Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8af8_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 4.A N.A SER 1.A OG GLN 4.A H.A 3.354 2.532 GLN 4.A N.B SER 1.A OG GLN 4.A H.B 3.346 2.518 GLN 4.A NE2.B LEU 32.A O GLN 4.A HE22.B 2.691 1.919 GLN 5.A N SER 1.A O GLN 5.A H 3.189 2.454 LYS 6.A N ALA 2.A O LYS 6.A H 2.966 2.125 LYS 6.A NZ GLU 259.A OE2 LYS 6.A HZ3 2.983 2.219 LEU 7.A N VAL 3.A O LEU 7.A H 2.908 2.094 ALA 8.A N GLN 4.A O.A ALA 8.A H 3.060 2.242 ALA 8.A N GLN 4.A O.B ALA 8.A H 2.949 2.126 ALA 9.A N GLN 5.A O ALA 9.A H 2.918 2.110 LEU 10.A N LYS 6.A O LEU 10.A H 2.894 2.063 GLU 11.A N LEU 7.A O GLU 11.A H 2.971 2.138 LYS 12.A N ALA 8.A O LYS 12.A H 2.954 2.122 SER 13.A N ALA 9.A O SER 13.A H 2.945 2.165 SER 14.A N LEU 10.A O SER 14.A H 3.031 2.392 SER 14.A N GLU 11.A O SER 14.A H 3.060 2.345 SER 14.A OG GLU 11.A O SER 14.A HG 2.692 1.855 GLY 15.A N GLU 11.A O GLY 15.A H 3.189 2.542 GLY 16.A N SER 14.A OG GLY 16.A H 3.092 2.232 ARG 17.A N THR 237.A O ARG 17.A H 2.868 2.031 ARG 17.A NH1 GLU 37.A OE1 ARG 17.A HH11 3.141 2.368 ARG 17.A NH1 ARG 38.A O ARG 17.A HH12 2.993 2.215 ARG 17.A NH2 ARG 38.A O ARG 17.A HH22 3.044 2.286 LEU 18.A N GLU 11.A OE2 LEU 18.A H 2.847 1.999 GLY 19.A N TYR 235.A O GLY 19.A H 2.827 1.999 VAL 20.A N TYR 33.A O VAL 20.A H 2.801 1.982 ALA 21.A N VAL 233.A O ALA 21.A H 3.012 2.209 LEU 22.A N VAL 31.A O LEU 22.A H 2.781 1.946 ILE 23.A N VAL 231.A O ILE 23.A H 2.832 2.011 ASP 24.A N THR 29.A O ASP 24.A H 2.989 2.149 THR 25.A N PRO 229.A O THR 25.A H 3.240 2.421 THR 25.A OG1 PRO 229.A O THR 25.A HG1 2.572 1.810 ALA 26.A N ASP 24.A OD1 ALA 26.A H 3.035 2.184 THR 29.A N ASP 27.A OD1 THR 29.A H 3.122 2.287 VAL 31.A N LEU 22.A O VAL 31.A H 3.042 2.265 TYR 33.A N VAL 20.A O TYR 33.A H 2.829 1.998 TYR 33.A OH GLU 11.A OE1 TYR 33.A HH 2.731 1.945 ARG 34.A NE GLU 11.A OE2 ARG 34.A HE 2.758 1.927 ARG 34.A NH1 GLU 37.A OE2 ARG 34.A HH11 2.930 2.124 ARG 34.A NH2 GLU 11.A OE1 ARG 34.A HH21 3.029 2.207 GLU 37.A N ARG 34.A O GLU 37.A H 3.240 2.397 ARG 38.A NH1 THR 132.A O ARG 38.A HH12 2.925 2.173 ARG 38.A NH1 THR 153.A OG1 ARG 38.A HH11 2.827 2.024 ARG 38.A NH2 THR 132.A O ARG 38.A HH22 2.944 2.199 PHE 39.A N THR 154.A O PHE 39.A H 2.909 2.086 MET 41.A N ASP 152.A O MET 41.A H 3.067 2.216 SER 43.A OG SER 103.A OG no hydrogen 3.020 N/A THR 44.A N MET 41.A O THR 44.A H 3.050 2.244 THR 44.A OG1 TYR 235.A OH.A THR 44.A HG1 3.150 2.372 THR 44.A OG1 TYR 235.A OH.B THR 44.A HG1 3.277 2.505 SER 45.A N CYS 42.A O SER 45.A H 3.209 2.356 LYS 46.A N SER 43.A O LYS 46.A H 2.983 2.148 LYS 46.A NZ SER 103.A O LYS 46.A HZ2 2.867 2.084 LYS 46.A NZ SER 103.A OG LYS 46.A HZ3 2.958 2.182 LYS 46.A NZ ASN 105.A OD1 LYS 46.A HZ1 2.572 1.971 VAL 47.A N THR 44.A O VAL 47.A H 3.310 2.496 MET 48.A N.A SER 45.A O MET 48.A H.A 3.025 2.378 MET 48.A N.B SER 45.A O MET 48.A H.B 3.030 2.393 ALA 49.A N SER 45.A O ALA 49.A H 3.406 2.603 ALA 50.A N LYS 46.A O ALA 50.A H 2.991 2.144 ALA 51.A N VAL 47.A O ALA 51.A H 2.888 2.057 ALA 52.A N MET 48.A O.A ALA 52.A H 2.953 2.172 ALA 52.A N MET 48.A O.B ALA 52.A H 2.942 2.160 VAL 53.A N ALA 49.A O VAL 53.A H 3.212 2.387 LEU 54.A N ALA 50.A O LEU 54.A H 2.987 2.151 LYS 55.A N ALA 51.A O LYS 55.A H 2.858 2.067 LYS 55.A NZ GLU 58.A OE2 LYS 55.A HZ2 3.047 2.320 GLN 56.A N ALA 52.A O GLN 56.A H 3.052 2.256 SER 57.A N VAL 53.A O SER 57.A H 3.116 2.449 SER 57.A N LEU 54.A O SER 57.A H 2.994 2.324 SER 57.A OG LEU 54.A O SER 57.A HG 2.685 1.856 GLU 58.A N LYS 55.A O GLU 58.A H 3.147 2.313 THR 59.A N GLN 56.A O THR 59.A H 3.421 2.623 THR 59.A OG1.B GLN 56.A O THR 59.A HG1.B 3.243 2.848 GLN 60.A N GLN 56.A O GLN 60.A H 3.161 2.304 LYS 61.A NZ GLU 58.A O LYS 61.A HZ1 2.833 2.112 LEU 63.A N GLN 60.A O LEU 63.A H 2.868 2.075 ASN 65.A N GLN 62.A O ASN 65.A H 3.122 2.340 GLN 66.A N LEU 63.A O GLN 66.A H 3.055 2.201 VAL 68.A N MET 90.A O VAL 68.A H 2.753 1.972 ILE 70.A N GLY 88.A O ILE 70.A H 2.994 2.141 LYS 71.A N ASP 74.A OD2 LYS 71.A H 2.947 2.094 ASP 74.A N LYS 71.A O ASP 74.A H 2.767 1.971 LEU 75.A N PRO 72.A O LEU 75.A H 3.167 2.324 VAL 76.A N ASN 79.A OD1 VAL 76.A H 3.217 2.417 ASN 79.A ND2 VAL 76.A O ASN 79.A HD22 3.021 2.168 ASN 79.A ND2 GLU 83.A OE2.A ASN 79.A HD21 3.254 2.404 ILE 81.A N ASP 104.A OD2 ILE 81.A H 2.914 2.133 ALA 82.A N ASP 104.A OD2 ALA 82.A H 2.871 2.027 GLU 83.A N.A ASN 79.A O GLU 83.A H.A 3.099 2.258 GLU 83.A N.B ASN 79.A O GLU 83.A H.B 3.108 2.268 LYS 84.A N ILE 81.A O LYS 84.A H 2.945 2.216 HIS 85.A N ALA 82.A O HIS 85.A H 2.884 2.057 ASN 87.A N ILE 70.A O ASN 87.A H 2.657 1.903 GLY 88.A N HIS 85.A O GLY 88.A H 2.851 2.143 MET 90.A N VAL 68.A O MET 90.A H 2.960 2.151 THR 91.A N GLU 94.A OE1 THR 91.A H 2.840 2.020 LEU 92.A N GLN 66.A O LEU 92.A H 3.177 2.559 ALA 93.A N LEU 64.A O ALA 93.A H 2.954 2.132 GLU 94.A N THR 91.A OG1 GLU 94.A H 3.077 2.259 LEU 95.A N THR 91.A O LEU 95.A H 2.852 2.040 SER 96.A N LEU 92.A O SER 96.A H 2.834 2.031 ALA 97.A N ALA 93.A O ALA 97.A H 2.908 2.058 ALA 98.A N GLU 94.A O ALA 98.A H 2.901 2.095 ALA 99.A N LEU 95.A O ALA 99.A H 2.933 2.082 LEU 100.A N SER 96.A O LEU 100.A H 3.035 2.244 GLN 101.A N ALA 97.A O GLN 101.A H 2.753 1.912 GLN 101.A NE2 TRP 183.A O GLN 101.A HE22 3.098 2.269 TYR 102.A N ALA 98.A O TYR 102.A H 3.082 2.275 ASP 104.A N ALA 98.A O ASP 104.A H 3.235 2.376 ASN 105.A N TYR 78.A O ASN 105.A H 2.862 2.007 ASN 105.A ND2 ASN 77.A OD1 ASN 105.A HD22 2.937 2.117 THR 106.A OG1 ASN 79.A OD1 THR 106.A HG1 2.700 1.998 ALA 107.A N ASP 104.A OD1 ALA 107.A H 2.913 2.083 MET 108.A N ASP 104.A O MET 108.A H 3.297 2.468 ASN 109.A N ASN 105.A O ASN 109.A H 3.070 2.247 ASN 109.A ND2 GLU 139.A O ASN 109.A HD21 3.040 2.184 LYS 110.A N THR 106.A O LYS 110.A H 2.969 2.176 LYS 110.A NZ ASP 74.A OD2 LYS 110.A HZ2 2.768 2.081 LEU 111.A N ALA 107.A O LEU 111.A H 2.976 2.181 ILE 112.A N MET 108.A O ILE 112.A H 2.923 2.079 ALA 113.A N ASN 109.A O ALA 113.A H 2.949 2.123 GLN 114.A N LYS 110.A O GLN 114.A H 3.073 2.265 GLN 114.A NE2 GLN 56.A OE1 GLN 114.A HE22 3.147 2.286 LEU 115.A N LEU 111.A O LEU 115.A H 3.163 2.443 LEU 115.A N ILE 112.A O LEU 115.A H 3.135 2.484 GLY 116.A N ALA 113.A O GLY 116.A H 3.035 2.199 GLY 117.A N ILE 112.A O GLY 117.A H 2.955 2.118 GLY 120.A N GLY 117.A O GLY 120.A H 2.895 2.130 THR 122.A N PRO 118.A O THR 122.A H 3.003 2.164 THR 122.A OG1 PRO 118.A O THR 122.A HG1 3.298 2.546 ALA 123.A N GLY 119.A O ALA 123.A H 2.952 2.181 ALA 125.A N VAL 121.A O ALA 125.A H 3.319 2.495 ARG 126.A N THR 122.A O ARG 126.A H 3.118 2.293 ARG 126.A NH1 ASP 130.A O ARG 126.A HH11 2.777 2.017 ARG 126.A NH1 PHE 133.A O ARG 126.A HH12 2.824 2.064 ARG 126.A NH2 PHE 133.A O ARG 126.A HH22 2.971 2.264 ALA 127.A N ALA 123.A O ALA 127.A H 2.920 2.175 ILE 128.A N PHE 124.A O ILE 128.A H 3.135 2.444 ILE 128.A N ALA 125.A O ILE 128.A H 3.205 2.499 GLY 129.A N ARG 126.A O GLY 129.A H 3.078 2.247 ASP 130.A N ALA 125.A O ASP 130.A H 2.867 2.032 THR 132.A N ASP 130.A OD1 THR 132.A H 2.917 2.094 PHE 133.A N ASP 130.A OD1 PHE 133.A H 2.901 2.051 ARG 134.A N THR 153.A O ARG 134.A H 3.180 2.404 ARG 134.A NE ASP 136.A OD2 ARG 134.A HE 2.888 2.056 ARG 134.A NH2 ASP 136.A OD1 ARG 134.A HH21 2.969 2.169 ARG 134.A NH2 ASP 136.A OD2 ARG 134.A HH21 3.459 2.797 LEU 135.A N THR 122.A OG1 LEU 135.A H 3.041 2.197 ASP 136.A N ASP 152.A OD1 ASP 136.A H 2.720 1.862 ARG 137.A N ASP 152.A OD1 ARG 137.A H 3.069 2.298 ARG 137.A NE ASP 152.A OD2 ARG 137.A HE 2.732 1.947 ARG 137.A NH1 THR 144.A OG1 ARG 137.A HH12 2.958 2.195 ARG 137.A NH2 THR 144.A OG1 ARG 137.A HH22 3.190 2.499 ARG 137.A NH2 ASP 152.A OD2 ARG 137.A HH21 2.795 2.048 GLU 139.A N ASN 109.A OD1 GLU 139.A H 2.896 2.051 THR 141.A OG1 THR 138.A O THR 141.A HG1 3.467 2.933 LEU 142.A N THR 138.A O LEU 142.A H 3.090 2.342 ASN 143.A N PRO 140.A O ASN 143.A H 3.256 2.413 ASN 143.A ND2 GLU 139.A OE1 ASN 143.A HD21 2.840 2.076 ASN 143.A ND2 PRO 140.A O ASN 143.A HD22 2.922 2.170 THR 144.A N THR 141.A O THR 144.A H 3.293 2.548 ASP 149.A N ILE 146.A O ASP 149.A H 3.141 2.288 ARG 151.A N ASP 149.A OD1 ARG 151.A H 3.049 2.191 ARG 151.A NE ASP 149.A OD1 ARG 151.A HE 3.055 2.253 ARG 151.A NE ASP 149.A OD2 ARG 151.A HE 3.060 2.321 ARG 151.A NH2 ASP 149.A OD2 ARG 151.A HH21 2.878 2.097 ASP 152.A N ASP 136.A OD2 ASP 152.A H 2.964 2.192 THR 153.A OG1 PRO 150.A O THR 153.A HG1 2.725 1.967 THR 154.A N PHE 39.A O THR 154.A H 3.198 2.414 ARG 157.A N GLY 35.A O ARG 157.A H 3.034 2.178 ARG 157.A NE ASP 36.A OD1 ARG 157.A HE 2.883 2.033 ARG 157.A NH2 ASP 36.A OD2 ARG 157.A HH21 3.116 2.258 ALA 158.A N THR 155.A OG1 ALA 158.A H 3.186 2.342 MET 159.A N THR 155.A O MET 159.A H 3.009 2.178 ALA 160.A N PRO 156.A O ALA 160.A H 2.959 2.113 GLN 161.A N ARG 157.A O GLN 161.A H 3.071 2.229 THR 162.A N ALA 158.A O THR 162.A H 2.966 2.127 THR 162.A OG1 ASP 130.A OD2 THR 162.A HG1 2.648 1.871 LEU 163.A N MET 159.A O LEU 163.A H 2.833 2.003 ARG 164.A N ALA 160.A O ARG 164.A H 2.961 2.119 ARG 164.A NH1 ASN 28.A OD1 ARG 164.A HH12 3.161 2.344 GLN 165.A N GLN 161.A O GLN 165.A H 3.003 2.187 GLN 165.A NE2 ILE 128.A O GLN 165.A HE22 3.183 2.408 LEU 166.A N THR 162.A O LEU 166.A H 2.967 2.174 THR 167.A N LEU 163.A O THR 167.A H 3.071 2.333 THR 167.A OG1 LEU 163.A O THR 167.A HG1 2.681 1.853 LEU 168.A N ARG 164.A O LEU 168.A H 2.813 1.978 GLY 169.A N ARG 164.A O GLY 169.A H 2.922 2.168 ALA 171.A N GLN 165.A O ALA 171.A H 3.342 2.482 GLY 173.A N GLU 58.A OE2 GLY 173.A H 2.761 1.972 ARG 177.A N GLY 173.A O ARG 177.A H 2.836 1.987 ARG 177.A NH1 LEU 168.A O ARG 177.A HH11 3.414 2.868 ARG 177.A NH1 GLY 169.A O ARG 177.A HH11 3.272 2.592 ALA 178.A N GLU 174.A O ALA 178.A H 3.123 2.288 GLN 179.A N THR 175.A O GLN 179.A H 3.024 2.229 LEU 180.A N GLN 176.A O LEU 180.A H 2.976 2.150 VAL 181.A N ARG 177.A O VAL 181.A H 2.986 2.148 THR 182.A N ALA 178.A O THR 182.A H 2.927 2.097 TRP 183.A N GLN 179.A O TRP 183.A H 2.898 2.063 LEU 184.A N LEU 180.A O LEU 184.A H 2.915 2.102 LYS 185.A N VAL 181.A O LYS 185.A H 2.867 2.012 GLY 186.A N THR 182.A O GLY 186.A H 3.259 2.621 GLY 186.A N TRP 183.A O GLY 186.A H 3.082 2.375 ASN 187.A N LEU 184.A O ASN 187.A H 3.217 2.368 ASN 187.A ND2 THR 189.A OG1 ASN 187.A HD21 3.034 2.256 ASN 187.A ND2 ASP 206.A OD1 ASN 187.A HD22 3.205 2.353 ASN 187.A ND2 ASP 206.A OD2 ASN 187.A HD22 3.395 2.783 THR 188.A N GLN 101.A O THR 188.A H 3.093 2.253 THR 188.A OG1 GLN 101.A O THR 188.A HG1 2.855 2.015 SER 193.A N GLY 190.A O SER 193.A H 3.109 2.252 ILE 194.A N ASP 218.A OD2 ILE 194.A H 2.935 2.091 ARG 195.A NE ASP 206.A OD1 ARG 195.A HE 3.032 2.372 ARG 195.A NH2 ASP 206.A OD1 ARG 195.A HH21 2.969 2.307 ALA 196.A N SER 193.A O ALA 196.A H 3.024 2.292 GLY 197.A N ILE 194.A O GLY 197.A H 2.926 2.104 LEU 198.A N ARG 195.A O LEU 198.A H 3.269 2.420 TRP 202.A N PRO 199.A O TRP 202.A H 3.183 2.326 THR 203.A N TRP 223.A O THR 203.A H 3.298 2.454 GLY 205.A N VAL 221.A O.A GLY 205.A H 2.837 1.992 GLY 205.A N VAL 221.A O.B GLY 205.A H 2.840 1.996 ASP 206.A N LEU 184.A O ASP 206.A H 3.190 2.478 LYS 207.A N ILE 219.A O LYS 207.A H 2.852 2.060 LYS 207.A NZ SER 103.A OG LYS 207.A HZ2 2.854 1.968 LYS 207.A NZ THR 208.A O LYS 207.A HZ1 2.850 1.964 GLY 209.A N ASN 217.A O GLY 209.A H 2.943 2.133 GLY 211.A N THR 215.A O GLY 211.A H 3.069 2.342 ASP 212.A N ASN 143.A O ASP 212.A H 3.200 2.390 TYR 213.A N GLN 241.A O TYR 213.A H 3.097 2.300 THR 215.A N ASP 212.A O THR 215.A H 3.125 2.327 THR 216.A N PHE 236.A O THR 216.A H 2.872 2.049 ASN 217.A N GLY 209.A O ASN 217.A H 2.723 1.908 ASN 217.A ND2 PRO 40.A O ASN 217.A HD21 2.866 2.146 ASN 217.A ND2 MET 41.A O ASN 217.A HD22 3.101 2.338 ASP 218.A N THR 234.A O ASP 218.A H 2.922 2.141 ILE 219.A N LYS 207.A O ILE 219.A H 3.058 2.246 ALA 220.A N LEU 232.A O ALA 220.A H 2.813 2.048 VAL 221.A N.A GLY 205.A O VAL 221.A H.A 2.825 2.018 VAL 221.A N.B GLY 205.A O VAL 221.A H.B 2.825 2.029 ILE 222.A N LEU 230.A O ILE 222.A H 2.844 2.027 TRP 223.A N THR 203.A O TRP 223.A H 2.799 1.947 ARG 227.A NH1 ASP 24.A OD1 ARG 227.A HH12 2.945 2.105 ARG 227.A NH1 ALA 228.A O ARG 227.A HH11 3.128 2.388 ARG 227.A NH2 ASP 24.A OD2 ARG 227.A HH22 2.784 1.944 LEU 230.A N ILE 222.A O LEU 230.A H 2.902 2.098 VAL 231.A N ILE 23.A O VAL 231.A H 2.972 2.151 LEU 232.A N ALA 220.A O LEU 232.A H 2.953 2.108 VAL 233.A N ALA 21.A O VAL 233.A H 2.872 2.031 THR 234.A N ASP 218.A O THR 234.A H 2.984 2.145 TYR 235.A N GLY 19.A O TYR 235.A H 2.908 2.065 PHE 236.A N ASN 217.A OD1 PHE 236.A H 3.242 2.450 THR 237.A N ARG 17.A O THR 237.A H 3.024 2.226 THR 237.A OG1 TYR 213.A O THR 237.A HG1 3.482 3.044 THR 237.A OG1 THR 215.A OG1 THR 237.A HG1 2.832 2.096 GLN 238.A N TYR 213.A O GLN 238.A H 2.879 2.142 GLN 238.A NE2 GLY 214.A O GLN 238.A HE22 3.051 2.205 GLN 238.A NE2 GLU 244.A O.A GLN 238.A HE21 2.876 2.100 GLN 238.A NE2 GLU 244.A O.B GLN 238.A HE21 2.734 2.003 GLN 240.A N GLN 240.A OE1 GLN 240.A H 2.904 2.262 ALA 243.A N GLN 240.A O ALA 243.A H 3.092 2.274 ARG 246.A N THR 216.A OG1 ARG 246.A H 3.006 2.163 ARG 246.A NE ASP 248.A OD1 ARG 246.A HE 2.855 2.018 ARG 246.A NH2 ASP 248.A OD2 ARG 246.A HH21 3.115 2.268 VAL 249.A N ARG 246.A O VAL 249.A H 3.069 2.325 LEU 250.A N ARG 247.A O LEU 250.A H 3.047 2.458 ALA 251.A N ARG 247.A O ALA 251.A H 3.114 2.285 SER 252.A N ASP 248.A O SER 252.A H 2.990 2.189 ALA 253.A N VAL 249.A O ALA 253.A H 2.896 2.083 ALA 254.A N LEU 250.A O ALA 254.A H 2.957 2.113 ARG 255.A N ALA 251.A O ARG 255.A H 2.954 2.185 ILE 256.A N SER 252.A O ILE 256.A H 3.013 2.172 ILE 257.A N ALA 253.A O ILE 257.A H 3.025 2.194 ALA 258.A N ALA 254.A O ALA 258.A H 2.822 2.000 GLU 259.A N ARG 255.A O no hydrogen 2.902 N/A GLY 260.A N ILE 257.A O no hydrogen 2.999 N/A