Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8apc_G1.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 5.A N SER 1.A O ARG 5.A H 3.113 2.287 ARG 5.A NH1 GLU 9.A OE2 ARG 5.A HH11 2.690 2.064 LEU 6.A N GLY 2.A O LEU 6.A H 2.637 1.888 LYS 8.A N LEU 4.A O LYS 8.A H 3.124 2.334 GLU 9.A N ARG 5.A O GLU 9.A H 2.634 1.799 LYS 10.A N LEU 6.A O LYS 10.A H 2.905 2.082 LEU 11.A N TYR 7.A O LEU 11.A H 2.717 1.888 GLU 12.A N LYS 8.A O GLU 12.A H 2.750 2.022 GLY 13.A N GLU 9.A O GLY 13.A H 2.977 2.190 TYR 14.A N LYS 10.A O TYR 14.A H 3.298 2.486 ASN 15.A N LEU 11.A O ASN 15.A H 3.211 2.490 ARG 16.A N GLU 12.A O ARG 16.A H 3.441 2.616 PHE 17.A N GLY 13.A O PHE 17.A H 3.047 2.223 TYR 18.A N TYR 14.A O TYR 18.A H 3.053 2.253 SER 19.A N ASN 15.A O SER 19.A H 3.170 2.374 ILE 20.A N ARG 16.A O ILE 20.A H 2.957 2.121 VAL 21.A N PHE 17.A O VAL 21.A H 2.950 2.097 LYS 22.A N TYR 18.A O LYS 22.A H 2.847 2.014 THR 23.A N SER 19.A O THR 23.A H 2.897 2.103 ILE 24.A N ILE 20.A O ILE 24.A H 2.954 2.198 LYS 25.A N VAL 21.A O LYS 25.A H 3.013 2.232 MET 26.A N LYS 22.A O MET 26.A H 3.098 2.318 VAL 27.A N THR 23.A O VAL 27.A H 3.154 2.357 THR 28.A N ILE 24.A O THR 28.A H 2.985 2.138 THR 28.A OG1 ILE 24.A O THR 28.A HG1 3.307 2.676 THR 28.A OG1 LYS 25.A O THR 28.A HG1 2.923 2.249 LEU 29.A N LYS 25.A O LEU 29.A H 2.891 2.060 ALA 30.A N MET 26.A O ALA 30.A H 3.207 2.387 LYS 31.A N VAL 27.A O LYS 31.A H 3.100 2.267 TYR 32.A N THR 28.A O TYR 32.A H 2.671 1.845 ARG 33.A N LEU 29.A O ARG 33.A H 2.704 1.919 ALA 34.A N ALA 30.A O ALA 34.A H 3.072 2.282 ALA 35.A N LYS 31.A O ALA 35.A H 2.794 2.048 GLN 36.A NE2 TYR 32.A OH GLN 36.A HE21 3.435 2.694 ILE 39.A N GLN 36.A O ILE 39.A H 3.237 2.475 ARG 40.A N GLY 37.A O ARG 40.A H 2.893 2.185 THR 41.A N ARG 38.A O THR 41.A H 2.990 2.398 THR 41.A OG1 ARG 38.A O THR 41.A HG1 3.516 3.061 ARG 42.A NH1 PHE 163.A O ARG 42.A HH12 3.471 2.885 ARG 42.A NH1 GLU 231.A OE2 ARG 42.A HH11 2.621 1.827 ARG 42.A NH2 PHE 163.A O ARG 42.A HH22 3.340 2.728 THR 49.A OG1 HIS 220.A ND1 THR 49.A HG1 2.891 2.361 ALA 52.A N TYR 48.A O ALA 52.A H 3.024 2.235 PHE 53.A N THR 49.A O PHE 53.A H 3.000 2.269 PHE 53.A N GLU 50.A O PHE 53.A H 3.183 2.526 SER 54.A N GLU 50.A O SER 54.A H 2.449 1.622 VAL 63.A N ARG 60.A O VAL 63.A H 3.179 2.557 VAL 64.A N ARG 60.A O VAL 64.A H 2.808 2.017 LEU 70.A N LYS 100.A O LEU 70.A H 2.911 2.131 VAL 71.A N ARG 155.A O VAL 71.A H 2.975 2.152 TYR 72.A N VAL 102.A O TYR 72.A H 2.860 2.049 ILE 73.A N GLN 157.A O ILE 73.A H 2.833 2.163 ILE 75.A N ILE 159.A O ILE 75.A H 2.921 2.097 THR 76.A N VAL 106.A O THR 76.A H 2.737 2.041 ASN 78.A ND2 ASN 128.A O ASN 78.A HD21 2.826 2.125 ASN 88.A N ALA 84.A O ASN 88.A H 2.871 2.024 ILE 89.A N LEU 85.A O ILE 89.A H 2.979 2.144 VAL 90.A N ASN 86.A O VAL 90.A H 2.943 2.114 ARG 91.A N SER 87.A O ARG 91.A H 2.968 2.143 CYS 92.A N ASN 88.A O CYS 92.A H 2.726 1.937 CYS 92.A SG ASN 88.A O CYS 92.A HG 3.144 2.325 ILE 93.A N ILE 89.A O ILE 93.A H 2.788 2.070 ASP 94.A N VAL 90.A O ASP 94.A H 2.670 1.821 SER 95.A N ARG 91.A O SER 95.A H 3.076 2.342 VAL 96.A N ILE 93.A O VAL 96.A H 2.976 2.127 MET 101.A N SER 98.A O MET 101.A H 3.437 2.584 VAL 102.A N LEU 70.A O VAL 102.A H 2.918 2.088 MET 104.A N TYR 72.A O MET 104.A H 2.905 2.076 VAL 106.A N PRO 74.A O VAL 106.A H 2.911 2.211 GLY 107.A N ILE 126.A O GLY 107.A H 2.986 2.143 ARG 109.A N THR 77.A O ARG 109.A H 3.322 2.525 ILE 111.A N GLY 107.A O ILE 111.A H 2.980 2.158 ASP 112.A N LYS 108.A O ASP 112.A H 2.659 1.805 SER 113.A N ARG 109.A O SER 113.A H 2.775 1.928 PHE 114.A N GLY 110.A O PHE 114.A H 2.873 2.062 SER 115.A N ILE 111.A O SER 115.A H 2.634 1.800 LYS 116.A N ASP 112.A O LYS 116.A H 3.429 2.575 LEU 117.A N SER 113.A O LEU 117.A H 2.939 2.130 TYR 118.A N PHE 114.A O TYR 118.A H 2.636 1.810 GLU 121.A N ASP 120.A OD1 GLU 121.A H 2.553 1.901 PHE 122.A N TYR 118.A O PHE 122.A H 2.975 2.142 ARG 123.A N LEU 103.A O ARG 123.A H 3.406 2.557 ARG 123.A NE GLU 121.A O ARG 123.A HE 3.222 2.746 TYR 124.A OH ASN 145.A OD1 TYR 124.A HH 3.173 2.401 ILE 126.A N PRO 105.A O ILE 126.A H 3.147 2.352 LYS 131.A N ASP 129.A O LYS 131.A H 2.660 1.909 HIS 135.A ND1 SER 133.A O HIS 135.A HD1 2.904 2.255 THR 140.A N PHE 136.A O THR 140.A H 2.869 2.043 THR 140.A OG1 PHE 136.A O THR 140.A HG1 3.530 2.979 THR 140.A OG1 GLY 137.A O THR 140.A HG1 2.507 1.790 PHE 141.A N GLY 137.A O PHE 141.A H 2.933 2.189 VAL 142.A N TYR 138.A O VAL 142.A H 2.996 2.242 ILE 143.A N ALA 139.A O ILE 143.A H 3.010 2.216 GLU 144.A N THR 140.A O GLU 144.A H 3.060 2.209 ASN 145.A N PHE 141.A O ASN 145.A H 3.317 2.463 ASN 145.A ND2 PHE 141.A O ASN 145.A HD22 2.678 1.878 ALA 146.A N VAL 142.A O ALA 146.A H 3.015 2.228 TYR 147.A N ILE 143.A O TYR 147.A H 2.908 2.092 GLU 148.A N GLU 144.A O GLU 148.A H 3.071 2.231 VAL 149.A N ASN 145.A O VAL 149.A H 2.872 2.090 SER 150.A N ALA 146.A O SER 150.A H 3.256 2.433 ASP 154.A N ALA 69.A O ASP 154.A H 2.885 2.243 TYR 156.A N ILE 176.A O TYR 156.A H 2.932 2.081 TYR 156.A OH SER 150.A O TYR 156.A HH 2.753 2.045 GLN 157.A N VAL 71.A O GLN 157.A H 2.888 2.076 VAL 158.A N TYR 174.A O VAL 158.A H 2.866 2.066 PHE 160.A N ALA 172.A O PHE 160.A H 2.957 2.123 ARG 162.A N ARG 170.A O ARG 162.A H 2.854 2.096 VAL 164.A N VAL 168.A O VAL 164.A H 2.922 2.319 SER 165.A N VAL 168.A O SER 165.A H 3.223 2.384 VAL 168.A N SER 165.A O VAL 168.A H 3.144 2.313 GLN 169.A NE2 SER 165.A O GLN 169.A HE21 2.904 2.367 GLN 169.A NE2 ALA 166.A O GLN 169.A HE22 3.087 2.458 ARG 170.A N ARG 162.A O ARG 170.A H 2.939 2.300 ALA 172.A N PHE 160.A O ALA 172.A H 2.874 2.037 TYR 174.A N VAL 158.A O TYR 174.A H 2.910 2.080 TYR 174.A OH ASN 227.A OD1 TYR 174.A HH 3.257 2.522 ILE 176.A N TYR 156.A O ILE 176.A H 2.849 2.076 SER 178.A OG ALA 153.A O SER 178.A HG 3.089 2.624 TRP 182.A N SER 178.A O TRP 182.A H 3.004 2.187 TRP 182.A NE1 ALA 52.A O TRP 182.A HE1 2.962 2.332 LYS 183.A N TYR 179.A O LYS 183.A H 2.861 2.008 GLU 184.A N GLU 180.A O GLU 184.A H 3.152 2.383 ASP 185.A N LYS 181.A O ASP 185.A H 3.091 2.257 LEU 186.A N TRP 182.A O LEU 186.A H 2.717 1.877 ALA 187.A N LYS 183.A O ALA 187.A H 2.933 2.239 ALA 187.A N GLU 184.A O ALA 187.A H 3.220 2.618 ASP 188.A N GLU 184.A O ASP 188.A H 3.144 2.408 ALA 189.A N ASP 185.A O ALA 189.A H 2.873 2.037 ALA 190.A N LEU 186.A O ALA 190.A H 3.279 2.575 SER 191.A N ALA 187.A O SER 191.A H 3.275 2.425 SER 192.A N ASP 188.A O SER 192.A H 2.967 2.135 GLN 195.A NE2 ASP 185.A OD1 GLN 195.A HE22 2.625 1.836 ARG 198.A N GLN 195.A O ARG 198.A H 3.112 2.401 ARG 198.A NE GLN 195.A OE1 ARG 198.A HE 3.397 2.613 ARG 198.A NH1 LEU 51.A O ARG 198.A HH11 2.637 1.819 ARG 198.A NH2 GLN 195.A OE1 ARG 198.A HH21 3.279 2.488 TYR 199.A N LYS 196.A O TYR 199.A H 2.758 1.908 ALA 202.A N ARG 198.A O ALA 202.A H 2.860 2.031 ASN 203.A N TYR 199.A O ASN 203.A H 3.091 2.238 ASN 203.A ND2 ALA 190.A O ASN 203.A HD21 3.272 2.443 ASN 203.A ND2 TYR 199.A O ASN 203.A HD22 2.788 2.086 ALA 204.A N LEU 200.A O ALA 204.A H 3.056 2.289 LEU 205.A N ALA 202.A O LEU 205.A H 3.008 2.253 GLN 206.A N ALA 202.A O GLN 206.A H 2.984 2.172 ASN 207.A N ASN 203.A O ASN 207.A H 3.298 2.561 GLU 208.A N LEU 205.A O GLU 208.A H 3.108 2.391 ILE 213.A N GLU 209.A O ILE 213.A H 3.349 2.572 ARG 214.A N GLU 210.A O ARG 214.A H 2.846 2.039 ASP 215.A N GLN 211.A O ASP 215.A H 2.848 2.006 PHE 216.A N LEU 212.A O PHE 216.A H 2.727 1.910 PHE 217.A N ILE 213.A O PHE 217.A H 2.783 1.978 ASP 218.A N ARG 214.A O ASP 218.A H 3.004 2.160 PHE 219.A N ASP 215.A O PHE 219.A H 2.840 2.010 HIS 220.A N PHE 216.A O HIS 220.A H 3.085 2.233 ALA 221.A N PHE 217.A O ALA 221.A H 3.023 2.193 ALA 222.A N ASP 218.A O ALA 222.A H 2.897 2.083 LEU 223.A N PHE 219.A O LEU 223.A H 3.053 2.265 ALA 224.A N HIS 220.A O ALA 224.A H 3.023 2.202 VAL 225.A N ALA 221.A O VAL 225.A H 3.122 2.290 LEU 226.A N ALA 222.A O LEU 226.A H 2.787 1.977 ASN 227.A N LEU 223.A O ASN 227.A H 2.834 2.016 ALA 228.A N ALA 224.A O ALA 228.A H 3.040 2.237 VAL 229.A N VAL 225.A O VAL 229.A H 3.031 2.181 GLY 230.A N LEU 226.A O GLY 230.A H 3.019 2.180 GLU 231.A N ASN 227.A O GLU 231.A H 2.843 2.000 ASN 232.A N ALA 228.A O ASN 232.A H 2.726 1.897 GLU 233.A N VAL 229.A O GLU 233.A H 2.912 2.148 LEU 234.A N GLY 230.A O LEU 234.A H 3.210 2.388 SER 235.A N GLU 231.A O SER 235.A H 2.807 1.959 SER 235.A OG ASN 161.A O SER 235.A HG 3.263 2.621 GLU 236.A N ASN 232.A O GLU 236.A H 3.040 2.328 GLN 237.A N GLU 233.A O GLN 237.A H 2.983 2.164 ALA 238.A N LEU 234.A O ALA 238.A H 3.086 2.234 ALA 239.A N SER 235.A O ALA 239.A H 2.854 2.039 ARG 240.A N GLU 236.A O ARG 240.A H 2.848 2.033 LEU 241.A N GLN 237.A O LEU 241.A H 3.103 2.273 VAL 242.A N ALA 238.A O VAL 242.A H 3.267 2.456 ALA 243.A N ALA 239.A O ALA 243.A H 2.784 1.946 VAL 244.A N ARG 240.A O VAL 244.A H 2.666 1.826 GLU 245.A N LEU 241.A O GLU 245.A H 3.170 2.347 GLY 246.A N VAL 242.A O GLY 246.A H 3.214 2.408 GLN 247.A N ALA 243.A O GLN 247.A H 2.953 2.158 LEU 248.A N VAL 244.A O LEU 248.A H 2.875 2.059 THR 249.A N GLU 245.A O THR 249.A H 3.035 2.225 THR 249.A OG1 GLU 245.A O THR 249.A HG1 3.357 2.645 THR 249.A OG1 GLY 246.A O THR 249.A HG1 2.772 2.180 ASN 250.A N GLY 246.A O ASN 250.A H 2.937 2.104 ILE 251.A N GLN 247.A O ILE 251.A H 2.857 2.029 SER 252.A N THR 249.A O SER 252.A H 3.136 2.473 SER 253.A N THR 249.A O SER 253.A H 2.904 2.097 LEU 254.A N ASN 250.A O LEU 254.A H 3.168 2.338 GLN 256.A N SER 252.A O GLN 256.A H 3.024 2.317 GLN 256.A N SER 253.A O GLN 256.A H 3.152 2.534 ARG 257.A N SER 253.A O ARG 257.A H 3.025 2.430 ARG 257.A N LEU 254.A O ARG 257.A H 3.115 2.407 THR 258.A N LEU 254.A O THR 258.A H 2.872 2.044 THR 258.A OG1 LEU 254.A O THR 258.A HG1 2.992 2.208 SER 259.A OG GLN 256.A O SER 259.A HG 3.326 2.643 TYR 262.A N THR 258.A O TYR 262.A H 3.181 2.495 TYR 262.A N SER 259.A O TYR 262.A H 3.123 2.533 ASN 263.A N SER 259.A O ASN 263.A H 2.838 2.040 LYS 264.A N SER 260.A O LYS 264.A H 2.715 1.922 THR 265.A N LEU 261.A O THR 265.A H 3.112 2.401 THR 265.A OG1 LEU 261.A O THR 265.A HG1 2.505 1.838 ARG 266.A N TYR 262.A O ARG 266.A H 3.263 2.457 PHE 268.A N LYS 264.A O PHE 268.A H 3.198 2.376 GLY 269.A N THR 265.A O GLY 269.A H 2.838 2.030 ILE 270.A N ARG 266.A O ILE 270.A H 3.120 2.294 THR 271.A N GLN 267.A O THR 271.A H 3.244 2.436 THR 271.A OG1 GLN 267.A O THR 271.A HG1 2.679 1.866 ALA 272.A N PHE 268.A O ALA 272.A H 2.989 2.157 ALA 273.A N GLY 269.A O ALA 273.A H 3.174 2.320 LEU 274.A N ILE 270.A O LEU 274.A H 3.191 2.349 ILE 275.A N THR 271.A O ILE 275.A H 2.967 2.175 GLU 276.A N ALA 272.A O GLU 276.A H 2.909 2.080 ILE 277.A N ALA 273.A O ILE 277.A H 3.208 2.388 LEU 278.A N LEU 274.A O LEU 278.A H 3.069 2.234 SER 279.A N ILE 275.A O SER 279.A H 2.910 2.103 SER 279.A OG ILE 275.A O SER 279.A HG 2.852 2.096 ALA 280.A N GLU 276.A O ALA 280.A H 3.052 2.229 MET 281.A N ILE 277.A O MET 281.A H 2.870 2.063 SER 282.A N LEU 278.A O SER 282.A H 2.819 2.013 SER 283.A N SER 279.A O SER 283.A H 2.915 2.133 LEU 284.A N ALA 280.A O LEU 284.A H 3.001 2.171 GLU 285.A N MET 281.A O GLU 285.A H 2.995 2.231 GLY 286.A N SER 282.A O GLY 286.A H 2.820 2.006 ASN 287.A N SER 283.A O ASN 287.A H 2.962 2.123 ALA 288.A N GLU 285.A O ALA 288.A H 3.240 2.590 PHE 297.A N ASN 295.A O PHE 297.A H 2.829 2.234 GLU 299.A N LYS 296.A O GLU 299.A H 3.064 2.438 GLY 300.A N TRP 298.A O GLY 300.A H 2.707 2.092