Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8apa_j.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLU 4.A N GLU 4.A OE1 GLU 4.A H 2.495 1.694 MET 7.A N TYR 3.A O MET 7.A H 2.898 2.143 GLN 8.A N GLU 4.A O GLN 8.A H 2.927 2.214 GLN 8.A NE2 LEU 5.A O GLN 8.A HE21 3.565 3.090 ASP 11.A N MET 7.A O ASP 11.A H 2.897 2.075 GLU 12.A N GLN 8.A O GLU 12.A H 2.965 2.122 TRP 13.A N TYR 9.A O TRP 13.A H 2.910 2.079 MET 14.A N PHE 10.A O MET 14.A H 2.879 2.054 ILE 15.A N ASP 11.A O ILE 15.A H 2.940 2.113 ARG 16.A N GLU 12.A O ARG 16.A H 2.918 2.105 TRP 17.A N TRP 13.A O TRP 17.A H 2.723 1.967 LYS 19.A NZ GLN 162.A OE1 LYS 19.A HZ1 3.205 2.411 PHE 20.A N TRP 17.A O PHE 20.A H 3.406 2.621 GLN 21.A N ARG 18.A O GLN 21.A H 3.061 2.308 THR 22.A OG1 ASP 25.A OD2 THR 22.A HG1 3.147 2.354 TRP 26.A N THR 22.A O TRP 26.A H 3.165 2.339 GLU 27.A N GLU 23.A O GLU 27.A H 2.901 2.081 ILE 28.A N SER 24.A O ILE 28.A H 2.903 2.108 GLU 29.A N ASP 25.A O GLU 29.A H 2.935 2.119 LYS 30.A N TRP 26.A O LYS 30.A H 2.905 2.083 GLY 31.A N GLU 27.A O GLY 31.A H 2.883 2.055 ARG 32.A N ILE 28.A O ARG 32.A H 2.913 2.110 ARG 32.A NE GLU 119.A OE1 ARG 32.A HE 2.982 2.239 ARG 32.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 32.A HH12 3.014 2.168 ARG 32.A NH2 GLU 119.A OE1 ARG 32.A HH21 2.771 1.973 GLN 33.A N GLU 29.A O GLN 33.A H 2.913 2.095 TRP 34.A N LYS 30.A O TRP 34.A H 2.903 2.086 TRP 35.A N GLY 31.A O TRP 35.A H 2.883 2.060 ARG 36.A N ARG 32.A O ARG 36.A H 2.896 2.082 ARG 37.A N GLN 33.A O ARG 37.A H 2.959 2.133 PHE 38.A N TRP 34.A O PHE 38.A H 2.896 2.085 ASN 39.A N TRP 35.A O ASN 39.A H 2.871 2.039 ASN 39.A ND2 GLU 115.A OE1 ASN 39.A HD22 2.685 1.886 MET 40.A N ARG 36.A O MET 40.A H 2.925 2.091 ALA 41.A N ARG 37.A O ALA 41.A H 2.915 2.114 VAL 42.A N PHE 38.A O VAL 42.A H 2.936 2.103 SER 43.A N ASN 39.A O SER 43.A H 2.913 2.064 SER 43.A OG ASN 39.A O SER 43.A HG 2.805 2.072 GLY 44.A N MET 40.A O GLY 44.A H 2.894 2.064 ALA 45.A N ALA 41.A O ALA 45.A H 2.903 2.089 LEU 46.A N VAL 42.A O LEU 46.A H 2.913 2.085 PHE 47.A N SER 43.A O PHE 47.A H 2.897 2.077 CYS 48.A N GLY 44.A O CYS 48.A H 2.886 2.052 CYS 48.A SG GLY 44.A O CYS 48.A HG 3.349 2.480 GLY 49.A N ALA 45.A O GLY 49.A H 2.909 2.080 LEU 50.A N LEU 46.A O LEU 50.A H 2.918 2.076 VAL 51.A N PHE 47.A O VAL 51.A H 2.909 2.079 LEU 52.A N CYS 48.A O LEU 52.A H 2.907 2.083 TYR 53.A N GLY 49.A O TYR 53.A H 2.898 2.072 THR 54.A N LEU 50.A O THR 54.A H 3.038 2.219 THR 54.A OG1 LEU 50.A O THR 54.A HG1 2.754 1.919 SER 55.A N LEU 52.A O SER 55.A H 3.252 2.427 LEU 60.A N GLY 56.A O LEU 60.A H 2.878 2.060 LYS 61.A N THR 57.A O LYS 61.A H 2.907 2.087 ARG 62.A N ALA 58.A O ARG 62.A H 2.913 2.081 GLN 63.A N THR 59.A O GLN 63.A H 2.889 2.065 TYR 64.A N LEU 60.A O TYR 64.A H 2.804 1.948 GLN 77.A N GLY 73.A O GLN 77.A H 3.135 2.310 ALA 78.A N VAL 74.A O ALA 78.A H 2.906 2.063 LYS 79.A N ASP 75.A O LYS 79.A H 2.924 2.079 LYS 79.A NZ GLY 65.A O LYS 79.A HZ1 3.007 2.321 LYS 79.A NZ HIS 68.A ND1 LYS 79.A HZ3 3.009 2.339 GLU 80.A N GLY 76.A O GLU 80.A H 2.894 2.044 THR 81.A N GLN 77.A O THR 81.A H 2.902 2.076 THR 81.A OG1 GLN 77.A O THR 81.A HG1 2.785 1.978 MET 82.A N ALA 78.A O MET 82.A H 2.939 2.096 LEU 83.A N LYS 79.A O LEU 83.A H 2.888 2.054 LYS 84.A N GLU 80.A O LYS 84.A H 2.898 2.049 THR 85.A N THR 81.A O THR 85.A H 2.923 2.088 THR 85.A OG1 THR 81.A O THR 85.A HG1 2.801 1.998 LEU 86.A N MET 82.A O LEU 86.A H 2.922 2.118 THR 87.A N LEU 83.A O THR 87.A H 2.892 2.077 THR 87.A OG1 LEU 83.A O THR 87.A HG1 2.647 1.844 THR 87.A OG1 LYS 84.A O THR 87.A HG1 3.514 3.053 SER 88.A N LYS 84.A O SER 88.A H 2.907 2.281 SER 88.A OG LYS 84.A O SER 88.A HG 2.446 1.653 ARG 91.A NE LEU 86.A O ARG 91.A HE 2.913 2.339 ARG 91.A NH1 TYR 53.A O ARG 91.A HH11 2.416 1.715 ARG 91.A NH1 SER 55.A O ARG 91.A HH12 2.772 1.973 ARG 91.A NH2 SER 55.A O ARG 91.A HH22 3.093 2.403 ARG 99.A NE THR 54.A OG1 ARG 99.A HE 3.209 2.367 ARG 99.A NH2 VAL 51.A O ARG 99.A HH21 3.037 2.229 VAL 100.A N GLY 96.A O VAL 100.A H 3.184 2.348 LEU 101.A N TYR 97.A O LEU 101.A H 2.898 2.062 ILE 102.A N GLY 98.A O ILE 102.A H 2.921 2.075 THR 103.A N ARG 99.A O THR 103.A H 2.893 2.053 THR 103.A OG1 ARG 99.A O THR 103.A HG1 2.688 1.866 GLY 104.A N VAL 100.A O GLY 104.A H 2.901 2.171 GLY 104.A N LEU 101.A O GLY 104.A H 3.216 2.581 VAL 105.A N LEU 101.A O VAL 105.A H 2.895 2.070 TYR 108.A N GLY 104.A O TYR 108.A H 2.742 1.898 ILE 109.A N VAL 105.A O ILE 109.A H 2.899 2.055 LEU 110.A N PRO 106.A O LEU 110.A H 2.909 2.064 PHE 111.A N THR 107.A O PHE 111.A H 2.939 2.084 VAL 112.A N TYR 108.A O VAL 112.A H 2.911 2.060 THR 113.A N ILE 109.A O THR 113.A H 2.901 2.054 THR 113.A OG1 ILE 109.A O THR 113.A HG1 2.614 1.815 LEU 114.A N LEU 110.A O LEU 114.A H 2.945 2.090 GLU 115.A N PHE 111.A O GLU 115.A H 2.935 2.098 HIS 116.A N VAL 112.A O HIS 116.A H 2.879 2.048 HIS 116.A ND1 GLU 4.A OE2 HIS 116.A HD1 3.003 2.155 TYR 117.A N THR 113.A O TYR 117.A H 2.972 2.127 ARG 118.A N LEU 114.A O ARG 118.A H 2.903 2.087 GLU 119.A N GLU 115.A O GLU 119.A H 2.880 2.092 ARG 120.A N HIS 116.A O ARG 120.A H 2.966 2.153 ARG 121.A N TYR 117.A O ARG 121.A H 2.891 2.084 ARG 122.A N ARG 118.A O ARG 122.A H 2.876 2.076 ARG 122.A NH1 GLU 29.A OE1 ARG 122.A HH11 2.948 2.239 ARG 122.A NH2 ASP 11.A OD2 ARG 122.A HH22 3.191 2.537 ARG 122.A NH2 GLU 119.A OE2 ARG 122.A HH21 2.451 1.785 MET 123.A N GLU 119.A O MET 123.A H 2.923 2.107 GLN 124.A N ARG 120.A O GLN 124.A H 2.954 2.127 GLN 125.A N ARG 121.A O GLN 125.A H 2.882 2.065 TYR 126.A N ARG 122.A O TYR 126.A H 2.918 2.078 TYR 126.A OH GLU 29.A OE2 TYR 126.A HH 2.606 1.806 LEU 127.A N MET 123.A O LEU 127.A H 2.916 2.135 GLN 128.A N GLN 124.A O GLN 128.A H 2.930 2.183 GLN 129.A N TYR 126.A O GLN 129.A H 3.329 2.526 THR 131.A OG1 ASP 25.A OD2 THR 131.A HG1 3.569 2.769 GLU 135.A N THR 131.A O GLU 135.A H 3.015 2.199 GLN 136.A N VAL 132.A O GLN 136.A H 2.881 2.063 GLN 136.A NE2 GLU 147.A O GLN 136.A HE22 2.538 1.794 MET 137.A N PHE 133.A O MET 137.A H 2.907 2.094 ARG 138.A N GLY 134.A O ARG 138.A H 2.925 2.094 ARG 138.A NE GLU 135.A OE1 ARG 138.A HE 3.427 2.686 ARG 138.A NH1 LEU 127.A O ARG 138.A HH11 2.719 2.037 ARG 138.A NH1 GLN 129.A O ARG 138.A HH12 2.768 1.910 ARG 138.A NH2 GLN 129.A O ARG 138.A HH22 3.539 2.914 ARG 138.A NH2 GLU 135.A OE1 ARG 138.A HH21 3.222 2.432 ARG 139.A N GLU 135.A O ARG 139.A H 2.885 2.046 ARG 139.A NE GLU 135.A OE2 ARG 139.A HE 2.843 2.158 LEU 140.A N GLN 136.A O LEU 140.A H 2.854 2.043 LEU 141.A N MET 137.A O LEU 141.A H 2.952 2.118 SER 142.A N ARG 138.A O SER 142.A H 2.903 2.221 SER 142.A N ARG 139.A O SER 142.A H 3.208 2.588 SER 142.A OG ARG 138.A O SER 142.A HG 2.720 1.924 THR 143.A N ARG 139.A O THR 143.A H 2.880 2.042 THR 143.A OG1 ARG 139.A O THR 143.A HG1 2.855 2.026 GLY 144.A N LEU 140.A O GLY 144.A H 2.703 1.997 GLU 147.A N GLN 136.A OE1 GLU 147.A H 3.478 2.622 ASN 153.A N TYR 149.A O ASN 153.A H 3.112 2.410 ASN 153.A N LEU 150.A O ASN 153.A H 2.908 2.288 ILE 154.A N LEU 150.A O ILE 154.A H 3.046 2.228 LYS 155.A NZ TYR 168.A O LYS 155.A HZ1 3.566 2.951 ALA 156.A N PRO 151.A O ALA 156.A H 2.712 1.865 GLN 162.A N PRO 159.A O GLN 162.A H 2.925 2.079 GLN 163.A NE2 LEU 158.A O GLN 163.A HE21 3.594 2.894 TYR 166.A OH ALA 156.A O TYR 166.A HH 2.725 1.997 ASN 167.A N ALA 164.A O ASN 167.A H 2.933 2.114 TYR 168.A N TYR 166.A O TYR 168.A H 2.672 2.045