Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7nkd_d.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 5.A N MET 1.A O LEU 5.A H 2.442 1.717 ILE 6.A N ARG 2.A O ILE 6.A H 2.939 2.137 ARG 7.A N GLN 3.A O ARG 7.A H 2.869 2.053 GLN 8.A N GLN 4.A O GLN 8.A H 2.883 2.068 LEU 9.A N LEU 5.A O LEU 9.A H 2.942 2.103 ARG 10.A N ILE 6.A O ARG 10.A H 2.873 2.023 THR 11.A N ARG 7.A O THR 11.A H 2.870 2.035 THR 11.A OG1 GLN 8.A O THR 11.A HG1 2.513 2.088 GLY 12.A N GLN 8.A O GLY 12.A H 2.935 2.087 LEU 13.A N LEU 9.A O LEU 13.A H 2.913 2.061 GLY 14.A N ARG 10.A O GLY 14.A H 2.866 2.013 ALA 15.A N THR 11.A O ALA 15.A H 2.889 2.051 GLU 16.A N GLY 12.A O GLU 16.A H 2.954 2.108 ALA 17.A N LEU 13.A O ALA 17.A H 2.898 2.064 VAL 18.A N GLY 14.A O VAL 18.A H 2.883 2.051 ASN 19.A N ALA 15.A O ASN 19.A H 2.925 2.094 LYS 20.A N GLU 16.A O LYS 20.A H 2.957 2.114 ALA 21.A N ALA 17.A O ALA 21.A H 2.855 2.067 ALA 22.A N VAL 18.A O ALA 22.A H 2.881 2.062 GLU 23.A N ASN 19.A O GLU 23.A H 2.959 2.140 ILE 24.A N LYS 20.A O ILE 24.A H 2.872 2.048 VAL 25.A N ALA 21.A O VAL 25.A H 2.866 2.044 ARG 26.A N ALA 22.A O ARG 26.A H 2.935 2.089 ALA 27.A N GLU 23.A O ALA 27.A H 2.921 2.089 HIS 28.A N ILE 24.A O HIS 28.A H 2.867 2.025 VAL 29.A N VAL 25.A O VAL 29.A H 2.894 2.072 ALA 30.A N ALA 27.A O ALA 30.A H 3.146 2.367 ASP 31.A N HIS 28.A O ASP 31.A H 3.398 2.598 GLN 33.A N ASP 31.A OD1 GLN 33.A H 2.772 2.017 GLN 35.A N ASP 31.A O GLN 35.A H 3.252 2.491 SER 36.A N PRO 32.A O SER 36.A H 2.945 2.140 ALA 37.A N GLN 33.A O ALA 37.A H 2.897 2.074 THR 38.A N ALA 34.A O THR 38.A H 2.894 2.070 THR 38.A OG1 GLN 35.A O THR 38.A HG1 2.480 2.001 VAL 39.A N GLN 35.A O VAL 39.A H 2.936 2.101 ASP 40.A N SER 36.A O ASP 40.A H 2.912 2.085 ARG 41.A N ALA 37.A O ARG 41.A H 2.885 2.069 PHE 42.A N THR 38.A O PHE 42.A H 2.920 2.091 LEU 43.A N VAL 39.A O LEU 43.A H 2.917 2.082 SER 44.A N ASP 40.A O SER 44.A H 2.893 2.055 SER 44.A OG ASP 40.A O SER 44.A HG 2.819 1.980 GLU 45.A N ARG 41.A O GLU 45.A H 2.925 2.111 LEU 46.A N PHE 42.A O LEU 46.A H 2.892 2.126 GLU 47.A N LEU 43.A O GLU 47.A H 2.929 2.147 GLN 48.A N GLU 45.A O GLN 48.A H 3.085 2.410 GLN 48.A NE2 SER 44.A O GLN 48.A HE21 3.390 2.671 MET 49.A N LEU 46.A O MET 49.A H 2.798 2.006 SER 52.A N ILE 292.A O SER 52.A H 2.667 1.834 ASP 57.A N VAL 55.A O ASP 57.A H 3.077 2.487 THR 58.A N ASP 57.A OD1 THR 58.A H 2.484 1.873 LEU 64.A N THR 61.A O LEU 64.A H 3.101 2.265 ARG 69.A N ARG 65.A O ARG 69.A H 2.640 1.834 GLN 70.A N ALA 66.A O GLN 70.A H 2.895 2.057 SER 71.A N ALA 67.A O SER 71.A H 2.943 2.106 SER 71.A OG ARG 152.A O SER 71.A HG 2.447 1.638 LEU 72.A N SER 68.A O LEU 72.A H 2.862 2.036 ALA 73.A N ARG 69.A O ALA 73.A H 2.903 2.099 ALA 74.A N GLN 70.A O ALA 74.A H 2.955 2.119 LEU 75.A N SER 71.A O LEU 75.A H 2.896 2.095 VAL 76.A N LEU 72.A O VAL 76.A H 2.868 2.036 GLU 77.A N ALA 73.A O GLU 77.A H 2.955 2.123 LYS 78.A N ALA 74.A O LYS 78.A H 2.915 2.091 PHE 79.A N LEU 75.A O PHE 79.A H 2.890 2.072 ASP 80.A N VAL 76.A O ASP 80.A H 2.881 2.057 SER 81.A N GLU 77.A O SER 81.A H 2.951 2.125 VAL 82.A N LYS 78.A O VAL 82.A H 2.906 2.118 ALA 83.A N PHE 79.A O ALA 83.A H 2.877 2.066 GLY 90.A N ASP 87.A OD1 GLY 90.A H 2.554 1.784 LEU 91.A N ASP 87.A O LEU 91.A H 2.635 1.849 THR 92.A N ALA 88.A O THR 92.A H 2.899 2.088 THR 92.A OG1 ALA 88.A O THR 92.A HG1 3.524 2.800 THR 92.A OG1 ASP 89.A O THR 92.A HG1 2.454 1.896 ASN 93.A N ASP 89.A O ASN 93.A H 2.937 2.099 LEU 94.A N GLY 90.A O LEU 94.A H 2.871 2.049 ALA 95.A N LEU 91.A O ALA 95.A H 2.883 2.057 ASP 96.A N THR 92.A O ASP 96.A H 2.931 2.083 GLU 97.A N ASN 93.A O GLU 97.A H 2.889 2.049 LEU 98.A N LEU 94.A O LEU 98.A H 2.889 2.059 ALA 99.A N ALA 95.A O ALA 99.A H 2.919 2.082 SER 100.A N ASP 96.A O SER 100.A H 2.928 2.091 SER 100.A OG ASP 96.A O SER 100.A HG 3.191 2.456 SER 100.A OG GLU 97.A O SER 100.A HG 2.499 2.025 VAL 101.A N GLU 97.A O VAL 101.A H 2.885 2.067 ALA 102.A N LEU 98.A O ALA 102.A H 2.864 2.054 LYS 103.A N ALA 99.A O LYS 103.A H 2.953 2.115 LEU 104.A N SER 100.A O LEU 104.A H 2.892 2.073 LEU 105.A N VAL 101.A O LEU 105.A H 2.883 2.047 LEU 106.A N ALA 102.A O LEU 106.A H 2.907 2.079 SER 107.A N LYS 103.A O SER 107.A H 2.898 2.085 GLU 108.A N LEU 104.A O GLU 108.A H 2.887 2.043 ASN 112.A N GLU 108.A O ASN 112.A H 3.190 2.340 ASN 112.A ND2 GLU 156.A O ASN 112.A HD21 3.467 2.708 LYS 113.A N THR 109.A O LYS 113.A H 2.895 2.055 HIS 114.A N ALA 110.A O HIS 114.A H 2.923 2.084 HIS 114.A ND1 ALA 110.A O HIS 114.A HD1 2.545 1.691 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 2.891 2.094 ALA 116.A N ASN 112.A O ALA 116.A H 2.903 2.254 LYS 125.A NZ GLU 117.A O LYS 125.A HZ1 2.702 2.011 VAL 126.A N SER 122.A O VAL 126.A H 2.975 2.164 ARG 127.A N ALA 123.A O ARG 127.A H 2.913 2.071 LEU 128.A N PRO 124.A O LEU 128.A H 2.903 2.073 LEU 129.A N LYS 125.A O LEU 129.A H 2.901 2.060 GLU 130.A N VAL 126.A O GLU 130.A H 2.906 2.060 ARG 131.A N ARG 127.A O ARG 131.A H 2.905 2.047 LEU 132.A N LEU 128.A O LEU 132.A H 2.927 2.101 LEU 133.A N LEU 129.A O LEU 133.A H 2.918 2.068 SER 134.A N GLU 130.A O SER 134.A H 2.705 2.092 SER 138.A N GLU 97.A OE1 SER 138.A H 3.444 2.592 THR 141.A OG1 GLU 97.A OE1 THR 141.A HG1 2.444 1.729 LEU 142.A N SER 138.A O LEU 142.A H 2.974 2.142 ASP 143.A N ALA 139.A O ASP 143.A H 2.900 2.073 LEU 144.A N THR 140.A O LEU 144.A H 2.914 2.080 LEU 145.A N THR 141.A O LEU 145.A H 2.914 2.082 ARG 146.A N LEU 142.A O ARG 146.A H 2.882 2.052 THR 147.A N ASP 143.A O THR 147.A H 2.931 2.082 THR 147.A OG1 ASP 143.A O THR 147.A HG1 3.305 2.647 ALA 148.A N LEU 144.A O ALA 148.A H 2.887 2.075 VAL 149.A N LEU 145.A O VAL 149.A H 2.918 2.094 SER 150.A N ARG 146.A O SER 150.A H 2.912 2.186 SER 150.A OG THR 147.A O SER 150.A HG 2.604 1.794 TRP 153.A NE1 ALA 148.A O TRP 153.A HE1 3.055 2.386 SER 154.A N SER 68.A OG SER 154.A H 2.683 1.831 THR 155.A N ASN 158.A OD1 THR 155.A H 2.949 2.249 THR 155.A OG1 ASN 158.A OD1 THR 155.A HG1 2.211 1.616 GLU 156.A N GLU 156.A OE1 GLU 156.A H 2.351 1.679 SER 157.A OG GLU 156.A OE2 SER 157.A HG 2.912 2.139 ASN 158.A N THR 155.A O ASN 158.A H 2.761 2.003 LEU 159.A N GLU 156.A O LEU 159.A H 2.990 2.223 ASP 161.A N SER 157.A O ASP 161.A H 2.949 2.115 ALA 162.A N ASN 158.A O ALA 162.A H 2.838 2.053 VAL 163.A N LEU 159.A O VAL 163.A H 2.939 2.127 GLU 164.A N ILE 160.A O GLU 164.A H 2.920 2.072 HIS 165.A N ASP 161.A O HIS 165.A H 2.857 2.053 THR 166.A N ALA 162.A O THR 166.A H 2.878 2.076 THR 166.A OG1 VAL 163.A O THR 166.A HG1 2.411 1.948 ALA 167.A N VAL 163.A O ALA 167.A H 2.948 2.127 ARG 168.A N GLU 164.A O ARG 168.A H 2.927 2.094 LEU 169.A N HIS 165.A O LEU 169.A H 2.860 2.056 ALA 170.A N THR 166.A O ALA 170.A H 2.893 2.090 LEU 171.A N ALA 167.A O LEU 171.A H 2.990 2.161 LEU 172.A N ARG 168.A O LEU 172.A H 2.879 2.038 LYS 173.A N LEU 169.A O LYS 173.A H 2.826 2.026 ARG 174.A N ALA 170.A O ARG 174.A H 2.965 2.151 ALA 175.A N LEU 171.A O ALA 175.A H 2.952 2.130 GLU 176.A N LEU 172.A O GLU 176.A H 2.864 2.073 ILE 177.A N LYS 173.A O ILE 177.A H 2.888 2.088 ALA 178.A N ARG 174.A O ALA 178.A H 3.376 2.535 GLY 179.A N GLU 176.A O GLY 179.A H 2.673 1.910 GLU 180.A N ALA 175.A O GLU 180.A H 3.114 2.258 VAL 184.A N GLU 180.A O VAL 184.A H 3.099 2.259 GLU 185.A N VAL 181.A O GLU 185.A H 2.912 2.077 GLU 186.A N ASP 182.A O GLU 186.A H 2.923 2.085 GLN 187.A N GLU 183.A O GLN 187.A H 2.904 2.071 LEU 188.A N VAL 184.A O LEU 188.A H 2.876 2.037 PHE 189.A N GLU 185.A O PHE 189.A H 2.954 2.116 ARG 190.A N GLU 186.A O ARG 190.A H 2.898 2.068 ARG 190.A NE GLU 186.A OE2 ARG 190.A HE 3.023 2.254 PHE 191.A N GLN 187.A O PHE 191.A H 2.878 2.052 GLY 192.A N LEU 188.A O GLY 192.A H 2.915 2.074 ARG 193.A N PHE 189.A O ARG 193.A H 2.902 2.089 VAL 194.A N ARG 190.A O VAL 194.A H 2.915 2.091 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 2.900 2.051 ASP 196.A N GLY 192.A O ASP 196.A H 2.914 2.077 ALA 197.A N ARG 193.A O ALA 197.A H 2.898 2.103 GLU 198.A N VAL 194.A O GLU 198.A H 2.918 2.191 GLU 198.A N LEU 195.A O GLU 198.A H 3.199 2.589 SER 202.A N GLU 198.A O SER 202.A H 3.268 2.445 SER 202.A OG PRO 199.A O SER 202.A HG 2.714 1.987 ALA 203.A N PRO 199.A O ALA 203.A H 2.893 2.050 LEU 204.A N ARG 200.A O LEU 204.A H 2.929 2.099 LEU 205.A N LEU 201.A O LEU 205.A H 2.895 2.077 SER 206.A N ALA 203.A O SER 206.A H 3.214 2.464 SER 206.A OG SER 206.A O SER 206.A HG 2.329 1.850 GLU 213.A N GLU 213.A OE1 GLU 213.A H 2.500 1.681 ARG 215.A N PRO 211.A O ARG 215.A H 3.399 2.576 ARG 215.A NE PRO 211.A O ARG 215.A HE 3.345 2.522 ARG 215.A NH2 THR 210.A O ARG 215.A HH21 2.778 2.241 VAL 216.A N ALA 212.A O VAL 216.A H 2.909 2.074 ALA 217.A N GLU 213.A O ALA 217.A H 2.900 2.069 LEU 218.A N GLY 214.A O LEU 218.A H 2.889 2.066 LEU 219.A N ARG 215.A O LEU 219.A H 2.895 2.070 ASP 220.A N VAL 216.A O ASP 220.A H 2.917 2.081 LYS 221.A N ALA 217.A O LYS 221.A H 2.883 2.059 ALA 222.A N LEU 218.A O ALA 222.A H 2.902 2.141 LEU 223.A N LEU 219.A O LEU 223.A H 2.893 2.101 THR 224.A N LEU 219.A O THR 224.A H 2.775 1.984 GLY 225.A N ASP 220.A O GLY 225.A H 2.634 1.933 ARG 226.A N THR 224.A O ARG 226.A H 2.912 2.253 VAL 229.A N ARG 226.A O VAL 229.A H 3.341 2.493 ALA 234.A N ASN 230.A O ALA 234.A H 2.906 2.072 ALA 235.A N GLN 231.A O ALA 235.A H 2.900 2.067 LEU 236.A N THR 232.A O LEU 236.A H 2.911 2.072 LEU 237.A N ALA 233.A O LEU 237.A H 2.901 2.054 SER 238.A N ALA 234.A O SER 238.A H 2.905 2.061 SER 238.A OG ALA 234.A O SER 238.A HG 3.160 2.499 SER 238.A OG ALA 235.A O SER 238.A HG 2.742 2.122 GLN 239.A N ALA 235.A O GLN 239.A H 2.906 2.056 THR 240.A N LEU 236.A O THR 240.A H 2.921 2.102 THR 240.A OG1 LEU 236.A O THR 240.A HG1 3.050 2.311 VAL 241.A N LEU 237.A O VAL 241.A H 2.916 2.073 GLY 242.A N SER 238.A O GLY 242.A H 2.925 2.098 LEU 243.A N GLN 239.A O LEU 243.A H 3.084 2.294 ARG 245.A NH1 GLU 164.A OE1 ARG 245.A HH12 3.105 2.396 ARG 245.A NH2 GLU 164.A OE1 ARG 245.A HH22 2.948 2.192 ARG 248.A NH2 SER 202.A OG ARG 248.A HH22 2.765 2.115 ALA 252.A N ARG 248.A O ALA 252.A H 2.760 1.949 VAL 253.A N ALA 249.A O VAL 253.A H 2.908 2.097 ILE 254.A N ASP 250.A O ILE 254.A H 2.927 2.091 ASP 255.A N GLU 251.A O ASP 255.A H 2.895 2.070 LEU 256.A N ALA 252.A O LEU 256.A H 2.883 2.076 ALA 257.A N VAL 253.A O ALA 257.A H 2.946 2.122 GLU 258.A N ILE 254.A O GLU 258.A H 2.894 2.061 LEU 259.A N ASP 255.A O LEU 259.A H 2.885 2.046 ALA 260.A N LEU 256.A O ALA 260.A H 2.890 2.058 VAL 261.A N ALA 257.A O VAL 261.A H 2.971 2.130 SER 262.A N GLU 258.A O SER 262.A H 2.869 2.081 SER 262.A OG GLU 258.A O SER 262.A HG 2.534 1.701 ARG 263.A N LEU 259.A O ARG 263.A H 2.950 2.159 ARG 263.A NH2 ASP 80.A OD1 ARG 263.A HH22 3.300 2.554 GLY 265.A N SER 262.A O GLY 265.A H 2.532 1.719 GLU 266.A N VAL 261.A O GLU 266.A H 3.273 2.597 ALA 269.A N SER 298.A O ALA 269.A H 2.921 2.095 HIS 270.A N THR 314.A O HIS 270.A H 3.275 2.464 VAL 271.A N GLN 300.A O VAL 271.A H 2.892 2.219 SER 272.A N SER 312.A O SER 272.A H 3.097 2.248 SER 272.A OG HIS 302.A O SER 272.A HG 3.271 2.588 SER 278.A N GLN 281.A OE1 SER 278.A H 3.029 2.221 ALA 280.A N ASP 279.A OD1 ALA 280.A H 2.686 2.032 GLN 281.A N SER 278.A OG GLN 281.A H 2.950 2.104 GLN 281.A NE2 ASP 40.A OD1 GLN 281.A HE21 2.803 1.955 GLN 281.A NE2 ASP 40.A OD2 GLN 281.A HE21 3.512 2.833 ARG 282.A N SER 278.A O ARG 282.A H 2.673 1.856 THR 283.A N ASP 279.A O THR 283.A H 2.900 2.065 THR 283.A OG1 ASP 279.A O THR 283.A HG1 3.187 2.433 THR 283.A OG1 ALA 280.A O THR 283.A HG1 2.636 2.166 ARG 284.A N ALA 280.A O ARG 284.A H 2.919 2.074 ARG 284.A NE GLU 47.A OE2 ARG 284.A HE 2.873 2.031 ARG 284.A NH2 ASP 40.A O ARG 284.A HH22 3.456 2.813 ARG 284.A NH2 SER 44.A OG ARG 284.A HH22 2.872 2.107 ARG 284.A NH2 GLU 47.A OE1 ARG 284.A HH21 3.034 2.225 LEU 285.A N GLN 281.A O LEU 285.A H 2.884 2.047 THR 286.A N ARG 282.A O THR 286.A H 2.907 2.067 THR 286.A OG1 THR 283.A O THR 286.A HG1 2.497 1.780 GLU 287.A N THR 283.A O GLU 287.A H 2.917 2.088 VAL 288.A N ARG 284.A O VAL 288.A H 2.932 2.091 LEU 289.A N LEU 285.A O LEU 289.A H 2.924 2.067 SER 290.A N THR 286.A O SER 290.A H 2.883 2.055 ARG 291.A N GLU 287.A O ARG 291.A H 2.929 2.100 ARG 291.A NH1 MET 49.A O ARG 291.A HH12 2.458 1.677 ARG 291.A NH2 MET 49.A O ARG 291.A HH22 2.932 2.316 ILE 292.A N VAL 288.A O ILE 292.A H 2.932 2.103 TYR 293.A N LEU 289.A O TYR 293.A H 2.940 2.095 GLY 294.A N SER 290.A O GLY 294.A H 2.657 2.034 SER 298.A N VAL 267.A O SER 298.A H 2.885 2.175 GLN 300.A N ALA 269.A O GLN 300.A H 2.896 2.060 HIS 302.A N VAL 271.A O HIS 302.A H 3.074 2.333 ASP 304.A N ALA 273.A O ASP 304.A H 2.839 2.032 GLU 306.A N GLU 306.A OE1 GLU 306.A H 2.861 2.082 LEU 308.A N PRO 305.A O LEU 308.A H 3.197 2.421 SER 312.A N SER 272.A O SER 312.A H 3.172 2.570 ILE 313.A N ILE 320.A O ILE 313.A H 2.909 2.213 VAL 315.A N GLU 318.A O VAL 315.A H 2.887 2.133 GLU 318.A N VAL 315.A O GLU 318.A H 2.906 2.092 ILE 320.A N ILE 313.A O ILE 320.A H 2.869 2.069 GLY 322.A N LEU 311.A O GLY 322.A H 2.758 2.066 SER 323.A N ASP 321.A OD1 SER 323.A H 3.108 2.287 ILE 324.A N GLY 309.A O ILE 324.A H 3.033 2.220 ALA 325.A N LEU 307.A O ALA 325.A H 3.206 2.402 SER 326.A N SER 323.A O SER 326.A H 3.172 2.570 SER 326.A OG ASP 321.A OD1 SER 326.A HG 3.017 2.351 SER 326.A OG ASP 321.A OD2 SER 326.A HG 3.140 2.369 ARG 327.A N SER 323.A O ARG 327.A H 3.399 2.624 LEU 328.A N ILE 324.A O LEU 328.A H 2.922 2.115 ALA 329.A N ALA 325.A O ALA 329.A H 2.898 2.073 ALA 330.A N SER 326.A O ALA 330.A H 2.898 2.063 ALA 331.A N ARG 327.A O ALA 331.A H 2.907 2.074 GLN 332.A N LEU 328.A O GLN 332.A H 2.893 2.065 THR 333.A N ALA 329.A O THR 333.A H 2.918 2.088 GLY 334.A N ALA 330.A O GLY 334.A H 2.627 2.027 GLY 334.A N ALA 331.A O GLY 334.A H 3.296 2.606