Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7ycd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A SD THR 2.A O no hydrogen 3.755 N/A MET 1.A SD LYS 5.A O no hydrogen 3.636 N/A CYS 3.A N GLU 111.A O CYS 3.A H 2.977 2.071 LYS 5.A N THR 2.A O LYS 5.A H 2.934 2.105 LEU 6.A N CYS 3.A O LEU 6.A H 2.978 2.088 LYS 8.A NZ ASP 4.A O LYS 8.A HZ3 3.108 2.277 VAL 9.A N PHE 90.A O VAL 9.A H 3.008 2.149 GLU 16.A N PRO 13.A O GLU 16.A H 2.867 2.124 ILE 18.A N LEU 14.A O ILE 18.A H 3.030 2.166 LYS 19.A N GLU 15.A O LYS 19.A H 2.934 2.075 LYS 19.A NZ GLU 16.A OE2 LYS 19.A HZ2 3.215 2.370 SER 20.A N GLU 16.A O SER 20.A H 3.290 2.568 SER 20.A N PHE 17.A O SER 20.A H 2.901 2.241 SER 20.A OG GLU 16.A O SER 20.A HG 2.895 2.132 ASN 21.A N ILE 18.A O ASN 21.A H 3.165 2.317 ASN 21.A ND2 TYR 40.A O ASN 21.A HD22 2.855 2.041 LEU 23.A N ARG 38.A O LEU 23.A H 3.003 2.098 GLN 24.A N ASN 120.A O GLN 24.A H 2.900 1.991 PHE 25.A N THR 36.A O PHE 25.A H 3.290 2.416 ALA 26.A N CYS 118.A O ALA 26.A H 2.830 1.994 VAL 28.A N HIS 146.A O VAL 28.A H 3.142 2.261 LEU 29.A N GLU 115.A OE2 LEU 29.A H 3.088 2.361 LEU 29.A N TYR 116.A O LEU 29.A H 3.294 2.627 THR 30.A N GLU 115.A OE2 THR 30.A H 2.919 2.048 THR 30.A OG1 GLU 115.A OE1 THR 30.A HG1 2.494 1.752 THR 32.A N THR 30.A OG1 THR 32.A H 3.334 2.461 ASP 34.A N ASP 31.A O ASP 34.A H 3.318 2.436 CYS 35.A N ALA 148.A O CYS 35.A H 3.005 2.143 CYS 35.A SG ALA 148.A O no hydrogen 3.900 N/A THR 37.A N ILE 57.A O THR 37.A H 2.812 1.902 ARG 38.A N LEU 23.A O ARG 38.A H 2.803 1.947 ARG 38.A NE ASP 56.A OD1 ARG 38.A HE 2.888 2.032 VAL 39.A N LEU 55.A O VAL 39.A H 3.012 2.120 TYR 40.A N ASN 21.A OD1 TYR 40.A H 2.937 2.031 VAL 41.A N THR 53.A O VAL 41.A H 2.863 2.023 SER 47.A N ALA 44.A O SER 47.A H 3.078 2.245 GLN 50.A N SER 47.A OG GLN 50.A H 3.190 2.475 ALA 51.A N ASN 49.A OD1 ALA 51.A H 3.167 2.287 THR 53.A N VAL 41.A O THR 53.A H 2.781 1.888 THR 53.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 53.A HG1 2.656 1.875 ALA 54.A N ASN 65.A O ALA 54.A H 2.763 1.861 LEU 55.A N VAL 39.A O LEU 55.A H 2.807 1.935 ASP 56.A N ILE 63.A O ASP 56.A H 2.789 1.884 ILE 57.A N THR 37.A O ILE 57.A H 2.787 1.896 ARG 58.A N ARG 61.A O ARG 58.A H 2.947 2.041 ARG 58.A NH2 ASP 31.A O ARG 58.A HH21 2.839 2.207 ARG 61.A N ARG 58.A O ARG 61.A H 2.980 2.140 ARG 61.A NH2 THR 32.A O ARG 61.A HH21 2.788 2.195 ILE 63.A N ASP 56.A O ILE 63.A H 2.808 1.902 ASN 65.A N ALA 54.A O ASN 65.A H 3.098 2.211 PHE 67.A N ALA 52.A O PHE 67.A H 2.975 2.122 VAL 68.A N ILE 76.A O VAL 68.A H 3.080 2.228 GLY 70.A N SER 74.A O GLY 70.A H 2.755 1.859 ASN 73.A ND2 LYS 8.A O ASN 73.A HD21 3.183 2.341 ALA 75.A N TRP 88.A O ALA 75.A H 2.898 2.009 ILE 76.A N VAL 68.A O ILE 76.A H 2.815 1.931 LEU 77.A N ALA 86.A O LEU 77.A H 2.857 1.944 ASN 78.A N ASP 66.A O ASN 78.A H 2.816 1.910 ASN 79.A N GLU 84.A O ASN 79.A H 2.810 1.901 CYS 80.A N THR 64.A O CYS 80.A H 2.959 2.073 CYS 80.A SG ASN 78.A O no hydrogen 3.924 N/A THR 81.A N ASN 79.A OD1 THR 81.A H 2.888 2.048 THR 81.A OG1 ASN 79.A OD1 THR 81.A HG1 2.804 2.003 THR 82.A N ASN 79.A OD1 THR 82.A H 3.287 2.607 GLY 83.A N ASN 79.A O GLY 83.A H 2.679 1.844 GLU 84.A N THR 82.A OG1 GLU 84.A H 3.070 2.189 LYS 85.A NZ ASN 78.A OD1 LYS 85.A HZ2 3.137 2.299 ALA 86.A N LEU 77.A O ALA 86.A H 3.048 2.257 TRP 88.A N ALA 75.A O TRP 88.A H 2.749 1.840 TYR 89.A N TYR 106.A O TYR 89.A H 2.945 2.067 GLN 91.A N CYS 104.A O GLN 91.A H 2.778 2.040 GLN 91.A NE2 ALA 132.A O GLN 91.A HE22 2.960 2.127 ASN 94.A N SER 102.A O ASN 94.A H 2.758 1.928 ASN 94.A ND2 ASP 126.A OD1 ASN 94.A HD21 3.548 2.787 ASN 94.A ND2 ASP 126.A OD2 ASN 94.A HD21 2.827 1.951 ASN 96.A N SER 101.A OG ASN 96.A H 2.771 1.933 ASN 96.A ND2 SER 20.A OG ASN 96.A HD22 3.272 2.658 THR 97.A N GLY 100.A O THR 97.A H 2.867 2.085 THR 97.A OG1 GLY 100.A O THR 97.A HG1 2.592 1.741 ASN 99.A N THR 97.A OG1 ASN 99.A H 2.973 2.170 ASN 99.A ND2 THR 125.A OG1 ASN 99.A HD22 3.096 2.236 GLY 100.A N THR 97.A O GLY 100.A H 2.916 2.047 SER 101.A N ASN 121.A OD1 SER 101.A H 2.810 1.898 SER 102.A N ASN 94.A O SER 102.A H 2.983 2.111 SER 102.A OG TYR 92.A OH SER 102.A HG 2.495 1.711 TYR 103.A N ALA 119.A O TYR 103.A H 2.893 2.031 CYS 104.A N TYR 92.A O CYS 104.A H 3.209 2.339 CYS 104.A SG TYR 116.A OH no hydrogen 3.566 N/A ALA 105.A N LYS 117.A O ALA 105.A H 2.838 1.944 TYR 106.A N TYR 89.A O TYR 106.A H 2.967 2.126 THR 107.A N GLU 115.A O THR 107.A H 2.966 2.082 ASN 109.A N GLU 112.A O ASN 109.A H 2.600 1.730 GLU 112.A N ASN 109.A O GLU 112.A H 3.022 2.182 ILE 113.A N PRO 140.A O ILE 113.A H 2.944 2.064 ALA 114.A N THR 107.A O ALA 114.A H 2.903 2.098 GLU 115.A N THR 107.A O GLU 115.A H 3.267 2.377 TYR 116.A N GLU 115.A OE2 TYR 116.A H 3.294 2.417 TYR 116.A OH GLN 91.A OE1 TYR 116.A HH 2.695 1.873 LYS 117.A N ALA 105.A O LYS 117.A H 2.870 1.976 LYS 117.A NZ ASP 56.A OD2 LYS 117.A HZ1 3.013 2.179 CYS 118.A N TYR 27.A O CYS 118.A H 2.899 1.997 ALA 119.A N TYR 103.A O ALA 119.A H 2.804 2.109 ASN 120.A N GLN 24.A O ASN 120.A H 2.981 2.089 ASN 120.A ND2 GLN 129.A OE1 ASN 120.A HD21 2.866 2.042 ASN 121.A N SER 101.A O ASN 121.A H 3.164 2.328 ASN 121.A ND2 SER 20.A O ASN 121.A HD21 3.236 2.475 ASN 122.A N ASN 120.A OD1 ASN 122.A H 3.032 2.199 ASN 122.A ND2 ASN 99.A O ASN 122.A HD21 2.892 2.065 GLY 124.A N ASN 120.A OD1 GLY 124.A H 3.136 2.293 THR 125.A OG1 ASN 122.A O THR 125.A HG1 2.943 2.204 LEU 128.A N ASP 126.A OD1 LEU 128.A H 3.047 2.200 GLN 129.A N ASP 126.A O GLN 129.A H 2.830 2.004 GLN 129.A NE2 ALA 119.A O GLN 129.A HE22 3.121 2.273 GLN 131.A N.B PRO 127.A O no hydrogen 3.465 N/A GLN 131.A N.C PRO 127.A O no hydrogen 3.491 N/A GLN 131.A O.B LYS 130.A O no hydrogen 3.637 N/A GLN 131.A O.C LYS 130.A O no hydrogen 3.404 N/A GLN 131.A O.C GLN 131.A OE1.C no hydrogen 3.340 N/A GLN 131.A OE1.C GLN 131.A O.C no hydrogen 3.340 N/A ALA 132.A N LEU 128.A O ALA 132.A H 3.053 2.201 VAL 133.A N GLN 129.A O VAL 133.A H 2.968 2.098 GLU 134.A N LYS 130.A O GLU 134.A H 3.149 2.263 VAL 135.A N GLN 131.A O.B VAL 135.A H 3.324 2.497 VAL 135.A N GLN 131.A O.C VAL 135.A H 3.111 2.264 ALA 136.A N ALA 132.A O ALA 136.A H 3.079 2.243 LYS 137.A N VAL 133.A O LYS 137.A H 2.912 2.052 LYS 138.A N VAL 135.A O LYS 138.A H 3.257 2.520 VAL 139.A N ALA 136.A O VAL 139.A H 3.090 2.235 ASN 141.A ND2 ILE 113.A O ASN 141.A HD21 2.872 2.043 GLY 142.A N VAL 139.A O GLY 142.A H 2.813 1.981 LYS 144.A N ASN 141.A O LYS 144.A H 3.209 2.317 LYS 144.A NZ ASN 141.A OD1 LYS 144.A HZ1 3.441 2.590 ILE 145.A N GLY 142.A O ILE 145.A H 3.184 2.351 HIS 146.A N VAL 28.A O HIS 146.A H 2.948 2.079 HIS 146.A ND1 LYS 144.A O HIS 146.A HD1 2.779 1.941 HIS 146.A NE2 ASP 34.A OD1 HIS 146.A HE2 2.692 1.866 ALA 148.A N ALA 26.A O ALA 148.A H 2.838 1.987 CYS 152.A SG ALA 148.A O no hydrogen 3.926 N/A