Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7pny_D.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N PHE 2.A O LYS 5.A H 3.407 2.554 THR 7.A N GLU 10.A OE1 THR 7.A H 2.908 2.058 LEU 11.A N THR 7.A O LEU 11.A H 3.079 2.279 TRP 12.A N ALA 8.A O TRP 12.A H 2.990 2.164 LYS 13.A N ASP 9.A O LYS 13.A H 2.961 2.113 GLY 14.A N GLU 10.A O GLY 14.A H 3.190 2.364 ALA 15.A N LEU 11.A O ALA 15.A H 2.886 2.035 LEU 16.A N TRP 12.A O LEU 16.A H 2.845 2.025 LYS 24.A N GLY 20.A O LYS 24.A H 2.654 1.975 GLY 28.A N GLY 22.A O GLY 28.A H 3.259 2.425 ARG 30.A NH1 LEU 16.A O ARG 30.A HH11 2.969 2.245 ARG 36.A NH1 ASP 9.A OD1 ARG 36.A HH12 2.795 2.152 ASN 40.A N ASP 38.A OD1 ASN 40.A H 3.146 2.352 GLN 43.A NE2 LEU 39.A O GLN 43.A HE22 2.721 1.870 GLU 47.A N ILE 44.A O GLU 47.A H 3.193 2.356 GLY 51.A N GLY 48.A O GLY 51.A H 3.141 2.367 LEU 53.A N ALA 71.A O LEU 53.A H 2.612 1.764 TRP 54.A N ASN 58.A OD1 TRP 54.A H 2.748 2.004 GLY 56.A N VAL 59.A O GLY 56.A H 3.114 2.293 LEU 57.A N TRP 54.A O LEU 57.A H 3.197 2.340 ASN 58.A N TRP 54.A O ASN 58.A H 3.412 2.596 ASN 58.A ND2 GLU 47.A OE1 ASN 58.A HD22 3.232 2.391 ASN 58.A ND2 PHE 52.A O ASN 58.A HD21 3.159 2.396 LYS 63.A N ALA 66.A O LYS 63.A H 2.679 1.864 ALA 66.A N LYS 63.A O ALA 66.A H 3.237 2.395 GLN 68.A N LEU 61.A O GLN 68.A H 2.930 2.080 GLN 68.A NE2 PRO 60.A O GLN 68.A HE22 2.585 2.042 GLN 72.A NE2 TYR 50.A O GLN 72.A HE22 2.800 1.959 ARG 73.A N GLY 51.A O ARG 73.A H 2.826 1.972 ARG 73.A NE GLN 78.A OE1 ARG 73.A HE 2.620 1.791 ARG 73.A NH1 GLU 47.A OE2 ARG 73.A HH12 2.463 1.671 ARG 73.A NH1 GLN 78.A OE1 ARG 73.A HH11 3.299 2.678 GLU 76.A N GLU 76.A OE1 GLU 76.A H 2.626 1.859 GLU 77.A N SER 74.A OG GLU 77.A H 3.081 2.260 GLN 78.A N SER 74.A O GLN 78.A H 2.759 2.014 GLN 78.A NE2 GLU 82.A OE2 GLN 78.A HE22 3.311 2.522 GLU 79.A N LYS 75.A O GLU 79.A H 3.144 2.331 LYS 80.A N GLU 76.A O LYS 80.A H 3.303 2.486 GLU 82.A N GLN 78.A O GLU 82.A H 2.911 2.076 ALA 83.A N GLU 79.A O ALA 83.A H 2.767 1.919 ASP 84.A N LYS 80.A O ASP 84.A H 2.685 1.861 MET 85.A N VAL 81.A O MET 85.A H 2.994 2.212 ILE 86.A N GLU 82.A O ILE 86.A H 3.081 2.293 GLN 87.A N ALA 83.A O GLN 87.A H 3.029 2.183 GLN 88.A N ASP 84.A O GLN 88.A H 2.986 2.153 ARG 89.A N MET 85.A O ARG 89.A H 3.052 2.391 ARG 89.A N ILE 86.A O ARG 89.A H 3.017 2.372 GLU 90.A N ILE 86.A O GLU 90.A H 3.122 2.353 GLU 91.A N GLN 87.A O GLU 91.A H 2.798 1.959 TRP 92.A N GLN 88.A O TRP 92.A H 2.931 2.111 ASP 93.A N ARG 89.A O ASP 93.A H 3.047 2.228 ARG 94.A N GLU 90.A O ARG 94.A H 2.605 1.823 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.846 2.042 LYS 96.A N TRP 92.A O LYS 96.A H 3.137 2.322 LYS 97.A N ASP 93.A O LYS 97.A H 2.861 2.077 MET 98.A N ARG 94.A O MET 98.A H 3.035 2.341 MET 98.A N LYS 95.A O MET 98.A H 3.269 2.617 TRP 106.A N GLY 112.A O TRP 106.A H 2.919 2.103 SER 110.A N SER 107.A O SER 110.A H 3.288 2.472 GLY 112.A N SER 110.A OG GLY 112.A H 3.221 2.516 GLY 113.A N ILE 135.A O GLY 113.A H 2.634 1.780 ILE 114.A N TRP 111.A O ILE 114.A H 3.216 2.385 LEU 116.A N THR 133.A O LEU 116.A H 3.096 2.309 GLY 117.A N SER 115.A OG GLY 117.A H 3.338 2.511 ASP 120.A N ASN 186.A OD1 ASP 120.A H 3.374 2.547 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 3.146 2.372 PHE 131.A N TYR 128.A O PHE 131.A H 3.003 2.157 ASP 132.A N GLY 161.A O ASP 132.A H 2.742 1.908 THR 133.A OG1 GLY 117.A O THR 133.A HG1 2.884 2.376 ARG 134.A N ALA 159.A O ARG 134.A H 2.876 2.036 ARG 134.A NE ASP 132.A OD2 ARG 134.A HE 2.965 2.148 ARG 134.A NH1 GLY 113.A O ARG 134.A HH11 2.893 2.077 ILE 135.A N ILE 114.A O ILE 135.A H 3.066 2.271 LEU 136.A N LEU 157.A O LEU 136.A H 2.841 1.988 GLU 137.A N LEU 157.A O GLU 137.A H 3.249 2.463 ARG 139.A N ARG 155.A O ARG 139.A H 2.863 2.020 ARG 139.A NH2 GLU 137.A OE1 ARG 139.A HH21 3.457 2.749 VAL 141.A N SER 153.A O VAL 141.A H 2.886 2.128 THR 143.A N LYS 151.A O THR 143.A H 2.825 2.066 THR 145.A N GLY 149.A O THR 145.A H 2.928 2.183 GLY 149.A N THR 145.A O GLY 149.A H 3.267 2.581 LYS 151.A N THR 143.A O LYS 151.A H 2.759 1.903 LYS 151.A NZ GLU 148.A OE2 LYS 151.A HZ1 3.308 2.602 SER 153.A N VAL 141.A O SER 153.A H 2.784 1.926 ILE 154.A N ALA 174.A O ILE 154.A H 2.875 2.056 ARG 155.A N ARG 139.A O ARG 155.A H 2.938 2.128 ARG 155.A NH2 GLU 137.A OE2 ARG 155.A HH21 3.002 2.171 VAL 156.A N GLY 172.A O VAL 156.A H 2.709 1.868 LEU 157.A N GLU 137.A O LEU 157.A H 2.833 1.990 VAL 158.A N SER 170.A O VAL 158.A H 3.285 2.431 ALA 159.A N ARG 134.A O ALA 159.A H 2.890 2.059 VAL 160.A N GLY 168.A O VAL 160.A H 2.572 1.728 GLY 161.A N ASP 132.A O GLY 161.A H 3.011 2.256 ASN 162.A N ALA 166.A O ASN 162.A H 3.046 2.257 GLY 163.A N LEU 239.A O GLY 163.A H 2.637 1.879 LYS 164.A N ASN 162.A OD1 LYS 164.A H 3.101 2.247 LYS 164.A NZ ASP 130.A OD2 LYS 164.A HZ3 2.440 1.724 GLY 165.A N ILE 240.A O GLY 165.A H 2.716 1.957 ALA 166.A N ASN 162.A OD1 ALA 166.A H 3.110 2.366 ALA 167.A N HIS 193.A O ALA 167.A H 2.940 2.131 GLY 168.A N VAL 160.A O GLY 168.A H 2.780 1.984 SER 170.A N VAL 158.A O SER 170.A H 3.067 2.281 SER 170.A OG ILE 171.A O SER 170.A HG 3.448 2.613 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.624 1.795 ALA 174.A N ILE 154.A O ALA 174.A H 3.172 2.377 ALA 180.A N ASP 176.A O ALA 180.A H 3.278 2.467 PHE 181.A N ARG 177.A O PHE 181.A H 3.260 2.462 ARG 182.A N MET 178.A O ARG 182.A H 3.255 2.456 ARG 182.A NH1 ASP 179.A OD1 ARG 182.A HH12 3.153 2.379 LYS 183.A N ASP 179.A O LYS 183.A H 3.028 2.188 LYS 183.A NZ LYS 173.A O LYS 183.A HZ1 3.028 2.206 ALA 184.A N ALA 180.A O ALA 184.A H 2.931 2.074 LYS 185.A N PHE 181.A O LYS 185.A H 3.041 2.182 LYS 185.A NZ LEU 116.A O LYS 185.A HZ3 3.559 2.864 LYS 185.A NZ PRO 118.A O LYS 185.A HZ1 3.194 2.342 ASN 186.A N ARG 182.A O ASN 186.A H 3.003 2.177 ASN 186.A ND2 ASP 120.A OD2 ASN 186.A HD21 3.467 2.633 ARG 187.A N LYS 183.A O ARG 187.A H 2.881 2.057 ARG 187.A NH2 SER 170.A OG ARG 187.A HH21 3.190 2.340 ALA 188.A N ALA 184.A O ALA 188.A H 2.909 2.117 HIS 190.A N ARG 187.A O HIS 190.A H 3.059 2.255 HIS 191.A N ALA 188.A O HIS 191.A H 2.952 2.107 HIS 191.A ND1 ARG 187.A O HIS 191.A HD1 3.076 2.222 HIS 193.A N ALA 167.A O HIS 193.A H 2.663 1.864 ILE 195.A N GLY 165.A O ILE 195.A H 2.668 1.878 ARG 197.A NH1 GLY 241.A O ARG 197.A HH11 3.052 2.240 TYR 198.A N THR 202.A O TYR 198.A H 2.646 1.905 HIS 201.A N TYR 198.A O HIS 201.A H 3.160 2.312 HIS 201.A ND1 ASP 244.A OD2 HIS 201.A HD1 2.789 2.146 THR 202.A N TYR 198.A O THR 202.A H 3.317 2.515 THR 202.A OG1 ASP 244.A O THR 202.A HG1 2.665 1.964 PHE 204.A N GLN 269.A OE1 PHE 204.A H 2.993 2.141 HIS 205.A ND1 ASP 206.A O HIS 205.A HD1 3.195 2.342 ILE 207.A N MET 218.A O ILE 207.A H 2.777 2.014 LEU 209.A N ILE 216.A O LEU 209.A H 3.023 2.186 ARG 210.A NE LYS 212.A O ARG 210.A HE 3.029 2.382 PHE 211.A N THR 214.A O PHE 211.A H 2.866 2.023 ARG 213.A NE LYS 212.A O ARG 213.A HE 3.240 2.717 THR 214.A N PHE 211.A O THR 214.A H 2.951 2.125 HIS 215.A N SER 250.A O HIS 215.A H 3.055 2.214 ILE 216.A N LEU 209.A O ILE 216.A H 2.995 2.147 LYS 217.A N LYS 248.A O LYS 217.A H 2.995 2.160 MET 218.A N ILE 207.A O MET 218.A H 2.523 1.671 LYS 219.A N TYR 246.A O LYS 219.A H 2.745 1.941 LYS 219.A NZ ASP 323.A OD1 LYS 219.A HZ2 2.519 1.682 LYS 220.A N ASP 206.A OD1 LYS 220.A H 2.848 2.076 GLN 221.A N THR 202.A OG1 GLN 221.A H 3.384 2.538 TYR 225.A N PRO 222.A O TYR 225.A H 3.264 2.455 GLY 226.A N ASP 244.A OD1 GLY 226.A H 2.910 2.061 LEU 227.A N THR 343.A O LEU 227.A H 3.204 2.386 ARG 228.A N MET 245.A O ARG 228.A H 3.025 2.233 ARG 228.A NH1 ASN 337.A OD1 ARG 228.A HH12 3.302 2.492 ALA 232.A N HIS 230.A ND1 ALA 232.A H 2.980 2.180 ILE 234.A N HIS 230.A O ILE 234.A H 2.846 2.053 THR 235.A N ARG 231.A O THR 235.A H 3.028 2.218 ILE 236.A N ALA 232.A O ILE 236.A H 3.004 2.167 CYS 237.A N ILE 233.A O CYS 237.A H 2.804 1.998 ARG 238.A N ILE 234.A O ARG 238.A H 3.073 2.264 LEU 239.A N THR 235.A O LEU 239.A H 3.383 2.621 ILE 240.A N ILE 236.A O ILE 240.A H 2.930 2.158 GLY 241.A N CYS 237.A O GLY 241.A H 2.831 2.033 ILE 242.A N CYS 237.A O ILE 242.A H 2.971 2.244 LYS 243.A N HIS 201.A O LYS 243.A H 2.713 1.931 LYS 243.A NZ ASP 200.A O LYS 243.A HZ3 3.328 2.511 LYS 243.A NZ GLY 241.A O LYS 243.A HZ1 3.021 2.280 ASP 244.A N HIS 201.A O ASP 244.A H 2.997 2.192 MET 245.A N GLY 226.A O MET 245.A H 2.966 2.161 TYR 246.A N LYS 219.A O TYR 246.A H 3.357 2.518 ALA 247.A N ARG 228.A O ALA 247.A H 3.294 2.467 LYS 248.A N LYS 217.A O LYS 248.A H 2.875 2.086 LYS 248.A NZ VAL 249.A O LYS 248.A HZ1 3.044 2.421 SER 250.A N HIS 215.A O SER 250.A H 2.914 2.093 SER 252.A N ARG 213.A O SER 252.A H 3.148 2.397 LEU 256.A N ASN 254.A OD1 LEU 256.A H 3.356 2.601 LEU 258.A N ASN 254.A O LEU 258.A H 2.660 1.824 THR 259.A N MET 255.A O THR 259.A H 2.769 1.975 THR 259.A OG1 MET 255.A O THR 259.A HG1 2.693 1.888 GLN 260.A N LEU 256.A O GLN 260.A H 2.933 2.088 GLY 261.A N SER 257.A O GLY 261.A H 2.821 2.049 LEU 262.A N LEU 258.A O LEU 262.A H 2.880 2.120 PHE 263.A N THR 259.A O PHE 263.A H 3.122 2.311 ARG 264.A N GLN 260.A O ARG 264.A H 3.006 2.211 GLY 265.A N GLY 261.A O GLY 265.A H 3.159 2.401 LEU 266.A N LEU 262.A O LEU 266.A H 2.986 2.172 SER 267.A N PHE 263.A O SER 267.A H 3.066 2.348 GLN 269.A NE2 LEU 266.A O GLN 269.A HE22 3.003 2.338 GLU 270.A N HIS 205.A NE2 GLU 270.A H 2.937 2.300 GLN 273.A NE2 GLN 273.A O GLN 273.A HE22 3.361 2.820 GLN 273.A NE2 ASP 277.A OD1 GLN 273.A HE22 2.710 1.991 GLN 273.A NE2 SER 299.A O GLN 273.A HE21 2.999 2.142 GLN 274.A N THR 271.A OG1 GLN 274.A H 3.227 2.382 LEU 275.A N THR 271.A O LEU 275.A H 3.082 2.270 ALA 276.A N HIS 272.A O ALA 276.A H 2.903 2.079 ASP 277.A N GLN 273.A O ASP 277.A H 2.831 1.982 LYS 278.A N GLN 274.A O LYS 278.A H 2.814 2.022 LYS 279.A N LEU 275.A O LYS 279.A H 2.974 2.184 HIS 282.A ND1 SER 299.A OG no hydrogen 2.724 N/A VAL 283.A N ALA 298.A O VAL 283.A H 2.898 2.040 GLU 285.A N ILE 295.A O GLU 285.A H 2.560 1.706 ARG 287.A NH2 GLU 199.A OE1 ARG 287.A HH22 3.130 2.414 GLU 289.A N GLU 289.A OE1 GLU 289.A H 2.864 2.072 CYS 290.A N ARG 287.A O CYS 290.A H 3.042 2.353 GLY 291.A N GLU 288.A O GLY 291.A H 3.244 2.413 LEU 293.A N CYS 290.A O LEU 293.A H 3.426 2.593 ILE 295.A N GLU 285.A O ILE 295.A H 3.139 2.316 VAL 297.A N VAL 283.A O VAL 297.A H 2.799 1.964 ARG 301.A N ASP 277.A OD1 ARG 301.A H 3.404 2.603 ARG 305.A N GLY 280.A O ARG 305.A H 2.955 2.119 ARG 305.A NE ASP 307.A OD1 ARG 305.A HE 3.317 2.539 ARG 305.A NH1 ASP 307.A O ARG 305.A HH11 3.152 2.373 ARG 305.A NH2 LYS 279.A O ARG 305.A HH21 3.430 2.810 ARG 305.A NH2 GLU 309.A OE1 ARG 305.A HH22 3.464 2.798 VAL 314.A N ASP 312.A OD1 VAL 314.A H 3.420 2.602 VAL 324.A N ASP 320.A O VAL 324.A H 3.067 2.246 LYS 325.A N TRP 321.A O LYS 325.A H 2.738 1.892 THR 326.A N GLU 322.A O THR 326.A H 3.238 2.465 ALA 327.A N ASP 323.A O ALA 327.A H 3.165 2.336 GLN 328.A N VAL 324.A O GLN 328.A H 3.107 2.394 GLY 329.A N THR 326.A O GLY 329.A H 3.005 2.158 MET 330.A N LYS 325.A O MET 330.A H 2.940 2.233 TRP 335.A N SER 333.A OG TRP 335.A H 3.303 2.509 THR 343.A OG1 LEU 227.A O THR 343.A HG1 2.530 1.914