Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7yrk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ.A GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1.A 2.872 2.096 LYS 1.A NZ.B GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1.B 2.740 1.892 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.923 2.120 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 2.958 2.143 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.903 2.059 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.978 2.158 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.299 2.582 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.846 2.022 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.995 2.155 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.942 2.115 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.012 2.191 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.787 1.941 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.933 2.101 LYS 13.A NZ LEU 129.A O LYS 13.A HZ3 2.684 1.805 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H.B 2.930 2.097 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.215 2.471 HIS 15.A N MET 12.A O HIS 15.A H 3.239 2.609 HIS 15.A ND1 ALA 11.A O HIS 15.A HD1 2.774 1.926 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.949 2.100 LEU 17.A N MET 12.A O LEU 17.A H.B 3.022 2.168 ASP 18.A OD2 LYS 13.A O ASP 18.A HD2 3.425 2.682 ASN 19.A N TYR 23.A O ASN 19.A H.A 2.872 2.247 TYR 20.A N LEU 17.A O TYR 20.A H 3.036 2.183 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.966 2.173 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.003 2.150 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.920 2.278 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.947 2.276 TRP 28.A NE1 TYR 23.A O TRP 28.A HE1 3.099 2.471 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 2.997 2.166 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.891 2.043 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.946 2.126 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.996 2.163 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H 2.860 2.044 LYS 33.A NZ ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2 2.759 1.897 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.129 2.307 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.822 2.025 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.947 2.121 SER 36.A OG ALA 32.A O SER 36.A HG 2.992 2.552 SER 36.A OG ILE 55.A O SER 36.A HG 2.836 2.117 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.834 2.094 PHE 38.A N SER 36.A OG PHE 38.A H 3.079 2.457 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H 3.085 2.258 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.852 2.012 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 2.992 2.190 GLN 41.A N ASN 39.A OD1 GLN 41.A H 2.940 2.114 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.193 2.339 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H.B 3.018 2.279 ASN 44.A ND2.A GLN 57.A OE1 ASN 44.A HD22.A 2.634 1.788 ARG 45.A NE.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HE.A 2.778 1.953 ARG 45.A NE.B GLY 49.A O ARG 45.A HE.B 3.057 2.342 ARG 45.A NH2.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HH21.A 3.188 2.504 ARG 45.A NH2.B GLY 49.A O ARG 45.A HH21.B 2.736 1.933 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.869 2.010 GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 2.914 2.069 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 2.885 2.058 SER 50.A OG ASP 48.A OD1 SER 50.A HG 2.594 1.764 SER 50.A OG ASP 48.A OD2 SER 50.A HG 3.552 2.898 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 2.989 2.156 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.810 1.970 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.883 2.160 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.644 1.830 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.846 2.007 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 2.983 2.165 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.067 2.413 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.624 3.099 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.955 2.102 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.991 2.199 ASN 59.A ND2 SER 50.A OG ASN 59.A HD21 2.887 2.063 ASN 59.A ND2 ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD22 2.677 1.828 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.911 2.141 SER 60.A OG THR 69.A OG1 SER 60.A HG 2.773 1.935 ARG 61.A N ASN 59.A OD1 ARG 61.A H.A 2.823 1.993 ARG 61.A NE.A ASP 48.A OD2 ARG 61.A HE.A 3.079 2.278 ARG 61.A NH1.A PRO 70.A O ARG 61.A HH12.A 3.337 2.492 ARG 61.A NH1.B ASP 48.A OD2 ARG 61.A HH11.B 3.308 2.504 ARG 61.A NH2.A ASP 48.A O ARG 61.A HH21.A 3.464 2.745 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.079 2.266 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.949 2.113 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.133 2.341 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H.A 3.050 2.200 ARG 68.A NH2.A GLY 49.A O ARG 68.A HH21.A 3.023 2.165 ARG 68.A NH2.B THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21.B 2.954 2.097 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.789 1.968 SER 72.A N THR 69.A O SER 72.A H 3.113 2.348 SER 72.A OG THR 69.A O SER 72.A HG 2.798 2.131 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H 2.887 2.053 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.844 2.009 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.907 2.090 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H 2.920 2.118 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H.B 2.961 2.156 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.860 2.031 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 2.952 2.171 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H.C 2.915 2.115 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.975 2.129 SER 85.A OG.B ASP 87.A O SER 85.A HG.B 2.518 1.824 ASP 87.A N SER 85.A OG.A ASP 87.A H 2.997 2.175 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 2.986 2.131 THR 89.A OG1 ASP 87.A OD1 THR 89.A HG1 2.640 1.819 SER 91.A OG LEU 83.A O SER 91.A HG 3.500 3.104 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.898 2.066 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.855 2.008 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 2.986 2.158 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.864 2.026 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.954 2.154 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ1 2.799 1.955 LYS 97.A N ASN 93.A O LYS 97.A H.A 3.394 2.612 LYS 97.A NZ.A LEU 75.A O LYS 97.A HZ3.A 2.787 1.938 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 2.934 2.111 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.916 2.069 SER 100.A N LYS 97.A O SER 100.A H 3.140 2.420 SER 100.A OG LYS 96.A O SER 100.A HG 2.758 1.960 ASP 101.A N ILE 98.A O ASP 101.A H 3.049 2.212 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.119 2.295 ASN 106.A N ASN 103.A O ASN 106.A H 3.113 2.385 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O ASN 106.A HD22 2.997 2.200 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.380 2.524 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.962 2.163 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.820 2.135 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 2.884 2.070 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H 3.090 2.276 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.862 2.072 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.865 2.207 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.876 2.055 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.843 2.016 LYS 116.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 116.A HZ2 2.956 2.074 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.972 2.131 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.702 1.888 ALA 122.A N ASP 119.A O ALA 122.A H 3.145 2.317 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H 2.983 2.156 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 2.988 2.183 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.255 2.432 ARG 125.A NE GLN 121.A OE1 ARG 125.A HE 2.755 1.993 ARG 125.A NH2 ASP 119.A OD1 ARG 125.A HH22 2.987 2.153 ARG 125.A NH2 GLN 121.A OE1 ARG 125.A HH21 2.724 1.976 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.127 2.277 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.326 N/A CYS 127.A SG ARG 125.A O no hydrogen 3.974 N/A