Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7pny_X.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A OG GLU 316.A OE2 SER 3.A HG 3.564 2.924 ARG 4.A N ALA 1.A O ARG 4.A H 3.249 2.427 ARG 4.A NH1 GLU 50.A OE2 ARG 4.A HH12 2.716 2.045 ARG 4.A NH2 GLU 50.A OE2 ARG 4.A HH22 2.426 1.645 THR 5.A N HIS 21.A O THR 5.A H 2.989 2.194 GLU 7.A N THR 5.A OG1 GLU 7.A H 3.397 2.541 ASN 8.A N ASN 8.A OD1 ASN 8.A H 2.622 1.954 ASP 9.A N GLU 7.A OE1 ASP 9.A H 3.399 2.578 ALA 11.A N ASP 9.A OD1 ALA 11.A H 3.200 2.341 LYS 12.A N ASP 9.A O LYS 12.A H 3.061 2.212 HIS 13.A NE2 GLU 7.A O HIS 13.A HE2 3.001 2.165 GLY 14.A N HIS 17.A ND1 GLY 14.A H 3.150 2.378 GLN 16.A N GLN 16.A OE1 GLN 16.A H 2.654 1.847 HIS 17.A N GLY 14.A O HIS 17.A H 2.936 2.109 GLU 18.A N ASP 15.A O GLU 18.A H 3.327 2.473 GLY 19.A N VAL 55.A O GLY 19.A H 2.728 1.896 GLN 20.A N HIS 17.A O GLN 20.A H 3.091 2.252 HIS 21.A N SER 3.A O HIS 21.A H 2.609 1.802 HIS 21.A ND1 SER 3.A O HIS 21.A HD1 3.116 2.340 TYR 22.A N LEU 53.A O TYR 22.A H 3.094 2.276 ILE 24.A N ALA 51.A O ILE 24.A H 2.911 2.070 ASP 28.A N SER 25.A OG ASP 28.A H 3.163 2.346 LEU 29.A N SER 25.A O LEU 29.A H 3.087 2.345 GLU 30.A N PRO 26.A O GLU 30.A H 3.186 2.405 THR 31.A N GLN 27.A O THR 31.A H 3.178 2.376 VAL 32.A N ASP 28.A O VAL 32.A H 2.872 2.087 PHE 33.A N LEU 29.A O PHE 33.A H 3.305 2.603 ARG 40.A NE GLU 346.A OE1 ARG 40.A HE 2.774 1.955 ARG 40.A NE GLU 346.A OE2 ARG 40.A HE 3.158 2.482 ARG 40.A NH1 GLU 346.A OE2 ARG 40.A HH11 3.175 2.438 VAL 42.A N PRO 38.A O VAL 42.A H 2.991 2.192 MET 43.A N PRO 39.A O MET 43.A H 3.207 2.417 GLN 44.A N ARG 40.A O GLN 44.A H 3.031 2.277 VAL 45.A N PHE 41.A O VAL 45.A H 3.023 2.279 LYS 46.A N VAL 42.A O LYS 46.A H 3.184 2.359 THR 47.A N MET 43.A O THR 47.A H 3.004 2.217 PHE 48.A N GLN 44.A O PHE 48.A H 2.879 2.027 LEU 53.A N TYR 22.A O LEU 53.A H 2.928 2.119 VAL 55.A N GLN 20.A O VAL 55.A H 2.858 2.046 ARG 56.A NE GLU 306.A OE2 ARG 56.A HE 3.395 2.573 ARG 56.A NH1 THR 86.A O ARG 56.A HH12 2.654 1.824 ARG 56.A NH2 SER 300.A O ARG 56.A HH22 2.521 1.720 LYS 57.A NZ ASP 15.A OD1 LYS 57.A HZ2 3.500 2.856 LEU 60.A N ARG 56.A O LEU 60.A H 2.991 2.154 GLU 61.A N LYS 57.A O GLU 61.A H 2.827 1.975 LEU 62.A N PRO 58.A O LEU 62.A H 3.015 2.205 LEU 63.A N ALA 59.A O LEU 63.A H 2.766 1.932 HIS 64.A N LEU 60.A O HIS 64.A H 2.940 2.155 TYR 65.A N GLU 61.A O TYR 65.A H 3.276 2.499 LEU 66.A N LEU 62.A O LEU 66.A H 2.994 2.175 LYS 67.A N LEU 63.A O LYS 67.A H 2.952 2.134 LYS 67.A NZ ALA 11.A O LYS 67.A HZ3 3.296 2.461 ASN 68.A N TYR 65.A O ASN 68.A H 3.172 2.519 THR 69.A N LEU 66.A O THR 69.A H 3.257 2.417 TYR 73.A N SER 70.A O TYR 73.A H 3.279 2.615 ALA 75.A N TRP 255.A O ALA 75.A H 2.728 1.904 ARG 77.A NH1 MET 251.A O ARG 77.A HH11 2.632 1.916 ARG 77.A NH1 ALA 290.A O ARG 77.A HH12 3.423 2.673 ARG 77.A NH2 PRO 293.A O ARG 77.A HH21 3.148 2.487 TYR 78.A N ILE 260.A O TYR 78.A H 2.608 1.770 LEU 79.A N ILE 295.A O LEU 79.A H 2.965 2.126 LEU 80.A N SER 262.A O LEU 80.A H 2.709 1.859 TYR 81.A N ILE 297.A O TYR 81.A H 2.937 2.115 LYS 84.A NZ GLN 266.A OE1 LYS 84.A HZ3 2.566 1.678 THR 86.A N GLU 83.A O THR 86.A H 3.224 2.550 LYS 88.A NZ GLY 82.A O LYS 88.A HZ1 3.246 2.442 LYS 88.A NZ GLU 83.A O LYS 88.A HZ1 2.842 2.283 THR 89.A OG1 ASP 217.A OD1 THR 89.A HG1 3.447 2.691 THR 89.A OG1 ASP 217.A OD2 THR 89.A HG1 3.148 2.484 SER 91.A N GLY 87.A O SER 91.A H 2.927 2.173 LEU 92.A N LYS 88.A O LEU 92.A H 2.944 2.130 CYS 93.A N THR 89.A O CYS 93.A H 2.845 2.063 HIS 94.A N LEU 90.A O HIS 94.A H 3.039 2.237 HIS 94.A NE2 HIS 13.A ND1 HIS 94.A HE2 3.188 2.473 VAL 95.A N SER 91.A O VAL 95.A H 3.360 2.620 ILE 96.A N LEU 92.A O ILE 96.A H 2.850 2.073 HIS 97.A N CYS 93.A O HIS 97.A H 3.006 2.214 PHE 98.A N HIS 94.A O PHE 98.A H 3.363 2.584 CYS 99.A N VAL 95.A O CYS 99.A H 3.167 2.335 ALA 100.A N ILE 96.A O ALA 100.A H 2.830 2.007 LYS 101.A N HIS 97.A O LYS 101.A H 3.079 2.318 LYS 101.A NZ ASP 28.A OD1 LYS 101.A HZ3 3.328 2.626 GLN 102.A N CYS 99.A O GLN 102.A H 3.066 2.310 TRP 104.A N CYS 99.A O TRP 104.A H 3.121 2.281 LEU 105.A N HIS 211.A O LEU 105.A H 2.680 1.838 ILE 106.A N ASN 149.A OD1 ILE 106.A H 2.950 2.091 LEU 107.A N LEU 213.A O LEU 107.A H 2.812 1.983 ILE 109.A N ALA 215.A O ILE 109.A H 2.585 1.744 ALA 112.A N ASP 217.A O ALA 112.A H 2.961 2.160 HIS 113.A NE2 SER 265.A O HIS 113.A HE2 2.995 2.279 LEU 114.A N ASP 111.A OD1 LEU 114.A H 2.844 2.235 TRP 115.A N ALA 112.A O TRP 115.A H 3.458 2.628 VAL 116.A N HIS 113.A O VAL 116.A H 3.352 2.501 LYS 117.A NZ GLY 268.A O LYS 117.A HZ3 2.798 1.929 SER 125.A N ARG 131.A O SER 125.A H 2.958 2.125 GLN 130.A N ASN 128.A OD1 GLN 130.A H 2.661 1.826 ARG 131.A N ASN 128.A O ARG 131.A H 3.316 2.464 PHE 132.A N GLU 240.A O PHE 132.A H 2.914 2.123 ASP 133.A N LEU 123.A O ASP 133.A H 2.595 1.829 GLN 134.A N THR 191.A OG1 GLN 134.A H 2.852 2.050 GLN 134.A NE2 TRP 115.A O GLN 134.A HE21 2.820 1.990 ALA 138.A N GLN 134.A O ALA 138.A H 2.866 2.034 SER 139.A N PRO 135.A O SER 139.A H 2.851 2.023 THR 140.A N LEU 136.A O THR 140.A H 3.156 2.307 TRP 141.A N GLU 137.A O TRP 141.A H 3.420 2.572 TRP 141.A NE1 HIS 108.A O TRP 141.A HE1 2.952 2.207 LEU 142.A N ALA 138.A O LEU 142.A H 3.056 2.252 LYS 143.A N SER 139.A O LYS 143.A H 3.172 2.384 ASN 144.A N THR 140.A O ASN 144.A H 3.297 2.483 ASN 144.A ND2 HIS 35.A ND1 ASN 144.A HD22 3.081 2.481 PHE 145.A N TRP 141.A O PHE 145.A H 2.741 1.909 LYS 146.A N LEU 142.A O LYS 146.A H 2.809 2.012 LYS 146.A NZ GLU 181.A OE2 LYS 146.A HZ3 2.986 2.153 THR 147.A N LYS 143.A O THR 147.A H 3.201 2.401 THR 148.A N ASN 144.A O THR 148.A H 3.063 2.234 ASN 149.A N PHE 145.A O ASN 149.A H 3.160 2.375 ASN 149.A ND2 ILE 106.A O ASN 149.A HD21 2.548 1.751 ASN 149.A ND2 PHE 145.A O ASN 149.A HD22 3.578 2.901 PHE 152.A N ASN 149.A O PHE 152.A H 3.324 2.571 ILE 156.A N PHE 152.A O ILE 156.A H 3.323 2.492 VAL 158.A N SER 174.A O VAL 158.A H 2.982 2.157 GLN 159.A N GLU 200.A OE1 GLN 159.A H 3.211 2.363 TYR 162.A N THR 170.A O TYR 162.A H 2.899 2.101 TRP 164.A N GLU 168.A O TRP 164.A H 3.277 2.592 TRP 164.A NE1 THR 170.A OG1 TRP 164.A HE1 2.532 1.712 ASN 165.A N GLU 168.A O ASN 165.A H 3.068 2.210 THR 170.A N TYR 162.A O THR 170.A H 2.646 1.804 GLY 173.A N VAL 158.A O GLY 173.A H 3.133 2.327 SER 174.A N GLU 171.A O SER 174.A H 3.366 2.540 LEU 176.A N ILE 156.A O LEU 176.A H 2.821 1.990 GLY 177.A N LEU 153.A O GLY 177.A H 2.917 2.203 GLU 178.A N PRO 175.A O GLU 178.A H 3.064 2.303 VAL 179.A N LEU 176.A O VAL 179.A H 3.119 2.532 VAL 180.A N LEU 176.A O VAL 180.A H 3.228 2.480 GLU 181.A N GLY 177.A O GLU 181.A H 2.759 2.048 GLN 182.A N GLU 178.A O GLN 182.A H 3.000 2.203 GLN 182.A NE2 GLU 168.A OE1 GLN 182.A HE21 2.950 2.263 GLN 182.A NE2 ASN 189.A OD1 GLN 182.A HE22 3.508 2.656 ILE 184.A N VAL 180.A O ILE 184.A H 3.344 2.546 THR 185.A N GLU 181.A O THR 185.A H 2.877 2.029 ARG 186.A N GLN 182.A O ARG 186.A H 2.809 1.965 ASN 189.A N ARG 186.A O ASN 189.A H 3.031 2.252 ALA 190.A N VAL 187.A O ALA 190.A H 2.984 2.137 ALA 193.A N ASN 189.A O ALA 193.A H 2.814 2.001 VAL 194.A N ALA 190.A O VAL 194.A H 3.070 2.254 GLY 195.A N THR 191.A O GLY 195.A H 3.291 2.469 ILE 196.A N ASP 192.A O ILE 196.A H 3.012 2.237 VAL 197.A N ALA 193.A O VAL 197.A H 2.981 2.174 LEU 198.A N VAL 194.A O LEU 198.A H 2.995 2.154 LYS 199.A N GLY 195.A O LYS 199.A H 3.030 2.266 GLU 200.A N ILE 196.A O GLU 200.A H 2.808 2.006 LEU 201.A N VAL 197.A O LEU 201.A H 2.898 2.044 LYS 202.A N LEU 198.A O LYS 202.A H 3.270 2.423 LYS 202.A NZ ASP 254.A OD2 LYS 202.A HZ2 2.756 1.952 ARG 203.A N LYS 199.A O ARG 203.A H 3.156 2.377 ARG 203.A NH2 GLU 160.A OE2 ARG 203.A HH22 2.496 1.847 GLN 204.A N GLU 200.A O GLN 204.A H 2.739 1.922 GLN 204.A NE2 LYS 157.A O GLN 204.A HE21 3.081 2.606 GLN 204.A NE2 GLU 200.A OE2 GLN 204.A HE22 3.287 2.487 SER 205.A N LEU 201.A O SER 205.A H 2.865 2.102 GLY 208.A N SER 205.A O GLY 208.A H 3.346 2.525 MET 209.A N GLN 204.A O MET 209.A H 3.311 2.494 LEU 212.A N GLY 257.A O LEU 212.A H 3.278 2.497 LEU 213.A N LEU 105.A O LEU 213.A H 2.814 1.964 VAL 214.A N ALA 259.A O VAL 214.A H 3.047 2.195 ALA 215.A N LEU 107.A O ALA 215.A H 2.713 1.854 VAL 216.A N VAL 261.A O VAL 216.A H 3.292 2.530 ASP 217.A N ILE 109.A O ASP 217.A H 2.959 2.102 GLY 218.A N ALA 263.A O GLY 218.A H 2.818 2.093 ILE 219.A N ALA 263.A O ILE 219.A H 3.314 2.532 ASN 220.A ND2 SER 265.A O ASN 220.A HD21 3.069 2.306 ALA 221.A N GLY 218.A O ALA 221.A H 2.883 2.025 LEU 222.A N ILE 219.A O LEU 222.A H 2.994 2.159 GLY 224.A N ALA 221.A O GLY 224.A H 3.404 2.586 THR 227.A N VAL 116.A O THR 227.A H 3.074 2.246 LYS 229.A NZ THR 227.A O LYS 229.A HZ3 3.336 2.710 ARG 230.A N SER 234.A O ARG 230.A H 2.835 2.010 ARG 230.A NH1 SER 234.A OG ARG 230.A HH11 3.009 2.215 ARG 230.A NH1 PRO 235.A O ARG 230.A HH12 2.963 2.371 LYS 233.A N ARG 230.A O LYS 233.A H 2.750 2.004 SER 234.A N ASP 232.A OD1 SER 234.A H 3.122 2.424 ILE 236.A N LEU 228.A O ILE 236.A H 3.113 2.302 ALA 237.A N GLU 240.A OE1 ALA 237.A H 3.402 2.571 GLU 239.A N GLU 239.A OE2 GLU 239.A H 2.621 1.806 GLU 240.A N ALA 237.A O GLU 240.A H 2.982 2.229 LEU 241.A N PRO 238.A O LEU 241.A H 3.090 2.272 ALA 242.A N PHE 132.A O ALA 242.A H 3.026 2.170 HIS 245.A N LEU 241.A O HIS 245.A H 2.809 1.964 ASN 246.A N ALA 242.A O ASN 246.A H 3.142 2.355 LEU 247.A N LEU 243.A O LEU 247.A H 3.085 2.257 ARG 248.A N VAL 244.A O ARG 248.A H 2.922 2.085 ARG 248.A NE LEU 222.A O ARG 248.A HE 3.012 2.305 ARG 248.A NH1 LEU 222.A O ARG 248.A HH11 2.676 1.881 LYS 249.A N ASN 246.A O LYS 249.A H 3.181 2.398 LYS 249.A NZ ASN 246.A OD1 LYS 249.A HZ2 3.239 2.481 LYS 252.A N LYS 249.A O LYS 252.A H 3.094 2.241 LYS 252.A NZ ASN 253.A OD1 LYS 252.A HZ1 3.484 2.803 ALA 259.A N LEU 212.A O ALA 259.A H 3.245 2.494 ILE 260.A N ILE 76.A O ILE 260.A H 2.879 2.033 VAL 261.A N VAL 214.A O VAL 261.A H 2.799 1.994 SER 262.A N TYR 78.A O SER 262.A H 2.690 1.849 ALA 263.A N VAL 216.A O ALA 263.A H 3.094 2.322 LEU 264.A N LEU 80.A O LEU 264.A H 2.792 1.959 SER 265.A N ASN 220.A OD1 SER 265.A H 3.352 2.501 GLN 266.A NE2 LYS 272.A O GLN 266.A HE22 3.026 2.296 SER 269.A N GLN 266.A O SER 269.A H 3.022 2.171 LYS 272.A NZ GLU 281.A O LYS 272.A HZ1 3.262 2.420 ALA 276.A N PRO 273.A O ALA 276.A H 3.222 2.366 LEU 282.A N LEU 278.A O LEU 282.A H 3.099 2.315 LEU 283.A N PRO 279.A O LEU 283.A H 2.646 1.801 GLY 284.A N GLN 280.A O GLY 284.A H 2.837 2.026 PHE 288.A N GLY 284.A O PHE 288.A H 3.204 2.366 ASP 289.A N LYS 285.A O ASP 289.A H 3.177 2.364 ALA 290.A N GLU 286.A O ALA 290.A H 3.250 2.546 ALA 290.A N GLY 287.A O ALA 290.A H 2.955 2.362 LEU 291.A N GLY 287.A O LEU 291.A H 3.166 2.425 ASP 292.A N PHE 288.A O ASP 292.A H 2.891 2.106 ILE 295.A N ARG 77.A O ILE 295.A H 2.864 2.028 ILE 297.A N LEU 79.A O ILE 297.A H 2.677 1.844 VAL 299.A N TYR 81.A O VAL 299.A H 2.751 1.940 ASN 301.A ND2 ASN 339.A O ASN 301.A HD22 3.449 2.886 TYR 302.A N ALA 340.A O TYR 302.A H 2.913 2.118 ASN 303.A N GLU 306.A OE1 ASN 303.A H 3.125 2.318 ASN 303.A ND2 GLU 18.A OE2 ASN 303.A HD21 3.020 2.414 LYS 305.A NZ GLU 18.A OE1 LYS 305.A HZ1 3.235 2.415 GLU 306.A N ASN 303.A OD1 GLU 306.A H 2.488 1.670 PHE 307.A N ASN 303.A O PHE 307.A H 2.869 2.036 GLU 308.A N PRO 304.A O GLU 308.A H 3.274 2.426 SER 309.A N LYS 305.A O SER 309.A H 3.122 2.279 SER 309.A OG GLY 19.A O SER 309.A HG 2.726 2.057 CYS 310.A N GLU 306.A O CYS 310.A H 2.817 2.026 ILE 311.A N PHE 307.A O ILE 311.A H 2.936 2.113 GLN 312.A N GLU 308.A O GLN 312.A H 2.952 2.137 GLN 312.A NE2 GLU 308.A OE1 GLN 312.A HE22 3.117 2.262 TYR 313.A N SER 309.A O TYR 313.A H 3.021 2.222 TYR 314.A N CYS 310.A O TYR 314.A H 3.261 2.465 LEU 315.A N ILE 311.A O LEU 315.A H 2.868 2.040 GLU 316.A N GLN 312.A O GLU 316.A H 2.706 1.959 ASN 317.A N TYR 314.A O ASN 317.A H 3.199 2.472 ASN 317.A ND2 TYR 313.A O ASN 317.A HD22 2.891 2.052 ASN 318.A N LEU 315.A O ASN 318.A H 3.246 2.407 TRP 319.A N TYR 314.A O TRP 319.A H 2.938 2.099 GLN 321.A N LEU 352.A O GLN 321.A H 3.359 2.584 GLN 321.A NE2 ASN 318.A O GLN 321.A HE22 2.895 2.089 GLU 323.A N GLU 323.A OE1 GLU 323.A H 2.718 1.911 LYS 324.A N HIS 322.A ND1 LYS 324.A H 3.171 2.325 ALA 325.A N HIS 322.A O ALA 325.A H 3.046 2.211 THR 327.A N LYS 324.A O THR 327.A H 3.187 2.401 GLY 330.A N THR 327.A OG1 GLY 330.A H 3.060 2.305 LYS 331.A N THR 327.A O LYS 331.A H 3.018 2.235 LYS 332.A N GLU 328.A O LYS 332.A H 3.066 2.294 LEU 334.A N GLY 330.A O LEU 334.A H 3.092 2.264 LEU 335.A N LYS 331.A O LEU 335.A H 2.933 2.249 PHE 336.A N LYS 332.A O PHE 336.A H 3.080 2.281 LEU 337.A N GLU 333.A O LEU 337.A H 2.999 2.145 SER 338.A N LEU 334.A O SER 338.A H 3.408 2.574 ASN 339.A N LEU 335.A O ASN 339.A H 2.587 1.907 ALA 340.A N SER 338.A OG ALA 340.A H 2.982 2.179 ASN 341.A N SER 338.A O ASN 341.A H 3.300 2.452 ASN 341.A ND2 LYS 84.A O ASN 341.A HD21 3.184 2.376 ASN 341.A ND2 ASN 301.A OD1 ASN 341.A HD22 2.861 2.128 SER 343.A N GLY 85.A O SER 343.A H 3.013 2.260 LEU 344.A N ASN 341.A OD1 LEU 344.A H 3.136 2.319 LEU 345.A N ASN 341.A O LEU 345.A H 2.990 2.152 GLU 346.A N PRO 342.A O GLU 346.A H 3.030 2.209 ARG 347.A N SER 343.A O ARG 347.A H 3.082 2.265 HIS 348.A N LEU 344.A O HIS 348.A H 3.005 2.158 CYS 349.A N LEU 345.A O CYS 349.A H 2.863 2.008 ALA 350.A N ARG 347.A O ALA 350.A H 3.144 2.457