Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7pnx_D.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N PHE 2.A O LYS 5.A H 3.434 2.581 THR 7.A N GLU 10.A OE1 THR 7.A H 2.846 1.991 LEU 11.A N THR 7.A O LEU 11.A H 2.958 2.171 TRP 12.A N ALA 8.A O TRP 12.A H 2.808 1.992 LYS 13.A N ASP 9.A O LYS 13.A H 2.936 2.093 GLY 14.A N GLU 10.A O GLY 14.A H 3.216 2.382 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.991 2.148 LEU 16.A N TRP 12.A O LEU 16.A H 2.808 1.986 LYS 24.A N GLY 20.A O LYS 24.A H 2.716 2.060 GLY 28.A N GLY 22.A O GLY 28.A H 3.185 2.367 ARG 30.A NH1 LEU 16.A O ARG 30.A HH11 2.976 2.303 ARG 36.A NH1 ASP 9.A OD1 ARG 36.A HH12 2.514 1.835 ASN 40.A N ASP 38.A OD1 ASN 40.A H 3.174 2.380 GLN 43.A NE2 LEU 39.A O GLN 43.A HE22 2.717 1.869 GLU 47.A N ILE 44.A O GLU 47.A H 3.176 2.334 GLY 51.A N GLY 48.A O GLY 51.A H 3.162 2.382 LEU 53.A N ALA 71.A O LEU 53.A H 2.600 1.753 TRP 54.A N ASN 58.A OD1 TRP 54.A H 2.816 2.067 GLY 56.A N VAL 59.A O GLY 56.A H 3.056 2.233 LEU 57.A N TRP 54.A O LEU 57.A H 3.200 2.342 ASN 58.A N TRP 54.A O ASN 58.A H 3.433 2.621 ASN 58.A ND2 GLU 47.A OE1 ASN 58.A HD22 3.258 2.414 ASN 58.A ND2 PHE 52.A O ASN 58.A HD21 3.107 2.324 LYS 63.A N ALA 66.A O LYS 63.A H 2.783 1.957 ALA 66.A N LYS 63.A O ALA 66.A H 3.233 2.387 GLN 68.A N LEU 61.A O GLN 68.A H 2.936 2.087 GLN 68.A NE2 PRO 60.A O GLN 68.A HE22 2.614 2.041 GLN 72.A NE2 TYR 50.A O GLN 72.A HE22 2.908 2.061 ARG 73.A N GLY 51.A O ARG 73.A H 2.682 1.865 ARG 73.A NE GLN 78.A OE1 ARG 73.A HE 2.590 1.742 ARG 73.A NH1 GLU 47.A OE2 ARG 73.A HH12 2.463 1.674 ARG 73.A NH1 GLN 78.A OE1 ARG 73.A HH11 3.152 2.509 SER 74.A N GLU 77.A OE1 SER 74.A H 2.615 1.761 GLU 76.A N GLU 76.A OE1 GLU 76.A H 2.629 1.911 GLN 78.A N SER 74.A O GLN 78.A H 2.741 1.894 GLN 78.A NE2 GLY 48.A O GLN 78.A HE21 3.565 3.107 GLN 78.A NE2 GLU 82.A OE2 GLN 78.A HE22 3.087 2.463 GLU 79.A N LYS 75.A O GLU 79.A H 2.916 2.147 LYS 80.A N GLU 76.A O LYS 80.A H 3.245 2.518 VAL 81.A N GLU 77.A O VAL 81.A H 3.214 2.444 GLU 82.A N GLN 78.A O GLU 82.A H 3.129 2.306 ALA 83.A N GLU 79.A O ALA 83.A H 3.087 2.248 ASP 84.A N LYS 80.A O ASP 84.A H 2.917 2.096 MET 85.A N VAL 81.A O MET 85.A H 3.052 2.289 ILE 86.A N GLU 82.A O ILE 86.A H 3.080 2.315 GLN 87.A N ALA 83.A O GLN 87.A H 3.045 2.205 GLN 88.A N ASP 84.A O GLN 88.A H 2.962 2.117 ARG 89.A N MET 85.A O ARG 89.A H 2.972 2.310 ARG 89.A N ILE 86.A O ARG 89.A H 3.017 2.402 GLU 90.A N ILE 86.A O GLU 90.A H 2.935 2.108 GLU 91.A N GLN 87.A O GLU 91.A H 2.698 1.871 TRP 92.A N GLN 88.A O TRP 92.A H 3.001 2.175 ASP 93.A N ARG 89.A O ASP 93.A H 2.997 2.208 ARG 94.A N GLU 90.A O ARG 94.A H 2.872 2.116 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.988 2.152 LYS 96.A N TRP 92.A O LYS 96.A H 3.282 2.453 LYS 97.A N ASP 93.A O LYS 97.A H 3.116 2.305 MET 98.A N ARG 94.A O MET 98.A H 3.281 2.577 MET 98.A N LYS 95.A O MET 98.A H 3.241 2.561 TRP 106.A N GLY 112.A O TRP 106.A H 2.860 2.040 SER 110.A N SER 107.A O SER 110.A H 3.280 2.461 GLY 112.A N SER 110.A OG GLY 112.A H 3.110 2.407 GLY 113.A N ILE 135.A O GLY 113.A H 2.770 1.916 ILE 114.A N TRP 111.A O ILE 114.A H 3.189 2.352 LEU 116.A N THR 133.A O LEU 116.A H 2.980 2.185 GLY 117.A N SER 115.A OG GLY 117.A H 3.411 2.576 ASP 120.A N ASN 186.A OD1 ASP 120.A H 3.151 2.327 PHE 131.A N TYR 128.A O PHE 131.A H 2.995 2.146 ASP 132.A N GLY 161.A O ASP 132.A H 2.812 1.976 THR 133.A OG1 GLY 117.A O THR 133.A HG1 2.707 2.205 ARG 134.A N ALA 159.A O ARG 134.A H 2.808 1.972 ARG 134.A NE ASP 132.A OD2 ARG 134.A HE 3.054 2.261 ARG 134.A NH1 GLY 113.A O ARG 134.A HH11 2.692 1.916 ILE 135.A N ILE 114.A O ILE 135.A H 3.039 2.223 LEU 136.A N LEU 157.A O LEU 136.A H 2.821 1.965 GLU 137.A N LEU 157.A O GLU 137.A H 3.269 2.482 ARG 139.A N ARG 155.A O ARG 139.A H 2.889 2.042 VAL 141.A N SER 153.A O VAL 141.A H 2.833 2.041 THR 143.A N LYS 151.A O THR 143.A H 2.825 2.040 THR 145.A N GLY 149.A O THR 145.A H 2.992 2.256 LYS 151.A N THR 143.A O LYS 151.A H 2.755 1.903 LYS 151.A NZ GLU 148.A OE2 LYS 151.A HZ1 3.282 2.557 SER 153.A N VAL 141.A O SER 153.A H 2.775 1.919 ILE 154.A N ALA 174.A O ILE 154.A H 2.883 2.078 ARG 155.A N ARG 139.A O ARG 155.A H 3.013 2.205 ARG 155.A NH2 GLU 137.A OE2 ARG 155.A HH21 2.865 2.046 VAL 156.A N GLY 172.A O VAL 156.A H 2.705 1.866 LEU 157.A N GLU 137.A O LEU 157.A H 2.849 2.005 VAL 158.A N SER 170.A O VAL 158.A H 3.147 2.300 ALA 159.A N ARG 134.A O ALA 159.A H 2.817 1.982 VAL 160.A N GLY 168.A O VAL 160.A H 2.613 1.774 GLY 161.A N ASP 132.A O GLY 161.A H 3.054 2.297 ASN 162.A N ALA 166.A O ASN 162.A H 3.035 2.251 GLY 163.A N LEU 239.A O GLY 163.A H 2.652 1.887 LYS 164.A N ASN 162.A OD1 LYS 164.A H 3.036 2.183 LYS 164.A NZ ASP 130.A OD2 LYS 164.A HZ3 2.495 1.701 LYS 164.A NZ ASN 162.A O LYS 164.A HZ1 3.509 2.648 GLY 165.A N ILE 240.A O GLY 165.A H 2.729 1.962 ALA 166.A N ASN 162.A OD1 ALA 166.A H 3.120 2.361 ALA 167.A N HIS 193.A O ALA 167.A H 3.005 2.198 GLY 168.A N VAL 160.A O GLY 168.A H 2.800 1.997 SER 170.A N VAL 158.A O SER 170.A H 3.010 2.226 SER 170.A OG ILE 171.A O SER 170.A HG 3.364 2.538 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.666 1.841 ALA 174.A N ILE 154.A O ALA 174.A H 3.142 2.356 ALA 180.A N ASP 176.A O ALA 180.A H 3.108 2.290 PHE 181.A N ARG 177.A O PHE 181.A H 2.980 2.222 ARG 182.A N MET 178.A O ARG 182.A H 3.062 2.265 ARG 182.A NH1 ASP 179.A OD1 ARG 182.A HH12 3.496 2.772 LYS 183.A N ASP 179.A O LYS 183.A H 2.978 2.155 LYS 183.A NZ LYS 173.A O LYS 183.A HZ1 3.133 2.366 ALA 184.A N ALA 180.A O ALA 184.A H 3.162 2.311 LYS 185.A N PHE 181.A O LYS 185.A H 3.098 2.238 LYS 185.A NZ LEU 116.A O LYS 185.A HZ3 3.507 2.822 LYS 185.A NZ PRO 118.A O LYS 185.A HZ1 3.124 2.276 ASN 186.A N ARG 182.A O ASN 186.A H 3.173 2.342 ASN 186.A ND2 ASP 120.A OD2 ASN 186.A HD21 3.320 2.480 ARG 187.A N LYS 183.A O ARG 187.A H 2.977 2.163 ARG 187.A NH2 SER 170.A OG ARG 187.A HH21 3.393 2.556 ALA 188.A N ALA 184.A O ALA 188.A H 2.803 2.006 HIS 190.A N ARG 187.A O HIS 190.A H 2.963 2.159 HIS 191.A N ALA 188.A O HIS 191.A H 3.012 2.169 HIS 191.A ND1 ARG 187.A O HIS 191.A HD1 3.026 2.169 HIS 193.A N ALA 167.A O HIS 193.A H 2.675 1.871 ILE 195.A N GLY 165.A O ILE 195.A H 2.688 1.899 ARG 197.A NH1 GLY 241.A O ARG 197.A HH11 3.105 2.286 TYR 198.A N THR 202.A O TYR 198.A H 2.613 1.861 HIS 201.A N TYR 198.A O HIS 201.A H 3.115 2.263 HIS 201.A ND1 ASP 244.A OD2 HIS 201.A HD1 2.753 2.086 THR 202.A N TYR 198.A O THR 202.A H 3.240 2.432 THR 202.A OG1 ASP 244.A O THR 202.A HG1 2.660 1.939 PHE 204.A N GLN 269.A OE1 PHE 204.A H 3.063 2.212 HIS 205.A ND1 ASP 206.A O HIS 205.A HD1 3.132 2.280 ILE 207.A N MET 218.A O ILE 207.A H 2.888 2.138 LEU 209.A N ILE 216.A O LEU 209.A H 3.005 2.171 ARG 210.A NE LYS 212.A O ARG 210.A HE 2.960 2.277 PHE 211.A N THR 214.A O PHE 211.A H 2.888 2.061 ARG 213.A NE LYS 212.A O ARG 213.A HE 3.259 2.737 THR 214.A N PHE 211.A O THR 214.A H 2.988 2.154 HIS 215.A N SER 250.A O HIS 215.A H 2.932 2.090 ILE 216.A N LEU 209.A O ILE 216.A H 2.964 2.113 LYS 217.A N LYS 248.A O LYS 217.A H 2.986 2.149 MET 218.A N ILE 207.A O MET 218.A H 2.585 1.731 LYS 219.A N TYR 246.A O LYS 219.A H 2.772 1.975 LYS 219.A NZ ASP 323.A OD1 LYS 219.A HZ2 2.787 1.993 LYS 220.A N ASP 206.A OD1 LYS 220.A H 2.754 1.966 GLN 221.A N THR 202.A OG1 GLN 221.A H 3.394 2.542 TYR 225.A N PRO 222.A O TYR 225.A H 3.281 2.469 GLY 226.A N ASP 244.A OD1 GLY 226.A H 2.923 2.077 LEU 227.A N THR 343.A O LEU 227.A H 3.310 2.491 ARG 228.A N MET 245.A O ARG 228.A H 3.041 2.234 ARG 228.A NH1 ASN 337.A OD1 ARG 228.A HH12 2.731 1.952 ALA 232.A N HIS 230.A ND1 ALA 232.A H 2.964 2.172 ILE 234.A N HIS 230.A O ILE 234.A H 2.909 2.112 THR 235.A N ARG 231.A O THR 235.A H 3.040 2.220 ILE 236.A N ALA 232.A O ILE 236.A H 3.021 2.191 CYS 237.A N ILE 233.A O CYS 237.A H 2.732 1.915 ARG 238.A N ILE 234.A O ARG 238.A H 3.016 2.204 LEU 239.A N THR 235.A O LEU 239.A H 3.301 2.538 ILE 240.A N ILE 236.A O ILE 240.A H 2.914 2.131 GLY 241.A N CYS 237.A O GLY 241.A H 2.834 2.050 ILE 242.A N CYS 237.A O ILE 242.A H 2.899 2.179 LYS 243.A N HIS 201.A O LYS 243.A H 2.662 1.867 LYS 243.A NZ ASP 200.A O LYS 243.A HZ3 3.229 2.442 LYS 243.A NZ GLY 241.A O LYS 243.A HZ1 3.084 2.332 ASP 244.A N HIS 201.A O ASP 244.A H 3.035 2.236 MET 245.A N GLY 226.A O MET 245.A H 3.057 2.259 TYR 246.A N LYS 219.A O TYR 246.A H 3.381 2.553 ALA 247.A N ARG 228.A O ALA 247.A H 3.257 2.428 LYS 248.A N LYS 217.A O LYS 248.A H 2.881 2.095 LYS 248.A NZ VAL 249.A O LYS 248.A HZ1 3.136 2.487 SER 250.A N HIS 215.A O SER 250.A H 2.910 2.093 SER 252.A N ARG 213.A O SER 252.A H 3.099 2.367 LEU 256.A N ASN 254.A OD1 LEU 256.A H 3.331 2.607 LEU 258.A N ASN 254.A O LEU 258.A H 2.694 1.854 THR 259.A N MET 255.A O THR 259.A H 2.766 1.958 THR 259.A OG1 MET 255.A O THR 259.A HG1 2.799 1.997 GLN 260.A N LEU 256.A O GLN 260.A H 2.966 2.113 GLY 261.A N SER 257.A O GLY 261.A H 2.671 1.882 LEU 262.A N LEU 258.A O LEU 262.A H 2.798 2.028 PHE 263.A N THR 259.A O PHE 263.A H 3.026 2.216 ARG 264.A N GLN 260.A O ARG 264.A H 3.029 2.233 GLY 265.A N GLY 261.A O GLY 265.A H 3.292 2.512 LEU 266.A N LEU 262.A O LEU 266.A H 3.053 2.240 SER 267.A N PHE 263.A O SER 267.A H 3.062 2.334 GLN 269.A NE2 LEU 266.A O GLN 269.A HE22 2.941 2.255 GLU 270.A N HIS 205.A NE2 GLU 270.A H 3.012 2.376 GLN 273.A NE2 GLN 273.A O GLN 273.A HE22 3.280 2.739 GLN 273.A NE2 ASP 277.A OD1 GLN 273.A HE22 2.898 2.207 GLN 273.A NE2 SER 299.A O GLN 273.A HE21 2.928 2.074 GLN 274.A N THR 271.A OG1 GLN 274.A H 3.235 2.396 LEU 275.A N THR 271.A O LEU 275.A H 2.986 2.189 ALA 276.A N HIS 272.A O ALA 276.A H 2.923 2.101 ASP 277.A N GLN 273.A O ASP 277.A H 3.008 2.173 LYS 278.A N GLN 274.A O LYS 278.A H 2.893 2.093 LYS 279.A N LEU 275.A O LYS 279.A H 3.127 2.327 HIS 282.A ND1 SER 299.A OG no hydrogen 2.995 N/A VAL 283.A N ALA 298.A O VAL 283.A H 2.876 2.019 GLU 285.A N ILE 295.A O GLU 285.A H 2.569 1.710 ARG 287.A NH2 TYR 198.A OH ARG 287.A HH21 3.005 2.350 ARG 287.A NH2 GLU 199.A OE1 ARG 287.A HH22 3.246 2.455 GLU 289.A N GLU 289.A OE1 GLU 289.A H 2.789 1.983 CYS 290.A N ARG 287.A O CYS 290.A H 3.051 2.351 GLY 291.A N GLU 288.A O GLY 291.A H 3.330 2.490 LEU 293.A N CYS 290.A O LEU 293.A H 3.461 2.627 ILE 295.A N GLU 285.A O ILE 295.A H 3.024 2.194 VAL 297.A N VAL 283.A O VAL 297.A H 2.851 2.020 ARG 301.A N ASP 277.A OD1 ARG 301.A H 3.264 2.458 ARG 305.A N GLY 280.A O ARG 305.A H 2.916 2.085 ARG 305.A NE ASP 307.A OD1 ARG 305.A HE 3.322 2.543 ARG 305.A NH1 ASP 307.A O ARG 305.A HH11 3.177 2.400 ARG 305.A NH1 GLU 309.A OE1 ARG 305.A HH12 3.562 2.914 ARG 305.A NH2 LYS 279.A O ARG 305.A HH21 3.244 2.647 ARG 305.A NH2 GLU 309.A OE1 ARG 305.A HH22 3.426 2.747 VAL 324.A N ASP 320.A O VAL 324.A H 3.058 2.240 LYS 325.A N TRP 321.A O LYS 325.A H 2.707 1.856 THR 326.A N GLU 322.A O THR 326.A H 3.129 2.363 ALA 327.A N ASP 323.A O ALA 327.A H 3.120 2.298 GLN 328.A N VAL 324.A O GLN 328.A H 3.055 2.345 GLY 329.A N THR 326.A O GLY 329.A H 3.065 2.218 MET 330.A N LYS 325.A O MET 330.A H 2.944 2.257 TRP 335.A N SER 333.A OG TRP 335.A H 3.320 2.520 THR 343.A OG1 LEU 227.A O THR 343.A HG1 2.509 1.801