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.971 2.322 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.803 1.983 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.846 2.133 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 2.904 2.094 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD21 3.240 2.458 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.976 2.149 ASP 155.A N ASP 155.A OD1 ASP 155.A H 2.719 2.103 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 3.046 2.200 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 2.907 2.059 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.776 1.936 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.927 2.138 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 2.992 2.155 TYR 161.A OH HIS 163.A ND1 TYR 161.A HH 3.176 2.346 MET 162.A N THR 175.A O no hydrogen 2.837 N/A HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.877 2.039 HIS 164.A N ALA 173.A O no hydrogen 3.017 N/A MET 165.A N ALA 173.A O MET 165.A H 2.987 2.136 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.730 1.935 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.722 1.884 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.887 2.044 ALA 173.A N MET 165.A O ALA 173.A H 2.947 2.113 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 3.020 2.223 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 2.999 2.205 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 2.976 2.315 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.011 2.163 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 2.949 2.106 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 2.967 2.142 TYR 182.A OH CYS 160.A O TYR 182.A HH 2.667 1.862 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 2.916 2.102 ARG 188.A NH1 ASN 51.A OD1 ARG 188.A HH11 2.877 2.292 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 2.662 1.806 GLN 189.A NE2 SER 46.A O GLN 189.A HE22 3.574 3.057 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 3.044 2.269 GLN 192.A NE2 THR 190.A O GLN 192.A HE21 3.626 2.902 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 2.962 2.127 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.923 2.072 THR 201.A OG1 GLU 240.A O THR 201.A HG1 2.673 1.961 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 2.995 2.371 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD22 3.199 2.406 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD21 2.919 2.079 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.136 2.340 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.051 2.220 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.047 2.244 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 3.002 2.196 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.922 2.130 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 3.022 2.206 TYR 209.A OH ILE 259.A O TYR 209.A HH 2.869 2.040 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 3.001 2.216 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.927 2.168 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.089 2.291 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 2.996 2.164 ASN 214.A N ALA 210.A O ASN 214.A H 3.092 2.378 ASN 214.A N ALA 211.A O ASN 214.A H 3.187 2.567 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD21 2.838 1.983 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 3.056 2.210 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 2.801 2.023 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 2.976 2.165 LEU 220.A N ARG 217.A O.A LEU 220.A H 3.148 2.295 LEU 220.A N ARG 217.A O.B LEU 220.A H 3.302 2.451 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD21 3.419 2.585 ASN 221.A ND2 GLU 270.A OE1 ASN 221.A HD22 3.218 2.399 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.973 2.132 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 3.182 2.347 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 2.961 2.120 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 2.998 2.198 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 3.052 2.197 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 3.097 2.350 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.894 2.062 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 2.994 2.166 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 2.987 2.278 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.274 2.423 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 2.986 2.135 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 3.003 2.149 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.779 1.930 GLN 244.A NE2 ASP 248.A OD1 GLN 244.A HE21 3.051 2.255 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.184 2.383 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 3.002 2.185 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.903 2.141 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 3.208 2.432 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.293 2.587 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.233 2.541 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 3.072 2.237 LEU 253.A N LEU 250.A O LEU 253.A H 3.067 2.472 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 3.024 2.200 SER 254.A OG ILE 259.A O SER 254.A HG 2.857 2.047 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.852 2.043 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 3.059 2.270 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.137 2.357 THR 257.A OG1 LEU 253.A O THR 257.A HG1 2.933 2.149 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.862 2.153 ILE 259.A N THR 257.A OG1 ILE 259.A H 3.351 2.578 ASP 263.A N ALA 260.A O ASP 263.A H 2.962 2.366 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 3.051 2.242 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.896 2.113 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.003 2.247 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.040 2.258 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 2.901 2.091 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.907 2.083 LYS 269.A NZ THR 225.A OG1 LYS 269.A HZ3 2.876 2.205 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.267 2.464 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 3.086 2.282 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.918 2.102 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 3.026 2.248 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.930 2.178 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.782 2.080 ARG 279.A N MET 276.A O ARG 279.A H 3.210 2.404 ARG 279.A NE MET 276.A O ARG 279.A HE 3.028 2.187 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.895 2.072 LEU 282.A N ASP 216.A OD2 LEU 282.A H 3.305 2.477 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 2.822 2.015 LEU 286.A N SER 284.A OG LEU 286.A H 3.136 2.311 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 3.071 2.223 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 3.020 2.182 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.080 2.257 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.083 2.247 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.964 2.123 ARG 298.A NH2 ASP 295.A OD1 ARG 298.A HH21 3.066 2.241 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 3.186 2.499 GLN 299.A N VAL 296.A O GLN 299.A H 3.152 2.470 GLN 299.A NE2 ASP 295.A O GLN 299.A HE21 3.491 3.029 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.784 2.160 CYS 300.A N VAL 297.A O CYS 300.A H 3.293 2.566