Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7q0y_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 3.A N GLN 6.A OE1 SER 3.A H 2.884 2.070 GLN 6.A N SER 3.A OG GLN 6.A H 3.271 2.442 GLN 6.A NE2 LEU 34.A O GLN 6.A HE21 2.845 1.986 GLN 7.A N SER 3.A O GLN 7.A H 2.871 2.059 GLN 7.A NE2 THR 2.A OG1 GLN 7.A HE21 2.957 2.108 LYS 8.A N ALA 4.A O LYS 8.A H 2.942 2.112 LYS 8.A NZ GLU 261.A OE1 LYS 8.A HZ3 2.698 1.937 LEU 9.A N VAL 5.A O LEU 9.A H 2.975 2.164 ALA 10.A N GLN 6.A O ALA 10.A H 2.884 2.073 ALA 11.A N GLN 7.A O ALA 11.A H 3.037 2.237 LEU 12.A N LYS 8.A O LEU 12.A H 2.988 2.154 GLU 13.A N LEU 9.A O GLU 13.A H 2.821 1.969 LYS 14.A N ALA 10.A O LYS 14.A H 2.854 2.032 SER 15.A N ALA 11.A O SER 15.A H.A 2.967 2.139 SER 15.A OG.A ALA 11.A O SER 15.A HG.A 3.471 2.854 SER 15.A OG.A LEU 12.A O SER 15.A HG.A 2.854 2.128 SER 16.A N LEU 12.A O SER 16.A H 2.929 2.201 SER 16.A N GLU 13.A O SER 16.A H 3.140 2.517 GLY 17.A N GLU 13.A O GLY 17.A H 3.198 2.527 GLY 18.A N SER 16.A OG GLY 18.A H 3.014 2.155 ARG 19.A N THR 239.A O ARG 19.A H 2.828 2.000 ARG 19.A NH1 GLU 39.A OE1 ARG 19.A HH11 2.984 2.223 ARG 19.A NH1 ARG 40.A O ARG 19.A HH12 3.044 2.307 ARG 19.A NH2 ARG 40.A O ARG 19.A HH22 2.911 2.131 LEU 20.A N GLU 13.A OE2 LEU 20.A H 2.841 1.993 GLY 21.A N TYR 237.A O GLY 21.A H 2.816 1.978 VAL 22.A N TYR 35.A O VAL 22.A H 2.836 2.013 ALA 23.A N VAL 235.A O ALA 23.A H 3.003 2.211 LEU 24.A N VAL 33.A O LEU 24.A H 2.858 2.027 ILE 25.A N VAL 233.A O ILE 25.A H 2.841 2.029 ASP 26.A N THR 31.A O ASP 26.A H 2.922 2.090 THR 27.A N PRO 231.A O THR 27.A H 3.103 2.269 THR 27.A OG1 PRO 231.A O THR 27.A HG1 2.734 1.930 ALA 28.A N ASP 26.A OD1 ALA 28.A H 2.922 2.081 ASP 29.A N ASP 26.A O ASP 29.A H 3.380 2.596 ASN 30.A N ASP 26.A O ASN 30.A H 2.779 2.126 THR 31.A N ASP 29.A OD1 THR 31.A H 3.085 2.239 GLN 32.A NE2 GLN 163.A OE1 GLN 32.A HE22 3.042 2.211 VAL 33.A N LEU 24.A O VAL 33.A H 2.897 2.109 TYR 35.A N VAL 22.A O TYR 35.A H 2.869 2.043 TYR 35.A OH GLU 13.A OE1 TYR 35.A HH 2.651 1.837 ARG 36.A NE GLU 13.A OE2 ARG 36.A HE 2.768 1.921 ARG 36.A NH1 GLU 39.A OE2 ARG 36.A HH11 2.893 2.058 ARG 36.A NH2 GLU 13.A OE1 ARG 36.A HH21 2.933 2.087 GLU 39.A N ARG 36.A O GLU 39.A H 3.180 2.331 ARG 40.A NH1 THR 134.A O ARG 40.A HH12 3.029 2.280 ARG 40.A NH1 THR 155.A OG1 ARG 40.A HH11 2.849 2.061 ARG 40.A NH2 THR 134.A O ARG 40.A HH22 2.969 2.203 PHE 41.A N THR 156.A O PHE 41.A H 2.863 2.049 MET 43.A N ASP 154.A O MET 43.A H 3.032 2.187 SER 45.A OG GLU 141.A OE2 no hydrogen 3.507 N/A THR 46.A N MET 43.A O THR 46.A H 3.103 2.316 THR 46.A OG1 MET 43.A O THR 46.A HG1 2.793 1.953 SER 47.A N CYS 44.A O SER 47.A H 3.074 2.226 SER 47.A OG CYS 44.A O SER 47.A HG 2.822 2.050 LYS 48.A N SER 45.A O LYS 48.A H 3.008 2.163 LYS 48.A NZ SER 45.A OG LYS 48.A HZ1 2.759 1.943 LYS 48.A NZ SER 105.A O LYS 48.A HZ2 2.980 2.262 LYS 48.A NZ ASN 107.A OD1 LYS 48.A HZ3 2.663 1.781 VAL 49.A N THR 46.A O VAL 49.A H 3.217 2.396 ALA 51.A N SER 47.A O ALA 51.A H.A 3.277 2.459 ALA 52.A N LYS 48.A O ALA 52.A H 2.959 2.105 ALA 53.A N VAL 49.A O ALA 53.A H 2.880 2.036 ALA 54.A N MET 50.A O ALA 54.A H 2.887 2.109 VAL 55.A N ALA 51.A O VAL 55.A H 3.198 2.387 LEU 56.A N ALA 52.A O LEU 56.A H 2.939 2.098 LYS 57.A N ALA 53.A O LYS 57.A H 2.874 2.070 LYS 57.A NZ GLU 60.A OE1 LYS 57.A HZ2 2.934 2.091 LYS 57.A NZ GLU 60.A OE2 LYS 57.A HZ2 3.139 2.407 LYS 57.A NZ ALA 173.A O LYS 57.A HZ3 2.870 2.056 GLN 58.A N ALA 54.A O GLN 58.A H 3.101 2.295 SER 59.A N VAL 55.A O SER 59.A H 2.979 2.220 SER 59.A OG LEU 56.A O SER 59.A HG 2.658 1.851 GLU 60.A N LYS 57.A O GLU 60.A H 3.093 2.285 THR 61.A N GLN 58.A O THR 61.A H 3.286 2.474 GLN 62.A N GLN 58.A O GLN 62.A H 3.274 2.547 LEU 65.A N GLN 62.A O LEU 65.A H 2.922 2.072 ASN 67.A N GLN 64.A O ASN 67.A H 2.957 2.236 ASN 67.A ND2 GLN 64.A OE1 ASN 67.A HD22 3.018 2.180 GLN 68.A N LEU 65.A O GLN 68.A H 3.012 2.160 VAL 70.A N MET 92.A O VAL 70.A H 2.759 1.947 ILE 72.A N GLY 90.A O ILE 72.A H 2.981 2.139 LYS 73.A N ASP 76.A OD2 LYS 73.A H 2.807 1.951 LYS 73.A NZ ASP 76.A OD1 LYS 73.A HZ2 3.163 2.564 LYS 73.A NZ ASP 76.A OD2 LYS 73.A HZ2 3.520 2.668 ASP 76.A N LYS 73.A O ASP 76.A H 2.892 2.058 LEU 77.A N PRO 74.A O LEU 77.A H 3.266 2.407 VAL 78.A N ASN 81.A OD1 VAL 78.A H 3.054 2.278 ASN 81.A ND2 VAL 78.A O ASN 81.A HD21 2.912 2.059 ILE 83.A N ASP 106.A OD2 ILE 83.A H 2.869 2.087 ALA 84.A N ASP 106.A OD2 ALA 84.A H 2.878 2.038 GLU 85.A N ASN 81.A O GLU 85.A H 3.007 2.178 LYS 86.A N ILE 83.A O LYS 86.A H 2.988 2.177 HIS 87.A N ALA 84.A O HIS 87.A H 2.914 2.076 ASN 89.A N ILE 72.A O ASN 89.A H 2.744 2.066 GLY 90.A N HIS 87.A O GLY 90.A H 2.789 2.030 MET 92.A N VAL 70.A O MET 92.A H 2.970 2.170 THR 93.A N GLU 96.A OE1 THR 93.A H 2.877 2.054 LEU 94.A N GLN 68.A O LEU 94.A H 3.222 2.564 ALA 95.A N LEU 66.A O ALA 95.A H 2.818 2.001 GLU 96.A N THR 93.A OG1 GLU 96.A H 3.021 2.180 LEU 97.A N THR 93.A O LEU 97.A H 2.780 1.955 SER 98.A N LEU 94.A O SER 98.A H 2.897 2.085 SER 98.A OG LEU 94.A O SER 98.A HG 2.891 2.114 ALA 99.A N ALA 95.A O ALA 99.A H 2.876 2.034 ALA 100.A N GLU 96.A O ALA 100.A H 2.926 2.108 ALA 101.A N LEU 97.A O ALA 101.A H 2.877 2.030 LEU 102.A N SER 98.A O LEU 102.A H 2.889 2.063 GLN 103.A N ALA 99.A O GLN 103.A H 2.776 1.937 GLN 103.A NE2 TRP 185.A O GLN 103.A HE21 2.900 2.057 TYR 104.A N ALA 100.A O TYR 104.A H 3.097 2.301 SER 105.A N ALA 101.A O SER 105.A H 3.133 2.546 ASP 106.A N ALA 100.A O ASP 106.A H 3.140 2.282 ASN 107.A N TYR 80.A O ASN 107.A H 2.899 2.053 ASN 107.A ND2 ASN 79.A OD1 ASN 107.A HD22 2.856 2.012 THR 108.A OG1 ASN 81.A OD1 THR 108.A HG1 2.624 1.941 ALA 109.A N ASP 106.A OD1 ALA 109.A H 2.892 2.060 MET 110.A N ASP 106.A O MET 110.A H 3.197 2.376 ASN 111.A N ASN 107.A O ASN 111.A H 3.034 2.220 ASN 111.A ND2 GLU 141.A O ASN 111.A HD21 2.976 2.117 LYS 112.A N THR 108.A O LYS 112.A H 3.008 2.217 LYS 112.A NZ ASP 76.A OD2 LYS 112.A HZ1 2.897 2.125 LEU 113.A N ALA 109.A O LEU 113.A H 3.056 2.253 ILE 114.A N MET 110.A O ILE 114.A H 2.922 2.084 ALA 115.A N ASN 111.A O ALA 115.A H 2.893 2.078 GLN 116.A N LYS 112.A O GLN 116.A H 2.924 2.110 GLN 116.A NE2 GLN 58.A OE1 GLN 116.A HE21 2.886 2.030 LEU 117.A N LEU 113.A O LEU 117.A H 3.186 2.486 LEU 117.A N ILE 114.A O LEU 117.A H 3.054 2.383 GLY 118.A N ALA 115.A O GLY 118.A H 2.982 2.138 GLY 119.A N ILE 114.A O GLY 119.A H 2.957 2.111 GLY 122.A N GLY 119.A O GLY 122.A H 2.857 2.122 VAL 123.A N PRO 120.A O VAL 123.A H 3.011 2.392 THR 124.A N PRO 120.A O THR 124.A H 3.151 2.331 THR 124.A OG1 PRO 120.A O THR 124.A HG1 3.428 2.614 ALA 125.A N GLY 121.A O ALA 125.A H 2.893 2.104 PHE 126.A N GLY 122.A O PHE 126.A H 3.186 2.366 ALA 127.A N VAL 123.A O ALA 127.A H 3.046 2.218 ARG 128.A N THR 124.A O ARG 128.A H 2.946 2.126 ARG 128.A NH1 ASP 132.A O ARG 128.A HH11 2.828 2.052 ARG 128.A NH1 PHE 135.A O ARG 128.A HH12 2.798 2.016 ARG 128.A NH2 PHE 135.A O ARG 128.A HH22 2.975 2.255 ALA 129.A N ALA 125.A O ALA 129.A H 2.975 2.200 ILE 130.A N PHE 126.A O ILE 130.A H 3.101 2.377 ILE 130.A N ALA 127.A O ILE 130.A H 3.164 2.497 GLY 131.A N ARG 128.A O GLY 131.A H 3.058 2.214 ASP 132.A N ALA 127.A O ASP 132.A H 2.915 2.124 THR 134.A N ASP 132.A OD1 THR 134.A H 2.927 2.093 PHE 135.A N ASP 132.A OD1 PHE 135.A H 2.874 2.019 ARG 136.A N THR 155.A O ARG 136.A H 3.168 2.381 ARG 136.A NE ASP 138.A OD2 ARG 136.A HE 2.922 2.121 ARG 136.A NH2 ASP 138.A OD1 ARG 136.A HH21 2.899 2.069 ARG 136.A NH2 ASP 138.A OD2 ARG 136.A HH21 3.532 2.889 LEU 137.A N THR 124.A OG1 LEU 137.A H 2.982 2.125 ASP 138.A N ASP 154.A OD1 ASP 138.A H 2.676 1.819 ARG 139.A N ASP 154.A OD1 ARG 139.A H 3.094 2.336 ARG 139.A NE ASP 154.A OD2 ARG 139.A HE 2.756 1.997 ARG 139.A NH1 THR 146.A OG1 ARG 139.A HH12 2.867 2.107 ARG 139.A NH2 THR 146.A OG1 ARG 139.A HH22 3.049 2.350 ARG 139.A NH2 ASP 154.A OD2 ARG 139.A HH21 2.834 2.099 GLU 141.A N ASN 111.A OD1 GLU 141.A H 2.871 2.056 LEU 144.A N THR 140.A O LEU 144.A H 2.997 2.236 ASN 145.A N PRO 142.A O ASN 145.A H 3.168 2.336 ASN 145.A ND2 GLU 141.A OE1 ASN 145.A HD22 2.825 2.104 ASN 145.A ND2 PRO 142.A O ASN 145.A HD21 2.906 2.204 THR 146.A N THR 143.A O THR 146.A H 3.340 2.540 ASP 151.A N ILE 148.A O ASP 151.A H 3.046 2.205 ARG 153.A N ASP 151.A OD1 ARG 153.A H 3.079 2.221 ARG 153.A NE ASP 151.A OD1 ARG 153.A HE 3.275 2.497 ARG 153.A NE ASP 151.A OD2 ARG 153.A HE 3.063 2.320 ARG 153.A NH2 ASP 151.A OD2 ARG 153.A HH21 2.813 2.012 ASP 154.A N ASP 138.A OD2 ASP 154.A H 2.950 2.149 THR 155.A OG1 PRO 152.A O THR 155.A HG1 2.704 1.968 THR 156.A N PHE 41.A O THR 156.A H 3.169 2.398 ARG 159.A N GLY 37.A O ARG 159.A H 2.954 2.103 ARG 159.A NE ASP 38.A OD1 ARG 159.A HE 2.774 1.945 ARG 159.A NH2 ASP 38.A OD2 ARG 159.A HH21 2.887 2.029 ALA 160.A N THR 157.A OG1 ALA 160.A H 3.088 2.246 MET 161.A N THR 157.A O MET 161.A H 3.001 2.158 ALA 162.A N PRO 158.A O ALA 162.A H 2.905 2.074 GLN 163.A N ARG 159.A O GLN 163.A H 2.954 2.104 THR 164.A N ALA 160.A O THR 164.A H 2.972 2.132 THR 164.A OG1 ASP 132.A OD2 THR 164.A HG1 2.650 1.842 LEU 165.A N MET 161.A O LEU 165.A H 2.816 1.970 ARG 166.A N ALA 162.A O ARG 166.A H 2.909 2.063 ARG 166.A NH1 ASN 30.A OD1 ARG 166.A HH12 3.162 2.463 ARG 166.A NH2 ASN 30.A OD1 ARG 166.A HH22 2.780 1.954 GLN 167.A N GLN 163.A O GLN 167.A H 2.955 2.126 LEU 168.A N THR 164.A O LEU 168.A H 2.850 2.077 THR 169.A N LEU 165.A O THR 169.A H 3.045 2.335 THR 169.A OG1 LEU 165.A O THR 169.A HG1 2.782 1.957 LEU 170.A N ARG 166.A O LEU 170.A H 2.865 2.036 GLY 171.A N ARG 166.A O GLY 171.A H 2.884 2.047 ALA 173.A N GLN 167.A O ALA 173.A H 3.039 2.197 GLY 175.A N GLU 60.A OE2 GLY 175.A H 2.888 2.057 ARG 179.A N GLY 175.A O ARG 179.A H 2.782 1.942 ARG 179.A NE GLU 176.A OE1 ARG 179.A HE 2.874 2.072 ARG 179.A NH1 THR 169.A O ARG 179.A HH11 2.827 1.987 ARG 179.A NH2 GLU 176.A OE1 ARG 179.A HH21 3.086 2.364 ALA 180.A N GLU 176.A O ALA 180.A H 3.026 2.171 GLN 181.A N THR 177.A O GLN 181.A H 2.966 2.173 GLN 181.A NE2 GLN 181.A O GLN 181.A HE21 3.035 2.288 LEU 182.A N GLN 178.A O LEU 182.A H 2.919 2.096 VAL 183.A N ARG 179.A O VAL 183.A H 2.969 2.126 THR 184.A N ALA 180.A O THR 184.A H 2.892 2.054 THR 184.A OG1 ALA 180.A O THR 184.A HG1 2.975 2.179 TRP 185.A N GLN 181.A O TRP 185.A H 2.936 2.106 LEU 186.A N LEU 182.A O LEU 186.A H 2.908 2.059 LYS 187.A N VAL 183.A O LYS 187.A H 2.876 2.035 GLY 188.A N THR 184.A O GLY 188.A H 3.222 2.472 GLY 188.A N TRP 185.A O GLY 188.A H 3.137 2.506 ASN 189.A N LEU 186.A O ASN 189.A H 3.193 2.343 ASN 189.A ND2 THR 191.A OG1 ASN 189.A HD21 3.101 2.349 ASN 189.A ND2 ASP 208.A OD1 ASN 189.A HD22 2.949 2.092 ASN 189.A ND2 ASP 208.A OD2 ASN 189.A HD22 3.275 2.693 THR 190.A N GLN 103.A O THR 190.A H 2.996 2.159 THR 190.A OG1 GLN 103.A O THR 190.A HG1 2.723 1.897 THR 191.A N ASN 189.A OD1 THR 191.A H 3.151 2.313 SER 195.A N GLY 192.A O SER 195.A H 3.143 2.289 ILE 196.A N ASP 220.A OD2 ILE 196.A H 2.941 2.115 ARG 197.A NE ASP 208.A OD1 ARG 197.A HE 2.869 2.065 ARG 197.A NH2 LYS 187.A O ARG 197.A HH22 3.528 2.746 ARG 197.A NH2 ASP 208.A OD1 ARG 197.A HH21 2.979 2.237 ALA 198.A N SER 195.A O ALA 198.A H 2.985 2.249 GLY 199.A N ILE 196.A O GLY 199.A H 2.891 2.083 LEU 200.A N ARG 197.A O LEU 200.A H 3.314 2.458 TRP 204.A N PRO 201.A O TRP 204.A H 3.132 2.284 THR 205.A N TRP 225.A O THR 205.A H 3.173 2.428 GLY 207.A N VAL 223.A O.A GLY 207.A H 2.880 2.049 GLY 207.A N VAL 223.A O.B GLY 207.A H 2.882 2.056 ASP 208.A N LEU 186.A O ASP 208.A H 3.165 2.412 LYS 209.A N ILE 221.A O LYS 209.A H 2.908 2.124 LYS 209.A NZ SER 105.A OG LYS 209.A HZ3 2.939 2.081 LYS 209.A NZ THR 210.A O LYS 209.A HZ1 2.794 1.921 GLY 211.A N ASN 219.A O GLY 211.A H 2.920 2.151 GLY 213.A N THR 217.A O GLY 213.A H 3.051 2.299 ASP 214.A N ASN 145.A O ASP 214.A H 3.022 2.185 TYR 215.A N GLN 243.A O TYR 215.A H 2.884 2.134 THR 217.A N GLY 213.A O THR 217.A H 3.225 2.557 THR 217.A N ASP 214.A O THR 217.A H 3.140 2.362 THR 217.A OG1 ASP 214.A O THR 217.A HG1 2.715 1.987 THR 218.A N PHE 238.A O THR 218.A H 2.829 2.004 THR 218.A OG1 GLY 216.A O THR 218.A HG1 2.887 2.090 ASN 219.A N GLY 211.A O ASN 219.A H 2.851 2.041 ASN 219.A ND2 PRO 42.A O ASN 219.A HD21 2.869 2.108 ASN 219.A ND2 MET 43.A O ASN 219.A HD22 3.051 2.281 ASP 220.A N THR 236.A O ASP 220.A H 2.929 2.148 ILE 221.A N LYS 209.A O ILE 221.A H 3.022 2.226 ALA 222.A N LEU 234.A O ALA 222.A H 2.800 2.035 VAL 223.A N.A GLY 207.A O VAL 223.A H.A 2.844 2.069 VAL 223.A N.B GLY 207.A O VAL 223.A H.B 2.839 2.079 ILE 224.A N LEU 232.A O ILE 224.A H.A 2.812 1.991 TRP 225.A N THR 205.A O TRP 225.A H 2.841 1.997 ARG 229.A NH1 ASP 26.A OD1 ARG 229.A HH12 2.799 2.014 ARG 229.A NH1 ALA 230.A O ARG 229.A HH11 2.920 2.202 ARG 229.A NH2 ASP 26.A OD1 ARG 229.A HH22 3.086 2.396 ARG 229.A NH2 ASP 26.A OD2 ARG 229.A HH22 2.333 1.658 LEU 232.A N ILE 224.A O LEU 232.A H 2.829 1.998 VAL 233.A N ILE 25.A O VAL 233.A H 2.999 2.193 LEU 234.A N ALA 222.A O LEU 234.A H 2.874 2.037 VAL 235.A N ALA 23.A O VAL 235.A H 2.840 2.013 THR 236.A N ASP 220.A O THR 236.A H 2.917 2.059 TYR 237.A N GLY 21.A O TYR 237.A H 2.826 1.977 TYR 237.A OH THR 46.A OG1 TYR 237.A HH 2.905 2.242 PHE 238.A N ASN 219.A OD1 PHE 238.A H 3.211 2.431 THR 239.A N ARG 19.A O THR 239.A H 3.014 2.202 THR 239.A OG1 THR 217.A OG1 THR 239.A HG1 2.741 2.017 GLN 240.A N TYR 215.A O GLN 240.A H 2.908 2.153 GLN 240.A NE2 GLY 216.A O GLN 240.A HE21 2.966 2.154 GLN 240.A NE2 GLU 246.A O GLN 240.A HE22 2.817 2.031 GLN 243.A NE2 ASP 214.A OD2 GLN 243.A HE21 3.088 2.240 ALA 245.A N GLN 242.A O ALA 245.A H 3.118 2.289 ARG 248.A N THR 218.A OG1 ARG 248.A H 3.094 2.248 ARG 248.A NE ASP 250.A OD1 ARG 248.A HE 2.881 2.037 ARG 248.A NH2 ASP 250.A OD2 ARG 248.A HH21 2.898 2.044 VAL 251.A N ARG 248.A O VAL 251.A H 3.014 2.256 ALA 253.A N ARG 249.A O ALA 253.A H 3.113 2.286 SER 254.A N ASP 250.A O SER 254.A H 2.915 2.108 ALA 255.A N VAL 251.A O ALA 255.A H 2.870 2.056 ALA 256.A N LEU 252.A O ALA 256.A H 2.946 2.115 ARG 257.A N ALA 253.A O ARG 257.A H 2.928 2.114 ILE 258.A N SER 254.A O ILE 258.A H 3.020 2.198 ILE 259.A N ALA 255.A O ILE 259.A H.A 3.015 2.185 ALA 260.A N ALA 256.A O ALA 260.A H 2.936 2.210 GLU 261.A N ILE 258.A O GLU 261.A H 3.231 2.410 LEU 263.A N ALA 260.A O LEU 263.A H 2.939 2.091